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trcnam.F90 in branches/NERC/dev_r5518_GO6_CleanMedusa/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC – NEMO

source: branches/NERC/dev_r5518_GO6_CleanMedusa/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcnam.F90 @ 8344

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jpalm -- split trcbio_medusa and clean debug printing-flush in common TOP modules
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Line 
1MODULE trcnam
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE trcnam  ***
4   !! TOP :   Read and print options for the passive tracer run (namelist)
5   !!======================================================================
6   !! History :    -   !  1996-11  (M.A. Foujols, M. Levy)  original code
7   !!              -   !  1998-04  (M.A Foujols, L. Bopp) ahtrb0 for isopycnal mixing
8   !!              -   !  1999-10  (M.A. Foujols, M. Levy) separation of sms
9   !!              -   !  2000-07  (A. Estublier) add TVD and MUSCL : Tests on ndttrc
10   !!              -   !  2000-11  (M.A Foujols, E Kestenare) trcrat, ahtrc0 and aeivtr0
11   !!              -   !  2001-01 (E Kestenare) suppress ndttrc=1 for CEN2 and TVD schemes
12   !!             1.0  !  2005-03 (O. Aumont, A. El Moussaoui) F90
13   !!              -   !  2014-06  (A. Yool, J. Palmieri) adding MEDUSA-2
14   !!----------------------------------------------------------------------
15#if defined key_top
16   !!----------------------------------------------------------------------
17   !!   'key_top'                                                TOP models
18   !!----------------------------------------------------------------------
19   !!   trc_nam    :  Read and print options for the passive tracer run (namelist)
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   USE oce_trc           ! shared variables between ocean and passive tracers
22   USE trc               ! passive tracers common variables
23   USE trcnam_trp        ! Transport namelist
24   USE trcnam_pisces     ! PISCES namelist
25   USE trcnam_cfc        ! CFC SMS namelist
26   USE trcnam_c14b       ! C14 SMS namelist
27   USE trcnam_age        ! AGE SMS namelist
28   USE trcnam_my_trc     ! MY_TRC SMS namelist
29   USE trcnam_idtra      ! Idealise tracer namelist
30   USE trcnam_medusa     ! MEDUSA namelist
31   USE trd_oce       
32   USE trdtrc_oce
33   USE iom               ! I/O manager
34
35   IMPLICIT NONE
36   PRIVATE
37
38   PUBLIC trc_nam_run  ! called in trcini
39   PUBLIC trc_nam      ! called in trcini
40
41   !! * Substitutions
42#  include "top_substitute.h90"
43   !!----------------------------------------------------------------------
44   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
45   !! $Id$
46   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
47   !!----------------------------------------------------------------------
48
49CONTAINS
50
51
52   SUBROUTINE trc_nam
53      !!---------------------------------------------------------------------
54      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
55      !!
56      !! ** Purpose :   READ and PRINT options for the passive tracer run (namelist)
57      !!
58      !! ** Method  : - read passive tracer namelist
59      !!              - read namelist of each defined SMS model
60      !!                ( (PISCES, CFC, MY_TRC, MEDUSA, IDTRA, Age )
61      !!---------------------------------------------------------------------
62      INTEGER  ::   jn, jk                     ! dummy loop indice
63      !                                        !   Parameters of the run
64      IF( .NOT. lk_offline ) CALL trc_nam_run
65     
66      !                                        !  passive tracer informations
67      CALL trc_nam_trc
68     
69      !                                        !   Parameters of additional diagnostics
70      CALL trc_nam_dia
71
72      !                                        !   namelist of transport
73      CALL trc_nam_trp
74
75
76      IF( ln_rsttr )                      ln_trcdta = .FALSE.   ! restart : no need of clim data
77      !
78      IF( ln_trcdmp .OR. ln_trcdmp_clo )  ln_trcdta = .TRUE.   ! damping : need to have clim data
79      !
80      IF( .NOT.ln_trcdta ) THEN
81         ln_trc_ini(:) = .FALSE.
82      ENDIF
83
84     IF(lwp) THEN                   ! control print
85         WRITE(numout,*)
86         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc'
87         WRITE(numout,*) '   Read inputs data from file (y/n)             ln_trcdta     = ', ln_trcdta
88         WRITE(numout,*) '   Damping of passive tracer (y/n)              ln_trcdmp     = ', ln_trcdmp
89         WRITE(numout,*) '   Restoring of tracer on closed seas           ln_trcdmp_clo = ', ln_trcdmp_clo
90         WRITE(numout,*) ' '
91         DO jn = 1, jptra
92            WRITE(numout,*) '  tracer nb : ', jn, '    short name : ', ctrcnm(jn)
93         END DO
94         WRITE(numout,*) ' '
95      ENDIF
96
97      IF(lwp) THEN                   ! control print
98         IF( ln_rsttr ) THEN
99            WRITE(numout,*)
100            WRITE(numout,*) '  Read a restart file for passive tracer : ', TRIM( cn_trcrst_in )
101            WRITE(numout,*)
102         ENDIF
103         IF( ln_trcdta .AND. .NOT.ln_rsttr ) THEN
104            WRITE(numout,*)
105            WRITE(numout,*) '  Some of the passive tracers are initialised from climatologies '
106            WRITE(numout,*)
107         ENDIF
108         IF( .NOT.ln_trcdta ) THEN
109            WRITE(numout,*)
110            WRITE(numout,*) '  All the passive tracers are initialised with constant values '
111            WRITE(numout,*)
112         ENDIF
113      ENDIF
114
115# if defined key_debug_medusa
116       DO jk = 1, jpk
117          WRITE(numout,*) '  level number: ', jk, 'rdttrc: ',rdttrc(jk),'rdttra: ', rdttra(jk),'nn_dttrc: ', nn_dttrc
118       END DO
119      CALL flush(numout)
120# endif
121     
122      rdttrc(:) = rdttra(:) * FLOAT( nn_dttrc )   ! vertical profile of passive tracer time-step
123 
124      IF(lwp) THEN                   ! control print
125        WRITE(numout,*) 
126        WRITE(numout,*) '    Passive Tracer  time step    rdttrc  = ', rdttrc(1)
127        WRITE(numout,*) 
128      ENDIF
129
130
131#if defined key_trdmxl_trc || defined key_trdtrc
132
133         REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_trd in reference namelist : Passive tracer trends
134         READ  ( numnat_ref, namtrc_trd, IOSTAT = ios, ERR = 905)
135905      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_trd in reference namelist', lwp )
136
137         REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_trd in configuration namelist : Passive tracer trends
138         READ  ( numnat_cfg, namtrc_trd, IOSTAT = ios, ERR = 906 )
139906      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_trd in configuration namelist', lwp )
140         IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_trd )
141
142         IF(lwp) THEN
143            WRITE(numout,*)
144            WRITE(numout,*) ' trd_mxl_trc_init : read namelist namtrc_trd                    '
145            WRITE(numout,*) ' ~~~~~~~~~~~~~~~~                                               '
146            WRITE(numout,*) '   * frequency of trends diagnostics   nn_trd_trc             = ', nn_trd_trc
147            WRITE(numout,*) '   * control surface type              nn_ctls_trc            = ', nn_ctls_trc
148            WRITE(numout,*) '   * restart for ML diagnostics        ln_trdmxl_trc_restart  = ', ln_trdmxl_trc_restart
149            WRITE(numout,*) '   * flag to diagnose trends of                                 '
150            WRITE(numout,*) '     instantantaneous or mean ML T/S   ln_trdmxl_trc_instant  = ', ln_trdmxl_trc_instant
151            WRITE(numout,*) '   * unit conversion factor            rn_ucf_trc             = ', rn_ucf_trc
152            DO jn = 1, jptra
153               IF( ln_trdtrc(jn) ) WRITE(numout,*) '    compute ML trends for tracer number :', jn
154            END DO
155         WRITE(numout,*) ' '
156         CALL flush(numout)
157         ENDIF
158#endif
159
160
161      ! Call the ice module for tracers
162      ! -------------------------------
163      CALL trc_nam_ice
164
165      ! namelist of SMS
166      ! ---------------     
167      IF( lk_pisces  ) THEN   ;   CALL trc_nam_pisces      ! PISCES  bio-model
168      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          PISCES not used'
169      ENDIF
170
171      IF( lk_medusa  ) THEN   ;   CALL trc_nam_medusa      ! MEDUSA  tracers
172      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          MEDUSA not used'
173      ENDIF
174
175      IF( lk_idtra   ) THEN   ;   CALL trc_nam_idtra       ! Idealize tracers
176      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          Idealize tracers not used'
177      ENDIF
178
179      IF( lk_cfc     ) THEN   ;   CALL trc_nam_cfc         ! CFC     tracers
180      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          CFC not used'
181      ENDIF
182
183      IF( lk_c14b     ) THEN   ;   CALL trc_nam_c14b         ! C14 bomb     tracers
184      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          C14 not used'
185      ENDIF
186
187      IF( lk_age     ) THEN  ;   CALL trc_nam_age         ! AGE     tracer
188      ELSE                   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          AGE not used'
189      ENDIF
190
191      IF( lk_my_trc  ) THEN   ;   CALL trc_nam_my_trc      ! MY_TRC  tracers
192      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          MY_TRC not used'
193      ENDIF
194       
195      IF(lwp)   CALL flush(numout)
196   END SUBROUTINE trc_nam
197
198   SUBROUTINE trc_nam_run
199      !!---------------------------------------------------------------------
200      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
201      !!
202      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer run (namelist)
203      !!
204      !!---------------------------------------------------------------------
205      NAMELIST/namtrc_run/ nn_dttrc, nn_writetrc, ln_rsttr, nn_rsttr, ln_top_euler, &
206        &                  cn_trcrst_indir, cn_trcrst_outdir, cn_trcrst_in, cn_trcrst_out
207
208
209      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
210
211      !!---------------------------------------------------------------------
212
213
214      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam : read the passive tracer namelists'
215      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
216
217      CALL ctl_opn( numnat_ref, 'namelist_top_ref'   , 'OLD'    , 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE. )
218      CALL ctl_opn( numnat_cfg, 'namelist_top_cfg'   , 'OLD'    , 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE. )
219      IF(lwm) CALL ctl_opn( numont, 'output.namelist.top', 'UNKNOWN', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE., 1 )
220
221      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc in reference namelist : Passive tracer variables
222      READ  ( numnat_ref, namtrc_run, IOSTAT = ios, ERR = 901)
223901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in reference namelist', lwp )
224
225      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc in configuration namelist : Passive tracer variables
226      READ  ( numnat_cfg, namtrc_run, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
227902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in configuration namelist', lwp )
228      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_run )
229
230      !  computes the first time step of tracer model
231      nittrc000 = nit000 + nn_dttrc - 1
232
233      IF(lwp) THEN                   ! control print
234         WRITE(numout,*)
235         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc_run'
236         WRITE(numout,*) '   time step freq. for passive tracer           nn_dttrc      = ', nn_dttrc
237         WRITE(numout,*) '   restart  for passive tracer                  ln_rsttr      = ', ln_rsttr
238         WRITE(numout,*) '   control of time step for passive tracer      nn_rsttr      = ', nn_rsttr
239         WRITE(numout,*) '   first time step for pass. trac.              nittrc000     = ', nittrc000
240         WRITE(numout,*) '   frequency of outputs for passive tracers     nn_writetrc   = ', nn_writetrc 
241         WRITE(numout,*) '   Use euler integration for TRC (y/n)          ln_top_euler  = ', ln_top_euler
242         WRITE(numout,*) ' '
243        CALL flush(numout)
244      ENDIF
245      !
246    END SUBROUTINE trc_nam_run
247
248   SUBROUTINE trc_nam_ice
249      !!---------------------------------------------------------------------
250      !!                     ***  ROUTINE trc_nam_ice ***
251      !!
252      !! ** Purpose :   Read the namelist for the ice effect on tracers
253      !!
254      !! ** Method  : -
255      !!
256      !!---------------------------------------------------------------------
257      ! --- Variable declarations --- !
258      INTEGER :: jn      ! dummy loop indices
259      INTEGER :: ios     ! Local integer output status for namelist read
260
261      ! --- Namelist declarations --- !
262      TYPE(TRC_I_NML), DIMENSION(jptra) :: sn_tri_tracer
263      NAMELIST/namtrc_ice/ nn_ice_tr, sn_tri_tracer
264
265      IF(lwp) THEN
266         WRITE(numout,*)
267         WRITE(numout,*) 'trc_nam_ice : Read the namelist for trc_ice'
268         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~'
269      ENDIF
270
271      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('trc_nam_ice')
272
273      !
274      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_ice in reference namelist : Passive tracer input data
275      READ  ( numnat_ref, namtrc_ice, IOSTAT = ios, ERR = 901)
276 901  IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , ' namtrc_ice in reference namelist ', lwp )
277
278      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_ice in configuration namelist : Pisces external sources of nutrients
279      READ  ( numnat_cfg, namtrc_ice, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
280 902  IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_ice in configuration namelist', lwp )
281
282      IF( lwp ) THEN
283         WRITE(numout,*) ' '
284         WRITE(numout,*) ' Sea ice tracers option (nn_ice_tr) : ', nn_ice_tr
285         WRITE(numout,*) ' '
286      ENDIF
287
288      ! Assign namelist stuff
289      DO jn = 1, jptra
290         trc_ice_ratio(jn)  = sn_tri_tracer(jn)%trc_ratio
291         trc_ice_prescr(jn) = sn_tri_tracer(jn)%trc_prescr
292         cn_trc_o      (jn) = sn_tri_tracer(jn)%ctrc_o
293      END DO
294
295      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_stop('trc_nam_ice')
296      !
297   END SUBROUTINE trc_nam_ice
298
299   SUBROUTINE trc_nam_trc
300      !!---------------------------------------------------------------------
301      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
302      !!
303      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer run (namelist)
304      !!
305      !!---------------------------------------------------------------------
306      TYPE(PTRACER), DIMENSION(jptra) :: sn_tracer  ! type of tracer for saving if not key_iomput
307      !!
308      NAMELIST/namtrc/ sn_tracer, ln_trcdta,ln_trcdmp, ln_trcdmp_clo
309 
310      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
311      INTEGER  ::   jn                  ! dummy loop indice
312      !!---------------------------------------------------------------------
313      IF(lwp) WRITE(numout,*)
314      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam : read the passive tracer namelists'
315      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
316
317
318      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc in reference namelist : Passive tracer variables
319      READ  ( numnat_ref, namtrc, IOSTAT = ios, ERR = 901)
320901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in reference namelist', lwp )
321
322      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc in configuration namelist : Passive tracer variables
323      READ  ( numnat_cfg, namtrc, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
324902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in configuration namelist', lwp )
325      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc )
326
327      DO jn = 1, jptra
328         ctrcnm    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%clsname )
329         ctrcln    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%cllname )
330         ctrcun    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%clunit  )
331         ln_trc_ini(jn) =       sn_tracer(jn)%llinit
332         ln_trc_wri(jn) =       sn_tracer(jn)%llsave
333      END DO
334      IF(lwp)  CALL flush(numout)     
335
336    END SUBROUTINE trc_nam_trc
337
338
339   SUBROUTINE trc_nam_dia
340      !!---------------------------------------------------------------------
341      !!                     ***  ROUTINE trc_nam_dia  ***
342      !!
343      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer diagnostics
344      !!
345      !! ** Method  : - read passive tracer namelist
346      !!              - read namelist of each defined SMS model
347      !!                ( (PISCES, CFC, MY_TRC )
348      !!---------------------------------------------------------------------
349      INTEGER ::  ierr
350#if defined key_trdmxl_trc  || defined key_trdtrc
351      NAMELIST/namtrc_trd/ nn_trd_trc, nn_ctls_trc, rn_ucf_trc, &
352         &                ln_trdmxl_trc_restart, ln_trdmxl_trc_instant, &
353         &                cn_trdrst_trc_in, cn_trdrst_trc_out, ln_trdtrc
354#endif
355      NAMELIST/namtrc_dia/ ln_diatrc, ln_diabio, nn_writedia, nn_writebio
356
357      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
358      !!---------------------------------------------------------------------
359
360      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
361      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_dia : read the passive tracer diagnostics options'
362      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
363
364      IF(lwp) WRITE(numout,*)
365      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_dia : read the passive tracer diagnostics options'
366      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
367
368      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_dia in reference namelist : Passive tracer diagnostics
369      READ  ( numnat_ref, namtrc_dia, IOSTAT = ios, ERR = 903)
370903   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_dia in reference namelist', lwp )
371
372      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_dia in configuration namelist : Passive tracer diagnostics
373      READ  ( numnat_cfg, namtrc_dia, IOSTAT = ios, ERR = 904 )
374904   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_dia in configuration namelist', lwp )
375      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_dia )
376
377      IF(lwp) THEN
378         WRITE(numout,*)
379         WRITE(numout,*)
380         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc_dia'
381         WRITE(numout,*) '    save additionnal diagnostics arrays         ln_diatrc   = ', ln_diatrc
382         WRITE(numout,*) '    save additionnal biology diagnostics arrays ln_diabio   = ', ln_diabio
383         WRITE(numout,*) '    frequency of outputs for additional arrays  nn_writedia = ', nn_writedia
384         WRITE(numout,*) '    frequency of outputs for biological trends  nn_writebio = ', nn_writebio
385         WRITE(numout,*) ' '
386         CALL flush(numout)
387      ENDIF
388
389      IF( ( ln_diatrc .AND. .NOT. lk_iomput ) .OR. ( ln_diatrc .AND. lk_medusa ) ) THEN
390         ALLOCATE( trc2d(jpi,jpj,jpdia2d), trc3d(jpi,jpj,jpk,jpdia3d),  &
391           &       ctrc2d(jpdia2d), ctrc2l(jpdia2d), ctrc2u(jpdia2d) ,  & 
392           &       ctrc3d(jpdia3d), ctrc3l(jpdia3d), ctrc3u(jpdia3d) ,  STAT = ierr ) 
393         IF( ierr > 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'trcnam: unable to allocate add. diag. array' )
394         !
395         trc2d(:,:,:  ) = 0._wp  ;   ctrc2d(:) = ' '   ;   ctrc2l(:) = ' '    ;    ctrc2u(:) = ' ' 
396         trc3d(:,:,:,:) = 0._wp  ;   ctrc3d(:) = ' '   ;   ctrc3l(:) = ' '    ;    ctrc3u(:) = ' ' 
397         !
398      ENDIF
399
400      IF( ( ln_diabio .AND. .NOT. lk_iomput ) .OR. l_trdtrc ) THEN
401         ALLOCATE( trbio (jpi,jpj,jpk,jpdiabio) , &
402           &       ctrbio(jpdiabio), ctrbil(jpdiabio), ctrbiu(jpdiabio), STAT = ierr ) 
403         IF( ierr > 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'trcnam: unable to allocate bio. diag. array' )
404         !
405         trbio(:,:,:,:) = 0._wp  ;   ctrbio(:) = ' '   ;   ctrbil(:) = ' '    ;    ctrbiu(:) = ' ' 
406         !
407      ENDIF
408      !
409   END SUBROUTINE trc_nam_dia
410
411#else
412   !!----------------------------------------------------------------------
413   !!  Dummy module :                                     No passive tracer
414   !!----------------------------------------------------------------------
415CONTAINS
416   SUBROUTINE trc_nam                      ! Empty routine   
417   END SUBROUTINE trc_nam
418   SUBROUTINE trc_nam_run                      ! Empty routine   
419   END SUBROUTINE trc_nam_run
420#endif
421
422   !!----------------------------------------------------------------------
423   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
424   !! $Id$
425   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
426   !!======================================================================
427END MODULE trcnam
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.