New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
namelist_top_cfg_PISCES in NEMO/branches/NERC/dev_r4.0.2_NERC_Externals/tests/BENCH/EXPREF – NEMO

source: NEMO/branches/NERC/dev_r4.0.2_NERC_Externals/tests/BENCH/EXPREF/namelist_top_cfg_PISCES @ 13314

Last change on this file since 13314 was 13314, checked in by smueller, 4 years ago

Enabling of the choice between biogeochemical model components PISCES and MEDUSA in the BENCH test case

The biogeochemical model component used in the BENCH test case can be selected by creating in the experiment directory a symbolic link 'namelist_top_cfg' that links to file './namelist_top_cfg_PISCES' (PISCES) or file './namelist_top_cfg_MEDUSA' (MEDUSA).
File size: 7.5 KB
Line 
1!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
2!! NEMO/TOP1 :  Configuration namelist : used to overwrite defaults values defined in SHARED/namelist_top_ref
3!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
4!-----------------------------------------------------------------------
5&namtrc_run      !   run information
6!-----------------------------------------------------------------------
7   ln_top_euler  = .true.
8/
9!-----------------------------------------------------------------------
10&namtrc          !   tracers definition
11!-----------------------------------------------------------------------
12   jp_bgc        =  24
13!
14   ln_pisces     =  .true.
15   ln_medusa     =  .false.
16   ln_my_trc     =  .false.
17   ln_age        =  .false.
18   ln_cfc11      =  .false.
19   ln_cfc12      =  .false.
20   ln_c14        =  .false.
21!
22   ln_trcdta     =  .false.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F)
23!                 !           !                                          !             !
24!                 !    name   !           title of the field             !   units     ! initial data from file or not !
25!                 !           !                                          !             !
26   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.
27   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.
28   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.
29   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.
30   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.
31   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.
32   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.
33   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.
34   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.
35   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true.
36   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.
37   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.
38   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.
39   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.
40   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.
41   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.
42   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.
43   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.
44   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.
45   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.
46   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.
47   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.
48   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.
49   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.
50/
51!-----------------------------------------------------------------------
52&namage          !   AGE
53!-----------------------------------------------------------------------
54/
55!-----------------------------------------------------------------------
56&namtrc_dta      !    Initialisation from data input file
57!-----------------------------------------------------------------------
58!          !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
59!          !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
60   sn_trcdta(1)  = 'data_DIC_nomask'        ,        -12.       ,  'DIC'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
61   sn_trcdta(2)  = 'data_Alkalini_nomask'   ,        -12.       ,  'Alkalini',    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
62   sn_trcdta(3)  = 'data_O2_nomask'         ,        -1.        ,  'O2'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
63   sn_trcdta(5)  = 'data_PO4_nomask'        ,        -1.        ,  'PO4'     ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
64   sn_trcdta(7)  = 'data_Si_nomask'         ,        -1.        ,  'Si'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
65   sn_trcdta(10) = 'data_DOC_nomask'        ,        -12.       ,  'DOC'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
66   sn_trcdta(14) = 'data_Fer_nomask'        ,        -12.       ,  'Fer'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
67   sn_trcdta(23) = 'data_NO3_nomask'        ,        -1.        ,  'NO3'     ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , ''
68   rn_trfac(1)   =   1.0e-06  !  multiplicative factor
69   rn_trfac(2)   =   1.0e-06  !  -      -      -     -
70   rn_trfac(3)   =  44.6e-06  !  -      -      -     -
71   rn_trfac(5)   = 122.0e-06  !  -      -      -     -
72   rn_trfac(7)   =   1.0e-06  !  -      -      -     -
73   rn_trfac(10)  =   1.0      !  -      -      -     -
74   rn_trfac(14)  =   1.0      !  -      -      -     -
75   rn_trfac(23)  =   7.6e-06  !  -      -      -     -
76/
77!-----------------------------------------------------------------------
78&namtrc_adv      !   advection scheme for passive tracer                (default: NO selection)
79!-----------------------------------------------------------------------
80   ln_trcadv_mus =  .true.  !  MUSCL scheme
81      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths
82/
83!-----------------------------------------------------------------------
84&namtrc_ldf      !   lateral diffusion scheme for passive tracer        (default: NO selection)
85!-----------------------------------------------------------------------
86   ln_trcldf_tra   = .true.      !  use active tracer setting
87/
88!-----------------------------------------------------------------------
89&namtrc_rad      !  treatment of negative concentrations
90!-----------------------------------------------------------------------
91/
92!-----------------------------------------------------------------------
93&namtrc_dmp      !   passive tracer newtonian damping   
94!-----------------------------------------------------------------------
95/
96!-----------------------------------------------------------------------
97&namtrc_ice      !    Representation of sea ice growth & melt effects
98!-----------------------------------------------------------------------
99/
100!-----------------------------------------------------------------------
101&namtrc_trd      !   diagnostics on tracer trends                       ('key_trdtrc')
102!----------------------------------------------------------------------
103/
104!----------------------------------------------------------------------
105&namtrc_bc       !   data for boundary conditions
106!-----------------------------------------------------------------------
107/
108!----------------------------------------------------------------------
109&namtrc_bdy      !   Setup of tracer boundary conditions
110!-----------------------------------------------------------------------
111/
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.