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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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iodef_medusa_et_al.xml in branches/NERC/dev_r5518_NOC_MEDUSA_Stable/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/XIOS2 – NEMO

source: branches/NERC/dev_r5518_NOC_MEDUSA_Stable/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/XIOS2/iodef_medusa_et_al.xml @ 7516

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JPALM - remove nemogcm debug printing statements to avoid conflicts - change update field_def_dyn.xml to latest version
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Line 
1<!-- GO6.0 version of the XIOS namelist -->
2<!-- XIOS2 version namelist -->
3
4<?xml version="1.0"?>
5<simulation> 
6
7 <context id="nemo" >
8   
9    <!-- $id$ -->
10   
11    <!--
12============================================================================================================
13=                                  definition of all existing variables                                    =
14=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
15============================================================================================================
16    -->
17    <field_definition src="./field_def.xml"/>
18    <field_definition src="./field_def_bgc.xml"/>
19    <!--
20============================================================================================================
21=                                           output files definition                                        =
22=                                            Define your own files                                         =
23=                                         put the variables you want...                                    =
24============================================================================================================
25    -->
26   
27    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
28   
29      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
30
31      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
32      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
33      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
34      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
35      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".FALSE."> <!-- 6h files -->
36        <file id="file8" name_suffix="_UK_shelf" description="Forcings for the UK shelf seas model" >
37          <field field_ref="toce"         name="votemper"     grid_ref="grid_T_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="sea_water_potential_temperature"/> 
38          <field field_ref="soce"         name="vosaline"     grid_ref="grid_T_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="sea_water_salinity"/>   
39          <field field_ref="ssh"          name="sossheig"     grid_ref="grid_T_2D_zoom"    operation="instant" standard_name="sea_surface_height_above_geoid"/>
40          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"     grid_ref="grid_U_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="sea_water_x_velocity"/>
41          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"     grid_ref="grid_V_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="sea_water_y_velocity"/>
42          <field field_ref="ubar"         name="ubar"         grid_ref="grid_U_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="ocean_barotropic_current_along_i-axis"/>
43          <field field_ref="vbar"         name="vbar"         grid_ref="grid_V_3D_zoom"    operation="instant" standard_name="ocean_barotropic_current_along_j-axis"/>
44        </file>
45      </file_group>
46     
47      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files -->
48      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
49
50      <file_group id="10d" output_freq="10d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 10d files -->   
51   
52   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
53          <field_group group_ref="SPIN-UP_T" />
54   </file>
55   
56   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
57          <field_group group_ref="SPIN-UP_U" /> 
58   </file>
59   
60   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
61          <field_group group_ref="SPIN-UP_V" />
62   </file>
63
64   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
65          <field_group group_ref="SPIN-UP_W" />
66   </file>
67   
68   <file id="file5" name_suffix="_diaptr" description="process diagnostics" >
69          <field_group group_ref="SPIN-UP_diaptr" />
70   </file> 
71   
72        <file id="file6" name_suffix="_ptrc_T" description="Medusa sms variables" >
73          <field_group group_ref="groupMEDUSA" />
74          <field_group group_ref="groupIDTRA" />
75          <field_group group_ref="groupCFC" />
76        </file>
77
78        <file id="file7" name_suffix="_diad_T" description="Medusa diagnostic variables" >
79          <field_group group_ref="groupMEDUSA_dia" /> 
80          <field_group group_ref="groupMEDUSA_3dd" /> 
81          <field_group group_ref="groupMEDUSA_dms" />
82          <field_group group_ref="groupIDTRA_dia" />
83          <field_group group_ref="groupCFC_dia" />
84        </file>
85       
86      </file_group>
87     
88 
89      <!-- file_group id="1m" output_freq="1mo" split_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE." -->  <!-- 1mo files -->   
90      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".FALSE.">  <!-- 1mo files -->   
91
92        <file id="file9" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
93          <field_group group_ref="SPIN-UP_T" />
94   </file>
95   
96   <file id="file10" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
97          <field_group group_ref="SPIN-UP_U" />
98   </file>
99   
100   <file id="file11" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
101          <field_group group_ref="SPIN-UP_V" />
102   </file>
103   
104   <file id="file12" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
105          <field_group group_ref="SPIN-UP_W" />
106   </file>
107   
108   <file id="file13" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
109          <field_group group_ref="SPIN-UP_diaptr" />
110   </file>
111   
112        <file id="file14" name_suffix="_ptrc_T" description="Medusa sms variables" >
113          <field_group group_ref="groupMEDUSA" />
114          <field_group group_ref="groupIDTRA" />
115          <field_group group_ref="groupCFC" />
116        </file>
117
118        <file id="file15" name_suffix="_diad_T" description="Medusa diagnostic variables" >
119          <field_group group_ref="groupMEDUSA_dia" /> 
120          <field_group group_ref="groupMEDUSA_3dd" /> 
121          <field_group group_ref="groupMEDUSA_dms" />
122          <field_group group_ref="groupIDTRA_dia" />
123          <field_group group_ref="groupCFC_dia" />
124        </file>
125
126      </file_group>
127
128      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
129      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
130      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
131      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
132
133      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files -->
134      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
135      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
136      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
137
138   </file_definition>
139   
140    <!--
141============================================================================================================
142= grid definition = = DO NOT CHANGE =
143============================================================================================================
144    -->
145
146   <axis_definition>
147      <axis id="deptht" standard_name="depth" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" />
148      <axis id="depthu" standard_name="depth" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" />
149      <axis id="depthv" standard_name="depth" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" />
150      <axis id="depthw" standard_name="depth" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" />
151      <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  />
152      <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  />
153   </axis_definition>
154   
155   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
156   
157   
158  <grid_definition>
159        <!--  -->
160       <grid id="grid_T_2D" >
161         <domain id="grid_T" />
162       </grid>
163        <!--  -->
164       <grid id="grid_T_3D_ncatice" >
165         <domain id="grid_T" />
166         <axis id="ncatice" />
167       </grid>
168        <!--  -->
169       <grid id="grid_T_3D" >
170         <domain id="grid_T" />
171         <axis id="deptht" />
172       </grid>
173        <!--  -->
174       <grid id="grid_U_2D" >
175         <domain id="grid_U" />
176       </grid>
177        <!--  -->
178       <grid id="grid_U_3D" >
179         <domain id="grid_U" />
180         <axis id="depthu" />
181       </grid>
182        <!--  -->
183       <grid id="grid_V_2D" >
184         <domain id="grid_V" />
185       </grid>
186        <!--  -->
187       <grid id="grid_V_3D" >
188         <domain id="grid_V" />
189         <axis id="depthv" />
190       </grid>
191        <!--  -->
192       <grid id="grid_W_2D" >
193         <domain id="grid_W" />
194       </grid>
195        <!--  -->
196       <grid id="grid_W_3D" >
197         <domain id="grid_W" />
198         <axis id="depthw" />
199       </grid>
200        <!--  -->
201       <grid id="grid_1point" >
202         <domain domain_ref="1point"/>
203       </grid>
204        <!--  -->
205       <grid id="grid_T_nfloat" >
206         <domain id="grid_T" />
207         <axis id="nfloat" />
208       </grid>
209        <!--  -->
210       <grid id="grid_EqT" >
211         <domain domain_ref="EqT" />
212       </grid>
213        <!--  -->
214       <grid id="gznl_T_2D">
215         <domain domain_ref="ptr" />
216       </grid>
217        <!--  -->
218       <grid id="gznl_T_3D">
219         <domain domain_ref="ptr" />
220         <axis id="deptht" />
221       </grid>
222        <!--  -->
223       <grid id="gznl_W_2D">
224         <domain domain_ref="ptr" />
225       </grid>
226        <!--  -->
227       <grid id="gznl_W_3D">
228         <domain domain_ref="ptr" />
229         <axis id="depthw" />
230       </grid>
231  </grid_definition> 
232
233  <context id="xios">
234
235      <variable_definition>
236   
237     <!--
238        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
239-->
240     <variable id="info_level"                type="int">0</variable>
241     <variable id="using_server"              type="bool">true</variable>
242     <variable id="using_oasis"               type="bool">true</variable>
243     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >toyoce</variable>
244   
245      </variable_definition>
246               
247  </context>
248 
249</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.