source: branches/NERC/dev_r5518_GO6_split_trcbiomedusa/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA/bio_medusa_mod.F90 @ 8434

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JPALM — 11-08-2017 — MEDUSA cleaned and purged

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Line 
1MODULE bio_medusa_mod
2   !!======================================================================
3   !!                      ***  MODULE  bio_medusa_mod  ***
4   !! MEDUSA variables   :  module for MEDUSA variables which are shared
5   !!                       across subroutines
6   !!======================================================================
7   !! History :
8   !!   -   ! 2017-04 (M. Stringer)        Code taken from trcbio_medusa.F90
9   !!----------------------------------------------------------------------
10#if defined key_medusa
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!   'key_medusa'                                           MEDUSA
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   !! Variable conventions
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   !!
17   !! names: z*** - state variable
18   !!        f*** - function (or temporary variable used in part of a function)
19   !!        b*** - right-hand part (sources and sinks)
20   !!        i*** - integer variable (usually used in yes/no flags)
21   !!----------------------------------------------------------------------
22   USE par_kind,          ONLY: wp
23   
24   IMPLICIT NONE
25   PUBLIC
26
27   PUBLIC   bio_medusa_alloc     ! called by trcini.F90
28
29   !! model state variables
30   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zchn,zchd,zphn,zphd,zpds,zzmi
31   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zzme,zdet,zdtc,zdin,zsil,zfer
32# if defined key_roam
33   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zdic, zalk, zoxy
34   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ztmp, zsal
35# endif
36# if defined key_mocsy
37   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zpho
38# endif
39
40   !! integrated source and sink terms
41   REAL(wp) ::    b0
42
43   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fthetan,fprn,frn
44   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fthetad,fprd,frd
45
46   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fjlim_pn,fjlim_pd
47   !! AXY (16/07/09): add in Eppley curve functionality
48   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fun_T,xvpnT,xvpdT
49
50   !! AXY (16/05/11): per Katya's prompting, add in new T-dependence
51   !!                 for phytoplankton growth only (i.e. no change
52   !!                 for remineralisation)
53   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fun_Q10
54   !! AXY (01/03/10): add in mixed layer PP diagnostics
55   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fprn_ml,fprd_ml
56   !!
57   !! nutrient limiting factors
58   !! N and Fe (renaming ffln to ffln2 to avoid conflict with
59   !! ffln in module sms_medusa - marc 25/4/17)
60   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnln,ffln2
61   !! N, Fe and Si
62   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnld,ffld,fsld,fsld2
63   !!
64   !! silicon cycle
65   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsin,fprds,fsdiss
66
67   !! iron cycle; includes parameters for Parekh et al. (2005) iron scheme
68   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffetop,ffebot,ffescav
69   !! Variable for iron-ligand system
70   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: xFree
71
72   !! Microzooplankton grazing
73   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmipn,fgmid,fgmidc
74   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: finmi,ficmi
75   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fmigrow,fmiexcr,fmiresp
76   !!
77   !! Mesozooplankton grazing
78   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmepn,fgmepd
79   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmepds,fgmezmi,fgmed,fgmedc
80   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: finme,ficme
81   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fmegrow,fmeexcr,fmeresp
82   !!
83   !! mortality/Remineralisation
84   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdpn,fdpd,fdpds,fdzmi,fdzme,fdd
85# if defined key_roam
86   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fddc
87# endif
88   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdpn2,fdpd2,fdpds2,fdzmi2,fdzme2
89   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fslown, fslowc
90   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fslownflux, fslowcflux
91   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregen,fregensi
92   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregenfast,fregenfastsi
93# if defined key_roam
94   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregenfastc
95# endif
96
97   !! Particle flux
98   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdep1
99   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempn,ftempsi,ftempfe
100   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempc,ftempca
101   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminn,freminsi,freminfe
102   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminc,freminca
103   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffastn,ffastsi,ffastfe
104   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffastc,ffastca
105   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsedn,fsedsi,fsedfe,fsedc,fsedca
106   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fccd
107
108   !! AXY (08/07/11): fate of fast detritus reaching the seafloor
109   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffast2slown,ffast2slowc
110
111   !! water column nutrient and flux integrals
112   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_n,ftot_si,ftot_fe
113   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fflx_n,fflx_si,fflx_fe
114   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fifd_n,fifd_si,fifd_fe
115   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fofd_n,fofd_si,fofd_fe
116# if defined key_roam
117   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_c,ftot_a,ftot_o2
118   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fflx_c,fflx_a,fflx_o2
119! I don't think fifd_a, fifd_o2, fofd_a or fofd_o2 are used - marc 11/5/17
120!   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fifd_c,fifd_a,fifd_o2
121!   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fofd_c,fofd_a,fofd_o2
122   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fifd_c
123   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fofd_c
124# endif
125
126   !! Zooplankton grazing integrals
127   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fzmi_i,fzmi_o,fzme_i,fzme_o
128
129   !! Limitation term temporary variables
130   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_pn,ftot_pd
131   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_zmi,ftot_zme,ftot_det,ftot_dtc
132
133   !! use biological fluxes (1) or not (0)
134   INTEGER  ::    ibio_switch
135   !!
136   !! diagnose fluxes (should only be used in 1D runs)
137   INTEGER                               :: idf, idfval
138
139   !! Nitrogen and silicon production and consumption
140   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnit_prod,fnit_cons
141   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsil_prod,fsil_cons
142
143# if defined key_roam
144   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_xco2a
145   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ph,f_pco2w,f_h2co3
146   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_hco3,f_co3,f_co2flux
147   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_TDIC,f_TALK,f_dcf,f_henry
148   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_pp0
149   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_kw660,f_o2flux,f_o2sat
150   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_omcal,f_omarg
151
152   !! AXY (23/06/15): additional diagnostics for MOCSY and oxygen
153   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_pco2atm
154
155   !! Carbon, alkalinity production and consumption
156   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fcomm_resp
157   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fcar_prod,fcar_cons
158
159   !! Oxygen production and consumption (and non-consumption)
160   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: foxy_prod,foxy_cons,foxy_anox
161
162   !! Add DMS in MEDUSA for UKESM1 model
163   REAL(wp)                              :: dms_surf,dms_andm
164   !! AXY (13/03/15): add in other DMS calculations
165   REAL(wp)                              :: dms_andr,dms_simo,dms_aran,dms_hall
166   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: dms_nlim, dms_wtkn
167# endif
168
169   !! Benthic fluxes
170   INTEGER  ::    ibenthic
171   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_sbenin_n,f_sbenin_fe,f_sbenin_c
172   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_fbenin_n,f_fbenin_fe,f_fbenin_si
173   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_fbenin_c,f_fbenin_ca
174   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_n,f_benout_fe,f_benout_si 
175   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_c,f_benout_ca
176
177   !! Benthic fluxes of CaCO3 that shouldn't happen because of lysocline
178   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_lyso_ca
179
180   !! riverine fluxes
181   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_runoff,f_riv_n,f_riv_si
182   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_c,f_riv_alk
183   !! AXY (19/07/12): variables for local riverine fluxes to handle
184   !! inputs below surface
185   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_loc_n,f_riv_loc_si
186   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_loc_c, f_riv_loc_alk
187
188   !! Jpalm -- 11-10-2015 -- adapt diag to iom_use
189   !! 2D var for diagnostics.
190   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fprn2d, fdpn2d, fprd2d, fdpd2d
191   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fprds2d, fsdiss2d, fgmipn2d
192   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmid2d, fdzmi2d, fgmepn2d
193   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmepd2d, fgmezmi2d, fgmed2d
194   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdzme2d, fslown2d, fdd2d
195   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffetop2d, ffebot2d, ffescav2d
196   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fjln2d, fnln2d, ffln2d, fjld2d
197   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnld2d, ffld2d, fsld2d2
198   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsld2d, fregen2d, fregensi2d
199   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempn2d, ftempsi2d, ftempfe2d
200   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempc2d, ftempca2d, freminn2d
201   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminsi2d, freminfe2d
202   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminc2d, freminca2d
203   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zw2d
204# if defined key_roam
205   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffastca2d, rivn2d, rivsi2d
206   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: rivc2d, rivalk2d, fslowc2d
207   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdpn22d, fdpd22d, fdzmi22d
208   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdzme22d, zimesn2d, zimesd2d
209   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zimesc2d, zimesdc2d, ziexcr2d
210   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ziresp2d, zigrow2d, zemesn2d
211   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zemesd2d, zemesc2d, zemesdc2d
212   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zeexcr2d, zeresp2d, zegrow2d
213   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: mdetc2d, gmidc2d, gmedc2d
214   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_pco2a2d, f_pco2w2d, f_co2flux2d
215   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_TDIC2d, f_TALK2d, f_kw6602d
216   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_pp02d, f_o2flux2d, f_o2sat2d
217   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: dms_andr2d, dms_simo2d, dms_aran2d
218   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: dms_hall2d, dms_andm2d, dms_surf2d
219   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: iben_n2d, iben_fe2d, iben_c2d
220   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: iben_si2d, iben_ca2d, oben_n2d
221   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: oben_fe2d, oben_c2d, oben_si2d
222   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: oben_ca2d, sfr_ocal2d
223   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: sfr_oarg2d, lyso_ca2d 
224   !! AXY (23/11/16): extra MOCSY diagnostics
225   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_xco2a_2d, f_fco2w_2d, f_fco2a_2d
226   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ocnrhosw_2d, f_ocnschco2_2d
227   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ocnkwco2_2d
228   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ocnk0_2d, f_co2starair_2d
229   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ocndpco2_2d
230# endif
231   !!
232   !! 3D var for diagnostics.
233   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: tpp3d, detflux3d, remin3dn
234   !!
235# if defined key_roam
236   !! AXY (04/11/16)
237   !! 2D var for new CMIP6 diagnostics (behind a key_roam ifdef
238   !! for simplicity)
239   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgco2,intdissic,intdissin
240   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: intdissisi,inttalk,o2min,zo2min
241   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fbddtalk,fbddtdic,fbddtdife
242   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fbddtdin,fbddtdisi
243   !!
244   !! 3D var for new CMIP6 diagnostics
245   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: tppd3
246   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: bddtalk3,bddtdic3,bddtdife3
247   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: bddtdin3, bddtdisi3
248   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: fd_nit3,fd_sil3,fd_car3,fd_cal3
249   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: co33,co3satarag3
250   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: co3satcalc3,dcalc3
251   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: expc3,expn3
252   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: fediss3,fescav3
253   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: migrazp3,migrazd3,megrazp3
254   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: megrazd3, megrazz3
255   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: o2sat3,pbsi3,pcal3,remoc3
256   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: pnlimj3,pnlimn3,pnlimfe3
257   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: pdlimj3,pdlimn3,pdlimfe3,pdlimsi3
258# endif
259   !!----------------------------------------------------------------------
260   !! NEMO/TOP 3.3.1 , NEMO Consortium (2010)
261   !! $Id$
262   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
263   !!----------------------------------------------------------------------
264CONTAINS
265
266   INTEGER FUNCTION bio_medusa_alloc()
267      !!-------------------------------------------------------------------
268      !!                    *** ROUTINE bio_medusa_alloc ***
269      !!-------------------------------------------------------------------
270      USE lib_mpp,           ONLY: ctl_warn
271      USE par_oce,           ONLY: jpi, jpj
272      !!-------------------------------------------------------------------
273      !
274      ALLOCATE(zchn(jpi,jpj),zchd(jpi,jpj),zphn(jpi,jpj),             &
275               zphd(jpi,jpj),zpds(jpi,jpj),zzmi(jpi,jpj),             &
276               zzme(jpi,jpj),zdet(jpi,jpj),zdtc(jpi,jpj),             &
277               zdin(jpi,jpj),zsil(jpi,jpj),zfer(jpi,jpj),             &
278# if defined key_roam
279               zdic(jpi,jpj),zalk(jpi,jpj),zoxy(jpi,jpj),             &
280               ztmp(jpi,jpj),zsal(jpi,jpj),                           &
281# endif
282# if defined key_mocsy
283               zpho(jpi,jpj),                                         &
284# endif
285               fthetan(jpi,jpj),fprn(jpi,jpj),frn(jpi,jpj),           &
286               fthetad(jpi,jpj),fprd(jpi,jpj),frd(jpi,jpj),           &
287               fjlim_pn(jpi,jpj),fjlim_pd(jpi,jpj),                   &
288               fun_T(jpi,jpj),fun_Q10(jpi,jpj),                       &
289               fprn_ml(jpi,jpj),fprd_ml(jpi,jpj),                     &
290               fnln(jpi,jpj),ffln2(jpi,jpj),                          &
291               fnld(jpi,jpj),ffld(jpi,jpj),fsld(jpi,jpj),             &
292               fsld2(jpi,jpj),                                        &
293               fsin(jpi,jpj),fprds(jpi,jpj),fsdiss(jpi,jpj),          &
294               ffetop(jpi,jpj),ffebot(jpi,jpj),ffescav(jpi,jpj),      &
295               xFree(jpi,jpj),                                        &
296               fgmipn(jpi,jpj),fgmid(jpi,jpj),fgmidc(jpi,jpj),        &
297               finmi(jpi,jpj),ficmi(jpi,jpj),                         &
298               fmigrow(jpi,jpj),fmiexcr(jpi,jpj),fmiresp(jpi,jpj),    &
299               fgmepn(jpi,jpj),fgmepd(jpi,jpj),                       &
300               fgmepds(jpi,jpj),fgmezmi(jpi,jpj),fgmed(jpi,jpj),      &
301               fgmedc(jpi,jpj),                                       &
302               finme(jpi,jpj),ficme(jpi,jpj),                         &
303               fmegrow(jpi,jpj),fmeexcr(jpi,jpj),fmeresp(jpi,jpj),    &
304               fdpn(jpi,jpj),fdpd(jpi,jpj),fdpds(jpi,jpj),            &
305               fdzmi(jpi,jpj),fdzme(jpi,jpj),fdd(jpi,jpj),            &
306# if defined key_roam
307               fddc(jpi,jpj),                                         &
308# endif
309               fdpn2(jpi,jpj),fdpd2(jpi,jpj),fdpds2(jpi,jpj),         &
310               fdzmi2(jpi,jpj),fdzme2(jpi,jpj),                       &
311               fslown(jpi,jpj),fslowc(jpi,jpj),                       &
312               fslownflux(jpi,jpj),fslowcflux(jpi,jpj),               &
313               fregen(jpi,jpj),fregensi(jpi,jpj),                     &
314               fregenfast(jpi,jpj),fregenfastsi(jpi,jpj),             &
315# if defined key_roam
316               fregenfastc(jpi,jpj),                                  &
317# endif
318               fdep1(jpi,jpj),                                        &
319               ftempn(jpi,jpj),ftempsi(jpi,jpj),ftempfe(jpi,jpj),     &
320               ftempc(jpi,jpj),ftempca(jpi,jpj),                      &
321               freminn(jpi,jpj),freminsi(jpi,jpj),freminfe(jpi,jpj),  &
322               freminc(jpi,jpj),freminca(jpi,jpj),                    &
323               ffastn(jpi,jpj),ffastsi(jpi,jpj),ffastfe(jpi,jpj),     &
324               ffastc(jpi,jpj),ffastca(jpi,jpj),                      &
325               fsedn(jpi,jpj),fsedsi(jpi,jpj),fsedfe(jpi,jpj),        &
326               fsedc(jpi,jpj),fsedca(jpi,jpj),                        &
327               fccd(jpi,jpj),                                         &
328               ffast2slown(jpi,jpj),ffast2slowc(jpi,jpj),             &
329               ftot_n(jpi,jpj),ftot_si(jpi,jpj),ftot_fe(jpi,jpj),     &
330               fflx_n(jpi,jpj),fflx_si(jpi,jpj),fflx_fe(jpi,jpj),     &
331               fifd_n(jpi,jpj),fifd_si(jpi,jpj),fifd_fe(jpi,jpj),     &
332               fofd_n(jpi,jpj),fofd_si(jpi,jpj),fofd_fe(jpi,jpj),     &
333# if defined key_roam
334               ftot_c(jpi,jpj),ftot_a(jpi,jpj),ftot_o2(jpi,jpj),      &
335               fflx_c(jpi,jpj),fflx_a(jpi,jpj),fflx_o2(jpi,jpj),      &
336! I don't think fifd_a, fifd_o2, fofd_a or fofd_o2 are used - marc 11/5/17
337!               fifd_c(jpi,jpj),fifd_a(jpi,jpj),fifd_o2(jpi,jpj),      &
338!               fofd_c(jpi,jpj),fofd_a(jpi,jpj),fofd_o2(jpi,jpj),      &
339               fifd_c(jpi,jpj), fofd_c(jpi,jpj),                      &
340# endif
341               fzmi_i(jpi,jpj),fzmi_o(jpi,jpj),fzme_i(jpi,jpj),       &
342               fzme_o(jpi,jpj),                                       &
343               ftot_pn(jpi,jpj),ftot_pd(jpi,jpj),                     &
344               ftot_zmi(jpi,jpj),ftot_zme(jpi,jpj),ftot_det(jpi,jpj), &
345               ftot_dtc(jpi,jpj),                                     &
346               fnit_prod(jpi,jpj),fnit_cons(jpi,jpj),                 &
347               fsil_prod(jpi,jpj),fsil_cons(jpi,jpj),                 &
348# if defined key_roam
349               f_xco2a(jpi,jpj),                                      &
350               f_ph(jpi,jpj),f_pco2w(jpi,jpj),f_h2co3(jpi,jpj),       &
351               f_hco3(jpi,jpj),f_co3(jpi,jpj),f_co2flux(jpi,jpj),     &
352               f_TDIC(jpi,jpj),f_TALK(jpi,jpj),f_dcf(jpi,jpj),        &
353               f_henry(jpi,jpj),                                      &
354               f_pp0(jpi,jpj),                                        &
355               f_kw660(jpi,jpj),f_o2flux(jpi,jpj),f_o2sat(jpi,jpj),   &
356               f_omcal(jpi,jpj),f_omarg(jpi,jpj),                     &
357               f_pco2atm(jpi,jpj),                 &
358               fcomm_resp(jpi,jpj),                                   &
359               fcar_prod(jpi,jpj),fcar_cons(jpi,jpj),                 &
360               foxy_prod(jpi,jpj), foxy_cons(jpi,jpj),                &
361               foxy_anox(jpi,jpj),                                    &
362               dms_nlim(jpi,jpj),dms_wtkn(jpi,jpj),                   &
363# endif
364               f_sbenin_n(jpi,jpj),f_sbenin_fe(jpi,jpj),              &
365               f_sbenin_c(jpi,jpj),                                   &
366               f_fbenin_n(jpi,jpj),f_fbenin_fe(jpi,jpj),              &
367               f_fbenin_si(jpi,jpj),                                  &
368               f_fbenin_c(jpi,jpj),f_fbenin_ca(jpi,jpj),              &
369               f_benout_n(jpi,jpj),f_benout_fe(jpi,jpj),              &
370               f_benout_si(jpi,jpj),                                  &
371               f_benout_c(jpi,jpj),f_benout_ca(jpi,jpj),              &
372               f_benout_lyso_ca(jpi,jpj),                             &
373               f_runoff(jpi,jpj),f_riv_n(jpi,jpj),f_riv_si(jpi,jpj),  &
374               f_riv_c(jpi,jpj),f_riv_alk(jpi,jpj),                   &
375               f_riv_loc_n(jpi,jpj),f_riv_loc_si(jpi,jpj),            &
376               f_riv_loc_c(jpi,jpj),f_riv_loc_alk(jpi,jpj),           &
377               STAT = bio_medusa_alloc)
378
379      !! Check that allocation was successful
380      IF ( bio_medusa_alloc /= 0 ) THEN 
381         CALL ctl_warn('bio_medusa_alloc: failed to allocate arrays')
382      END IF
383   
384   END FUNCTION bio_medusa_alloc
385
386#else
387   !!----------------------------------------------------------------------
388   !!  Empty module :                                          No MEDUSA
389   !!----------------------------------------------------------------------
390#endif 
391
392   !!======================================================================
393END MODULE bio_medusa_mod
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.