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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
trcnam.F90 in branches/UKMO/AMM15_v3_6_STABLE_package_collate_coupling/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC – NEMO

source: branches/UKMO/AMM15_v3_6_STABLE_package_collate_coupling/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcnam.F90

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Add NEMO-FABM coupling code, essentially identical to commit 4bc68d33 of the PML NEMO-FABM GitLab?.
File size: 19.6 KB
Line 
1MODULE trcnam
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE trcnam  ***
4   !! TOP :   Read and print options for the passive tracer run (namelist)
5   !!======================================================================
6   !! History :    -   !  1996-11  (M.A. Foujols, M. Levy)  original code
7   !!              -   !  1998-04  (M.A Foujols, L. Bopp) ahtrb0 for isopycnal mixing
8   !!              -   !  1999-10  (M.A. Foujols, M. Levy) separation of sms
9   !!              -   !  2000-07  (A. Estublier) add TVD and MUSCL : Tests on ndttrc
10   !!              -   !  2000-11  (M.A Foujols, E Kestenare) trcrat, ahtrc0 and aeivtr0
11   !!              -   !  2001-01 (E Kestenare) suppress ndttrc=1 for CEN2 and TVD schemes
12   !!             1.0  !  2005-03 (O. Aumont, A. El Moussaoui) F90
13   !!----------------------------------------------------------------------
14#if defined key_top
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   !!   'key_top'                                                TOP models
17   !!----------------------------------------------------------------------
18   !!   trc_nam    :  Read and print options for the passive tracer run (namelist)
19   !!----------------------------------------------------------------------
20   USE oce_trc           ! shared variables between ocean and passive tracers
21   USE trc               ! passive tracers common variables
22   USE trcnam_trp        ! Transport namelist
23   USE trcnam_pisces     ! PISCES namelist
24   USE trcnam_cfc        ! CFC SMS namelist
25   USE trcnam_c14b       ! C14 SMS namelist
26   USE trcnam_my_trc     ! MY_TRC SMS namelist
27   ! +++>>> FABM
28   USE trcnam_fabm       ! FABM SMS namelist
29   ! FABM <<<+++
30   USE trd_oce       
31   USE trdtrc_oce
32   USE iom               ! I/O manager
33
34   IMPLICIT NONE
35   PRIVATE
36
37   PUBLIC trc_nam_run  ! called in trcini
38   PUBLIC trc_nam      ! called in trcini
39   PUBLIC trc_nam_dia
40#if defined key_trdmxl_trc  || defined key_trdtrc
41   NAMELIST/namtrc_trd/ nn_trd_trc, nn_ctls_trc, rn_ucf_trc, &
42      &                ln_trdmxl_trc_restart, ln_trdmxl_trc_instant, &
43      &                cn_trdrst_trc_in, cn_trdrst_trc_out, ln_trdtrc
44#endif
45
46   !! * Substitutions
47#  include "top_substitute.h90"
48   !!----------------------------------------------------------------------
49   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
50   !! $Id$
51   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
52   !!----------------------------------------------------------------------
53
54CONTAINS
55
56
57   SUBROUTINE trc_nam
58      !!---------------------------------------------------------------------
59      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
60      !!
61      !! ** Purpose :   READ and PRINT options for the passive tracer run (namelist)
62      !!
63      !! ** Method  : - read passive tracer namelist
64      !!              - read namelist of each defined SMS model
65      !!                ( (PISCES, CFC, MY_TRC )
66      !!---------------------------------------------------------------------
67      INTEGER  ::   jn                  ! dummy loop indice
68#if defined key_trdmxl_trc  || defined key_trdtrc
69      INTEGER :: ios
70#endif
71
72      !                                        !   Parameters of the run
73      IF( .NOT. lk_offline ) CALL trc_nam_run
74     
75      !                                        !  passive tracer informations
76      CALL trc_nam_trc
77     
78      !                                        !   Parameters of additional diagnostics
79      CALL trc_nam_dia
80
81      !                                        !   namelist of transport
82      CALL trc_nam_trp
83
84
85      IF( ln_rsttr )                      ln_trcdta = .FALSE.   ! restart : no need of clim data
86      !
87      IF( ln_trcdmp .OR. ln_trcdmp_clo )  ln_trcdta = .TRUE.   ! damping : need to have clim data
88      !
89      IF( .NOT.ln_trcdta ) THEN
90         ln_trc_ini(:) = .FALSE.
91      ENDIF
92
93     IF(lwp) THEN                   ! control print
94         WRITE(numout,*)
95         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc'
96         WRITE(numout,*) '   Read inputs data from file (y/n)             ln_trcdta     = ', ln_trcdta
97         WRITE(numout,*) '   Damping of passive tracer (y/n)              ln_trcdmp     = ', ln_trcdmp
98         WRITE(numout,*) '   Restoring of tracer on closed seas           ln_trcdmp_clo = ', ln_trcdmp_clo
99         WRITE(numout,*) ' '
100         DO jn = 1, jptra
101            WRITE(numout,*) '  tracer nb : ', jn, '    short name : ', ctrcnm(jn)
102         END DO
103         WRITE(numout,*) ' '
104      ENDIF
105
106      IF(lwp) THEN                   ! control print
107         IF( ln_rsttr ) THEN
108            WRITE(numout,*)
109            WRITE(numout,*) '  Read a restart file for passive tracer : ', TRIM( cn_trcrst_in )
110            WRITE(numout,*)
111         ENDIF
112         IF( ln_trcdta .AND. .NOT.ln_rsttr ) THEN
113            WRITE(numout,*)
114            WRITE(numout,*) '  Some of the passive tracers are initialised from climatologies '
115            WRITE(numout,*)
116         ENDIF
117         IF( .NOT.ln_trcdta ) THEN
118            WRITE(numout,*)
119            WRITE(numout,*) '  All the passive tracers are initialised with constant values '
120            WRITE(numout,*)
121         ENDIF
122      ENDIF
123
124     
125      rdttrc(:) = rdttra(:) * FLOAT( nn_dttrc )   ! vertical profile of passive tracer time-step
126 
127      IF(lwp) THEN                   ! control print
128        WRITE(numout,*) 
129        WRITE(numout,*) '    Passive Tracer  time step    rdttrc  = ', rdttrc(1)
130        WRITE(numout,*) 
131      ENDIF
132
133
134#if defined key_trdmxl_trc || defined key_trdtrc
135
136         REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_trd in reference namelist : Passive tracer trends
137         READ  ( numnat_ref, namtrc_trd, IOSTAT = ios, ERR = 905)
138905      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_trd in reference namelist', lwp )
139
140         REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_trd in configuration namelist : Passive tracer trends
141         READ  ( numnat_cfg, namtrc_trd, IOSTAT = ios, ERR = 906 )
142906      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_trd in configuration namelist', lwp )
143         IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_trd )
144
145         IF(lwp) THEN
146            WRITE(numout,*)
147            WRITE(numout,*) ' trd_mxl_trc_init : read namelist namtrc_trd                    '
148            WRITE(numout,*) ' ~~~~~~~~~~~~~~~~                                               '
149            WRITE(numout,*) '   * frequency of trends diagnostics   nn_trd_trc             = ', nn_trd_trc
150            WRITE(numout,*) '   * control surface type              nn_ctls_trc            = ', nn_ctls_trc
151            WRITE(numout,*) '   * restart for ML diagnostics        ln_trdmxl_trc_restart  = ', ln_trdmxl_trc_restart
152            WRITE(numout,*) '   * flag to diagnose trends of                                 '
153            WRITE(numout,*) '     instantantaneous or mean ML T/S   ln_trdmxl_trc_instant  = ', ln_trdmxl_trc_instant
154            WRITE(numout,*) '   * unit conversion factor            rn_ucf_trc             = ', rn_ucf_trc
155            DO jn = 1, jptra
156               IF( ln_trdtrc(jn) ) WRITE(numout,*) '    compute ML trends for tracer number :', jn
157            END DO
158         ENDIF
159#endif
160
161
162      ! Call the ice module for tracers
163      ! -------------------------------
164      CALL trc_nam_ice
165
166      ! namelist of SMS
167      ! ---------------     
168      IF( lk_pisces  ) THEN   ;   CALL trc_nam_pisces      ! PISCES  bio-model
169      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          PISCES not used'
170      ENDIF
171
172      IF( lk_cfc     ) THEN   ;   CALL trc_nam_cfc         ! CFC     tracers
173      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          CFC not used'
174      ENDIF
175
176      IF( lk_c14b     ) THEN   ;   CALL trc_nam_c14b         ! C14 bomb     tracers
177      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          C14 not used'
178      ENDIF
179
180      IF( lk_my_trc  ) THEN   ;   CALL trc_nam_my_trc      ! MY_TRC  tracers
181      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          MY_TRC not used'
182      ENDIF
183
184      ! +++>>> FABM
185      IF( lk_fabm    ) THEN   ;   CALL trc_nam_fabm        ! FABM tracers
186      ELSE                    ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '          FABM not used'
187      ENDIF
188      ! FABM <<<+++
189      !
190   END SUBROUTINE trc_nam
191
192   SUBROUTINE trc_nam_run
193      !!---------------------------------------------------------------------
194      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
195      !!
196      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer run (namelist)
197      !!
198      !!---------------------------------------------------------------------
199      NAMELIST/namtrc_run/ nn_dttrc, nn_writetrc, ln_rsttr, nn_rsttr, ln_top_euler, &
200        &                  cn_trcrst_indir, cn_trcrst_outdir, cn_trcrst_in, cn_trcrst_out
201
202
203      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
204
205      !!---------------------------------------------------------------------
206
207
208      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_run : read the passive tracer namelists'
209      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
210
211      CALL ctl_opn( numnat_ref, 'namelist_top_ref'   , 'OLD'    , 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE. )
212      CALL ctl_opn( numnat_cfg, 'namelist_top_cfg'   , 'OLD'    , 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE. )
213      IF(lwm) CALL ctl_opn( numont, 'output.namelist.top', 'UNKNOWN', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, .FALSE., 1 )
214
215      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc in reference namelist : Passive tracer variables
216      READ  ( numnat_ref, namtrc_run, IOSTAT = ios, ERR = 901)
217901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in reference namelist', lwp )
218
219      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc in configuration namelist : Passive tracer variables
220      READ  ( numnat_cfg, namtrc_run, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
221902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in configuration namelist', lwp )
222      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_run )
223
224      !  computes the first time step of tracer model
225      nittrc000 = nit000 + nn_dttrc - 1
226
227      IF(lwp) THEN                   ! control print
228         WRITE(numout,*)
229         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc_run'
230         WRITE(numout,*) '   time step freq. for passive tracer           nn_dttrc      = ', nn_dttrc
231         WRITE(numout,*) '   restart  for passive tracer                  ln_rsttr      = ', ln_rsttr
232         WRITE(numout,*) '   control of time step for passive tracer      nn_rsttr      = ', nn_rsttr
233         WRITE(numout,*) '   first time step for pass. trac.              nittrc000     = ', nittrc000
234         WRITE(numout,*) '   frequency of outputs for passive tracers     nn_writetrc   = ', nn_writetrc 
235         WRITE(numout,*) '   Use euler integration for TRC (y/n)          ln_top_euler  = ', ln_top_euler
236         WRITE(numout,*) ' '
237      ENDIF
238      !
239    END SUBROUTINE trc_nam_run
240
241   SUBROUTINE trc_nam_ice
242      !!---------------------------------------------------------------------
243      !!                     ***  ROUTINE trc_nam_ice ***
244      !!
245      !! ** Purpose :   Read the namelist for the ice effect on tracers
246      !!
247      !! ** Method  : -
248      !!
249      !!---------------------------------------------------------------------
250      ! --- Variable declarations --- !
251      INTEGER :: jn      ! dummy loop indices
252      INTEGER :: ios     ! Local integer output status for namelist read
253
254      ! --- Namelist declarations --- !
255      ! --->>> FABM
256      !TYPE(TRC_I_NML), DIMENSION(jptra) :: sn_tri_tracer
257      ! FABM <<<---
258      ! +++>>> FABM
259      TYPE(TRC_I_NML), DIMENSION(jpmaxtrc) :: sn_tri_tracer
260      ! FABM <<<+++
261      NAMELIST/namtrc_ice/ nn_ice_tr, sn_tri_tracer
262
263      IF(lwp) THEN
264         WRITE(numout,*)
265         WRITE(numout,*) 'trc_nam_ice : Read the namelist for trc_ice'
266         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~'
267      ENDIF
268
269      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('trc_nam_ice')
270
271      !
272      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_ice in reference namelist : Passive tracer input data
273      READ  ( numnat_ref, namtrc_ice, IOSTAT = ios, ERR = 901)
274 901  IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , ' namtrc_ice in reference namelist ', lwp )
275
276      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_ice in configuration namelist : Pisces external sources of nutrients
277      READ  ( numnat_cfg, namtrc_ice, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
278 902  IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_ice in configuration namelist', lwp )
279
280      IF( lwp ) THEN
281         WRITE(numout,*) ' '
282         WRITE(numout,*) ' Sea ice tracers option (nn_ice_tr) : ', nn_ice_tr
283         WRITE(numout,*) ' '
284      ENDIF
285
286      ! Assign namelist stuff
287      DO jn = 1, jptra
288         trc_ice_ratio(jn)  = sn_tri_tracer(jn)%trc_ratio
289         trc_ice_prescr(jn) = sn_tri_tracer(jn)%trc_prescr
290         cn_trc_o      (jn) = sn_tri_tracer(jn)%ctrc_o
291      END DO
292
293      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_stop('trc_nam_ice')
294      !
295   END SUBROUTINE trc_nam_ice
296
297   SUBROUTINE trc_nam_trc
298      !!---------------------------------------------------------------------
299      !!                     ***  ROUTINE trc_nam  ***
300      !!
301      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer run (namelist)
302      !!
303      !!---------------------------------------------------------------------
304      ! --->>> FABM
305      !TYPE(PTRACER), DIMENSION(jptra) :: sn_tracer  ! type of tracer for saving if not key_iomput
306      ! FABM <<<---
307      ! +++>>> FABM
308      TYPE(PTRACER), DIMENSION(jpmaxtrc) :: sn_tracer  ! type of tracer for saving if not key_iomput
309      ! FABM <<<+++
310      !!
311      NAMELIST/namtrc/ sn_tracer, ln_trcdta, ln_trcdmp, ln_trcdmp_clo
312 
313      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
314      INTEGER  ::   jn                  ! dummy loop indice
315      !!---------------------------------------------------------------------
316      IF(lwp) WRITE(numout,*)
317      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_trc : read the passive tracer namelists'
318      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
319
320      ! Initialise logical flags to .FALSE.:
321      sn_tracer(:)%llinit = .FALSE.
322      sn_tracer(:)%llsave = .FALSE.
323#ifdef key_fabm
324      sn_tracer(:)%llsbc = .FALSE.
325      sn_tracer(:)%llcbc = .FALSE.
326      sn_tracer(:)%llcbc = .FALSE.
327#endif
328
329      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc in reference namelist : Passive tracer variables
330      READ  ( numnat_ref, namtrc, IOSTAT = ios, ERR = 901)
331901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in reference namelist', lwp )
332
333      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc in configuration namelist : Passive tracer variables
334      READ  ( numnat_cfg, namtrc, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
335902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc in configuration namelist', lwp )
336      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc )
337
338      DO jn = 1, jptra
339         ctrcnm    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%clsname )
340         ctrcln    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%cllname )
341         ctrcun    (jn) = TRIM( sn_tracer(jn)%clunit  )
342         ln_trc_ini(jn) =       sn_tracer(jn)%llinit
343! --->>> FABM
344!!#if defined key_my_trc
345! FABM <<<---
346! +++>>> FABM
347#if defined key_fabm
348! FABM <<<+++
349         ln_trc_sbc(jn) =       sn_tracer(jn)%llsbc
350         ln_trc_cbc(jn) =       sn_tracer(jn)%llcbc
351         ln_trc_obc(jn) =       sn_tracer(jn)%llobc
352#endif
353         ln_trc_wri(jn) =       sn_tracer(jn)%llsave
354      END DO
355     
356      ! +++>>> FABM
357      if (lk_fabm) CALL trc_nam_fabm_override
358      ! FABM <<<+++
359    END SUBROUTINE trc_nam_trc
360
361
362   SUBROUTINE trc_nam_dia
363      !!---------------------------------------------------------------------
364      !!                     ***  ROUTINE trc_nam_dia  ***
365      !!
366      !! ** Purpose :   read options for the passive tracer diagnostics
367      !!
368      !! ** Method  : - read passive tracer namelist
369      !!              - read namelist of each defined SMS model
370      !!                ( (PISCES, CFC, MY_TRC )
371      !!---------------------------------------------------------------------
372      INTEGER ::  ierr
373#if defined key_trdmxl_trc  || defined key_trdtrc
374!     NAMELIST/namtrc_trd/ nn_trd_trc, nn_ctls_trc, rn_ucf_trc, &
375!        &                ln_trdmxl_trc_restart, ln_trdmxl_trc_instant, &
376!        &                cn_trdrst_trc_in, cn_trdrst_trc_out, ln_trdtrc
377#endif
378      NAMELIST/namtrc_dia/ ln_diatrc, ln_diabio, nn_writedia, nn_writebio
379
380      INTEGER  ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
381      !!---------------------------------------------------------------------
382
383      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
384      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_dia : read the passive tracer diagnostics options'
385      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
386
387      IF(lwp) WRITE(numout,*)
388      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_nam_dia : read the passive tracer diagnostics options'
389      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
390
391      REWIND( numnat_ref )              ! Namelist namtrc_dia in reference namelist : Passive tracer diagnostics
392      READ  ( numnat_ref, namtrc_dia, IOSTAT = ios, ERR = 903)
393903   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_dia in reference namelist', lwp )
394
395      REWIND( numnat_cfg )              ! Namelist namtrc_dia in configuration namelist : Passive tracer diagnostics
396      READ  ( numnat_cfg, namtrc_dia, IOSTAT = ios, ERR = 904 )
397904   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namtrc_dia in configuration namelist', lwp )
398      IF(lwm) WRITE ( numont, namtrc_dia )
399
400      IF(lwp) THEN
401         WRITE(numout,*)
402         WRITE(numout,*)
403         WRITE(numout,*) ' Namelist : namtrc_dia'
404         WRITE(numout,*) '    save additionnal diagnostics arrays         ln_diatrc   = ', ln_diatrc
405         WRITE(numout,*) '    save additionnal biology diagnostics arrays ln_diabio   = ', ln_diabio
406         WRITE(numout,*) '    frequency of outputs for additional arrays  nn_writedia = ', nn_writedia
407         WRITE(numout,*) '    frequency of outputs for biological trends  nn_writebio = ', nn_writebio
408         WRITE(numout,*) ' '
409      ENDIF
410
411      IF( ln_diatrc .AND. .NOT. lk_iomput ) THEN
412         ALLOCATE( trc2d(jpi,jpj,jpdia2d), trc3d(jpi,jpj,jpk,jpdia3d),  &
413           &       ctrc2d(jpdia2d), ctrc2l(jpdia2d), ctrc2u(jpdia2d) ,  & 
414           &       ctrc3d(jpdia3d), ctrc3l(jpdia3d), ctrc3u(jpdia3d) ,  STAT = ierr ) 
415         IF( ierr > 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'trcnam: unable to allocate add. diag. array' )
416         !
417         trc2d(:,:,:  ) = 0._wp  ;   ctrc2d(:) = ' '   ;   ctrc2l(:) = ' '    ;    ctrc2u(:) = ' ' 
418         trc3d(:,:,:,:) = 0._wp  ;   ctrc3d(:) = ' '   ;   ctrc3l(:) = ' '    ;    ctrc3u(:) = ' ' 
419         !
420      ENDIF
421
422      IF( ( ln_diabio .AND. .NOT. lk_iomput ) .OR. l_trdtrc ) THEN
423         ALLOCATE( trbio (jpi,jpj,jpk,jpdiabio) , &
424           &       ctrbio(jpdiabio), ctrbil(jpdiabio), ctrbiu(jpdiabio), STAT = ierr ) 
425         IF( ierr > 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'trcnam: unable to allocate bio. diag. array' )
426         !
427         trbio(:,:,:,:) = 0._wp  ;   ctrbio(:) = ' '   ;   ctrbil(:) = ' '    ;    ctrbiu(:) = ' ' 
428         !
429      ENDIF
430      !
431   END SUBROUTINE trc_nam_dia
432
433#else
434   !!----------------------------------------------------------------------
435   !!  Dummy module :                                     No passive tracer
436   !!----------------------------------------------------------------------
437CONTAINS
438   SUBROUTINE trc_nam                      ! Empty routine   
439   END SUBROUTINE trc_nam
440   SUBROUTINE trc_nam_run                      ! Empty routine   
441   END SUBROUTINE trc_nam_run
442#endif
443
444   !!----------------------------------------------------------------------
445   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
446   !! $Id$
447   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
448   !!======================================================================
449END MODULE trcnam
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.