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iodef.xml in branches/2012/dev_NOC_2012_rev3555/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00 – NEMO

source: branches/2012/dev_NOC_2012_rev3555/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/iodef.xml @ 3631

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Branch dev_NOC_2012_r3555. #1006. Step 8. Minor code changes and updated iodef.xml files to enable successful SETTE testing
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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation>
3 
4  <context id="nemo"> 
5   
6    <!-- $id$ -->
7
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14   
15    <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined -->
16
17      <!-- T grid -->
18     
19      <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
20   <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   />
21         <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   />
22   <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     />
23   <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    />
24   <field id="sstgrad"      description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   />
25   <field id="sstgrad2"     description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 />
26   <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      />
27   <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     />
28   <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        />
29   <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       />
30   <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        />
31   <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        />
32         <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  />
33   <!-- next variables available with key_diahth -->
34   <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        />
35   <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        />
36   <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        />
37   <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        />
38   <field id="mld_dt02"     description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        />
39   <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        />
40   <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        />
41   <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        />
42   <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     />
43   <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        />
44        <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        />
45   <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        />
46   <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        />
47   <!-- variables available with key_diaar5 -->
48   <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     />
49   <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  />
50     </group>
51
52      <!-- SBC -->
53     
54      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
55
56   <field id="empmr"        description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  />
57   <field id="saltflx"      description="Downward salt flux"                                          unit="PSU/m2/s"  />
58   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  />
59   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  />
60
61   <field id="qt"           description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     />
62   <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     />
63   <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     />
64   <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     />
65   <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     />
66   <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  />
67   <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     />
68   <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      />
69   
70        <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn -->
71        <field id="ssh_ib"       description="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        />
72
73   <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core -->
74   <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     />
75   <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
76   <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
77   <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     />
78        <field id="qhc_oce"      description="Downward Heat Content of E-P over open ocean"                 unit="W/m2"     />
79   <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     />
80
81   <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        />
82
83   <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     />
84   <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
85   <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
86   <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     />
87   
88   <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
89   <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
90   
91   <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        />
92   <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        />
93   <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      />
94   
95   <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        />
96   <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     />
97   <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />     
98   <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
99   <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
100   
101   <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
102   <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
103   
104   <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     />
105   <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     />
106
107        <!-- available if not defined key_vvl -->
108        <field id="emp_x_sst"      description="Concentration/Dilution term on SST"                         unit="kgC/m2/s" />
109        <field id="emp_x_sss"      description="Concentration/Dilution term on SSS"                       unit="kgPSU/m2/s" />
110   <!-- available key_coupled -->
111   <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
112   <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  />
113   <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
114   <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        />
115   <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  />
116   <!-- available if key_coupled + conservative method -->
117   <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  />
118   <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  />
119   <!-- variables available with key_diaar5 -->
120   <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  />
121   <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  />
122   <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  />
123   <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     />
124   <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     />
125   <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     />
126   <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     />
127   <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     />
128   <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     />
129   <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  />
130   <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  />
131   <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  />
132   <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  />
133   <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  />
134
135      </group>
136
137      <!-- U grid -->
138     
139      <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U">
140   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
141   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  />
142   <field id="uocetr_eff"   description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                  />
143   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
144   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  />
145   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
146   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  />
147   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
148   <!-- variables available with key_diaar5 -->
149   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 />
150   <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
151   <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
152   <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
153     </group>
154     
155      <!-- V grid -->
156     
157      <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V">
158   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
159   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  />
160   <field id="vocetr_eff"   description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                  />
161   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
162   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  />
163   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
164   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  />
165   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
166   <!-- variables available with key_diaar5 -->
167   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 />
168   <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
169   <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
170   <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
171      </group>
172     
173      <!-- W grid -->
174     
175      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
176   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  />
177   <field id="wocetr_eff"   description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 />
178   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
179   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  />
180   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
181   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 />
182   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 />
183   <!-- avs: available with key_zdfddm -->
184   <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 />
185   <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd -->
186   <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 />
187   <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 />
188   <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d -->
189   <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" />
190   <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" />
191   <!-- avt_tide: available with key_zdftmx -->
192   <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 />
193   <!-- variables available with key_diaar5 -->   
194   <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 />
195   <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               />
196      </group>
197         
198      <!-- scalar -->
199     
200      <!-- variables available with key_diaar5 -->
201      <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" >
202   <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   />
203   <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    />
204   <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    />
205   <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    />
206   <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   />
207   <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" />
208   <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  />
209   <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" />
210      </group>
211
212      <!-- variables available with key_float -->
213      <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point">
214        <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" />
215        <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   />
216        <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     />
217        <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  />
218        <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   />
219        <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" />
220        <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  />
221      </group>
222
223
224      <!-- ptrc on T grid -->
225
226     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">
227       <field id="DET"      description="Detritus"                                      unit="mmole-N/m3" />
228       <field id="ZOO"      description="Zooplankton Concentration"                     unit="mmole-N/m3" />
229       <field id="PHY"      description="Phytoplankton Concentration"                   unit="mmole-N/m3" />
230       <field id="NO3"      description="Nitrate Concentration"                         unit="mmole-N/m3" />
231       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                        unit="mmole-N/m3" />
232       <field id="DOM"      description="Dissolved Organic Matter"                      unit="mmole-N/m3" />
233     </group>
234
235     <!-- diad on T grid -->
236
237     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
238       <field id="FNO3PHY"  description="FNO3PHY"                             unit="-"  axis_ref="deptht" /> 
239       <field id="FNH4PHY"  description="FNH4PHY"                             unit="-"  axis_ref="deptht" /> 
240       <field id="FNH4NO3"  description="FNH4NO3"                             unit="-"  axis_ref="deptht" /> 
241       <field id="TNO3PHY"  description="TNO3PHY"                             unit="-"  /> 
242       <field id="TNH4PHY"  description="TNH4PHY"                             unit="-"  /> 
243       <field id="TPHYDOM"  description="TPHYDOM"                             unit="-"  /> 
244       <field id="TPHYNH4"  description="TPHYNH4"                             unit="-"  /> 
245       <field id="TPHYZOO"  description="TPHYZOO"                             unit="-"  /> 
246       <field id="TPHYDET"  description="TPHYDET"                             unit="-"  /> 
247       <field id="TDETZOO"  description="TDETZOO"                             unit="-"  /> 
248       <field id="TDETSED"  description="TDETSED"                             unit="-"  /> 
249       <field id="TZOODET"  description="TZOODET"                             unit="-"  /> 
250       <field id="TZOOBOD"  description="TZOOBOD"                             unit="-"  /> 
251       <field id="TZOONH4"  description="TZOONH4"                             unit="-"  /> 
252       <field id="TZOODOM"  description="TZOODOM"                             unit="-"  /> 
253       <field id="TNH4NO3"  description="TNH4NO3"                             unit="-"  /> 
254       <field id="TDOMNH4"  description="TDOMNH4"                             unit="-"  /> 
255       <field id="TDETNH4"  description="TDETNH4"                             unit="-"  /> 
256       <field id="TPHYTOT"  description="TPHYTOT"                             unit="-"  /> 
257       <field id="TZOOTOT"  description="TZOOTOT"                             unit="-"  /> 
258       <field id="TDETDOM"  description="TDETDOM"                             unit="-"  /> 
259       <field id="SEDPOC"   description="SEDPOC"                              unit="-"  /> 
260     </group>
261
262  </field_definition>
263
264    <!--
265============================================================================================================
266=                                           output files definition                                        =
267=                                            Define your own files                                         =
268=                                         put the variables you want...                                    =
269============================================================================================================
270    -->
271
272  <file_definition output_level="10" enabled=".TRUE.">
273
274
275      <group id="1h" output_freq="3600"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1h files -->
276      </group>
277
278      <group id="2h" output_freq="7200"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2h files -->
279      </group>
280
281      <group id="3h" output_freq="10800"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3h files -->
282      </group>
283
284      <group id="4h" output_freq="14400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 4h files -->
285      </group>
286
287      <group id="6h" output_freq="21600"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 6h files -->
288      </group>
289
290      <group id="1d" output_freq="86400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files -->
291      </group>
292
293      <group id="2d" output_freq="172800" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2d files -->
294      </group>
295
296      <group id="5d" output_freq="432000" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 5d files -->
297
298        <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
299          <field ref="toce"         name="votemper"  />
300          <field ref="soce"         name="vosaline"  />
301          <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
302          <field ref="sss"          name="sosaline"  />
303          <field ref="ssh"          name="sossheig"  />
304          <field ref="empmr"        name="sowaflup"  />
305          <field ref="qsr"          name="soshfldo"  />
306          <field ref="saltflx"      name="sosfldow"  />
307          <field ref="qt"           name="sohefldo"  />
308          <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  />
309          <field ref="mldkz5"       name="somixhgt"  />
310          <field ref="wspd"         name="sowindsp"  />
311          <field ref="qrp"          name="sohefldp"  />
312          <field ref="erp"          name="sowafldp"  />
313          <field ref="mldr10_1"     name="sobowlin"  operation="t_max(X)" />
314          <field ref="mlddzt"       name="sothedep"  />
315          <field ref="20d"          name="so20chgt"  />
316          <field ref="28d"          name="so28chgt"  />
317          <field ref="hc300"        name="sohtc300"  />
318        </file>
319
320        <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" >
321          <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  />
322          <field ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  />
323          <field ref="utau"         name="sozotaux"  />
324        </file>
325
326        <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" >
327          <field ref="voce"         name="vomecrty"  />
328          <field ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  />
329          <field ref="vtau"         name="sometauy"  />
330        </file>
331
332        <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" >
333          <field ref="woce"         name="vovecrtz" />
334          <field ref="woce_eiv"     name="voveeivw" />
335          <field ref="avt"          name="votkeavt" />
336          <field ref="avt_evd"      name="votkeevd" />
337          <field ref="avm"          name="votkeavm" />
338          <field ref="avm_evd"      name="votkeevm" />
339          <field ref="avs"          name="voddmavs" />
340          <field ref="aht2d"        name="soleahtw" />
341          <field ref="aht2d_eiv"    name="soleaeiw" />
342        </file>
343 
344       <!-- variables available with key_float, instantaneous fields -->
345        <file id="floats"  description="floats variables">
346            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="432000" />
347            <field ref="traj_lat"   name="floats_latitude"    freq_op="432000" />
348            <field ref="traj_dep"   name="floats_depth"       freq_op="432000" />
349            <field ref="traj_temp"  name="floats_temperature" freq_op="432000" />
350            <field ref="traj_salt"  name="floats_salinity"    freq_op="432000" />
351            <field ref="traj_dens"  name="floats_density"     freq_op="432000" />
352            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="432000" />
353        </file>
354
355       <file id="5d_ptrc_T" name="auto" description="lobster sms variables" >
356         <field ref="DET"      />
357         <field ref="ZOO"      />
358         <field ref="PHY"      />
359         <field ref="NO3"      />
360         <field ref="NH4"      />
361         <field ref="DOM"      />
362       </file>
363
364       <file id="5d_diad_T" name="auto" description="additional lobster diagnostics" > 
365         <field ref="FNO3PHY"   /> 
366         <field ref="FNH4PHY"   /> 
367         <field ref="FNH4NO3"   /> 
368         <field ref="TNO3PHY"   /> 
369         <field ref="TNH4PHY"   /> 
370         <field ref="TPHYDOM"   /> 
371         <field ref="TPHYNH4"   /> 
372         <field ref="TPHYZOO"   /> 
373         <field ref="TPHYDET"   /> 
374         <field ref="TDETZOO"   /> 
375         <field ref="TDETSED"   /> 
376         <field ref="TZOODET"   /> 
377         <field ref="TZOOBOD"   /> 
378         <field ref="TZOONH4"   /> 
379         <field ref="TZOODOM"   /> 
380         <field ref="TNH4NO3"   /> 
381         <field ref="TDOMNH4"   /> 
382         <field ref="TDETNH4"   /> 
383         <field ref="TPHYTOT"   /> 
384         <field ref="TZOOTOT"   /> 
385         <field ref="TDETDOM"   /> 
386         <field ref="SEDPOC"    /> 
387       </file>
388
389      </group>
390
391      <group id="1m" output_freq="-1"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files -->
392      </group>
393
394      <group id="2m" output_freq="-2"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2m files -->
395      </group>
396
397      <group id="3m" output_freq="-3"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 3m files -->
398      </group>
399
400      <group id="4m" output_freq="-4"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 4m files -->
401      </group>
402
403      <group id="6m" output_freq="-6"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 6m files -->
404      </group>
405
406      <group id="1y" output_freq="-12"    output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real yearly files -->
407      </group>
408
409      <group id="2y"  output_freq="-24"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2y files -->
410      </group>
411
412      <group id="5y"  output_freq="-60"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 5y files -->
413      </group>
414
415      <group id="10y" output_freq="-120"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 10y files -->
416      </group>
417
418 
419  </file_definition>
420
421    <!--
422============================================================================================================
423=                                           grid definition                                                =
424=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
425============================================================================================================
426    -->
427
428  <axis_definition> 
429     <axis id="deptht" description="Vertical T levels" unit="m" positive=".false." />
430     <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" positive=".false." />
431     <axis id="depthv" description="Vertical V levels" unit="m" positive=".false." />
432     <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" positive=".false." />
433     <axis id="nfloat" description="Number of float"   unit="no unit" positive=".false." />
434     <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" />
435  </axis_definition> 
436
437  <grid_definition>
438    <grid id="grid_T" description="grid T" />
439    <grid id="grid_U" description="grid U" />
440    <grid id="grid_V" description="grid V" />
441    <grid id="grid_W" description="grid W" />
442    <grid id="scalarpoint" description="scalar" >
443      <zoom id="1point" ibegin="1" jbegin="1" ni="1" nj="1" />
444    </grid>
445  </grid_definition>   
446
447</context>
448
449</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.