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iodef.xml in branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00 – NEMO

source: branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/iodef.xml @ 6963

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diagnostics for conservation checks, see ticket #1777

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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22   
23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
24   
25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
26
27      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
28
29      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
30
31      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
32
33      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
34
35      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->     
36
37      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files -->
38     
39      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->
40     
41      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
42   
43   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
44     <field field_ref="e3t"      />
45     <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field>
46     <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field>
47     <field field_ref="sst"          name="tos"   />
48     <field field_ref="sss"          name="sos"   />
49     <field field_ref="ssh"          name="zos"   />
50     <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field>
51     <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field>
52     <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field>
53     <field field_ref="mldkz5"   />
54     <field field_ref="mldr10_1" />
55     <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field>
56     <field field_ref="sbt"      />
57     <field field_ref="heatc"        name="heatc" />
58     <field field_ref="saltc"        name="saltc" />
59   </file>
60
61   <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
62     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      />
63          <field field_ref="emp_oce"      name="emp_oce"  long_name="Evap minus Precip over ocean"              />
64          <field field_ref="emp_ice"      name="emp_ice"  long_name="Evap minus Precip over ice"                />
65     <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  />
66     <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  />
67     <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   />
68     <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  />
69     <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  />
70     <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  />
71     <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   />
72     <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      />
73     <field field_ref="taum"         name="taum"     />
74     <field field_ref="wspd"         name="windsp"   />
75     <field field_ref="precip"       name="precip"   />
76     <!-- ice and snow -->
77     <field field_ref="snowpre" />
78     <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" />
79     <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" />
80   </file>
81
82   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
83     <field field_ref="e3u" />
84     <field field_ref="ssu"          name="uos"      />
85     <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field>
86     <field field_ref="utau"         name="tauuo"    />
87          <!-- available with key_diaar5 -->
88     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" />
89     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" />
90     <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" />
91   </file>
92   
93   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
94     <field field_ref="e3v" />
95     <field field_ref="ssv"          name="vos"      />
96     <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field>
97     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    />
98          <!-- available with key_diaar5 -->
99     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" />
100     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" />
101     <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" />
102   </file>
103   
104   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
105     <field field_ref="e3w" />
106     <field field_ref="woce"         name="wo"       />
107     <field field_ref="avt"          name="difvho"   />
108     <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" />
109   </file>
110
111   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." >
112          <field field_ref="snowthic_cea"    name="snthic" />
113          <field field_ref="icethic_cea"     name="sithic" />
114          <field field_ref="icevolu"         name="sivolu" />
115          <field field_ref="snowvol"         name="snvolu" />
116          <field field_ref="iceconc"         name="siconc" />
117
118          <field field_ref="vfxice"          name="vfxice" />
119          <field field_ref="vfxsnw"          name="vfxsnw" />
120          <field field_ref="vfxsub"          name="vfxsub" />
121          <field field_ref="vfxsub_err"      name="vfxsub_err" />
122          <field field_ref="vfxspr"          name="vfxspr" />
123
124          <field field_ref="icetrp"          name="sivtrp" />
125          <field field_ref="snwtrp"          name="snvtrp" />
126          <field field_ref="saltrp"          name="saltrp" />
127          <field field_ref="deitrp"          name="deitrp" />
128          <field field_ref="destrp"          name="destrp" />
129
130          <field field_ref="sfx"             name="sfx"    />
131
132          <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"     />
133          <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"      />
134
135
136     <!-- diags -->
137          <field field_ref="isst"            name="sst"    />
138          <field field_ref="isss"            name="sss"    />
139          <field field_ref="micesalt"        name="sisali" />
140          <field field_ref="micet"           name="sitemp" />
141          <field field_ref="icest"           name="sistem" />
142          <field field_ref="icehc"           name="siheco" />
143          <field field_ref="isnowhc"         name="snheco" />
144          <field field_ref="miceage"         name="siages" />
145
146          <field field_ref="uice_ipa"        name="sivelu" />
147          <field field_ref="vice_ipa"        name="sivelv" />
148          <field field_ref="icevel"          name="sivelo" />
149          <field field_ref="idive"           name="sidive" />
150          <field field_ref="ishear"          name="sishea" />
151          <field field_ref="icestr"          name="sistre" />
152
153          <field field_ref="ibrinv"          name="sibrin" />
154          <field field_ref="icecolf"         name="sicolf" />
155
156          <field field_ref="iceage_cat"      name="siagecat" />
157          <field field_ref="iceconc_cat"     name="siconcat" />
158          <field field_ref="icethic_cat"     name="sithicat" />
159          <field field_ref="snowthic_cat"    name="snthicat" />
160          <field field_ref="salinity_cat"    name="salincat" />
161          <field field_ref="brinevol_cat"    name="sibricat" />
162     <field field_ref="icetemp_cat"     name="sitemcat" />
163     <field field_ref="snwtemp_cat"     name="sntemcat" />
164
165   </file>
166
167        <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." >
168          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   />
169          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   />
170          <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"   />
171          <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"   />
172          <field field_ref="masstot"      name="scmastot"   />
173          <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"   />
174          <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"   />
175
176          <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"   />
177          <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   />
178          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   />
179          <field field_ref="bgheatfx"     name="bgheatfx"   />
180          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   />
181          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   /> 
182          <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   />
183          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   />
184          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   />
185          <field field_ref="bgfrchfx"     name="bgfrchfx"   />
186          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   />
187
188     <field field_ref="ibgvol_tot"   name="ibgvol_tot"  />
189     <field field_ref="sbgvol_tot"   name="sbgvol_tot"  />
190     <field field_ref="ibgarea_tot"  name="ibgarea_tot" />
191     <field field_ref="ibgsalt_tot"  name="ibgsalt_tot" />
192     <field field_ref="ibgheat_tot"  name="ibgheat_tot" />
193     <field field_ref="sbgheat_tot"  name="sbgheat_tot" />
194     
195     <field field_ref="ibgvolume"    name="ibgvolume"   />
196     <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"   />
197     <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"   />
198          <field field_ref="ibgheatfx"    name="ibgheatfx"   />
199     
200     <field field_ref="ibgfrcvoltop" name="ibgfrcvoltop" />
201     <field field_ref="ibgfrcvolbot" name="ibgfrcvolbot" />
202     <field field_ref="ibgfrctemtop" name="ibgfrctemtop" />
203     <field field_ref="ibgfrctembot" name="ibgfrctembot" />
204     <field field_ref="ibgfrcsal"    name="ibgfrcsal"    />
205          <field field_ref="ibgfrchfxtop" name="ibgfrchfxtop" />
206          <field field_ref="ibgfrchfxbot" name="ibgfrchfxbot" />
207
208        </file>
209
210   <!--
211   <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" >
212     <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       />
213     <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  />
214     <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       />
215     <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  />
216     <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       />
217     <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  />
218   </file>
219   -->
220
221      </file_group>
222
223      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files -->
224      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
225      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
226      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
227      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
228
229      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files -->
230      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
231      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
232      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
233
234   </file_definition>
235   
236    <!--
237============================================================================================================
238= grid definition = = DO NOT CHANGE =
239============================================================================================================
240    -->
241   
242   <axis_definition> 
243      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" />
244      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" />
245      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" />
246      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" />
247      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 />
248      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 />
249      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 />
250      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              />
251      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              />
252   </axis_definition> 
253   
254   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
255   
256   <grid_definition>   
257     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
258     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
259     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
260     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
261     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
262     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
263     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
264     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
265     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/>
266     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/>
267     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/>
268    </grid_definition>   
269  </context>
270 
271
272  <context id="xios">
273
274      <variable_definition>
275   
276     <!--
277        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
278-->
279     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable>
280     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
281     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
282     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
283     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
284     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
285   
286      </variable_definition>
287               
288  </context>
289 
290</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.