source: branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA/bio_medusa_fin.F90 @ 8521

Last change on this file since 8521 was 8521, checked in by marc, 3 years ago

gmed:#346 Merging branches/NERC/dev_r5518_GO6_MEDUSA_conserv

File size: 35.1 KB
Line 
1MODULE bio_medusa_fin_mod
2   !!======================================================================
3   !!                         ***  MODULE bio_medusa_fin_mod  ***
4   !! Finalisation for TRC_BIO_MEDUSA
5   !!======================================================================
6   !! History :
7   !!   -   ! 2017-04 (M. Stringer)        Code taken from trcbio_medusa.F90
8   !!   -   ! 2017-08 (A. Yool)            Amend bethic reservoir updating
9   !!----------------------------------------------------------------------
10#if defined key_medusa
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!                                                   MEDUSA bio-model
13   !!----------------------------------------------------------------------
14
15   IMPLICIT NONE
16   PRIVATE
17     
18   PUBLIC   bio_medusa_fin     ! Called in trcbio_medusa.F90
19
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   !! NEMO/TOP 2.0 , LOCEAN-IPSL (2007)
22   !! $Id$
23   !! Software governed by the CeCILL licence (modipsl/doc/NEMO_CeCILL.txt)
24   !!----------------------------------------------------------------------
25
26CONTAINS
27
28   SUBROUTINE bio_medusa_fin( kt )
29      !!---------------------------------------------------------------------
30      !!                     ***  ROUTINE bio_medusa_fin  ***
31      !! This called from TRC_BIO_MEDUSA and
32      !!  - ...
33      !!----------------------------------------------------------------------
34      USE bio_medusa_mod
35      USE dom_oce,           ONLY: atfp, atfp1, neuler, rdt, e3t_n, tmask
36      USE in_out_manager,    ONLY: lwp, numout
37# if defined key_iomput
38      USE iom,               ONLY: iom_put, lk_iomput
39# endif
40      USE lbclnk,            ONLY: lbc_lnk
41      USE par_medusa,        ONLY: jp_medusa_2d, jp_medusa_3d,          &
42                                   jp_medusa_trd
43      USE par_oce,           ONLY: jpi, jpim1, jpj, jpjm1, jpk
44      USE phycst,            ONLY: rsmall
45      USE sms_medusa,        ONLY: jinorgben, jorgben,                  &
46                                   f3_co3, f3_h2co3, f3_hco3,           &
47                                   f3_omarg, f3_omcal, f3_pH,           &
48                                   za_sed_c, za_sed_ca, za_sed_fe,      &
49                                   za_sed_n, za_sed_si,                 &
50                                   zb_sed_c, zb_sed_ca, zb_sed_fe,      &
51                                   zb_sed_n, zb_sed_si,                 &
52                                   zn_sed_c, zn_sed_ca, zn_sed_fe,      &
53                                   zn_sed_n, zn_sed_si
54      USE trc,               ONLY: med_diag, nittrc000 
55      USE trcnam_trp,        ONLY: ln_trcadv_cen2, ln_trcadv_tvd
56 
57      !! time (integer timestep)
58      INTEGER, INTENT( in ) ::    kt
59
60      INTEGER :: ji, jj
61      INTEGER :: jn
62
63      REAL(wp) :: fq0,fq1,fq2,fq3
64
65# if defined key_roam                     
66      !!----------------------------------------------------------------------
67      !! AXY (09/08/17): fix benthic submodel
68      !!----------------------------------------------------------------------
69      !! Process benthic in/out fluxes
70      !! These can be handled outside of the 3D calculations since the
71      !! benthic pools (and fluxes) are 2D in nature; this code was
72      !! developed with help from George Nurser (NOC); it cannot be run
73      !! in a configuration with variable time-stepping with depth
74      !!----------------------------------------------------------------------
75      !!
76      !! time-step calculation
77      if (jorgben.eq.1) then
78         za_sed_n(:,:)  = zb_sed_n(:,:)  + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
79                          ( f_sbenin_n(:,:)  + f_fbenin_n(:,:)  - f_benout_n(:,:)  ))
80         za_sed_fe(:,:) = zb_sed_fe(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
81                          ( f_sbenin_fe(:,:) + f_fbenin_fe(:,:) - f_benout_fe(:,:) ))
82         za_sed_c(:,:)  = zb_sed_c(:,:)  + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
83                          ( f_sbenin_c(:,:)  + f_fbenin_c(:,:)  - f_benout_c(:,:)  ))
84      endif
85      if (jinorgben.eq.1) then
86         za_sed_si(:,:) = zb_sed_si(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
87                          ( f_fbenin_si(:,:) - f_benout_si(:,:) ))
88         za_sed_ca(:,:) = zb_sed_ca(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
89                          ( f_fbenin_ca(:,:) - f_benout_ca(:,:) ))
90      endif
91      !!
92      !! time-level calculation
93      if (jorgben.eq.1) then
94         zb_sed_n(:,:)  = zn_sed_n(:,:)  + (atfp * &
95                          ( za_sed_n(:,:)  - (2. * zn_sed_n(:,:))  + zb_sed_n(:,:)  ))
96         zn_sed_n(:,:)  = za_sed_n(:,:)
97         zb_sed_fe(:,:) = zn_sed_fe(:,:) + (atfp * &
98                          ( za_sed_fe(:,:) - (2. * zn_sed_fe(:,:)) + zb_sed_fe(:,:) ))
99         zn_sed_fe(:,:) = za_sed_fe(:,:)
100         zb_sed_c(:,:)  = zn_sed_c(:,:)  + (atfp * &
101                          ( za_sed_c(:,:)  - (2. * zn_sed_c(:,:))  + zb_sed_c(:,:)  ))
102         zn_sed_c(:,:)  = za_sed_c(:,:)
103      endif
104      if (jinorgben.eq.1) then
105         zb_sed_si(:,:) = zn_sed_si(:,:) + (atfp * &
106                          ( za_sed_si(:,:) - (2. * zn_sed_si(:,:)) + zb_sed_si(:,:) ))
107         zn_sed_si(:,:) = za_sed_si(:,:)
108         zb_sed_ca(:,:) = zn_sed_ca(:,:) + (atfp * &
109                          ( za_sed_ca(:,:) - (2. * zn_sed_ca(:,:)) + zb_sed_ca(:,:) ))
110         zn_sed_ca(:,:) = za_sed_ca(:,:)
111      endif
112# endif     
113
114#  if defined key_debug_medusa
115         !! AXY (12/07/17)
116         !!-----------------------------------------------------------------
117         !! Check conservation of MEDUSA's sinks-minus-sources using fflx_X
118         !! diagnostics (i.e. biogeochemical processes only)
119         !!   - fflx_X diagnostics *should* include all transfers between
120         !!     modelled components
121         !!   - they should also include gains / losses due to air-sea
122         !!     fluxes of C and O2, aeolian and seafloor inputs of Fe, and
123         !!     inputs from seafloor "benthic buckets" (N, Si, Fe, C and
124         !!     alkalinity)
125         !!   - however, they do not include the transfer of material to
126         !!     "benthic buckets" by sedimenting slow- and fast-sinking
127         !!     detritus since these are separate 2D reservoirs
128         !!   - consequently, for a given water column, the integrated
129         !!     fluxes should sum to the "loss" of material to the "benthic
130         !!     buckets"
131         !!   - if they do not, this suggests that MEDUSA contains errors
132         !!     in its accounting (e.g. processes omitted from calculated
133         !!     fluxes)
134         !!   - here, the local integrated fluxes and benthic inputs (plus
135         !!     air-sea fluxes in the case of C) are reported together with
136         !!     the resulting error
137         !!   - only N, Si, C and alkalinity inventories considered; Fe and
138         !!     O2 overlooked because of wholesale loss (and addition, in
139         !!     the case of O2) of these tracers within the water column
140         !!-----------------------------------------------------------------
141         !!
142         !! nitrogen
143         DO jj = 2,jpjm1
144            DO ji = 2,jpim1
145               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
146                  fq0 = fflx_n(ji,jj)
147                  fq1 = f_sbenin_n(ji,jj) + f_fbenin_n(ji,jj)
148                  fq2 = fq0 + fq1
149                  fq3 = f_benout_n(ji,jj)
150                  if (lwp) write (numout,'a,2i3,a,4f15,5)')                   &
151                     'AXY N   cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',      &
152                     fq0,fq1,fq2,fq3
153               ENDIF
154            ENDDO
155         ENDDO   
156         !! silicon
157         DO jj = 2,jpjm1
158            DO ji = 2,jpim1
159               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
160                  fq0 = fflx_si(ji,jj)
161                  fq1 = f_fbenin_si(ji,jj)
162                  fq2 = fq0 + fq1
163                  fq3 = f_benout_si(ji,jj)
164                  if (lwp) write (numout,'a,2i3,a,4f15,5)')                   &
165                     'AXY Si  cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',     &
166                     fq0,fq1,fq2,fq3
167               ENDIF
168            ENDDO
169         ENDDO   
170         !! carbon
171         DO jj = 2,jpjm1
172            DO ji = 2,jpim1
173               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
174                  fq0 = fflx_c(ji,jj)
175                  fq1 = f_sbenin_c(ji,jj) + f_fbenin_c(ji,jj) + f_fbenin_ca(ji,jj)
176                  fq2 = f_co2flux(ji,jj) * fse3t(ji,jj,1)
177                  fq3 = fq0 + fq1
178                  fq4 = f_benout_c(ji,jj) + f_benout_ca(ji,jj)
179                  if (lwp) write (numout,'a,2i3,a,5f15,5)')                   &
180                     'AXY C   cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,asf,err,out)=', &
181                     fq0,fq1,fq2,fq3,fq4
182                ENDIF
183             ENDDO
184          ENDDO   
185          !! alkalinity
186          DO jj = 2,jpjm1
187             DO ji = 2,jpim1
188                if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
189                   fq0 = fflx_a(ji,jj)
190                   fq1 = 2.0 * f_fbenin_ca(ji,jj)
191                   fq2 = fq0 + fq1
192                   fq3 = 2.0 * f_benout_ca(ji,jj)
193                   if (lwp) write (numout,'a,2i3,a,4f15,5)')                   &
194                      'AXY alk cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',     &
195                      fq0,fq1,fq2,fq3
196               ENDIF
197            ENDDO
198         ENDDO   
199#  endif
200
201         !!!---------------------------------------------------------------
202         !! Add very last diag calculations
203         !!!---------------------------------------------------------------
204         DO jj = 2,jpjm1
205            DO ji = 2,jpim1
206               !!         
207               IF( med_diag%PN_JLIM%dgsave ) THEN
208                  fjln2d(ji,jj) = fjln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
209               ENDIF
210               IF( med_diag%PN_NLIM%dgsave ) THEN
211                  fnln2d(ji,jj) = fnln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
212               ENDIF
213               IF( med_diag%PN_FELIM%dgsave ) THEN
214                  ffln2d(ji,jj) = ffln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
215               ENDIF
216               IF( med_diag%PD_JLIM%dgsave ) THEN
217                  fjld2d(ji,jj) = fjld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
218               ENDIF
219               IF( med_diag%PD_NLIM%dgsave ) THEN
220                  fnld2d(ji,jj) = fnld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
221               ENDIF
222               IF( med_diag%PD_FELIM%dgsave ) THEN
223                  ffld2d(ji,jj) = ffld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
224               ENDIF
225               IF( med_diag%PD_SILIM%dgsave ) THEN
226                  fsld2d2(ji,jj) = fsld2d2(ji,jj) / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
227               ENDIF
228               IF( med_diag%PDSILIM2%dgsave ) THEN
229                  fsld2d(ji,jj) = fsld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
230               ENDIF
231            ENDDO
232         ENDDO
233         !!----------------------------------------------------------------
234         !! Add in XML diagnostics stuff
235         !!----------------------------------------------------------------
236         !!
237         !! ** 2D diagnostics
238#   if defined key_debug_medusa
239         IF (lwp) write (numout,*) 'bio_medusa_fin: export all diag kt = ', kt
240         CALL flush(numout)
241#   endif
242         IF ( med_diag%INVTN%dgsave ) THEN
243            CALL iom_put( "INVTN"  , ftot_n )
244         ENDIF
245         IF ( med_diag%INVTSI%dgsave ) THEN
246            CALL iom_put( "INVTSI"  , ftot_si )
247         ENDIF
248         IF ( med_diag%INVTFE%dgsave ) THEN
249            CALL iom_put( "INVTFE"  , ftot_fe )
250         ENDIF                           
251         IF ( med_diag%ML_PRN%dgsave ) THEN
252            CALL iom_put( "ML_PRN"  , fprn_ml )
253         ENDIF
254         IF ( med_diag%ML_PRD%dgsave ) THEN
255            CALL iom_put( "ML_PRD"  , fprd_ml )
256         ENDIF
257         IF ( med_diag%OCAL_LVL%dgsave ) THEN
258            CALL iom_put( "OCAL_LVL"  , fccd )
259         ENDIF
260         IF ( med_diag%CHL_MLD%dgsave ) THEN
261            CALL iom_put( "CHL_MLD"  , fchl_ml )
262         ENDIF
263         IF ( med_diag%PN_JLIM%dgsave ) THEN
264            CALL iom_put( "PN_JLIM"  , fjln2d )
265            DEALLOCATE( fjln2d )
266         ENDIF
267         IF ( med_diag%PN_NLIM%dgsave ) THEN
268            CALL iom_put( "PN_NLIM"  , fnln2d )
269            DEALLOCATE( fnln2d )
270         ENDIF
271         IF ( med_diag%PN_FELIM%dgsave ) THEN
272            CALL iom_put( "PN_FELIM"  , ffln2d )
273            DEALLOCATE( ffln2d )
274         ENDIF
275         IF ( med_diag%PD_JLIM%dgsave ) THEN
276            CALL iom_put( "PD_JLIM"  , fjld2d )
277            DEALLOCATE( fjld2d )
278         ENDIF
279         IF ( med_diag%PD_NLIM%dgsave ) THEN
280            CALL iom_put( "PD_NLIM"  , fnld2d )
281            DEALLOCATE( fnld2d )
282         ENDIF
283         IF ( med_diag%PD_FELIM%dgsave ) THEN
284            CALL iom_put( "PD_FELIM"  , ffld2d )
285            DEALLOCATE( ffld2d )
286         ENDIF
287         IF ( med_diag%PD_SILIM%dgsave ) THEN
288            CALL iom_put( "PD_SILIM"  , fsld2d2 )
289            DEALLOCATE( fsld2d2 )
290         ENDIF
291         IF ( med_diag%PDSILIM2%dgsave ) THEN
292            CALL iom_put( "PDSILIM2"  , fsld2d )
293            DEALLOCATE( fsld2d )
294         ENDIF
295         IF ( med_diag%INTFLX_N%dgsave ) THEN
296            CALL iom_put( "INTFLX_N"  , fflx_n )
297         ENDIF
298         IF ( med_diag%INTFLX_SI%dgsave ) THEN
299            CALL iom_put( "INTFLX_SI"  , fflx_si )
300         ENDIF
301         IF ( med_diag%INTFLX_FE%dgsave ) THEN
302            CALL iom_put( "INTFLX_FE"  , fflx_fe )
303         ENDIF       
304         IF ( med_diag%INT_PN%dgsave ) THEN
305            CALL iom_put( "INT_PN"  , ftot_pn )
306         ENDIF
307         IF ( med_diag%INT_PD%dgsave ) THEN
308            CALL iom_put( "INT_PD"  , ftot_pd )
309         ENDIF         
310         IF ( med_diag%INT_ZMI%dgsave ) THEN
311            CALL iom_put( "INT_ZMI"  , ftot_zmi )
312         ENDIF
313         IF ( med_diag%INT_ZME%dgsave ) THEN
314            CALL iom_put( "INT_ZME"  , ftot_zme )
315         ENDIF
316         IF ( med_diag%INT_DET%dgsave ) THEN
317            CALL iom_put( "INT_DET"  , ftot_det )
318         ENDIF
319         IF ( med_diag%INT_DTC%dgsave ) THEN
320            CALL iom_put( "INT_DTC"  , ftot_dtc )
321         ENDIF
322         IF ( med_diag%BEN_N%dgsave ) THEN
323            CALL iom_put( "BEN_N"  , za_sed_n )
324         ENDIF
325         IF ( med_diag%BEN_FE%dgsave ) THEN
326            CALL iom_put( "BEN_FE"  , za_sed_fe )
327         ENDIF
328         IF ( med_diag%BEN_C%dgsave ) THEN
329            CALL iom_put( "BEN_C"  , za_sed_c )
330         ENDIF
331         IF ( med_diag%BEN_SI%dgsave ) THEN
332            CALL iom_put( "BEN_SI"  , za_sed_si )
333         ENDIF
334         IF ( med_diag%BEN_CA%dgsave ) THEN
335            CALL iom_put( "BEN_CA"  , za_sed_ca )
336         ENDIF
337         IF ( med_diag%RUNOFF%dgsave ) THEN
338            CALL iom_put( "RUNOFF"  , f_runoff )
339         ENDIF 
340# if defined key_roam       
341         IF ( med_diag%N_PROD%dgsave ) THEN
342            CALL iom_put( "N_PROD"  , fnit_prod )
343         ENDIF
344         IF ( med_diag%N_CONS%dgsave ) THEN
345            CALL iom_put( "N_CONS"  , fnit_cons )
346         ENDIF
347         IF ( med_diag%C_PROD%dgsave ) THEN
348            CALL iom_put( "C_PROD"  , fcar_prod )
349         ENDIF
350         IF ( med_diag%C_CONS%dgsave ) THEN
351            CALL iom_put( "C_CONS"  , fcar_cons )
352         ENDIF
353         IF ( med_diag%O2_PROD%dgsave ) THEN
354            CALL iom_put( "O2_PROD"  , foxy_prod )
355         ENDIF
356         IF ( med_diag%O2_CONS%dgsave ) THEN
357            CALL iom_put( "O2_CONS"  , foxy_cons )
358         ENDIF
359         IF ( med_diag%O2_ANOX%dgsave ) THEN
360            CALL iom_put( "O2_ANOX"  , foxy_anox )
361         ENDIF
362         IF ( med_diag%INVTC%dgsave ) THEN
363            CALL iom_put( "INVTC"  , ftot_c )
364         ENDIF
365         IF ( med_diag%INVTALK%dgsave ) THEN
366            CALL iom_put( "INVTALK"  , ftot_a )
367         ENDIF
368         IF ( med_diag%INVTO2%dgsave ) THEN
369            CALL iom_put( "INVTO2"  , ftot_o2 )
370         ENDIF
371         IF ( med_diag%COM_RESP%dgsave ) THEN
372            CALL iom_put( "COM_RESP"  , fcomm_resp )
373         ENDIF         
374# endif     
375         !!
376         !! diagnostic filled in the i-j-k main loop
377         !!--------------------------------------------
378         IF ( med_diag%PRN%dgsave ) THEN
379            CALL iom_put( "PRN"  , fprn2d )
380            DEALLOCATE( fprn2d )
381         ENDIF
382         IF ( med_diag%MPN%dgsave ) THEN
383            CALL iom_put( "MPN"  ,fdpn2d )
384            DEALLOCATE( fdpn2d )
385         ENDIF
386         IF ( med_diag%PRD%dgsave ) THEN
387            CALL iom_put( "PRD"  ,fprd2d )
388            DEALLOCATE( fprd2d )
389         ENDIF
390         IF( med_diag%MPD%dgsave ) THEN
391            CALL iom_put( "MPD"  , fdpd2d )
392            DEALLOCATE( fdpd2d )
393         ENDIF
394         !  IF( med_diag%DSED%dgsave ) THEN
395         !      CALL iom_put( "DSED"  , ftot_n )
396         !  ENDIF
397         IF( med_diag%OPAL%dgsave ) THEN
398            CALL iom_put( "OPAL"  , fprds2d )
399            DEALLOCATE( fprds2d )
400         ENDIF
401         IF( med_diag%OPALDISS%dgsave ) THEN
402            CALL iom_put( "OPALDISS"  , fsdiss2d )
403            DEALLOCATE( fsdiss2d )
404         ENDIF
405         IF( med_diag%GMIPn%dgsave ) THEN
406            CALL iom_put( "GMIPn"  , fgmipn2d )
407            DEALLOCATE( fgmipn2d )
408         ENDIF
409         IF( med_diag%GMID%dgsave ) THEN
410            CALL iom_put( "GMID"  , fgmid2d )
411            DEALLOCATE( fgmid2d )
412         ENDIF
413         IF( med_diag%MZMI%dgsave ) THEN
414            CALL iom_put( "MZMI"  , fdzmi2d )
415            DEALLOCATE( fdzmi2d )
416         ENDIF
417         IF( med_diag%GMEPN%dgsave ) THEN
418            CALL iom_put( "GMEPN"  , fgmepn2d )
419            DEALLOCATE( fgmepn2d )
420         ENDIF
421         IF( med_diag%GMEPD%dgsave ) THEN
422            CALL iom_put( "GMEPD"  , fgmepd2d )
423            DEALLOCATE( fgmepd2d )
424         ENDIF
425         IF( med_diag%GMEZMI%dgsave ) THEN
426            CALL iom_put( "GMEZMI"  , fgmezmi2d )
427            DEALLOCATE( fgmezmi2d )
428         ENDIF
429         IF( med_diag%GMED%dgsave ) THEN
430            CALL iom_put( "GMED"  , fgmed2d )
431            DEALLOCATE( fgmed2d )
432         ENDIF
433         IF( med_diag%MZME%dgsave ) THEN
434            CALL iom_put( "MZME"  , fdzme2d )
435            DEALLOCATE( fdzme2d )
436         ENDIF
437         !  IF( med_diag%DEXP%dgsave ) THEN
438         !      CALL iom_put( "DEXP"  , ftot_n )
439         !  ENDIF
440         IF( med_diag%DETN%dgsave ) THEN
441            CALL iom_put( "DETN"  , fslown2d )
442            DEALLOCATE( fslown2d )
443         ENDIF
444         IF( med_diag%MDET%dgsave ) THEN
445            CALL iom_put( "MDET"  , fdd2d )
446            DEALLOCATE( fdd2d )
447         ENDIF
448         IF( med_diag%AEOLIAN%dgsave ) THEN
449            CALL iom_put( "AEOLIAN"  , ffetop2d )
450            DEALLOCATE( ffetop2d )
451         ENDIF
452         IF( med_diag%BENTHIC%dgsave ) THEN
453            CALL iom_put( "BENTHIC"  , ffebot2d )
454            DEALLOCATE( ffebot2d )
455         ENDIF
456         IF( med_diag%SCAVENGE%dgsave ) THEN
457            CALL iom_put( "SCAVENGE"  , ffescav2d )
458            DEALLOCATE( ffescav2d )
459         ENDIF
460         !!
461         IF( med_diag%TOTREG_N%dgsave ) THEN
462            CALL iom_put( "TOTREG_N"  , fregen2d )
463            DEALLOCATE( fregen2d )
464         ENDIF
465         IF( med_diag%TOTRG_SI%dgsave ) THEN
466            CALL iom_put( "TOTRG_SI"  , fregensi2d )
467            DEALLOCATE( fregensi2d )
468         ENDIF
469         !!
470         IF( med_diag%FASTN%dgsave ) THEN
471            CALL iom_put( "FASTN"  , ftempn2d )
472            DEALLOCATE( ftempn2d )
473         ENDIF
474         IF( med_diag%FASTSI%dgsave ) THEN
475            CALL iom_put( "FASTSI"  , ftempsi2d )
476            DEALLOCATE( ftempsi2d )
477         ENDIF
478         IF( med_diag%FASTFE%dgsave ) THEN
479            CALL iom_put( "FASTFE"  , ftempfe2d )
480            DEALLOCATE( ftempfe2d )
481         ENDIF
482         IF( med_diag%FASTC%dgsave ) THEN
483            CALL iom_put( "FASTC"  , ftempc2d )
484            DEALLOCATE( ftempc2d )
485         ENDIF
486         IF( med_diag%FASTCA%dgsave ) THEN
487            CALL iom_put( "FASTCA"  , ftempca2d )
488            DEALLOCATE( ftempca2d )
489         ENDIF
490         !!
491         IF( med_diag%REMINN%dgsave ) THEN
492            CALL iom_put( "REMINN"  , freminn2d )
493            DEALLOCATE( freminn2d )
494         ENDIF
495         IF( med_diag%REMINSI%dgsave ) THEN
496            CALL iom_put( "REMINSI"  , freminsi2d )
497            DEALLOCATE( freminsi2d )
498         ENDIF
499         IF( med_diag%REMINFE%dgsave ) THEN
500            CALL iom_put( "REMINFE"  , freminfe2d )
501            DEALLOCATE( freminfe2d )
502         ENDIF
503         IF( med_diag%REMINC%dgsave ) THEN
504            CALL iom_put( "REMINC"  , freminc2d )
505            DEALLOCATE( freminc2d )
506         ENDIF
507         IF( med_diag%REMINCA%dgsave ) THEN
508            CALL iom_put( "REMINCA"  , freminca2d )
509            DEALLOCATE( freminca2d )
510         ENDIF
511         IF( med_diag%SEAFLRN%dgsave ) THEN
512            CALL iom_put( "SEAFLRN"  , fsedn )
513         ENDIF
514         IF( med_diag%SEAFLRSI%dgsave ) THEN
515            CALL iom_put( "SEAFLRSI"  , fsedsi )
516         ENDIF
517         IF( med_diag%SEAFLRFE%dgsave ) THEN
518            CALL iom_put( "SEAFLRFE"  , fsedfe )
519         ENDIF
520         IF( med_diag%SEAFLRC%dgsave ) THEN
521            CALL iom_put( "SEAFLRC"  , fsedc )
522         ENDIF
523         IF( med_diag%SEAFLRCA%dgsave ) THEN
524            CALL iom_put( "SEAFLRCA"  , fsedca )
525         ENDIF
526         !!
527# if defined key_roam           
528         !!
529         IF( med_diag%RIV_N%dgsave ) THEN
530            CALL iom_put( "RIV_N"  , rivn2d )
531            DEALLOCATE( rivn2d )
532         ENDIF
533         IF( med_diag%RIV_SI%dgsave ) THEN
534            CALL iom_put( "RIV_SI"  , rivsi2d )
535            DEALLOCATE( rivsi2d )
536         ENDIF
537         IF( med_diag%RIV_C%dgsave ) THEN
538            CALL iom_put( "RIV_C"  , rivc2d )
539            DEALLOCATE( rivc2d )
540         ENDIF
541         IF( med_diag%RIV_ALK%dgsave ) THEN
542            CALL iom_put( "RIV_ALK"  , rivalk2d )
543            DEALLOCATE( rivalk2d )
544         ENDIF
545         IF( med_diag%DETC%dgsave ) THEN
546            CALL iom_put( "DETC"  , fslowc2d )
547            DEALLOCATE( fslowc2d )
548         ENDIF
549         !!
550         IF( med_diag%PN_LLOSS%dgsave ) THEN
551            CALL iom_put( "PN_LLOSS"  , fdpn22d )
552            DEALLOCATE( fdpn22d )
553         ENDIF
554         IF( med_diag%PD_LLOSS%dgsave ) THEN
555            CALL iom_put( "PD_LLOSS"  , fdpd22d )
556            DEALLOCATE( fdpd22d )
557         ENDIF
558         IF( med_diag%ZI_LLOSS%dgsave ) THEN
559            CALL iom_put( "ZI_LLOSS"  , fdzmi22d )
560             DEALLOCATE( fdzmi22d )
561          ENDIF
562          IF( med_diag%ZE_LLOSS%dgsave ) THEN
563             CALL iom_put( "ZE_LLOSS"  , fdzme22d )
564             DEALLOCATE( fdzme22d )
565          ENDIF
566          IF( med_diag%ZI_MES_N%dgsave ) THEN
567             CALL iom_put( "ZI_MES_N"  , zimesn2d )
568             DEALLOCATE( zimesn2d )
569          ENDIF
570          IF( med_diag%ZI_MES_D%dgsave ) THEN
571             CALL iom_put( "ZI_MES_D"  , zimesd2d )
572             DEALLOCATE( zimesd2d )
573          ENDIF
574          IF( med_diag%ZI_MES_C%dgsave ) THEN
575             CALL iom_put( "ZI_MES_C"  , zimesc2d )
576             DEALLOCATE( zimesc2d )
577          ENDIF
578          IF( med_diag%ZI_MESDC%dgsave ) THEN
579             CALL iom_put( "ZI_MESDC"  ,zimesdc2d )
580             DEALLOCATE( zimesdc2d )
581          ENDIF
582          IF( med_diag%ZI_EXCR%dgsave ) THEN
583             CALL iom_put( "ZI_EXCR"  , ziexcr2d )
584             DEALLOCATE( ziexcr2d )
585          ENDIF
586          IF( med_diag%ZI_RESP%dgsave ) THEN
587             CALL iom_put( "ZI_RESP"  , ziresp2d )
588             DEALLOCATE( ziresp2d )
589          ENDIF
590          IF( med_diag%ZI_GROW%dgsave ) THEN
591             CALL iom_put( "ZI_GROW"  , zigrow2d )
592             DEALLOCATE( zigrow2d )
593          ENDIF
594          IF( med_diag%ZE_MES_N%dgsave ) THEN
595             CALL iom_put( "ZE_MES_N"  , zemesn2d )
596             DEALLOCATE( zemesn2d )
597          ENDIF
598          IF( med_diag%ZE_MES_D%dgsave ) THEN
599             CALL iom_put( "ZE_MES_D"  , zemesd2d )
600             DEALLOCATE( zemesd2d )
601          ENDIF
602          IF( med_diag%ZE_MES_C%dgsave ) THEN
603             CALL iom_put( "ZE_MES_C"  , zemesc2d )
604             DEALLOCATE( zemesc2d )
605          ENDIF
606          IF( med_diag%ZE_MESDC%dgsave ) THEN
607             CALL iom_put( "ZE_MESDC"  , zemesdc2d )
608             DEALLOCATE( zemesdc2d )
609          ENDIF
610          IF( med_diag%ZE_EXCR%dgsave ) THEN
611             CALL iom_put( "ZE_EXCR"  , zeexcr2d )
612             DEALLOCATE( zeexcr2d )
613          ENDIF
614          IF( med_diag%ZE_RESP%dgsave ) THEN
615             CALL iom_put( "ZE_RESP"  , zeresp2d )
616             DEALLOCATE( zeresp2d )
617          ENDIF
618          IF( med_diag%ZE_GROW%dgsave ) THEN
619             CALL iom_put( "ZE_GROW"  , zegrow2d )
620             DEALLOCATE( zegrow2d )
621          ENDIF
622          IF( med_diag%MDETC%dgsave ) THEN
623             CALL iom_put( "MDETC"  , mdetc2d )
624             DEALLOCATE( mdetc2d )
625          ENDIF
626          IF( med_diag%GMIDC%dgsave ) THEN
627             CALL iom_put( "GMIDC"  , gmidc2d )
628             DEALLOCATE( gmidc2d )
629          ENDIF
630          IF( med_diag%GMEDC%dgsave ) THEN
631             CALL iom_put( "GMEDC"  , gmedc2d )
632             DEALLOCATE( gmedc2d )
633          ENDIF
634          IF( med_diag%IBEN_N%dgsave ) THEN
635             CALL iom_put( "IBEN_N"  , iben_n2d )
636             DEALLOCATE( iben_n2d )
637          ENDIF
638          IF( med_diag%IBEN_FE%dgsave ) THEN
639             CALL iom_put( "IBEN_FE"  , iben_fe2d )
640             DEALLOCATE( iben_fe2d )
641          ENDIF
642          IF( med_diag%IBEN_C%dgsave ) THEN
643             CALL iom_put( "IBEN_C"  , iben_c2d )
644             DEALLOCATE( iben_c2d )
645          ENDIF
646          IF( med_diag%IBEN_SI%dgsave ) THEN
647             CALL iom_put( "IBEN_SI"  , iben_si2d )
648             DEALLOCATE( iben_si2d )
649          ENDIF
650          IF( med_diag%IBEN_CA%dgsave ) THEN
651             CALL iom_put( "IBEN_CA"  , iben_ca2d )
652             DEALLOCATE( iben_ca2d )
653          ENDIF
654          IF( med_diag%OBEN_N%dgsave ) THEN
655             CALL iom_put( "OBEN_N"  , oben_n2d )
656             DEALLOCATE( oben_n2d )
657          ENDIF
658          IF( med_diag%OBEN_FE%dgsave ) THEN
659             CALL iom_put( "OBEN_FE"  , oben_fe2d )
660             DEALLOCATE( oben_fe2d )
661          ENDIF
662          IF( med_diag%OBEN_C%dgsave ) THEN
663             CALL iom_put( "OBEN_C"  , oben_c2d )
664             DEALLOCATE( oben_c2d )
665          ENDIF
666          IF( med_diag%OBEN_SI%dgsave ) THEN
667             CALL iom_put( "OBEN_SI"  , oben_si2d )
668             DEALLOCATE( oben_si2d )
669          ENDIF
670          IF( med_diag%OBEN_CA%dgsave ) THEN
671             CALL iom_put( "OBEN_CA"  , oben_ca2d )
672             DEALLOCATE( oben_ca2d )
673          ENDIF
674          IF( med_diag%SFR_OCAL%dgsave ) THEN
675             CALL iom_put( "SFR_OCAL"  , sfr_ocal2d )
676             DEALLOCATE( sfr_ocal2d )
677          ENDIF
678          IF( med_diag%SFR_OARG%dgsave ) THEN
679             CALL iom_put( "SFR_OARG"  , sfr_oarg2d )
680             DEALLOCATE( sfr_oarg2d )
681          ENDIF
682          IF( med_diag%LYSO_CA%dgsave ) THEN
683             CALL iom_put( "LYSO_CA"  , lyso_ca2d )
684             DEALLOCATE( lyso_ca2d )
685          ENDIF
686# endif                   
687          !!
688          !! ** 3D diagnostics
689          IF( med_diag%TPP3%dgsave ) THEN
690             CALL iom_put( "TPP3"  , tpp3d )
691             DEALLOCATE( tpp3d )
692          ENDIF
693          IF( med_diag%DETFLUX3%dgsave ) THEN
694             CALL iom_put( "DETFLUX3"  , detflux3d )
695             DEALLOCATE( detflux3d )
696          ENDIF
697          IF( med_diag%REMIN3N%dgsave ) THEN
698             CALL iom_put( "REMIN3N"  , remin3dn )
699             DEALLOCATE( remin3dn )
700          ENDIF
701# if defined key_roam         
702          IF( med_diag%PH3%dgsave ) THEN
703             CALL iom_put( "PH3"  , f3_pH )
704          ENDIF
705          IF( med_diag%OM_CAL3%dgsave ) THEN
706             CALL iom_put( "OM_CAL3"  , f3_omcal )
707          ENDIF
708          !!
709          !! AXY (09/11/16): 2D CMIP6 diagnostics
710          IF( med_diag%INTDISSIC%dgsave ) THEN
711             CALL iom_put( "INTDISSIC"  , intdissic )
712             DEALLOCATE( intdissic )
713          ENDIF         
714          IF( med_diag%INTDISSIN%dgsave ) THEN
715             CALL iom_put( "INTDISSIN"  , intdissin )
716             DEALLOCATE( intdissin )
717          ENDIF         
718          IF( med_diag%INTDISSISI%dgsave ) THEN
719             CALL iom_put( "INTDISSISI"  , intdissisi )
720             DEALLOCATE( intdissisi )
721          ENDIF         
722          IF( med_diag%INTTALK%dgsave ) THEN
723             CALL iom_put( "INTTALK"  , inttalk )
724             DEALLOCATE( inttalk )
725          ENDIF         
726          IF( med_diag%O2min%dgsave ) THEN
727             CALL iom_put( "O2min"  , o2min )
728             DEALLOCATE( o2min )
729          ENDIF         
730          IF( med_diag%ZO2min%dgsave ) THEN
731             CALL iom_put( "ZO2min"  , zo2min )
732             DEALLOCATE( zo2min )
733          ENDIF         
734          IF( med_diag%FBDDTALK%dgsave ) THEN
735             CALL iom_put( "FBDDTALK"  , fbddtalk )
736             DEALLOCATE( fbddtalk )
737          ENDIF         
738          IF( med_diag%FBDDTDIC%dgsave ) THEN
739             CALL iom_put( "FBDDTDIC"  , fbddtdic )
740             DEALLOCATE( fbddtdic )
741          ENDIF         
742          IF( med_diag%FBDDTDIFE%dgsave ) THEN
743             CALL iom_put( "FBDDTDIFE" , fbddtdife )
744             DEALLOCATE( fbddtdife )
745          ENDIF         
746          IF( med_diag%FBDDTDIN%dgsave ) THEN
747             CALL iom_put( "FBDDTDIN"  , fbddtdin )
748             DEALLOCATE( fbddtdin )
749          ENDIF         
750          IF( med_diag%FBDDTDISI%dgsave ) THEN
751             CALL iom_put( "FBDDTDISI" , fbddtdisi )
752             DEALLOCATE( fbddtdisi )
753          ENDIF   
754          !!
755          !! AXY (09/11/16): 3D CMIP6 diagnostics
756          IF( med_diag%TPPD3%dgsave ) THEN
757             CALL iom_put( "TPPD3"     , tppd3 )
758             DEALLOCATE( tppd3 )
759          ENDIF         
760          IF( med_diag%BDDTALK3%dgsave ) THEN
761             CALL iom_put( "BDDTALK3"  , bddtalk3 )
762             DEALLOCATE( bddtalk3 )
763          ENDIF         
764          IF( med_diag%BDDTDIC3%dgsave ) THEN
765             CALL iom_put( "BDDTDIC3"  , bddtdic3 )
766             DEALLOCATE( bddtdic3 )
767          ENDIF         
768          IF( med_diag%BDDTDIFE3%dgsave ) THEN
769             CALL iom_put( "BDDTDIFE3" , bddtdife3 )
770             DEALLOCATE( bddtdife3 )
771          ENDIF         
772          IF( med_diag%BDDTDIN3%dgsave ) THEN
773             CALL iom_put( "BDDTDIN3"  , bddtdin3 )
774             DEALLOCATE( bddtdin3 )
775          ENDIF         
776          IF( med_diag%BDDTDISI3%dgsave ) THEN
777             CALL iom_put( "BDDTDISI3" , bddtdisi3 )
778             DEALLOCATE( bddtdisi3 )
779          ENDIF   
780          IF( med_diag%FD_NIT3%dgsave ) THEN
781             CALL iom_put( "FD_NIT3"  , fd_nit3 )
782             DEALLOCATE( fd_nit3 )
783          ENDIF
784          IF( med_diag%FD_SIL3%dgsave ) THEN
785             CALL iom_put( "FD_SIL3"  , fd_sil3 )
786             DEALLOCATE( fd_sil3 )
787          ENDIF
788          IF( med_diag%FD_CAL3%dgsave ) THEN
789             CALL iom_put( "FD_CAL3"  , fd_cal3 )
790             DEALLOCATE( fd_cal3 )
791          ENDIF
792          IF( med_diag%FD_CAR3%dgsave ) THEN
793             CALL iom_put( "FD_CAR3"  , fd_car3 )
794             DEALLOCATE( fd_car3 )
795          ENDIF
796          IF( med_diag%CO33%dgsave ) THEN
797             CALL iom_put( "CO33"  , f3_co3 )
798          ENDIF                   
799          IF( med_diag%CO3SATARAG3%dgsave ) THEN
800             CALL iom_put( "CO3SATARAG3"  , f3_omarg )
801          ENDIF                   
802          IF( med_diag%CO3SATCALC3%dgsave ) THEN
803             CALL iom_put( "CO3SATCALC3"  , f3_omcal )
804          ENDIF                   
805          IF( med_diag%EXPC3%dgsave ) THEN
806             CALL iom_put( "EXPC3"  , expc3 )
807             DEALLOCATE( expc3 )
808          ENDIF                   
809          IF( med_diag%EXPN3%dgsave ) THEN
810             CALL iom_put( "EXPN3"  , expn3 )
811             DEALLOCATE( expn3 )
812          ENDIF                   
813          IF( med_diag%DCALC3%dgsave ) THEN
814             CALL iom_put( "DCALC3"  , dcalc3 )
815             DEALLOCATE( dcalc3 )
816          ENDIF                   
817          IF( med_diag%FEDISS3%dgsave ) THEN
818             CALL iom_put( "FEDISS3"  , fediss3 )
819             DEALLOCATE( fediss3 )
820          ENDIF                   
821          IF( med_diag%FESCAV3%dgsave ) THEN
822             CALL iom_put( "FESCAV3"  , fescav3 )
823             DEALLOCATE( fescav3 )
824          ENDIF                   
825          IF( med_diag%MIGRAZP3%dgsave ) THEN
826             CALL iom_put( "MIGRAZP3"  , migrazp3 )
827             DEALLOCATE( migrazp3 )
828          ENDIF                   
829          IF( med_diag%MIGRAZD3%dgsave ) THEN
830             CALL iom_put( "MIGRAZD3"  , migrazd3 )
831             DEALLOCATE( migrazd3 )
832          ENDIF                   
833          IF( med_diag%MEGRAZP3%dgsave ) THEN
834             CALL iom_put( "MEGRAZP3"  , megrazp3 )
835             DEALLOCATE( megrazp3 )
836          ENDIF                   
837          IF( med_diag%MEGRAZD3%dgsave ) THEN
838             CALL iom_put( "MEGRAZD3"  , megrazd3 )
839             DEALLOCATE( megrazd3 )
840          ENDIF                   
841          IF( med_diag%MEGRAZZ3%dgsave ) THEN
842             CALL iom_put( "MEGRAZZ3"  , megrazz3 )
843             DEALLOCATE( megrazz3 )
844          ENDIF                   
845          IF( med_diag%O2SAT3%dgsave ) THEN
846             CALL iom_put( "O2SAT3"  , o2sat3 )
847             DEALLOCATE( o2sat3 )
848          ENDIF                   
849          IF( med_diag%PBSI3%dgsave ) THEN
850             CALL iom_put( "PBSI3"  , pbsi3 )
851             DEALLOCATE( pbsi3 )
852          ENDIF                   
853          IF( med_diag%PCAL3%dgsave ) THEN
854             CALL iom_put( "PCAL3"  , pcal3 )
855             DEALLOCATE( pcal3 )
856          ENDIF                   
857          IF( med_diag%REMOC3%dgsave ) THEN
858             CALL iom_put( "REMOC3"  , remoc3 )
859             DEALLOCATE( remoc3 )
860          ENDIF                   
861          IF( med_diag%PNLIMJ3%dgsave ) THEN
862             CALL iom_put( "PNLIMJ3" , pnlimj3 )
863             DEALLOCATE( pnlimj3 )
864          ENDIF                   
865          IF( med_diag%PNLIMN3%dgsave ) THEN
866             CALL iom_put( "PNLIMN3" , pnlimn3 )
867             DEALLOCATE( pnlimn3 )
868          ENDIF                   
869          IF( med_diag%PNLIMFE3%dgsave ) THEN
870             CALL iom_put( "PNLIMFE3" , pnlimfe3 )
871             DEALLOCATE( pnlimfe3 )
872          ENDIF                   
873          IF( med_diag%PDLIMJ3%dgsave ) THEN
874             CALL iom_put( "PDLIMJ3" , pdlimj3 )
875             DEALLOCATE( pdlimj3 )
876          ENDIF                   
877          IF( med_diag%PDLIMN3%dgsave ) THEN
878             CALL iom_put( "PDLIMN3" , pdlimn3 )
879             DEALLOCATE( pdlimn3 )
880          ENDIF                   
881          IF( med_diag%PDLIMFE3%dgsave ) THEN
882             CALL iom_put( "PDLIMFE3" , pdlimfe3 )
883             DEALLOCATE( pdlimfe3 )
884          ENDIF                   
885          IF( med_diag%PDLIMSI3%dgsave ) THEN
886             CALL iom_put( "PDLIMSI3" , pdlimsi3 )
887             DEALLOCATE( pdlimsi3 )
888          ENDIF                   
889         
890# endif         
891
892          DEALLOCATE( zw2d )
893
894   END SUBROUTINE bio_medusa_fin
895
896#else
897   !!======================================================================
898   !!  Dummy module :                                   No MEDUSA bio-model
899   !!======================================================================
900CONTAINS
901   SUBROUTINE bio_medusa_fin( )                    ! Empty routine
902      WRITE(*,*) 'bio_medusa_fin: You should not have seen this print! error?'
903   END SUBROUTINE bio_medusa_fin
904#endif 
905
906   !!======================================================================
907END MODULE bio_medusa_fin_mod
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.