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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iodef.xml in branches/2014/dev_r4650_UKMO3_masked_damping/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00 – NEMO

source: branches/2014/dev_r4650_UKMO3_masked_damping/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/iodef.xml @ 5086

Last change on this file since 5086 was 5086, checked in by timgraham, 9 years ago

Merged head of trunk into branch in preparation for putting code back onto the trunk
In working copy ran the command:
svn merge svn+sshtimgraham@…/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk

Also recompiled NEMO_book.pdf with merged input files

File size: 18.5 KB
Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22   
23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
24   
25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
26
27      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
28
29      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
30
31      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
32
33      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
34
35      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->     
36
37      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE." > <!-- 1d files -->
38
39   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
40     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       />
41     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          />
42     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                />
43     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               />
44     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            />
45     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             />
46     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      />
47     <field field_ref="mldkz5"       />
48     <field field_ref="mldr10_1"     />
49      <field field_ref="heatc"        name="heatc"    long_name="Heat content vertically integrated"            />
50      <field field_ref="saltc"        name="saltc"    long_name="Salt content vertically integrated"            />
51   </file>
52
53   <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
54     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     />
55     <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  long_name="downward shortwave flux at ocean surface"           />
56     <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  long_name="downward non solar flux at ocean surface"           />
57     <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   long_name="downward total flux at ocean surface"           />
58     <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  long_name="downward shortwave flux at ice surface"           />
59     <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  long_name="downward non solar flux at ice surface"           />
60     <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  long_name="shortwave flux transmitted thru the ice"           />
61     <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   long_name="downward total flux at ice surface"           />
62     <field field_ref="saltflx"      name="sfx"  />
63     <field field_ref="taum"         name="taum" />
64     <field field_ref="wspd"         name="windsp"  />
65      <field field_ref="precip"       name="precip" />
66     <!-- ice and snow -->
67     <field field_ref="snowpre"      />
68      <field field_ref="utau_ice"         name="utau_ice" />
69      <field field_ref="vtau_ice"         name="vtau_ice" />
70
71   </file>
72
73   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
74     <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    />
75     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      />
76     <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" />
77          <!-- available with key_diaar5 -->
78     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr"  />
79     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr"  />
80      <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr"  />
81   </file>
82   
83   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
84     <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    />
85     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      />
86     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" />
87          <!-- available with key_diaar5 -->
88     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr"  />
89     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr"  />
90      <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr"  />
91   </file>
92   
93   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
94     <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         />
95     <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" />
96     <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr"  />
97   </file>
98
99   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." >
100     <field field_ref="snowthic_cea"     name="snthic"     long_name="surface_snow_thickness"   />
101     <field field_ref="icethic_cea"      name="sithic"     long_name="sea_ice_thickness"        />
102          <field field_ref="icevolu"          name="sivolu" />
103          <field field_ref="snowvol"          name="snvolu" />
104          <field field_ref="iceconc"          name="siconc"  />
105
106          <field field_ref="vfxbog"          name="vfxbog" />
107          <field field_ref="vfxdyn"          name="vfxdyn" />
108          <field field_ref="vfxopw"          name="vfxopw" />
109          <field field_ref="vfxsni"          name="vfxsni" />
110          <field field_ref="vfxsum"          name="vfxsum" />
111          <field field_ref="vfxbom"          name="vfxbom" />
112          <field field_ref="vfxres"          name="vfxres" />
113          <field field_ref="vfxice"          name="vfxice" />
114          <field field_ref="vfxsnw"          name="vfxsnw" />
115          <field field_ref="vfxsub"          name="vfxsub" />
116          <field field_ref="vfxspr"          name="vfxspr" />
117
118          <field field_ref="icetrp"          name="sivtrp" />
119          <field field_ref="snwtrp"          name="snvtrp" />
120          <field field_ref="deitrp"          name="deitrp" />
121          <field field_ref="destrp"          name="destrp" />
122
123          <field field_ref="sfxbri"           name="sfxbri" />
124          <field field_ref="sfxdyn"           name="sfxdyn" />
125          <field field_ref="sfxres"           name="sfxres" />
126          <field field_ref="sfxbog"           name="sfxbog" />
127          <field field_ref="sfxbom"           name="sfxbom" />
128          <field field_ref="sfxsum"           name="sfxsum" />
129          <field field_ref="sfxsni"           name="sfxsni" />
130          <field field_ref="sfxopw"           name="sfxopw" />
131          <field field_ref="sfx"              name="sfx" />
132
133          <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"    />
134          <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"    />
135          <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"    />
136          <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"    />
137          <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"    />
138          <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"    />
139          <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"    />
140          <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"    />
141          <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"    />
142          <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem"    />
143
144     <!-- ice-ocean heat flux from mass exchange -->
145          <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn"    />
146          <field field_ref="hfxres"          name="hfxres"    />
147          <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd"    />
148     <!-- ice-atm. heat flux from mass exchange -->
149          <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub"    />
150          <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr"    />
151
152     <!-- diags -->
153          <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc"    />
154          <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur"    />
155
156          <field field_ref="isst"             name="sst" />
157          <field field_ref="isss"             name="sss" />
158          <field field_ref="micesalt"         name="sisali" />
159          <field field_ref="micet"            name="sitemp" />
160          <field field_ref="icest"            name="sistem" />
161          <field field_ref="icehc"            name="siheco" />
162          <field field_ref="isnowhc"          name="snheco" />
163          <field field_ref="miceage"          name="siages" />
164
165          <field field_ref="uice_ipa"         name="sivelu" />
166          <field field_ref="vice_ipa"         name="sivelv" />
167          <field field_ref="icevel"           name="sivelo" />
168          <field field_ref="idive"            name="sidive" />
169          <field field_ref="ishear"           name="sishea" />
170          <field field_ref="icestr"           name="sistre" />
171
172          <field field_ref="ibrinv"           name="sibrin" />
173          <field field_ref="icecolf"          name="sicolf" />
174
175          <field field_ref="iceage_cat"       name="siagecat"/>
176          <field field_ref="iceconc_cat"      name="siconcat"/>
177          <field field_ref="icethic_cat"      name="sithicat"/>
178          <field field_ref="snowthic_cat"     name="snthicat"/>
179          <field field_ref="salinity_cat"     name="salincat"/>
180          <field field_ref="brinevol_cat"     name="sibricat"/>
181
182   </file>
183
184        <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." >
185          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"  />
186          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"  />
187          <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"  />
188          <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"  />
189          <field field_ref="masstot"      name="scmastot"  />
190          <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"  />
191          <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"  />
192
193          <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"    />
194          <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"    />
195          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"    />
196          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"    />
197          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"    /> 
198          <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"    />
199          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"    />
200          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"    />
201          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"    />
202
203          <field field_ref="ibgvoltot"    name="ibgvoltot"   />
204          <field field_ref="sbgvoltot"    name="sbgvoltot"   />
205          <field field_ref="ibgarea"      name="ibgarea"     />
206          <field field_ref="ibgsaline"    name="ibgsaline"   />
207          <field field_ref="ibgtemper"    name="ibgtemper"   />
208          <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"   />
209          <field field_ref="sbgheatco"    name="sbgheatco"   />
210          <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"   />
211
212          <field field_ref="ibgvfx"       name="ibgvfx"      />
213          <field field_ref="ibgvfxbog"    name="ibgvfxbog"      />
214          <field field_ref="ibgvfxopw"    name="ibgvfxopw"      />
215          <field field_ref="ibgvfxsni"    name="ibgvfxsni"      />
216          <field field_ref="ibgvfxdyn"    name="ibgvfxdyn"      />
217          <field field_ref="ibgvfxbom"    name="ibgvfxbom"      />
218          <field field_ref="ibgvfxsum"    name="ibgvfxsum"      />
219          <field field_ref="ibgvfxres"    name="ibgvfxres"      />
220          <field field_ref="ibgvfxspr"    name="ibgvfxspr"      />
221          <field field_ref="ibgvfxsnw"    name="ibgvfxsnw"      />
222          <field field_ref="ibgvfxsub"    name="ibgvfxsub"      />
223
224          <field field_ref="ibgsfx"       name="ibgsfx"     />
225          <field field_ref="ibgsfxbri"    name="ibgsfxbri"    />
226          <field field_ref="ibgsfxdyn"    name="ibgsfxdyn" />
227          <field field_ref="ibgsfxres"    name="ibgsfxres" />
228          <field field_ref="ibgsfxbog"    name="ibgsfxbog"      />
229          <field field_ref="ibgsfxopw"    name="ibgsfxopw"      />
230          <field field_ref="ibgsfxsni"    name="ibgsfxsni"      />
231          <field field_ref="ibgsfxbom"    name="ibgsfxbom"      />
232          <field field_ref="ibgsfxsum"    name="ibgsfxsum"      />
233
234          <field field_ref="ibghfxdhc"    name="ibghfxdhc"    />
235          <field field_ref="ibghfxspr"    name="ibghfxspr"    />
236
237          <field field_ref="ibghfxres"    name="ibghfxres"    />
238          <field field_ref="ibghfxsub"    name="ibghfxsub"    />
239          <field field_ref="ibghfxdyn"    name="ibghfxdyn"    />
240          <field field_ref="ibghfxthd"    name="ibghfxthd"    />
241          <field field_ref="ibghfxsum"    name="ibghfxsum"    />
242          <field field_ref="ibghfxbom"    name="ibghfxbom"    />
243          <field field_ref="ibghfxbog"    name="ibghfxbog"    />
244          <field field_ref="ibghfxdif"    name="ibghfxdif"    />
245          <field field_ref="ibghfxopw"    name="ibghfxopw"    />
246          <field field_ref="ibghfxout"    name="ibghfxout"    />
247          <field field_ref="ibghfxin"    name="ibghfxin"    />
248          <field field_ref="ibghfxsnw"    name="ibghfxsnw"    />
249
250          <field field_ref="ibgfrcvol"    name="ibgfrcvol"   />
251          <field field_ref="ibgfrcsfx"    name="ibgfrcsfx"  />
252          <field field_ref="ibgvolgrm"    name="ibgvolgrm"    />
253
254        </file>
255
256   <!--
257   <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" >
258     <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       />
259     <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  />
260     <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       />
261     <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  />
262     <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       />
263     <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  />
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287    <!--
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289= grid definition = = DO NOT CHANGE =
290============================================================================================================
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293   <axis_definition> 
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301   </axis_definition> 
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303   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
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306     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
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308     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
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317
318  <context id="xios">
319
320      <variable_definition>
321   
322     <!--
323        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
324-->
325     <variable id="buffer_size"               type="integer">5000000</variable>
326     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
327     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
328     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
329     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
330     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
331   
332      </variable_definition>
333               
334  </context>
335 
336</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.