New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
trc_oce.F90 in branches/2011/dev_r2787_LOCEAN3_TRA_TRP/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC – NEMO

source: branches/2011/dev_r2787_LOCEAN3_TRA_TRP/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/trc_oce.F90 @ 2819

Last change on this file since 2819 was 2819, checked in by cetlod, 13 years ago

Improvment of branch dev_r2787_LOCEAN3_TRA_TRP
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 16.8 KB
RevLine 
[187]1MODULE trc_oce
2   !!======================================================================
3   !!                      ***  MODULE  trc_oce  ***
4   !! Ocean passive tracer  :  share SMS/Ocean variables
5   !!======================================================================
[1423]6   !! History :  1.0  !  2004-03  (C. Ethe)  Original code
[187]7   !!----------------------------------------------------------------------
[1423]8
9   !!----------------------------------------------------------------------
10   !!   trc_oce_rgb : tabulated attenuation coefficients for RGB light penetration         
11   !!----------------------------------------------------------------------
[1445]12   USE par_oce
[1423]13   USE in_out_manager  ! I/O manager
14   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
[2715]15   USE lib_mpp         ! MPP library
[1423]16
[1445]17   IMPLICIT NONE
18   PRIVATE
19
20   PUBLIC   trc_oce_rgb        ! routine called by traqsr.F90
21   PUBLIC   trc_oce_rgb_read   ! routine called by traqsr.F90
22   PUBLIC   trc_oce_ext_lev    ! function called by traqsr.F90 at least
[2715]23   PUBLIC   trc_oce_alloc      ! function called by nemogcm.F90
[1445]24
[2715]25   REAL(wp), PUBLIC                                      ::   r_si2   !: largest depth of extinction (blue & 0.01 mg.m-3)  (RGB)
26   REAL(wp), PUBLIC, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) ::   etot3   !: light absortion coefficient
27
[923]28#if defined key_top && defined key_pisces
[187]29   !!----------------------------------------------------------------------
[1423]30   !!   'key_top'   &   'key_pisces'                       PISCES bio-model         
[189]31   !!----------------------------------------------------------------------
[1423]32   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_qsr_bio = .TRUE.   !: bio-model light absorption flag
[189]33#else
34   !!----------------------------------------------------------------------
[1423]35   !! Default option                          No bio-model light absorption     
[187]36   !!----------------------------------------------------------------------
[1423]37   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_qsr_bio = .FALSE.   !: bio-model light absorption flag
[189]38#endif
[187]39
[2528]40#if defined key_offline
41   !!----------------------------------------------------------------------
42   !!   'key_offline'                                     OFFLINE mode         
43   !!----------------------------------------------------------------------
44   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_offline = .TRUE.   !: offline flag
45#else
46   !!----------------------------------------------------------------------
47   !!   Default option                                   NO  OFFLINE mode         
48   !!----------------------------------------------------------------------
49   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_offline = .FALSE.   !: offline flag
50#endif
[2819]51#if defined key_degrad
52   !!----------------------------------------------------------------------
53   !!   'key_degrad'                                     Degradation mode         
54   !!----------------------------------------------------------------------
55   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_degrad = .TRUE.   !: degradation flag
56#else
57   !!----------------------------------------------------------------------
58   !!   Default option                                   NO  Degradation mode         
59   !!----------------------------------------------------------------------
60   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_degrad = .FALSE.   !: degradation flag
61#endif
[2528]62
[1423]63   !! * Substitutions
64#  include "domzgr_substitute.h90"
65   !!----------------------------------------------------------------------
[2528]66   !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010)
[1445]67   !! $Id$
[2715]68   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
[1423]69   !!----------------------------------------------------------------------
70CONTAINS
71
[2715]72   INTEGER FUNCTION trc_oce_alloc()
73      !!----------------------------------------------------------------------
74      !!                  ***  trc_oce_alloc  ***
75      !!----------------------------------------------------------------------
76      ALLOCATE( etot3(jpi,jpj,jpk)   , STAT= trc_oce_alloc )
77      !
78      IF( trc_oce_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('trc_oce_alloc: failed to allocate etot3 array')
79   END FUNCTION trc_oce_alloc
80
81
[1423]82   SUBROUTINE trc_oce_rgb( prgb )
83      !!---------------------------------------------------------------------
84      !!                  ***  ROUTINE p4z_opt_init  ***
85      !!
86      !! ** Purpose :   Initialization of of the optical scheme
87      !!
88      !! ** Method  :   Set a look up table for the optical coefficients
89      !!                i.e. the attenuation coefficient for R-G-B light
90      !!                tabulated in Chlorophyll class (from JM Andre)
91      !!
92      !! ** Action  :   prgb(3,61) tabulated R-G-B attenuation coef.
93      !!
94      !! Reference  : Lengaigne et al. 2007, Clim. Dyn., V28, 5, 503-516.
95      !!----------------------------------------------------------------------
[1445]96      REAL(wp), DIMENSION(3,61), INTENT(out) ::   prgb   ! tabulated attenuation coefficient
[1423]97      !!
98      INTEGER  ::   jc     ! dummy loop indice
99      INTEGER  ::   irgb   ! temporary integer
100      REAL(wp) ::   zchl   ! temporary scalar
101      REAL(wp), DIMENSION(4,61) ::   zrgb   ! tabulated attenuation coefficient (formerly read in 'kRGB61.txt')
102      !!----------------------------------------------------------------------
103      !
104      IF(lwp) THEN
105         WRITE(numout,*)
106         WRITE(numout,*) 'trc_oce_rgb : Initialisation of the optical look-up table'
107         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~ '
108      ENDIF
109      !
110      !  Chlorophyll        !     Blue attenuation     !     Green attenuation    !     Red attenuation      !
111      zrgb(1, 1) =  0.010   ;   zrgb(2, 1) = 0.01618   ;   zrgb(3, 1) = 0.07464   ;   zrgb(4, 1) = 0.37807
112      zrgb(1, 2) =  0.011   ;   zrgb(2, 2) = 0.01654   ;   zrgb(3, 2) = 0.07480   ;   zrgb(4, 2) = 0.37823
113      zrgb(1, 3) =  0.013   ;   zrgb(2, 3) = 0.01693   ;   zrgb(3, 3) = 0.07499   ;   zrgb(4, 3) = 0.37840
114      zrgb(1, 4) =  0.014   ;   zrgb(2, 4) = 0.01736   ;   zrgb(3, 4) = 0.07518   ;   zrgb(4, 4) = 0.37859
115      zrgb(1, 5) =  0.016   ;   zrgb(2, 5) = 0.01782   ;   zrgb(3, 5) = 0.07539   ;   zrgb(4, 5) = 0.37879
116      zrgb(1, 6) =  0.018   ;   zrgb(2, 6) = 0.01831   ;   zrgb(3, 6) = 0.07562   ;   zrgb(4, 6) = 0.37900
117      zrgb(1, 7) =  0.020   ;   zrgb(2, 7) = 0.01885   ;   zrgb(3, 7) = 0.07586   ;   zrgb(4, 7) = 0.37923
118      zrgb(1, 8) =  0.022   ;   zrgb(2, 8) = 0.01943   ;   zrgb(3, 8) = 0.07613   ;   zrgb(4, 8) = 0.37948
119      zrgb(1, 9) =  0.025   ;   zrgb(2, 9) = 0.02005   ;   zrgb(3, 9) = 0.07641   ;   zrgb(4, 9) = 0.37976
120      zrgb(1,10) =  0.028   ;   zrgb(2,10) = 0.02073   ;   zrgb(3,10) = 0.07672   ;   zrgb(4,10) = 0.38005
121      zrgb(1,11) =  0.032   ;   zrgb(2,11) = 0.02146   ;   zrgb(3,11) = 0.07705   ;   zrgb(4,11) = 0.38036
122      zrgb(1,12) =  0.035   ;   zrgb(2,12) = 0.02224   ;   zrgb(3,12) = 0.07741   ;   zrgb(4,12) = 0.38070
123      zrgb(1,13) =  0.040   ;   zrgb(2,13) = 0.02310   ;   zrgb(3,13) = 0.07780   ;   zrgb(4,13) = 0.38107
124      zrgb(1,14) =  0.045   ;   zrgb(2,14) = 0.02402   ;   zrgb(3,14) = 0.07821   ;   zrgb(4,14) = 0.38146
125      zrgb(1,15) =  0.050   ;   zrgb(2,15) = 0.02501   ;   zrgb(3,15) = 0.07866   ;   zrgb(4,15) = 0.38189
126      zrgb(1,16) =  0.056   ;   zrgb(2,16) = 0.02608   ;   zrgb(3,16) = 0.07914   ;   zrgb(4,16) = 0.38235
127      zrgb(1,17) =  0.063   ;   zrgb(2,17) = 0.02724   ;   zrgb(3,17) = 0.07967   ;   zrgb(4,17) = 0.38285
128      zrgb(1,18) =  0.071   ;   zrgb(2,18) = 0.02849   ;   zrgb(3,18) = 0.08023   ;   zrgb(4,18) = 0.38338
129      zrgb(1,19) =  0.079   ;   zrgb(2,19) = 0.02984   ;   zrgb(3,19) = 0.08083   ;   zrgb(4,19) = 0.38396
130      zrgb(1,20) =  0.089   ;   zrgb(2,20) = 0.03131   ;   zrgb(3,20) = 0.08149   ;   zrgb(4,20) = 0.38458
131      zrgb(1,21) =  0.100   ;   zrgb(2,21) = 0.03288   ;   zrgb(3,21) = 0.08219   ;   zrgb(4,21) = 0.38526
132      zrgb(1,22) =  0.112   ;   zrgb(2,22) = 0.03459   ;   zrgb(3,22) = 0.08295   ;   zrgb(4,22) = 0.38598
133      zrgb(1,23) =  0.126   ;   zrgb(2,23) = 0.03643   ;   zrgb(3,23) = 0.08377   ;   zrgb(4,23) = 0.38676
134      zrgb(1,24) =  0.141   ;   zrgb(2,24) = 0.03842   ;   zrgb(3,24) = 0.08466   ;   zrgb(4,24) = 0.38761
135      zrgb(1,25) =  0.158   ;   zrgb(2,25) = 0.04057   ;   zrgb(3,25) = 0.08561   ;   zrgb(4,25) = 0.38852
136      zrgb(1,26) =  0.178   ;   zrgb(2,26) = 0.04289   ;   zrgb(3,26) = 0.08664   ;   zrgb(4,26) = 0.38950
137      zrgb(1,27) =  0.200   ;   zrgb(2,27) = 0.04540   ;   zrgb(3,27) = 0.08775   ;   zrgb(4,27) = 0.39056
138      zrgb(1,28) =  0.224   ;   zrgb(2,28) = 0.04811   ;   zrgb(3,28) = 0.08894   ;   zrgb(4,28) = 0.39171
139      zrgb(1,29) =  0.251   ;   zrgb(2,29) = 0.05103   ;   zrgb(3,29) = 0.09023   ;   zrgb(4,29) = 0.39294
140      zrgb(1,30) =  0.282   ;   zrgb(2,30) = 0.05420   ;   zrgb(3,30) = 0.09162   ;   zrgb(4,30) = 0.39428
141      zrgb(1,31) =  0.316   ;   zrgb(2,31) = 0.05761   ;   zrgb(3,31) = 0.09312   ;   zrgb(4,31) = 0.39572
142      zrgb(1,32) =  0.355   ;   zrgb(2,32) = 0.06130   ;   zrgb(3,32) = 0.09474   ;   zrgb(4,32) = 0.39727
143      zrgb(1,33) =  0.398   ;   zrgb(2,33) = 0.06529   ;   zrgb(3,33) = 0.09649   ;   zrgb(4,33) = 0.39894
144      zrgb(1,34) =  0.447   ;   zrgb(2,34) = 0.06959   ;   zrgb(3,34) = 0.09837   ;   zrgb(4,34) = 0.40075
145      zrgb(1,35) =  0.501   ;   zrgb(2,35) = 0.07424   ;   zrgb(3,35) = 0.10040   ;   zrgb(4,35) = 0.40270
146      zrgb(1,36) =  0.562   ;   zrgb(2,36) = 0.07927   ;   zrgb(3,36) = 0.10259   ;   zrgb(4,36) = 0.40480
147      zrgb(1,37) =  0.631   ;   zrgb(2,37) = 0.08470   ;   zrgb(3,37) = 0.10495   ;   zrgb(4,37) = 0.40707
148      zrgb(1,38) =  0.708   ;   zrgb(2,38) = 0.09056   ;   zrgb(3,38) = 0.10749   ;   zrgb(4,38) = 0.40952
149      zrgb(1,39) =  0.794   ;   zrgb(2,39) = 0.09690   ;   zrgb(3,39) = 0.11024   ;   zrgb(4,39) = 0.41216
150      zrgb(1,40) =  0.891   ;   zrgb(2,40) = 0.10374   ;   zrgb(3,40) = 0.11320   ;   zrgb(4,40) = 0.41502
151      zrgb(1,41) =  1.000   ;   zrgb(2,41) = 0.11114   ;   zrgb(3,41) = 0.11639   ;   zrgb(4,41) = 0.41809
152      zrgb(1,42) =  1.122   ;   zrgb(2,42) = 0.11912   ;   zrgb(3,42) = 0.11984   ;   zrgb(4,42) = 0.42142
153      zrgb(1,43) =  1.259   ;   zrgb(2,43) = 0.12775   ;   zrgb(3,43) = 0.12356   ;   zrgb(4,43) = 0.42500
154      zrgb(1,44) =  1.413   ;   zrgb(2,44) = 0.13707   ;   zrgb(3,44) = 0.12757   ;   zrgb(4,44) = 0.42887
155      zrgb(1,45) =  1.585   ;   zrgb(2,45) = 0.14715   ;   zrgb(3,45) = 0.13189   ;   zrgb(4,45) = 0.43304
156      zrgb(1,46) =  1.778   ;   zrgb(2,46) = 0.15803   ;   zrgb(3,46) = 0.13655   ;   zrgb(4,46) = 0.43754
157      zrgb(1,47) =  1.995   ;   zrgb(2,47) = 0.16978   ;   zrgb(3,47) = 0.14158   ;   zrgb(4,47) = 0.44240
158      zrgb(1,48) =  2.239   ;   zrgb(2,48) = 0.18248   ;   zrgb(3,48) = 0.14701   ;   zrgb(4,48) = 0.44765
159      zrgb(1,49) =  2.512   ;   zrgb(2,49) = 0.19620   ;   zrgb(3,49) = 0.15286   ;   zrgb(4,49) = 0.45331
160      zrgb(1,50) =  2.818   ;   zrgb(2,50) = 0.21102   ;   zrgb(3,50) = 0.15918   ;   zrgb(4,50) = 0.45942
161      zrgb(1,51) =  3.162   ;   zrgb(2,51) = 0.22703   ;   zrgb(3,51) = 0.16599   ;   zrgb(4,51) = 0.46601
162      zrgb(1,52) =  3.548   ;   zrgb(2,52) = 0.24433   ;   zrgb(3,52) = 0.17334   ;   zrgb(4,52) = 0.47313
[1834]163      zrgb(1,53) =  3.981   ;   zrgb(2,53) = 0.26301   ;   zrgb(3,53) = 0.18126   ;   zrgb(4,53) = 0.48080
164      zrgb(1,54) =  4.467   ;   zrgb(2,54) = 0.28320   ;   zrgb(3,54) = 0.18981   ;   zrgb(4,54) = 0.48909
165      zrgb(1,55) =  5.012   ;   zrgb(2,55) = 0.30502   ;   zrgb(3,55) = 0.19903   ;   zrgb(4,55) = 0.49803
166      zrgb(1,56) =  5.623   ;   zrgb(2,56) = 0.32858   ;   zrgb(3,56) = 0.20898   ;   zrgb(4,56) = 0.50768
167      zrgb(1,57) =  6.310   ;   zrgb(2,57) = 0.35404   ;   zrgb(3,57) = 0.21971   ;   zrgb(4,57) = 0.51810
168      zrgb(1,58) =  7.079   ;   zrgb(2,58) = 0.38154   ;   zrgb(3,58) = 0.23129   ;   zrgb(4,58) = 0.52934
169      zrgb(1,59) =  7.943   ;   zrgb(2,59) = 0.41125   ;   zrgb(3,59) = 0.24378   ;   zrgb(4,59) = 0.54147
[1423]170      zrgb(1,60) =  8.912   ;   zrgb(2,60) = 0.44336   ;   zrgb(3,60) = 0.25725   ;   zrgb(4,60) = 0.55457
171      zrgb(1,61) = 10.000   ;   zrgb(2,61) = 0.47804   ;   zrgb(3,61) = 0.27178   ;   zrgb(4,61) = 0.56870
172      !
173      prgb(:,:) = zrgb(2:4,:)
174      !
[2528]175      r_si2 = 1.e0 / zrgb(2, 1)        ! blue with the smallest chlorophyll concentration)
176      IF(lwp) WRITE(numout,*) '      RGB longest depth of extinction    r_si2 = ', r_si2
177      !
[1423]178      DO jc = 1, 61                         ! check
179         zchl = zrgb(1,jc)
180         irgb = NINT( 41 + 20.* LOG10( zchl ) + 1.e-15 )
181         IF(lwp) WRITE(numout,*) '    jc =', jc, '  Chl = ', zchl, '  irgb = ', irgb
182         IF( irgb /= jc ) THEN
183            IF(lwp) WRITE(numout,*) '    jc =', jc, '  Chl = ', zchl, '  Chl class = ', irgb
184            CALL ctl_stop( 'trc_oce_rgb : inconsistency in Chl tabulated attenuation coeff.' )
185         ENDIF
186      END DO
187      !
188   END SUBROUTINE trc_oce_rgb
189
190
191   SUBROUTINE trc_oce_rgb_read( prgb )
192      !!----------------------------------------------------------------------
193      !!                  ***  ROUTINE p4z_opt_init  ***
194      !!
195      !! ** Purpose :   Initialization of of the optical scheme
196      !!
197      !! ** Method  :   read the look up table for the optical coefficients
198      !!
199      !! ** input   :   xkrgb(61) precomputed array corresponding to the 
200      !!                          attenuation coefficient (from JM Andre)
201      !!----------------------------------------------------------------------
[1445]202      REAL(wp), DIMENSION(3,61), INTENT(out) ::   prgb   ! tabulated attenuation coefficient
[1423]203      !!
[2528]204      INTEGER  ::   jc, jb ! dummy loop indice
205      INTEGER  ::   irgb   ! temporary integer
206      REAL(wp) ::   zchl   ! temporary scalar
[1423]207      INTEGER  ::   numlight
208      !!----------------------------------------------------------------------
209      !
210      IF(lwp) THEN                         ! control print
211         WRITE(numout,*)
212         WRITE(numout,*) ' trc_oce_rgb_read : optical look-up table read in kRGB61.txt file'
213         WRITE(numout,*) ' ~~~~~~~~~~~~~~~~'
[2528]214         WRITE(numout,*) 
[1423]215      ENDIF
216      !
[2528]217      CALL ctl_opn( numlight, 'kRGB61.txt', 'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp )
218      DO jc = 1, 61
219         READ(numlight,*) zchl, ( prgb(jb,jc), jb = 1, 3 )
220         irgb = NINT( 41 + 20.* LOG10( zchl ) + 1.e-15 )   
221         IF(lwp) WRITE(numout,*) '    jc =', jc, '  Chl = ', zchl, '  irgb = ', irgb 
222         IF( irgb /= jc ) THEN 
223            IF(lwp) WRITE(numout,*) '    jc =', jc, '  Chl = ', zchl, '  Chl class = ', irgb
224            CALL ctl_stop( 'trc_oce_rgb_read : inconsistency in Chl tabulated attenuation coeff.' )
225         ENDIF
226      END DO
227      CLOSE( numlight )
228      !
229      r_si2 = 1.e0 / prgb(1, 1)      ! blue with the smallest chlorophyll concentration)
230      IF(lwp) WRITE(numout,*) '      RGB longest depth of extinction    r_si2 = ', r_si2
231      !
[1423]232   END SUBROUTINE trc_oce_rgb_read
233
234
235   FUNCTION trc_oce_ext_lev( prldex, pqsr_frc ) RESULT( pjl )
236      !!----------------------------------------------------------------------
237      !!                 ***  ROUTINE trc_oce_ext_lev  ***
238      !!       
239      !! ** Purpose :   compute max. level for light penetration
240      !!         
241      !! ** Method  :   the function provides the level at which irradiance
242      !!                becomes negligible (i.e. = 1.e-15 W/m2) for 3 or 2 bands light
243      !!                penetration: I(z) = pqsr_frc * EXP(hext/prldex) = 1.e-15 W/m2
244      !!                # prldex is the longest depth of extinction:
245      !!                   - prldex = 23 m (2 bands case)
246      !!                   - prldex = 62 m (3 bands case: blue waveband & 0.01 mg/m2 for the chlorophyll)
247      !!                # pqsr_frc is the fraction of solar radiation which penetrates,
248      !!                considering Qsr=240 W/m2 and rn_abs = 0.58:
249      !!                   - pqsr_frc = Qsr * (1-rn_abs)   = 1.00e2 W/m2 (2 bands case)
250      !!                   - pqsr_frc = Qsr * (1-rn_abs)/3 = 0.33e2 W/m2 (3 bands case & equi-partition)
251      !!
252      !!----------------------------------------------------------------------
253      REAL(wp), INTENT(in) ::   prldex    ! longest depth of extinction
254      REAL(wp), INTENT(in) ::   pqsr_frc  ! frac. solar radiation which penetrates
255      !!
256      INTEGER  ::   jk, pjl            ! levels
257      REAL(wp) ::   zhext              ! deepest level till which light penetrates
258      REAL(wp) ::   zprec = 15._wp     ! precision to reach -LOG10(1.e-15)
259      REAL(wp) ::   zem                ! temporary scalar
260      !!----------------------------------------------------------------------
261      !
262      ! It is not necessary to compute anything bellow the following depth
[2715]263      zhext = prldex * ( LOG(10._wp) * zprec + LOG(pqsr_frc) )
264      !
[1423]265      ! Level of light extinction
266      pjl = jpkm1
267      DO jk = jpkm1, 1, -1
268         zem = MAXVAL( fsdepw(:,:,jk+1) * tmask(:,:,jk) )
269         IF( zem >= zhext )   pjl = jk                       ! last T-level reached by Qsr
270      END DO
271      !
272   END FUNCTION trc_oce_ext_lev
273
274   !!======================================================================
[187]275END MODULE trc_oce
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.