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iodef.xml in branches/2012/dev_LOCEAN_2012/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00 – NEMO

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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3 
4  <context id="nemo">
5   
6    <!-- $id$ -->
7
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14   
15    <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined -->
16
17      <!-- T grid -->
18     
19      <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
20   <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   />
21         <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   />
22   <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     />
23   <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    />
24   <field id="sstgrad"      description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   />
25   <field id="sstgrad2"     description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 />
26   <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      />
27   <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     />
28   <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        />
29   <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       />
30   <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        />
31   <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        />
32         <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  />
33   <!-- next variables available with key_diahth -->
34   <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        />
35   <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        />
36   <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        />
37   <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        />
38   <field id="mld_dt02"     description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        />
39   <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        />
40   <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        />
41   <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        />
42   <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     />
43   <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        />
44        <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        />
45   <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        />
46   <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        />
47   <!-- variables available with key_diaar5 -->
48   <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     />
49   <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  />
50     </group>
51
52      <!-- SBC -->
53     
54      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
55
56   <field id="empmr"        description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  />
57   <field id="empsmr"       description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  />
58   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  />
59   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  />
60
61   <field id="qt"           description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     />
62   <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     />
63   <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     />
64   <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     />
65   <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     />
66   <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  />
67   <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     />
68   <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      />
69
70        <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn -->
71        <field id="ssh_ib"       description="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        />
72   
73   <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core -->
74   <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     />
75   <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
76   <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
77   <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     />
78   <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     />
79
80   <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        />
81
82   <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     />
83   <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
84   <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
85   <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     />
86   
87   <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
88   <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
89   
90   <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        />
91   <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        />
92   <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      />
93   
94   <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        />
95   <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     />
96   <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />     
97   <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
98   <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
99   
100   <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
101   <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
102   
103   <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     />
104   <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     />
105
106   <!-- available key_coupled -->
107   <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
108   <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  />
109   <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
110   <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        />
111   <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  />
112   <!-- available if key_coupled + conservative method -->
113   <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  />
114   <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  />
115   <!-- variables available with key_diaar5 -->
116   <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  />
117   <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  />
118   <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  />
119   <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     />
120   <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     />
121   <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     />
122   <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     />
123   <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     />
124   <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     />
125   <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  />
126   <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  />
127   <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  />
128   <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  />
129   <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  />
130
131      </group>
132
133      <!-- U grid -->
134     
135      <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U">
136   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
137   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  />
138   <field id="uocetr_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"    unit="m3/s"                 />
139   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
140   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  />
141   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl -->
142   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" />
143   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
144   <!-- variables available with key_diaar5 -->
145   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 />
146   <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
147   <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
148   <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
149     </group>
150     
151      <!-- V grid -->
152     
153      <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V">
154   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
155   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  />
156   <field id="vocetr_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"    unit="m3/s"                 />
157   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
158   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  />
159   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl -->
160   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  />
161   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
162   <!-- variables available with key_diaar5 -->
163   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 />
164   <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
165   <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
166   <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
167      </group>
168     
169      <!-- W grid -->
170     
171      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
172   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  />
173   <field id="wocetr_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 />
174   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
175   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  />
176   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
177   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 />
178   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 />
179   <!-- avs: available with key_zdfddm -->
180   <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 />
181   <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd -->
182   <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 />
183   <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 />
184   <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d -->
185   <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" />
186   <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" />
187   <!-- avt_tide: available with key_zdftmx -->
188   <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 />
189   <!-- variables available with key_diaar5 -->   
190   <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 />
191   <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               />
192      </group>
193         
194      <!-- scalar -->
195     
196      <!-- variables available with key_diaar5 -->
197      <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" >
198   <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   />
199   <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    />
200   <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    />
201   <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    />
202   <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   />
203   <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" />
204   <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  />
205   <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" />
206      </group>
207
208      <!-- variables available with key_float -->
209      <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point">
210        <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" />
211        <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   />
212        <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     />
213        <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  />
214        <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   />
215        <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" />
216        <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  />
217      </group>
218     
219      <!-- ptrc on T grid -->
220
221     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">
222       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" />
223       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" />
224       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" />
225       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" />
226       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" />
227       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" />
228       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" />
229       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" />
230       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" />
231       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" />
232       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" />
233       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" />
234       <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" />
235       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" />
236       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" />
237       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" />
238       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" />
239       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" />
240       <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" />
241       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" />
242       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3"   />
243       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3"   />
244       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" />
245       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" />
246     </group>
247
248      <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc -->
249
250     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
251       <field id="PH"          description="PH"                                      unit="-"          axis_ref="deptht" />
252       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                            unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" />
253       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                          unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" />
254       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"  unit="W/m2"       axis_ref="deptht" />
255       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"         unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
256       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"           unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
257       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
258       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"       unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
259       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"        unit="molSi/m3/s" axis_ref="deptht" />
260       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"         unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" />
261       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"      unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" />
262       <field id="xfracal"     description="Calcifying fraction"                     unit="-"          axis_ref="deptht" />
263       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                      unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
264       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
265       <field id="GRAZ1"       description="Grazing by microzooplankton"             unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
266       <field id="GRAZ2"       description="Grazing by mesozooplankton"              unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
267       <field id="REMIN"       description="Oxic remineralization of OM"             unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
268       <field id="DENIT"       description="Anoxic remineralization of OM"           unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" />
269       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation"                       unit="molN/m3/s"  axis_ref="deptht" />
270       <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                     unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
271       <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"      unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
272       <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
273       <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit="-"          axis_ref="deptht" />
274       <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit="-"          axis_ref="deptht" />
275       <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" />
276       <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" />
277       <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"      unit="-"          axis_ref="deptht" />
278       <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"        unit="-"          axis_ref="deptht" />
279       <field id="Fe2"         description="Iron II concentration"                   unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
280       <field id="Fe3"         description="Iron III concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
281       <field id="FeL1"        description="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
282       <field id="FeL2"        description="Complexed Iron concentration with L2"    unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
283       <field id="FeP"         description="Precipitated Iron III"                   unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
284       <field id="TL1"         description="Total L1 concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
285       <field id="TL2"         description="Total L2 concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
286       <field id="pdust"       description="dust concentration"                      unit="g/L"                          />
287       <field id="Totlig"      description="Total ligand concentation"               unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
288       <field id="Biron"       description="Bioavailable iron"                       unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" />
289       <field id="Sdenit"      description="Nitrate reduction in the sediments"      unit="molN/m2/s"                    />
290       <field id="Ironice"     description="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="molFe/m2/s"                   />
291       <field id="HYDR"        description="Iron input from hydrothemal vents"       unit="molFe/m2/s"                   />
292       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                     />
293       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                     />
294       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                     />
295       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     />
296       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                     />
297       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                     />
298       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                />
299       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                               unit="uatm"                         />
300       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                unit="uatm"                         />
301       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                    unit="m"                            />
302       <field id="Irondep"     description="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                     />
303       <field id="Ironsed"     description="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"  axis_ref="deptht"  />
304     </group>
305       
306    </field_definition>
307   
308    <!--
309============================================================================================================
310=                                           output files definition                                        =
311=                                            Define your own files                                         =
312=                                         put the variables you want...                                    =
313============================================================================================================
314    -->
315   
316    <file_definition >
317
318      <group id="1h" output_freq="3600"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1h files -->
319      </group>
320     
321      <group id="2h" output_freq="7200"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2h files -->
322      </group>
323     
324      <group id="3h" output_freq="10800"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3h files -->
325      </group>
326     
327      <group id="4h" output_freq="14400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 4h files -->
328      </group>
329     
330      <group id="6h" output_freq="21600"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 6h files -->
331      </group>
332     
333      <group id="1d" output_freq="86400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files -->
334
335    <!--
336............................................................................................................
337           example of 3 types of 1d files
338............................................................................................................
339    -->
340        <!-- automatic definition of the name based on id="1d_grid_T"
341             => this name is used as the radical for all file names of this group
342             => add a suffix to be sure that all files names of this group are different   -->
343        <group id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
344          <!-- mooring: automatic definition of the file name suffix based on id="0n180wT"  -->
345          <file id="0n180wT" name_suffix="auto" >
346            <group id="0n180wT" zoom_ref="0n180wT" >    <!-- group of variables sharing the same zoom -->
347              <field ref="toce" name="votemper"  />
348              <field ref="uoce" name="vozocrtx"  />     <!-- include a U-grid variable in the list => switch to T-grid -->
349            </group>
350          </file>
351          <!-- Equatorial section: automatic definition of the file name suffix based on id="EqT" -->
352          <file id="EqT" name_suffix="auto" >
353            <group id="EqT" zoom_ref="EqT" >
354              <field ref="toce" name="votemper"  />
355            </group>
356          </file>
357          <!-- global file with different operations on data   -->
358          <file id="global" >
359            <field ref="sst"    name="sst_1d_ave"                       />     <!-- mean -->
360            <field ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="t_max(X)" />     <!-- max -->
361          </file>
362        </group>
363
364      </group>
365     
366      <group id="3d" output_freq="259200" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3d files -->
367      </group>
368     
369      <group id="5d" output_freq="432000" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 5d files -->
370
371   <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
372     <field ref="toce"         name="votemper"  />
373     <field ref="soce"         name="vosaline"  />
374     <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
375     <field ref="sss"          name="sosaline"  />
376     <field ref="ssh"          name="sossheig"  />
377     <field ref="empmr"        name="sowaflup"  />
378     <field ref="qsr"          name="soshfldo"  />
379     <field ref="empsmr"       name="sowaflcd"  />
380     <field ref="qt"           name="sohefldo"  />
381     <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  />
382     <field ref="mldkz5"       name="somixhgt"  />
383     <field ref="ice_cover"    name="soicecov"  />
384     <field ref="wspd"         name="sowindsp"  />
385     <field ref="qrp"          name="sohefldp"  />
386     <field ref="erp"          name="sowafldp"  />
387     <field ref="mlddzt"       name="sothedep"  />
388     <field ref="20d"          name="so20chgt"  />
389     <field ref="28d"          name="so28chgt"  />
390     <field ref="hc300"        name="sohtc300"  />
391     <field ref="ist_ipa"      name="soicetem"  />
392     <field ref="icealb_cea"   name="soicealb"  />   
393   </file>
394   
395   <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" >
396     <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  />
397     <field ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  />
398     <field ref="utau"         name="sozotaux"  />
399   </file>
400   
401   <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" >
402     <field ref="voce"         name="vomecrty"  />
403     <field ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  />
404     <field ref="vtau"         name="sometauy"  />
405   </file>
406   
407   <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" >
408     <field ref="woce"         name="vovecrtz" />
409     <field ref="woce_eiv"     name="voveeivw" />
410     <field ref="avt"          name="votkeavt" />
411     <field ref="avt_evd"      name="votkeevd" />
412     <field ref="avm"          name="votkeavm" />
413     <field ref="avm_evd"      name="votkeevm" />
414     <field ref="avs"          name="voddmavs" />
415     <field ref="aht2d"        name="soleahtw" />
416     <field ref="aht2d_eiv"    name="soleaeiw" />
417   </file>
418
419
420   <file id="5d_icemod" name="auto" description="ice variables" >
421     <field ref="ice_pres"                     />
422     <field ref="snowthic_cea" name="isnowthi" />
423     <field ref="icethic_cea"  name="iicethic" />
424     <field ref="iceprod_cea"  name="iiceprod" />
425     <field ref="ist_ipa"      name="iicetemp" />
426     <field ref="ioceflxb"     name="ioceflxb" />
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431     <field ref="qsr_io_cea"   name="iicesflx" />
432     <field ref="qns_io_cea"   name="iicenflx" />
433     <field ref="snowpre"      name="isnowpre" />
434   </file>
435
436        <!-- variables available with key_float, instantaneous fields -->
437        <file id="floats"  description="floats variables">
438            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="432000" />
439            <field ref="traj_lat"   name="floats_latitude"    freq_op="432000" />
440            <field ref="traj_dep"   name="floats_depth"       freq_op="432000" />
441            <field ref="traj_temp"  name="floats_temperature" freq_op="432000" />
442            <field ref="traj_salt"  name="floats_salinity"    freq_op="432000" />
443            <field ref="traj_dens"  name="floats_density"     freq_op="432000" />
444            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="432000" />
445        </file>
446
447       <file id="5d_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" >
448          <field ref="Cflx"     />
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453       </file>
454
455      </group>
456     
457      <group id="1m" output_freq="-1"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files -->
458
459   <file id="1m_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
460     <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
461   </file>   
462
463        <file id="1m_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" >
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468          <field ref="DCHL"     />
469          <field ref="DOC"      />
470          <field ref="Fer"      />
471          <field ref="NO3"      />
472       </file>
473   
474      </group>
475
476      <group id="2m" output_freq="-2"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2m files -->
477      </group>
478
479      <group id="3m" output_freq="-3"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 3m files -->
480      </group>
481
482      <group id="4m" output_freq="-4"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 4m files -->
483      </group>
484
485      <group id="6m" output_freq="-6"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 6m files -->
486      </group>
487
488      <group id="1y" output_freq="-12"    output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real yearly files -->
489
490        <file id="1y_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
491          <field ref="mldr10_1"     name="sobowlin"  operation="t_max(X)" />
492        </file>
493
494        <file id="1y_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" >
495          <field ref="DIC"      />
496          <field ref="Alkalini" />
497          <field ref="O2"       />
498          <field ref="CaCO3"    />
499          <field ref="PO4"      />
500          <field ref="POC"      />
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507          <field ref="DSi"      />
508          <field ref="Fer"      />
509          <field ref="BFe"      />
510          <field ref="GOC"      />
511          <field ref="SFe"      />
512          <field ref="DFe"      />
513          <field ref="GSi"      />
514          <field ref="NFe"      />
515          <field ref="NCHL"     />
516          <field ref="DCHL"     />
517          <field ref="NO3"      />
518          <field ref="NH4"      />
519       </file>
520
521       <file id="1y_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" >
522          <field ref="PH"       />
523          <field ref="CO3"      />
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544          <field ref="Kg"       />
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568          <field ref="Sdenit"      />
569          <field ref="Totlig" />
570       </file>
571
572      </group>
573
574      <group id="2y"  output_freq="-24"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2y files -->
575      </group>
576
577      <group id="5y"  output_freq="-60"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 5y files -->
578      </group>
579
580      <group id="10y" output_freq="-120"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 10y files -->
581      </group>
582
583    </file_definition>
584   
585    <!--
586============================================================================================================
587=                                           grid definition                                                =
588=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
589============================================================================================================
590    -->
591   
592    <axis_definition> 
593      <axis id="deptht" description="Vertical T levels" unit="m" positive=".false." />
594      <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" positive=".false." />
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597      <axis id="nfloat" description="Number of float"   unit="no unit" positive=".false." />
598      <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" />
599    </axis_definition> 
600   
601    <grid_definition>
602      <grid id="grid_T" description="grid T" >
603    <!--   Eq section   -->
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614      <!--   156e   -->
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Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.