New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
file_def_nemo-opa.xml in branches/2017/dev_r7881_ENHANCE09_RK3/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3_PISCES/EXP00 – NEMO

source: branches/2017/dev_r7881_ENHANCE09_RK3/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3_PISCES/EXP00/file_def_nemo-opa.xml @ 8720

Last change on this file since 8720 was 8720, checked in by clem, 6 years ago

add xml files
  • Property svn:executable set to *
File size: 12.0 KB
Line 
1<?xml version="1.0"?>
2
3<!--
4============================================================================================================
5=                                           output files definition                                        =
6=                                            Define your own filesfor ocean dynamics context               =
7=                                         put the variables you want...                                    =
8============================================================================================================
9    -->
10   
11    <file_definition type="one_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1mo" min_digits="4">
12   
13      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
14        <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
15          <field field_ref="e3t"      />
16          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field>
17          <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field>
18          <field field_ref="sst"          name="tos"   />
19          <field field_ref="sss"          name="sos"   />
20          <field field_ref="ssh"          name="zos"   />
21          <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field>
22          <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field>
23          <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field>
24          <field field_ref="mldkz5"   />
25          <field field_ref="mldr10_1" />
26          <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field>
27          <field field_ref="sbt"      />
28          <field field_ref="heatc"        name="heatc" />
29          <field field_ref="saltc"        name="saltc" />
30        </file>
31
32   <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
33     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      />
34     <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  />
35     <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  />
36     <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   />
37     <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  />
38     <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  />
39     <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  />
40     <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   />
41     <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      />
42     <field field_ref="taum"         name="taum"     />
43     <field field_ref="wspd"         name="windsp"   />
44     <field field_ref="precip"       name="precip"   />
45     <!-- ice and snow -->
46     <field field_ref="snowpre" />
47     <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" />
48     <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" />
49   </file>
50
51   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
52     <field field_ref="e3u" />
53     <field field_ref="ssu"          name="uos"      />
54     <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field>
55     <field field_ref="utau"         name="tauuo"    />
56          <field field_ref="uocetr_eff"   name="uocetr_eff"  />
57          <!-- available with diaar5 -->
58     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" />
59     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" />
60     <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" />
61   </file>
62   
63   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
64     <field field_ref="e3v" />
65     <field field_ref="ssv"          name="vos"      />
66     <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field>
67     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    />
68          <field field_ref="vocetr_eff"   name="vocetr_eff"  />
69          <!-- available with diaar5 -->
70     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" />
71     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" />
72          <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" />
73   </file>
74   
75   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
76     <field field_ref="e3w" />
77     <field field_ref="woce"         name="wo"       />
78     <field field_ref="avt"          name="difvho"   />
79     <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" />
80         <!-- variables available with ln_zdfiwm =T -->
81          <field field_ref="av_wave"      name="av_wave"    />
82          <field field_ref="bn2"          name="bn2"        />
83          <field field_ref="bflx_iwm"     name="bflx_iwm"   />
84          <field field_ref="pcmap_iwm"    name="pcmap_iwm"  />
85          <field field_ref="emix_iwm"     name="emix_iwm"   />
86          <field field_ref="av_ratio"     name="av_ratio"   />
87   </file>
88
89        <file id="file6" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." >
90          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   />
91          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   />
92          <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"   />
93          <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"   />
94          <field field_ref="masstot"      name="scmastot"   />
95          <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"   />
96          <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"   />
97
98          <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"   />
99          <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   />
100          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   />
101          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   />
102          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />
103          <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   />
104          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   />
105          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   />
106          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   />
107        </file>
108
109        <file id="file7" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" >
110          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
111          <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
112          <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
113          <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field>
114          <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
115          <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
116          <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field>
117          <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field>
118          <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field>
119          <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field>
120          <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field>
121        </file>
122
123      </file_group> 
124
125
126      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files -->
127
128        <file id="file8" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
129          <field field_ref="DIC"      />
130          <field field_ref="Alkalini" />
131          <field field_ref="O2"       />
132          <field field_ref="PO4"      />
133          <field field_ref="Si"       />
134          <field field_ref="Fer"      />
135          <field field_ref="NCHL"     />
136          <field field_ref="DCHL"     />
137          <field field_ref="NO3"      />
138        </file>
139
140        <file id="file9" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
141          <field field_ref="Cflx"     />
142          <field field_ref="Dpco2"    />
143        </file>
144
145      </file_group>
146
147      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files -->
148
149        <file id="file10" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
150          <field field_ref="DIC"      />
151          <field field_ref="Alkalini" />
152          <field field_ref="O2"       />
153          <field field_ref="CaCO3"    />
154          <field field_ref="PO4"      />
155          <field field_ref="POC"      />
156          <field field_ref="Si"       />
157          <field field_ref="PHY"      />
158          <field field_ref="ZOO"      />
159          <field field_ref="DOC"      />
160          <field field_ref="PHY2"     />
161          <field field_ref="ZOO2"     />
162          <field field_ref="DSi"      />
163          <field field_ref="Fer"      />
164          <field field_ref="BFe"      />
165          <field field_ref="GOC"      />
166          <field field_ref="SFe"      />
167          <field field_ref="DFe"      />
168          <field field_ref="GSi"      />
169          <field field_ref="NFe"      />
170          <field field_ref="NCHL"     />
171          <field field_ref="DCHL"     />
172          <field field_ref="NO3"      />
173          <field field_ref="NH4"      />
174        </file>
175
176        <file id="file11" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
177          <field field_ref="PH"       />
178          <field field_ref="PAR"      />
179          <field field_ref="PPPHYN"    />
180          <field field_ref="PPPHYD"   />
181          <field field_ref="PPPHYP"   />
182          <field field_ref="PPNEWN"   />
183          <field field_ref="PPNEWD"   />
184          <field field_ref="PPNEWP"   />
185          <field field_ref="PBSi"     />
186          <field field_ref="PFeN"     />
187          <field field_ref="PFeD"     />
188          <field field_ref="PCAL"     />
189          <field field_ref="DCAL"     />
190          <field field_ref="GRAZ1"    />
191          <field field_ref="GRAZ2"    />
192          <field field_ref="EPC100"   />
193          <field field_ref="EPFE100"  />
194          <field field_ref="EPSI100"  />
195          <field field_ref="EPCAL100" />
196          <field field_ref="Cflx"     />
197          <field field_ref="Dpco2"    />
198          <field field_ref="Heup"     />
199          <field field_ref="Nfix"     />
200        </file>
201     </file_group>
202   
203   
204     
205      <file_group id="1ts" output_freq="1ts" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
206      <file_group id="2h"  output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
207      <file_group id="3h"  output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
208      <file_group id="4h"  output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
209      <file_group id="6h"  output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->     
210      <file_group id="2m"  output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
211      <file_group id="3m"  output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
212      <file_group id="4m"  output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
213      <file_group id="6m"  output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
214      <file_group id="2y"  output_freq="2y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
215      <file_group id="5y"  output_freq="5y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
216      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
217
218   </file_definition>
219   
220
221
222
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.