New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iom.F90 in NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package_ENHANCE-02_ISF_nemo/src/OCE/IOM – NEMO

source: NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package_ENHANCE-02_ISF_nemo/src/OCE/IOM/iom.F90 @ 12721

Last change on this file since 12721 was 12721, checked in by mathiot, 4 years ago

NEMO_4.0.2_GO8_package_ENHANCE-02_ISF_nemo: add last year isf dev

File size: 128.8 KB
Line 
1MODULE iom
2   !!======================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files
5   !!======================================================================
6   !! History :  2.0  ! 2005-12  (J. Belier) Original code
7   !!            2.0  ! 2006-02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!            3.0  ! 2007-07  (D. Storkey) Changes to iom_gettime
9   !!            3.4  ! 2012-12  (R. Bourdalle-Badie and G. Reffray)  add C1D case 
10   !!            3.6  ! 2014-15  DIMG format removed
11   !!            3.6  ! 2015-15  (J. Harle) Added procedure to read REAL attributes
12   !!            4.0  ! 2017-11  (M. Andrejczuk) Extend IOM interface to write any 3D fields
13   !!----------------------------------------------------------------------
14
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   !!   iom_open       : open a file read only
17   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
18   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
19   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
20   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
21   !!----------------------------------------------------------------------
22   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
23   USE c1d             ! 1D vertical configuration
24   USE flo_oce         ! floats module declarations
25   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
26   USE iom_def         ! iom variables definitions
27   USE iom_nf90        ! NetCDF format with native NetCDF library
28   USE in_out_manager  ! I/O manager
29   USE lib_mpp           ! MPP library
30#if defined key_iomput
31   USE sbc_oce  , ONLY :   nn_fsbc         ! ocean space and time domain
32   USE trc_oce  , ONLY :   nn_dttrc        !  !: frequency of step on passive tracers
33   USE icb_oce  , ONLY :   nclasses, class_num       !  !: iceberg classes
34#if defined key_si3
35   USE ice      , ONLY :   jpl
36#endif
37   USE domngb          ! ocean space and time domain
38   USE phycst          ! physical constants
39   USE dianam          ! build name of file
40   USE xios
41# endif
42   USE ioipsl, ONLY :  ju2ymds    ! for calendar
43   USE crs             ! Grid coarsening
44#if defined key_top
45   USE trc, ONLY    :  profsed
46#endif
47   USE lib_fortran 
48   USE diurnal_bulk, ONLY : ln_diurnal_only, ln_diurnal
49
50   IMPLICIT NONE
51   PUBLIC   !   must be public to be able to access iom_def through iom
52   
53#if defined key_iomput
54   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .TRUE.        !: iom_put flag
55#else
56   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .FALSE.       !: iom_put flag
57#endif
58   PUBLIC iom_init, iom_swap, iom_open, iom_close, iom_setkt, iom_varid, iom_get, iom_get_var
59   PUBLIC iom_chkatt, iom_getatt, iom_putatt, iom_getszuld, iom_rstput, iom_delay_rst, iom_put
60   PUBLIC iom_use, iom_context_finalize, iom_miss_val
61
62   PRIVATE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
63   PRIVATE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d, iom_get_123d
64   PRIVATE iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d, iom_p4d
65#if defined key_iomput
66   PRIVATE iom_set_domain_attr, iom_set_axis_attr, iom_set_field_attr, iom_set_file_attr, iom_get_file_attr, iom_set_grid_attr
67   PRIVATE set_grid, set_grid_bounds, set_scalar, set_xmlatt, set_mooring, iom_update_file_name, iom_sdate
68   PRIVATE iom_set_rst_context, iom_set_rstw_active, iom_set_rstr_active
69# endif
70   PUBLIC iom_set_rstw_var_active, iom_set_rstw_core, iom_set_rst_vars
71
72   INTERFACE iom_get
73      MODULE PROCEDURE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d
74   END INTERFACE
75   INTERFACE iom_getatt
76      MODULE PROCEDURE iom_g0d_iatt, iom_g1d_iatt, iom_g0d_ratt, iom_g1d_ratt, iom_g0d_catt
77   END INTERFACE
78   INTERFACE iom_putatt
79      MODULE PROCEDURE iom_p0d_iatt, iom_p1d_iatt, iom_p0d_ratt, iom_p1d_ratt, iom_p0d_catt
80   END INTERFACE
81   INTERFACE iom_rstput
82      MODULE PROCEDURE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
83   END INTERFACE
84   INTERFACE iom_put
85      MODULE PROCEDURE iom_p0d, iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d, iom_p4d
86   END INTERFACE iom_put
87 
88   !!----------------------------------------------------------------------
89   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
90   !! $Id$
91   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
92   !!----------------------------------------------------------------------
93CONTAINS
94
95   SUBROUTINE iom_init( cdname, fname, ld_tmppatch ) 
96      !!----------------------------------------------------------------------
97      !!                     ***  ROUTINE   ***
98      !!
99      !! ** Purpose :   
100      !!
101      !!----------------------------------------------------------------------
102      CHARACTER(len=*),           INTENT(in)  :: cdname
103      CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(in)  :: fname
104      LOGICAL         , OPTIONAL, INTENT(in)  :: ld_tmppatch
105#if defined key_iomput
106      !
107      TYPE(xios_duration) :: dtime    = xios_duration(0, 0, 0, 0, 0, 0)
108      TYPE(xios_date)     :: start_date
109      CHARACTER(len=lc) :: clname
110      INTEGER             :: irefyear, irefmonth, irefday
111      INTEGER           :: ji, jkmin
112      LOGICAL :: llrst_context              ! is context related to restart
113      !
114      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zt_bnds, zw_bnds
115      LOGICAL ::   ll_tmppatch = .TRUE.    !: seb: patch before we remove periodicity
116      INTEGER ::   nldi_save, nlei_save    !:      and close boundaries in output files
117      INTEGER ::   nldj_save, nlej_save    !:
118      !!----------------------------------------------------------------------
119      !
120      ! seb: patch before we remove periodicity and close boundaries in output files
121      IF( PRESENT(ld_tmppatch) ) THEN   ;   ll_tmppatch = ld_tmppatch
122      ELSE                              ;   ll_tmppatch = .TRUE.
123      ENDIF
124      IF ( ll_tmppatch ) THEN
125         nldi_save = nldi   ;   nlei_save = nlei
126         nldj_save = nldj   ;   nlej_save = nlej
127         IF( nimpp           ==      1 ) nldi = 1
128         IF( nimpp + jpi - 1 == jpiglo ) nlei = jpi
129         IF( njmpp           ==      1 ) nldj = 1
130         IF( njmpp + jpj - 1 == jpjglo ) nlej = jpj
131      ENDIF
132      !
133      ALLOCATE( zt_bnds(2,jpk), zw_bnds(2,jpk) )
134      !
135      clname = cdname
136      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname)
137      CALL xios_context_initialize(TRIM(clname), mpi_comm_oce)
138      CALL iom_swap( cdname )
139      llrst_context =  (TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) .OR. TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context))
140
141      ! Calendar type is now defined in xml file
142      IF (.NOT.(xios_getvar('ref_year' ,irefyear ))) irefyear  = 1900
143      IF (.NOT.(xios_getvar('ref_month',irefmonth))) irefmonth = 01
144      IF (.NOT.(xios_getvar('ref_day'  ,irefday  ))) irefday   = 01
145
146      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
147      CASE ( 1)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "Gregorian", time_origin = xios_date(irefyear,irefmonth,irefday,00,00,00), &
148          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
149      CASE ( 0)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "NoLeap"   , time_origin = xios_date(irefyear,irefmonth,irefday,00,00,00), &
150          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
151      CASE (30)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "D360"     , time_origin = xios_date(irefyear,irefmonth,irefday,00,00,00), &
152          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
153      END SELECT
154
155      ! horizontal grid definition
156      IF(.NOT.llrst_context) CALL set_scalar
157      !
158      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context) ) THEN 
159         CALL set_grid( "T", glamt, gphit, .FALSE., .FALSE. ) 
160         CALL set_grid( "U", glamu, gphiu, .FALSE., .FALSE. )
161         CALL set_grid( "V", glamv, gphiv, .FALSE., .FALSE. )
162         CALL set_grid( "W", glamt, gphit, .FALSE., .FALSE. )
163         CALL set_grid_znl( gphit )
164         !
165         IF( ln_cfmeta ) THEN   ! Add additional grid metadata
166            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e1e2t(nldi:nlei, nldj:nlej))
167            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e1e2u(nldi:nlei, nldj:nlej))
168            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e1e2v(nldi:nlei, nldj:nlej))
169            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e1e2t(nldi:nlei, nldj:nlej))
170            CALL set_grid_bounds( "T", glamf, gphif, glamt, gphit )
171            CALL set_grid_bounds( "U", glamv, gphiv, glamu, gphiu )
172            CALL set_grid_bounds( "V", glamu, gphiu, glamv, gphiv )
173            CALL set_grid_bounds( "W", glamf, gphif, glamt, gphit )
174         ENDIF
175      ENDIF
176      !
177      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context)//"_crs" ) THEN 
178         CALL dom_grid_crs   ! Save the parent grid information  & Switch to coarse grid domain
179         !
180         CALL set_grid( "T", glamt_crs, gphit_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
181         CALL set_grid( "U", glamu_crs, gphiu_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
182         CALL set_grid( "V", glamv_crs, gphiv_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
183         CALL set_grid( "W", glamt_crs, gphit_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
184         CALL set_grid_znl( gphit_crs )
185          !
186         CALL dom_grid_glo   ! Return to parent grid domain
187         !
188         IF( ln_cfmeta .AND. .NOT. llrst_context) THEN   ! Add additional grid metadata
189            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
190            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e1u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
191            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e1v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
192            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
193            CALL set_grid_bounds( "T", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
194            CALL set_grid_bounds( "U", glamv_crs, gphiv_crs, glamu_crs, gphiu_crs )
195            CALL set_grid_bounds( "V", glamu_crs, gphiu_crs, glamv_crs, gphiv_crs )
196            CALL set_grid_bounds( "W", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
197         ENDIF
198      ENDIF
199      !
200      ! vertical grid definition
201      IF(.NOT.llrst_context) THEN
202          CALL iom_set_axis_attr( "deptht",  paxis = gdept_1d )
203          CALL iom_set_axis_attr( "depthu",  paxis = gdept_1d )
204          CALL iom_set_axis_attr( "depthv",  paxis = gdept_1d )
205          CALL iom_set_axis_attr( "depthw",  paxis = gdepw_1d )
206
207          ! Add vertical grid bounds
208          jkmin = MIN(2,jpk)  ! in case jpk=1 (i.e. sas2D)
209          zt_bnds(2,:        ) = gdept_1d(:)
210          zt_bnds(1,jkmin:jpk) = gdept_1d(1:jpkm1)
211          zt_bnds(1,1        ) = gdept_1d(1) - e3w_1d(1)
212          zw_bnds(1,:        ) = gdepw_1d(:)
213          zw_bnds(2,1:jpkm1  ) = gdepw_1d(jkmin:jpk)
214          zw_bnds(2,jpk:     ) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)
215          CALL iom_set_axis_attr( "deptht", bounds=zw_bnds )
216          CALL iom_set_axis_attr( "depthu", bounds=zw_bnds )
217          CALL iom_set_axis_attr( "depthv", bounds=zw_bnds )
218          CALL iom_set_axis_attr( "depthw", bounds=zt_bnds )
219          CALL iom_set_axis_attr( "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpnfl) /) )
220# if defined key_si3
221          CALL iom_set_axis_attr( "ncatice", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) )
222          ! SIMIP diagnostics (4 main arctic straits)
223          CALL iom_set_axis_attr( "nstrait", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,4) /) )
224# endif
225#if defined key_top
226          IF( ALLOCATED(profsed) ) CALL iom_set_axis_attr( "profsed", paxis = profsed )
227#endif
228          CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num )
229          CALL iom_set_axis_attr( "iax_20C", (/ REAL(20,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea...
230          CALL iom_set_axis_attr( "iax_26C", (/ REAL(26,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea...
231          CALL iom_set_axis_attr( "iax_28C", (/ REAL(28,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea...
232          CALL iom_set_axis_attr( "basin"  , (/ (REAL(ji,wp), ji=1,5) /) )
233      ENDIF
234      !
235      ! automatic definitions of some of the xml attributs
236      IF( TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) ) THEN
237!set names of the fields in restart file IF using XIOS to read data
238          CALL iom_set_rst_context(.TRUE.)
239          CALL iom_set_rst_vars(rst_rfields)
240!set which fields are to be read from restart file
241          CALL iom_set_rstr_active()
242      ELSE IF( TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context) ) THEN
243!set names of the fields in restart file IF using XIOS to write data
244          CALL iom_set_rst_context(.FALSE.)
245          CALL iom_set_rst_vars(rst_wfields)
246!set which fields are to be written to a restart file
247          CALL iom_set_rstw_active(fname)
248      ELSE
249          CALL set_xmlatt
250      ENDIF
251      !
252      ! end file definition
253      dtime%second = rdt
254      CALL xios_set_timestep( dtime )
255      CALL xios_close_context_definition()
256      CALL xios_update_calendar( 0 )
257      !
258      DEALLOCATE( zt_bnds, zw_bnds )
259      !
260      IF ( ll_tmppatch ) THEN
261         nldi = nldi_save   ;   nlei = nlei_save
262         nldj = nldj_save   ;   nlej = nlej_save
263      ENDIF
264#endif
265      !
266   END SUBROUTINE iom_init
267
268   SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active(field)
269      !!---------------------------------------------------------------------
270      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_var_active  ***
271      !!
272      !! ** Purpose :  enable variable in restart file when writing with XIOS
273      !!---------------------------------------------------------------------
274   CHARACTER(len = *), INTENT(IN) :: field
275   INTEGER :: i
276   LOGICAL :: llis_set
277   CHARACTER(LEN=256) :: clinfo    ! info character
278
279#if defined key_iomput
280   llis_set = .FALSE.
281
282   DO i = 1, max_rst_fields
283       IF(TRIM(rst_wfields(i)%vname) == field) THEN
284          rst_wfields(i)%active = .TRUE.
285          llis_set = .TRUE.
286          EXIT
287       ENDIF
288   ENDDO
289!Warn if variable is not in defined in rst_wfields
290   IF(.NOT.llis_set) THEN
291      WRITE(ctmp1,*) 'iom_set_rstw_var_active: variable ', field ,' is available for writing but not defined' 
292      CALL ctl_stop( 'iom_set_rstw_var_active:', ctmp1 )
293   ENDIF
294#else
295        clinfo = 'iom_set_rstw_var_active: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality'
296        CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo))
297#endif
298
299   END SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active
300
301   SUBROUTINE iom_set_rstr_active()
302      !!---------------------------------------------------------------------
303      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstr_active  ***
304      !!
305      !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for reading restart file,
306      !!               enable variables present in restart file for reading with XIOS
307      !!---------------------------------------------------------------------
308
309!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file
310   CHARACTER(len=256) :: rst_file
311
312#if defined key_iomput
313   TYPE(xios_field) :: field_hdl
314   TYPE(xios_file) :: file_hdl
315   TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl
316   INTEGER :: i
317   CHARACTER(lc)  ::   clpath
318
319        clpath = TRIM(cn_ocerst_indir)
320        IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/'
321        IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
322           rst_file = TRIM(clpath)//TRIM(cn_ocerst_in)
323        ELSE
324           rst_file = TRIM(clpath)//'1_'//TRIM(cn_ocerst_in)
325        ENDIF
326!set name of the restart file and enable available fields
327        if(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS) to: ',rst_file
328        CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl )
329        CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'rrestart')
330        CALL xios_set_file_attr( "rrestart", name=trim(rst_file), type="one_file", &
331             par_access="collective", enabled=.TRUE., mode="read",                 &
332             output_freq=xios_timestep)
333!define variables for restart context
334        DO i = 1, max_rst_fields
335         IF( TRIM(rst_rfields(i)%vname) /= "NO_NAME") THEN
336           IF( iom_varid( numror, TRIM(rst_rfields(i)%vname), ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
337                CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_rfields(i)%vname))
338                SELECT CASE (TRIM(rst_rfields(i)%grid))
339                 CASE ("grid_N_3D")
340                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
341                        domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", operation = "instant")
342                 CASE ("grid_N")
343                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
344                        domain_ref="grid_N", operation = "instant") 
345                CASE ("grid_vector")
346                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
347                         axis_ref="nav_lev", operation = "instant")
348                 CASE ("grid_scalar")
349                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
350                        scalar_ref = "grid_scalar", operation = "instant")
351                END SELECT
352                IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS read: ', TRIM(rst_rfields(i)%vname), ' enabled in ', TRIM(rst_file)
353           ENDIF
354         ENDIF
355        END DO
356#endif
357   END SUBROUTINE iom_set_rstr_active
358
359   SUBROUTINE iom_set_rstw_core(cdmdl)
360      !!---------------------------------------------------------------------
361      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_core  ***
362      !!
363      !! ** Purpose :  set variables which are always in restart file
364      !!---------------------------------------------------------------------
365   CHARACTER (len=*), INTENT (IN) :: cdmdl ! model OPA or SAS
366   CHARACTER(LEN=256)             :: clinfo    ! info character
367#if defined key_iomput
368   IF(cdmdl == "OPA") THEN
369!from restart.F90
370   CALL iom_set_rstw_var_active("rdt")
371   CALL iom_set_rstw_var_active("neos")
372
373   IF ( .NOT. ln_diurnal_only ) THEN
374        CALL iom_set_rstw_var_active('ub'  )
375        CALL iom_set_rstw_var_active('vb'  )
376        CALL iom_set_rstw_var_active('tb'  )
377        CALL iom_set_rstw_var_active('sb'  )
378        CALL iom_set_rstw_var_active('sshb')
379        !
380        CALL iom_set_rstw_var_active('un'  )
381        CALL iom_set_rstw_var_active('vn'  )
382        CALL iom_set_rstw_var_active('tn'  )
383        CALL iom_set_rstw_var_active('sn'  )
384        CALL iom_set_rstw_var_active('sshn')
385        CALL iom_set_rstw_var_active('rhop')
386      ENDIF
387      IF(ln_diurnal) CALL iom_set_rstw_var_active('Dsst')
388!from trasbc.F90
389         CALL iom_set_rstw_var_active('sbc_hc_b')
390         CALL iom_set_rstw_var_active('sbc_sc_b')
391   ENDIF
392#else
393        clinfo = 'iom_set_rstw_core: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality'
394        CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo))
395#endif
396   END SUBROUTINE iom_set_rstw_core
397
398   SUBROUTINE iom_set_rst_vars(fields)
399      !!---------------------------------------------------------------------
400      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rst_vars   ***
401      !!
402      !! ** Purpose :  Fill array fields with the information about all
403      !!               possible variables and corresponding grids definition
404      !!               for reading/writing restart with XIOS
405      !!---------------------------------------------------------------------
406   TYPE(RST_FIELD), INTENT(INOUT) :: fields(max_rst_fields)
407   INTEGER :: i
408
409        i = 0
410        i = i + 1; fields(i)%vname="rdt";            fields(i)%grid="grid_scalar"
411        i = i + 1; fields(i)%vname="neos";           fields(i)%grid="grid_scalar"
412        i = i + 1; fields(i)%vname="un";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
413        i = i + 1; fields(i)%vname="ub";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
414        i = i + 1; fields(i)%vname="vn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
415        i = i + 1; fields(i)%vname="vb";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
416        i = i + 1; fields(i)%vname="tn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
417        i = i + 1; fields(i)%vname="tb";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
418        i = i + 1; fields(i)%vname="sn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
419        i = i + 1; fields(i)%vname="sb";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
420        i = i + 1; fields(i)%vname="sshn";           fields(i)%grid="grid_N"
421        i = i + 1; fields(i)%vname="sshb";           fields(i)%grid="grid_N"
422        i = i + 1; fields(i)%vname="rhop";           fields(i)%grid="grid_N_3D"
423        i = i + 1; fields(i)%vname="kt";             fields(i)%grid="grid_scalar"
424        i = i + 1; fields(i)%vname="ndastp";         fields(i)%grid="grid_scalar"
425        i = i + 1; fields(i)%vname="adatrj";         fields(i)%grid="grid_scalar"
426        i = i + 1; fields(i)%vname="utau_b";         fields(i)%grid="grid_N"
427        i = i + 1; fields(i)%vname="vtau_b";         fields(i)%grid="grid_N"
428        i = i + 1; fields(i)%vname="qns_b";          fields(i)%grid="grid_N"
429        i = i + 1; fields(i)%vname="emp_b";          fields(i)%grid="grid_N"
430        i = i + 1; fields(i)%vname="sfx_b";          fields(i)%grid="grid_N"
431        i = i + 1; fields(i)%vname="en" ;            fields(i)%grid="grid_N_3D" 
432        i = i + 1; fields(i)%vname="avt_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D"
433        i = i + 1; fields(i)%vname="avm_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D"
434        i = i + 1; fields(i)%vname="dissl";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
435        i = i + 1; fields(i)%vname="sbc_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
436        i = i + 1; fields(i)%vname="sbc_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
437        i = i + 1; fields(i)%vname="qsr_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N_3D"
438        i = i + 1; fields(i)%vname="fraqsr_1lev";    fields(i)%grid="grid_N"
439        i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass"
440                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
441        i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_timelapsed"
442                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
443        i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass_roc"
444                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
445        i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass"
446                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
447        i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_timelapsed"
448                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
449        i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass_roc"
450                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
451        i = i + 1; fields(i)%vname="frc_v";          fields(i)%grid="grid_scalar"
452        i = i + 1; fields(i)%vname="frc_t";          fields(i)%grid="grid_scalar"
453        i = i + 1; fields(i)%vname="frc_s";          fields(i)%grid="grid_scalar"
454        i = i + 1; fields(i)%vname="frc_wn_t";       fields(i)%grid="grid_scalar"
455        i = i + 1; fields(i)%vname="frc_wn_s";       fields(i)%grid="grid_scalar"
456        i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_ini";        fields(i)%grid="grid_N"
457        i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_ini";        fields(i)%grid="grid_N_3D"
458        i = i + 1; fields(i)%vname="hc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D"
459        i = i + 1; fields(i)%vname="sc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D"
460        i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_hc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N"
461        i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_sc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N"
462        i = i + 1; fields(i)%vname="tilde_e3t_b";    fields(i)%grid="grid_N"
463        i = i + 1; fields(i)%vname="tilde_e3t_n";    fields(i)%grid="grid_N"
464        i = i + 1; fields(i)%vname="hdiv_lf";        fields(i)%grid="grid_N"
465        i = i + 1; fields(i)%vname="ub2_b";          fields(i)%grid="grid_N"
466        i = i + 1; fields(i)%vname="vb2_b";          fields(i)%grid="grid_N"
467        i = i + 1; fields(i)%vname="sshbb_e";        fields(i)%grid="grid_N"
468        i = i + 1; fields(i)%vname="ubb_e";          fields(i)%grid="grid_N"
469        i = i + 1; fields(i)%vname="vbb_e";          fields(i)%grid="grid_N"
470        i = i + 1; fields(i)%vname="sshb_e";         fields(i)%grid="grid_N"
471        i = i + 1; fields(i)%vname="ub_e";           fields(i)%grid="grid_N"
472        i = i + 1; fields(i)%vname="vb_e";           fields(i)%grid="grid_N"
473        i = i + 1; fields(i)%vname="fwf_isf_b";      fields(i)%grid="grid_N"
474        i = i + 1; fields(i)%vname="isf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
475        i = i + 1; fields(i)%vname="isf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
476        i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_ibb";        fields(i)%grid="grid_N"
477        i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_b";          fields(i)%grid="grid_N"
478        i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
479        i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
480        i = i + 1; fields(i)%vname="nn_fsbc";        fields(i)%grid="grid_scalar"
481        i = i + 1; fields(i)%vname="ssu_m";          fields(i)%grid="grid_N"
482        i = i + 1; fields(i)%vname="ssv_m";          fields(i)%grid="grid_N"
483        i = i + 1; fields(i)%vname="sst_m";          fields(i)%grid="grid_N"
484        i = i + 1; fields(i)%vname="sss_m";          fields(i)%grid="grid_N"
485        i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_m";          fields(i)%grid="grid_N"
486        i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_m";          fields(i)%grid="grid_N"
487        i = i + 1; fields(i)%vname="frq_m";          fields(i)%grid="grid_N"
488        i = i + 1; fields(i)%vname="avmb";           fields(i)%grid="grid_vector"
489        i = i + 1; fields(i)%vname="avtb";           fields(i)%grid="grid_vector"
490        i = i + 1; fields(i)%vname="ub2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N"
491        i = i + 1; fields(i)%vname="vb2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N"
492        i = i + 1; fields(i)%vname="ntime";          fields(i)%grid="grid_scalar"
493        i = i + 1; fields(i)%vname="Dsst";           fields(i)%grid="grid_scalar"
494        i = i + 1; fields(i)%vname="tmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
495        i = i + 1; fields(i)%vname="umask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
496        i = i + 1; fields(i)%vname="vmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
497        i = i + 1; fields(i)%vname="smask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
498        i = i + 1; fields(i)%vname="gdepw_n";        fields(i)%grid="grid_N_3D"
499        i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
500        i = i + 1; fields(i)%vname="e3u_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
501        i = i + 1; fields(i)%vname="e3v_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
502        i = i + 1; fields(i)%vname="surf_ini";       fields(i)%grid="grid_N"
503        i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_b";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
504        i = i + 1; fields(i)%vname="hmxl_n";         fields(i)%grid="grid_N_3D"
505        i = i + 1; fields(i)%vname="un_bf";          fields(i)%grid="grid_N"
506        i = i + 1; fields(i)%vname="vn_bf";          fields(i)%grid="grid_N"
507        i = i + 1; fields(i)%vname="hbl";            fields(i)%grid="grid_N"
508        i = i + 1; fields(i)%vname="hbli";           fields(i)%grid="grid_N"
509        i = i + 1; fields(i)%vname="wn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
510
511        IF( i-1 > max_rst_fields) THEN
512           WRITE(ctmp1,*) 'E R R O R : iom_set_rst_vars SIZE of RST_FIELD array is too small'
513           CALL ctl_stop( 'iom_set_rst_vars:', ctmp1 )
514        ENDIF
515   END SUBROUTINE iom_set_rst_vars
516
517
518   SUBROUTINE iom_set_rstw_active(cdrst_file)
519      !!---------------------------------------------------------------------
520      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rstw_active   ***
521      !!
522      !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for writing restart
523      !!               enable variables present in restart file for writing
524      !!---------------------------------------------------------------------
525!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file
526   CHARACTER(len=*) :: cdrst_file
527#if defined key_iomput
528   TYPE(xios_field) :: field_hdl
529   TYPE(xios_file) :: file_hdl
530   TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl
531   INTEGER :: i
532   CHARACTER(lc)  ::   clpath
533
534!set name of the restart file and enable available fields
535        IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS write) to: ',cdrst_file
536        CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl )
537        CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'wrestart')
538        IF(nxioso.eq.1) THEN
539           CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="one_file", enabled=.TRUE.,& 
540                                    mode="write", output_freq=xios_timestep) 
541           if(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in one_file mode' 
542        ELSE 
543           CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="multiple_file", enabled=.TRUE.,& 
544                                    mode="write", output_freq=xios_timestep) 
545           if(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in multiple_file mode' 
546        ENDIF
547        CALL xios_set_file_attr( "wrestart", name=trim(cdrst_file))
548!define fields for restart context
549        DO i = 1, max_rst_fields
550         IF( rst_wfields(i)%active ) THEN
551                CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_wfields(i)%vname))
552                SELECT CASE (TRIM(rst_wfields(i)%grid))
553                 CASE ("grid_N_3D")
554                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), &
555                        domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant")
556                 CASE ("grid_N")
557                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), &
558                        domain_ref="grid_N", prec = 8, operation = "instant") 
559                 CASE ("grid_vector")
560                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), &
561                         axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant")
562                 CASE ("grid_scalar")
563                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), &
564                        scalar_ref = "grid_scalar", prec = 8, operation = "instant")
565                END SELECT
566         ENDIF
567        END DO
568#endif
569   END SUBROUTINE iom_set_rstw_active
570
571   SUBROUTINE iom_set_rst_context(ld_rstr) 
572     !!---------------------------------------------------------------------
573      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rst_context  ***
574      !!
575      !! ** Purpose : Define domain, axis and grid for restart (read/write)
576      !!              context
577      !!               
578      !!---------------------------------------------------------------------
579   LOGICAL, INTENT(IN)               :: ld_rstr
580!ld_rstr is true for restart context. There is no need to define grid for
581!restart read, because it's read from file
582#if defined key_iomput
583   TYPE(xios_domaingroup)            :: domaingroup_hdl 
584   TYPE(xios_domain)                 :: domain_hdl 
585   TYPE(xios_axisgroup)              :: axisgroup_hdl 
586   TYPE(xios_axis)                   :: axis_hdl 
587   TYPE(xios_scalar)                 :: scalar_hdl 
588   TYPE(xios_scalargroup)            :: scalargroup_hdl 
589
590     CALL xios_get_handle("domain_definition",domaingroup_hdl) 
591     CALL xios_add_child(domaingroup_hdl, domain_hdl, "grid_N") 
592     CALL set_grid("N", glamt, gphit, .TRUE., ld_rstr) 
593 
594     CALL xios_get_handle("axis_definition",axisgroup_hdl) 
595     CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nav_lev") 
596!AGRIF fails to compile when unit= is in call to xios_set_axis_attr
597!    CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels",  unit="m", positive="down")
598     CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels in meters", positive="down")
599     CALL iom_set_axis_attr( "nav_lev", paxis = gdept_1d ) 
600
601     CALL xios_get_handle("scalar_definition", scalargroup_hdl) 
602     CALL xios_add_child(scalargroup_hdl, scalar_hdl, "grid_scalar") 
603#endif
604   END SUBROUTINE iom_set_rst_context
605
606   SUBROUTINE iom_swap( cdname )
607      !!---------------------------------------------------------------------
608      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_swap  ***
609      !!
610      !! ** Purpose :  swap context between different agrif grid for xmlio_server
611      !!---------------------------------------------------------------------
612      CHARACTER(len=*), INTENT(in) :: cdname
613#if defined key_iomput
614      TYPE(xios_context) :: nemo_hdl
615
616      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
617        CALL xios_get_handle(TRIM(cdname),nemo_hdl)
618      ELSE
619        CALL xios_get_handle(TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname),nemo_hdl)
620      ENDIF
621      !
622      CALL xios_set_current_context(nemo_hdl)
623#endif
624      !
625   END SUBROUTINE iom_swap
626
627
628   SUBROUTINE iom_open( cdname, kiomid, ldwrt, kdom, ldstop, ldiof, kdlev )
629      !!---------------------------------------------------------------------
630      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
631      !!
632      !! ** Purpose :  open an input file (return 0 if not found)
633      !!---------------------------------------------------------------------
634      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )           ::   cdname   ! File name
635      INTEGER         , INTENT(  out)           ::   kiomid   ! iom identifier of the opened file
636      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldwrt    ! open in write modeb          (default = .FALSE.)
637      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdom     ! Type of domain to be written (default = jpdom_local_noovlap)
638      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if open to read a non-existing file (default = .TRUE.)
639      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldiof    ! Interp On the Fly, needed for AGRIF (default = .FALSE.)
640      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdlev    ! number of vertical levels
641      !
642      CHARACTER(LEN=256)    ::   clname    ! the name of the file based on cdname [[+clcpu]+clcpu]
643      CHARACTER(LEN=256)    ::   cltmpn    ! tempory name to store clname (in writting mode)
644      CHARACTER(LEN=10)     ::   clsuffix  ! ".nc"
645      CHARACTER(LEN=15)     ::   clcpu     ! the cpu number (max jpmax_digits digits)
646      CHARACTER(LEN=256)    ::   clinfo    ! info character
647      LOGICAL               ::   llok      ! check the existence
648      LOGICAL               ::   llwrt     ! local definition of ldwrt
649      LOGICAL               ::   llnoov    ! local definition to read overlap
650      LOGICAL               ::   llstop    ! local definition of ldstop
651      LOGICAL               ::   lliof     ! local definition of ldiof
652      INTEGER               ::   icnt      ! counter for digits in clcpu (max = jpmax_digits)
653      INTEGER               ::   iln, ils  ! lengths of character
654      INTEGER               ::   idom      ! type of domain
655      INTEGER               ::   istop     !
656      INTEGER, DIMENSION(2,5) ::   idompar ! domain parameters:
657      ! local number of points for x,y dimensions
658      ! position of first local point for x,y dimensions
659      ! position of last local point for x,y dimensions
660      ! start halo size for x,y dimensions
661      ! end halo size for x,y dimensions
662      !---------------------------------------------------------------------
663      ! Initializations and control
664      ! =============
665      kiomid = -1
666      clinfo = '                    iom_open ~~~  '
667      istop = nstop
668      ! if iom_open is called for the first time: initialize iom_file(:)%nfid to 0
669      ! (could be done when defining iom_file in f95 but not in f90)
670      IF( Agrif_Root() ) THEN
671         IF( iom_open_init == 0 ) THEN
672            iom_file(:)%nfid = 0
673            iom_open_init = 1
674         ENDIF
675      ENDIF
676      ! do we read or write the file?
677      IF( PRESENT(ldwrt) ) THEN   ;   llwrt = ldwrt
678      ELSE                        ;   llwrt = .FALSE.
679      ENDIF
680      ! do we call ctl_stop if we try to open a non-existing file in read mode?
681      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
682      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
683      ENDIF
684      ! are we using interpolation on the fly?
685      IF( PRESENT(ldiof) ) THEN   ;   lliof = ldiof
686      ELSE                        ;   lliof = .FALSE.
687      ENDIF
688      ! do we read the overlap
689      ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
690      llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif
691      ! create the file name by added, if needed, TRIM(Agrif_CFixed()) and TRIM(clsuffix)
692      ! =============
693      clname   = trim(cdname)
694      IF ( .NOT. Agrif_Root() .AND. .NOT. lliof ) THEN
695!FUS         iln    = INDEX(clname,'/')
696         iln    = INDEX(clname,'/',BACK=.true.)  ! FUS: to insert the nest index at the right location within the string, the last / has to be found (search from the right to left)
697         cltmpn = clname(1:iln)
698         clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
699         clname=TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
700      ENDIF
701      ! which suffix should we use?
702      clsuffix = '.nc'
703      ! Add the suffix if needed
704      iln = LEN_TRIM(clname)
705      ils = LEN_TRIM(clsuffix)
706      IF( iln <= ils .OR. INDEX( TRIM(clname), TRIM(clsuffix), back = .TRUE. ) /= iln - ils + 1 )   &
707         &   clname = TRIM(clname)//TRIM(clsuffix)
708      cltmpn = clname   ! store this name
709      ! try to find if the file to be opened already exist
710      ! =============
711      INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
712      IF( .NOT.llok ) THEN
713         ! we try to add the cpu number to the name
714         WRITE(clcpu,*) narea-1
715
716         clcpu  = TRIM(ADJUSTL(clcpu))
717         iln = INDEX(clname,TRIM(clsuffix), back = .TRUE.)
718         clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
719         icnt = 0
720         INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok ) 
721         ! we try different formats for the cpu number by adding 0
722         DO WHILE( .NOT.llok .AND. icnt < jpmax_digits )
723            clcpu  = "0"//trim(clcpu)
724            clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
725            INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
726            icnt = icnt + 1
727         END DO
728      ELSE
729         lxios_sini = .TRUE.
730      ENDIF
731      IF( llwrt ) THEN
732         ! check the domain definition
733! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
734!         idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
735         IF( llnoov ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
736         ELSE                ;   idom = jpdom_local_full      ! default definition
737         ENDIF
738         IF( PRESENT(kdom) )   idom = kdom
739         ! create the domain informations
740         ! =============
741         SELECT CASE (idom)
742         CASE (jpdom_local_full)
743            idompar(:,1) = (/ jpi             , jpj              /)
744            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
745            idompar(:,3) = (/ nimpp + jpi - 1 , njmpp + jpj - 1  /)
746            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
747            idompar(:,5) = (/ jpi - nlei      , jpj - nlej       /)
748         CASE (jpdom_local_noextra)
749            idompar(:,1) = (/ nlci            , nlcj             /)
750            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
751            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlci - 1, njmpp + nlcj - 1 /)
752            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
753            idompar(:,5) = (/ nlci - nlei     , nlcj - nlej      /)
754         CASE (jpdom_local_noovlap)
755            idompar(:,1) = (/ nlei  - nldi + 1, nlej  - nldj + 1 /)
756            idompar(:,2) = (/ nimpp + nldi - 1, njmpp + nldj - 1 /)
757            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlei - 1, njmpp + nlej - 1 /)
758            idompar(:,4) = (/ 0               , 0                /)
759            idompar(:,5) = (/ 0               , 0                /)
760         CASE DEFAULT
761            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'wrong value of kdom, only jpdom_local* cases are accepted' )
762         END SELECT
763      ENDIF
764      ! Open the NetCDF file
765      ! =============
766      ! do we have some free file identifier?
767      IF( MINVAL(iom_file(:)%nfid) /= 0 )   &
768         &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'No more free file identifier', 'increase jpmax_files in iom_def' )
769      ! if no file was found...
770      IF( .NOT. llok ) THEN
771         IF( .NOT. llwrt ) THEN   ! we are in read mode
772            IF( llstop ) THEN   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'File '//TRIM(cltmpn)//'* not found' )
773            ELSE                ;   istop = nstop + 1   ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
774            ENDIF
775         ELSE                     ! we are in write mode so we
776            clname = cltmpn       ! get back the file name without the cpu number
777         ENDIF
778      ELSE
779         IF( llwrt .AND. .NOT. ln_clobber ) THEN   ! we stop as we want to write in a new file
780            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'We want to write in a new file but '//TRIM(clname)//' already exists...' )
781            istop = nstop + 1                      ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
782         ELSEIF( llwrt ) THEN     ! the file exists and we are in write mode with permission to
783            clname = cltmpn       ! overwrite so get back the file name without the cpu number
784         ENDIF
785      ENDIF
786      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
787         CALL iom_nf90_open( clname, kiomid, llwrt, llok, idompar, kdlev = kdlev )
788      ENDIF
789      !
790   END SUBROUTINE iom_open
791
792
793   SUBROUTINE iom_close( kiomid )
794      !!--------------------------------------------------------------------
795      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_close  ***
796      !!
797      !! ** Purpose : close an input file, or all files opened by iom
798      !!--------------------------------------------------------------------
799      INTEGER, INTENT(inout), OPTIONAL ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
800      !                                              ! return 0 when file is properly closed
801      !                                              ! No argument: all files opened by iom are closed
802
803      INTEGER ::   jf         ! dummy loop indices
804      INTEGER ::   i_s, i_e   ! temporary integer
805      CHARACTER(LEN=100)    ::   clinfo    ! info character
806      !---------------------------------------------------------------------
807      !
808      IF( iom_open_init == 0 )   RETURN   ! avoid to use iom_file(jf)%nfid that us not yet initialized
809      !
810      clinfo = '                    iom_close ~~~  '
811      IF( PRESENT(kiomid) ) THEN
812         i_s = kiomid
813         i_e = kiomid
814      ELSE
815         i_s = 1
816         i_e = jpmax_files
817      ENDIF
818
819      IF( i_s > 0 ) THEN
820         DO jf = i_s, i_e
821            IF( iom_file(jf)%nfid > 0 ) THEN
822               CALL iom_nf90_close( jf )
823               iom_file(jf)%nfid       = 0          ! free the id
824               IF( PRESENT(kiomid) )   kiomid = 0   ! return 0 as id to specify that the file was closed
825               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' close file: '//TRIM(iom_file(jf)%name)//' ok'
826            ELSEIF( PRESENT(kiomid) ) THEN
827               WRITE(ctmp1,*) '--->',  kiomid
828               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' Invalid file identifier', ctmp1 )
829            ENDIF
830         END DO
831      ENDIF
832      !   
833   END SUBROUTINE iom_close
834
835
836   FUNCTION iom_varid ( kiomid, cdvar, kdimsz, kndims, lduld, ldstop ) 
837      !!-----------------------------------------------------------------------
838      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
839      !!
840      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file (return 0 if not found)
841      !!-----------------------------------------------------------------------
842      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
843      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
844      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of each dimension
845      INTEGER              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! number of dimensions
846      LOGICAL              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   lduld    ! true if the last dimension is unlimited (time)
847      LOGICAL              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if looking for non-existing variable (default = .TRUE.)
848      !
849      INTEGER                        ::   iom_varid, iiv, i_nvd
850      LOGICAL                        ::   ll_fnd
851      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo                   ! info character
852      LOGICAL                        ::   llstop                   ! local definition of ldstop
853      !!-----------------------------------------------------------------------
854      iom_varid = 0                         ! default definition
855      ! do we call ctl_stop if we look for non-existing variable?
856      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
857      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
858      ENDIF
859      !
860      IF( kiomid > 0 ) THEN
861         clinfo = 'iom_varid, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(cdvar)
862         IF( iom_file(kiomid)%nfid == 0 ) THEN
863            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the file is not open' )
864         ELSE
865            ll_fnd  = .FALSE.
866            iiv = 0
867            !
868            DO WHILE ( .NOT.ll_fnd .AND. iiv < iom_file(kiomid)%nvars )
869               iiv = iiv + 1
870               ll_fnd  = ( TRIM(cdvar) == TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(iiv)) )
871            END DO
872            !
873            IF( .NOT.ll_fnd ) THEN
874               iiv = iiv + 1
875               IF( iiv <= jpmax_vars ) THEN
876                  iom_varid = iom_nf90_varid( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz, kndims, lduld )
877               ELSE
878                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'Too many variables in the file '//iom_file(kiomid)%name,   &
879                        &                      'increase the parameter jpmax_vars')
880               ENDIF
881               IF( llstop .AND. iom_varid == -1 )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' not found' ) 
882            ELSE
883               iom_varid = iiv
884               IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
885                  i_nvd = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
886                  IF( i_nvd <= size(kdimsz) ) THEN
887                     kdimsz(1:i_nvd) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,iiv)
888                  ELSE
889                     WRITE(ctmp1,*) i_nvd, size(kdimsz)
890                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'error in kdimsz size'//trim(ctmp1) )
891                  ENDIF
892               ENDIF
893               IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
894               IF( PRESENT( lduld) )  lduld  = iom_file(kiomid)%luld( iiv)
895            ENDIF
896         ENDIF
897      ENDIF
898      !
899   END FUNCTION iom_varid
900
901
902   !!----------------------------------------------------------------------
903   !!                   INTERFACE iom_get
904   !!----------------------------------------------------------------------
905   SUBROUTINE iom_g0d( kiomid, cdvar, pvar, ktime, ldxios )
906      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
907      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable
908      REAL(wp)        , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
909      INTEGER         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ktime     ! record number
910      LOGICAL         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ldxios    ! use xios to read restart
911      !
912      INTEGER                                         ::   idvar     ! variable id
913      INTEGER                                         ::   idmspc    ! number of spatial dimensions
914      INTEGER         , DIMENSION(1)                  ::   itime     ! record number
915      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clinfo    ! info character
916      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clname    ! file name
917      CHARACTER(LEN=1)                                ::   cldmspc   !
918      LOGICAL                                         ::   llxios
919      !
920      llxios = .FALSE.
921      IF( PRESENT(ldxios) ) llxios = ldxios
922
923      IF(.NOT.llxios) THEN  ! read data using default library
924         itime = 1
925         IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
926         !
927         clname = iom_file(kiomid)%name
928         clinfo = '          iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
929         !
930         IF( kiomid > 0 ) THEN
931            idvar = iom_varid( kiomid, cdvar )
932            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 .AND. idvar > 0 ) THEN
933               idmspc = iom_file ( kiomid )%ndims( idvar )
934               IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )  idmspc = idmspc - 1
935               WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
936               IF( idmspc > 0 )  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'When reading to a 0D array, we do not accept data', &
937                                    &                         'with 1 or more spatial dimensions: '//cldmspc//' were found.' , &
938                                    &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
939               CALL iom_nf90_get( kiomid, idvar, pvar, itime )
940            ENDIF
941         ENDIF
942      ELSE
943#if defined key_iomput
944         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (0D): ', trim(cdvar)
945         CALL iom_swap( TRIM(crxios_context) )
946         CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pvar)
947         CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )
948#else
949         WRITE(ctmp1,*) 'Can not use XIOS in iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar)
950         CALL ctl_stop( 'iom_g0d', ctmp1 )
951#endif
952      ENDIF
953   END SUBROUTINE iom_g0d
954
955   SUBROUTINE iom_g1d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, ldxios )
956      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file
957      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read
958      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                         ::   cdvar     ! Name of the variable
959      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:)           ::   pvar      ! read field
960      INTEGER         , INTENT(in   )              , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
961      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
962      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
963      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS
964      !
965      IF( kiomid > 0 ) THEN
966         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=pvar,   &
967              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
968              &                                                     ldxios=ldxios )
969      ENDIF
970   END SUBROUTINE iom_g1d
971
972   SUBROUTINE iom_g2d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, ldxios)
973      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kiomid    ! Identifier of the file
974      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kdom      ! Type of domain to be read
975      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                           ::   cdvar     ! Name of the variable
976      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:)           ::   pvar      ! read field
977      INTEGER         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
978      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
979      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
980      LOGICAL         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
981                                                                               ! look for and use a file attribute
982                                                                               ! called open_ocean_jstart to set the start
983                                                                               ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
984      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios      ! read data using XIOS
985      !
986      IF( kiomid > 0 ) THEN
987         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r2d=pvar,   &
988              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
989              &                                                     lrowattr=lrowattr,  ldxios=ldxios)
990      ENDIF
991   END SUBROUTINE iom_g2d
992
993   SUBROUTINE iom_g3d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, ldxios )
994      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kiomid    ! Identifier of the file
995      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kdom      ! Type of domain to be read
996      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                             ::   cdvar     ! Name of the variable
997      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:,:)           ::   pvar      ! read field
998      INTEGER         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
999      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
1000      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
1001      LOGICAL         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
1002                                                                                 ! look for and use a file attribute
1003                                                                                 ! called open_ocean_jstart to set the start
1004                                                                                 ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1005      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios        ! read data using XIOS
1006      !
1007      IF( kiomid > 0 ) THEN
1008         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r3d=pvar,   &
1009              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
1010              &                                                     lrowattr=lrowattr, ldxios=ldxios )
1011      ENDIF
1012   END SUBROUTINE iom_g3d
1013   !!----------------------------------------------------------------------
1014
1015   SUBROUTINE iom_get_123d( kiomid, kdom  , cdvar ,   &
1016         &                  pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d,   &
1017         &                  ktime , kstart, kcount,   &
1018         &                  lrowattr, ldxios        )
1019      !!-----------------------------------------------------------------------
1020      !!                  ***  ROUTINE  iom_get_123d  ***
1021      !!
1022      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable
1023      !!
1024      !! ** Method : read ONE record at each CALL
1025      !!-----------------------------------------------------------------------
1026      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid     ! Identifier of the file
1027      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kdom       ! Type of domain to be read
1028      CHARACTER(len=*)           , INTENT(in   )           ::   cdvar      ! Name of the variable
1029      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d     ! read field (1D case)
1030      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d     ! read field (2D case)
1031      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d     ! read field (3D case)
1032      INTEGER                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ktime      ! record number
1033      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kstart     ! start position of the reading in each axis
1034      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kcount     ! number of points to be read in each axis
1035      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   lrowattr   ! logical flag telling iom_get to
1036                                                                           ! look for and use a file attribute
1037                                                                           ! called open_ocean_jstart to set the start
1038                                                                           ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1039      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldxios     ! use XIOS to read restart
1040      !
1041      LOGICAL                        ::   llxios       ! local definition for XIOS read
1042      LOGICAL                        ::   llnoov      ! local definition to read overlap
1043      LOGICAL                        ::   luse_jattr  ! local definition to read open_ocean_jstart file attribute
1044      INTEGER                        ::   jstartrow   ! start point for 2nd dimension optionally set by file attribute
1045      INTEGER                        ::   jl          ! loop on number of dimension
1046      INTEGER                        ::   idom        ! type of domain
1047      INTEGER                        ::   idvar       ! id of the variable
1048      INTEGER                        ::   inbdim      ! number of dimensions of the variable
1049      INTEGER                        ::   idmspc      ! number of spatial dimensions
1050      INTEGER                        ::   itime       ! record number
1051      INTEGER                        ::   istop       ! temporary value of nstop
1052      INTEGER                        ::   ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes
1053      INTEGER                        ::   ji, jj      ! loop counters
1054      INTEGER                        ::   irankpv     !
1055      INTEGER                        ::   ind1, ind2  ! substring index
1056      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   istart      ! starting point to read for each axis
1057      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   icnt        ! number of value to read along each axis
1058      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimsz      ! size of the dimensions of the variable
1059      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   ishape      ! size of the dimensions of the variable
1060      REAL(wp)                       ::   zscf, zofs  ! sacle_factor and add_offset
1061      INTEGER                        ::   itmp        ! temporary integer
1062      CHARACTER(LEN=256)             ::   clinfo      ! info character
1063      CHARACTER(LEN=256)             ::   clname      ! file name
1064      CHARACTER(LEN=1)               ::   clrankpv, cldmspc      !
1065      LOGICAL                        ::   ll_depth_spec ! T => if kstart, kcount present then *only* use values for 3rd spatial dimension.
1066      INTEGER                        ::   inlev       ! number of levels for 3D data
1067      REAL(wp)                       ::   gma, gmi
1068      !---------------------------------------------------------------------
1069      !
1070      inlev = -1
1071      IF( PRESENT(pv_r3d) )   inlev = SIZE(pv_r3d, 3)
1072      !
1073      llxios = .FALSE.
1074      if(PRESENT(ldxios)) llxios = ldxios
1075      idvar = iom_varid( kiomid, cdvar ) 
1076      idom = kdom
1077      !
1078      IF(.NOT.llxios) THEN
1079         clname = iom_file(kiomid)%name   !   esier to read
1080         clinfo = '          iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
1081         ! local definition of the domain ?
1082         ! do we read the overlap
1083         ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
1084         llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
1085         ! check kcount and kstart optionals parameters...
1086         IF( PRESENT(kcount) .AND. (.NOT. PRESENT(kstart)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kcount present needs kstart present')
1087         IF( PRESENT(kstart) .AND. (.NOT. PRESENT(kcount)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kcount present')
1088         IF( PRESENT(kstart) .AND. idom /= jpdom_unknown .AND.  idom /= jpdom_autoglo_xy  ) &
1089     &          CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kdom = jpdom_unknown or kdom = jpdom_autoglo_xy')
1090
1091         luse_jattr = .false.
1092         IF( PRESENT(lrowattr) ) THEN
1093            IF( lrowattr .AND. idom /= jpdom_data   ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'lrowattr present and true needs kdom = jpdom_data')
1094            IF( lrowattr .AND. idom == jpdom_data   ) luse_jattr = .true.
1095         ENDIF
1096
1097         ! Search for the variable in the data base (eventually actualize data)
1098         istop = nstop
1099         !
1100         IF( idvar > 0 ) THEN
1101            ! to write iom_file(kiomid)%dimsz in a shorter way !
1102            idimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(:, idvar) 
1103            inbdim = iom_file(kiomid)%ndims(idvar)            ! number of dimensions in the file
1104            idmspc = inbdim                                   ! number of spatial dimensions in the file
1105            IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   idmspc = inbdim - 1
1106            IF( idmspc > 3 )   CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'the file has more than 3 spatial dimensions this case is not coded...') 
1107            !
1108            ! update idom definition...
1109            ! Identify the domain in case of jpdom_auto(glo/dta) definition
1110            IF( idom == jpdom_autoglo_xy ) THEN
1111               ll_depth_spec = .TRUE.
1112               idom = jpdom_autoglo
1113            ELSE
1114               ll_depth_spec = .FALSE.
1115            ENDIF
1116            IF( idom == jpdom_autoglo .OR. idom == jpdom_autodta ) THEN           
1117               IF( idom == jpdom_autoglo ) THEN   ;   idom = jpdom_global 
1118               ELSE                               ;   idom = jpdom_data
1119               ENDIF
1120               ind1 = INDEX( clname, '_', back = .TRUE. ) + 1
1121               ind2 = INDEX( clname, '.', back = .TRUE. ) - 1
1122               IF( ind2 > ind1 ) THEN   ;   IF( VERIFY( clname(ind1:ind2), '0123456789' ) == 0 )   idom = jpdom_local   ;   ENDIF
1123            ENDIF
1124            ! Identify the domain in case of jpdom_local definition
1125            IF( idom == jpdom_local ) THEN
1126               IF(     idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN   ;   idom = jpdom_local_full
1127               ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noextra
1128               ELSEIF( idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap
1129               ELSE   ;   CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'impossible to identify the local domain' )
1130               ENDIF
1131            ENDIF
1132            !
1133            ! check the consistency between input array and data rank in the file
1134            !
1135            ! initializations
1136            itime = 1
1137            IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
1138            !
1139            irankpv = 1 * COUNT( (/PRESENT(pv_r1d)/) ) + 2 * COUNT( (/PRESENT(pv_r2d)/) ) + 3 * COUNT( (/PRESENT(pv_r3d)/) )
1140            WRITE(clrankpv, fmt='(i1)') irankpv
1141            WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
1142            !
1143            IF(     idmspc <  irankpv ) THEN
1144               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'The file has only '//cldmspc//' spatial dimension',   &
1145                  &                         'it is impossible to read a '//clrankpv//'D array from this file...' )
1146            ELSEIF( idmspc == irankpv ) THEN
1147               IF( PRESENT(pv_r1d) .AND. idom /= jpdom_unknown )   &
1148                  &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'case not coded...You must use jpdom_unknown' )
1149            ELSEIF( idmspc >  irankpv ) THEN
1150                  IF( PRESENT(pv_r2d) .AND. itime == 1 .AND. idimsz(3) == 1 .AND. idmspc == 3 ) THEN
1151                     CALL ctl_warn( trim(clinfo), '2D array but 3 spatial dimensions for the data...'              ,   &
1152                           &         'As the size of the z dimension is 1 and as we try to read the first record, ',   &
1153                           &         'we accept this case, even if there is a possible mix-up between z and time dimension' )   
1154                     idmspc = idmspc - 1
1155                  ELSE
1156                     CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'To keep iom lisibility, when reading a '//clrankpv//'D array,'         ,   &
1157                        &                         'we do not accept data with '//cldmspc//' spatial dimensions',   &
1158                        &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
1159                  ENDIF
1160            ENDIF
1161            !
1162            ! definition of istart and icnt
1163            !
1164            icnt  (:) = 1
1165            istart(:) = 1
1166            istart(idmspc+1) = itime
1167   
1168            IF( PRESENT(kstart) .AND. .NOT. ll_depth_spec ) THEN
1169               istart(1:idmspc) = kstart(1:idmspc) 
1170               icnt  (1:idmspc) = kcount(1:idmspc)
1171            ELSE
1172               IF(idom == jpdom_unknown ) THEN
1173                  icnt(1:idmspc) = idimsz(1:idmspc)
1174               ELSE
1175                  IF( .NOT. PRESENT(pv_r1d) ) THEN   !   not a 1D array
1176                     IF(     idom == jpdom_data    ) THEN
1177                        jstartrow = 1
1178                        IF( luse_jattr ) THEN
1179                           CALL iom_getatt(kiomid, 'open_ocean_jstart', jstartrow ) ! -999 is returned if the attribute is not found
1180                           jstartrow = MAX(1,jstartrow)
1181                        ENDIF
1182                        istart(1:2) = (/ mig(1), mjg(1) + jstartrow - 1 /)  ! icnt(1:2) done below
1183                     ELSEIF( idom == jpdom_global  ) THEN ; istart(1:2) = (/ nimpp , njmpp  /)  ! icnt(1:2) done below
1184                     ENDIF
1185                     ! we do not read the overlap                     -> we start to read at nldi, nldj
1186! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1187!                  IF( idom /= jpdom_local_noovlap )   istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1188                     IF( llnoov .AND. idom /= jpdom_local_noovlap ) istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1189                  ! we do not read the overlap and the extra-halos -> from nldi to nlei and from nldj to nlej
1190! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1191!                  icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1192                     IF( llnoov ) THEN   ;   icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1193                     ELSE                ;   icnt(1:2) = (/ nlci           , nlcj            /)
1194                     ENDIF
1195                     IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1196                        IF( idom == jpdom_data ) THEN                        ;                               icnt(3) = inlev
1197                        ELSEIF( ll_depth_spec .AND. PRESENT(kstart) ) THEN   ;   istart(3) = kstart(3)   ;   icnt(3) = kcount(3)
1198                        ELSE                                                 ;                               icnt(3) = inlev
1199                        ENDIF
1200                     ENDIF
1201                  ENDIF
1202               ENDIF
1203            ENDIF
1204
1205            ! check that istart and icnt can be used with this file
1206            !-
1207            DO jl = 1, jpmax_dims
1208               itmp = istart(jl)+icnt(jl)-1
1209               IF( itmp > idimsz(jl) .AND. idimsz(jl) /= 0 ) THEN
1210                  WRITE( ctmp1, FMT="('(istart(', i1, ') + icnt(', i1, ') - 1) = ', i5)" ) jl, jl, itmp
1211                  WRITE( ctmp2, FMT="(' is larger than idimsz(', i1,') = ', i5)"         ) jl, idimsz(jl)
1212                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'start and count too big regarding to the size of the data, ', ctmp1, ctmp2 )     
1213               ENDIF
1214            END DO
1215
1216            ! check that icnt matches the input array
1217            !-     
1218            IF( idom == jpdom_unknown ) THEN
1219               IF( irankpv == 1 )        ishape(1:1) = SHAPE(pv_r1d)
1220               IF( irankpv == 2 )        ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d)
1221               IF( irankpv == 3 )        ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d)
1222               ctmp1 = 'd'
1223            ELSE
1224               IF( irankpv == 2 ) THEN
1225! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1226!               ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  ))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1227                  IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  )) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1228                  ELSE              ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(1   :nlci,1   :nlcj  )) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj)'
1229                  ENDIF
1230               ENDIF
1231               IF( irankpv == 3 ) THEN 
1232! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1233!               ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1234                  IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1235                  ELSE              ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(1   :nlci,1   :nlcj,:)) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj,:)'
1236                  ENDIF
1237               ENDIF
1238            ENDIF
1239         
1240            DO jl = 1, irankpv
1241               WRITE( ctmp2, FMT="(', ', i1,'): ', i5,' /= icnt(', i1,'):', i5)" ) jl, ishape(jl), jl, icnt(jl)
1242               IF( ishape(jl) /= icnt(jl) )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'size(pv_r'//clrankpv//TRIM(ctmp1)//TRIM(ctmp2) )
1243            END DO
1244
1245         ENDIF
1246
1247         ! read the data
1248         !-     
1249         IF( idvar > 0 .AND. istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1250            !
1251         ! find the right index of the array to be read
1252! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1253!         IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1254!         ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1255!         ENDIF
1256            IF( llnoov ) THEN
1257               IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1258               ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1259               ENDIF
1260            ELSE
1261               IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = 1      ;   ix2 = nlci      ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
1262               ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1263               ENDIF
1264            ENDIF
1265     
1266            CALL iom_nf90_get( kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
1267
1268            IF( istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1269               IF(lwp) WRITE(numout,"(10x,' read ',a,' (rec: ',i6,') in ',a,' ok')") TRIM(cdvar), itime, TRIM(iom_file(kiomid)%name)
1270             
1271               !--- overlap areas and extra hallows (mpp)
1272               IF(     PRESENT(pv_r2d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1273                  CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r2d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing )
1274               ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1275                  ! this if could be simplified with the new lbc_lnk that works with any size of the 3rd dimension
1276                  IF( icnt(3) == inlev ) THEN
1277                     CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing )
1278                  ELSE   ! put some arbitrary value (a call to lbc_lnk will be done later...)
1279                     DO jj = nlcj+1, jpj   ;   pv_r3d(1:nlci, jj, :) = pv_r3d(1:nlci, nlej, :)   ;   END DO
1280                     DO ji = nlci+1, jpi   ;   pv_r3d(ji    , : , :) = pv_r3d(nlei  , :   , :)   ;   END DO
1281                  ENDIF
1282               ENDIF
1283               !
1284            ELSE
1285               ! return if istop == nstop is false
1286               RETURN
1287            ENDIF
1288         ELSE
1289            ! return if statment idvar > 0 .AND. istop == nstop is false
1290            RETURN
1291         ENDIF
1292         !
1293      ELSE        ! read using XIOS. Only if KEY_IOMPUT is defined
1294#if defined key_iomput
1295!would be good to be able to check which context is active and swap only if current is not restart
1296         CALL iom_swap( TRIM(crxios_context) ) 
1297         IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1298            pv_r3d(:, :, :) = 0.
1299            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (3D): ',trim(cdvar)
1300            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r3d)
1301            IF(idom /= jpdom_unknown ) then
1302                CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing)
1303            ENDIF
1304         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1305            pv_r2d(:, :) = 0.
1306            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (2D): ', trim(cdvar)
1307            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r2d)
1308            IF(idom /= jpdom_unknown ) THEN
1309                CALL lbc_lnk('iom', pv_r2d,'Z',-999., kfillmode = jpfillnothing)
1310            ENDIF
1311         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1312            pv_r1d(:) = 0.
1313            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (1D): ', trim(cdvar)
1314            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r1d)
1315         ENDIF
1316         CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )
1317#else
1318         istop = istop + 1 
1319         clinfo = 'Can not use XIOS in iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar)
1320#endif
1321      ENDIF
1322!some final adjustments
1323      ! C1D case : always call lbc_lnk to replicate the central value over the whole 3X3 domain
1324      IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r2d) )   CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r2d,'Z',1. )
1325      IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r3d) )   CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z',1. )
1326
1327      !--- Apply scale_factor and offset
1328      zscf = iom_file(kiomid)%scf(idvar)      ! scale factor
1329      zofs = iom_file(kiomid)%ofs(idvar)      ! offset
1330      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1331         IF( zscf /= 1. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf 
1332         IF( zofs /= 0. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs
1333      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1334         IF( zscf /= 1.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf
1335         IF( zofs /= 0.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs
1336      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1337         IF( zscf /= 1.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf
1338         IF( zofs /= 0.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs
1339      ENDIF
1340      !
1341   END SUBROUTINE iom_get_123d
1342
1343   SUBROUTINE iom_get_var( cdname, z2d)
1344      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in ) ::   cdname
1345      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   z2d 
1346#if defined key_iomput
1347      IF( xios_field_is_active( cdname, at_current_timestep_arg = .TRUE. ) ) THEN
1348         z2d(:,:) = 0._wp
1349         CALL xios_recv_field( cdname, z2d)
1350      ENDIF
1351#else
1352      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, z2d ! useless test to avoid compilation warnings
1353#endif
1354   END SUBROUTINE iom_get_var
1355
1356
1357   FUNCTION iom_getszuld ( kiomid ) 
1358      !!-----------------------------------------------------------------------
1359      !!                  ***  FUNCTION  iom_getszuld  ***
1360      !!
1361      !! ** Purpose : get the size of the unlimited dimension in a file
1362      !!              (return -1 if not found)
1363      !!-----------------------------------------------------------------------
1364      INTEGER, INTENT(in   ) ::   kiomid   ! file Identifier
1365      !
1366      INTEGER                ::   iom_getszuld
1367      !!-----------------------------------------------------------------------
1368      iom_getszuld = -1
1369      IF( kiomid > 0 ) THEN
1370         IF( iom_file(kiomid)%iduld > 0 )   iom_getszuld = iom_file(kiomid)%lenuld
1371      ENDIF
1372   END FUNCTION iom_getszuld
1373   
1374
1375   !!----------------------------------------------------------------------
1376   !!                   INTERFACE iom_chkatt
1377   !!----------------------------------------------------------------------
1378   SUBROUTINE iom_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize, cdvar )
1379      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
1380      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdatt     ! Name of the attribute
1381      LOGICAL         , INTENT(  out)                 ::   llok      ! Error code
1382      INTEGER         , INTENT(  out), OPTIONAL       ::   ksize     ! Size of the attribute array
1383      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ), OPTIONAL       ::   cdvar     ! Name of the variable
1384      !
1385      IF( kiomid > 0 ) THEN
1386         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize=ksize, cdvar=cdvar )
1387      ENDIF
1388      !
1389   END SUBROUTINE iom_chkatt
1390
1391   !!----------------------------------------------------------------------
1392   !!                   INTERFACE iom_getatt
1393   !!----------------------------------------------------------------------
1394   SUBROUTINE iom_g0d_iatt( kiomid, cdatt, katt0d, cdvar )
1395      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1396      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1397      INTEGER               , INTENT(  out)           ::   katt0d    ! read field
1398      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1399      !
1400      IF( kiomid > 0 ) THEN
1401         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  katt0d =  katt0d, cdvar=cdvar )
1402      ENDIF
1403   END SUBROUTINE iom_g0d_iatt
1404
1405   SUBROUTINE iom_g1d_iatt( kiomid, cdatt, katt1d, cdvar )
1406      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1407      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1408      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(  out)           ::   katt1d    ! read field
1409      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1410      !
1411      IF( kiomid > 0 ) THEN
1412         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  katt1d =  katt1d, cdvar=cdvar )
1413      ENDIF
1414   END SUBROUTINE iom_g1d_iatt
1415
1416   SUBROUTINE iom_g0d_ratt( kiomid, cdatt, patt0d, cdvar )
1417      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1418      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1419      REAL(wp)              , INTENT(  out)           ::   patt0d    ! read field
1420      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1421      !
1422      IF( kiomid > 0 ) THEN
1423         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  patt0d =  patt0d, cdvar=cdvar )
1424      ENDIF
1425   END SUBROUTINE iom_g0d_ratt
1426
1427   SUBROUTINE iom_g1d_ratt( kiomid, cdatt, patt1d, cdvar )
1428      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1429      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1430      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(  out)           ::   patt1d    ! read field
1431      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1432      !
1433      IF( kiomid > 0 ) THEN
1434         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  patt1d =  patt1d, cdvar=cdvar )
1435      ENDIF
1436   END SUBROUTINE iom_g1d_ratt
1437   
1438   SUBROUTINE iom_g0d_catt( kiomid, cdatt, cdatt0d, cdvar )
1439      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1440      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1441      CHARACTER(len=*)      , INTENT(  out)           ::   cdatt0d   ! read field
1442      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1443      !
1444      IF( kiomid > 0 ) THEN
1445         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, cdatt0d = cdatt0d, cdvar=cdvar )
1446      ENDIF
1447   END SUBROUTINE iom_g0d_catt
1448
1449
1450   !!----------------------------------------------------------------------
1451   !!                   INTERFACE iom_putatt
1452   !!----------------------------------------------------------------------
1453   SUBROUTINE iom_p0d_iatt( kiomid, cdatt, katt0d, cdvar )
1454      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1455      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1456      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   katt0d    ! written field
1457      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1458      !
1459      IF( kiomid > 0 ) THEN
1460         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  katt0d =  katt0d, cdvar=cdvar )
1461      ENDIF
1462   END SUBROUTINE iom_p0d_iatt
1463
1464   SUBROUTINE iom_p1d_iatt( kiomid, cdatt, katt1d, cdvar )
1465      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1466      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1467      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(in   )           ::   katt1d    ! written field
1468      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1469      !
1470      IF( kiomid > 0 ) THEN
1471         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  katt1d =  katt1d, cdvar=cdvar )
1472      ENDIF
1473   END SUBROUTINE iom_p1d_iatt
1474
1475   SUBROUTINE iom_p0d_ratt( kiomid, cdatt, patt0d, cdvar )
1476      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1477      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1478      REAL(wp)              , INTENT(in   )           ::   patt0d    ! written field
1479      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1480      !
1481      IF( kiomid > 0 ) THEN
1482         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  patt0d =  patt0d, cdvar=cdvar )
1483      ENDIF
1484   END SUBROUTINE iom_p0d_ratt
1485
1486   SUBROUTINE iom_p1d_ratt( kiomid, cdatt, patt1d, cdvar )
1487      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1488      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1489      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in   )           ::   patt1d    ! written field
1490      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1491      !
1492      IF( kiomid > 0 ) THEN
1493         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  patt1d =  patt1d, cdvar=cdvar )
1494      ENDIF
1495   END SUBROUTINE iom_p1d_ratt
1496   
1497   SUBROUTINE iom_p0d_catt( kiomid, cdatt, cdatt0d, cdvar )
1498      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1499      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1500      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt0d   ! written field
1501      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1502      !
1503      IF( kiomid > 0 ) THEN
1504         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt, cdatt0d = cdatt0d, cdvar=cdvar )
1505      ENDIF
1506   END SUBROUTINE iom_p0d_catt
1507
1508
1509   !!----------------------------------------------------------------------
1510   !!                   INTERFACE iom_rstput
1511   !!----------------------------------------------------------------------
1512   SUBROUTINE iom_rp0d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1513      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1514      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1515      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1516      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1517      REAL(wp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field
1518      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1519      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1520      LOGICAL :: llx                ! local xios write flag
1521      INTEGER :: ivid   ! variable id
1522
1523      llx = .FALSE.
1524      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1525      IF( llx ) THEN
1526#ifdef key_iomput
1527      IF( kt == kwrite ) THEN
1528          IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar)
1529          CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar)
1530      ENDIF
1531#endif
1532      ELSE
1533         IF( kiomid > 0 ) THEN
1534            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1535               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1536               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
1537            ENDIF
1538         ENDIF
1539      ENDIF
1540   END SUBROUTINE iom_rp0d
1541
1542   SUBROUTINE iom_rp1d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1543      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1544      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1545      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1546      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1547      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(          :) ::   pvar     ! written field
1548      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1549      LOGICAL, OPTIONAL                                    ::   ldxios   ! xios write flag
1550      LOGICAL :: llx                ! local xios write flag
1551      INTEGER :: ivid   ! variable id
1552
1553      llx = .FALSE.
1554      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1555      IF( llx ) THEN
1556#ifdef key_iomput
1557      IF( kt == kwrite ) THEN
1558         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 1D) ',trim(cdvar)
1559         CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar)
1560      ENDIF
1561#endif
1562      ELSE
1563         IF( kiomid > 0 ) THEN
1564            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1565               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1566               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
1567            ENDIF
1568         ENDIF
1569      ENDIF
1570   END SUBROUTINE iom_rp1d
1571
1572   SUBROUTINE iom_rp2d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1573      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1574      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1575      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1576      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1577      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(:,    :    ) ::   pvar     ! written field
1578      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1579      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1580      LOGICAL :: llx
1581      INTEGER :: ivid   ! variable id
1582
1583      llx = .FALSE.
1584      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1585      IF( llx ) THEN
1586#ifdef key_iomput
1587      IF( kt == kwrite ) THEN
1588         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 2D) ',trim(cdvar)
1589         CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar)
1590      ENDIF
1591#endif
1592      ELSE
1593         IF( kiomid > 0 ) THEN
1594            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1595               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1596               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
1597            ENDIF
1598         ENDIF
1599      ENDIF
1600   END SUBROUTINE iom_rp2d
1601
1602   SUBROUTINE iom_rp3d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1603      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1604      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1605      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1606      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1607      REAL(wp)        , INTENT(in),       DIMENSION(:,:,:) ::   pvar     ! written field
1608      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1609      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1610      LOGICAL :: llx                 ! local xios write flag
1611      INTEGER :: ivid   ! variable id
1612
1613      llx = .FALSE.
1614      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1615      IF( llx ) THEN
1616#ifdef key_iomput
1617      IF( kt == kwrite ) THEN
1618         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 3D) ',trim(cdvar)
1619         CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar)
1620      ENDIF
1621#endif
1622      ELSE
1623         IF( kiomid > 0 ) THEN
1624            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1625               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1626               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
1627            ENDIF
1628         ENDIF
1629      ENDIF
1630   END SUBROUTINE iom_rp3d
1631
1632
1633  SUBROUTINE iom_delay_rst( cdaction, cdcpnt, kncid )
1634      !!---------------------------------------------------------------------
1635      !!   Routine iom_delay_rst: used read/write restart related to mpp_delay
1636      !!
1637      !!---------------------------------------------------------------------
1638      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdaction        !
1639      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdcpnt
1640      INTEGER         , INTENT(in   ) ::   kncid
1641      !
1642      INTEGER  :: ji
1643      INTEGER  :: indim
1644      LOGICAL  :: llattexist
1645      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:) ::   zreal1d
1646      !!---------------------------------------------------------------------
1647      !
1648      !                                      ===================================
1649      IF( TRIM(cdaction) == 'READ' ) THEN   ! read restart related to mpp_delay !
1650         !                                   ===================================
1651         DO ji = 1, nbdelay
1652            IF ( c_delaycpnt(ji) == cdcpnt ) THEN
1653               CALL iom_chkatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), llattexist, indim )
1654               IF( llattexist )  THEN
1655                  ALLOCATE( todelay(ji)%z1d(indim) )
1656                  CALL iom_getatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), todelay(ji)%z1d(:) )
1657                  ndelayid(ji) = 0   ! set to 0 to specify that the value was read in the restart
1658               ENDIF
1659           ENDIF
1660         END DO
1661         !                                   ====================================
1662      ELSE                                  ! write restart related to mpp_delay !
1663         !                                   ====================================
1664         DO ji = 1, nbdelay   ! save only ocean delayed global communication variables
1665            IF ( c_delaycpnt(ji) == cdcpnt ) THEN
1666               IF( ASSOCIATED(todelay(ji)%z1d) ) THEN
1667                  CALL mpp_delay_rcv(ji)   ! make sure %z1d is received
1668                  CALL iom_putatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), todelay(ji)%z1d(:) )
1669               ENDIF
1670            ENDIF
1671         END DO
1672         !
1673      ENDIF
1674     
1675   END SUBROUTINE iom_delay_rst
1676 
1677   
1678
1679   !!----------------------------------------------------------------------
1680   !!                   INTERFACE iom_put
1681   !!----------------------------------------------------------------------
1682   SUBROUTINE iom_p0d( cdname, pfield0d )
1683      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
1684      REAL(wp)        , INTENT(in) ::   pfield0d
1685!!      REAL(wp)        , DIMENSION(jpi,jpj) ::   zz     ! masson
1686#if defined key_iomput
1687!!clem      zz(:,:)=pfield0d
1688!!clem      CALL xios_send_field(cdname, zz)
1689      CALL xios_send_field(cdname, (/pfield0d/)) 
1690#else
1691      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield0d   ! useless test to avoid compilation warnings
1692#endif
1693   END SUBROUTINE iom_p0d
1694
1695   SUBROUTINE iom_p1d( cdname, pfield1d )
1696      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdname
1697      REAL(wp),     DIMENSION(:), INTENT(in) ::   pfield1d
1698#if defined key_iomput
1699      CALL xios_send_field( cdname, RESHAPE( (/pfield1d/), (/1,1,SIZE(pfield1d)/) ) )
1700#else
1701      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield1d   ! useless test to avoid compilation warnings
1702#endif
1703   END SUBROUTINE iom_p1d
1704
1705   SUBROUTINE iom_p2d( cdname, pfield2d )
1706      CHARACTER(LEN=*)            , INTENT(in) ::   cdname
1707      REAL(wp),     DIMENSION(:,:), INTENT(in) ::   pfield2d
1708#if defined key_iomput
1709      CALL xios_send_field(cdname, pfield2d)
1710#else
1711      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield2d   ! useless test to avoid compilation warnings
1712#endif
1713   END SUBROUTINE iom_p2d
1714
1715   SUBROUTINE iom_p3d( cdname, pfield3d )
1716      CHARACTER(LEN=*)                , INTENT(in) ::   cdname
1717      REAL(wp),       DIMENSION(:,:,:), INTENT(in) ::   pfield3d
1718#if defined key_iomput
1719      CALL xios_send_field( cdname, pfield3d )
1720#else
1721      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield3d   ! useless test to avoid compilation warnings
1722#endif
1723   END SUBROUTINE iom_p3d
1724
1725   SUBROUTINE iom_p4d( cdname, pfield4d )
1726      CHARACTER(LEN=*)                  , INTENT(in) ::   cdname
1727      REAL(wp),       DIMENSION(:,:,:,:), INTENT(in) ::   pfield4d
1728#if defined key_iomput
1729      CALL xios_send_field(cdname, pfield4d)
1730#else
1731      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield4d   ! useless test to avoid compilation warnings
1732#endif
1733   END SUBROUTINE iom_p4d
1734
1735
1736#if defined key_iomput
1737   !!----------------------------------------------------------------------
1738   !!   'key_iomput'                                         XIOS interface
1739   !!----------------------------------------------------------------------
1740
1741   SUBROUTINE iom_set_domain_attr( cdid, ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj,                                               &
1742      &                                    data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj, lonvalue, latvalue, mask,     &
1743      &                                    nvertex, bounds_lon, bounds_lat, area )
1744      !!----------------------------------------------------------------------
1745      !!----------------------------------------------------------------------
1746      CHARACTER(LEN=*)                  , INTENT(in) ::   cdid
1747      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj
1748      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj
1749      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   nvertex
1750      REAL(wp), DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   lonvalue, latvalue
1751      REAL(wp), DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds_lon, bounds_lat, area
1752      LOGICAL , DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1753      !!----------------------------------------------------------------------
1754      !
1755      IF( xios_is_valid_domain     (cdid) ) THEN
1756         CALL xios_set_domain_attr     ( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1757            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1758            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,      &
1759            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear')
1760      ENDIF
1761      IF( xios_is_valid_domaingroup(cdid) ) THEN
1762         CALL xios_set_domaingroup_attr( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1763            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1764            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,      &
1765            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear' )
1766      ENDIF
1767      !
1768      CALL xios_solve_inheritance()
1769      !
1770   END SUBROUTINE iom_set_domain_attr
1771
1772
1773   SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr( cdid, ibegin, jbegin, ni, nj )
1774      !!----------------------------------------------------------------------
1775      !!----------------------------------------------------------------------
1776      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdid
1777      INTEGER         , INTENT(in) ::   ibegin, jbegin, ni, nj
1778      !
1779      TYPE(xios_gridgroup) :: gridgroup_hdl
1780      TYPE(xios_grid)      :: grid_hdl
1781      TYPE(xios_domain)    :: domain_hdl 
1782      TYPE(xios_axis)      :: axis_hdl 
1783      CHARACTER(LEN=64)    :: cldomrefid   ! domain_ref name
1784      CHARACTER(len=1)     :: cl1          ! last character of this name
1785      !!----------------------------------------------------------------------
1786      !
1787      IF( xios_is_valid_zoom_domain(cdid) ) THEN
1788         ! define the zoom_domain attributs
1789         CALL xios_set_zoom_domain_attr( cdid, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj )
1790         ! define a new 2D grid with this new domain
1791         CALL xios_get_handle("grid_definition", gridgroup_hdl )
1792         CALL xios_add_child(gridgroup_hdl, grid_hdl, TRIM(cdid)//'_2D' )   ! add a new 2D grid to grid_definition
1793         CALL xios_add_child(grid_hdl, domain_hdl, TRIM(cdid) )             ! add its domain
1794         ! define a new 3D grid with this new domain
1795         CALL xios_add_child(gridgroup_hdl, grid_hdl, TRIM(cdid)//'_3D' )   ! add a new 3D grid to grid_definition
1796         CALL xios_add_child(grid_hdl, domain_hdl, TRIM(cdid) )             ! add its domain
1797         ! vertical axis
1798         cl1 = cdid(LEN_TRIM(cdid):)                                        ! last letter of cdid
1799         cl1 = CHAR(ICHAR(cl1)+32)                                          ! from upper to lower case
1800         CALL xios_add_child(grid_hdl, axis_hdl, 'depth'//cl1)              ! add its axis
1801      ENDIF
1802      !     
1803   END SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr
1804
1805
1806   SUBROUTINE iom_set_axis_attr( cdid, paxis, bounds )
1807      !!----------------------------------------------------------------------
1808      !!----------------------------------------------------------------------
1809      CHARACTER(LEN=*)      , INTENT(in) ::   cdid
1810      REAL(wp), DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   paxis
1811      REAL(wp), DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds
1812      !!----------------------------------------------------------------------
1813      IF( PRESENT(paxis) ) THEN
1814         IF( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
1815         IF( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
1816      ENDIF
1817      IF( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, bounds=bounds )
1818      IF( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, bounds=bounds )
1819      CALL xios_solve_inheritance()
1820   END SUBROUTINE iom_set_axis_attr
1821
1822
1823   SUBROUTINE iom_set_field_attr( cdid, freq_op, freq_offset )
1824      !!----------------------------------------------------------------------
1825      !!----------------------------------------------------------------------
1826      CHARACTER(LEN=*)             , INTENT(in) ::   cdid
1827      TYPE(xios_duration), OPTIONAL, INTENT(in) ::   freq_op
1828      TYPE(xios_duration), OPTIONAL, INTENT(in) ::   freq_offset
1829      !!----------------------------------------------------------------------
1830      IF( xios_is_valid_field     (cdid) )   CALL xios_set_field_attr     ( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1831      IF( xios_is_valid_fieldgroup(cdid) )   CALL xios_set_fieldgroup_attr( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1832      CALL xios_solve_inheritance()
1833   END SUBROUTINE iom_set_field_attr
1834
1835
1836   SUBROUTINE iom_set_file_attr( cdid, name, name_suffix )
1837      !!----------------------------------------------------------------------
1838      !!----------------------------------------------------------------------
1839      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1840      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   name, name_suffix
1841      !!----------------------------------------------------------------------
1842      IF( xios_is_valid_file     (cdid) )   CALL xios_set_file_attr     ( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1843      IF( xios_is_valid_filegroup(cdid) )   CALL xios_set_filegroup_attr( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1844      CALL xios_solve_inheritance()
1845   END SUBROUTINE iom_set_file_attr
1846
1847
1848   SUBROUTINE iom_get_file_attr( cdid, name, name_suffix, output_freq )
1849      !!----------------------------------------------------------------------
1850      !!----------------------------------------------------------------------
1851      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in ) ::   cdid
1852      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(out) ::   name, name_suffix
1853      TYPE(xios_duration), OPTIONAL , INTENT(out) :: output_freq
1854      LOGICAL                                 ::   llexist1,llexist2,llexist3
1855      !---------------------------------------------------------------------
1856      IF( PRESENT( name        ) )   name = ''          ! default values
1857      IF( PRESENT( name_suffix ) )   name_suffix = ''
1858      IF( PRESENT( output_freq ) )   output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
1859      IF( xios_is_valid_file     (cdid) ) THEN
1860         CALL xios_solve_inheritance()
1861         CALL xios_is_defined_file_attr     ( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1862         IF(llexist1)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name = name )
1863         IF(llexist2)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name_suffix = name_suffix )
1864         IF(llexist3)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, output_freq = output_freq )
1865      ENDIF
1866      IF( xios_is_valid_filegroup(cdid) ) THEN
1867         CALL xios_solve_inheritance()
1868         CALL xios_is_defined_filegroup_attr( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1869         IF(llexist1)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name = name )
1870         IF(llexist2)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name_suffix = name_suffix )
1871         IF(llexist3)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, output_freq = output_freq )
1872      ENDIF
1873   END SUBROUTINE iom_get_file_attr
1874
1875
1876   SUBROUTINE iom_set_grid_attr( cdid, mask )
1877      !!----------------------------------------------------------------------
1878      !!----------------------------------------------------------------------
1879      CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
1880      LOGICAL, DIMENSION(:,:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1881      !!----------------------------------------------------------------------
1882      IF( xios_is_valid_grid     (cdid) )   CALL xios_set_grid_attr     ( cdid, mask_3D=mask )
1883      IF( xios_is_valid_gridgroup(cdid) )   CALL xios_set_gridgroup_attr( cdid, mask_3D=mask )
1884      CALL xios_solve_inheritance()
1885   END SUBROUTINE iom_set_grid_attr
1886
1887   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
1888      !!----------------------------------------------------------------------
1889      !!----------------------------------------------------------------------
1890      INTEGER         , INTENT(in) ::   kt 
1891      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
1892      !!----------------------------------------------------------------------
1893      CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
1894      CALL xios_update_calendar(kt)
1895      IF( cdname /= TRIM(cxios_context) )   CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
1896   END SUBROUTINE iom_setkt
1897
1898   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
1899      !!----------------------------------------------------------------------
1900      !!----------------------------------------------------------------------
1901      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdname
1902      CHARACTER(LEN=120)           :: clname
1903      !!----------------------------------------------------------------------
1904      clname = cdname
1905      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) .NE. '0' ) clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//clname 
1906      IF( xios_is_valid_context(clname) ) THEN
1907         CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
1908         CALL xios_context_finalize() ! finalize the context
1909         IF( cdname /= TRIM(cxios_context) ) CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
1910      ENDIF
1911      !
1912   END SUBROUTINE iom_context_finalize
1913
1914
1915   SUBROUTINE set_grid( cdgrd, plon, plat, ldxios, ldrxios )
1916      !!----------------------------------------------------------------------
1917      !!                     ***  ROUTINE set_grid  ***
1918      !!
1919      !! ** Purpose :   define horizontal grids
1920      !!----------------------------------------------------------------------
1921      CHARACTER(LEN=1)            , INTENT(in) ::   cdgrd
1922      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plon
1923      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
1924      !
1925      INTEGER  :: ni, nj
1926      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zmask
1927      LOGICAL, INTENT(IN) :: ldxios, ldrxios
1928      !!----------------------------------------------------------------------
1929      !
1930      ni = nlei-nldi+1
1931      nj = nlej-nldj+1
1932      !
1933      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
1934      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
1935!don't define lon and lat for restart reading context.
1936      IF ( .NOT.ldrxios ) &
1937         CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, lonvalue = RESHAPE(plon(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /)),   &
1938         &                                     latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
1939      !
1940      IF ( ln_mskland .AND. (.NOT.ldxios) ) THEN
1941         ! mask land points, keep values on coast line -> specific mask for U, V and W points
1942         SELECT CASE ( cdgrd )
1943         CASE('T')   ;   zmask(:,:,:)       = tmask(:,:,:)
1944         CASE('U')   ;   zmask(2:jpim1,:,:) = tmask(2:jpim1,:,:) + tmask(3:jpi,:,:)   ;   CALL lbc_lnk( 'iom', zmask, 'U', 1. )
1945         CASE('V')   ;   zmask(:,2:jpjm1,:) = tmask(:,2:jpjm1,:) + tmask(:,3:jpj,:)   ;   CALL lbc_lnk( 'iom', zmask, 'V', 1. )
1946         CASE('W')   ;   zmask(:,:,2:jpk  ) = tmask(:,:,1:jpkm1) + tmask(:,:,2:jpk)   ;   zmask(:,:,1) = tmask(:,:,1)
1947         END SELECT
1948         !
1949         CALL iom_set_domain_attr( "grid_"//cdgrd       , mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ni*nj    /)) /= 0. )
1950         CALL iom_set_grid_attr  ( "grid_"//cdgrd//"_3D", mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,:),(/ni,nj,jpk/)) /= 0. )
1951      ENDIF
1952      !
1953   END SUBROUTINE set_grid
1954
1955
1956   SUBROUTINE set_grid_bounds( cdgrd, plon_cnr, plat_cnr, plon_pnt, plat_pnt )
1957      !!----------------------------------------------------------------------
1958      !!                   ***  ROUTINE set_grid_bounds  ***
1959      !!
1960      !! ** Purpose :   define horizontal grid corners
1961      !!
1962      !!----------------------------------------------------------------------
1963      CHARACTER(LEN=1)                      , INTENT(in) :: cdgrd
1964      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)          , INTENT(in) :: plon_cnr, plat_cnr  ! Lat/lon coord. of a contiguous vertex of cell (i,j)
1965      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), OPTIONAL, INTENT(in) :: plon_pnt, plat_pnt  ! Lat/lon coord. of the point of cell (i,j)
1966      !
1967      INTEGER :: ji, jj, jn, ni, nj
1968      INTEGER :: icnr, jcnr                                    ! Offset such that the vertex coordinate (i+icnr,j+jcnr)
1969      !                                                        ! represents the bottom-left corner of cell (i,j)
1970      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:,:) :: z_bnds      ! Lat/lon coordinates of the vertices of cell (i,j)
1971      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)     :: z_fld       ! Working array to determine where to rotate cells
1972      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)     :: z_rot       ! Lat/lon working array for rotation of cells
1973      !!----------------------------------------------------------------------
1974      !
1975      ALLOCATE( z_bnds(4,jpi,jpj,2), z_fld(jpi,jpj), z_rot(4,2)  )
1976      !
1977      ! Offset of coordinate representing bottom-left corner
1978      SELECT CASE ( TRIM(cdgrd) )
1979      CASE ('T', 'W')   ;   icnr = -1   ;   jcnr = -1
1980      CASE ('U')        ;   icnr =  0   ;   jcnr = -1
1981      CASE ('V')        ;   icnr = -1   ;   jcnr =  0
1982      END SELECT
1983      !
1984      ni = nlei-nldi+1   ! Dimensions of subdomain interior
1985      nj = nlej-nldj+1
1986      !
1987      z_fld(:,:) = 1._wp
1988      CALL lbc_lnk( 'iom', z_fld, cdgrd, -1. )    ! Working array for location of northfold
1989      !
1990      ! Cell vertices that can be defined
1991      DO jj = 2, jpjm1
1992         DO ji = 2, jpim1
1993            z_bnds(1,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
1994            z_bnds(2,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
1995            z_bnds(3,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
1996            z_bnds(4,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
1997            z_bnds(1,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
1998            z_bnds(2,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
1999            z_bnds(3,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
2000            z_bnds(4,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
2001         END DO
2002      END DO
2003      !
2004      ! Cell vertices on boundries
2005      DO jn = 1, 4
2006         CALL lbc_lnk( 'iom', z_bnds(jn,:,:,1), cdgrd, 1., pfillval=999._wp )
2007         CALL lbc_lnk( 'iom', z_bnds(jn,:,:,2), cdgrd, 1., pfillval=999._wp )
2008      END DO
2009      !
2010      ! Zero-size cells at closed boundaries if cell points provided,
2011      ! otherwise they are closed cells with unrealistic bounds
2012      IF( PRESENT(plon_pnt) .AND. PRESENT(plat_pnt) ) THEN
2013         IF( (nbondi == -1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
2014            DO jn = 1, 4        ! (West or jpni = 1), closed E-W
2015               z_bnds(jn,1,:,1) = plat_pnt(1,:)  ;  z_bnds(jn,1,:,2) = plon_pnt(1,:)
2016            END DO
2017         ENDIF
2018         IF( (nbondi == 1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
2019            DO jn = 1, 4        ! (East or jpni = 1), closed E-W
2020               z_bnds(jn,nlci,:,1) = plat_pnt(nlci,:)  ;  z_bnds(jn,nlci,:,2) = plon_pnt(nlci,:)
2021            END DO
2022         ENDIF
2023         IF( nbondj == -1 .OR. (nbondj == 2 .AND. jperio /= 2) ) THEN
2024            DO jn = 1, 4        ! South or (jpnj = 1, not symmetric)
2025               z_bnds(jn,:,1,1) = plat_pnt(:,1)  ;  z_bnds(jn,:,1,2) = plon_pnt(:,1)
2026            END DO
2027         ENDIF
2028         IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio  < 3 ) THEN
2029            DO jn = 1, 4        ! (North or jpnj = 1), no north fold
2030               z_bnds(jn,:,nlcj,1) = plat_pnt(:,nlcj)  ;  z_bnds(jn,:,nlcj,2) = plon_pnt(:,nlcj)
2031            END DO
2032         ENDIF
2033      ENDIF
2034      !
2035      IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio >= 3 ) THEN    ! Rotate cells at the north fold
2036         DO jj = 1, jpj
2037            DO ji = 1, jpi
2038               IF( z_fld(ji,jj) == -1. ) THEN
2039                  z_rot(1,:) = z_bnds(3,ji,jj,:) ; z_rot(2,:) = z_bnds(4,ji,jj,:)
2040                  z_rot(3,:) = z_bnds(1,ji,jj,:) ; z_rot(4,:) = z_bnds(2,ji,jj,:)
2041                  z_bnds(:,ji,jj,:) = z_rot(:,:)
2042               ENDIF
2043            END DO
2044         END DO
2045      ELSE IF( nbondj == 2 .AND. jperio == 2 ) THEN                  ! Invert cells at the symmetric equator
2046         DO ji = 1, jpi
2047            z_rot(1:2,:) = z_bnds(3:4,ji,1,:)
2048            z_rot(3:4,:) = z_bnds(1:2,ji,1,:)
2049            z_bnds(:,ji,1,:) = z_rot(:,:)
2050         END DO
2051      ENDIF
2052      !
2053      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, bounds_lat = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ 4,ni*nj /)),           &
2054          &                                    bounds_lon = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,2),(/ 4,ni*nj /)), nvertex=4 )
2055      !
2056      DEALLOCATE( z_bnds, z_fld, z_rot ) 
2057      !
2058   END SUBROUTINE set_grid_bounds
2059
2060
2061   SUBROUTINE set_grid_znl( plat )
2062      !!----------------------------------------------------------------------
2063      !!                     ***  ROUTINE set_grid_znl  ***
2064      !!
2065      !! ** Purpose :   define grids for zonal mean
2066      !!
2067      !!----------------------------------------------------------------------
2068      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
2069      !
2070      INTEGER  :: ni, nj, ix, iy
2071      REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE  ::   zlon
2072      !!----------------------------------------------------------------------
2073      !
2074      ni=nlei-nldi+1       ! define zonal mean domain (jpj*jpk)
2075      nj=nlej-nldj+1
2076      ALLOCATE( zlon(ni*nj) )       ;       zlon(:) = 0._wp
2077      !
2078!      CALL dom_ngb( -168.53, 65.03, ix, iy, 'T' ) !  i-line that passes through Bering Strait: Reference latitude (used in plots)
2079      CALL dom_ngb( 180., 90., ix, iy, 'T' ) !  i-line that passes near the North Pole : Reference latitude (used in plots)
2080      CALL iom_set_domain_attr("gznl", ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
2081      CALL iom_set_domain_attr("gznl", data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
2082      CALL iom_set_domain_attr("gznl", lonvalue = zlon,   &
2083         &                             latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
2084      CALL iom_set_zoom_domain_attr("ptr", ibegin=ix-1, jbegin=0, ni=1, nj=jpjglo)
2085      !
2086      CALL iom_update_file_name('ptr')
2087      !
2088   END SUBROUTINE set_grid_znl
2089
2090
2091   SUBROUTINE set_scalar
2092      !!----------------------------------------------------------------------
2093      !!                     ***  ROUTINE set_scalar  ***
2094      !!
2095      !! ** Purpose :   define fake grids for scalar point
2096      !!
2097      !!----------------------------------------------------------------------
2098      REAL(wp), DIMENSION(1)   ::   zz = 1.
2099      !!----------------------------------------------------------------------
2100      !
2101      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', ni_glo=jpnij, nj_glo=1, ibegin=narea-1, jbegin=0, ni=1, nj=1)
2102      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', data_dim=2, data_ibegin = 1, data_ni = 1, data_jbegin = 1, data_nj = 1)
2103      !
2104      zz = REAL( narea, wp )
2105      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', lonvalue=zz, latvalue=zz)
2106      !
2107   END SUBROUTINE set_scalar
2108
2109
2110   SUBROUTINE set_xmlatt
2111      !!----------------------------------------------------------------------
2112      !!                     ***  ROUTINE set_xmlatt  ***
2113      !!
2114      !! ** Purpose :   automatic definitions of some of the xml attributs...
2115      !!
2116      !!----------------------------------------------------------------------
2117      CHARACTER(len=1),DIMENSION( 3) ::   clgrd                    ! suffix name
2118      CHARACTER(len=256)             ::   clsuff                   ! suffix name
2119      CHARACTER(len=1)               ::   cl1                      ! 1 character
2120      CHARACTER(len=2)               ::   cl2                      ! 2 characters
2121      CHARACTER(len=3)               ::   cl3                      ! 3 characters
2122      INTEGER                        ::   ji, jg                   ! loop counters
2123      INTEGER                        ::   ix, iy                   ! i-,j- index
2124      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlontao                  ! longitudes of tao    moorings
2125      REAL(wp)        ,DIMENSION( 7) ::   zlattao                  ! latitudes  of tao    moorings
2126      REAL(wp)        ,DIMENSION( 4) ::   zlonrama                 ! longitudes of rama   moorings
2127      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlatrama                 ! latitudes  of rama   moorings
2128      REAL(wp)        ,DIMENSION( 3) ::   zlonpira                 ! longitudes of pirata moorings
2129      REAL(wp)        ,DIMENSION( 9) ::   zlatpira                 ! latitudes  of pirata moorings
2130      TYPE(xios_duration)            ::   f_op, f_of
2131      !!----------------------------------------------------------------------
2132      !
2133      ! frequency of the call of iom_put (attribut: freq_op)
2134      f_op%timestep = 1        ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('field_definition', freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2135      f_op%timestep = 2        ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('trendT_even'     , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2136      f_op%timestep = 2        ;  f_of%timestep = -1  ; CALL iom_set_field_attr('trendT_odd'      , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2137      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC'             , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2138      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC_scalar'      , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2139      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('ptrc_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2140      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('diad_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2141
2142      ! output file names (attribut: name)
2143      DO ji = 1, 9
2144         WRITE(cl1,'(i1)') ji 
2145         CALL iom_update_file_name('file'//cl1)
2146      END DO
2147      DO ji = 1, 99
2148         WRITE(cl2,'(i2.2)') ji 
2149         CALL iom_update_file_name('file'//cl2)
2150      END DO
2151      DO ji = 1, 999
2152         WRITE(cl3,'(i3.3)') ji 
2153         CALL iom_update_file_name('file'//cl3)
2154      END DO
2155
2156      ! Zooms...
2157      clgrd = (/ 'T', 'U', 'W' /) 
2158      DO jg = 1, SIZE(clgrd)                                                                   ! grid type
2159         cl1 = clgrd(jg)
2160         ! Equatorial section (attributs: jbegin, ni, name_suffix)
2161         CALL dom_ngb( 0., 0., ix, iy, cl1 )
2162         CALL iom_set_zoom_domain_attr('Eq'//cl1, ibegin=0, jbegin=iy-1, ni=jpiglo, nj=1 )
2163         CALL iom_get_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = clsuff             )
2164         CALL iom_set_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_Eq')
2165         CALL iom_update_file_name('Eq'//cl1)
2166      END DO
2167      ! TAO moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2168      zlontao = (/ 137.0, 147.0, 156.0, 165.0, -180.0, -170.0, -155.0, -140.0, -125.0, -110.0, -95.0 /)
2169      zlattao = (/  -8.0,  -5.0,  -2.0,   0.0,    2.0,    5.0,    8.0 /)
2170      CALL set_mooring( zlontao, zlattao )
2171      ! RAMA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2172      zlonrama = (/  55.0,  67.0, 80.5, 90.0 /)
2173      zlatrama = (/ -16.0, -12.0, -8.0, -4.0, -1.5, 0.0, 1.5, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0 /)
2174      CALL set_mooring( zlonrama, zlatrama )
2175      ! PIRATA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2176      zlonpira = (/ -38.0, -23.0, -10.0 /)
2177      zlatpira = (/ -19.0, -14.0,  -8.0, 0.0, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0, 20.0 /)
2178      CALL set_mooring( zlonpira, zlatpira )
2179      !
2180   END SUBROUTINE set_xmlatt
2181
2182
2183   SUBROUTINE set_mooring( plon, plat )
2184      !!----------------------------------------------------------------------
2185      !!                     ***  ROUTINE set_mooring  ***
2186      !!
2187      !! ** Purpose :   automatic definitions of moorings xml attributs...
2188      !!
2189      !!----------------------------------------------------------------------
2190      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in) ::   plon, plat   ! longitudes/latitudes oft the mooring
2191      !
2192!!$      CHARACTER(len=1),DIMENSION(4) ::   clgrd = (/ 'T', 'U', 'V', 'W' /)   ! suffix name
2193      CHARACTER(len=1),DIMENSION(1) ::   clgrd = (/ 'T' /)        ! suffix name
2194      CHARACTER(len=256)            ::   clname                   ! file name
2195      CHARACTER(len=256)            ::   clsuff                   ! suffix name
2196      CHARACTER(len=1)              ::   cl1                      ! 1 character
2197      CHARACTER(len=6)              ::   clon,clat                ! name of longitude, latitude
2198      INTEGER                       ::   ji, jj, jg               ! loop counters
2199      INTEGER                       ::   ix, iy                   ! i-,j- index
2200      REAL(wp)                      ::   zlon, zlat
2201      !!----------------------------------------------------------------------
2202      DO jg = 1, SIZE(clgrd)
2203         cl1 = clgrd(jg)
2204         DO ji = 1, SIZE(plon)
2205            DO jj = 1, SIZE(plat)
2206               zlon = plon(ji)
2207               zlat = plat(jj)
2208               ! modifications for RAMA moorings
2209               IF( zlon ==  67. .AND. zlat ==  15. )   zlon =  65.
2210               IF( zlon ==  90. .AND. zlat <=  -4. )   zlon =  95.
2211               IF( zlon ==  95. .AND. zlat ==  -4. )   zlat =  -5.
2212               ! modifications for PIRATA moorings
2213               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -19. )   zlon = -34.
2214               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -14. )   zlon = -32.
2215               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==  -8. )   zlon = -30.
2216               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==   0. )   zlon = -35.
2217               IF( zlon == -23. .AND. zlat ==  20. )   zlat =  21.
2218               IF( zlon == -10. .AND. zlat == -14. )   zlat = -10.
2219               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==  -8. )   zlat =  -6.
2220               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==   4. ) THEN   ;   zlon = 0.   ;   zlat = 0.   ;   ENDIF
2221               CALL dom_ngb( zlon, zlat, ix, iy, cl1 )
2222               IF( zlon >= 0. ) THEN 
2223                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT( zlon), 'e'
2224                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')       zlon , 'e'
2225                  ENDIF
2226               ELSE             
2227                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT(-zlon), 'w'
2228                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')      -zlon , 'w'
2229                  ENDIF
2230               ENDIF
2231               IF( zlat >= 0. ) THEN 
2232                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT( zlat), 'n'
2233                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')       zlat , 'n'
2234                  ENDIF
2235               ELSE             
2236                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT(-zlat), 's'
2237                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')      -zlat , 's'
2238                  ENDIF
2239               ENDIF
2240               clname = TRIM(ADJUSTL(clat))//TRIM(ADJUSTL(clon))
2241               CALL iom_set_zoom_domain_attr(TRIM(clname)//cl1, ibegin= ix-1, jbegin= iy-1, ni=1, nj=1)
2242
2243               CALL iom_get_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = clsuff                         )
2244               CALL iom_set_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_'//TRIM(clname))
2245               CALL iom_update_file_name(TRIM(clname)//cl1)
2246            END DO
2247         END DO
2248      END DO
2249     
2250   END SUBROUTINE set_mooring
2251
2252   
2253   SUBROUTINE iom_update_file_name( cdid )
2254      !!----------------------------------------------------------------------
2255      !!                     ***  ROUTINE iom_update_file_name  ***
2256      !!
2257      !! ** Purpose :   
2258      !!
2259      !!----------------------------------------------------------------------
2260      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
2261      !
2262      CHARACTER(LEN=256) ::   clname
2263      CHARACTER(LEN=20)  ::   clfreq
2264      CHARACTER(LEN=20)  ::   cldate
2265      CHARACTER(LEN=256) ::   cltmpn                 !FUS needed for correct path with AGRIF
2266      INTEGER            ::   iln                    !FUS needed for correct path with AGRIF
2267      INTEGER            ::   idx
2268      INTEGER            ::   jn
2269      INTEGER            ::   itrlen
2270      INTEGER            ::   iyear, imonth, iday, isec
2271      REAL(wp)           ::   zsec
2272      LOGICAL            ::   llexist
2273      TYPE(xios_duration)   ::   output_freq 
2274      !!----------------------------------------------------------------------
2275      !
2276      DO jn = 1, 2
2277         !
2278         output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
2279         IF( jn == 1 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name        = clname, output_freq = output_freq )
2280         IF( jn == 2 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2281         !
2282         IF ( TRIM(clname) /= '' ) THEN 
2283            !
2284            idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2285            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2286               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cexper)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2287               idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2288            END DO
2289            !
2290            idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2291            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2292              IF ( output_freq%timestep /= 0) THEN
2293                  WRITE(clfreq,'(I18,A2)')INT(output_freq%timestep),'ts' 
2294                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2295              ELSE IF ( output_freq%second /= 0 ) THEN
2296                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%second),'s' 
2297                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2298              ELSE IF ( output_freq%minute /= 0 ) THEN
2299                  WRITE(clfreq,'(I18,A2)')INT(output_freq%minute),'mi' 
2300                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2301              ELSE IF ( output_freq%hour /= 0 ) THEN
2302                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%hour),'h' 
2303                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2304              ELSE IF ( output_freq%day /= 0 ) THEN
2305                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%day),'d' 
2306                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2307              ELSE IF ( output_freq%month /= 0 ) THEN   
2308                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%month),'m' 
2309                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2310              ELSE IF ( output_freq%year /= 0 ) THEN   
2311                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%year),'y' 
2312                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2313              ELSE
2314                  CALL ctl_stop('error in the name of file id '//TRIM(cdid),   &
2315                     & ' attribute output_freq is undefined -> cannot replace @freq@ in '//TRIM(clname) )
2316              ENDIF
2317              clname = clname(1:idx-1)//TRIM(ADJUSTL(clfreq))//clname(idx+6:LEN_TRIM(clname))
2318              idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2319            END DO
2320            !
2321            idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2322            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2323               cldate = iom_sdate( fjulday - rdt / rday )
2324               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+11:LEN_TRIM(clname))
2325               idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2326            END DO
2327            !
2328            idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2329            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2330               cldate = iom_sdate( fjulday - rdt / rday, ldfull = .TRUE. )
2331               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+15:LEN_TRIM(clname))
2332               idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2333            END DO
2334            !
2335            idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2336            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2337               cldate = iom_sdate( fjulday + rdt / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE. )
2338               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2339               idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2340            END DO
2341            !
2342            idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2343            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2344               cldate = iom_sdate( fjulday + rdt / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE., ldfull = .TRUE. )
2345               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+13:LEN_TRIM(clname))
2346               idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2347            END DO
2348            !
2349!FUS            IF( jn == 1 .AND. TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname)
2350!FUS see comment line 700
2351            IF( jn == 1 .AND. TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' ) THEN
2352             iln    = INDEX(clname,'/',BACK=.true.)
2353             cltmpn = clname(1:iln)
2354             clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
2355             clname = TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
2356            ENDIF
2357!FUS
2358            IF( jn == 1 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name        = clname )
2359            IF( jn == 2 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2360            !
2361         ENDIF
2362         !
2363      END DO
2364      !
2365   END SUBROUTINE iom_update_file_name
2366
2367
2368   FUNCTION iom_sdate( pjday, ld24, ldfull )
2369      !!----------------------------------------------------------------------
2370      !!                     ***  ROUTINE iom_sdate  ***
2371      !!
2372      !! ** Purpose :   send back the date corresponding to the given julian day
2373      !!----------------------------------------------------------------------
2374      REAL(wp), INTENT(in   )           ::   pjday    ! julian day
2375      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ld24     ! true to force 24:00 instead of 00:00
2376      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldfull   ! true to get the compleate date: yyyymmdd_hh:mm:ss
2377      !
2378      CHARACTER(LEN=20) ::   iom_sdate
2379      CHARACTER(LEN=50) ::   clfmt                         !  format used to write the date
2380      INTEGER           ::   iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec
2381      REAL(wp)          ::   zsec
2382      LOGICAL           ::   ll24, llfull
2383      !!----------------------------------------------------------------------
2384      !
2385      IF( PRESENT(ld24) ) THEN   ;   ll24 = ld24
2386      ELSE                       ;   ll24 = .FALSE.
2387      ENDIF
2388      !
2389      IF( PRESENT(ldfull) ) THEN   ;   llfull = ldfull
2390      ELSE                         ;   llfull = .FALSE.
2391      ENDIF
2392      !
2393      CALL ju2ymds( pjday, iyear, imonth, iday, zsec )
2394      isec = NINT(zsec)
2395      !
2396      IF ( ll24 .AND. isec == 0 ) THEN   ! 00:00 of the next day -> move to 24:00 of the current day
2397         CALL ju2ymds( pjday - 1., iyear, imonth, iday, zsec )
2398         isec = 86400
2399      ENDIF
2400      !
2401      IF( iyear < 10000 ) THEN   ;   clfmt = "i4.4,2i2.2"                ! format used to write the date
2402      ELSE                       ;   WRITE(clfmt, "('i',i1,',2i2.2')") INT(LOG10(REAL(iyear,wp))) + 1
2403      ENDIF
2404      !
2405!$AGRIF_DO_NOT_TREAT     
2406      ! needed in the conv
2407      IF( llfull ) THEN
2408         clfmt = TRIM(clfmt)//",'_',i2.2,':',i2.2,':',i2.2"
2409         ihour   = isec / 3600
2410         isec    = MOD(isec, 3600)
2411         iminute = isec / 60
2412         isec    = MOD(isec, 60)
2413         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec    ! date of the end of run
2414      ELSE
2415         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday                          ! date of the end of run
2416      ENDIF
2417!$AGRIF_END_DO_NOT_TREAT     
2418      !
2419   END FUNCTION iom_sdate
2420
2421#else
2422   !!----------------------------------------------------------------------
2423   !!   NOT 'key_iomput'                               a few dummy routines
2424   !!----------------------------------------------------------------------
2425   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
2426      INTEGER         , INTENT(in)::   kt 
2427      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2428      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) kt, cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2429   END SUBROUTINE iom_setkt
2430
2431   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
2432      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2433      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*)  cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2434   END SUBROUTINE iom_context_finalize
2435
2436#endif
2437
2438   LOGICAL FUNCTION iom_use( cdname )
2439      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2440#if defined key_iomput
2441      iom_use = xios_field_is_active( cdname )
2442#else
2443      iom_use = .FALSE.
2444#endif
2445   END FUNCTION iom_use
2446
2447   SUBROUTINE iom_miss_val( cdname, pmiss_val )
2448      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in ) ::   cdname
2449      REAL(wp)        , INTENT(out) ::   pmiss_val   
2450#if defined key_iomput
2451      ! get missing value
2452      CALL xios_get_field_attr( cdname, default_value = pmiss_val )
2453#else
2454      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pmiss_val   ! useless test to avoid compilation warnings
2455#endif
2456   END SUBROUTINE iom_miss_val
2457 
2458   !!======================================================================
2459END MODULE iom
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.