source: NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main/NEMO_manual.bib @ 11115

Last change on this file since 11115 was 11115, checked in by nicolasmartin, 18 months ago

Fixed version with unused references

File size: 193.0 KB
Line 
1
2@Article{         adcroft.campin_04,
3  author        = {A. Adcroft and J.-M. Campin},
4  title         = {Rescaled height coordinates for accurate representation of
5                  free-surface flows in ocean circulation models},
6  journal       = {Ocean Modelling},
7  publisher     = {Elsevier BV},
8  year          = {2004},
9  month         = {jan},
10  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
11  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
12  pages         = {269--284},
13  volume        = {7},
14  number        = {3-4},
15  issn          = {1463-5003}
16}
17
18@Article{         arakawa.hsu_90,
19  author        = {A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu},
20  title         = {Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
21                  Schemes for the Shallow Water Equations},
22  journal       = {Monthly Weather Review},
23  publisher     = {American Meteorological Society},
24  year          = {1990},
25  month         = {oct},
26  doi           = {10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
27  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
28  pages         = {1960--1969},
29  volume        = {118},
30  number        = {10},
31  issn          = {1520-0493}
32}
33
34@Article{         arakawa.lamb_81,
35  author        = {A. Arakawa and V. R. Lamb},
36  title         = {A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
37                  Shallow Water Equations},
38  journal       = {Monthly Weather Review},
39  publisher     = {American Meteorological Society},
40  year          = {1981},
41  month         = {jan},
42  doi           = {10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
43  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
44  pages         = {18--36},
45  volume        = {109},
46  number        = {1},
47  issn          = {1520-0493}
48}
49
50@Article{         arakawa_66,
51  author        = {A. Arakawa},
52  title         = {Computational design for long-term numerical integration
53                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
54                  incompressible flow. Part {I}},
55  journal       = {Journal of Computational Physics},
56  publisher     = {Elsevier BV},
57  year          = {1966},
58  month         = {Aug},
59  doi           = {10.1016/0021-9991(66)90015-5},
60  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(66)90015-5},
61  pages         = {119--143},
62  volume        = {1},
63  number        = {1},
64  issn          = {0021-9991}
65}
66
67@Article{         arbic.garner.ea_04,
68  author        = {B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
69                  Simmons},
70  title         = {The accuracy of surface elevations in forward global
71                  barotropic and baroclinic tide models},
72  journal       = {Deep Sea Research},
73  publisher     = {Elsevier BV},
74  year          = {2004},
75  month         = {dec},
76  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
77  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
78  pages         = {3069--3101},
79  volume        = {51},
80  number        = {25-26},
81  issn          = {0967-0645}
82}
83
84@Article{         arbic.wallcraft.ea_10,
85  author        = {B. K. Arbic and A. J. Wallcraft and E. J. Metzger},
86  title         = {Concurrent simulation of the eddying general circulation
87                  and tides in a global ocean model},
88  journal       = {Ocean Modelling},
89  publisher     = {Elsevier BV},
90  year          = {2010},
91  month         = {jan},
92  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.01.007},
93  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.01.007},
94  pages         = {175--187},
95  volume        = {32},
96  number        = {3-4},
97  issn          = {1463-5003}
98}
99
100@Article{         arhan.treguier.ea_06,
101  author        = {M. Arhan and A. M. Tr\'{e}guier and B. Bourl\`{e}s and S.
102                  Michel},
103  title         = {Diagnosing the annual cycle of the Equatorial Undercurrent
104                  in the Atlantic Ocean from a General Circulation Model},
105  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
106  publisher     = {American Meteorological Society},
107  year          = {2006},
108  month         = {aug},
109  doi           = {10.1175/jpo2929.1},
110  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jpo2929.1},
111  pages         = {1502--1522},
112  volume        = {36},
113  number        = {8},
114  issn          = {1520-0485}
115}
116
117@Article{         artale.iudicone.ea_02,
118  author        = {V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
119                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio},
120  title         = {Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
121                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
122                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
123                  thermohaline circulation},
124  journal       = {Journal of Geophysical Research},
125  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
126  year          = {2002},
127  doi           = {10.1029/2000jc000452},
128  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000JC000452},
129  pages         = {2901--2924},
130  volume        = {107},
131  number        = {C8},
132  issn          = {0148-0227}
133}
134
135@Article{         asselin_72,
136  author        = {R. Asselin},
137  title         = {Frequency Filter for Time Integrations},
138  journal       = {Monthly Weather Review},
139  publisher     = {American Meteorological Society},
140  year          = {1972},
141  month         = {jun},
142  doi           = {10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2},
143  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2},
144  pages         = {487--490},
145  volume        = {100},
146  number        = {6},
147  issn          = {1520-0493}
148}
149
150@Article{         atmadipoera.molcard.ea_09,
151  author        = {A. Atmadipoera and R. Molcard and G. Madec and S. Wijffels
152                  and J. Sprintall and A. Koch-Larrouy and I. Jaya and A.
153                  Supangat},
154  title         = {Characteristics and variability of the Indonesian
155                  ThroughFlow water at the outflow straits},
156  journal       = {Deep Sea Research},
157  publisher     = {Elsevier BV},
158  year          = {2009},
159  month         = {nov},
160  doi           = {10.1016/j.dsr.2009.06.004},
161  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr.2009.06.004},
162  pages         = {1942--1954},
163  volume        = {56},
164  number        = {11},
165  issn          = {0967-0637}
166}
167
168@Article{         aumont.orr.ea_98,
169  author        = {O. Aumont and J. C. Orr and D. Jamous and P. Monfray and
170                  O. Marti and G. Madec},
171  title         = {A degradation approach to accelerate simulations to
172                  steady-state in a 3-{D} tracer transport model of the
173                  global ocean},
174  journal       = {Climate Dynamics},
175  publisher     = {Springer Nature},
176  year          = {1998},
177  month         = {feb},
178  doi           = {10.1007/s003820050212},
179  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s003820050212},
180  pages         = {101--116},
181  volume        = {14},
182  number        = {2},
183  issn          = {1432-0894}
184}
185
186@Article{         aumont.orr.ea_99,
187  author        = {O. Aumont and J. C. Orr and P. Monfray and G. Madec and E.
188                  Maier-Reimer},
189  title         = {Nutrient trapping in the equatorial Pacific: The ocean
190                  circulation solution},
191  journal       = {Global Biogeochemical Cycles},
192  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
193  year          = {1999},
194  month         = {jun},
195  doi           = {10.1029/1998gb900012},
196  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1998gb900012},
197  pages         = {351--369},
198  volume        = {13},
199  number        = {2},
200  issn          = {0886-6236}
201}
202
203@Article{         axell.liungman_01,
204  author        = {L. B. Axell and O. Liungman},
205  title         = {A one-equation turbulence model for geophysical
206                  applications: Comparison with data and the k-$\epsilon$
207                  model},
208  journal       = {Environmental Fluid Mechanics},
209  publisher     = {Springer Nature},
210  year          = {2001},
211  doi           = {10.1023/a:1011560202388},
212  url           = {http://dx.doi.org/10.1023/A:1011560202388},
213  pages         = {71--106},
214  volume        = {1},
215  number        = {1},
216  issn          = {1567-7419}
217}
218
219@Article{         axell_02,
220  author        = {L. B. Axell},
221  title         = {Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
222                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea},
223  journal       = {Journal of Geophysical Research},
224  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
225  year          = {2002},
226  doi           = {10.1029/2001jc000922},
227  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001JC000922},
228  volume        = {107},
229  number        = {C11},
230  issn          = {0148-0227}
231}
232
233@Article{         ayina.bentamy.ea_06,
234  author        = {L.-H. Ayina and A. Bentamy and A. Munes-Mestaz and G.
235                  Madec},
236  title         = {The Impact of Satellite Winds and Latent Heat Fluxes in a
237                  Numerical Simulation of the Tropical Pacific Ocean},
238  journal       = {Journal of Climate},
239  publisher     = {American Meteorological Society},
240  year          = {2006},
241  month         = {nov},
242  doi           = {10.1175/jcli3939.1},
243  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3939.1},
244  pages         = {5889--5902},
245  volume        = {19},
246  number        = {22},
247  issn          = {1520-0442}
248}
249
250@Article{         barnier.madec.ea_06,
251  author        = {B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
252                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. Le Sommer and A. Beckmann and
253                  A. Biastoch and C. B\"{o}ning and J. Dengg and C. Derval
254                  and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C. Talandier and
255                  S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and B. De Cuevas},
256  title         = {Impact of partial steps and momentum advection schemes in
257                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
258                  resolution},
259  journal       = {Ocean Dynamics},
260  publisher     = {Springer Nature},
261  year          = {2006},
262  month         = {jun},
263  doi           = {10.1007/s10236-006-0082-1},
264  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-006-0082-1},
265  pages         = {543--567},
266  volume        = {56},
267  number        = {5-6},
268  issn          = {1616-7228}
269}
270
271@InBook{          barnier.marchesiello.ea_96,
272  author        = {B. Barnier and P. Marchesiello and A. P. de Miranda},
273  booktitle     = {The South Atlantic: Present and Past Circulation},
274  publisher     = {Springer Berlin Heidelberg},
275  editor        = {G. Wefer and W. H. Berger and G. Siedler and D. Webb},
276  year          = {1996},
277  doi           = {10.1007/978-3-642-80353-6_16},
278  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-80353-6_16},
279  title         = {Modeling the ocean circulation in the South Atlantic: {A}
280                  strategy for dealing with open boundaries},
281  chapter       = {2},
282  pages         = {289--304},
283  isbn          = {978-3-642-80353-6}
284}
285
286@Article{         barnier.marchesiello.ea_98,
287  author        = {B. Barnier and P. Marchesiello and A. P. de Miranda and
288                  J.-M. Molines and M. Coulibaly},
289  title         = {A sigma-coordinate primitive equation model for studying
290                  the circulation in the South Atlantic. Part {I}: Model
291                  configuration with error estimates},
292  journal       = {Deep Sea Research},
293  publisher     = {Elsevier BV},
294  year          = {1998},
295  month         = {apr},
296  doi           = {10.1016/s0967-0637(97)00086-1},
297  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0967-0637(97)00086-1},
298  pages         = {543--572},
299  volume        = {45},
300  number        = {4-5},
301  issn          = {0967-0637}
302}
303
304@Article{         barthelet.bony.ea_98,
305  author        = {P. Barthelet and S. Bony and P. Braconnot and A. Braun and
306                  D. Cariolle and E. Cohen-Solal and J.-L. Dufresne and P.
307                  Del\'{e}cluse and M. D\'{e}qu\'{e} and L. Fairhead and
308                  M.-A. Filiberti and M. Forichon and J.-Y. Grandpeix and E.
309                  Guilyardi and M.-N. Houssais and M. Imbard and H. Le Treut
310                  and C. Lévy and Z. X. Li and G. Madec and P. Marquet and
311                  O. Marti and S. Planton and L. Terray and O. Thual and S.
312                  Valcke},
313  title         = {Global coupled simulations of climate change due to
314                  increased atmospheric {CO}_{2} concentration},
315  journal       = {Comptes Rendus de l'Acad\'{e}mie des Sciences de Paris},
316  publisher     = {Elsevier BV},
317  year          = {1998},
318  month         = {May},
319  doi           = {10.1016/s1251-8050(98)80178-x},
320  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/S1251-8050(98)80178-X},
321  series        = {IIA Earth and Planetary Science},
322  volume        = {326},
323  number        = {10},
324  pages         = {677-684},
325  issn          = {1251-8050}
326}
327
328@Article{         beckmann.doscher_97,
329  author        = {A. Beckmann and R. D\"{o}scher},
330  title         = {A method for improved representation of dense water
331                  spreading over topography in geopotential-coordinate
332                  models},
333  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
334  publisher     = {American Meteorological Society},
335  year          = {1997},
336  month         = {apr},
337  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
338  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
339  pages         = {581--591},
340  volume        = {27},
341  number        = {4},
342  issn          = {1520-0485}
343}
344
345@Article{         beckmann.goosse_03,
346  author        = {A. Beckmann and H. Goosse},
347  title         = {A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
348                  climate models},
349  journal       = {Ocean Modelling},
350  publisher     = {Elsevier BV},
351  year          = {2003},
352  month         = {jan},
353  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
354  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
355  pages         = {157--170},
356  volume        = {5},
357  number        = {2},
358  issn          = {1463-5003}
359}
360
361@Article{         beckmann.haidvogel_93,
362  author        = {A. Beckmann and D. B. Haidvogel},
363  title         = {Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
364                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model
365                  Accuracy},
366  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
367  publisher     = {American Meteorological Society},
368  year          = {1993},
369  month         = {aug},
370  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
371  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
372  pages         = {1736--1753},
373  volume        = {23},
374  number        = {8},
375  issn          = {1520-0485}
376}
377
378@InBook{          beckmann_98,
379  author        = {A. Beckmann},
380  booktitle     = {Ocean Modeling and Parameterization},
381  publisher     = {Springer Netherlands},
382  editor        = {E. P. Chassignet and J. Verron},
383  year          = {1998},
384  doi           = {10.1007/978-94-011-5096-5_5},
385  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/978-94-011-5096-5_5},
386  title         = {The representation of bottom boundary layer processes in
387                  numerical ocean circulation models},
388  chapter       = {5},
389  series        = {NATO Science},
390  pages         = {135--154},
391  isbn          = {978-94-011-5096-5}
392}
393
394@Article{         bernie.guilyardi.ea_07,
395  author        = {D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
396                  Slingo and S. J. Woolnough},
397  title         = {Impact of resolving the diurnal cycle in an
398                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced
399                  {OGCM}},
400  journal       = {Climate Dynamics},
401  publisher     = {Springer Nature},
402  year          = {2007},
403  month         = {may},
404  doi           = {10.1007/s00382-007-0249-6},
405  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-007-0249-6},
406  pages         = {575--590},
407  volume        = {29},
408  number        = {6},
409  issn          = {1432-0894}
410}
411
412@Article{         bernie.guilyardi.ea_08,
413  author        = {D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
414                  Slingo and S. J. Woolnough and J. Cole},
415  title         = {Impact of resolving the diurnal cycle in an
416                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 2: {A} diurnally coupled
417                  {CGCM}},
418  journal       = {Climate Dynamics},
419  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
420  year          = {2008},
421  month         = {jun},
422  doi           = {10.1007/s00382-008-0429-z},
423  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-008-0429-z},
424  pages         = {909--925},
425  volume        = {31},
426  number        = {7-8},
427  issn          = {1432-0894}
428}
429
430@Article{         bernie.woolnough.ea_05,
431  author        = {D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
432                  Guilyardi},
433  title         = {Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
434                  ocean mixed layer},
435  journal       = {Journal of Climate},
436  publisher     = {American Meteorological Society},
437  year          = {2005},
438  month         = {apr},
439  doi           = {10.1175/jcli3319.1},
440  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3319.1},
441  pages         = {1190--1202},
442  volume        = {18},
443  number        = {8},
444  issn          = {1520-0442}
445}
446
447@Article{         bessieres.madec.ea_08,
448  author        = {L. Bessi\`{e}res and G. Madec and F. Lyard},
449  title         = {Global tidal residual mean circulation: Does it affect a
450                  climate {OGCM}?},
451  journal       = {Geophysical Research Letters},
452  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
453  year          = {2008},
454  month         = {feb},
455  doi           = {10.1029/2007gl032644},
456  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2007GL032644},
457  pages         = {L03609},
458  volume        = {35},
459  number        = {3},
460  issn          = {0094-8276}
461}
462
463@Article{         biastoch.boning.ea_08,
464  author        = {A. Biastoch and C. W. B\"{o}ning and J. Getzlaff and J.-M.
465                  Molines and G. Madec},
466  title         = {Causes of interannual - decadal variability in the
467                  Meridional Overturning Circulation of the mid-latitude
468                  north Atlantic Ocean},
469  journal       = {Journal of Climate},
470  publisher     = {American Meteorological Society},
471  year          = {2008},
472  month         = {dec},
473  doi           = {10.1175/2008jcli2404.1},
474  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2008JCLI2404.1},
475  pages         = {6599--6615},
476  volume        = {21},
477  number        = {24},
478  issn          = {1520-0442}
479}
480
481@Article{         bignami.marullo.ea_95,
482  author        = {F. Bignami and S. Marullo and R. Santoleri and M. E.
483                  Schiano},
484  title         = {Longwave radiation budget in the Mediterranean Sea},
485  journal       = {Journal of Geophysical Research},
486  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
487  year          = {1995},
488  doi           = {10.1029/94jc02496},
489  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94JC02496},
490  pages         = {2501--2514},
491  volume        = {100},
492  number        = {C2},
493  issn          = {0148-0227}
494}
495
496@Article{         blanke.arhan.ea_99,
497  author        = {B. Blanke and M. Arhan and G. Madec and S. Roche},
498  title         = {Warm Water Paths in the Equatorial Atlantic as Diagnosed
499                  with a General Circulation Model},
500  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
501  publisher     = {American Meteorological Society},
502  year          = {1999},
503  month         = {nov},
504  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<2753:wwpite>2.0.co;2},
505  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<2753:wwpite>2.0.co;2},
506  pages         = {2753--2768},
507  volume        = {29},
508  number        = {11},
509  issn          = {1520-0485}
510}
511
512@Article{         blanke.delecluse_93,
513  author        = {B. Blanke and P. Del\'{e}cluse},
514  title         = {Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
515                  General Circulation Model with two different mixed-layer
516                  physics},
517  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
518  publisher     = {American Meteorological Society},
519  year          = {1993},
520  month         = {jul},
521  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
522  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
523  pages         = {1363--1388},
524  volume        = {23},
525  number        = {7},
526  issn          = {1520-0485}
527}
528
529@Article{         blanke.neelin.ea_97,
530  author        = {B. Blanke and J. D. Neelin and D. Gutzler},
531  title         = {Estimating the effect of stochastic wind stress forcing on
532                  {ENSO} irregularity},
533  journal       = {Journal of Climate},
534  publisher     = {American Meteorological Society},
535  year          = {1997},
536  month         = {jul},
537  doi           = {10.1175/1520-0442(1997)010<1473:eteosw>2.0.co;2},
538  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0442(1997)010<1473:eteosw>2.0.co;2},
539  pages         = {1473--1486},
540  volume        = {10},
541  number        = {7},
542  issn          = {1520-0442}
543}
544
545@Article{         blanke.raynaud_97,
546  author        = {B. Blanke and S. Raynaud},
547  title         = {Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
548                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results},
549  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
550  publisher     = {American Meteorological Society},
551  year          = {1997},
552  month         = {jun},
553  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
554  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
555  pages         = {1038--1053},
556  volume        = {27},
557  number        = {6},
558  issn          = {1520-0485}
559}
560
561@Article{         blanke.speich.ea_01,
562  author        = {B. Blanke and S. Speich and G. Madec and K. D\"{o}\"{o}s},
563  title         = {A global diagnostic of interocean mass transfers},
564  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
565  publisher     = {American Meteorological Society},
566  year          = {2001},
567  month         = {jun},
568  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<1623:agdoim>2.0.co;2},
569  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<1623:agdoim>2.0.co;2},
570  pages         = {1623--1632},
571  volume        = {31},
572  number        = {6},
573  issn          = {1520-0485}
574}
575
576@Article{         blanke.speich.ea_02,
577  author        = {B. Blanke and S. Speich and G. Madec and R. Maug\'{e}},
578  title         = {A global diagnostic of interior ocean ventilation},
579  journal       = {Geophysical Research Letters},
580  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
581  year          = {2002},
582  month         = {apr},
583  doi           = {10.1029/2001gl013727},
584  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001gl013727},
585  pages         = {1081--1084},
586  volume        = {29},
587  number        = {8},
588  issn          = {0094-8276}
589}
590
591@Article{         blayo.debreu_05,
592  author        = {E. Blayo and L. Debreu},
593  title         = {Revisiting open boundary conditions from the point of view
594                  of characteristic variables},
595  journal       = {Ocean Modelling},
596  publisher     = {Elsevier BV},
597  year          = {2005},
598  month         = {jan},
599  doi           = {10.1016/j.ocemod.2004.07.001},
600  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2004.07.001},
601  pages         = {231--252},
602  volume        = {9},
603  number        = {3},
604  issn          = {1463-5003}
605}
606
607@Article{         bloom.takacs.ea_96,
608  author        = {S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
609                  Ledvina},
610  title         = {Data assimilation using incremental analysis updates},
611  journal       = {Monthly Weather Review},
612  publisher     = {American Meteorological Society},
613  year          = {1996},
614  month         = {jun},
615  doi           = {10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
616  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
617  pages         = {1256--1271},
618  volume        = {124},
619  number        = {6},
620  issn          = {1520-0493}
621}
622
623@Article{         bopp.monfray.ea_01,
624  author        = {L. Bopp and P. Monfray and O. Aumont and J.-L. Dufresne
625                  and H. Le Treut and G. Madec and L. Terray and J. C. Orr},
626  title         = {Potential impact of climate change on marine export
627                  production},
628  journal       = {Global Biogeochemical Cycles},
629  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
630  year          = {2001},
631  month         = {mar},
632  doi           = {10.1029/1999gb001256},
633  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999gb001256},
634  pages         = {81--99},
635  volume        = {15},
636  number        = {1},
637  issn          = {0886-6236}
638}
639
640@Article{         bouffard.boegman_13,
641  author        = {D. Bouffard and L. Boegman},
642  title         = {A diapycnal diffusivity model for stratified environmental
643                  flows},
644  journal       = {Dynamics of Atmospheres and Oceans},
645  publisher     = {Elsevier BV},
646  year          = {2013},
647  month         = {jun},
648  doi           = {10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002},
649  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002},
650  pages         = {14--34},
651  volume        = {61-62},
652  issn          = {0377-0265}
653}
654
655@Article{         bougeault.lacarrere_89,
656  author        = {P. Bougeault and P. Lacarrere},
657  title         = {Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
658                  Mesobeta--Scale Model},
659  journal       = {Monthly Weather Review},
660  publisher     = {American Meteorological Society},
661  year          = {1989},
662  month         = {aug},
663  doi           = {10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
664  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
665  pages         = {1872--1890},
666  volume        = {117},
667  number        = {8},
668  issn          = {1520-0493}
669}
670
671@Article{         bouillon.maqueda.ea_09,
672  author        = {S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
673                  Fichefet},
674  title         = {An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
675                  Arakawa {B} and {C} grids},
676  journal       = {Ocean Modelling},
677  publisher     = {Elsevier BV},
678  year          = {2009},
679  month         = {jan},
680  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
681  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
682  pages         = {174--184},
683  volume        = {27},
684  number        = {3-4},
685  issn          = {1463-5003}
686}
687
688@Article{         boulanger.durand.ea_01,
689  author        = {J.-P. Boulanger and E. Durand and J.-P. Duvel and C.
690                  Menkes and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and M. Lengaigne
691                  and G. Madec and S. Masson},
692  title         = {Role of non-linear oceanic processes in the response to
693                  westerly wind events: New implications for the 1997 El
694                  Ni\~{n}o onset},
695  journal       = {Geophysical Research Letters},
696  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
697  year          = {2001},
698  month         = {apr},
699  doi           = {10.1029/2000gl012364},
700  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000gl012364},
701  pages         = {1603--1606},
702  volume        = {28},
703  number        = {8},
704  issn          = {0094-8276}
705}
706
707@Article{         boyer-montegut.madec.ea_04,
708  author        = {C. de Boyer Mont\'{e}gut and G. Madec and A. S. Fischer
709                  and A. Lazar and D. Iudicone},
710  title         = {Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
711                  profile data and a profile-based climatology},
712  journal       = {Journal of Geophysical Research},
713  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
714  year          = {2004},
715  doi           = {10.1029/2004jc002378},
716  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2004JC002378},
717  pages         = {C12003},
718  volume        = {109},
719  number        = {C12},
720  issn          = {0148-0227}
721}
722
723@Article{         boyer-montegut.vialard.ea_07,
724  author        = {C. de Boyer Mont\'{e}gut and J. Vialard and S. S. C.
725                  Shenoi and and D. Shankar and F. Durand and C. \'{E}th\'{e}
726                  and G. Madec},
727  title         = {Simulated seasonal and interannual variability of the
728                  mixed layer heat budget in the northern Indian Ocean},
729  journal       = {Journal of Climate},
730  publisher     = {American Meteorological Society},
731  year          = {2007},
732  month         = {jul},
733  doi           = {10.1175/jcli4148.1},
734  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli4148.1},
735  pages         = {3249--3268},
736  volume        = {20},
737  number        = {13},
738  issn          = {1520-0442}
739}
740
741@Article{         brankart.candille.ea_15,
742  author        = {J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
743                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
744                  J. Verron},
745  title         = {A generic approach to explicit simulation of uncertainty
746                  in the {NEMO} ocean model},
747  journal       = {Geoscientific Model Development},
748  publisher     = {Copernicus GmbH},
749  year          = {2015},
750  month         = {may},
751  doi           = {10.5194/gmd-8-1285-2015},
752  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1285-2015},
753  pages         = {1285--1297},
754  volume        = {8},
755  number        = {5},
756  issn          = {1991-9603}
757}
758
759@Article{         brankart_13,
760  author        = {J.-M. Brankart},
761  title         = {Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
762                  upon low resolution global ocean modelling},
763  journal       = {Ocean Modelling},
764  publisher     = {Elsevier BV},
765  year          = {2013},
766  month         = {jun},
767  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
768  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
769  pages         = {64--76},
770  volume        = {66},
771  issn          = {1463-5003}
772}
773
774@Article{         breivik.bidlot.ea_16,
775  author        = {{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen},
776  title         = {A Stokes drift approximation based on the Phillips
777                  spectrum},
778  journal       = {Ocean Modelling},
779  publisher     = {Elsevier BV},
780  year          = {2016},
781  month         = {apr},
782  doi           = {10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
783  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
784  pages         = {49--56},
785  volume        = {100},
786  issn          = {1463-5003}
787}
788
789@Article{         breivik.janssen.ea_14,
790  author        = {{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot},
791  title         = {Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water},
792  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
793  publisher     = {American Meteorological Society},
794  year          = {2014},
795  month         = {sep},
796  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0020.1},
797  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0020.1},
798  pages         = {2433--2445},
799  volume        = {44},
800  number        = {9},
801  issn          = {1520-0485}
802}
803
804@Article{         brodeau.barnier.ea_10,
805  author        = {L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
806                  Penduff and S. Gulev},
807  title         = {An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
808                  circulation models},
809  journal       = {Ocean Modelling},
810  publisher     = {Elsevier BV},
811  year          = {2010},
812  month         = {jan},
813  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
814  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
815  pages         = {88--104},
816  volume        = {31},
817  number        = {3-4},
818  issn          = {1463-5003}
819}
820
821@Article{         brown.campana_78,
822  author        = {J. A. Brown and K. A. Campana},
823  title         = {An economical time-differencing system for numerical
824                  weather prediction},
825  journal       = {Monthly Weather Review},
826  publisher     = {American Meteorological Society},
827  year          = {1978},
828  month         = {aug},
829  doi           = {10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
830  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
831  pages         = {1125--1136},
832  volume        = {106},
833  number        = {8},
834  issn          = {1520-0493}
835}
836
837@Article{         bryan_84,
838  author        = {K. Bryan},
839  title         = {Accelerating the convergence to equilibrium of
840                  ocean-climate models},
841  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
842  publisher     = {American Meteorological Society},
843  year          = {1984},
844  month         = {apr},
845  doi           = {10.1175/1520-0485(1984)014<0666:atcteo>2.0.co;2},
846  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1984)014<0666:atcteo>2.0.co;2},
847  pages         = {666--673},
848  volume        = {14},
849  number        = {4},
850  issn          = {1520-0485}
851}
852
853@Article{         bryan_97,
854  author        = {K. Bryan},
855  title         = {A numerical method for the study of the circulation of the
856                  world ocean},
857  journal       = {Journal of Computational Physics},
858  publisher     = {Elsevier BV},
859  year          = {1997},
860  month         = {Aug},
861  doi           = {10.1006/jcph.1997.5699},
862  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1997.5699},
863  volume        = {135},
864  number        = {2},
865  pages         = {154--169},
866  issn          = {0021-9991}
867}
868
869@Article{         bryden_73,
870  author        = {H. L. Bryden},
871  title         = {New polynomials for thermal expansion, adiabatic
872                  temperature gradient and potential temperature of sea
873                  water},
874  journal       = {Deep Sea Research and Oceanographic Abstracts},
875  publisher     = {Elsevier BV},
876  year          = {1973},
877  month         = {apr},
878  doi           = {10.1016/0011-7471(73)90063-6},
879  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0011-7471(73)90063-6},
880  pages         = {401--408},
881  volume        = {20},
882  number        = {4},
883  issn          = {0011-7471}
884}
885
886@Article{         burchard_02,
887  author        = {H. Burchard},
888  title         = {Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
889                  buoyancy production},
890  journal       = {Ocean Modelling},
891  publisher     = {Elsevier BV},
892  year          = {2002},
893  month         = {jun},
894  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00009-4},
895  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/S1463-5003(02)00009-4},
896  pages         = {347--361},
897  volume        = {4},
898  number        = {3-4},
899  issn          = {1463-5003}
900}
901
902@Article{         campin.adcroft.ea_04,
903  author        = {J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall},
904  title         = {Conservation of properties in a free-surface model},
905  journal       = {Ocean Modelling},
906  publisher     = {Elsevier BV},
907  year          = {2004},
908  month         = {jan},
909  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
910  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
911  pages         = {221--244},
912  volume        = {6},
913  number        = {3-4},
914  issn          = {1463-5003}
915}
916
917@Article{         campin.goosse_99,
918  author        = {J.-M. Campin and H. Goosse},
919  title         = {Parameterization of density-driven downsloping flow for a
920                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate},
921  journal       = {Tellus A},
922  publisher     = {Informa UK Limited},
923  year          = {1999},
924  month         = {may},
925  doi           = {10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
926  url           = {http://dx.doi.org/10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
927  pages         = {412--430},
928  volume        = {51},
929  number        = {3},
930  issn          = {1600-0870}
931}
932
933@Article{         campin.marshall.ea_08,
934  author        = {J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira},
935  title         = {Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
936                  coordinate z^{∗}},
937  journal       = {Ocean Modelling},
938  publisher     = {Elsevier BV},
939  year          = {2008},
940  month         = {jan},
941  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
942  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
943  pages         = {1--14},
944  volume        = {24},
945  number        = {1-2},
946  issn          = {1463-5003}
947}
948
949@Article{         canuto.howard.ea_01,
950  author        = {V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
951                  Dubovikov},
952  title         = {Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
953                  model-momentum and heat vertical diffusivities},
954  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
955  publisher     = {American Meteorological Society},
956  year          = {2001},
957  month         = {jun},
958  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
959  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
960  pages         = {1413--1426},
961  volume        = {31},
962  number        = {6},
963  issn          = {1520-0485}
964}
965
966@Article{         carrere.lyard_03,
967  author        = {L. Carr\`{e}re and F. Lyard},
968  title         = {Modeling the barotropic response of the global ocean to
969                  atmospheric wind and pressure forcing - comparisons with
970                  observations},
971  journal       = {Geophysical Research Letters},
972  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
973  year          = {2003},
974  month         = {mar},
975  doi           = {10.1029/2002gl016473},
976  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL016473},
977  volume        = {30},
978  number        = {6},
979  issn          = {0094-8276}
980}
981
982@Article{         castellari.pinardi.ea_98,
983  author        = {S. Castellari and N. Pinardi and K. Leaman},
984  title         = {A model study of air-sea interactions in the
985                  Mediterranean Sea},
986  journal       = {Journal of Marine Systems},
987  publisher     = {Elsevier BV},
988  year          = {1998},
989  month         = {dec},
990  doi           = {10.1016/s0924-7963(98)90007-0},
991  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0924-7963(98)90007-0},
992  pages         = {89--114},
993  volume        = {18},
994  number        = {1-3},
995  issn          = {0924-7963}
996}
997
998@TechReport{      chanut_mersea05,
999  author        = {J. Chanut},
1000  title         = {Nesting code for {NEMO}},
1001  year          = {2005},
1002  month         = {may},
1003  doi           = {10.5281/zenodo.3243409},
1004  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3243409},
1005  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
1006                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
1007  pages         = {25}
1008}
1009
1010@Article{         chassignet.smith.ea_03,
1011  author        = {E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
1012                  R. Bleck},
1013  title         = {North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
1014                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
1015                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity},
1016  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1017  publisher     = {American Meteorological Society},
1018  year          = {2003},
1019  month         = {dec},
1020  doi           = {10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
1021  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
1022  pages         = {2504--2526},
1023  volume        = {33},
1024  number        = {12},
1025  issn          = {1520-0485}
1026}
1027
1028@Article{         covey.abe-ouchi.ea_00,
1029  author        = {C. Covey and A. Abe-Ouchi and G. J. Boer and B. A. Boville
1030                  and U. Cubasch and L. Fairhead and G. M. Flato and H.
1031                  Gordon and E. Guilyardi and X. Jiang and T. C. Johns and H.
1032                  Le Treut and G. Madec and G. A. Meehl and R. Miller and A.
1033                  Noda and S. B. Power and E. Roeckner and G. Russell and E.
1034                  K. Schneider and R. J. Stouffer and L. Terray and J.-S. von
1035                  Storch},
1036  title         = {The seasonal cycle in Coupled ocean-atmosphere General
1037                  Circulation Models},
1038  journal       = {Climate Dynamics},
1039  publisher     = {Springer Nature},
1040  year          = {2000},
1041  month         = {oct},
1042  doi           = {10.1007/s003820000081},
1043  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s003820000081},
1044  pages         = {775--787},
1045  volume        = {16},
1046  number        = {10-11},
1047  issn          = {1432-0894}
1048}
1049
1050@Article{         cox_87,
1051  author        = {M. D. Cox},
1052  title         = {Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model},
1053  journal       = {Ocean Modelling},
1054  year          = {1987},
1055  month         = {jan},
1056  url           = {https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model},
1057  pages         = {1--9},
1058  volume        = {74}
1059}
1060
1061@Article{         craig.banner_94,
1062  author        = {P. D. Craig and M. L. Banner},
1063  title         = {Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
1064                  layer},
1065  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1066  publisher     = {American Meteorological Society},
1067  year          = {1994},
1068  month         = {dec},
1069  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
1070  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
1071  pages         = {2546--2559},
1072  volume        = {24},
1073  number        = {12},
1074  issn          = {1520-0485}
1075}
1076
1077@Article{         craik.leibovich_76,
1078  author        = {A. D. D. Craik and S. Leibovich},
1079  title         = {A rational model for Langmuir circulations},
1080  journal       = {Journal of Fluid Mechanics},
1081  publisher     = {Cambridge University Press (CUP)},
1082  year          = {1976},
1083  month         = {feb},
1084  doi           = {10.1017/s0022112076001420},
1085  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/s0022112076001420},
1086  pages         = {401--426},
1087  volume        = {73},
1088  number        = {3},
1089  issn          = {1469-7645}
1090}
1091
1092@Article{         cravatte.madec.ea_07,
1093  author        = {S. Cravatte and G. Madec and T. Izumo and C. Menkes and A.
1094                  Bozec},
1095  title         = {Progress in the 3-{D} circulation of the eastern
1096                  equatorial Pacific in a climate ocean model},
1097  journal       = {Ocean Modelling},
1098  publisher     = {Elsevier BV},
1099  year          = {2007},
1100  month         = {jan},
1101  doi           = {10.1016/j.ocemod.2006.11.003},
1102  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2006.11.003},
1103  pages         = {28--48},
1104  volume        = {17},
1105  number        = {1},
1106  issn          = {1463-5003}
1107}
1108
1109@Article{         dalessio.abdella.ea_98,
1110  author        = {S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane},
1111  title         = {A new second-order turbulence closure scheme for modeling
1112                  the oceanic mixed layer},
1113  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1114  publisher     = {American Meteorological Society},
1115  year          = {1998},
1116  month         = {aug},
1117  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
1118  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
1119  pages         = {1624--1641},
1120  volume        = {28},
1121  number        = {8},
1122  issn          = {1520-0485}
1123}
1124
1125@Book{            daley.barker_01,
1126  author        = {R. Daley and E. Barker},
1127  booktitle     = {{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
1128                  Data Assimilation System},
1129  publisher     = {Defense Technical Information Center},
1130  editor        = {Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division},
1131  year          = {2001},
1132  month         = {jul},
1133  doi           = {10.21236/ada396883},
1134  url           = {http://dx.doi.org/10.21236/ada396883},
1135  pages         = {163}
1136}
1137
1138@Article{         danabasoglu.ferrari.ea_08,
1139  author        = {G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams},
1140  title         = {Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
1141                  parameterization of near-surface eddy fluxes},
1142  journal       = {Journal of Climate},
1143  publisher     = {American Meteorological Society},
1144  year          = {2008},
1145  month         = {mar},
1146  doi           = {10.1175/2007jcli1508.1},
1147  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2007JCLI1508.1},
1148  pages         = {1192--1208},
1149  volume        = {21},
1150  number        = {6},
1151  issn          = {1520-0442}
1152}
1153
1154@Article{         dandonneau.menkes.ea_04,
1155  author        = {Y. Dandonneau and C. Menkes and T. Gorgues and G. Madec},
1156  title         = {Response to comment on {\"}Oceanic Rossby waves acting as a
1157                  'Hay Rake' for ecosystem floating by-products\"},
1158  journal       = {Science},
1159  publisher     = {American Association for the Advancement of Science
1160                  (AAAS)},
1161  year          = {2004},
1162  month         = {apr},
1163  doi           = {10.1126/science.1095997},
1164  url           = {http://dx.doi.org/10.1126/science.1095997},
1165  pages         = {390},
1166  volume        = {304},
1167  number        = {5669},
1168  issn          = {1095-9203}
1169}
1170
1171@Article{         davies_76,
1172  author        = {H. C. Davies},
1173  title         = {A lateral boundary formulation for multi-level prediction
1174                  models},
1175  journal       = {Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society},
1176  publisher     = {Wiley},
1177  year          = {1976},
1178  month         = {apr},
1179  doi           = {10.1002/qj.49710243210},
1180  url           = {http://dx.doi.org/10.1002/qj.49710243210},
1181  pages         = {405--418},
1182  volume        = {102},
1183  number        = {432},
1184  issn          = {0035-9009}
1185}
1186
1187@Article{         debreu.vouland.ea_08,
1188  author        = {L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo},
1189  title         = {{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran},
1190  journal       = {Computers \& Geosciences},
1191  publisher     = {Elsevier BV},
1192  year          = {2008},
1193  month         = {jan},
1194  doi           = {10.1016/j.cageo.2007.01.009},
1195  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2007.01.009},
1196  pages         = {8--13},
1197  volume        = {34},
1198  number        = {1},
1199  issn          = {0098-3004}
1200}
1201
1202@InCollection{    delecluse.madec_99,
1203  author        = {P. Del\'{e}cluse and G. Madec},
1204  title         = {Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
1205                  system},
1206  booktitle     = {Modeling the Earth's Climate and its Variability},
1207  publisher     = {North Holland},
1208  editor        = {W. R. Holland and S. Joussaume and F. David},
1209  year          = {1999},
1210  isbn          = {978-0-444-50338-1},
1211  series        = {Les Houches},
1212  volume        = {67},
1213  pages         = {237--313}
1214}
1215
1216@PhDThesis{       demange_14,
1217  author        = {J. Demange},
1218  title         = {Advection and gravity waves propagation numerical schemes
1219                  for oceanic circulation models},
1220  year          = {2014},
1221  pages         = {138},
1222  url           = {https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf},
1223  school        = {Grenoble University, France}
1224}
1225
1226@Article{         dobricic.pinardi.ea_07,
1227  author        = {S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
1228                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez},
1229  title         = {Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
1230                  System at the basin scale},
1231  journal       = {Ocean Science},
1232  publisher     = {Copernicus GmbH},
1233  year          = {2007},
1234  month         = {mar},
1235  doi           = {10.5194/os-3-149-2007},
1236  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-149-2007},
1237  pages         = {149--157},
1238  volume        = {3},
1239  number        = {1},
1240  issn          = {1812-0792}
1241}
1242
1243@Article{         doney.lindsay.ea_04,
1244  author        = {S. C. Doney and K. Lindsay and K. Caldeira and J.-M.
1245                  Campin and H. Drange and J.-C. Dutay and M. Follows and
1246                  Y. Gao and A. Gnanadesikan and N. Gruber and A. Ishida and
1247                  F. Joos and G. Madec and E. Maier-Reimer and J. C.
1248                  Marshall and R. J. Matear and P. Monfray and A. Mouchet and
1249                  R. Najjar and J. C. Orr and G.-K. Plattner and J.
1250                  Sarmiento and R. Schlitzer and R. Slater and I. J.
1251                  Totterdell and M.-F. Weirig and Y. Yamanaka and A. Yool},
1252  title         = {Evaluating global ocean carbon models: the importance of
1253                  realistic physics},
1254  journal       = {Global Biogeochemical Cycles},
1255  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1256  year          = {2004},
1257  month         = {sep},
1258  doi           = {10.1029/2003gb002150},
1259  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2003GB002150},
1260  volume        = {18},
1261  number        = {3},
1262  issn          = {0886-6236}
1263}
1264
1265@Article{         dortenzio.iudicone.ea_05,
1266  author        = {F. D'Ortenzio and D. Iudicone and C. de Boyer Mont\'{e}gut
1267                  and P. Testor and D. Antoine and S. Marullo and R.
1268                  Santoleri and G. Madec},
1269  title         = {Seasonal variability of the mixed layer depth in the
1270                  Mediterranean Sea as derived from in situ profiles},
1271  journal       = {Geophysical Research Letters},
1272  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1273  year          = {2005},
1274  month         = {jun},
1275  doi           = {10.1029/2005gl022463},
1276  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2005GL022463},
1277  pages         = {L12605},
1278  volume        = {32},
1279  number        = {12},
1280  issn          = {0094-8276}
1281}
1282
1283@Article{         doscher.beckmann_00,
1284  author        = {R. D\"{o}scher and A. Beckmann},
1285  title         = {Effects of a Bottom Boundary Layer Parameterization in a
1286                  Coarse-Resolution Model of the North Atlantic Ocean},
1287  journal       = {Journal of Atmospheric and Oceanic Technology},
1288  publisher     = {American Meteorological Society},
1289  year          = {2000},
1290  month         = {may},
1291  doi           = {10.1175/1520-0426(2000)017<0698:eoabbl>2.0.co;2},
1292  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0426(2000)017<0698:eoabbl>2.0.co;2},
1293  pages         = {698--707},
1294  volume        = {17},
1295  number        = {5},
1296  issn          = {1520-0426}
1297}
1298
1299@Article{         drijfhout_94,
1300  author        = {S. S. Drijfhout},
1301  title         = {Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
1302                  Model},
1303  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1304  publisher     = {American Meteorological Society},
1305  year          = {1994},
1306  month         = {feb},
1307  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
1308  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
1309  pages         = {353--369},
1310  volume        = {24},
1311  number        = {2},
1312  issn          = {1520-0485}
1313}
1314
1315@Article{         dukowicz.smith_94,
1316  author        = {J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
1317  title         = {Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
1318                  ocean model},
1319  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1320  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1321  year          = {1994},
1322  doi           = {10.1029/93jc03455},
1323  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc03455},
1324  pages         = {7991--8014},
1325  volume        = {99},
1326  number        = {C4},
1327  issn          = {0148-0227}
1328}
1329
1330@Article{         durand.shankar.ea_07,
1331  author        = {F. Durand and D. Shankar and C. de Boyer Mont\'{e}gut and
1332                  S. S. C. Shenoi and B. Blanke and G. Madec},
1333  title         = {Modeling the barrier-layer formation in the south-eastern
1334                  Arabian Sea},
1335  journal       = {Journal of Climate},
1336  publisher     = {American Meteorological Society},
1337  year          = {2007},
1338  month         = {may},
1339  doi           = {10.1175/jcli4112.1},
1340  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli4112.1},
1341  pages         = {2109--2120},
1342  volume        = {20},
1343  number        = {10},
1344  issn          = {1520-0442}
1345}
1346
1347@Article{         durand.shetye.ea_04,
1348  author        = {F. Durand and S. R. Shetye and J. Vialard and D. Shankar
1349                  and S. S. C. Shenoi and C. \'{E}th\'{e} and G. Madec},
1350  title         = {Impact of temperature inversions on {SST} evolution in the
1351                  south-eastern Arabian Sea during the pre-summer monsoon
1352                  season},
1353  journal       = {Geophysical Research Letters},
1354  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1355  year          = {2004},
1356  doi           = {10.1029/2003gl018906},
1357  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2003GL018906},
1358  pages         = {L01305},
1359  volume        = {31},
1360  number        = {1},
1361  issn          = {0094-8276}
1362}
1363
1364@InProceedings{   durran_01,
1365  author        = {D. R. Durran},
1366  title         = {Open boundary conditions: fact and fiction},
1367  booktitle     = {IUTAM symposium on advances in mathematical modelling of
1368                  atmosphere and ocean dynamics},
1369  publisher     = {Springer Netherlands},
1370  editor        = {P. F. Hodnett},
1371  year          = {2001},
1372  doi           = {10.1007/978-94-010-0792-4_1},
1373  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/978-94-010-0792-4_1},
1374  series        = {Fluid Mechanics and Its Applications},
1375  pages         = {1--18},
1376  issn          = {0926-5112},
1377  isbn          = {978-94-010-0792-4}
1378}
1379
1380@Article{         dutay.bullister.ea_02,
1381  author        = {J.-C. Dutay and J. L. Bullister and S. C. Doney and J. C.
1382                  Orr and R. Najjar and K. Caldeira and J.-M. Campin and H.
1383                  Drange and M. Follows and Y. Gao and N. Gruber and M. W.
1384                  Hecht and A. Ishida and F. Joos and K. Lindsay and G. Madec
1385                  and E. Maier-Reimer and J. C. Marshall and R. J. Matear and
1386                  P. Monfray and G.-K. Plattner and J. Sarmiento and R.
1387                  Schlitzer and R. Slater and I. J. Totterdell and M.-F.
1388                  Weirig and Y. Yamanaka and A. Yool},
1389  title         = {Evaluation of ocean model ventilation with {CFC}-11:
1390                  comparison of 13 global ocean models},
1391  journal       = {Ocean Modelling},
1392  publisher     = {Elsevier BV},
1393  year          = {2002},
1394  month         = {jan},
1395  doi           = {10.1016/s1463-5003(01)00013-0},
1396  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(01)00013-0},
1397  pages         = {89--120},
1398  volume        = {4},
1399  number        = {2},
1400  issn          = {1463-5003}
1401}
1402
1403@Article{         dutay.emile-geay.ea_09,
1404  author        = {J.-C. Dutay and J. Emile-Geay and D. Iudicone and P.
1405                  Jean-Baptiste and G. Madec and C. Carouge},
1406  title         = {Helium isotopic constraints on simulated ocean
1407                  circulations: implications for abyssal theories},
1408  journal       = {Environmental Fluid Mechanics},
1409  publisher     = {Springer Nature},
1410  year          = {2009},
1411  month         = {dec},
1412  doi           = {10.1007/s10652-009-9159-y},
1413  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10652-009-9159-y},
1414  pages         = {257--273},
1415  volume        = {10},
1416  number        = {1-2},
1417  issn          = {1573-1510}
1418}
1419
1420@Article{         dutay.jean-baptiste.ea_04,
1421  author        = {J.-C. Dutay and P. Jean-Baptiste and J.-M. Campin and A.
1422                  Ishida and E. Maier-Reimer and R. J. Matear and A. Mouchet
1423                  and I. J. Totterdell and Y. Yamanaka and K. Rodgers and G.
1424                  Madec and J. C. Orr},
1425  title         = {Evaluation of {OCMIP}-2 ocean models deep circulation with
1426                  mantle helium-3},
1427  journal       = {Journal of Marine Systems},
1428  publisher     = {Elsevier BV},
1429  year          = {2004},
1430  month         = {jul},
1431  doi           = {10.1016/j.jmarsys.2003.05.010},
1432  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jmarsys.2003.05.010},
1433  pages         = {15--36},
1434  volume        = {48},
1435  number        = {1-4},
1436  issn          = {0924-7963}
1437}
1438
1439@Article{         eby.holloway_94,
1440  author        = {M. Eby and G. Holloway},
1441  title         = {Sensitivity of a Large-Scale Ocean Model to a
1442                  Parameterization of Topographic Stress},
1443  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1444  publisher     = {American Meteorological Society},
1445  year          = {1994},
1446  month         = {dec},
1447  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<2577:soalso>2.0.co;2},
1448  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<2577:soalso>2.0.co;2},
1449  pages         = {2577--2588},
1450  volume        = {24},
1451  number        = {12},
1452  issn          = {1520-0485}
1453}
1454
1455@Article{         egbert.ray_00,
1456  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
1457  title         = {Significant dissipation of tidal energy in the deep ocean
1458                  inferred from satellite altimeter data},
1459  journal       = {Nature},
1460  publisher     = {Springer Nature},
1461  year          = {2000},
1462  month         = {jun},
1463  doi           = {10.1038/35015531},
1464  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/35015531},
1465  pages         = {775--778},
1466  volume        = {405},
1467  number        = {6788},
1468  issn          = {1476-4687}
1469}
1470
1471@Article{         egbert.ray_01,
1472  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
1473  title         = {Estimates of {M2} tidal energy dissipation from
1474                  {TOPEX}/Poseidon altimeter data},
1475  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1476  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1477  year          = {2001},
1478  month         = {oct},
1479  doi           = {10.1029/2000jc000699},
1480  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000699},
1481  pages         = {22475--22502},
1482  volume        = {106},
1483  number        = {C10},
1484  issn          = {0148-0227}
1485}
1486
1487@Article{         eiseman.stone_80,
1488  author        = {P. R. Eiseman and A. P. Stone},
1489  title         = {Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey},
1490  journal       = {SIAM Review},
1491  publisher     = {Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)},
1492  year          = {1980},
1493  month         = {jan},
1494  doi           = {10.1137/1022002},
1495  url           = {http://dx.doi.org/10.1137/1022002},
1496  pages         = {12--27},
1497  volume        = {22},
1498  number        = {1},
1499  issn          = {1095-7200}
1500}
1501
1502@Article{         emile-geay.madec_09,
1503  author        = {J. Emile-Geay and G. Madec},
1504  title         = {Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
1505                  circulation},
1506  journal       = {Ocean Science},
1507  publisher     = {Copernicus GmbH},
1508  year          = {2009},
1509  month         = {jun},
1510  doi           = {10.5194/os-5-203-2009},
1511  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-5-203-2009},
1512  pages         = {203--217},
1513  volume        = {5},
1514  number        = {2},
1515  issn          = {1812-0792}
1516}
1517
1518@Article{         engedahl_95,
1519  author        = {H. Engedahl},
1520  title         = {Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
1521                  baroclinic ocean model with realistic topography},
1522  journal       = {Tellus A},
1523  publisher     = {Informa UK Limited},
1524  year          = {1995},
1525  month         = {jan},
1526  doi           = {10.3402/tellusa.v47i3.11523},
1527  url           = {http://dx.doi.org/10.3402/tellusa.v47i3.11523},
1528  pages         = {365--382},
1529  volume        = {47},
1530  number        = {3},
1531  issn          = {1600-0870}
1532}
1533
1534@PhDThesis{       farge-coulombier_87,
1535  author        = {M. Farge Coulombier},
1536  title         = {Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
1537                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant},
1538  year          = {1987},
1539  pages         = {353},
1540  url           = {http://www.theses.fr/1987PA066365},
1541  school        = {Paris VI University, France}
1542}
1543
1544@Article{         farrow.stevens_95,
1545  author        = {D. E. Farrow and D. P. Stevens},
1546  title         = {A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
1547                  General Circulation Models},
1548  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1549  publisher     = {American Meteorological Society},
1550  year          = {1995},
1551  month         = {jul},
1552  doi           = {10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
1553  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
1554  pages         = {1731--1741},
1555  volume        = {25},
1556  number        = {7},
1557  issn          = {1520-0485}
1558}
1559
1560@Article{         flather_76,
1561  author        = {R. A. Flather},
1562  title         = {A tidal model of the north-west European continental
1563                  shelf},
1564  journal       = {M\'{e}moires de la Societ\'{e} Royale des Sciences de
1565                  Li\`{e}ge},
1566  year          = {1976},
1567  pages         = {141--164},
1568  volume        = {10},
1569  number        = {6}
1570}
1571
1572@Article{         flather_94,
1573  author        = {R. A. Flather},
1574  title         = {A storm surge prediction model for the northern Bay of
1575                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
1576                  1991},
1577  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1578  publisher     = {American Meteorological Society},
1579  year          = {1994},
1580  month         = {jan},
1581  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
1582  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
1583  pages         = {172--190},
1584  volume        = {24},
1585  number        = {1},
1586  issn          = {1520-0485}
1587}
1588
1589@Book{            fofonoff.millard_83,
1590  author        = {N P. Fofonoff and R. C. Millard},
1591  booktitle     = {Algorithms for computation of fundamental properties of
1592                  seawater},
1593  publisher     = {UNESCO},
1594  editor        = {UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO},
1595  year          = {1983},
1596  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en},
1597  series        = {Technical Paper in Marine Science},
1598  pages         = {53},
1599  volume        = {44}
1600}
1601
1602@Article{         fujio.imasato_91,
1603  author        = {S. Fujio and N. Imasato},
1604  title         = {Diagnostic calculation for circulation and water mass
1605                  movement in the deep Pacific},
1606  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1607  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1608  year          = {1991},
1609  month         = {jan},
1610  doi           = {10.1029/90jc02130},
1611  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/90jc02130},
1612  pages         = {759--774},
1613  volume        = {96},
1614  number        = {C1},
1615  issn          = {0148-0227}
1616}
1617
1618@Article{         galperin.kantha.ea_88,
1619  author        = {B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati},
1620  title         = {A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
1621                  flows},
1622  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
1623  publisher     = {American Meteorological Society},
1624  year          = {1988},
1625  month         = {jan},
1626  doi           = {10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
1627  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
1628  pages         = {55--62},
1629  volume        = {45},
1630  number        = {1},
1631  issn          = {1520-0469}
1632}
1633
1634@Article{         gargett_84,
1635  author        = {A. E. Gargett},
1636  title         = {Vertical eddy diffusivity in the ocean interior},
1637  journal       = {Journal of Marine Research},
1638  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
1639  year          = {1984},
1640  month         = {may},
1641  doi           = {10.1357/002224084788502756},
1642  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502756},
1643  pages         = {359--393},
1644  volume        = {42},
1645  number        = {2},
1646  issn          = {1543-9542}
1647}
1648
1649@Article{         gaspar.gregoris.ea_90,
1650  author        = {P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre},
1651  title         = {A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
1652                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
1653                  long-term upper ocean study site},
1654  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1655  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1656  year          = {1990},
1657  doi           = {10.1029/jc095ic09p16179},
1658  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc095ic09p16179},
1659  pages         = {16179},
1660  volume        = {95},
1661  number        = {C9},
1662  issn          = {0148-0227}
1663}
1664
1665@Article{         gent.mcwilliams_90,
1666  author        = {P. R. Gent and J. C. McWilliams},
1667  title         = {Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models},
1668  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1669  publisher     = {American Meteorological Society},
1670  year          = {1990},
1671  month         = {jan},
1672  doi           = {10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
1673  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
1674  pages         = {150--155},
1675  volume        = {20},
1676  number        = {1},
1677  issn          = {1520-0485}
1678}
1679
1680@Article{         gentemann.minnett.ea_09,
1681  author        = {C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward},
1682  title         = {Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
1683                  of upper ocean diurnal warming},
1684  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1685  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1686  year          = {2009},
1687  month         = {jul},
1688  doi           = {10.1029/2008jc004825},
1689  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2008JC004825},
1690  pages         = {C07017},
1691  volume        = {114},
1692  number        = {C7},
1693  issn          = {0148-0227}
1694}
1695
1696@Article{         gerdes.koberle_91,
1697  author        = {R. Gerdes and C. K\"{o}berle and J. Willebrand},
1698  title         = {The influence of numerical advection schemes on the
1699                  results of Ocean General Circulation Models},
1700  journal       = {Climate Dynamics},
1701  publisher     = {Springer Nature},
1702  year          = {1991},
1703  month         = {jun},
1704  doi           = {10.1007/bf00210006},
1705  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/BF00210006},
1706  pages         = {211--226},
1707  volume        = {5},
1708  number        = {4},
1709  issn          = {1432-0894}
1710}
1711
1712@Article{         gerdes_93,
1713  author        = {R. Gerdes},
1714  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
1715                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
1716                  and testing of the model},
1717  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1718  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1719  year          = {1993},
1720  doi           = {10.1029/93jc00760},
1721  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00760},
1722  pages         = {14683},
1723  volume        = {98},
1724  number        = {C8},
1725  issn          = {0148-0227}
1726}
1727
1728@Article{         gerdes_93*1,
1729  author        = {R. Gerdes},
1730  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
1731                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
1732                  to an overflow problem},
1733  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1734  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1735  year          = {1993},
1736  doi           = {10.1029/93jc00788},
1737  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00788},
1738  pages         = {14703--14726},
1739  volume        = {98},
1740  number        = {C8},
1741  issn          = {0148-0227}
1742}
1743
1744@TechReport{      gibson_86,
1745  author        = {J. K. Gibson},
1746  title         = {Standards for software development and maintenance},
1747  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
1748  year          = {1986},
1749  month         = {aug},
1750  doi           = {10.21957/gi113q4gn},
1751  url           = {https://www.ecmwf.int/node/9565},
1752  institution   = {ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom},
1753  pages         = {21},
1754  number        = {120}
1755}
1756
1757@Book{            gill_82,
1758  author        = {A. E. Gill},
1759  booktitle     = {Atmosphere-Ocean Dynamics},
1760  publisher     = {Elsevier},
1761  issn          = {0074-6142},
1762  year          = {1982},
1763  month         = {nov},
1764  doi           = {10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1765  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1766  isbn          = {978-0-12-283522-3},
1767  series        = {International Geophysics},
1768  pages         = {662},
1769  volume        = {30}
1770}
1771
1772@Article{         goff_10,
1773  author        = {J. A. Goff},
1774  title         = {Global prediction of abyssal hill root-mean-square heights
1775                  from small-scale altimetric gravity variability},
1776  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1777  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1778  year          = {2010},
1779  month         = {dec},
1780  doi           = {10.1029/2010jb007867},
1781  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2010JB007867},
1782  pages         = {B12104},
1783  volume        = {115},
1784  number        = {B12},
1785  issn          = {0148-0227}
1786}
1787
1788@Article{         goosse.deleersnijder.ea_99,
1789  author        = {H. Goosse and E. Deleersnijder and T. Fichefet and M. H.
1790                  England},
1791  title         = {Sensitivity of a global coupled ocean-sea ice model to the
1792                  parameterization of vertical mixing},
1793  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1794  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1795  year          = {1999},
1796  month         = {jun},
1797  doi           = {10.1029/1999jc900099},
1798  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999jc900099},
1799  pages         = {13681--13695},
1800  volume        = {104},
1801  number        = {C6},
1802  issn          = {0148-0227}
1803}
1804
1805@Article{         gorgues.menkes.ea_07,
1806  author        = {T. Gorgues and C. Menkes and O. Aumont and Y. Dandonneau
1807                  and G. Madec and K. Rodgers},
1808  title         = {Indonesian ThroughFlow control of the eastern equatorial
1809                  Pacific biogeochemistry},
1810  journal       = {Geophysical Research Letters},
1811  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1812  year          = {2007},
1813  month         = {mar},
1814  doi           = {10.1029/2006gl028210},
1815  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2006GL028210},
1816  pages         = {L05609},
1817  volume        = {34},
1818  number        = {5},
1819  issn          = {0094-8276}
1820}
1821
1822@Article{         graham.mcdougall_13,
1823  author        = {F. S. Graham and T. J. McDougall},
1824  title         = {Quantifying the nonconservative production of conservative
1825                  temperature, potential temperature, and entropy},
1826  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1827  publisher     = {American Meteorological Society},
1828  year          = {2013},
1829  month         = {may},
1830  doi           = {10.1175/jpo-d-11-0188.1},
1831  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-11-0188.1},
1832  pages         = {838--862},
1833  volume        = {43},
1834  number        = {5},
1835  issn          = {1520-0485}
1836}
1837
1838@Article{         greatbatch_94,
1839  author        = {R. J. Greatbatch},
1840  title         = {A note on the representation of steric sea level in models
1841                  that conserve volume rather than mass},
1842  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1843  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1844  year          = {1994},
1845  doi           = {10.1029/94jc00847},
1846  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc00847},
1847  pages         = {12767--12771},
1848  volume        = {99},
1849  number        = {C6},
1850  issn          = {0148-0227}
1851}
1852
1853@Article{         griffies.biastoch.ea_09,
1854  author        = {S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B\"{o}ning and F.
1855                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1856                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1857                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1858                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1859                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1860                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin},
1861  title         = {Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)},
1862  journal       = {Ocean Modelling},
1863  publisher     = {Elsevier BV},
1864  year          = {2009},
1865  month         = {jan},
1866  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1867  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1868  pages         = {1--46},
1869  volume        = {26},
1870  number        = {1-2},
1871  issn          = {1463-5003}
1872}
1873
1874@Article{         griffies.gnanadesikan.ea_05,
1875  author        = {S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and K. W. Dixon and J.
1876                  P. Dunne and R. Gerdes and M. J. Harrison and A. Rosati and
1877                  J. L. Russell and B. L. Samuels and M. J. Spelman and M.
1878                  Winton and R. Zhang},
1879  title         = {Formulation of an ocean model for global climate
1880                  simulations},
1881  journal       = {Ocean Science},
1882  publisher     = {Copernicus GmbH},
1883  year          = {2005},
1884  month         = {sep},
1885  doi           = {10.5194/os-1-45-2005},
1886  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-1-45-2005},
1887  pages         = {45--79},
1888  volume        = {1},
1889  number        = {1},
1890  issn          = {1812-0792}
1891}
1892
1893@Article{         griffies.gnanadesikan.ea_98,
1894  author        = {S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1895                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
1896  title         = {Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model},
1897  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1898  publisher     = {American Meteorological Society},
1899  year          = {1998},
1900  month         = {may},
1901  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1902  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1903  pages         = {805--830},
1904  volume        = {28},
1905  number        = {5},
1906  issn          = {1520-0485}
1907}
1908
1909@Article{         griffies.hallberg_00,
1910  author        = {S. M. Griffies and R. W. Hallberg},
1911  title         = {Biharmonic friction with a Smagorinsky-like viscosity for
1912                  use in large-scale eddy-permitting ocean models},
1913  journal       = {Monthly Weather Review},
1914  publisher     = {American Meteorological Society},
1915  year          = {2000},
1916  month         = {aug},
1917  doi           = {10.1175/1520-0493(2000)128<2935:bfwasl>2.0.co;2},
1918  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(2000)128<2935:bfwasl>2.0.co;2},
1919  pages         = {2935--2946},
1920  volume        = {128},
1921  number        = {8},
1922  issn          = {1520-0493}
1923}
1924
1925@Article{         griffies.pacanowski.ea_01,
1926  author        = {S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1927                  Balaji},
1928  title         = {Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1929                  for z-coordinate Ocean Models},
1930  journal       = {Monthly Weather Review},
1931  publisher     = {American Meteorological Society},
1932  year          = {2001},
1933  month         = {may},
1934  doi           = {10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1935  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1936  pages         = {1081--1098},
1937  volume        = {129},
1938  number        = {5},
1939  issn          = {1520-0493}
1940}
1941
1942@Book{            griffies_04,
1943  author        = {S. M. Griffies},
1944  booktitle     = {Fundamentals of ocean climate models},
1945  publisher     = {Princeton University Press},
1946  year          = {2004},
1947  month         = {dec},
1948  doi           = {10.2307/j.ctv301gzg},
1949  url           = {http://dx.doi.org/10.2307/j.ctv301gzg},
1950  pages         = {434},
1951  isbn          = {978-0-691-18712-9}
1952}
1953
1954@Article{         griffies_98,
1955  author        = {S. M. Griffies},
1956  title         = {The Gent-McWilliams skew-flux},
1957  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1958  publisher     = {American Meteorological Society},
1959  year          = {1998},
1960  month         = {may},
1961  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1962  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1963  pages         = {831--841},
1964  volume        = {28},
1965  number        = {5},
1966  issn          = {1520-0485}
1967}
1968
1969@Article{         guilyardi.gualdi.ea_04,
1970  author        = {E. Guilyardi and S. Gualdi and J. M. Slingo and A. Navarra
1971                  and P. Del\'{e}cluse and J. Cole and G. Madec and M.
1972                  Roberts and M. Latif and L. Terray},
1973  title         = {Representing El Ni\~{n}o in coupled ocean-atmosphere
1974                  {GCM}s: the dominant role of the atmospheric component},
1975  journal       = {Journal of Climate},
1976  publisher     = {American Meteorological Society},
1977  year          = {2004},
1978  month         = {dec},
1979  doi           = {10.1175/jcli-3260.1},
1980  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli-3260.1},
1981  pages         = {4623--4629},
1982  volume        = {17},
1983  number        = {24},
1984  issn          = {1520-0442}
1985}
1986
1987@Article{         guilyardi.madec.ea_01,
1988  author        = {E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray},
1989  title         = {The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1990                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}},
1991  journal       = {Climate Dynamics},
1992  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
1993  year          = {2001},
1994  month         = {may},
1995  doi           = {10.1007/pl00007930},
1996  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/pl00007930},
1997  pages         = {589--599},
1998  volume        = {17},
1999  number        = {8},
2000  issn          = {0930-7575}
2001}
2002
2003@Article{         guilyardi.madec.ea_95,
2004  author        = {E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray and M.
2005                  D\'{e}qu\'{e} and M. Pontaud and M. Imbard and D. B.
2006                  Stephenson and M.-A. Filiberti and D. Cariolle and P.
2007                  Del\'{e}cluse and O. Thual},
2008  title         = {Simulation couplée océan-atmosphère de la variabilité
2009                  du climat},
2010  journal       = {Comptes Rendus de l'Acad\'{e}mie des Sciences de Paris},
2011  year          = {1995},
2012  month         = {apr},
2013  url           = {https://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k65676840/f31.item},
2014  series        = {IIA Earth and Planetary Science},
2015  issn          = {1251-8050},
2016  pages         = {683--690},
2017  volume        = {320},
2018  number        = {s\'{e}rie IIa}
2019}
2020
2021@Article{         guilyardi.madec_97,
2022  author        = {E. Guilyardi and G. Madec},
2023  title         = {Performance of the {OPA}/{ARPEGE}-{T21} global
2024                  ocean-atmosphere coupled model},
2025  journal       = {Climate Dynamics},
2026  publisher     = {Springer Nature},
2027  year          = {1997},
2028  month         = {feb},
2029  doi           = {10.1007/s003820050157},
2030  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s003820050157},
2031  pages         = {149--165},
2032  volume        = {13},
2033  number        = {2},
2034  issn          = {1432-0894}
2035}
2036
2037@InProceedings{   guyon.madec.ea_99,
2038  author        = {M. Guyon and G. Madec and M. Imbard and F.-X. Roux},
2039  title         = {A parallel ocean model for high resolution studies},
2040  booktitle     = {Euro-Par'99 Parallel Processing},
2041  journal       = {Lecture Notes in Computer Science},
2042  publisher     = {Springer Berlin Heidelberg},
2043  editor        = {P. Amestoy and P. Berger and M. Dayd{\'e} and D. Ruiz and
2044                  I. Duff and V. Frayss{\'e} and L. Giraud},
2045  year          = {1999},
2046  doi           = {10.1007/3-540-48311-x_85},
2047  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/3-540-48311-x_85},
2048  pages         = {603--607},
2049  issn          = {0302-9743},
2050  isbn          = {978-3-540-48311-3}
2051}
2052
2053@Article{         guyon.madec.ea_99*1,
2054  author        = {M. Guyon and G. Madec and F.-X. Roux and M. Imbard and C.
2055                  Herbaut and P. Fronier},
2056  title         = {Parallelization of the {OPA} ocean model},
2057  journal       = {Calculateurs Paralleles Reseaux et Systemes Repartis},
2058  publisher     = {La Boucle informatique},
2059  year          = {1999},
2060  pages         = {499--517},
2061  volume        = {11},
2062  number        = {4}
2063}
2064
2065@Book{            haltiner.williams_80,
2066  author        = {G. J. Haltiner and R. T. Williams},
2067  booktitle     = {Numerical prediction and dynamic meteorology},
2068  publisher     = {Wiley},
2069  year          = {1980},
2070  url           = {https://books.google.fr/books?id=YS9RAAAAMAAJ},
2071  isbn          = {9780471059714},
2072  pages         = {477},
2073  edition       = {2}
2074}
2075
2076@Article{         haney_91,
2077  author        = {R. L. Haney},
2078  title         = {On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
2079                  Sigma Coordinate Ocean Models},
2080  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2081  publisher     = {American Meteorological Society},
2082  year          = {1991},
2083  month         = {apr},
2084  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
2085  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
2086  pages         = {610--619},
2087  volume        = {21},
2088  number        = {4},
2089  issn          = {1520-0485}
2090}
2091
2092@Article{         hazeleger.drijfhout_00,
2093  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
2094  title         = {A model study on internally generated variability in
2095                  subtropical mode water formation},
2096  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2097  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2098  year          = {2000},
2099  month         = {jun},
2100  doi           = {10.1029/2000jc900041},
2101  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900041},
2102  pages         = {13965--13979},
2103  volume        = {105},
2104  number        = {C6},
2105  issn          = {0148-0227}
2106}
2107
2108@Article{         hazeleger.drijfhout_00*1,
2109  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
2110  title         = {Eddy subduction in a model of the subtropical gyre},
2111  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2112  publisher     = {American Meteorological Society},
2113  year          = {2000},
2114  month         = {apr},
2115  doi           = {10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
2116  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
2117  pages         = {677--695},
2118  volume        = {30},
2119  number        = {4},
2120  issn          = {1520-0485}
2121}
2122
2123@Article{         hazeleger.drijfhout_98,
2124  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
2125  title         = {Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
2126                  response to anomalous forcing},
2127  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2128  publisher     = {American Meteorological Society},
2129  year          = {1998},
2130  month         = {feb},
2131  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
2132  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
2133  pages         = {266--288},
2134  volume        = {28},
2135  number        = {2},
2136  issn          = {1520-0485}
2137}
2138
2139@Article{         hazeleger.drijfhout_99,
2140  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
2141  title         = {Stochastically forced mode water variability},
2142  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2143  publisher     = {American Meteorological Society},
2144  year          = {1999},
2145  month         = {aug},
2146  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
2147  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
2148  pages         = {1772--1786},
2149  volume        = {29},
2150  number        = {8},
2151  issn          = {1520-0485}
2152}
2153
2154@Article{         he.ding_01,
2155  author        = {Y. He and C. H. Q. Ding},
2156  title         = {Using accurate arithmetics to improve numerical
2157                  reproducibility and stability in parallel applications},
2158  journal       = {The Journal of Supercomputing},
2159  publisher     = {Springer Nature},
2160  year          = {2001},
2161  doi           = {10.1023/a:1008153532043},
2162  url           = {http://dx.doi.org/10.1023/A:1008153532043},
2163  pages         = {259--277},
2164  volume        = {18},
2165  number        = {3},
2166  issn          = {0920-8542}
2167}
2168
2169@Article{         hellerman.rosenstein_83,
2170  author        = {S. Hellerman and M. Rosenstein},
2171  title         = {Normal monthly wind stress over the world ocean with error
2172                  estimates},
2173  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2174  publisher     = {American Meteorological Society},
2175  year          = {1983},
2176  month         = {jul},
2177  doi           = {10.1175/1520-0485(1983)013<1093:nmwsot>2.0.co;2},
2178  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1983)013<1093:nmwsot>2.0.co;2},
2179  pages         = {1093--1104},
2180  volume        = {13},
2181  number        = {7},
2182  issn          = {1520-0485}
2183}
2184
2185@Article{         hirt.amsden.ea_74,
2186  author        = {C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook},
2187  title         = {An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
2188                  flow speeds},
2189  journal       = {Journal of Computational Physics},
2190  publisher     = {Elsevier BV},
2191  year          = {1974},
2192  month         = {mar},
2193  doi           = {10.1016/0021-9991(74)90051-5},
2194  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(74)90051-5},
2195  pages         = {227--253},
2196  volume        = {14},
2197  number        = {3},
2198  issn          = {0021-9991}
2199}
2200
2201@Article{         hofmeister.burchard.ea_10,
2202  author        = {R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers},
2203  title         = {Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
2204                  ocean models},
2205  journal       = {Ocean Modelling},
2206  publisher     = {Elsevier BV},
2207  year          = {2010},
2208  month         = {jan},
2209  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
2210  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
2211  pages         = {70--86},
2212  volume        = {33},
2213  number        = {1-2},
2214  issn          = {1463-5003}
2215}
2216
2217@Article{         holland.jenkins_99,
2218  author        = {D. M. Holland and A. Jenkins},
2219  title         = {Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the
2220                  base of an ice shelf},
2221  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2222  publisher     = {American Meteorological Society},
2223  year          = {1999},
2224  month         = {aug},
2225  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
2226  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
2227  pages         = {1787--1800},
2228  volume        = {29},
2229  number        = {8},
2230  issn          = {1520-0485}
2231}
2232
2233@Article{         holloway.wang_09,
2234  author        = {G. Holloway and Z. Wang},
2235  title         = {Representing eddy stress in an Arctic Ocean model},
2236  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2237  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2238  year          = {2009},
2239  month         = {jun},
2240  doi           = {10.1029/2008jc005169},
2241  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2008JC005169},
2242  volume        = {114},
2243  number        = {C6},
2244  issn          = {0148-0227}
2245}
2246
2247@Article{         holloway_86,
2248  author        = {G. Holloway},
2249  title         = {A shelf wave/topographic pump drives mean coastal
2250                  Circulation (part {I})},
2251  journal       = {Ocean Modelling},
2252  year          = {1986},
2253  volume        = {68}
2254}
2255
2256@Article{         holloway_92,
2257  author        = {G. Holloway},
2258  title         = {Representing Topographic Stress for Large-Scale Ocean
2259                  Models},
2260  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2261  publisher     = {American Meteorological Society},
2262  year          = {1992},
2263  month         = {sep},
2264  doi           = {10.1175/1520-0485(1992)022<1033:rtsfls>2.0.co;2},
2265  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1992)022<1033:rtsfls>2.0.co;2},
2266  pages         = {1033--1046},
2267  volume        = {22},
2268  number        = {9},
2269  issn          = {1520-0485}
2270}
2271
2272@Article{         hordoir.polcher.ea_08,
2273  author        = {R. Hordoir and J. Polcher and J.-C. Brun-Cottan and G.
2274                  Madec},
2275  title         = {Towards a parametrization of river discharges into Ocean
2276                  General Circulation Models: a closure through energy
2277                  conservation},
2278  journal       = {Climate Dynamics},
2279  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
2280  year          = {2008},
2281  month         = {may},
2282  doi           = {10.1007/s00382-008-0416-4},
2283  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-008-0416-4},
2284  pages         = {891--908},
2285  volume        = {31},
2286  number        = {7-8},
2287  issn          = {1432-0894}
2288}
2289
2290@Article{         hsu.arakawa_90,
2291  author        = {Y.-J. G. Hsu and A. Arakawa},
2292  title         = {Numerical Modeling of the Atmosphere with an Isentropic
2293                  Vertical Coordinate},
2294  journal       = {Monthly Weather Review},
2295  publisher     = {American Meteorological Society},
2296  year          = {1990},
2297  month         = {oct},
2298  doi           = {10.1175/1520-0493(1990)118<1933:nmotaw>2.0.co;2},
2299  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1990)118<1933:nmotaw>2.0.co;2},
2300  pages         = {1933--1959},
2301  volume        = {118},
2302  number        = {10},
2303  issn          = {1520-0493}
2304}
2305
2306@Article{         huang_93,
2307  author        = {R. X. Huang},
2308  title         = {Real freshwater flux as a natural boundary condition for
2309                  the salinity balance and thermohaline circulation forced by
2310                  evaporation and precipitation},
2311  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2312  publisher     = {American Meteorological Society},
2313  year          = {1993},
2314  month         = {nov},
2315  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<2428:rffaan>2.0.co;2},
2316  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<2428:rffaan>2.0.co;2},
2317  pages         = {2428--2446},
2318  volume        = {23},
2319  number        = {11},
2320  issn          = {1520-0485}
2321}
2322
2323@TechReport{      hunter_06,
2324  author        = {J. R. Hunter},
2325  title         = {Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities},
2326  year          = {2006},
2327  month         = {jun},
2328  url           = {http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf},
2329  institution   = {Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
2330                  Centre},
2331  pages         = {17},
2332  number        = {7}
2333}
2334
2335@Article{         iudicone.madec.ea_08,
2336  author        = {D. Iudicone and G. Madec and T. J. McDougall},
2337  title         = {Water-mass transformations in a neutral density framework
2338                  and the key role of light penetration},
2339  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2340  publisher     = {American Meteorological Society},
2341  year          = {2008},
2342  month         = {jul},
2343  doi           = {10.1175/2007jpo3464.1},
2344  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2007jpo3464.1},
2345  pages         = {1357--1376},
2346  volume        = {38},
2347  number        = {7},
2348  issn          = {1520-0485}
2349}
2350
2351@Article{         iudicone.madec.ea_08*1,
2352  author        = {D. Iudicone and G. Madec and B. Blanke and S. Speich},
2353  title         = {The role of Southern Ocean surface forcings and mixing in
2354                  the global conveyor},
2355  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2356  publisher     = {American Meteorological Society},
2357  year          = {2008},
2358  month         = {jul},
2359  doi           = {10.1175/2008jpo3519.1},
2360  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2008jpo3519.1},
2361  pages         = {1377--1400},
2362  volume        = {38},
2363  number        = {7},
2364  issn          = {1520-0485}
2365}
2366
2367@Article{         iudicone.rodgers.ea_07,
2368  author        = {D. Iudicone and K. Rodgers and R. Schopp and G. Madec},
2369  title         = {An exchange window for the injection of Antarctic
2370                  intermediate water into the south Pacific},
2371  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2372  publisher     = {American Meteorological Society},
2373  year          = {2007},
2374  month         = {jan},
2375  doi           = {10.1175/jpo2985.1},
2376  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jpo2985.1},
2377  pages         = {31--49},
2378  volume        = {37},
2379  number        = {1},
2380  issn          = {1520-0485}
2381}
2382
2383@Article{         iudicone.speich.ea_08,
2384  author        = {D. Iudicone and S. Speich and G. Madec and B. Blanke},
2385  title         = {The global conveyor belt from a Southern Ocean
2386                  perspective},
2387  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2388  publisher     = {American Meteorological Society},
2389  year          = {2008},
2390  month         = {jul},
2391  doi           = {10.1175/2007jpo3525.1},
2392  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2007jpo3525.1},
2393  pages         = {1401--1425},
2394  volume        = {38},
2395  number        = {7},
2396  issn          = {1520-0485}
2397}
2398
2399@Article{         izumo.masson.ea_10,
2400  author        = {T. Izumo and S. Masson and J. Vialard and C. de Boyer
2401                  Mont\'{e}gut and S. K. Behera and G. Madec and K. Takahashi
2402                  and T. Yamagata},
2403  title         = {Low and high frequency Madden-Julian oscillations in
2404                  austral summer: interannual variations},
2405  journal       = {Climate Dynamics},
2406  publisher     = {Springer Nature},
2407  year          = {2010},
2408  month         = {sep},
2409  doi           = {10.1007/s00382-009-0655-z},
2410  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-009-0655-z},
2411  pages         = {669--683},
2412  volume        = {35},
2413  number        = {4},
2414  issn          = {1432-0894}
2415}
2416
2417@Article{         jackett.mcdougall_95,
2418  author        = {D. R. Jackett and T. J. McDougall},
2419  title         = {Minimal adjustment of hydrographic profiles to achieve
2420                  static stability},
2421  journal       = {Journal of Atmospheric and Oceanic Technology},
2422  publisher     = {American Meteorological Society},
2423  year          = {1995},
2424  month         = {apr},
2425  doi           = {10.1175/1520-0426(1995)012<0381:maohpt>2.0.co;2},
2426  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0426(1995)012<0381:maohpt>2.0.co;2},
2427  pages         = {381--389},
2428  volume        = {12},
2429  number        = {2},
2430  issn          = {1520-0426}
2431}
2432
2433@Article{         jackson.rehmann_14,
2434  author        = {P. R. Jackson and C. R. Rehmann},
2435  title         = {Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
2436                  a sheared, stratified flow},
2437  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2438  publisher     = {American Meteorological Society},
2439  year          = {2014},
2440  month         = {oct},
2441  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0027.1},
2442  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0027.1},
2443  pages         = {2661--2680},
2444  volume        = {44},
2445  number        = {10},
2446  issn          = {1520-0485}
2447}
2448
2449@TechReport{      janssen.breivik.ea_13,
2450  author        = {P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
2451                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
2452                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni},
2453  title         = {Air-sea interaction and surface waves},
2454  year          = {2013},
2455  month         = {nov},
2456  doi           = {10.21957/0kg73joh},
2457  url           = {https://www.ecmwf.int/node/10238},
2458  pages         = {36},
2459  volume        = {712},
2460  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
2461  institution   = {ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom}
2462}
2463
2464@Article{         jayne.laurent_01,
2465  author        = {S. R. Jayne and L. C. {St Laurent}},
2466  title         = {Parameterizing tidal dissipation over rough topography},
2467  journal       = {Geophysical Research Letters},
2468  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2469  year          = {2001},
2470  month         = {mar},
2471  doi           = {10.1029/2000gl012044},
2472  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000gl012044},
2473  pages         = {811--814},
2474  volume        = {28},
2475  number        = {5},
2476  issn          = {0094-8276}
2477}
2478
2479@Article{         jenkins.hellmer.ea_01,
2480  author        = {A. Jenkins and H. H. Hellmer and D. M. Holland},
2481  title         = {The role of meltwater advection in the formulation of
2482                  conservative boundary conditions at an ice-ocean
2483                  interface},
2484  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2485  publisher     = {American Meteorological Society},
2486  year          = {2001},
2487  month         = {jan},
2488  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<0285:tromai>2.0.co;2},
2489  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<0285:tromai>2.0.co;2},
2490  pages         = {285--296},
2491  volume        = {31},
2492  number        = {1},
2493  issn          = {1520-0485}
2494}
2495
2496@Article{         jenkins.nicholls.ea_10,
2497  author        = {A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr},
2498  title         = {Observation and parameterization of ablation at the base
2499                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica},
2500  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2501  publisher     = {American Meteorological Society},
2502  year          = {2010},
2503  month         = {oct},
2504  doi           = {10.1175/2010jpo4317.1},
2505  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2010jpo4317.1},
2506  pages         = {2298--2312},
2507  volume        = {40},
2508  number        = {10},
2509  issn          = {1520-0485}
2510}
2511
2512@Article{         jenkins_91,
2513  author        = {A. Jenkins},
2514  title         = {A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction},
2515  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2516  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2517  year          = {1991},
2518  doi           = {10.1029/91jc01842},
2519  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc01842},
2520  pages         = {20671--20677},
2521  volume        = {96},
2522  number        = {C11},
2523  issn          = {0148-0227}
2524}
2525
2526@Book{            jerlov_68,
2527  author        = {N. G. Jerlov},
2528  booktitle     = {Optical Oceanography},
2529  publisher     = {Elsevier},
2530  year          = {1968},
2531  isbn          = {978-0-444-40320-9},
2532  issn          = {0422-9894},
2533  series        = {Elsevier Oceanography},
2534  doi           = {10.1016/s0422-9894(08)x7043-6},
2535  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0422-9894(08)x7043-6},
2536  pages         = {194},
2537  volume        = {5}
2538}
2539
2540@Article{         jones_99,
2541  author        = {P. W. Jones},
2542  title         = {First- and second-order conservative remapping schemes for
2543                  grids in spherical coordinates},
2544  journal       = {Monthly Weather Review},
2545  publisher     = {American Meteorological Society},
2546  year          = {1999},
2547  month         = {sep},
2548  doi           = {10.1175/1520-0493(1999)127<2204:fasocr>2.0.co;2},
2549  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1999)127<2204:fasocr>2.0.co;2},
2550  pages         = {2204--2210},
2551  volume        = {127},
2552  number        = {9},
2553  issn          = {1520-0493}
2554}
2555
2556@Article{         kantha.carniel_03,
2557  author        = {L. Kantha and S. Carniel},
2558  title         = {Comments on {\"}{A} generic length-scale equation for
2559                  geophysical turbulence models{\"} by {L}. Umlauf and {H}.
2560                  Burchard},
2561  journal       = {Journal of Marine Research},
2562  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2563  year          = {2003},
2564  month         = {sep},
2565  doi           = {10.1357/002224003771816007},
2566  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003771816007},
2567  pages         = {693--702},
2568  volume        = {61},
2569  number        = {5},
2570  issn          = {1543-9542}
2571}
2572
2573@Article{         kantha.clayson_94,
2574  author        = {L. H. Kantha and C. A. Clayson},
2575  title         = {An improved mixed layer model for geophysical
2576                  applications},
2577  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2578  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2579  year          = {1994},
2580  doi           = {10.1029/94jc02257},
2581  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc02257},
2582  pages         = {25235--25266},
2583  volume        = {99},
2584  number        = {C12},
2585  issn          = {0148-0227}
2586}
2587
2588@Article{         kasahara_74,
2589  author        = {A. Kasahara},
2590  title         = {Various vertical coordinate systems used for numerical
2591                  weather prediction},
2592  journal       = {Monthly Weather Review},
2593  publisher     = {American Meteorological Society},
2594  year          = {1974},
2595  month         = {jul},
2596  doi           = {10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
2597  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
2598  pages         = {509--522},
2599  volume        = {102},
2600  number        = {7},
2601  issn          = {1520-0493}
2602}
2603
2604@Article{         killworth.stainforth.ea_91,
2605  author        = {P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
2606                  Paterson},
2607  title         = {The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner
2608                  ocean model},
2609  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2610  publisher     = {American Meteorological Society},
2611  year          = {1991},
2612  month         = {sep},
2613  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
2614  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
2615  pages         = {1333--1348},
2616  volume        = {21},
2617  number        = {9},
2618  issn          = {1520-0485}
2619}
2620
2621@InProceedings{   killworth_89,
2622  author        = {P. D. Killworth},
2623  title         = {On the parameterization of deep convection in ocean
2624                  models},
2625  booktitle     = {Parameterization of small-scale processes},
2626  publisher     = {Hawaii Institute of Geophysics},
2627  editor        = {P. Muller and D. Henderson},
2628  year          = {1989},
2629  month         = {jan},
2630  url           = {http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf},
2631  pages         = {59--74}
2632}
2633
2634@Article{         killworth_92,
2635  author        = {P. D. Killworth},
2636  title         = {An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
2637                  Antarctic model},
2638  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2639  publisher     = {American Meteorological Society},
2640  year          = {1992},
2641  month         = {nov},
2642  doi           = {10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
2643  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
2644  pages         = {1379--1387},
2645  volume        = {22},
2646  number        = {11},
2647  issn          = {1520-0485}
2648}
2649
2650@Article{         koch-larrouy.lengaigne.ea_10,
2651  author        = {A. Koch-Larrouy and M. Lengaigne and P. Terray and G.
2652                  Madec and S. Masson},
2653  title         = {Tidal mixing in the Indonesian Seas and its effect on the
2654                  tropical climate system},
2655  journal       = {Climate Dynamics},
2656  publisher     = {Springer Nature},
2657  year          = {2010},
2658  month         = {aug},
2659  doi           = {10.1007/s00382-009-0642-4},
2660  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-009-0642-4},
2661  pages         = {891--904},
2662  volume        = {34},
2663  number        = {6},
2664  issn          = {1432-0894}
2665}
2666
2667@Article{         koch-larrouy.madec.ea_07,
2668  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
2669                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard},
2670  title         = {On the transformation of Pacific water into Indonesian
2671                  ThroughFlow water by internal tidal mixing},
2672  journal       = {Geophysical Research Letters},
2673  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2674  year          = {2007},
2675  month         = {feb},
2676  doi           = {10.1029/2006gl028405},
2677  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2006GL028405},
2678  pages         = {L04604},
2679  volume        = {34},
2680  number        = {4},
2681  issn          = {0094-8276}
2682}
2683
2684@Article{         koch-larrouy.madec.ea_08,
2685  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and B. Blanke and R.
2686                  Molcard},
2687  title         = {Water mass transformation along the Indonesian ThroughFlow
2688                  in an {OGCM}},
2689  journal       = {Ocean Dynamics},
2690  publisher     = {Springer Nature},
2691  year          = {2008},
2692  month         = {oct},
2693  doi           = {10.1007/s10236-008-0155-4},
2694  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0155-4},
2695  pages         = {289--309},
2696  volume        = {58},
2697  number        = {3-4},
2698  issn          = {1616-7228}
2699}
2700
2701@Article{         koch-larrouy.madec.ea_08*1,
2702  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and D. Iudicone and A.
2703                  Atmadipoera and R. Molcard},
2704  title         = {Physical processes contributing to the water mass
2705                  transformation of the Indonesian ThroughFlow},
2706  journal       = {Ocean Dynamics},
2707  publisher     = {Springer Nature},
2708  year          = {2008},
2709  month         = {oct},
2710  doi           = {10.1007/s10236-008-0154-5},
2711  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0154-5},
2712  pages         = {275--288},
2713  volume        = {58},
2714  number        = {3-4},
2715  issn          = {1616-7228}
2716}
2717
2718@Article{         kolmogorov_42,
2719  author        = {A. N. Kolmogorov},
2720  title         = {Equations of turbulent motion in an incompressible fluid},
2721  journal       = {Izvestiya Akademiya Nauk SSSR},
2722  year          = {1942},
2723  series        = {Fizika},
2724  pages         = {56--58},
2725  volume        = {6}
2726}
2727
2728@Article{         kondo_75,
2729  author        = {J. Kondo},
2730  title         = {Air-sea bulk transfer coefficients in diabatic
2731                  conditions},
2732  journal       = {Boundary-Layer Meteorology},
2733  publisher     = {Springer Nature},
2734  year          = {1975},
2735  month         = {aug},
2736  doi           = {10.1007/bf00232256},
2737  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/bf00232256},
2738  pages         = {91--112},
2739  volume        = {9},
2740  number        = {1},
2741  issn          = {1573-1472}
2742}
2743
2744@Article{         large.mcwilliams.ea_94,
2745  author        = {W. G. Large and J. C. McWilliams and S. C. Doney},
2746  title         = {Oceanic vertical mixing: {A} review and a model with a
2747                  nonlocal boundary layer parameterization},
2748  journal       = {Reviews of Geophysics},
2749  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2750  year          = {1994},
2751  doi           = {10.1029/94rg01872},
2752  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94RG01872},
2753  pages         = {363--404},
2754  volume        = {32},
2755  number        = {4},
2756  issn          = {8755-1209}
2757}
2758
2759@TechReport{      large.yeager_04,
2760  author        = {W. G. Large and S. G. Yeager},
2761  title         = {Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
2762                  models: the data sets and flux climatologies},
2763  year          = {2004},
2764  month         = {may},
2765  doi           = {10.5065/d6kk98q6},
2766  url           = {http://dx.doi.org/10.5065/D6KK98Q6},
2767  institution   = {{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO, United States}
2768}
2769
2770@Article{         latif.boning.ea_06,
2771  author        = {M. Latif and C. B\"{o}ning and J. Willebrand and A.
2772                  Biastoch and J. Dengg and N. Keenlyside and U.
2773                  Schweckendiek and G. Madec},
2774  title         = {Is the Thermohaline Circulation Changing?},
2775  journal       = {Journal of Climate},
2776  publisher     = {American Meteorological Society},
2777  year          = {2006},
2778  month         = {sep},
2779  doi           = {10.1175/jcli3876.1},
2780  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3876.1},
2781  pages         = {4631--4637},
2782  volume        = {19},
2783  number        = {18},
2784  issn          = {1520-0442}
2785}
2786
2787@Article{         lavergne.madec.ea_16,
2788  author        = {C. de Lavergne and G. Madec and J. Le Sommer and A. J. G.
2789                  Nurser and A. C. Naveira Garabato},
2790  title         = {On the consumption of Antarctic Bottom Water in the
2791                  abyssal ocean},
2792  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2793  publisher     = {American Meteorological Society},
2794  year          = {2016},
2795  month         = {feb},
2796  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0201.1},
2797  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0201.1},
2798  pages         = {635--661},
2799  volume        = {46},
2800  number        = {2},
2801  issn          = {1520-0485}
2802}
2803
2804@Article{         lavergne.madec.ea_16*1,
2805  author        = {C. de Lavergne and G. Madec and J. Le Sommer and A. J. G.
2806                  Nurser and A. C. Naveira Garabato},
2807  title         = {The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
2808                  overturning},
2809  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2810  publisher     = {American Meteorological Society},
2811  year          = {2016},
2812  month         = {feb},
2813  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0259.1},
2814  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0259.1},
2815  pages         = {663--681},
2816  volume        = {46},
2817  number        = {2},
2818  issn          = {1520-0485}
2819}
2820
2821@Article{         lazar.madec.ea_99,
2822  author        = {A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
2823  title         = {The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
2824                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}},
2825  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2826  publisher     = {American Meteorological Society},
2827  year          = {1999},
2828  month         = {nov},
2829  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
2830  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
2831  pages         = {2945--2961},
2832  volume        = {29},
2833  number        = {11},
2834  issn          = {1520-0485}
2835}
2836
2837@PhDThesis{       lazar_97,
2838  author        = {A. Lazar},
2839  title         = {La branche froide de la circulation thermohaline -
2840                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
2841                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale id\'{e}alis\'{e}e},
2842  year          = {1997},
2843  url           = {http://www.theses.fr/1997PA066680},
2844  pages         = {269},
2845  school        = {Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France}
2846}
2847
2848@Article{         le-quere.orr.ea_00,
2849  author        = {C. Le Qu\'{e}r\'{e} and J. C. Orr and P. Monfray and O.
2850                  Aumont and G. Madec},
2851  title         = {Interannual variability of the oceanic sink of {CO}_2 from
2852                  1979 through 1997},
2853  journal       = {Global Biogeochemical Cycles},
2854  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2855  year          = {2000},
2856  month         = {dec},
2857  doi           = {10.1029/1999gb900049},
2858  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999gb900049},
2859  pages         = {1247--1265},
2860  volume        = {14},
2861  number        = {4},
2862  issn          = {0886-6236}
2863}
2864
2865@Article{         le-sommer.penduff.ea_09,
2866  author        = {J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
2867                  and B. Barnier},
2868  title         = {How momentum advection schemes influence
2869                  current-topography interactions at eddy permitting
2870                  resolution},
2871  journal       = {Ocean Modelling},
2872  publisher     = {Elsevier BV},
2873  year          = {2009},
2874  month         = {jan},
2875  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
2876  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
2877  pages         = {1--14},
2878  volume        = {29},
2879  number        = {1},
2880  issn          = {1463-5003}
2881}
2882
2883@Article{         leclair.madec_09,
2884  author        = {M. Leclair and G. Madec},
2885  title         = {A conservative leapfrog time stepping method},
2886  journal       = {Ocean Modelling},
2887  publisher     = {Elsevier BV},
2888  year          = {2009},
2889  month         = {jan},
2890  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
2891  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
2892  pages         = {88--94},
2893  volume        = {30},
2894  number        = {2-3},
2895  issn          = {1463-5003}
2896}
2897
2898@Article{         leclair.madec_11,
2899  author        = {M. Leclair and G. Madec},
2900  title         = {$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
2901                  coordinate separating high and low frequency motions},
2902  journal       = {Ocean Modelling},
2903  publisher     = {Elsevier BV},
2904  year          = {2011},
2905  doi           = {10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
2906  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
2907  pages         = {139--152},
2908  volume        = {37},
2909  number        = {3-4},
2910  issn          = {1463-5003}
2911}
2912
2913@PhDThesis{       leclair_10,
2914  author        = {M. Leclair},
2915  title         = {Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
2916                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an {NEMO}},
2917  year          = {2010},
2918  url           = {http://www.theses.fr/2010PA066728},
2919  pages         = {163},
2920  school        = {Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France}
2921}
2922
2923@Article{         lele_92,
2924  author        = {S. K. Lele},
2925  title         = {Compact finite difference schemes with spectral-like
2926                  resolution},
2927  journal       = {Journal of Computational Physics},
2928  publisher     = {Elsevier BV},
2929  year          = {1992},
2930  month         = {nov},
2931  doi           = {10.1016/0021-9991(92)90324-r},
2932  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(92)90324-r},
2933  pages         = {16--42},
2934  volume        = {103},
2935  number        = {1},
2936  issn          = {0021-9991}
2937}
2938
2939@Article{         lemarie.debreu.ea_12,
2940  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
2941                  C. McWilliams},
2942  title         = {On the stability and accuracy of the harmonic and
2943                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models},
2944  journal       = {Ocean Modelling},
2945  publisher     = {Elsevier BV},
2946  year          = {2012},
2947  month         = {aug},
2948  doi           = {10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
2949  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
2950  pages         = {9--35},
2951  volume        = {52-53},
2952  issn          = {1463-5003}
2953}
2954
2955@Article{         lemarie.debreu.ea_15,
2956  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
2957                  and J. M. Molines and M. Honnorat},
2958  title         = {Stability constraints for oceanic numerical models:
2959                  implications for the formulation of time and space
2960                  discretizations},
2961  journal       = {Ocean Modelling},
2962  publisher     = {Elsevier BV},
2963  year          = {2015},
2964  month         = {aug},
2965  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
2966  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
2967  pages         = {124--148},
2968  volume        = {92},
2969  issn          = {1463-5003}
2970}
2971
2972@Article{         lengaigne.boulanger.ea_02,
2973  author        = {M. Lengaigne and J.-P. Boulanger and C. Menkes and S.
2974                  Masson and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
2975  title         = {Ocean response to the March 1997 Westerly Wind Event},
2976  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2977  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2978  year          = {2002},
2979  month         = {nov},
2980  doi           = {10.1029/2001jc000841},
2981  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001JC000841},
2982  pages         = {1601--1620},
2983  volume        = {107},
2984  number        = {C12},
2985  issn          = {0148-0227}
2986}
2987
2988@Article{         lengaigne.boulanger.ea_03,
2989  author        = {M. Lengaigne and J.-P. Boulanger and C. Menkes and G.
2990                  Madec and P. Del\'{e}cluse and E. Guilyardi and J. Slingo},
2991  title         = {The March 1997 westerly wind event and the onset of the
2992                  1997/98 El Ni\~{n}o: Understanding the role of the atmospheric
2993                  response},
2994  journal       = {Journal of Climate},
2995  publisher     = {American Meteorological Society},
2996  year          = {2003},
2997  month         = {oct},
2998  doi           = {10.1175/1520-0442(2003)016<3330:tmwwea>2.0.co;2},
2999  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0442(2003)016<3330:tmwwea>2.0.co;2},
3000  pages         = {3330--3343},
3001  volume        = {16},
3002  number        = {20},
3003  issn          = {1520-0442}
3004}
3005
3006@Article{         lengaigne.madec.ea_03,
3007  author        = {M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes},
3008  title         = {Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
3009                  circulation},
3010  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3011  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3012  year          = {2003},
3013  doi           = {10.1029/2002jc001704},
3014  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002JC001704},
3015  pages         = {3345},
3016  volume        = {108},
3017  number        = {C11},
3018  issn          = {0148-0227}
3019}
3020
3021@Article{         lengaigne.madec.ea_09,
3022  author        = {M. Lengaigne and G. Madec and L. Bopp and C. Menkes and O.
3023                  Aumont and P. Cadule},
3024  title         = {Bio-physical feedbacks in the Arctic Ocean using an Earth
3025                  system model},
3026  journal       = {Geophysical Research Letters},
3027  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3028  year          = {2009},
3029  month         = {nov},
3030  doi           = {10.1029/2009gl040145},
3031  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2009GL040145},
3032  pages         = {L21602},
3033  volume        = {36},
3034  number        = {21},
3035  issn          = {0094-8276}
3036}
3037
3038@Article{         lengaigne.menkes.ea_07,
3039  author        = {M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
3040                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec},
3041  title         = {Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
3042                  climate in a Coupled General Circulation Model},
3043  journal       = {Climate Dynamics},
3044  publisher     = {Springer Nature},
3045  year          = {2007},
3046  month         = {nov},
3047  doi           = {10.1007/s00382-006-0200-2},
3048  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-006-0200-2},
3049  pages         = {503--516},
3050  volume        = {28},
3051  number        = {5},
3052  issn          = {1432-0894}
3053}
3054
3055@Article{         leonard_79,
3056  author        = {B. P. Leonard},
3057  title         = {A stable and accurate convective modelling procedure based
3058                  on quadratic upstream interpolation},
3059  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
3060  publisher     = {Elsevier BV},
3061  year          = {1979},
3062  month         = {jun},
3063  doi           = {10.1016/0045-7825(79)90034-3},
3064  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(79)90034-3},
3065  pages         = {59--98},
3066  volume        = {19},
3067  number        = {1},
3068  issn          = {0045-7825}
3069}
3070
3071@TechReport{      leonard_88,
3072  author        = {B. P. Leonard},
3073  title         = {Universal limiter for transient interpolation modeling of
3074                  the advective transport equations: The {ULTIMATE}
3075                  conservative difference scheme},
3076  year          = {1988},
3077  month         = {sep},
3078  institution   = {NASA Lewis Research Center; Cleveland, OH, United States},
3079  series        = {NASA Technical Memorandum},
3080  number        = {100916},
3081  url           = {https://ntrs.nasa.gov/search.jsp?R=19890005423},
3082  pages         = {117}
3083}
3084
3085@Article{         leonard_91,
3086  author        = {B. P. Leonard},
3087  title         = {The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
3088                  unsteady one-dimensional advection},
3089  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
3090  publisher     = {Elsevier BV},
3091  year          = {1991},
3092  month         = {jun},
3093  doi           = {10.1016/0045-7825(91)90232-u},
3094  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(91)90232-u},
3095  pages         = {17--74},
3096  volume        = {88},
3097  number        = {1},
3098  issn          = {0045-7825}
3099}
3100
3101@Article{         lermusiaux_01,
3102  author        = {P. F. J. Lermusiaux},
3103  title         = {Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
3104                  ocean variability: Massachusetts Bay},
3105  journal       = {Journal of Marine Systems},
3106  publisher     = {Elsevier BV},
3107  year          = {2001},
3108  month         = {may},
3109  doi           = {10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
3110  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
3111  pages         = {385--422},
3112  volume        = {29},
3113  number        = {1-4},
3114  issn          = {0924-7963}
3115}
3116
3117@TechReport{      levier.treguier.ea_mersea07,
3118  author        = {B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
3119                  Garnier},
3120  title         = {Free surface and variable volume in the {NEMO} code},
3121  year          = {2007},
3122  month         = {may},
3123  doi           = {10.5281/zenodo.3244182},
3124  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3244182},
3125  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
3126                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
3127  pages         = {47}
3128}
3129
3130@Book{            levitus_82,
3131  author        = {S. Levitus},
3132  booktitle     = {Climatological atlas of the world ocean},
3133  publisher     = {US Government Printing Office},
3134  year          = {1982},
3135  url           = {ftp://ftp.nodc.noaa.gov/pub/data.nodc/woa/PUBLICATIONS/levitus_atlas_1982.pdf},
3136  pages         = {173},
3137  series        = {NOAA Professional Paper},
3138  volume        = {13}
3139}
3140
3141@Article{         levy.estublier.ea_01,
3142  author        = {M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec},
3143  title         = {Choice of an advection scheme for biogeochemical models},
3144  journal       = {Geophysical Research Letters},
3145  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3146  year          = {2001},
3147  month         = {oct},
3148  doi           = {10.1029/2001gl012947},
3149  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001gl012947},
3150  pages         = {3725--3728},
3151  volume        = {28},
3152  number        = {19},
3153  issn          = {0094-8276}
3154}
3155
3156@Article{         levy.klein.ea_10,
3157  author        = {M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
3158                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi},
3159  title         = {Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
3160                  physics},
3161  journal       = {Ocean Modelling},
3162  publisher     = {Elsevier BV},
3163  year          = {2010},
3164  month         = {jan},
3165  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
3166  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
3167  pages         = {1--15},
3168  volume        = {34},
3169  number        = {1-2},
3170  issn          = {1463-5003}
3171}
3172
3173@Article{         levy.memery.ea_00,
3174  author        = {M. L\'{e}vy and L. M\'{e}mery and G. Madec},
3175  title         = {Combined effects of mesoscale processes and atmospheric
3176                  high-frequency variability on the spring bloom in the
3177                  {MEDOC} area},
3178  journal       = {Deep Sea Research},
3179  publisher     = {Elsevier BV},
3180  year          = {2000},
3181  month         = {jan},
3182  doi           = {10.1016/s0967-0637(99)00051-5},
3183  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0967-0637(99)00051-5},
3184  pages         = {27--53},
3185  volume        = {47},
3186  number        = {1},
3187  issn          = {0967-0637}
3188}
3189
3190@Article{         levy.memery.ea_98,
3191  author        = {M. L\'{e}vy and L. M\'{e}mery and G. Madec},
3192  title         = {The onset of a bloom after deep winter convection in the
3193                  northwestern Mediterranean sea: mesoscale process study
3194                  with a primitive equation model},
3195  journal       = {Journal of Marine Systems},
3196  publisher     = {Elsevier BV},
3197  year          = {1998},
3198  month         = {sep},
3199  doi           = {10.1016/s0924-7963(97)00097-3},
3200  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0924-7963(97)00097-3},
3201  pages         = {7--21},
3202  volume        = {16},
3203  number        = {1-2},
3204  issn          = {0924-7963}
3205}
3206
3207@Article{         levy.memery.ea_99,
3208  author        = {M. L\'{e}vy and L. M\'{e}mery and G. Madec},
3209  title         = {The onset of the spring bloom in the {MEDOC} area:
3210                  mesoscale spatial variability},
3211  journal       = {Deep Sea Research},
3212  publisher     = {Elsevier BV},
3213  year          = {1999},
3214  month         = {jul},
3215  doi           = {10.1016/s0967-0637(98)00105-8},
3216  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0967-0637(98)00105-8},
3217  pages         = {1137--1160},
3218  volume        = {46},
3219  number        = {7},
3220  issn          = {0967-0637}
3221}
3222
3223@Article{         li.fox-kemper.ea_17,
3224  author        = {Q. Li and B. Fox-Kemper and {\O}. Breivik and A. Webb},
3225  title         = {Statistical models of global Langmuir mixing},
3226  journal       = {Ocean Modelling},
3227  publisher     = {Elsevier BV},
3228  year          = {2017},
3229  month         = {may},
3230  doi           = {10.1016/j.ocemod.2017.03.016},
3231  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2017.03.016},
3232  pages         = {95--114},
3233  volume        = {113},
3234  issn          = {1463-5003}
3235}
3236
3237@Article{         li.garrett_93,
3238  author        = {M. Li and C. Garrett},
3239  title         = {Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
3240                  circulation},
3241  journal       = {Journal of Marine Research},
3242  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
3243  year          = {1993},
3244  month         = {nov},
3245  doi           = {10.1357/0022240933223945},
3246  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/0022240933223945},
3247  pages         = {737--769},
3248  volume        = {51},
3249  number        = {4},
3250  issn          = {1543-9542}
3251}
3252
3253@Article{         losch_08,
3254  author        = {M. Losch},
3255  title         = {Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
3256                  General Circulation Model},
3257  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3258  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3259  year          = {2008},
3260  month         = {aug},
3261  doi           = {10.1029/2007jc004368},
3262  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2007jc004368},
3263  volume        = {113},
3264  number        = {C8},
3265  issn          = {0148-0227}
3266}
3267
3268@Article{         lott.madec.ea_90,
3269  author        = {F. Lott and G. Madec and J. Verron},
3270  title         = {Topographic experiments in an Ocean General Circulation
3271                  Model},
3272  journal       = {Ocean Modelling},
3273  year          = {1990},
3274  pages         = {1--4},
3275  volume        = {88}
3276}
3277
3278@Article{         luo.masson.ea_05,
3279  author        = {J.-J. Luo and S. Masson and E. Roeckner and G. Madec and
3280                  T. Yamagata},
3281  title         = {Reducing climatology bias in an ocean-atmosphere {CGCM}
3282                  with improved coupling physics},
3283  journal       = {Journal of Climate},
3284  publisher     = {American Meteorological Society},
3285  year          = {2005},
3286  month         = {jul},
3287  doi           = {10.1175/jcli3404.1},
3288  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3404.1},
3289  pages         = {2344--2360},
3290  volume        = {18},
3291  number        = {13},
3292  issn          = {1520-0442}
3293}
3294
3295@Article{         madec.chartier.ea_91,
3296  author        = {G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon},
3297  title         = {The effect of thermohaline forcing variability on deep
3298                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
3299                  high-resolution three-dimensional numerical study},
3300  journal       = {Dynamics of Atmospheres and Oceans},
3301  publisher     = {Elsevier BV},
3302  year          = {1991},
3303  month         = {apr},
3304  doi           = {10.1016/0377-0265(91)90024-a},
3305  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0377-0265(91)90024-a},
3306  pages         = {301--332},
3307  volume        = {15},
3308  number        = {3-5},
3309  issn          = {0377-0265}
3310}
3311
3312@InProceedings{   madec.crepon_91,
3313  author        = {G. Madec and M. Cr\'{e}pon},
3314  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
3315                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
3316                  deep convection and deep water formation in the oceans",
3317  publisher     = {Elsevier},
3318  editor        = {P.C. Chu and J.C. Gascard},
3319  year          = {1991},
3320  doi           = {10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
3321  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
3322  title         = {Thermohaline-driven deep water formation in the
3323                  northwestern Mediterranean Sea},
3324  chapter       = {15},
3325  series        = {Elsevier Oceanography},
3326  volume        = {57},
3327  pages         = {241--265},
3328  issn          = {0422-9894},
3329  isbn          = {978-0-444-88764-1}
3330}
3331
3332@Article{         madec.delecluse.ea_91,
3333  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
3334                  Chartier},
3335  title         = {A three-dimensional numerical study of deep-water
3336                  formation in the northwestern Mediterranean Sea},
3337  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3338  publisher     = {American Meteorological Society},
3339  year          = {1991},
3340  month         = {sep},
3341  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
3342  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
3343  pages         = {1349--1371},
3344  volume        = {21},
3345  number        = {9},
3346  issn          = {1520-0485}
3347}
3348
3349@Article{         madec.delecluse.ea_96,
3350  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
3351                  Lott},
3352  title         = {Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
3353                  northwestern Mediterranean Sea},
3354  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3355  publisher     = {American Meteorological Society},
3356  year          = {1996},
3357  month         = {aug},
3358  doi           = {10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
3359  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
3360  pages         = {1393--1408},
3361  volume        = {26},
3362  number        = {8},
3363  issn          = {1520-0485}
3364}
3365
3366@Manual{          madec.delecluse.ea_98,
3367  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
3368                  L\'{e}vy},
3369  title         = {{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
3370                  manual},
3371  journal       = {Note du Pole de Mod\'{e}lisation},
3372  publisher     = {Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})},
3373  year          = {1998},
3374  url           = {http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf},
3375  pages         = {91},
3376  issn          = {1288-1619},
3377  volume        = {11}
3378}
3379
3380@Article{         madec.delecluse_97,
3381  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
3382  title         = {The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
3383                  Coupled Model},
3384  journal       = {International WOCE Newsletter},
3385  publisher     = {University of Southampton},
3386  year          = {1997},
3387  month         = {apr},
3388  url           = {https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf},
3389  pages         = {12--15},
3390  volume        = {26}
3391}
3392
3393@Article{         madec.imbard_96,
3394  author        = {G. Madec and M. Imbard},
3395  title         = {A global ocean mesh to overcome the North Pole
3396                  singularity},
3397  journal       = {Climate Dynamics},
3398  publisher     = {Springer Nature},
3399  year          = {1996},
3400  month         = {may},
3401  doi           = {10.1007/bf00211684},
3402  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/bf00211684},
3403  pages         = {381--388},
3404  volume        = {12},
3405  number        = {6},
3406  issn          = {1432-0894}
3407}
3408
3409@Article{         madec.rahier.ea_88,
3410  author        = {G. Madec and C. Rahier and M. Chartier},
3411  title         = {A comparison of two-dimensional elliptic solvers for the
3412                  barotropic streamfunction in a multilevel {OGCM}},
3413  journal       = {Ocean Modelling},
3414  year          = {1988},
3415  pages         = {1--6},
3416  volume        = {78}
3417}
3418
3419@Article{         maes.delecluse.ea_97,
3420  author        = {C. Maes and P. Del\'{e}cluse and G. Madec},
3421  title         = {Impact of westerly wind bursts on the warm pool of the
3422                  {TOGA}-{COARE} domain in an {OGCM}},
3423  journal       = {Climate Dynamics},
3424  publisher     = {Springer Nature},
3425  year          = {1997},
3426  month         = {dec},
3427  doi           = {10.1007/s003820050208},
3428  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s003820050208},
3429  pages         = {55--70},
3430  volume        = {14},
3431  number        = {1},
3432  issn          = {1432-0894}
3433}
3434
3435@Article{         maes.madec.ea_97,
3436  author        = {C. Maes and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
3437  title         = {Sensitivity of an equatorial Pacific {OGCM} to the lateral
3438                  diffusion},
3439  journal       = {Monthly Weather Review},
3440  publisher     = {American Meteorological Society},
3441  year          = {1997},
3442  month         = {may},
3443  doi           = {10.1175/1520-0493(1997)125<0958:soaepo>2.0.co;2},
3444  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1997)125<0958:soaepo>2.0.co;2},
3445  pages         = {958--971},
3446  volume        = {125},
3447  number        = {5},
3448  issn          = {1520-0493}
3449}
3450
3451@Article{         maggiore.zavatarelli.ea_98,
3452  author        = {A. Maggiore and M. Zavatarelli and M. G. Angelucci and N.
3453                  Pinardi},
3454  title         = {Surface heat and water fluxes in the Adriatic Sea:
3455                  seasonal and interannual variability},
3456  journal       = {Physics and Chemistry of the Earth},
3457  publisher     = {Elsevier BV},
3458  year          = {1998},
3459  month         = {jan},
3460  doi           = {10.1016/s0079-1946(98)00070-6},
3461  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0079-1946(98)00070-6},
3462  pages         = {561--567},
3463  volume        = {23},
3464  number        = {5-6},
3465  issn          = {0079-1946}
3466}
3467
3468@Article{         maltrud.holloway_08,
3469  author        = {M. E. Maltrud and G. Holloway},
3470  title         = {Implementing biharmonic neptune in a global eddying ocean
3471                  model},
3472  journal       = {Ocean Modelling},
3473  publisher     = {Elsevier BV},
3474  year          = {2008},
3475  month         = {jan},
3476  doi           = {10.1016/j.ocemod.2007.11.003},
3477  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2007.11.003},
3478  pages         = {22--34},
3479  volume        = {21},
3480  number        = {1-2},
3481  issn          = {1463-5003}
3482}
3483
3484@Article{         maltrud.smith.ea_98,
3485  author        = {M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
3486                  Malone},
3487  title         = {Global eddy-resolving ocean simulations driven by
3488                  1985-1995 atmospheric winds},
3489  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3490  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3491  year          = {1998},
3492  month         = {dec},
3493  doi           = {10.1029/1998jc900013},
3494  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1998jc900013},
3495  pages         = {30825--30853},
3496  volume        = {103},
3497  number        = {C13},
3498  issn          = {0148-0227}
3499}
3500
3501@Article{         marchesiello.williams.ea_01,
3502  author        = {P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin},
3503  title         = {Open boundary conditions for long-term integration of
3504                  regional oceanic models},
3505  journal       = {Ocean Modelling},
3506  publisher     = {Elsevier BV},
3507  year          = {2001},
3508  month         = {jan},
3509  doi           = {10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
3510  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
3511  pages         = {1--20},
3512  volume        = {3},
3513  number        = {1-2},
3514  issn          = {1463-5003}
3515}
3516
3517@Article{         marsaleix.auclair.ea_08,
3518  author        = {P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
3519                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses},
3520  title         = {Energy conservation issues in sigma-coordinate
3521                  free-surface ocean models},
3522  journal       = {Ocean Modelling},
3523  publisher     = {Elsevier BV},
3524  year          = {2008},
3525  month         = {jan},
3526  doi           = {10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
3527  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
3528  pages         = {61--89},
3529  volume        = {20},
3530  number        = {1},
3531  issn          = {1463-5003}
3532}
3533
3534@Article{         marsh.ivchenko.ea_15,
3535  author        = {R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
3536                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
3537                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. Le Sommer and N.
3538                  Merino and V. B. Zalesny},
3539  title         = {{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
3540                  ocean model globally configured at eddy-permitting
3541                  resolution},
3542  journal       = {Geoscientific Model Development},
3543  publisher     = {Copernicus GmbH},
3544  year          = {2015},
3545  month         = {may},
3546  doi           = {10.5194/gmd-8-1547-2015},
3547  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1547-2015},
3548  pages         = {1547--1562},
3549  volume        = {8},
3550  number        = {5},
3551  issn          = {1991-9603}
3552}
3553
3554@Article{         marti.braconnot.ea_10,
3555  author        = {O. Marti and P. Braconnot and J.-L. Dufresne and J.
3556                  Bellier and R. Benshila and S. Bony and P. Brockmann and P.
3557                  Cadule and A. Caubel and F. Codron and N. de Noblet and S.
3558                  Denvil and L. Fairhead and T. Fichefet and M.-A. Foujols
3559                  and P. Friedlingstein and H. Goosse and J.-Y. Grandpeix and
3560                  E. Guilyardi and F. Hourdin and A. Idelkadi and M. Kageyama
3561                  and G. Krinner and C. L\'{e}vy and G. Madec and J. Mignot
3562                  and I. Musat and D. Swingedouw and C. Talandier},
3563  title         = {Key features of the {IPSL} ocean atmosphere model and its
3564                  sensitivity to atmospheric resolution},
3565  journal       = {Climate Dynamics},
3566  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
3567  year          = {2010},
3568  month         = {aug},
3569  doi           = {10.1007/s00382-009-0640-6},
3570  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-009-0640-6},
3571  pages         = {1--26},
3572  volume        = {34},
3573  number        = {1},
3574  issn          = {1432-0894}
3575}
3576
3577@Article{         marti.madec.ea_92,
3578  author        = {O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
3579  title         = {Comment on {\"}Net diffusivity in ocean general circulation
3580                  models with nonuniform grids{\"} by {F}. {L}. Yin and {I}.
3581                  {Y}. Fung},
3582  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3583  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3584  year          = {1992},
3585  doi           = {10.1029/92jc00306},
3586  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00306},
3587  pages         = {12763--12766},
3588  volume        = {97},
3589  number        = {C8},
3590  issn          = {0148-0227}
3591}
3592
3593@Article{         martin.adcroft_10,
3594  author        = {T. Martin and A. Adcroft},
3595  title         = {Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
3596                  with interactive icebergs in a coupled climate model},
3597  journal       = {Ocean Modelling},
3598  publisher     = {Elsevier BV},
3599  year          = {2010},
3600  month         = {jan},
3601  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
3602  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
3603  pages         = {111--124},
3604  volume        = {34},
3605  number        = {3-4},
3606  issn          = {1463-5003}
3607}
3608
3609@InProceedings{   masson.foujols.ea_08,
3610  author        = {S. Masson and M.-A. Foujols and P. Klein and G. Madec and
3611                  L. Hua and M. L\'{e}vy and H. Sasaki and K. Takahashi and
3612                  F. Svensson},
3613  title         = {{OPA9} — French experiments on the Earth simulator and
3614                  teraflop workbench tunings},
3615  booktitle     = {High Performance Computing on vector systems 2007},
3616  publisher     = {Springer Berlin Heidelberg},
3617  editor        = {M. Resch and S. Roller and P. Lammers and T. Furui and M.
3618                  Galle and W. Bez},
3619  year          = {2008},
3620  doi           = {10.1007/978-3-540-74384-2_3},
3621  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74384-2_3},
3622  pages         = {25--34},
3623  isbn          = {978-3-540-74384-2}
3624}
3625
3626@Article{         masson.luo.ea_05,
3627  author        = {S. Masson and J.-J. Luo and G. Madec and J. Vialard and F.
3628                  Durand and S. Gualdi and E. Guilyardi and S. Behera and P.
3629                  Del\'{e}cluse and A. Navarra and T. Yamagata},
3630  title         = {Impact of barrier layer on winter-spring variability of
3631                  the south-eastern Arabian Sea},
3632  journal       = {Geophysical Research Letters},
3633  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3634  year          = {2005},
3635  month         = {apr},
3636  doi           = {10.1029/2004gl021980},
3637  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2004GL021980},
3638  pages         = {L07703},
3639  volume        = {32},
3640  number        = {7},
3641  issn          = {0094-8276}
3642}
3643
3644@Article{         mathiot.jenkins.ea_17,
3645  author        = {P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec},
3646  title         = {Explicit representation and parametrised impacts of under
3647                  ice shelf seas in the z^\star coordinate ocean model {NEMO}
3648                  3.6},
3649  journal       = {Geoscientific Model Development},
3650  publisher     = {Copernicus GmbH},
3651  year          = {2017},
3652  month         = {jul},
3653  doi           = {10.5194/gmd-10-2849-2017},
3654  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-10-2849-2017},
3655  pages         = {2849--2874},
3656  volume        = {10},
3657  number        = {7},
3658  issn          = {1991-9603}
3659}
3660
3661@Article{         mcdougall.taylor_84,
3662  author        = {T. J. McDougall and J. R. Taylor},
3663  title         = {Flux measurements across a finger interface at low values
3664                  of the stability ratio},
3665  journal       = {Journal of Marine Research},
3666  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
3667  year          = {1984},
3668  month         = {feb},
3669  doi           = {10.1357/002224084788506095},
3670  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788506095},
3671  pages         = {1--14},
3672  volume        = {42},
3673  number        = {1},
3674  issn          = {1543-9542}
3675}
3676
3677@Article{         mcdougall_87,
3678  author        = {T. J. McDougall},
3679  title         = {Neutral Surfaces},
3680  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3681  publisher     = {American Meteorological Society},
3682  year          = {1987},
3683  month         = {nov},
3684  doi           = {10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2},
3685  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1987)017<1950:NS>2.0.CO;2},
3686  pages         = {1950--1964},
3687  volume        = {17},
3688  number        = {11},
3689  issn          = {1520-0485}
3690}
3691
3692@Article{         mellor.blumberg_04,
3693  author        = {G. Mellor and A. Blumberg},
3694  title         = {Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response},
3695  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3696  publisher     = {American Meteorological Society},
3697  year          = {2004},
3698  month         = {mar},
3699  doi           = {10.1175/2517.1},
3700  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2517.1},
3701  pages         = {693--698},
3702  volume        = {34},
3703  number        = {3},
3704  issn          = {1520-0485}
3705}
3706
3707@Article{         mellor.yamada_82,
3708  author        = {G. L. Mellor and T. Yamada},
3709  title         = {Development of a turbulence closure model for geophysical
3710                  fluid problems},
3711  journal       = {Reviews of Geophysics},
3712  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3713  year          = {1982},
3714  doi           = {10.1029/rg020i004p00851},
3715  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/rg020i004p00851},
3716  pages         = {851--875},
3717  volume        = {20},
3718  number        = {4},
3719  issn          = {8755-1209}
3720}
3721
3722@Article{         menkes.vialard.ea_06,
3723  author        = {C. Menkes and J. Vialard and S C. Kennan and J.-P.
3724                  Boulanger and G. Madec},
3725  title         = {A modelling study of the impact of tropical instability
3726                  waves on the heat budget of the eastern equatorial
3727                  Pacific},
3728  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3729  publisher     = {American Meteorological Society},
3730  year          = {2006},
3731  month         = {may},
3732  doi           = {10.1175/jpo2904.1},
3733  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jpo2904.1},
3734  pages         = {847--865},
3735  volume        = {36},
3736  number        = {5},
3737  issn          = {1520-0485}
3738}
3739
3740@Article{         merryfield.holloway.ea_99,
3741  author        = {W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett},
3742  title         = {A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing},
3743  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3744  publisher     = {American Meteorological Society},
3745  year          = {1999},
3746  month         = {jun},
3747  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
3748  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
3749  pages         = {1124--1142},
3750  volume        = {29},
3751  number        = {6},
3752  issn          = {1520-0485}
3753}
3754
3755@Book{            mesinger.arakawa_76,
3756  author        = {F. Mesinger and A. Arakawa},
3757  booktitle     = {Numerical methods used in atmospheric models},
3758  year          = {1976},
3759  month         = {aug},
3760  url           = {https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models},
3761  series        = {GARP Publication},
3762  volume        = {1},
3763  number        = {17}
3764}
3765
3766@Article{         morel.berthon_89,
3767  author        = {A. Morel and J.-F. Berthon},
3768  title         = {Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
3769                  production of the euphotic layer: Relationships
3770                  reinvestigated in view of remote-sensing applications},
3771  journal       = {Limnology and Oceanography},
3772  publisher     = {Wiley},
3773  year          = {1989},
3774  month         = {dec},
3775  doi           = {10.4319/lo.1989.34.8.1545},
3776  url           = {http://dx.doi.org/10.4319/lo.1989.34.8.1545},
3777  pages         = {1545--1562},
3778  volume        = {34},
3779  number        = {8},
3780  issn          = {0024-3590}
3781}
3782
3783@Article{         morel.maritorena_01,
3784  author        = {A. Morel and S. Maritorena},
3785  title         = {Bio-optical properties of oceanic waters: {A}
3786                  reappraisal},
3787  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3788  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3789  year          = {2001},
3790  month         = {apr},
3791  doi           = {10.1029/2000jc000319},
3792  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000319},
3793  pages         = {7163--7180},
3794  volume        = {106},
3795  number        = {C4},
3796  issn          = {0148-0227}
3797}
3798
3799@Article{         morel_88,
3800  author        = {A. Morel},
3801  title         = {Optical modeling of the upper ocean in relation to its
3802                  biogenous matter content (case {I} waters)},
3803  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3804  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3805  year          = {1988},
3806  doi           = {10.1029/jc093ic09p10749},
3807  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc093ic09p10749},
3808  pages         = {10749--10768},
3809  volume        = {93},
3810  number        = {C9},
3811  issn          = {0148-0227}
3812}
3813
3814@Article{         moum.caldwell.ea_02,
3815  author        = {J. N. Moum and D. R. Caldwell and J. D. Nash and G. D.
3816                  Gunderson},
3817  title         = {Observations of boundary mixing over the continental
3818                  slope},
3819  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3820  publisher     = {American Meteorological Society},
3821  year          = {2002},
3822  month         = {jul},
3823  doi           = {10.1175/1520-0485(2002)032<2113:oobmot>2.0.co;2},
3824  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2002)032<2113:oobmot>2.0.co;2},
3825  pages         = {2113--2130},
3826  volume        = {32},
3827  number        = {7},
3828  issn          = {1520-0485}
3829}
3830
3831@Article{         murray_96,
3832  author        = {R. J. Murray},
3833  title         = {Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models},
3834  journal       = {Journal of Computational Physics},
3835  publisher     = {Elsevier BV},
3836  year          = {1996},
3837  month         = {jul},
3838  doi           = {10.1006/jcph.1996.0136},
3839  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1996.0136},
3840  pages         = {251--273},
3841  volume        = {126},
3842  number        = {2},
3843  issn          = {0021-9991}
3844}
3845
3846@Article{         oddo.adani.ea_09,
3847  author        = {P. Oddo and M. Adani and N. Pinardi and C. Fratianni and
3848                  M. Tonani and D. Pettenuzzo},
3849  title         = {A nested Atlantic-Mediterranean Sea general circulation
3850                  model for operational forecasting},
3851  journal       = {Ocean Science},
3852  publisher     = {Copernicus GmbH},
3853  year          = {2009},
3854  month         = {oct},
3855  doi           = {10.5194/os-5-461-2009},
3856  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-5-461-2009},
3857  pages         = {461--473},
3858  volume        = {5},
3859  number        = {4},
3860  issn          = {1812-0792}
3861}
3862
3863@Article{         oey_06,
3864  author        = {L.-Y. Oey},
3865  title         = {An {OGCM} with movable land-sea boundaries},
3866  journal       = {Ocean Modelling},
3867  publisher     = {Elsevier BV},
3868  year          = {2006},
3869  month         = {jan},
3870  doi           = {10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
3871  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
3872  pages         = {176--195},
3873  volume        = {13},
3874  number        = {2},
3875  issn          = {1463-5003}
3876}
3877
3878@Article{         osborn_80,
3879  author        = {T. R. Osborn},
3880  title         = {Estimates of the local rate of vertical diffusion from
3881                  dissipation measurements},
3882  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3883  publisher     = {American Meteorological Society},
3884  year          = {1980},
3885  month         = {jan},
3886  doi           = {10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
3887  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
3888  pages         = {83--89},
3889  volume        = {10},
3890  number        = {1},
3891  issn          = {1520-0485}
3892}
3893
3894@Article{         pacanowski.gnanadesikan_98,
3895  author        = {R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan},
3896  title         = {Transient response in a z-level ocean model that resolves
3897                  topography with partial-cells},
3898  journal       = {Monthly Weather Review},
3899  publisher     = {American Meteorological Society},
3900  year          = {1998},
3901  month         = {dec},
3902  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
3903  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
3904  pages         = {3248--3270},
3905  volume        = {126},
3906  number        = {12},
3907  issn          = {1520-0493}
3908}
3909
3910@Article{         pacanowski.philander_81,
3911  author        = {R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander},
3912  title         = {Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
3913                  Tropical Oceans},
3914  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3915  publisher     = {American Meteorological Society},
3916  year          = {1981},
3917  month         = {nov},
3918  doi           = {10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
3919  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
3920  pages         = {1443--1451},
3921  volume        = {11},
3922  number        = {11},
3923  issn          = {1520-0485}
3924}
3925
3926@Article{         park.keenlyside.ea_09,
3927  author        = {W. Park and N. Keenlyside and M. Latif and A. Str\"{o}h
3928                  and R. Redler and E. Roeckner and G. Madec},
3929  title         = {Tropical pacific climate and its response to global
3930                  warming in the Kiel Climate Model},
3931  journal       = {Journal of Climate},
3932  publisher     = {American Meteorological Society},
3933  year          = {2009},
3934  month         = {jan},
3935  doi           = {10.1175/2008jcli2261.1},
3936  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2008JCLI2261.1},
3937  pages         = {71--92},
3938  volume        = {22},
3939  number        = {1},
3940  issn          = {1520-0442}
3941}
3942
3943@Article{         paulson.simpson_77,
3944  author        = {C. A. Paulson and J. J. Simpson},
3945  title         = {Irradiance Measurements in the Upper Ocean},
3946  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3947  publisher     = {American Meteorological Society},
3948  year          = {1977},
3949  month         = {nov},
3950  doi           = {10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
3951  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
3952  pages         = {952--956},
3953  volume        = {7},
3954  number        = {6},
3955  issn          = {1520-0485}
3956}
3957
3958@Article{         payne_72,
3959  author        = {R. E. Payne},
3960  title         = {Albedo of the Sea Surface},
3961  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
3962  publisher     = {American Meteorological Society},
3963  year          = {1972},
3964  month         = {jul},
3965  doi           = {10.1175/1520-0469(1972)029<0959:aotss>2.0.co;2},
3966  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1972)029<0959:aotss>2.0.co;2},
3967  pages         = {959--970},
3968  volume        = {29},
3969  number        = {5},
3970  issn          = {1520-0469}
3971}
3972
3973@Article{         penduff.barnier.ea_00,
3974  author        = {T. Penduff and B. Barnier and A. Colin de Verdi\`{e}re},
3975  title         = {Self-adapting open boundaries for a sigma coordinate model
3976                  of the eastern North Atlantic},
3977  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3978  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3979  year          = {2000},
3980  month         = {may},
3981  doi           = {10.1029/1999jc900335},
3982  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999jc900335},
3983  pages         = {11279--11297},
3984  volume        = {105},
3985  number        = {C5},
3986  issn          = {0148-0227}
3987}
3988
3989@Article{         penduff.barnier.ea_06,
3990  author        = {T. Penduff and B. Barnier and J.-M. Molines and G. Madec},
3991  title         = {On the use of current meter data to assess the realism of
3992                  ocean model simulations},
3993  journal       = {Ocean Modelling},
3994  publisher     = {Elsevier BV},
3995  year          = {2006},
3996  month         = {jan},
3997  doi           = {10.1016/j.ocemod.2005.02.001},
3998  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2005.02.001},
3999  pages         = {399--416},
4000  volume        = {11},
4001  number        = {3-4},
4002  issn          = {1463-5003}
4003}
4004
4005@Article{         penduff.sommer.ea_07,
4006  author        = {T. Penduff and J. Le Sommer and B. Barnier and A.-M.
4007                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec},
4008  title         = {Influence of numerical schemes on current-topography
4009                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations},
4010  journal       = {Ocean Science},
4011  publisher     = {Copernicus GmbH},
4012  year          = {2007},
4013  month         = {dec},
4014  doi           = {10.5194/os-3-509-2007},
4015  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-509-2007},
4016  pages         = {509--524},
4017  volume        = {3},
4018  number        = {4},
4019  issn          = {1812-0792}
4020}
4021
4022@Article{         phillips_59,
4023  author        = {R. S. Phillips},
4024  title         = {Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
4025                  differential equations},
4026  journal       = {Transactions of the American Mathematical Society},
4027  publisher     = {American Mathematical Society (AMS)},
4028  year          = {1959},
4029  month         = {feb},
4030  doi           = {10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1},
4031  url           = {http://dx.doi.org/10.1090/S0002-9947-1959-0104919-1},
4032  pages         = {193--254},
4033  volume        = {90},
4034  number        = {2},
4035  issn          = {0002-9947}
4036}
4037
4038@Article{         raynaud.speich.ea_00,
4039  author        = {S. Raynaud and S. Speich and E. Guilyardi and G. Madec},
4040  title         = {Impacts of the ocean lateral diffusion on the El
4041                  Ni\~{n}o/Southern Oscillation-like variability of a global
4042                  Coupled General Circulation Model},
4043  journal       = {Geophysical Research Letters},
4044  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4045  year          = {2000},
4046  month         = {oct},
4047  doi           = {10.1029/1999gl011323},
4048  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999gl011323},
4049  pages         = {3041--3044},
4050  volume        = {27},
4051  number        = {19},
4052  issn          = {0094-8276}
4053}
4054
4055@Article{         redi_82,
4056  author        = {M. H. Redi},
4057  title         = {Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation},
4058  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4059  publisher     = {American Meteorological Society},
4060  year          = {1982},
4061  month         = {oct},
4062  doi           = {10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
4063  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
4064  pages         = {1154--1158},
4065  volume        = {12},
4066  number        = {10},
4067  issn          = {1520-0485}
4068}
4069
4070@Article{         reed_77,
4071  author        = {R. K. Reed},
4072  title         = {On estimating insolation over the ocean},
4073  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4074  publisher     = {American Meteorological Society},
4075  year          = {1977},
4076  month         = {may},
4077  doi           = {10.1175/1520-0485(1977)007<0482:oeioto>2.0.co;2},
4078  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1977)007<0482:oeioto>2.0.co;2},
4079  pages         = {482--485},
4080  volume        = {7},
4081  number        = {3},
4082  issn          = {1520-0485}
4083}
4084
4085@Article{         reverdin.delecluse.ea_91,
4086  author        = {G. Reverdin and P. Del\'{e}cluse and C. L\'{e}vy and P.
4087                  Andrich and A. Morli\`{e}re and J. M. Verstraete},
4088  title         = {The near surface tropical Atlantic in 1982-1984:
4089                  {R}esults from a numerical simulation and a data analysis},
4090  journal       = {Progress in Oceanography},
4091  publisher     = {Elsevier BV},
4092  year          = {1991},
4093  month         = {jan},
4094  doi           = {10.1016/0079-6611(91)90027-j},
4095  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0079-6611(91)90027-j},
4096  pages         = {273--340},
4097  volume        = {27},
4098  number        = {3-4},
4099  issn          = {0079-6611}
4100}
4101
4102@Book{            richtmyer.morton_67,
4103  author        = {R. D. Richtmyer and K. W. Morton},
4104  booktitle     = {Difference methods for initial-value problems},
4105  publisher     = {Interscience},
4106  year          = {1967},
4107  url           = {https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ},
4108  pages         = {405},
4109  edition       = {2},
4110  isbn          = {9780470720400},
4111  issn          = {0074-994X},
4112  series        = {Interscience tracts in pure and applied mathematics}
4113}
4114
4115@Article{         robert_66,
4116  author        = {A. J. Robert},
4117  title         = {The integration of a low order spectral form of the
4118                  primitive meteorological equations},
4119  journal       = {Journal of the Meteorological Society of Japan},
4120  publisher     = {Meteorological Society of Japan},
4121  year          = {1966},
4122  doi           = {10.2151/jmsj1965.44.5_237},
4123  url           = {http://dx.doi.org/10.2151/jmsj1965.44.5_237},
4124  pages         = {237--245},
4125  volume        = {44},
4126  number        = {5},
4127  issn          = {2186-9057}
4128}
4129
4130@Article{         rodgers.aumont.ea_04,
4131  author        = {K. Rodgers and O. Aumont and G. Madec and C. Menkes and B.
4132                  Blanke and P. Monfray and J. C. Orr and D. P. Schrag},
4133  title         = {Radiocarbon as a thermocline proxy for the eastern
4134                  equatorial Pacific},
4135  journal       = {Geophysical Research Letters},
4136  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4137  year          = {2004},
4138  doi           = {10.1029/2004gl019764},
4139  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2004GL019764},
4140  pages         = {L14314},
4141  volume        = {31},
4142  number        = {14},
4143  issn          = {0094-8276}
4144}
4145
4146@Article{         rodgers.aumont.ea_14,
4147  author        = {K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
4148                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. de Boyer Mont\'{e}gut
4149                  and D. Iudicone and R. F. Keeling and G. Madec and R.
4150                  Wanninkhof},
4151  title         = {Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
4152                  nutrient cycling to wind stirring},
4153  journal       = {Biogeosciences},
4154  publisher     = {Copernicus GmbH},
4155  year          = {2014},
4156  month         = {aug},
4157  doi           = {10.5194/bg-11-4077-2014},
4158  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/bg-11-4077-2014},
4159  pages         = {4077--4098},
4160  volume        = {11},
4161  number        = {15},
4162  issn          = {1726-4189}
4163}
4164
4165@Article{         rodgers.blanke.ea_03,
4166  author        = {K. Rodgers and B. Blanke and G. Madec and O. Aumont and P.
4167                  Ciais and J.-C. Dutay},
4168  title         = {Extratropical sources of equatorial pacific upwelling in
4169                  an {OGCM}},
4170  journal       = {Geophysical Research Letters},
4171  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4172  year          = {2003},
4173  month         = {jan},
4174  doi           = {10.1029/2002gl016003},
4175  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL016003},
4176  volume        = {30},
4177  number        = {2},
4178  issn          = {0094-8276}
4179}
4180
4181@Article{         rodi_87,
4182  author        = {W. Rodi},
4183  title         = {Examples of calculation methods for flow and mixing in
4184                  stratified fluids},
4185  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4186  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4187  year          = {1987},
4188  doi           = {10.1029/jc092ic05p05305},
4189  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc092ic05p05305},
4190  pages         = {5305--5328},
4191  volume        = {92},
4192  number        = {C5},
4193  issn          = {0148-0227}
4194}
4195
4196@InBook{          roed.cooper_86,
4197  author        = {L. P. R{\ {o}}ed and C. K. Cooper},
4198  booktitle     = {Advanced Physical Oceanographic Numerical Modelling},
4199  publisher     = {Springer Netherlands},
4200  editor        = {J. J. O'Brien},
4201  year          = {1986},
4202  doi           = {10.1007/978-94-017-0627-8_23},
4203  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/978-94-017-0627-8_23},
4204  title         = {Open boundary conditions in numerical ocean models},
4205  chapter       = {12},
4206  pages         = {411--436},
4207  volume        = {186},
4208  series        = {NATO Science},
4209  isbn          = {978-94-017-0627-8}
4210}
4211
4212@Article{         roquet.madec.ea_15,
4213  author        = {F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
4214                  Barker},
4215  title         = {Accurate polynomial expressions for the density and
4216                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard},
4217  journal       = {Ocean Modelling},
4218  publisher     = {Elsevier BV},
4219  year          = {2015},
4220  month         = {jun},
4221  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
4222  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
4223  pages         = {29--43},
4224  volume        = {90},
4225  issn          = {1463-5003}
4226}
4227
4228@Article{         roquet.madec.ea_15*1,
4229  author        = {F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander},
4230  title         = {Defining a simplified yet {\"}realistic{\"} equation of
4231                  state for seawater},
4232  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4233  publisher     = {American Meteorological Society},
4234  year          = {2015},
4235  month         = {oct},
4236  doi           = {10.1175/jpo-d-15-0080.1},
4237  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-15-0080.1},
4238  pages         = {2564--2579},
4239  volume        = {45},
4240  number        = {10},
4241  issn          = {1520-0485}
4242}
4243
4244@Article{         roullet.madec_00,
4245  author        = {G. Roullet and G. Madec},
4246  title         = {Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
4247                  new formulation for Ocean General Circulation Models},
4248  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4249  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4250  year          = {2000},
4251  month         = {oct},
4252  doi           = {10.1029/2000jc900089},
4253  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900089},
4254  pages         = {23927--23942},
4255  volume        = {105},
4256  number        = {C10},
4257  issn          = {0148-0227}
4258}
4259
4260@Article{         rousset.vancoppenolle.ea_15,
4261  author        = {C. Rousset and M. Vancoppenolle and G. Madec and T.
4262                  Fichefet and S. Flavoni and A. Barth\'{e}lemy and R.
4263                  Benshila and J. Chanut and C. L\'{e}vy and S. Masson and F.
4264                  Vivier},
4265  title         = {The Louvain-La-Neuve sea ice model {LIM3}.6: {G}lobal and
4266                  regional capabilities},
4267  journal       = {Geoscientific Model Development},
4268  publisher     = {Copernicus GmbH},
4269  year          = {2015},
4270  month         = {oct},
4271  doi           = {10.5194/gmd-8-2991-2015},
4272  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-2991-2015},
4273  pages         = {2991--3005},
4274  volume        = {8},
4275  number        = {10},
4276  issn          = {1991-9603}
4277}
4278
4279@Article{         sadourny_75,
4280  author        = {R. Sadourny},
4281  title         = {The Dynamics of Finite-Difference Models of the
4282                  Shallow-Water Equations},
4283  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
4284  publisher     = {American Meteorological Society},
4285  year          = {1975},
4286  month         = {apr},
4287  doi           = {10.1175/1520-0469(1975)032<0680:tdofdm>2.0.co;2},
4288  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1975)032<0680:tdofdm>2.0.co;2},
4289  pages         = {680--689},
4290  volume        = {32},
4291  number        = {4},
4292  issn          = {1520-0469}
4293}
4294
4295@Article{         sarmiento.bryan_82,
4296  author        = {J. L. Sarmiento and K. Bryan},
4297  title         = {An ocean transport model for the North Atlantic},
4298  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4299  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4300  year          = {1982},
4301  doi           = {10.1029/jc087ic01p00394},
4302  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc087ic01p00394},
4303  pages         = {394--409},
4304  volume        = {87},
4305  number        = {C1},
4306  issn          = {0148-0227}
4307}
4308
4309@Article{         saunders_67,
4310  author        = {P. M. Saunders},
4311  title         = {The temperature at the ocean-air interface},
4312  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
4313  publisher     = {American Meteorological Society},
4314  year          = {1967},
4315  month         = {may},
4316  doi           = {10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2},
4317  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1967)024<0269:TTATOA>2.0.CO;2},
4318  pages         = {269--273},
4319  volume        = {24},
4320  number        = {3},
4321  issn          = {1520-0469}
4322}
4323
4324@Article{         shchepetkin.mcwilliams_03,
4325  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
4326  title         = {A method for computing horizontal pressure-gradient force
4327                  in an oceanic model with a nonaligned vertical coordinate},
4328  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4329  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4330  year          = {2003},
4331  doi           = {10.1029/2001jc001047},
4332  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001JC001047},
4333  pages         = {3090},
4334  volume        = {108},
4335  number        = {C3},
4336  issn          = {0148-0227}
4337}
4338
4339@Article{         shchepetkin.mcwilliams_05,
4340  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
4341  title         = {The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
4342                  split-explicit, free-surface,
4343                  topography-following-coordinate oceanic model},
4344  journal       = {Ocean Modelling},
4345  publisher     = {Elsevier BV},
4346  year          = {2005},
4347  month         = {jan},
4348  doi           = {10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
4349  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
4350  pages         = {347--404},
4351  volume        = {9},
4352  number        = {4},
4353  issn          = {1463-5003}
4354}
4355
4356@InBook{          shchepetkin.mcwilliams_09,
4357  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
4358  booktitle     = {Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans},
4359  publisher     = {Elsevier},
4360  editor        = {R. M. Temam and J. J. Tribbia},
4361  year          = {2009},
4362  doi           = {10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
4363  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
4364  title         = {Computational kernel algorithms for fine-scale,
4365                  multiprocess, longtime oceanic simulations},
4366  chapter       = {2},
4367  series        = {Handbook of Numerical Analysis},
4368  pages         = {121--183},
4369  volume        = {14},
4370  issn          = {1570-8659},
4371  isbn          = {9780444518934}
4372}
4373
4374@Article{         shchepetkin.obrien_96,
4375  author        = {A. F. Shchepetkin and J. J. O'Brien},
4376  title         = {A Physically Consistent Formulation of Lateral Friction in
4377                  Shallow-Water Equation Ocean Models},
4378  journal       = {Monthly Weather Review},
4379  publisher     = {American Meteorological Society},
4380  year          = {1996},
4381  month         = {jun},
4382  doi           = {10.1175/1520-0493(1996)124<1285:apcfol>2.0.co;2},
4383  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1996)124<1285:apcfol>2.0.co;2},
4384  pages         = {1285--1300},
4385  volume        = {124},
4386  number        = {6},
4387  issn          = {1520-0493}
4388}
4389
4390@Article{         siddorn.furner_13,
4391  author        = {J. R. Siddorn and R. Furner},
4392  title         = {An analytical stretching function that combines the best
4393                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
4394                  coordinates},
4395  journal       = {Ocean Modelling},
4396  publisher     = {Elsevier BV},
4397  year          = {2013},
4398  month         = {jun},
4399  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
4400  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
4401  pages         = {1--13},
4402  volume        = {66},
4403  issn          = {1463-5003}
4404}
4405
4406@Article{         simmons.jayne.ea_04,
4407  author        = {H. L. Simmons and S. R. Jayne and L. C. {St Laurent} and
4408                  A. J. Weaver},
4409  title         = {Tidally driven mixing in a numerical model of the ocean
4410                  general circulation},
4411  journal       = {Ocean Modelling},
4412  publisher     = {Elsevier BV},
4413  year          = {2004},
4414  month         = {jan},
4415  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
4416  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
4417  pages         = {245--263},
4418  volume        = {6},
4419  number        = {3-4},
4420  issn          = {1463-5003}
4421}
4422
4423@InBook{          smagorinsky_93,
4424  author        = {J. Smagorinsky},
4425  booktitle     = {Large Eddy Simulation of Complex Engineering and
4426                  Geophysical Flows},
4427  publisher     = {Cambridge University Press},
4428  editor        = {B. Galperin and S. A. Orszag},
4429  year          = {1993},
4430  url           = {https://books.google.fr/books?id=rUuTDLh8nHcC},
4431  pages         = {3--36},
4432  title         = {Some historical remarks on the use of non-linear
4433                  viscosities},
4434  chapter       = {1}
4435}
4436
4437@Article{         song.haidvogel_94,
4438  author        = {Y. Song and D. Haidvogel},
4439  title         = {A semi-implicit ocean circulation model using a
4440                  generalized topography-following coordinate system},
4441  journal       = {Journal of Computational Physics},
4442  publisher     = {Elsevier BV},
4443  year          = {1994},
4444  month         = {nov},
4445  doi           = {10.1006/jcph.1994.1189},
4446  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1994.1189},
4447  pages         = {228--244},
4448  volume        = {115},
4449  number        = {1},
4450  issn          = {0021-9991}
4451}
4452
4453@Article{         song.wright_98,
4454  author        = {Y. T. Song and D. G. Wright},
4455  title         = {A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
4456                  Part {II}: Energy, Momentum, and Bottom Torque
4457                  Consistency},
4458  journal       = {Monthly Weather Review},
4459  publisher     = {American Meteorological Society},
4460  year          = {1998},
4461  month         = {dec},
4462  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3231:agpgff>2.0.co;2},
4463  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3231:agpgff>2.0.co;2},
4464  pages         = {3231--3247},
4465  volume        = {126},
4466  number        = {12},
4467  issn          = {1520-0493}
4468}
4469
4470@Article{         song_98,
4471  author        = {Y. T. Song},
4472  title         = {A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
4473                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis},
4474  journal       = {Monthly Weather Review},
4475  publisher     = {American Meteorological Society},
4476  year          = {1998},
4477  month         = {dec},
4478  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
4479  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
4480  pages         = {3213--3230},
4481  volume        = {126},
4482  number        = {12},
4483  issn          = {1520-0493}
4484}
4485
4486@Article{         speer.guilyardi.ea_00,
4487  author        = {K. Speer and E. Guilyardi and G. Madec},
4488  title         = {Southern Ocean transformation in a coupled model with and
4489                  without eddy mass fluxes},
4490  journal       = {Tellus A},
4491  publisher     = {Informa UK Limited},
4492  year          = {2000},
4493  month         = {oct},
4494  doi           = {10.1034/j.1600-0870.2000.01060.x},
4495  url           = {http://dx.doi.org/10.1034/j.1600-0870.2000.01060.x},
4496  pages         = {554--565},
4497  volume        = {52},
4498  number        = {5},
4499  issn          = {1600-0870}
4500}
4501
4502@Article{         speich.blanke.ea_01,
4503  author        = {S. Speich and B. Blanke and G. Madec},
4504  title         = {Warm and cold water routes of an {O}.{G}.{C}.{M}.
4505                  thermohaline conveyor belt},
4506  journal       = {Geophysical Research Letters},
4507  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4508  year          = {2001},
4509  month         = {jan},
4510  doi           = {10.1029/2000gl011748},
4511  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000gl011748},
4512  pages         = {311--314},
4513  volume        = {28},
4514  number        = {2},
4515  issn          = {0094-8276}
4516}
4517
4518@Article{         speich.madec.ea_96,
4519  author        = {S. Speich and G. Madec and M. Cr\'{e}pon},
4520  title         = {A strait outflow circulation process study: {T}he case of
4521                  the Alboran Sea},
4522  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4523  publisher     = {American Meteorological Society},
4524  year          = {1996},
4525  month         = {mar},
4526  doi           = {10.1175/1520-0485(1996)026<0320:asocps>2.0.co;2},
4527  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1996)026<0320:asocps>2.0.co;2},
4528  pages         = {320--340},
4529  volume        = {26},
4530  number        = {3},
4531  issn          = {1520-0485}
4532}
4533
4534@Article{         st-laurent.garrett_02,
4535  author        = {L. C. {St Laurent} and C. Garrett},
4536  title         = {The role of internal tides in mixing the deep ocean},
4537  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4538  publisher     = {American Meteorological Society},
4539  year          = {2002},
4540  month         = {oct},
4541  doi           = {10.1175/1520-0485(2002)032<2882:troiti>2.0.co;2},
4542  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2002)032<2882:troiti>2.0.co;2},
4543  pages         = {2882--2899},
4544  volume        = {32},
4545  number        = {10},
4546  issn          = {1520-0485}
4547}
4548
4549@Article{         st-laurent.nash_04,
4550  author        = {L. C. {St Laurent} and J. D. Nash},
4551  title         = {An examination of the radiative and dissipative properties
4552                  of deep ocean internal tides},
4553  journal       = {Deep Sea Research},
4554  publisher     = {Elsevier BV},
4555  year          = {2004},
4556  month         = {dec},
4557  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
4558  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
4559  pages         = {3029--3042},
4560  volume        = {51},
4561  number        = {25-26},
4562  issn          = {0967-0645}
4563}
4564
4565@Article{         st-laurent.simmons.ea_02,
4566  author        = {L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne},
4567  title         = {Estimating tidally driven mixing in the deep ocean},
4568  journal       = {Geophysical Research Letters},
4569  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4570  year          = {2002},
4571  month         = {dec},
4572  doi           = {10.1029/2002gl015633},
4573  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL015633},
4574  pages         = {2101--2104},
4575  volume        = {29},
4576  number        = {23},
4577  issn          = {0094-8276}
4578}
4579
4580@Article{         stacey_99,
4581  author        = {M. W. Stacey},
4582  title         = {Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
4583                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness
4584                  length},
4585  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4586  publisher     = {American Meteorological Society},
4587  year          = {1999},
4588  month         = {jun},
4589  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
4590  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
4591  pages         = {1363--1367},
4592  volume        = {29},
4593  number        = {6},
4594  issn          = {1520-0485}
4595}
4596
4597@Article{         steele.morley.ea_01,
4598  author        = {M. Steele and R. Morley and W. Ermold},
4599  title         = {{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
4600                  Arctic Ocean},
4601  journal       = {Journal of Climate},
4602  publisher     = {American Meteorological Society},
4603  year          = {2001},
4604  month         = {may},
4605  doi           = {10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
4606  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
4607  pages         = {2079--2087},
4608  volume        = {14},
4609  number        = {9},
4610  issn          = {1520-0442}
4611}
4612
4613@Article{         stein.stein_92,
4614  author        = {C. A. Stein and S. Stein},
4615  title         = {A model for the global variation in oceanic depth and heat
4616                  flow with lithospheric age},
4617  journal       = {Nature},
4618  publisher     = {Springer Nature},
4619  year          = {1992},
4620  month         = {sep},
4621  doi           = {10.1038/359123a0},
4622  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/359123a0},
4623  pages         = {123--129},
4624  volume        = {359},
4625  number        = {6391},
4626  issn          = {1476-4687}
4627}
4628
4629@InBook{          stokes_09,
4630  author        = {G. G. Stokes},
4631  booktitle     = {Mathematical and Physical Papers},
4632  publisher     = {Cambridge University Press},
4633  year          = {2009},
4634  doi           = {10.1017/cbo9780511702242.013},
4635  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511702242.013},
4636  title         = {On the theory of oscillatory waves},
4637  chapter       = {12},
4638  series        = {Cambridge Library Collection - Mathematics},
4639  volume        = {1},
4640  pages         = {197--229},
4641  isbn          = {9780511702242}
4642}
4643
4644@Article{         takaya.bidlot.ea_10,
4645  author        = {Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
4646                  E. M. Janssen},
4647  title         = {Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
4648                  temperature},
4649  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4650  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4651  year          = {2010},
4652  month         = {jun},
4653  doi           = {10.1029/2009jc005985},
4654  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2009JC005985},
4655  pages         = {C06009},
4656  volume        = {115},
4657  number        = {C6},
4658  issn          = {0148-0227}
4659}
4660
4661@Article{         talagrand_72,
4662  author        = {O. Talagrand},
4663  title         = {On the damping of high-frequency motions in
4664                  four-dimensional assimilation of meteorological data},
4665  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
4666  publisher     = {American Meteorological Society},
4667  year          = {1972},
4668  month         = {nov},
4669  doi           = {10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
4670  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
4671  pages         = {1571--1574},
4672  volume        = {29},
4673  number        = {8},
4674  issn          = {1520-0469}
4675}
4676
4677@Manual{          teos_10,
4678  author        = {IOC, SCOR and IAPSO},
4679  title         = {The international thermodynamic equation of seawater -
4680                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties},
4681  publisher     = {UNESCO},
4682  editor        = {Intergovernmental Oceanographic Commission},
4683  year          = {2010},
4684  month         = {mar},
4685  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en},
4686  pages         = {196},
4687  volume        = {56},
4688  series        = {Manuals and Guides}
4689}
4690
4691@Article{         thiem.berntsen_06,
4692  author        = {{\O}. Thiem and J. Berntsen},
4693  title         = {Internal pressure errors in sigma-coordinate ocean models
4694                  due to anisotropy},
4695  journal       = {Ocean Modelling},
4696  publisher     = {Elsevier BV},
4697  year          = {2006},
4698  month         = {jan},
4699  doi           = {10.1016/j.ocemod.2005.05.001},
4700  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2005.05.001},
4701  pages         = {140--156},
4702  volume        = {12},
4703  number        = {1-2},
4704  issn          = {1463-5003}
4705}
4706
4707@Article{         timmermann.goosse.ea_05,
4708  author        = {R. Timmermann and H. Goosse and G. Madec and T. Fichefet
4709                  and C. \'{E}th\'{e} and V. Duli\`{e}re},
4710  title         = {On the representation of high latitude processes in the
4711                  {ORCA}-{LIM} global coupled sea ice-ocean model},
4712  journal       = {Ocean Modelling},
4713  publisher     = {Elsevier BV},
4714  year          = {2005},
4715  month         = {jan},
4716  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.12.009},
4717  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.12.009},
4718  pages         = {175--201},
4719  volume        = {8},
4720  number        = {1-2},
4721  issn          = {1463-5003}
4722}
4723
4724@Article{         tonani.pinardi.ea_08,
4725  author        = {M. Tonani and N. Pinardi and S. Dobricic and I. Pujol and
4726                  C. Fratianni},
4727  title         = {A high-resolution free-surface model of the Mediterranean
4728                  Sea},
4729  journal       = {Ocean Science},
4730  publisher     = {Copernicus GmbH},
4731  year          = {2008},
4732  month         = {jan},
4733  doi           = {10.5194/os-4-1-2008},
4734  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-4-1-2008},
4735  pages         = {1--14},
4736  volume        = {4},
4737  number        = {1},
4738  issn          = {1812-0792}
4739}
4740
4741@Article{         treguier.barnier.ea_01,
4742  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and B. Barnier and A. P. de Miranda and
4743                  J.-M. Molines and N. Grima and M. Imbard and G. Madec and
4744                  C. Messager and T. Reynaud and S. Michel},
4745  title         = {An eddy-permitting model of the Atlantic circulation:
4746                  Evaluating open boundary conditions},
4747  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4748  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4749  year          = {2001},
4750  month         = {oct},
4751  doi           = {10.1029/2000jc000376},
4752  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000376},
4753  pages         = {22115--22129},
4754  volume        = {106},
4755  number        = {C10},
4756  issn          = {0148-0227}
4757}
4758
4759@Article{         treguier.boebel.ea_03,
4760  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and O. Boebel and B. Barnier and G.
4761                  Madec},
4762  title         = {Agulhas eddy fluxes in a 1/6\deg Atlantic model},
4763  journal       = {Deep Sea Research},
4764  publisher     = {Elsevier BV},
4765  year          = {2003},
4766  month         = {jan},
4767  doi           = {10.1016/s0967-0645(02)00396-x},
4768  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0967-0645(02)00396-x},
4769  pages         = {251--280},
4770  volume        = {50},
4771  number        = {1},
4772  issn          = {0967-0645}
4773}
4774
4775@Article{         treguier.dukowicz.ea_96,
4776  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan},
4777  title         = {Properties of nonuniform grids used in ocean general
4778                  circulation models},
4779  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4780  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4781  year          = {1996},
4782  month         = {sep},
4783  doi           = {10.1029/96jc01753},
4784  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/96jc01753},
4785  pages         = {20877--20881},
4786  volume        = {101},
4787  number        = {C9},
4788  issn          = {0148-0227}
4789}
4790
4791@Article{         treguier.england.ea_07,
4792  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and M. H. England and S. R. Rintoul and
4793                  G. Madec and J. Le Sommer and J.-M. Molines},
4794  title         = {Southern Ocean overturning across streamlines in an
4795                  eddying simulation of the Antarctic Circumpolar Current},
4796  journal       = {Ocean Science},
4797  publisher     = {Copernicus GmbH},
4798  year          = {2007},
4799  month         = {dec},
4800  doi           = {10.5194/os-3-491-2007},
4801  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-491-2007},
4802  pages         = {491--507},
4803  volume        = {3},
4804  number        = {4},
4805  issn          = {1812-0792}
4806}
4807
4808@Article{         treguier.gourcuff.ea_06,
4809  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and C. Gourcuff and P. Lherminier and
4810                  H. Mercier and B. Barnier and G. Madec and J.-M. Molines
4811                  and T. Penduff and L. Czeschel and C. B\"{o}ning},
4812  title         = {Internal and forced variability along a section between
4813                  Greenland and Portugal in the {CLIPPER} Atlantic model},
4814  journal       = {Ocean Dynamics},
4815  publisher     = {Springer Nature},
4816  year          = {2006},
4817  month         = {may},
4818  doi           = {10.1007/s10236-006-0069-y},
4819  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-006-0069-y},
4820  pages         = {568--580},
4821  volume        = {56},
4822  number        = {5-6},
4823  issn          = {1616-7228}
4824}
4825
4826@Article{         treguier.held.ea_97,
4827  author        = {A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev},
4828  title         = {Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
4829                  Equation Ocean Models},
4830  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4831  publisher     = {American Meteorological Society},
4832  year          = {1997},
4833  month         = {apr},
4834  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
4835  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
4836  pages         = {567--580},
4837  volume        = {27},
4838  number        = {4},
4839  issn          = {1520-0485}
4840}
4841
4842@Article{         treguier_92,
4843  author        = {A. M. Tr\'{e}guier},
4844  title         = {Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
4845                  equation model of the North Atlantic},
4846  journal       = {Journal of Geophysical Research},
4847  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4848  year          = {1992},
4849  doi           = {10.1029/91jc02350},
4850  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc02350},
4851  pages         = {687--701},
4852  volume        = {97},
4853  number        = {C1},
4854  issn          = {0148-0227}
4855}
4856
4857@Article{         tu.tsuang_05,
4858  author        = {C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang},
4859  title         = {Cool-skin simulation by a one-column ocean model},
4860  journal       = {Geophysical Research Letters},
4861  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
4862  year          = {2005},
4863  month         = {nov},
4864  doi           = {10.1029/2005gl024252},
4865  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2005GL024252},
4866  pages         = {L22602},
4867  volume        = {32},
4868  number        = {22},
4869  issn          = {0094-8276}
4870}
4871
4872@Article{         umlauf.burchard_03,
4873  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
4874  title         = {A generic length-scale equation for geophysical turbulence
4875                  models},
4876  journal       = {Journal of Marine Research},
4877  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
4878  year          = {2003},
4879  month         = {mar},
4880  doi           = {10.1357/002224003322005087},
4881  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003322005087},
4882  pages         = {235--265},
4883  volume        = {61},
4884  number        = {2},
4885  issn          = {0022-2402}
4886}
4887
4888@Article{         umlauf.burchard_05,
4889  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
4890  title         = {Second-order turbulence closure models for geophysical
4891                  boundary layers. {A} review of recent work},
4892  journal       = {Continental Shelf Research},
4893  publisher     = {Elsevier BV},
4894  year          = {2005},
4895  month         = {may},
4896  doi           = {10.1016/j.csr.2004.08.004},
4897  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.csr.2004.08.004},
4898  pages         = {795--827},
4899  volume        = {25},
4900  number        = {7-8},
4901  issn          = {0278-4343}
4902}
4903
4904@Book{            vallis_06,
4905  author        = {G. K. Vallis},
4906  booktitle     = {Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics},
4907  publisher     = {Cambridge University Press},
4908  year          = {2006},
4909  doi           = {10.1017/cbo9780511790447},
4910  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511790447},
4911  isbn          = {9780511790447}
4912}
4913
4914@Article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09,
4915  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse and S.
4916                  Bouillon and G. Madec and M. A. Morales Maqueda},
4917  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
4918                  Antarctic sea ice. 1. Model description and validation},
4919  journal       = {Ocean Modelling},
4920  publisher     = {Elsevier BV},
4921  year          = {2009},
4922  month         = {jan},
4923  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
4924  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
4925  pages         = {33--53},
4926  volume        = {27},
4927  number        = {1-2},
4928  issn          = {1463-5003}
4929}
4930
4931@Article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09*1,
4932  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse},
4933  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
4934                  Antarctic sea ice. 2. Importance of sea ice salinity
4935                  variations},
4936  journal       = {Ocean Modelling},
4937  publisher     = {Elsevier BV},
4938  year          = {2009},
4939  month         = {jan},
4940  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
4941  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
4942  pages         = {54--69},
4943  volume        = {27},
4944  number        = {1-2},
4945  issn          = {1463-5003}
4946}
4947
4948@Article{         vialard.menkes.ea_01,
4949  author        = {J. Vialard and C. Menkes and J.-P. Boulanger and P.
4950                  Del\'{e}cluse and E. Guilyardi and M. J. McPhaden and G.
4951                  Madec},
4952  title         = {A model study of oceanic mechanisms affecting equatorial
4953                  Pacific sea surface temperature during the 1997-98 El
4954                  Ni\~{n}o},
4955  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
4956  publisher     = {American Meteorological Society},
4957  year          = {2001},
4958  month         = {jul},
4959  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<1649:amsoom>2.0.co;2},
4960  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<1649:amsoom>2.0.co;2},
4961  pages         = {1649--1675},
4962  volume        = {31},
4963  number        = {7},
4964  issn          = {1520-0485}
4965}
4966
4967@Article{         warner.defne.ea_13,
4968  author        = {J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango},
4969  title         = {A wetting and drying scheme for {ROMS}},
4970  journal       = {Computers \& Geosciences},
4971  publisher     = {Elsevier BV},
4972  year          = {2013},
4973  month         = {aug},
4974  doi           = {10.1016/j.cageo.2013.05.004},
4975  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2013.05.004},
4976  pages         = {54--61},
4977  volume        = {58},
4978  issn          = {0098-3004}
4979}
4980
4981@Article{         warner.sherwood.ea_05,
4982  author        = {J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
4983                  Signell},
4984  title         = {Performance of four turbulence closure models implemented
4985                  using a generic length scale method},
4986  journal       = {Ocean Modelling},
4987  publisher     = {Elsevier BV},
4988  year          = {2005},
4989  month         = {jan},
4990  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
4991  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
4992  pages         = {81--113},
4993  volume        = {8},
4994  number        = {1-2},
4995  issn          = {1463-5003}
4996}
4997
4998@Article{         weatherly_84,
4999  author        = {G. L. Weatherly},
5000  title         = {An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
5001                  Stream fluctuations},
5002  journal       = {Journal of Marine Research},
5003  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
5004  year          = {1984},
5005  month         = {may},
5006  doi           = {10.1357/002224084788502729},
5007  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502729},
5008  pages         = {289--301},
5009  volume        = {42},
5010  number        = {2},
5011  issn          = {1543-9542}
5012}
5013
5014@Article{         weaver.eby_97,
5015  author        = {A. J. Weaver and M. Eby},
5016  title         = {On the numerical implementation of advection schemes for
5017                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
5018                  the {GFDL} ocean model},
5019  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
5020  publisher     = {American Meteorological Society},
5021  year          = {1997},
5022  month         = {feb},
5023  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
5024  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
5025  pages         = {369--377},
5026  volume        = {27},
5027  number        = {2},
5028  issn          = {1520-0485}
5029}
5030
5031@Article{         webb.cuevas.ea_98,
5032  author        = {D. J. Webb and B. A. de Cuevas and C. S. Richmond},
5033  title         = {Improved Advection Schemes for Ocean Models},
5034  journal       = {Journal of Atmospheric and Oceanic Technology},
5035  publisher     = {American Meteorological Society},
5036  year          = {1998},
5037  month         = {oct},
5038  doi           = {10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
5039  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
5040  pages         = {1171--1187},
5041  volume        = {15},
5042  number        = {5},
5043  issn          = {1520-0426}
5044}
5045
5046@Article{         white.adcroft.ea_09,
5047  author        = {L. White and A. Adcroft and R. Hallberg},
5048  title         = {High-order regridding-remapping schemes for continuous
5049                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models},
5050  journal       = {Journal of Computational Physics},
5051  publisher     = {Elsevier BV},
5052  year          = {2009},
5053  month         = {dec},
5054  doi           = {10.1016/j.jcp.2009.08.016},
5055  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jcp.2009.08.016},
5056  pages         = {8665--8692},
5057  volume        = {228},
5058  number        = {23},
5059  issn          = {0021-9991}
5060}
5061
5062@Article{         wilcox_88,
5063  author        = {D. C. Wilcox},
5064  title         = {Reassessment of the scale-determining equation for
5065                  advanced turbulence models},
5066  journal       = {AIAA Journal},
5067  publisher     = {American Institute of Aeronautics and Astronautics
5068                  (AIAA)},
5069  year          = {1988},
5070  month         = {nov},
5071  doi           = {10.2514/3.10041},
5072  url           = {http://dx.doi.org/10.2514/3.10041},
5073  pages         = {1299--1310},
5074  volume        = {26},
5075  number        = {11},
5076  issn          = {1533-385X}
5077}
5078
5079@Article{         willebrand.barnier.ea_01,
5080  author        = {J. Willebrand and B. Barnier and C. B\"{o}ning and C.
5081                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
5082                  and J.-M. Molines and A. L. New},
5083  title         = {Circulation characteristics in three eddy-permitting
5084                  models of the North Atlantic},
5085  journal       = {Progress in Oceanography},
5086  publisher     = {Elsevier BV},
5087  year          = {2001},
5088  month         = {jan},
5089  doi           = {10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
5090  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
5091  pages         = {123--161},
5092  volume        = {48},
5093  number        = {2-3},
5094  issn          = {0079-6611}
5095}
5096
5097@Article{         williams.guilyardi.ea_06,
5098  author        = {P. D. Williams and E. Guilyardi and R. T. Sutton and J. M.
5099                  Gregory and G. Madec},
5100  title         = {On the climate response of the low-latitude Pacific Ocean
5101                  to changes in the global freshwater cycle},
5102  journal       = {Climate Dynamics},
5103  publisher     = {Springer Nature},
5104  year          = {2006},
5105  month         = {may},
5106  doi           = {10.1007/s00382-006-0151-7},
5107  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-006-0151-7},
5108  pages         = {593--611},
5109  volume        = {27},
5110  number        = {6},
5111  issn          = {1432-0894}
5112}
5113
5114@Article{         williams.guilyardi.ea_07,
5115  author        = {P. D. Williams and E. Guilyardi and R. T. Sutton and J. M.
5116                  Gregory and G. Madec},
5117  title         = {A new feedback on climate change from the hydrological
5118                  cycle},
5119  journal       = {Geophysical Research Letters},
5120  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
5121  year          = {2007},
5122  month         = {apr},
5123  doi           = {10.1029/2007gl029275},
5124  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2007GL029275},
5125  pages         = {L08706},
5126  volume        = {34},
5127  number        = {8},
5128  issn          = {0094-8276}
5129}
5130
5131@Article{         williams.guilyardi.ea_10,
5132  author        = {P. D. Williams and E. Guilyardi and G. Madec and S. Gualdi
5133                  and E. Scoccimarro},
5134  title         = {The role of mean ocean salinity in climate},
5135  journal       = {Dynamics of Atmospheres and Oceans},
5136  publisher     = {Elsevier BV},
5137  year          = {2010},
5138  month         = {apr},
5139  doi           = {10.1016/j.dynatmoce.2009.02.001},
5140  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dynatmoce.2009.02.001},
5141  pages         = {108--123},
5142  volume        = {49},
5143  number        = {2-3},
5144  issn          = {0377-0265}
5145}
5146
5147@Article{         zalesak_79,
5148  author        = {S. T. Zalesak},
5149  title         = {Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
5150                  for fluids},
5151  journal       = {Journal of Computational Physics},
5152  publisher     = {Elsevier BV},
5153  year          = {1979},
5154  month         = {jun},
5155  doi           = {10.1016/0021-9991(79)90051-2},
5156  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(79)90051-2},
5157  pages         = {335--362},
5158  volume        = {31},
5159  number        = {3},
5160  issn          = {0021-9991}
5161}
5162
5163@Article{         zhang.endoh_92,
5164  author        = {R.-H. Zhang and M. Endoh},
5165  title         = {A free surface General Circulation Model for the tropical
5166                  Pacific Ocean},
5167  journal       = {Journal of Geophysical Research},
5168  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
5169  year          = {1992},
5170  doi           = {10.1029/92jc00911},
5171  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00911},
5172  pages         = {11237--11255},
5173  volume        = {97},
5174  number        = {C7},
5175  issn          = {0148-0227}
5176}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.