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JPALM — 21-02-2017 — merge the branch with Richard optim branch, and add 2 fixes in trcnam_medusa

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Line 
1<!-- GO6.0 version of the XIOS namelist -->
2<!-- XIOS version 2 -->
3<?xml version="1.0"?>
4
5<simulation> 
6
7 <context id="nemo">
8   
9    <!-- $id$ -->
10   
11    <!--
12============================================================================================================
13=                                  definition of all existing variables                                    =
14=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
15============================================================================================================
16    -->
17    <field_definition src="./field_def_bgc.xml"/>
18    <field_definition src="./field_def.xml"/>
19    <!--
20============================================================================================================
21=                                           output files definition                                        =
22=                                            Define your own files                                         =
23=                                         put the variables you want...                                    =
24============================================================================================================
25    -->
26
27    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1mo" min_digits="4">
28   
29      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
30
31      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
32      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
33      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
34      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
35      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->
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37      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files -->
38      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
39
40      <file_group id="10d" output_freq="10d" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 10d files -->
41      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE.">   <!-- 1m files -->   
42
43   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
44          <field field_ref="e3t"          name="e3t"        standard_name="cell_thickness" />
45          <field field_ref="toce"         name="votemper"        operation="average" freq_op="1mo" > @toce_e3t / @e3t </field>
46          <field field_ref="toce"         name="votemper2"       operation="average" freq_op="1mo" > @toce2_e3t / @e3t </field>
47          <field field_ref="soce"         name="vosaline"        operation="average" freq_op="1mo" > @soce_e3t / @e3t </field>
48          <field field_ref="soce"         name="vosaline2"       operation="average" freq_op="1mo" > @soce2_e3t / @e3t </field>
49          <field field_ref="ttrd_totad"   name="opottempadvect"  operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_totad_e3t * 1026.0 * 3991.86795711963 </field>
50          <field field_ref="ttrd_iso"     name="opottemppmdiff"  operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_iso_e3t * 1026.0 * 3991.86795711963 </field>
51          <field field_ref="ttrd_zdfp"    name="opottempdiff"    operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_zdfp_e3t * 1026.0 * 3991.86795711963 </field>
52          <field field_ref="ttrd_evd"     name="ttrd_evd"        operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_evd_e3t / @e3t </field>
53          <field field_ref="ttrd_qns"     name="ttrd_qns"        operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_qns_e3t / @e3t_surf </field>
54          <field field_ref="ttrd_qsr"     name="rsdoabsorb"      operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_qsr_e3t * 1026.0 * 3991.86795711963 </field>
55          <field field_ref="ttrd_bbl"     name="ttrd_bbl"        operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_bbl_e3t / @e3t </field>
56          <field field_ref="ttrd_tot"     name="opottemptend"    operation="average" freq_op="1mo" > @ttrd_tot_e3t * 1026.0 * 3991.86795711963 </field>
57          <field field_ref="strd_totad"   name="osaltadvect"     operation="average" freq_op="1mo" > @strd_totad_e3t * 1026.0 * 0.001 </field>
58          <field field_ref="strd_iso"     name="osaltpmdiff"     operation="average" freq_op="1mo" > @strd_iso_e3t * 1026.0 * 0.001  </field>
59          <field field_ref="strd_zdfp"    name="osaltdiff"       operation="average" freq_op="1mo" > @strd_zdfp_e3t * 1026.0 * 0.001  </field>
60          <field field_ref="strd_evd"     name="strd_evd"        operation="average" freq_op="1mo" > @strd_evd_e3t / @e3t </field>
61          <field field_ref="strd_tot"     name="osalttend"       operation="average" freq_op="1mo" > @strd_tot_e3t * 1026.0 * 0.001 </field>
62          <field field_ref="strd_bbl"     name="strd_bbl"        operation="average" freq_op="1mo" > @strd_bbl_e3t / @e3t </field>
63     <field field_ref="ssh"          name="sossheig"   standard_name="sea_surface_height_above_geoid"                          />
64          <field field_ref="ssh2"         name="zossq"      standard_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"                />
65     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"   standard_name="water_flux_out_of_sea_ice_and_sea_water"                 />
66     <field field_ref="saltflx"      name="sosafldo"   standard_name="salt_flux_into_sea_water"                                />
67     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"   standard_name="surface_downward_heat_flux_in_sea_water"                 />
68     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"   standard_name="downwelling_photosynthetic_radiative_flux_in_sea_water"               />
69          <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_vertical_tracer_diffusivity"   />
70          <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"      />
71          <field field_ref="mldzint_1"    name="sokaraml"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                             />
72          <field field_ref="mldzint_2"    name="somlddbm"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                             />
73          <field field_ref="ice_cover"    name="soicecov"   standard_name="sea_ice_area_fraction"                                   />
74          <field field_ref="wspd"         name="sowindsp"   standard_name="wind_speed"                                              />         
75          <field field_ref="qhcisf"       name="sohflisf"   standard_name="ice_shelf_heat_flux"                                                        />
76          <field field_ref="qlatisf"      name="soqlatisf"  standard_name="ice_shelf_latent_heat_flux"                                                        />
77          <field field_ref="fwfisf"       name="sowflisf"   standard_name="ice_shelf_melting"                                                        />
78          <field field_ref="berg_total_melt"       name="berg_total_melt"          standard_name=""                                 />
79          <field field_ref="berg_total_heat_flux"  name="berg_total_heat_flux"     standard_name=""                                 />
80          <field field_ref="runoffs"       name="sorunoff"    standard_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                 />
81          <field field_ref="hflx_rain_cea" name="hfrainds"    standard_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"/>
82          <field field_ref="hflx_evap_cea" name="hfevapds"    standard_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water"/>
83          <field field_ref="evap_ao_cea"   name="evap_ao_cea" standard_name="water_evaporation_flux"                                />
84          <field field_ref="rain"          name="pr"          standard_name="rainfall_flux"                                         />
85          <field field_ref="snowpre"       name="snowpre"     standard_name="snowfall_flux"                                         />
86          <field field_ref="snow_ao_cea"   name="snow_ao_cea" standard_name="snowfall_flux_over_ocean"                              />
87          <field field_ref="snow_ai_cea"   name="snow_ai_cea" standard_name="snowfall_flux_over_sea_ice"                            />
88   </file>
89   
90   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
91          <field field_ref="e3u"          name="e3u"        standard_name="cell_thickness" />
92          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"     operation="average" freq_op="1mo" > @uoce_e3u / @e3u </field>
93          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx2"    operation="average" freq_op="1mo" > @uoce2_e3u / @e3u </field>
94          <field field_ref="ut"           name="ut"           operation="average" freq_op="1mo" > @ut_e3u / @e3u </field>
95          <field field_ref="us"           name="us"           operation="average" freq_op="1mo" > @us_e3u / @e3u </field>
96     <field field_ref="utau"         name="sozotaux"   standard_name="surface_downward_x_stress" />
97   </file>
98   
99   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
100          <field field_ref="e3v"          name="e3v"        standard_name="cell_thickness" />
101          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"     operation="average" freq_op="1mo" > @voce_e3v / @e3v </field>
102          <field field_ref="voce"         name="vomecrty2"    operation="average" freq_op="1mo" > @voce2_e3v / @e3v </field>
103          <field field_ref="vt"           name="vt"           operation="average" freq_op="1mo" > @vt_e3v / @e3v </field>
104          <field field_ref="vs"           name="vs"           operation="average" freq_op="1mo" > @vs_e3v / @e3v </field>
105     <field field_ref="vtau"         name="sometauy"   standard_name="surface_downward_y_stress" />
106   </file>
107   
108   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
109     <field field_ref="woce"         name="vovecrtz"   standard_name="upward_sea_water_velocity"                         />
110          <field field_ref="wt"           name="wt"         standard_name=""                                                  />
111          <field field_ref="ws"           name="ws"         standard_name=""                                                  />
112     <field field_ref="avt"          name="votkeavt"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                   />
113          <field field_ref="avm"          name="votkeavm"   standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"               />
114          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw"   standard_name="vertical_component_of_ocean_xy_tracer_diffusivity" />
115   </file>
116       
117        <file id="file5" name_suffix="_diaptr" description="processed diagnostics" >
118     <field field_ref="zomsfglo"     name="zomsfglo"   standard_name="meridional_streamfunction_global"           grid_ref="gznl_W_3D"       />
119          <field field_ref="zotemglo"     name="zotemglo"   standard_name="zonal_mean_temperature_global"              grid_ref="gznl_T_3D"       />
120          <field field_ref="zosrfglo"     name="zosrfglo"   standard_name="zonal_mean_surface_global"                  grid_ref="gznl_T_3D"       />
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122          <field field_ref="zomsfatl"     name="zomsfatl"   standard_name="meridional_streamfunction_atlantic"         grid_ref="gznl_W_3D"       />
123          <field field_ref="zotematl"     name="zotematl"   standard_name="zonal_mean_temperature_atlantic"            grid_ref="gznl_T_3D"       />
124          <field field_ref="zosrfatl"     name="zosrfatl"   standard_name="zonal_mean_surface_atlantic"                grid_ref="gznl_T_3D"       />
125     <field field_ref="zosalatl"     name="zosalatl"   standard_name="zonal_mean_salinity_atlantic"               grid_ref="gznl_T_3D"       />         
126          <field field_ref="zomsfpac"     name="zomsfpac"   standard_name="meridional_streamfunction_pacific"          grid_ref="gznl_W_3D"       />
127          <field field_ref="zotempac"     name="zotempac"   standard_name="zonal_mean_temperature_pacific"             grid_ref="gznl_T_3D"       />
128          <field field_ref="zosrfpac"     name="zosrfpac"   standard_name="zonal_mean_surface_pacific"                 grid_ref="gznl_T_3D"       />
129     <field field_ref="zosalpac"     name="zosalpac"   standard_name="zonal_mean_salinity_pacific"                grid_ref="gznl_T_3D"       />
130          <field field_ref="zomsfind"     name="zomsfind"   standard_name="meridional_streamfunction_indian"           grid_ref="gznl_W_3D"       />
131          <field field_ref="zotemind"     name="zotemind"   standard_name="zonal_mean_temperature_indian"              grid_ref="gznl_T_3D"       />
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133     <field field_ref="zosalind"     name="zosalind"   standard_name="zonal_mean_salinity_indian"                 grid_ref="gznl_T_3D"       />         
134          <field field_ref="zomsfipc"     name="zomsfipc"   standard_name="meridional_streamfunction_indian_pacific"   grid_ref="gznl_W_3D"       />
135          <field field_ref="zotemipc"     name="zotemipc"   standard_name="zonal_mean_temperature_indian_pacific"      grid_ref="gznl_T_3D"       />
136          <field field_ref="zosrfipc"     name="zosrfipc"   standard_name="zonal_mean_surface_indian_pacific"          grid_ref="gznl_T_3D"       />
137     <field field_ref="zosalipc"     name="zosalipc"   standard_name="zonal_mean_salinity_indian_pacific"         grid_ref="gznl_T_3D"       />         
138          <field field_ref="sophtadv"     name="sophtadv"   standard_name="advective_heat_transport"                   grid_ref="gznl_T_2D"       />
139          <field field_ref="sopstadv"     name="sopstadv"   standard_name="advective_salt_transport"                   grid_ref="gznl_T_2D"       />
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141          <field field_ref="sopstldf"     name="sopstldf"   standard_name="diffusive_salt_transport"                   grid_ref="gznl_T_2D"       />
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145          <field field_ref="sopstldf_atl" name="sopstldf_atl"   standard_name="diffusive_salt_transport_atlantic"      grid_ref="gznl_T_2D"       />
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149          <field field_ref="sopstldf_pac" name="sopstldf_pac"   standard_name="diffusive_salt_transport_pacific"       grid_ref="gznl_T_2D"       />
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152          <field field_ref="sophtldf_ind" name="sophtldf_ind"   standard_name="diffusive_heat_transport_indian"        grid_ref="gznl_T_2D"       />
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309 
310</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.