New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
diawri.F90 in NEMO/trunk/tests/CANAL/MY_SRC – NEMO

source: NEMO/trunk/tests/CANAL/MY_SRC/diawri.F90 @ 12206

Last change on this file since 12206 was 12206, checked in by smasson, 4 years ago

trunk: supress diatmb as it was bugged and already coded in diawri, see #1759
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 52.8 KB
Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   !
46   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
47   USE in_out_manager ! I/O manager
48   USE dia25h         ! 25h Mean output
49   USE iom            !
50   USE ioipsl         !
51
52#if defined key_si3
53   USE ice 
54   USE icewri 
55#endif
56   USE lib_mpp         ! MPP library
57   USE timing          ! preformance summary
58   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
59   USE cool_skin       ! Cool skin
60
61   IMPLICIT NONE
62   PRIVATE
63
64   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
65   PUBLIC   dia_wri_state
66   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
67
68   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
69   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
70   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
71   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
72   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
73   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
74   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
75   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
77
78   !! * Substitutions
79#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
80   !!----------------------------------------------------------------------
81   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
82   !! $Id$
83   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
84   !!----------------------------------------------------------------------
85CONTAINS
86
87#if defined key_iomput
88   !!----------------------------------------------------------------------
89   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
90   !!----------------------------------------------------------------------
91   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
92      !
93      dia_wri_alloc = 0
94      !
95   END FUNCTION dia_wri_alloc
96
97   
98   SUBROUTINE dia_wri( kt )
99      !!---------------------------------------------------------------------
100      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
101      !!                   
102      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
103      !!      NETCDF format is used by default
104      !!
105      !! ** Method  :  use iom_put
106      !!----------------------------------------------------------------------
107      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
108      !!
109      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
110      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
111      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
112      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
113      REAL(wp)::   ze3   !   -      -
114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
116      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   bu, bv   ! volume of u- and v-boxes
117      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   r1_bt    ! inverse of t-box volume
118      !!----------------------------------------------------------------------
119      !
120      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
121      !
122      ! Output the initial state and forcings
123      IF( ninist == 1 ) THEN                       
124         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
125         ninist = 0
126      ENDIF
127
128      ! Output of initial vertical scale factor
129      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
130      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
131      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
132      !
133      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
134      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
135      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
136      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
137      IF( iom_use("e3tdef") )   &
138         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
139
140      IF( ll_wd ) THEN
141         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
142      ELSE
143         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
144      ENDIF
145
146      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
147         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
148     
149      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
150      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
151      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
152         DO jj = 1, jpj
153            DO ji = 1, jpi
154               ikbot = mbkt(ji,jj)
155               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
156            END DO
157         END DO
158         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
159      ENDIF
160     
161      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
162      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
163      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
164         DO jj = 1, jpj
165            DO ji = 1, jpi
166               ikbot = mbkt(ji,jj)
167               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
168            END DO
169         END DO
170         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
171      ENDIF
172
173      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
174         zztmp = rau0 * 0.25
175         z2d(:,:) = 0._wp
176         DO jj = 2, jpjm1
177            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
178               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
180                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
181                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
182               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
183               !
184            END DO
185         END DO
186         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
187         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
188      ENDIF
189         
190      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
191      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
192      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
193         DO jj = 1, jpj
194            DO ji = 1, jpi
195               ikbot = mbku(ji,jj)
196               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
197            END DO
198         END DO
199         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
200      ENDIF
201     
202      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
203      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
204      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
205         DO jj = 1, jpj
206            DO ji = 1, jpi
207               ikbot = mbkv(ji,jj)
208               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
209            END DO
210         END DO
211         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
212      ENDIF
213
214      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
215      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
216         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
217         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
218         DO jk = 1, jpk
219            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
220         END DO
221         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
222         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
223      ENDIF
224
225      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
226      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
227      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
228
229      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
230      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
231
232      IF ( iom_use("salgrad") .OR. iom_use("salgrad2") ) THEN
233         z3d(:,:,jpk) = 0.
234         DO jk = 1, jpkm1
235            DO jj = 2, jpjm1                                    ! sal gradient
236               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
237                  zztmp  = tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
238                  zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,jk,jp_sal) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
239                  zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,jk,jp_sal) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
240                  z3d(ji,jj,jk) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
241                     &                 * umask(ji,jj,jk) * umask(ji-1,jj,jk) * vmask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj-1,jk)
242               END DO
243            END DO
244         END DO
245         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
246         CALL iom_put( "salgrad2",  z3d )          ! square of module of sal gradient
247         z3d(:,:,:) = SQRT( z3d(:,:,:) )
248         CALL iom_put( "salgrad" ,  z3d )          ! module of sal gradient
249      ENDIF
250         
251      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
252         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
253            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
254               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
255               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
256               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
257               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
258                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
259            END DO
260         END DO
261         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
262         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
263         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
264         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
265      ENDIF
266         
267      ! heat and salt contents
268      IF( iom_use("heatc") ) THEN
269         z2d(:,:)  = 0._wp 
270         DO jk = 1, jpkm1
271            DO jj = 1, jpj
272               DO ji = 1, jpi
273                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
274               END DO
275            END DO
276         END DO
277         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
278      ENDIF
279
280      IF( iom_use("saltc") ) THEN
281         z2d(:,:)  = 0._wp 
282         DO jk = 1, jpkm1
283            DO jj = 1, jpj
284               DO ji = 1, jpi
285                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
286               END DO
287            END DO
288         END DO
289         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
290      ENDIF
291      !
292      IF( iom_use("salt2c") ) THEN
293         z2d(:,:)  = 0._wp 
294         DO jk = 1, jpkm1
295            DO jj = 1, jpj
296               DO ji = 1, jpi
297                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
298               END DO
299            END DO
300         END DO
301         CALL iom_put( "salt2c", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
302      ENDIF
303      !
304      IF ( iom_use("eken") ) THEN
305         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
306         DO jk = 1, jpkm1
307            DO jj = 2, jpj
308               DO ji = 2, jpi
309                  zztmpx = 0.5 * ( un(ji-1,jj  ,jk) + un(ji,jj,jk) )
310                  zztmpy = 0.5 * ( vn(ji  ,jj-1,jk) + vn(ji,jj,jk) )
311                  z3d(ji,jj,jk) = 0.5 * ( zztmpx*zztmpx + zztmpy*zztmpy )
312               END DO
313            END DO
314         END DO
315         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
316         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
317      ENDIF
318
319      IF ( iom_use("ke") .or. iom_use("ke_zint") ) THEN
320         !
321         z3d(:,:,jpk) = 0._wp
322         z3d(1,:, : ) = 0._wp
323         z3d(:,1, : ) = 0._wp
324         DO jk = 1, jpkm1
325            DO jj = 2, jpj
326               DO ji = 2, jpi
327                  z3d(ji,jj,jk) = 0.25_wp * ( un(ji  ,jj,jk) * un(ji  ,jj,jk) * e1e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)  &
328                     &                      + un(ji-1,jj,jk) * un(ji-1,jj,jk) * e1e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)  &
329                     &                      + vn(ji,jj  ,jk) * vn(ji,jj  ,jk) * e1e2v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)  &
330                     &                      + vn(ji,jj-1,jk) * vn(ji,jj-1,jk) * e1e2v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)  )  &
331                     &                    * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk)
332               END DO
333            END DO
334         END DO
335         
336         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
337         CALL iom_put( "ke", z3d ) ! kinetic energy
338
339         z2d(:,:)  = 0._wp 
340         DO jk = 1, jpkm1
341            DO jj = 1, jpj
342               DO ji = 1, jpi
343                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * z3d(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk)
344               END DO
345            END DO
346         END DO
347         CALL iom_put( "ke_zint", z2d )   ! vertically integrated kinetic energy
348
349      ENDIF
350      !
351      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
352
353      IF ( iom_use("relvor") .OR. iom_use("absvor") .OR. iom_use("potvor") ) THEN
354         
355         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
356         DO jk = 1, jpkm1
357            DO jj = 1, jpjm1
358               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt.
359                  z3d(ji,jj,jk) = (  e2v(ji+1,jj  ) * vn(ji+1,jj  ,jk) - e2v(ji,jj) * vn(ji,jj,jk)    &
360                     &              - e1u(ji  ,jj+1) * un(ji  ,jj+1,jk) + e1u(ji,jj) * un(ji,jj,jk)  ) * r1_e1e2f(ji,jj)
361               END DO
362            END DO
363         END DO
364         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'F', 1. )
365         CALL iom_put( "relvor", z3d )                  ! relative vorticity
366
367         DO jk = 1, jpkm1
368            DO jj = 1, jpj
369               DO ji = 1, jpi
370                  z3d(ji,jj,jk) = ff_f(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) 
371               END DO
372            END DO
373         END DO
374         CALL iom_put( "absvor", z3d )                  ! absolute vorticity
375
376         DO jk = 1, jpkm1
377            DO jj = 1, jpjm1
378               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt.
379                  ze3  = (  e3t_n(ji,jj+1,jk)*tmask(ji,jj+1,jk) + e3t_n(ji+1,jj+1,jk)*tmask(ji+1,jj+1,jk)   &
380                     &    + e3t_n(ji,jj  ,jk)*tmask(ji,jj  ,jk) + e3t_n(ji+1,jj  ,jk)*tmask(ji+1,jj  ,jk)  )
381                  IF( ze3 /= 0._wp ) THEN   ;   ze3 = 4._wp / ze3
382                  ELSE                      ;   ze3 = 0._wp
383                  ENDIF
384                  z3d(ji,jj,jk) = ze3 * z3d(ji,jj,jk) 
385               END DO
386            END DO
387         END DO
388         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'F', 1. )
389         CALL iom_put( "potvor", z3d )                  ! potential vorticity
390
391      ENDIF
392   
393      !
394      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
395         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
396         z2d(:,:) = 0.e0
397         DO jk = 1, jpkm1
398            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
399            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
400         END DO
401         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
402         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
403      ENDIF
404     
405      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
406         z2d(:,:) = 0._wp 
407         DO jk = 1, jpkm1
408            DO jj = 2, jpjm1
409               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
410                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
411               END DO
412            END DO
413         END DO
414         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
415         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
416      ENDIF
417
418      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
419         z2d(:,:) = 0.e0 
420         DO jk = 1, jpkm1
421            DO jj = 2, jpjm1
422               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
423                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
424               END DO
425            END DO
426         END DO
427         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
428         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
429      ENDIF
430
431     
432      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
433         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
434         DO jk = 1, jpkm1
435            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
436         END DO
437         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
438      ENDIF
439     
440      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
441         z2d(:,:) = 0.e0 
442         DO jk = 1, jpkm1
443            DO jj = 2, jpjm1
444               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
445                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
446               END DO
447            END DO
448         END DO
449         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
450         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
451      ENDIF
452
453      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
454         z2d(:,:) = 0._wp 
455         DO jk = 1, jpkm1
456            DO jj = 2, jpjm1
457               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
458                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
459               END DO
460            END DO
461         END DO
462         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
463         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
464      ENDIF
465
466      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
467         z2d(:,:) = 0._wp
468         DO jk = 1, jpkm1
469            DO jj = 2, jpjm1
470               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
471                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
472               END DO
473            END DO
474         END DO
475         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
476         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
477      ENDIF
478      IF( iom_use("somint") ) THEN
479         z2d(:,:)=0._wp
480         DO jk = 1, jpkm1
481            DO jj = 2, jpjm1
482               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
483                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
484               END DO
485            END DO
486         END DO
487         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
488         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
489      ENDIF
490
491      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
492      !
493         
494      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
495
496      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
497      !
498   END SUBROUTINE dia_wri
499
500#else
501   !!----------------------------------------------------------------------
502   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
503   !!----------------------------------------------------------------------
504
505   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
506      !!----------------------------------------------------------------------
507      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
508      !!----------------------------------------------------------------------
509      ierr = 0
510      ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
511         &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
512         &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
513         !
514      dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
515      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
516      !
517   END FUNCTION dia_wri_alloc
518
519   
520   SUBROUTINE dia_wri( kt )
521      !!---------------------------------------------------------------------
522      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
523      !!                   
524      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
525      !!      NETCDF format is used by default
526      !!
527      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
528      !!      define all the NETCDF files and fields
529      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
530      !!      Each nn_write time step, output the instantaneous or mean fields
531      !!----------------------------------------------------------------------
532      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
533      !
534      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
535      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
536      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
537      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
538      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
539      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
540      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
541      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
542      !
543      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
544      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
545      !!----------------------------------------------------------------------
546      !
547      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
548         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
549         ninist = 0
550      ENDIF
551      !
552      IF( nn_write == -1 )   RETURN   ! we will never do any output
553      !
554      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
555      !
556      ! 0. Initialisation
557      ! -----------------
558
559      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
560      ll_print = ll_print .AND. lwp
561
562      ! Define frequency of output and means
563      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
564#if defined key_diainstant
565      zsto = nn_write * rdt
566      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
567#else
568      zsto=rdt
569      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
570#endif
571      zout = nn_write * rdt
572      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
573
574      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
575      iimi = 1      ;      iima = jpi
576      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
577      ipk = jpk
578
579      ! define time axis
580      it = kt
581      itmod = kt - nit000 + 1
582
583
584      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
585      ! -----------------------------------------------------------------
586
587      IF( kt == nit000 ) THEN
588
589         ! Define the NETCDF files (one per grid)
590
591         ! Compute julian date from starting date of the run
592         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
593         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
594         IF(lwp)WRITE(numout,*)
595         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
596            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
597         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
598                                 ' limit storage in depth = ', ipk
599
600         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
601         IF(lwp) THEN
602            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write,' ' )
603            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
604            WRITE(inum,*) clhstnam
605            CLOSE(inum)
606         ENDIF
607
608         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
609
610         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_T' )
611         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
612         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
613            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
614            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
615         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
616            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
617         !                                                            ! Index of ocean points
618         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
619         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
620         !
621         IF( ln_icebergs ) THEN
622            !
623            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
624            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
625            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
626            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
627            IF( ierror /= 0 ) THEN
628               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
629               RETURN
630            ENDIF
631            !
632            !! iceberg vertical coordinate is class number
633            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
634               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
635            !
636            !! each class just needs the surface index pattern
637            ndim_bT = 3
638            DO jn = 1,nclasses
639               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
640            ENDDO
641            !
642         ENDIF
643
644         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
645
646         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_U' )
647         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
648         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
649            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
650            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
651         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
652            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
653         !                                                            ! Index of ocean points
654         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
655         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
656
657         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
658
659         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_V' )                   ! filename
660         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
661         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
662            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
663            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
664         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
665            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
666         !                                                            ! Index of ocean points
667         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
668         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
669
670         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
671
672         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_W' )                   ! filename
673         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
674         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
675            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
676            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
677         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
678            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
679
680
681         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
682
683         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
684         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
685            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
686         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
687            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
688         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
689            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
690            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
691            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
692            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
693            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
694            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
695         ENDIF
696         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
697         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
698            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
699         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
700            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
701         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
702            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
703         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
704            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
705         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
706            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
707         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
708            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
709         IF(  ln_linssh  ) THEN
710            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
711            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
712            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
713            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
714            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
715            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
716         ENDIF
717         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
718            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
719         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
720            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
721         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
722            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
723         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
724            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
725         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
726            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
727         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
728            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
729!
730         IF( ln_icebergs ) THEN
731            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
732               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
733            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
734               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
735            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
736               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
737            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
738               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
739            IF( ln_bergdia ) THEN
740               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
741                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
742               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
743                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
744               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
745                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
746               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
747                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
748               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
749                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
750               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
751                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
752               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
753                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
754               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
755                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
756               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
757                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
758               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
759                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
760            ENDIF
761         ENDIF
762
763         IF( ln_ssr ) THEN
764            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
765               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
766            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
767               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
768            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
769               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
770         ENDIF
771       
772         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
773!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
774!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
775#if defined key_diahth
776         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
777            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
778         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
779            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
780         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
781            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
782         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
783            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
784#endif
785
786         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
787
788         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
789         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
790            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
791         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
792            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
793               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
794         ENDIF
795         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
796         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
797            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
798
799         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
800
801         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
802         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
803            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
804         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
805            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
806               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
807         ENDIF
808         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
809         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
810            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
811
812         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
813
814         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
815         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
816            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
817         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
818            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
819         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
820            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
821
822         IF( ln_zdfddm ) THEN
823            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
824               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
825         ENDIF
826         
827         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
828            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
829               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
830         ENDIF
831         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
832         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
833
834         IF(lwp) WRITE(numout,*)
835         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
836         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
837
838      ENDIF
839
840      ! 2. Start writing data
841      ! ---------------------
842
843      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
844      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
845      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
846
847      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nn_write ) == 0 ) THEN
848         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
849         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
850      ENDIF
851
852      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
853         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
854         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
855         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
856         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
857      ELSE
858         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
859         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
860         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
861         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
862      ENDIF
863      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
864         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
865         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
866         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
867         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
868      ENDIF
869      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
870      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
871      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
872      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
873                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
874                                                                                  ! in linear free surface case)
875      IF( ln_linssh ) THEN
876         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
877         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
878         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
879         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
880      ENDIF
881      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
882      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
883      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
884      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
885      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
886      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
887!
888      IF( ln_icebergs ) THEN
889         !
890         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
891         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
892         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
893         !
894         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
895         !
896         IF( ln_bergdia ) THEN
897            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
898            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
899            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
900            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
901            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
902            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
903            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
904            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
905            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
906            !
907            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
908         ENDIF
909      ENDIF
910
911      IF( ln_ssr ) THEN
912         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
913         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
914         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
915         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
916      ENDIF
917!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
918!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
919
920#if defined key_diahth
921      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
922      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
923      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
924      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
925#endif
926
927      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
928      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
929
930      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
931      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
932
933      CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn             , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
934      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
935      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
936      IF( ln_zdfddm ) THEN
937         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
938      ENDIF
939
940      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
941         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
942         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
943         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
944      ENDIF
945
946      ! 3. Close all files
947      ! ---------------------------------------
948      IF( kt == nitend ) THEN
949         CALL histclo( nid_T )
950         CALL histclo( nid_U )
951         CALL histclo( nid_V )
952         CALL histclo( nid_W )
953      ENDIF
954      !
955      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
956      !
957   END SUBROUTINE dia_wri
958#endif
959
960   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
961      !!---------------------------------------------------------------------
962      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
963      !!       
964      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
965      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
966      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
967      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
968      !!
969      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
970      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
971      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
972      !!----------------------------------------------------------------------
973      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
974      !!
975      INTEGER :: inum
976      !!----------------------------------------------------------------------
977      !
978      IF(lwp) WRITE(numout,*)
979      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
980      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
981      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
982
983#if defined key_si3
984     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
985#else
986     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
987#endif
988
989      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
990      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
991      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
992      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
993      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
994      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn                )    ! now k-velocity
995      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
996         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
997         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
998      ENDIF
999      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
1000         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
1001         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
1002      ENDIF
1003      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
1004      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
1005      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
1006      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
1007      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
1008      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
1009      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
1010         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
1011         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
1012      END IF
1013      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
1014         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
1015         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
1016         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
1017      ENDIF
1018 
1019#if defined key_si3
1020      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
1021         CALL ice_wri_state( inum )
1022      ENDIF
1023#endif
1024      !
1025      CALL iom_close( inum )
1026      !
1027   END SUBROUTINE dia_wri_state
1028
1029   !!======================================================================
1030END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.