New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iom.F90 in branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/IOM – NEMO

source: branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/IOM/iom.F90 @ 8161

Last change on this file since 8161 was 8161, checked in by andmirek, 7 years ago

few small bug fixes and support for Agrif restart read

File size: 112.8 KB
Line 
1MODULE iom
2   !!=====================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files
5   !!====================================================================
6   !! History :  2.0  ! 2005-12  (J. Belier) Original code
7   !!            2.0  ! 2006-02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!            3.0  ! 2007-07  (D. Storkey) Changes to iom_gettime
9   !!            3.4  ! 2012-12  (R. Bourdalle-Badie and G. Reffray)  add C1D case 
10   !!--------------------------------------------------------------------
11
12   !!--------------------------------------------------------------------
13   !!   iom_open       : open a file read only
14   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
15   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
16   !!   iom_gettime    : read the time axis cdvar in the file
17   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
18   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
19   !!--------------------------------------------------------------------
20   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
21   USE c1d             ! 1D vertical configuration
22   USE flo_oce         ! floats module declarations
23   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
24   USE iom_def         ! iom variables definitions
25   USE iom_ioipsl      ! NetCDF format with IOIPSL library
26   USE iom_nf90        ! NetCDF format with native NetCDF library
27   USE iom_rstdimg     ! restarts access direct format "dimg" style...
28   USE in_out_manager  ! I/O manager
29   USE lib_mpp           ! MPP library
30#if defined key_iomput
31   USE sbc_oce, ONLY :   nn_fsbc         ! ocean space and time domain
32   USE trc_oce, ONLY :   nn_dttrc        !  !: frequency of step on passive tracers
33   USE icb_oce, ONLY :   nclasses, class_num       !  !: iceberg classes
34#if defined key_lim3
35   USE ice    , ONLY :   jpl
36#elif defined key_lim2
37   USE par_ice_2
38#endif
39   USE domngb          ! ocean space and time domain
40   USE phycst          ! physical constants
41   USE dianam          ! build name of file
42   USE xios
43   USE iom_def, ONLY : max_rst_fields, rst_fields
44# endif
45   USE ioipsl, ONLY :  ju2ymds    ! for calendar
46   USE crs             ! Grid coarsening
47   USE lib_fortran 
48
49   IMPLICIT NONE
50   PUBLIC   !   must be public to be able to access iom_def through iom
51   
52#if defined key_iomput
53   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .TRUE.        !: iom_put flag
54#else
55   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .FALSE.       !: iom_put flag
56#endif
57   PUBLIC iom_init, iom_swap, iom_open, iom_close, iom_setkt, iom_varid, iom_get, iom_gettime, iom_rstput, iom_put
58   PUBLIC iom_getatt, iom_use, iom_context_finalize
59
60   PRIVATE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
61   PRIVATE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d, iom_get_123d
62   PRIVATE iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
63#if defined key_iomput
64   PRIVATE iom_set_domain_attr, iom_set_axis_attr, iom_set_field_attr, iom_set_file_attr, iom_get_file_attr, iom_set_grid_attr
65   PRIVATE set_grid, set_grid_bounds, set_scalar, set_xmlatt, set_mooring, iom_update_file_name, iom_sdate
66   PRIVATE set_rst_vars, set_rstr_active
67# endif
68
69   INTERFACE iom_get
70      MODULE PROCEDURE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d
71   END INTERFACE
72   INTERFACE iom_getatt
73      MODULE PROCEDURE iom_g0d_intatt
74   END INTERFACE
75   INTERFACE iom_rstput
76      MODULE PROCEDURE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
77   END INTERFACE
78  INTERFACE iom_put
79     MODULE PROCEDURE iom_p0d, iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
80  END INTERFACE
81
82   !!----------------------------------------------------------------------
83   !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010)
84   !! $Id$
85   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
86   !!----------------------------------------------------------------------
87
88CONTAINS
89
90   SUBROUTINE iom_init( cdname ) 
91      !!----------------------------------------------------------------------
92      !!                     ***  ROUTINE   ***
93      !!
94      !! ** Purpose :   
95      !!
96      !!----------------------------------------------------------------------
97      CHARACTER(len=*), INTENT(in)  :: cdname
98#if defined key_iomput
99#if ! defined key_xios2
100      TYPE(xios_time)     :: dtime    = xios_time(0, 0, 0, 0, 0, 0)
101      CHARACTER(len=19)   :: cldate 
102#else
103      TYPE(xios_duration) :: dtime    = xios_duration(0, 0, 0, 0, 0, 0)
104      TYPE(xios_date)     :: start_date
105#endif
106      CHARACTER(len=10)   :: clname
107      INTEGER             :: ji
108      !
109      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: z_bnds
110      !!----------------------------------------------------------------------
111#if ! defined key_xios2
112      ALLOCATE( z_bnds(jpk,2) )
113#else
114      ALLOCATE( z_bnds(2,jpk) )
115#endif
116
117      clname = cdname
118      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname)
119      CALL xios_context_initialize(TRIM(clname), mpi_comm_opa)
120      CALL iom_swap( cdname )
121
122      ! calendar parameters
123#if ! defined key_xios2
124      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
125      CASE ( 1)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "Gregorian")
126      CASE ( 0)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "NoLeap")
127      CASE (30)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "D360")
128      END SELECT
129      WRITE(cldate,"(i4.4,'-',i2.2,'-',i2.2,' 00:00:00')") nyear,nmonth,nday 
130      CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), start_date=cldate )
131#else
132      ! Calendar type is now defined in xml file
133      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
134      CASE ( 1)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "Gregorian", time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
135          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
136      CASE ( 0)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "NoLeap"   , time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
137          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
138      CASE (30)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "D360"     , time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
139          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
140      END SELECT
141
142#endif
143      ! horizontal grid definition
144
145      CALL set_scalar
146
147      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context) .OR. TRIM(cdname) == TRIM(rxios_context)) THEN 
148         CALL set_grid( "T", glamt, gphit, ln_mskland ) 
149         CALL set_grid( "U", glamu, gphiu, ln_mskland )
150         CALL set_grid( "V", glamv, gphiv, ln_mskland )
151         CALL set_grid( "W", glamt, gphit, ln_mskland )
152         CALL set_grid_znl( gphit )
153         CALL set_grid("N",glamt, gphit, .FALSE.)        ! not masked values
154         !
155         IF( ln_cfmeta .AND. TRIM(cdname) .NE. TRIM(rxios_context)) THEN   ! Add additional grid metadata
156            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e12t(nldi:nlei, nldj:nlej))
157            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e12u(nldi:nlei, nldj:nlej))
158            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e12v(nldi:nlei, nldj:nlej))
159            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e12t(nldi:nlei, nldj:nlej))
160            CALL set_grid_bounds( "T", glamf, gphif, glamt, gphit )
161            CALL set_grid_bounds( "U", glamv, gphiv, glamu, gphiu )
162            CALL set_grid_bounds( "V", glamu, gphiu, glamv, gphiv )
163            CALL set_grid_bounds( "W", glamf, gphif, glamt, gphit )
164         ENDIF
165      ENDIF
166
167      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context)//"_crs" ) THEN 
168         CALL dom_grid_crs   ! Save the parent grid information  & Switch to coarse grid domain
169         !
170         CALL set_grid( "T", glamt_crs, gphit_crs, ln_mskland ) 
171         CALL set_grid( "U", glamu_crs, gphiu_crs, ln_mskland ) 
172         CALL set_grid( "V", glamv_crs, gphiv_crs, ln_mskland ) 
173         CALL set_grid( "W", glamt_crs, gphit_crs, ln_mskland ) 
174         CALL set_grid_znl( gphit_crs )
175          !
176         CALL dom_grid_glo   ! Return to parent grid domain
177         !
178         IF( ln_cfmeta .AND. TRIM(cdname) .NE. TRIM(rxios_context)) THEN   ! Add additional grid metadata
179            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
180            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e1u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
181            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e1v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
182            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
183            CALL set_grid_bounds( "T", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
184            CALL set_grid_bounds( "U", glamv_crs, gphiv_crs, glamu_crs, gphiu_crs )
185            CALL set_grid_bounds( "V", glamu_crs, gphiu_crs, glamv_crs, gphiv_crs )
186            CALL set_grid_bounds( "W", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
187         ENDIF
188      ENDIF
189
190      ! vertical grid definition
191      CALL iom_set_axis_attr( "deptht", paxis = gdept_1d )
192      CALL iom_set_axis_attr( "depthu", paxis = gdept_1d )
193      CALL iom_set_axis_attr( "depthv", paxis = gdept_1d )
194      CALL iom_set_axis_attr( "depthw", paxis = gdepw_1d )
195
196      ! Add vertical grid bounds
197#if ! defined key_xios2
198      z_bnds(:      ,1) = gdepw_1d(:)
199      z_bnds(1:jpkm1,2) = gdepw_1d(2:jpk)
200      z_bnds(jpk:   ,2) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)
201#else
202      z_bnds(1      ,:) = gdepw_1d(:)
203      z_bnds(2,1:jpkm1) = gdepw_1d(2:jpk)
204      z_bnds(2,jpk:   ) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)
205#endif
206
207      CALL iom_set_axis_attr( "deptht", bounds=z_bnds )
208      CALL iom_set_axis_attr( "depthu", bounds=z_bnds )
209      CALL iom_set_axis_attr( "depthv", bounds=z_bnds )
210
211#if ! defined key_xios2
212      z_bnds(:    ,2)  = gdept_1d(:)
213      z_bnds(2:jpk,1)  = gdept_1d(1:jpkm1)
214      z_bnds(1    ,1)  = gdept_1d(1) - e3w_1d(1)
215#else
216      z_bnds(2,:    )  = gdept_1d(:)
217      z_bnds(1,2:jpk)  = gdept_1d(1:jpkm1)
218      z_bnds(1,1    )  = gdept_1d(1) - e3w_1d(1)
219#endif
220      CALL iom_set_axis_attr( "depthw", bounds=z_bnds )
221
222
223# if defined key_floats
224      CALL iom_set_axis_attr( "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nfloat) /) )
225# endif
226#if defined key_lim3 || defined key_lim2
227      CALL iom_set_axis_attr( "ncatice", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) )
228#endif
229      CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num )
230      CALL iom_set_axis_attr( "iax_20C", (/ REAL(20,wp) /) )
231      CALL iom_set_axis_attr( "iax_28C", (/ REAL(28,wp) /) )
232     
233      ! automatic definitions of some of the xml attributs
234      IF( TRIM(cdname) == TRIM(rxios_context)) THEN
235!set names of the fields in restart file IF using XIOS to read/write data
236       CALL set_rst_vars()
237!set which fields are to be read from restart file
238       CALL set_rstr_active()
239      ELSE
240       CALL set_xmlatt
241      ENDIF
242
243      CALL set_1point
244
245      ! end file definition
246      dtime%second = rdt
247      CALL xios_set_timestep(dtime)
248      CALL xios_close_context_definition()
249     
250      CALL xios_update_calendar(0)
251
252      DEALLOCATE( z_bnds )
253
254#endif
255
256   END SUBROUTINE iom_init
257
258   
259   SUBROUTINE set_rst_vars()
260!set names for variables in restart file
261
262        rst_fields(:)%vname="NO_NAME";         rst_fields(:)%grid="NO_GRID"
263
264        rst_fields(1)%vname="rdt";             rst_fields(1)% grid="grid_scalar"
265        rst_fields(2)%vname="rdttra1";         rst_fields(2)% grid="grid_scalar"     
266        rst_fields(3)%vname="un";              rst_fields(3)% grid="grid_N_3D"
267        rst_fields(4)%vname="ub";              rst_fields(4)% grid="grid_N_3D"
268        rst_fields(5)%vname="vn";              rst_fields(5)% grid="grid_N_3D"
269        rst_fields(6)%vname="vb";              rst_fields(6)% grid="grid_N_3D" 
270        rst_fields(7)%vname="tn";              rst_fields(7)% grid="grid_N_3D"
271        rst_fields(8)%vname="tb";              rst_fields(8)% grid="grid_N_3D"
272        rst_fields(9)%vname="sn";              rst_fields(9)% grid="grid_N_3D"
273        rst_fields(10)%vname="sb";             rst_fields(10)%grid="grid_N_3D"
274        rst_fields(11)%vname="sshn";           rst_fields(11)%grid="grid_N"
275        rst_fields(12)%vname="sshb";           rst_fields(12)%grid="grid_N"
276        rst_fields(13)%vname="hdivn";          rst_fields(13)%grid="grid_N_3D"
277        rst_fields(14)%vname="hdivb";          rst_fields(14)%grid="grid_N_3D"
278        rst_fields(15)%vname="rhop";           rst_fields(15)%grid="grid_N_3D"
279        rst_fields(16)%vname="rotn";           rst_fields(16)%grid="grid_N_3D"
280        rst_fields(17)%vname="rotb";           rst_fields(17)%grid="grid_N_3D"
281        rst_fields(18)%vname="kt";             rst_fields(18)%grid="grid_scalar"
282        rst_fields(19)%vname="ndastp";         rst_fields(19)%grid="grid_scalar"
283        rst_fields(20)%vname="adatrj";         rst_fields(20)%grid="grid_scalar"
284        rst_fields(21)%vname="utau_b";         rst_fields(21)%grid="grid_N"
285        rst_fields(22)%vname="vtau_b";         rst_fields(22)%grid="grid_N"
286        rst_fields(23)%vname="qns_b";          rst_fields(23)%grid="grid_N"
287        rst_fields(24)%vname="emp_b";          rst_fields(24)%grid="grid_N"
288        rst_fields(25)%vname="sfx_b";          rst_fields(25)%grid="grid_N"
289        rst_fields(26)%vname="en" ;            rst_fields(26)%grid="grid_N_3D" 
290        rst_fields(27)%vname="avt";            rst_fields(27)%grid="grid_N_3D"
291        rst_fields(28)%vname="avm";            rst_fields(28)%grid="grid_N_3D"
292        rst_fields(29)%vname="avmu";           rst_fields(29)%grid="grid_N_3D"
293        rst_fields(30)%vname="avmv";           rst_fields(30)%grid="grid_N_3D"
294        rst_fields(31)%vname="dissl";          rst_fields(31)%grid="grid_N_3D"
295        rst_fields(32)%vname="sbc_hc_b";       rst_fields(32)%grid="grid_N"
296        rst_fields(33)%vname="sbc_sc_b";       rst_fields(33)%grid="grid_N"
297        rst_fields(34)%vname="qsr_hc_b";       rst_fields(34)%grid="grid_N_3D"
298        rst_fields(35)%vname="gcx";            rst_fields(35)%grid="grid_N"
299        rst_fields(36)%vname="gcxb";           rst_fields(36)%grid="grid_N"
300        rst_fields(37)%vname="fraqsr_1lev";    rst_fields(37)%grid="grid_N"
301        rst_fields(38)%vname="greenland_icesheet_mass"
302                                               rst_fields(38)%grid="grid_scalar"
303        rst_fields(39)%vname="greenland_icesheet_timelapsed"
304                                               rst_fields(39)%grid="grid_scalar"
305        rst_fields(40)%vname="greenland_icesheet_mass_roc"
306                                               rst_fields(40)%grid="grid_scalar"
307        rst_fields(41)%vname="antarctica_icesheet_mass"
308                                               rst_fields(41)%grid="grid_scalar"
309        rst_fields(42)%vname="antarctica_icesheet_timelapsed"
310                                               rst_fields(42)%grid="grid_scalar"
311        rst_fields(43)%vname="antarctica_icesheet_mass_roc"
312                                               rst_fields(43)%grid="grid_scalar"
313        rst_fields(44)%vname="rhd";            rst_fields(44)%grid="grid_N_3D"
314        rst_fields(45)%vname="frc_v";          rst_fields(45)%grid="grid_scalar"
315        rst_fields(46)%vname="frc_t";          rst_fields(46)%grid="grid_scalar"
316        rst_fields(47)%vname="frc_s";          rst_fields(47)%grid="grid_scalar"
317        rst_fields(48)%vname="frc_wn_t";       rst_fields(48)%grid="grid_scalar"
318        rst_fields(49)%vname="frc_wn_s";       rst_fields(49)%grid="grid_scalar"
319        rst_fields(50)%vname="ssh_ini";        rst_fields(50)%grid="grid_N"
320        rst_fields(51)%vname="e3t_ini";        rst_fields(51)%grid="grid_N_3D"
321        rst_fields(52)%vname="hc_loc_ini";     rst_fields(52)%grid="grid_N_3D"
322        rst_fields(53)%vname="sc_loc_ini";     rst_fields(53)%grid="grid_N_3D"
323        rst_fields(54)%vname="ssh_hc_loc_ini"; rst_fields(54)%grid="grid_N"
324        rst_fields(55)%vname="ssh_sc_loc_ini"; rst_fields(55)%grid="grid_N"
325        rst_fields(56)%vname="fse3t_b";        rst_fields(56)%grid="grid_N_3D"
326        rst_fields(57)%vname="fse3t_n";        rst_fields(57)%grid="grid_N_3D"
327        rst_fields(58)%vname="tilde_e3t_b";    rst_fields(58)%grid="grid_N"
328        rst_fields(59)%vname="tilde_e3t_n";    rst_fields(59)%grid="grid_N"
329        rst_fields(60)%vname="hdiv_lf";        rst_fields(60)%grid="grid_N"
330        rst_fields(61)%vname="ub2_b";          rst_fields(61)%grid="grid_N"
331        rst_fields(62)%vname="vb2_b";          rst_fields(62)%grid="grid_N"
332        rst_fields(63)%vname="sshbb_e";        rst_fields(63)%grid="grid_N"
333        rst_fields(64)%vname="ubb_e";          rst_fields(64)%grid="grid_N"
334        rst_fields(65)%vname="vbb_e";          rst_fields(65)%grid="grid_N"
335        rst_fields(66)%vname="sshb_e";         rst_fields(66)%grid="grid_N"
336        rst_fields(67)%vname="ub_e";           rst_fields(67)%grid="grid_N"
337        rst_fields(68)%vname="vb_e";           rst_fields(68)%grid="grid_N"
338        rst_fields(69)%vname="fwf_isf_b";      rst_fields(69)%grid="grid_N"
339        rst_fields(70)%vname="isf_sc_b";       rst_fields(70)%grid="grid_N"
340        rst_fields(71)%vname="isf_hc_b";       rst_fields(71)%grid="grid_N"
341        rst_fields(72)%vname="ssh_ibb";        rst_fields(72)%grid="grid_N"
342        rst_fields(73)%vname="rnf_b";          rst_fields(73)%grid="grid_N"
343        rst_fields(74)%vname="rnf_hc_b";       rst_fields(74)%grid="grid_N"
344        rst_fields(75)%vname="rnf_sc_b";       rst_fields(75)%grid="grid_N"
345        rst_fields(76)%vname="nn_fsbc";        rst_fields(76)%grid="grid_scalar"
346        rst_fields(77)%vname="ssu_m";          rst_fields(77)%grid="grid_N"
347        rst_fields(78)%vname="ssv_m";          rst_fields(78)%grid="grid_N"
348        rst_fields(79)%vname="sst_m";          rst_fields(79)%grid="grid_N"
349        rst_fields(80)%vname="sss_m";          rst_fields(80)%grid="grid_N"
350        rst_fields(81)%vname="ssh_m";          rst_fields(81)%grid="grid_N"
351        rst_fields(82)%vname="e3t_m";          rst_fields(82)%grid="grid_N"
352        rst_fields(83)%vname="frq_m";          rst_fields(83)%grid="grid_N"
353        rst_fields(84)%vname="avmb";           rst_fields(84)%grid="Vgrid"
354        rst_fields(85)%vname="avtb";           rst_fields(85)%grid="Vgrid"
355
356   END SUBROUTINE set_rst_vars
357
358
359   SUBROUTINE set_rstr_active()
360!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file
361#if defined key_xios2
362   CHARACTER(len=256) :: rst_file
363   TYPE(xios_field) :: field_hdl
364   TYPE(xios_file) :: file_hdl
365   TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl
366   INTEGER :: i
367   CHARACTER(lc)  ::   clpath
368
369        clpath = TRIM(cn_ocerst_indir)
370        IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/'
371        IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
372           rst_file = TRIM(cn_ocerst_indir)//TRIM(cn_ocerst_in)
373        ELSE
374           rst_file = TRIM(cn_ocerst_indir)//'1_'//TRIM(cn_ocerst_in)
375        ENDIF
376!set name of the restart file and enable available fields
377        if(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS) to: ',rst_file
378        CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl )
379        CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'rrestart')
380        CALL xios_set_file_attr( "rrestart", name=trim(rst_file), type="one_file", &
381             par_access="collective", enabled=.TRUE., mode="read",                 &
382             output_freq=xios_timestep)
383!defin files for restart context
384        DO i = 1, max_rst_fields
385         IF( TRIM(rst_fields(i)%vname) /= "NO_NAME") THEN
386           IF( iom_varid( numror, TRIM(rst_fields(i)%vname), ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
387                CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_fields(i)%vname))
388                CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_fields(i)%vname), &
389                     grid_ref = TRIM(rst_fields(i)%grid ), operation = "instant")
390                if(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(rst_fields(i)%vname), ' enabled'
391           ENDIF
392         ENDIF
393        END DO
394#endif
395   END SUBROUTINE set_rstr_active
396
397   SUBROUTINE iom_swap( cdname )
398      !!---------------------------------------------------------------------
399      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_swap  ***
400      !!
401      !! ** Purpose :  swap context between different agrif grid for xmlio_server
402      !!---------------------------------------------------------------------
403      CHARACTER(len=*), INTENT(in) :: cdname
404#if defined key_iomput
405      TYPE(xios_context) :: nemo_hdl
406
407      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
408        CALL xios_get_handle(TRIM(cdname),nemo_hdl)
409      ELSE
410        CALL xios_get_handle(TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname),nemo_hdl)
411      ENDIF
412      !
413      CALL xios_set_current_context(nemo_hdl)
414#endif
415      !
416   END SUBROUTINE iom_swap
417
418
419   SUBROUTINE iom_open( cdname, kiomid, ldwrt, kdom, kiolib, ldstop, ldiof )
420      !!---------------------------------------------------------------------
421      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
422      !!
423      !! ** Purpose :  open an input file (return 0 if not found)
424      !!---------------------------------------------------------------------
425      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )           ::   cdname   ! File name
426      INTEGER         , INTENT(  out)           ::   kiomid   ! iom identifier of the opened file
427      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldwrt    ! open in write modeb          (default = .FALSE.)
428      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdom     ! Type of domain to be written (default = jpdom_local_noovlap)
429      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kiolib   ! library used to open the file (default = jpnf90)
430      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if open to read a non-existing file (default = .TRUE.)
431      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldiof    ! Interp On the Fly, needed for AGRIF (default = .FALSE.)
432
433      CHARACTER(LEN=256)    ::   clname    ! the name of the file based on cdname [[+clcpu]+clcpu]
434      CHARACTER(LEN=256)    ::   cltmpn    ! tempory name to store clname (in writting mode)
435      CHARACTER(LEN=10)     ::   clsuffix  ! ".nc" or ".dimg"
436      CHARACTER(LEN=15)     ::   clcpu     ! the cpu number (max jpmax_digits digits)
437      CHARACTER(LEN=256)    ::   clinfo    ! info character
438      LOGICAL               ::   llok      ! check the existence
439      LOGICAL               ::   llwrt     ! local definition of ldwrt
440      LOGICAL               ::   llnoov    ! local definition to read overlap
441      LOGICAL               ::   llstop    ! local definition of ldstop
442      LOGICAL               ::   lliof     ! local definition of ldiof
443      INTEGER               ::   iolib     ! library do we use to open the file
444      INTEGER               ::   icnt      ! counter for digits in clcpu (max = jpmax_digits)
445      INTEGER               ::   iln, ils  ! lengths of character
446      INTEGER               ::   idom      ! type of domain
447      INTEGER               ::   istop     !
448      INTEGER, DIMENSION(2,5) ::   idompar ! domain parameters:
449      ! local number of points for x,y dimensions
450      ! position of first local point for x,y dimensions
451      ! position of last local point for x,y dimensions
452      ! start halo size for x,y dimensions
453      ! end halo size for x,y dimensions
454      !---------------------------------------------------------------------
455      ! Initializations and control
456      ! =============
457      kiomid = -1
458      clinfo = '                    iom_open ~~~  '
459      istop = nstop
460      ! if iom_open is called for the first time: initialize iom_file(:)%nfid to 0
461      ! (could be done when defining iom_file in f95 but not in f90)
462      IF( Agrif_Root() ) THEN
463         IF( iom_open_init == 0 ) THEN
464            iom_file(:)%nfid = 0
465            iom_open_init = 1
466         ENDIF
467      ENDIF
468      ! do we read or write the file?
469      IF( PRESENT(ldwrt) ) THEN   ;   llwrt = ldwrt
470      ELSE                        ;   llwrt = .FALSE.
471      ENDIF
472      ! do we call ctl_stop if we try to open a non-existing file in read mode?
473      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
474      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
475      ENDIF
476      ! what library do we use to open the file?
477      IF( PRESENT(kiolib) ) THEN   ;   iolib = kiolib
478      ELSE                         ;   iolib = jpnf90
479      ENDIF
480      ! are we using interpolation on the fly?
481      IF( PRESENT(ldiof) ) THEN   ;   lliof = ldiof
482      ELSE                        ;   lliof = .FALSE.
483      ENDIF
484      ! do we read the overlap
485      ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
486      llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
487      ! create the file name by added, if needed, TRIM(Agrif_CFixed()) and TRIM(clsuffix)
488      ! =============
489      clname   = trim(cdname)
490      IF ( .NOT. Agrif_Root() .AND. .NOT. lliof ) THEN
491         iln    = INDEX(clname,'/') 
492         cltmpn = clname(1:iln)
493         clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
494         clname=TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
495      ENDIF
496      ! which suffix should we use?
497      SELECT CASE (iolib)
498      CASE (jpioipsl ) ;   clsuffix = '.nc'
499      CASE (jpnf90   ) ;   clsuffix = '.nc'
500      CASE (jprstdimg) ;   clsuffix = '.dimg'
501      CASE DEFAULT     ;   clsuffix = ''
502         CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
503      END SELECT
504      ! Add the suffix if needed
505      iln = LEN_TRIM(clname)
506      ils = LEN_TRIM(clsuffix)
507      IF( iln <= ils .OR. INDEX( TRIM(clname), TRIM(clsuffix), back = .TRUE. ) /= iln - ils + 1 )   &
508         &   clname = TRIM(clname)//TRIM(clsuffix)
509      cltmpn = clname   ! store this name
510      ! try to find if the file to be opened already exist
511      ! =============
512      INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
513      IF( .NOT.llok ) THEN
514         ! we try to add the cpu number to the name
515         IF( iolib == jprstdimg ) THEN   ;   WRITE(clcpu,*) narea
516         ELSE                            ;   WRITE(clcpu,*) narea-1
517         ENDIF
518         clcpu  = TRIM(ADJUSTL(clcpu))
519         iln = INDEX(clname,TRIM(clsuffix), back = .TRUE.)
520         clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
521         icnt = 0
522         INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok ) 
523         ! we try different formats for the cpu number by adding 0
524         DO WHILE( .NOT.llok .AND. icnt < jpmax_digits )
525            clcpu  = "0"//trim(clcpu)
526            clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
527            INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
528            icnt = icnt + 1
529         END DO
530      ELSE
531         lxios_sini = .TRUE.
532      ENDIF
533      IF( llwrt ) THEN
534         ! check the domain definition
535! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
536!         idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
537         IF( llnoov ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
538         ELSE                ;   idom = jpdom_local_full      ! default definition
539         ENDIF
540         IF( PRESENT(kdom) )   idom = kdom
541         ! create the domain informations
542         ! =============
543         SELECT CASE (idom)
544         CASE (jpdom_local_full)
545            idompar(:,1) = (/ jpi             , jpj              /)
546            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
547            idompar(:,3) = (/ nimpp + jpi - 1 , njmpp + jpj - 1  /)
548            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
549            idompar(:,5) = (/ jpi - nlei      , jpj - nlej       /)
550         CASE (jpdom_local_noextra)
551            idompar(:,1) = (/ nlci            , nlcj             /)
552            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
553            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlci - 1, njmpp + nlcj - 1 /)
554            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
555            idompar(:,5) = (/ nlci - nlei     , nlcj - nlej      /)
556         CASE (jpdom_local_noovlap)
557            idompar(:,1) = (/ nlei  - nldi + 1, nlej  - nldj + 1 /)
558            idompar(:,2) = (/ nimpp + nldi - 1, njmpp + nldj - 1 /)
559            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlei - 1, njmpp + nlej - 1 /)
560            idompar(:,4) = (/ 0               , 0                /)
561            idompar(:,5) = (/ 0               , 0                /)
562         CASE DEFAULT
563            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'wrong value of kdom, only jpdom_local* cases are accepted' )
564         END SELECT
565      ENDIF
566      ! Open the NetCDF or RSTDIMG file
567      ! =============
568      ! do we have some free file identifier?
569      IF( MINVAL(iom_file(:)%nfid) /= 0 )   &
570         &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'No more free file identifier', 'increase jpmax_files in iom_def' )
571      ! if no file was found...
572      IF( .NOT. llok ) THEN
573         IF( .NOT. llwrt ) THEN   ! we are in read mode
574            IF( llstop ) THEN   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'File '//TRIM(cltmpn)//'* not found' )
575            ELSE                ;   istop = nstop + 1   ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
576            ENDIF
577         ELSE                     ! we are in write mode so we
578            clname = cltmpn       ! get back the file name without the cpu number
579         ENDIF
580      ELSE
581         IF( llwrt .AND. .NOT. ln_clobber ) THEN   ! we stop as we want to write in a new file
582            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'We want to write in a new file but '//TRIM(clname)//' already exists...' )
583            istop = nstop + 1                      ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
584         ELSEIF( llwrt ) THEN     ! the file exists and we are in write mode with permission to
585            clname = cltmpn       ! overwrite so get back the file name without the cpu number
586         ENDIF
587      ENDIF
588      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
589         SELECT CASE (iolib)
590         CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_open(  clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
591         CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_open(    clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
592         CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_open( clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
593         CASE DEFAULT
594            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
595         END SELECT
596      ENDIF
597      !
598   END SUBROUTINE iom_open
599
600
601   SUBROUTINE iom_close( kiomid )
602      !!--------------------------------------------------------------------
603      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_close  ***
604      !!
605      !! ** Purpose : close an input file, or all files opened by iom
606      !!--------------------------------------------------------------------
607      INTEGER, INTENT(inout), OPTIONAL ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
608      !                                              ! return 0 when file is properly closed
609      !                                              ! No argument: all files opened by iom are closed
610
611      INTEGER ::   jf         ! dummy loop indices
612      INTEGER ::   i_s, i_e   ! temporary integer
613      CHARACTER(LEN=100)    ::   clinfo    ! info character
614      !---------------------------------------------------------------------
615      !
616      clinfo = '                    iom_close ~~~  '
617      IF( PRESENT(kiomid) ) THEN
618         i_s = kiomid
619         i_e = kiomid
620      ELSE
621         i_s = 1
622         i_e = jpmax_files
623      ENDIF
624
625      IF( i_s > 0 ) THEN
626         DO jf = i_s, i_e
627            IF( iom_file(jf)%nfid > 0 ) THEN
628               SELECT CASE (iom_file(jf)%iolib)
629               CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_close(  jf )
630               CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_close(    jf )
631               CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_close( jf )
632               CASE DEFAULT
633                  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
634               END SELECT
635               iom_file(jf)%nfid       = 0          ! free the id
636               IF( PRESENT(kiomid) )   kiomid = 0   ! return 0 as id to specify that the file was closed
637               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' close file: '//TRIM(iom_file(jf)%name)//' ok'
638            ELSEIF( PRESENT(kiomid) ) THEN
639               WRITE(ctmp1,*) '--->',  kiomid
640               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' Invalid file identifier', ctmp1 )
641            ENDIF
642         END DO
643      ENDIF
644      !   
645   END SUBROUTINE iom_close
646
647
648   FUNCTION iom_varid ( kiomid, cdvar, kdimsz, kndims, ldstop ) 
649      !!-----------------------------------------------------------------------
650      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
651      !!
652      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file (return 0 if not found)
653      !!-----------------------------------------------------------------------
654      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
655      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
656      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of the dimensions
657      INTEGER,               INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! size of the dimensions
658      LOGICAL              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if looking for non-existing variable (default = .TRUE.)
659      !
660      INTEGER                        ::   iom_varid, iiv, i_nvd
661      LOGICAL                        ::   ll_fnd
662      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo                   ! info character
663      LOGICAL                        ::   llstop                   ! local definition of ldstop
664      !!-----------------------------------------------------------------------
665      iom_varid = 0                         ! default definition
666      ! do we call ctl_stop if we look for non-existing variable?
667      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
668      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
669      ENDIF
670      !
671      IF( kiomid > 0 ) THEN
672         clinfo = 'iom_varid, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(cdvar)
673         IF( iom_file(kiomid)%nfid == 0 ) THEN
674            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the file is not open' )
675         ELSE
676            ll_fnd  = .FALSE.
677            iiv = 0
678            !
679            DO WHILE ( .NOT.ll_fnd .AND. iiv < iom_file(kiomid)%nvars )
680               iiv = iiv + 1
681               ll_fnd  = ( TRIM(cdvar) == TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(iiv)) )
682            END DO
683            !
684            IF( .NOT.ll_fnd ) THEN
685               iiv = iiv + 1
686               IF( iiv <= jpmax_vars ) THEN
687                  SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
688                  CASE (jpioipsl )   ;   iom_varid = iom_ioipsl_varid( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz )
689                  CASE (jpnf90   )   ;   iom_varid = iom_nf90_varid  ( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz, kndims )
690                  CASE (jprstdimg)   ;   iom_varid = -1   ! all variables are listed in iom_file
691                  CASE DEFAULT   
692                     CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
693                  END SELECT
694               ELSE
695                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'Too many variables in the file '//iom_file(kiomid)%name,   &
696                        &                         'increase the parameter jpmax_vars')
697               ENDIF
698               IF( llstop .AND. iom_varid == -1 )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' not found' ) 
699            ELSE
700               iom_varid = iiv
701               IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
702                  i_nvd = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
703                  IF( i_nvd == size(kdimsz) ) THEN
704                     kdimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,iiv)
705                  ELSE
706                     WRITE(ctmp1,*) i_nvd, size(kdimsz)
707                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'error in kdimsz size'//trim(ctmp1) )
708                  ENDIF
709               ENDIF
710               IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
711            ENDIF
712         ENDIF
713      ENDIF
714      !
715   END FUNCTION iom_varid
716
717
718   !!----------------------------------------------------------------------
719   !!                   INTERFACE iom_get
720   !!----------------------------------------------------------------------
721   SUBROUTINE iom_g0d( kiomid, cdvar, pvar, ktime, lrxios )
722      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
723      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable
724      REAL(wp)        , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
725      INTEGER         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ktime     ! record number
726      LOGICAL         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   lrxios    ! use xios to read restart
727      !
728      INTEGER                                         ::   idvar     ! variable id
729      INTEGER                                         ::   idmspc    ! number of spatial dimensions
730      INTEGER         , DIMENSION(1)                  ::   itime     ! record number
731      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clinfo    ! info character
732      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clname    ! file name
733      CHARACTER(LEN=1)                                ::   cldmspc   !
734      LOGICAL                                         ::   lxios
735      !
736      lxios = .FALSE.
737      IF( PRESENT(lrxios) ) lxios = lrxios
738
739      IF(.NOT.lxios) THEN  ! read data using default library
740          itime = 1
741          IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
742          !
743          clname = iom_file(kiomid)%name
744          clinfo = '          iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
745          !
746          IF( kiomid > 0 ) THEN
747             idvar = iom_varid( kiomid, cdvar )
748             IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 .AND. idvar > 0 ) THEN
749                idmspc = iom_file ( kiomid )%ndims( idvar )
750                IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )  idmspc = idmspc - 1
751                WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
752                IF( idmspc > 0 )  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'When reading to a 0D array, we do not accept data', &
753                                     &                         'with 1 or more spatial dimensions: '//cldmspc//' were found.' , &
754                                     &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
755                SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
756                CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_get(  kiomid, idvar, pvar, itime )
757                CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_get(    kiomid, idvar, pvar, itime )
758                CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_get( kiomid, idvar, pvar )
759                CASE DEFAULT   
760                   CALL ctl_stop( 'iom_g0d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
761                END SELECT
762             ENDIF
763          ENDIF
764      ELSE
765#if defined key_iomput
766       IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (0D): ', trim(cdvar)
767       CALL iom_swap( TRIM(rxios_context) )
768       CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pvar)
769       CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )
770#endif
771      ENDIF   
772   END SUBROUTINE iom_g0d
773
774   SUBROUTINE iom_g1d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrxios )
775      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file
776      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read
777      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                         ::   cdvar     ! Name of the variable
778      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:)           ::   pvar      ! read field
779      INTEGER         , INTENT(in   )              , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
780      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
781      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
782      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   lrxios    ! read data using XIOS
783      !
784      IF( kiomid > 0 ) THEN
785         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=pvar,   &
786              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
787              &                                                     lrxios=lrxios )
788      ENDIF
789   END SUBROUTINE iom_g1d
790
791   SUBROUTINE iom_g2d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, lrxios)
792      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kiomid    ! Identifier of the file
793      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kdom      ! Type of domain to be read
794      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                           ::   cdvar     ! Name of the variable
795      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:)           ::   pvar      ! read field
796      INTEGER         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
797      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
798      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
799      LOGICAL         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
800                                                                               ! look for and use a file attribute
801                                                                               ! called open_ocean_jstart to set the start
802                                                                               ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
803      LOGICAL         , INTENT(in   ),                 OPTIONAL ::   lrxios    ! read data using XIOS
804      !
805      IF( kiomid > 0 ) THEN
806         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r2d=pvar,   &
807              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
808              &                                                     lrowattr=lrowattr,  lrxios=lrxios)
809      ENDIF
810   END SUBROUTINE iom_g2d
811
812   SUBROUTINE iom_g3d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, lrxios )
813      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kiomid    ! Identifier of the file
814      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kdom      ! Type of domain to be read
815      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                             ::   cdvar     ! Name of the variable
816      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:,:)           ::   pvar      ! read field
817      INTEGER         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
818      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
819      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
820      LOGICAL         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
821                                                                                 ! look for and use a file attribute
822                                                                                 ! called open_ocean_jstart to set the start
823                                                                                 ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
824      LOGICAL         , INTENT(in   ),                   OPTIONAL ::   lrxios    ! read data using XIOS
825      !
826      IF( kiomid > 0 ) THEN
827         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r3d=pvar,   &
828              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
829              &                                                     lrowattr=lrowattr, lrxios=lrxios )
830      ENDIF
831   END SUBROUTINE iom_g3d
832   !!----------------------------------------------------------------------
833
834   SUBROUTINE iom_get_123d( kiomid, kdom  , cdvar ,   &
835         &                  pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d,   &
836         &                  ktime , kstart, kcount,   &
837         &                  lrowattr, lrxios        )
838      !!-----------------------------------------------------------------------
839      !!                  ***  ROUTINE  iom_get_123d  ***
840      !!
841      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable
842      !!
843      !! ** Method : read ONE record at each CALL
844      !!-----------------------------------------------------------------------
845      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid     ! Identifier of the file
846      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kdom       ! Type of domain to be read
847      CHARACTER(len=*)           , INTENT(in   )           ::   cdvar      ! Name of the variable
848      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d     ! read field (1D case)
849      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d     ! read field (2D case)
850      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d     ! read field (3D case)
851      INTEGER                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ktime      ! record number
852      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kstart     ! start position of the reading in each axis
853      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kcount     ! number of points to be read in each axis
854      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   lrowattr   ! logical flag telling iom_get to
855                                                                           ! look for and use a file attribute
856                                                                           ! called open_ocean_jstart to set the start
857                                                                           ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
858      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   lrxios     ! use XIOS to read restart
859      !
860      LOGICAL                        ::   lxios       ! local definition for XIOS read
861      LOGICAL                        ::   llnoov      ! local definition to read overlap
862      LOGICAL                        ::   luse_jattr  ! local definition to read open_ocean_jstart file attribute
863      INTEGER                        ::   jstartrow   ! start point for 2nd dimension optionally set by file attribute
864      INTEGER                        ::   jl          ! loop on number of dimension
865      INTEGER                        ::   idom        ! type of domain
866      INTEGER                        ::   idvar       ! id of the variable
867      INTEGER                        ::   inbdim      ! number of dimensions of the variable
868      INTEGER                        ::   idmspc      ! number of spatial dimensions
869      INTEGER                        ::   itime       ! record number
870      INTEGER                        ::   istop       ! temporary value of nstop
871      INTEGER                        ::   ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes
872      INTEGER                        ::   ji, jj      ! loop counters
873      INTEGER                        ::   irankpv     !
874      INTEGER                        ::   ind1, ind2  ! substring index
875      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   istart      ! starting point to read for each axis
876      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   icnt        ! number of value to read along each axis
877      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimsz      ! size of the dimensions of the variable
878      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   ishape      ! size of the dimensions of the variable
879      REAL(wp)                       ::   zscf, zofs  ! sacle_factor and add_offset
880      INTEGER                        ::   itmp        ! temporary integer
881      CHARACTER(LEN=256)             ::   clinfo      ! info character
882      CHARACTER(LEN=256)             ::   clname      ! file name
883      CHARACTER(LEN=1)               ::   clrankpv, cldmspc      !
884      LOGICAL                        ::   ll_depth_spec ! T => if kstart, kcount present then *only* use values for 3rd spatial dimension.
885      !---------------------------------------------------------------------
886      !
887      REAL(wp)                       :: gma, gmi
888      lxios = .FALSE.
889      if(PRESENT(lrxios)) lxios = lrxios
890      idvar = iom_varid( kiomid, cdvar ) 
891      idom = kdom
892
893      IF(.NOT.lxios) THEN
894          clname = iom_file(kiomid)%name   !   esier to read
895          clinfo = '          iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
896          ! local definition of the domain ?
897          ! do we read the overlap
898          ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
899          llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
900          ! check kcount and kstart optionals parameters...
901          IF( PRESENT(kcount) .AND. (.NOT. PRESENT(kstart)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kcount present needs kstart present')
902          IF( PRESENT(kstart) .AND. (.NOT. PRESENT(kcount)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kcount present')
903          IF( PRESENT(kstart) .AND. idom /= jpdom_unknown .AND.  idom /= jpdom_autoglo_xy  ) &
904     &           CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kdom = jpdom_unknown or kdom = jpdom_autoglo_xy')
905
906          luse_jattr = .false.
907          IF( PRESENT(lrowattr) ) THEN
908             IF( lrowattr .AND. idom /= jpdom_data   ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'lrowattr present and true needs kdom = jpdom_data')
909             IF( lrowattr .AND. idom == jpdom_data   ) luse_jattr = .true.
910          ENDIF
911          IF( luse_jattr ) THEN
912             SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
913             CASE (jpioipsl, jprstdimg )
914                 CALL ctl_warn(trim(clinfo), 'lrowattr present and true but this only works with netcdf (jpnf90)')
915                 luse_jattr = .false.
916             CASE (jpnf90   )   
917                 ! Ok
918             CASE DEFAULT   
919                CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
920             END SELECT
921          ENDIF
922
923          ! Search for the variable in the data base (eventually actualize data)
924          istop = nstop
925          !
926          IF( idvar > 0 ) THEN
927             ! to write iom_file(kiomid)%dimsz in a shorter way !
928             idimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(:, idvar) 
929             inbdim = iom_file(kiomid)%ndims(idvar)            ! number of dimensions in the file
930             idmspc = inbdim                                   ! number of spatial dimensions in the file
931             IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   idmspc = inbdim - 1
932             IF( idmspc > 3 )   CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'the file has more than 3 spatial dimensions this case is not coded...') 
933             !
934             ! update idom definition...
935             ! Identify the domain in case of jpdom_auto(glo/dta) definition
936             IF( idom == jpdom_autoglo_xy ) THEN
937                ll_depth_spec = .TRUE.
938                idom = jpdom_autoglo
939             ELSE
940                ll_depth_spec = .FALSE.
941             ENDIF
942             IF( idom == jpdom_autoglo .OR. idom == jpdom_autodta ) THEN           
943                IF( idom == jpdom_autoglo ) THEN   ;   idom = jpdom_global 
944                ELSE                               ;   idom = jpdom_data
945                ENDIF
946                ind1 = INDEX( clname, '_', back = .TRUE. ) + 1
947                ind2 = INDEX( clname, '.', back = .TRUE. ) - 1
948                IF( ind2 > ind1 ) THEN   ;   IF( VERIFY( clname(ind1:ind2), '0123456789' ) == 0 )   idom = jpdom_local   ;   ENDIF
949             ENDIF
950             ! Identify the domain in case of jpdom_local definition
951             IF( idom == jpdom_local ) THEN
952                IF(     idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN   ;   idom = jpdom_local_full
953                ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noextra
954                ELSEIF( idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap
955                ELSE   ;   CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'impossible to identify the local domain' )
956                ENDIF
957             ENDIF
958             !
959             ! check the consistency between input array and data rank in the file
960             !
961             ! initializations
962             itime = 1
963             IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
964
965             irankpv = 1 * COUNT( (/PRESENT(pv_r1d)/) ) + 2 * COUNT( (/PRESENT(pv_r2d)/) ) + 3 * COUNT( (/PRESENT(pv_r3d)/) )
966             WRITE(clrankpv, fmt='(i1)') irankpv
967             WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
968             !
969             IF(     idmspc <  irankpv ) THEN
970                CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'The file has only '//cldmspc//' spatial dimension',   &
971               &                         'it is impossible to read a '//clrankpv//'D array from this file...' )
972             ELSEIF( idmspc == irankpv ) THEN
973                IF( PRESENT(pv_r1d) .AND. idom /= jpdom_unknown )   &
974               &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'case not coded...You must use jpdom_unknown' )
975             ELSEIF( idmspc >  irankpv ) THEN
976                   IF( PRESENT(pv_r2d) .AND. itime == 1 .AND. idimsz(3) == 1 .AND. idmspc == 3 ) THEN
977                      CALL ctl_warn( trim(clinfo), '2D array but 3 spatial dimensions for the data...'              ,   &
978                        &         'As the size of the z dimension is 1 and as we try to read the first record, ',   &
979                        &         'we accept this case, even if there is a possible mix-up between z and time dimension' )   
980                      idmspc = idmspc - 1
981                   ELSE
982                      CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'To keep iom lisibility, when reading a '//clrankpv//'D array,'         ,   &
983                     &                         'we do not accept data with '//cldmspc//' spatial dimensions',   &
984                     &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
985                   ENDIF
986             ENDIF
987
988             !
989             ! definition of istart and icnt
990             !
991             icnt  (:) = 1
992             istart(:) = 1
993             istart(idmspc+1) = itime
994
995             IF( PRESENT(kstart) .AND. .NOT. ll_depth_spec ) THEN ; istart(1:idmspc) = kstart(1:idmspc) ; icnt(1:idmspc) = kcount(1:idmspc)
996             ELSE
997                IF(           idom == jpdom_unknown ) THEN                                                ; icnt(1:idmspc) = idimsz(1:idmspc)
998                ELSE
999                   IF( .NOT. PRESENT(pv_r1d) ) THEN   !   not a 1D array
1000                      IF(     idom == jpdom_data    ) THEN
1001                         jstartrow = 1
1002                         IF( luse_jattr ) THEN
1003                            CALL iom_getatt(kiomid, 'open_ocean_jstart', jstartrow ) ! -999 is returned if the attribute is not found
1004                            jstartrow = MAX(1,jstartrow)
1005                         ENDIF
1006                         istart(1:2) = (/ mig(1), mjg(1) + jstartrow - 1 /)  ! icnt(1:2) done below
1007                      ELSEIF( idom == jpdom_global  ) THEN ; istart(1:2) = (/ nimpp , njmpp  /)  ! icnt(1:2) done below
1008                      ENDIF
1009                      ! we do not read the overlap                     -> we start to read at nldi, nldj
1010! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1011!                  IF( idom /= jpdom_local_noovlap )   istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1012                      IF( llnoov .AND. idom /= jpdom_local_noovlap ) istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1013                  ! we do not read the overlap and the extra-halos -> from nldi to nlei and from nldj to nlej
1014! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1015!                  icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1016                      IF( llnoov ) THEN   ;   icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1017                      ELSE                ;   icnt(1:2) = (/ nlci           , nlcj            /)
1018                      ENDIF
1019                      IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1020                         IF( idom == jpdom_data ) THEN                                  ; icnt(3) = jpkdta
1021                         ELSE IF( ll_depth_spec .AND. PRESENT(kstart) ) THEN            ; istart(3) = kstart(3); icnt(3) = kcount(3)
1022                         ELSE                                                           ; icnt(3) = jpk
1023                         ENDIF
1024                      ENDIF
1025                   ENDIF
1026                ENDIF
1027             ENDIF
1028
1029             ! check that istart and icnt can be used with this file
1030             !-
1031             DO jl = 1, jpmax_dims
1032                itmp = istart(jl)+icnt(jl)-1
1033                IF( itmp > idimsz(jl) .AND. idimsz(jl) /= 0 ) THEN
1034                   WRITE( ctmp1, FMT="('(istart(', i1, ') + icnt(', i1, ') - 1) = ', i5)" ) jl, jl, itmp
1035                   WRITE( ctmp2, FMT="(' is larger than idimsz(', i1,') = ', i5)"         ) jl, idimsz(jl)
1036                   CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'start and count too big regarding to the size of the data, ', ctmp1, ctmp2 )     
1037                ENDIF
1038             END DO
1039
1040             ! check that icnt matches the input array
1041             !-     
1042             IF( idom == jpdom_unknown ) THEN
1043                IF( irankpv == 1 )        ishape(1:1) = SHAPE(pv_r1d)
1044                IF( irankpv == 2 )        ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d)
1045                IF( irankpv == 3 )        ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d)
1046                ctmp1 = 'd'
1047             ELSE
1048                IF( irankpv == 2 ) THEN
1049! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1050!               ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  ))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1051                   IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  )) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1052                   ELSE              ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(1   :nlci,1   :nlcj  )) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj)'
1053                   ENDIF
1054                ENDIF
1055                IF( irankpv == 3 ) THEN 
1056! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1057!               ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1058                   IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1059                   ELSE              ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(1   :nlci,1   :nlcj,:)) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj,:)'
1060                   ENDIF
1061                ENDIF
1062             ENDIF
1063         
1064             DO jl = 1, irankpv
1065                WRITE( ctmp2, FMT="(', ', i1,'): ', i5,' /= icnt(', i1,'):', i5)" ) jl, ishape(jl), jl, icnt(jl)
1066                IF( ishape(jl) /= icnt(jl) )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'size(pv_r'//clrankpv//TRIM(ctmp1)//TRIM(ctmp2) )
1067             END DO
1068
1069          ENDIF
1070
1071          ! read the data
1072          !-     
1073          IF( idvar > 0 .AND. istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1074             !
1075             ! find the right index of the array to be read
1076! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1077!         IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1078!         ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1079!         ENDIF
1080             IF( llnoov ) THEN
1081                IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1082                ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1083                ENDIF
1084             ELSE
1085                IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = 1      ;   ix2 = nlci      ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
1086                ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1087                ENDIF
1088             ENDIF
1089     
1090             SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1091             CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_get(  kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
1092                &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
1093             CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_get(    kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
1094                &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
1095             CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_get( kiomid, idom, idvar, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
1096                &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
1097             CASE DEFAULT   
1098                CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1099             END SELECT
1100
1101             IF( istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1102                IF(lwp) WRITE(numout,"(10x,' read ',a,' (rec: ',i6,') in ',a,' ok')") TRIM(cdvar), itime, TRIM(iom_file(kiomid)%name)
1103         
1104                !--- overlap areas and extra hallows (mpp)
1105                IF(     PRESENT(pv_r2d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1106                   CALL lbc_lnk( pv_r2d,'Z',-999.,'no0' )
1107                ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1108                   ! this if could be simplified with the new lbc_lnk that works with any size of the 3rd dimension
1109                   IF( icnt(3) == jpk ) THEN
1110                      CALL lbc_lnk( pv_r3d,'Z',-999.,'no0' )
1111                   ELSE   ! put some arbitrary value (a call to lbc_lnk will be done later...)
1112                      DO jj = nlcj+1, jpj   ;   pv_r3d(1:nlci, jj, :) = pv_r3d(1:nlci, nlej, :)   ;   END DO
1113                      DO ji = nlci+1, jpi   ;   pv_r3d(ji    , : , :) = pv_r3d(nlei  , :   , :)   ;   END DO
1114                   ENDIF
1115                ENDIF
1116                !
1117             ELSE
1118                ! return if istop == nstop is false
1119                RETURN
1120             ENDIF
1121          ELSE
1122             ! return if statment idvar > 0 .AND. istop == nstop is false
1123             RETURN
1124          ENDIF
1125          !
1126       ELSE        ! read using XIOS. Only if KEY_IOMPUT is defined
1127#if defined key_iomput
1128!would be good to be able to check which context is active and swap only if current is not restart
1129          CALL iom_swap( TRIM(rxios_context) ) 
1130          IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1131             if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (3D): ',trim(cdvar)
1132             CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r3d)
1133             IF(idom /= jpdom_unknown ) then
1134                 CALL lbc_lnk( pv_r3d,'Z',-999.,'no0' )
1135             ENDIF
1136          ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1137             if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (2D): ', trim(cdvar)
1138             CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r2d)
1139             IF(idom /= jpdom_unknown ) THEN
1140                 CALL lbc_lnk(pv_r2d,'Z',-999.,'no0')
1141             ENDIF
1142          ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1143             if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (1D): ', trim(cdvar)
1144             CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r1d)
1145          ENDIF
1146          CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )
1147#else
1148          istop = istop + 1 
1149          clinfo = 'Can not use XIOS in iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar)
1150#endif
1151       ENDIF
1152!some final adjustments
1153       ! C1D case : always call lbc_lnk to replicate the central value over the whole 3X3 domain
1154       IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r2d) )   CALL lbc_lnk( pv_r2d,'Z',1. )
1155       IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r3d) )   CALL lbc_lnk( pv_r3d,'Z',1. )
1156
1157       !--- Apply scale_factor and offset
1158       zscf = iom_file(kiomid)%scf(idvar)      ! scale factor
1159       zofs = iom_file(kiomid)%ofs(idvar)      ! offset
1160       IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1161          IF( zscf /= 1. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf 
1162          IF( zofs /= 0. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs
1163       ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1164!CDIR COLLAPSE
1165          IF( zscf /= 1.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf
1166!CDIR COLLAPSE
1167          IF( zofs /= 0.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs
1168       ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1169!CDIR COLLAPSE
1170          IF( zscf /= 1.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf
1171!CDIR COLLAPSE
1172          IF( zofs /= 0.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs
1173       ENDIF
1174   END SUBROUTINE iom_get_123d
1175
1176
1177   SUBROUTINE iom_gettime( kiomid, ptime, cdvar, kntime, cdunits, cdcalendar )
1178      !!--------------------------------------------------------------------
1179      !!                   ***  SUBROUTINE iom_gettime  ***
1180      !!
1181      !! ** Purpose : read the time axis cdvar in the file
1182      !!--------------------------------------------------------------------
1183      INTEGER                    , INTENT(in   ) ::   kiomid     ! file Identifier
1184      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out) ::   ptime      ! the time axis
1185      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(in   ) ::   cdvar      ! time axis name
1186      INTEGER         , OPTIONAL , INTENT(  out) ::   kntime     ! number of times in file
1187      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(  out) ::   cdunits    ! units attribute of time coordinate
1188      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(  out) ::   cdcalendar ! calendar attribute of
1189      !
1190      INTEGER, DIMENSION(1) :: kdimsz
1191      INTEGER            ::   idvar    ! id of the variable
1192      CHARACTER(LEN=32)  ::   tname    ! local name of time coordinate
1193      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo   ! info character
1194      !---------------------------------------------------------------------
1195      !
1196      IF ( PRESENT(cdvar) ) THEN
1197         tname = cdvar
1198      ELSE
1199         tname = iom_file(kiomid)%uldname
1200      ENDIF
1201      IF( kiomid > 0 ) THEN
1202         clinfo = 'iom_gettime, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(tname)
1203         IF ( PRESENT(kntime) ) THEN
1204            idvar  = iom_varid( kiomid, tname, kdimsz = kdimsz )
1205            kntime = kdimsz(1)
1206         ELSE
1207            idvar = iom_varid( kiomid, tname )
1208         ENDIF
1209         !
1210         ptime(:) = 0. ! default definition
1211         IF( idvar > 0 ) THEN
1212            IF( iom_file(kiomid)%ndims(idvar) == 1 ) THEN
1213               IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) ) THEN
1214                  IF( iom_file(kiomid)%dimsz(1,idvar) <= size(ptime) ) THEN
1215                     SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1216                     CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_gettime( kiomid, idvar, ptime, cdunits, cdcalendar )
1217                     CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_gettime(   kiomid, idvar, ptime, cdunits, cdcalendar )
1218                     CASE (jprstdimg)   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' case IO library == jprstdimg not coded...' )
1219                     CASE DEFAULT   
1220                        CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1221                     END SELECT
1222                  ELSE
1223                     WRITE(ctmp1,*) 'error with the size of ptime ',size(ptime),iom_file(kiomid)%dimsz(1,idvar)
1224                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), trim(ctmp1) )
1225                  ENDIF
1226               ELSE
1227                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'variable dimension is not unlimited... use iom_get' )
1228               ENDIF
1229            ELSE
1230               CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the variable has more than 1 dimension' )
1231            ENDIF
1232         ELSE
1233            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'variable not found in '//iom_file(kiomid)%name )
1234         ENDIF
1235      ENDIF
1236      !
1237   END SUBROUTINE iom_gettime
1238
1239
1240   !!----------------------------------------------------------------------
1241   !!                   INTERFACE iom_getatt
1242   !!----------------------------------------------------------------------
1243   SUBROUTINE iom_g0d_intatt( kiomid, cdatt, pvar )
1244      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
1245      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdatt     ! Name of the attribute
1246      INTEGER         , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
1247      !
1248      IF( kiomid > 0 ) THEN
1249         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1250            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1251            CASE (jpioipsl )   ;   CALL ctl_stop('iom_getatt: only nf90 available')
1252            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, pvar )
1253            CASE (jprstdimg)   ;   CALL ctl_stop('iom_getatt: only nf90 available')
1254            CASE DEFAULT   
1255               CALL ctl_stop( 'iom_g0d_att: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1256            END SELECT
1257         ENDIF
1258      ENDIF
1259   END SUBROUTINE iom_g0d_intatt
1260
1261
1262   !!----------------------------------------------------------------------
1263   !!                   INTERFACE iom_rstput
1264   !!----------------------------------------------------------------------
1265   SUBROUTINE iom_rp0d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
1266      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1267      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1268      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1269      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1270      REAL(wp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field
1271      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1272      INTEGER :: ivid   ! variable id
1273      IF( kiomid > 0 ) THEN
1274         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1275            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1276            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1277            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
1278            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
1279            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )    CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pvar )
1280            CASE DEFAULT     
1281               CALL ctl_stop( 'iom_rp0d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1282            END SELECT
1283         ENDIF
1284      ENDIF
1285   END SUBROUTINE iom_rp0d
1286
1287   SUBROUTINE iom_rp1d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
1288      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1289      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1290      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1291      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1292      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(          :) ::   pvar     ! written field
1293      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1294      INTEGER :: ivid   ! variable id
1295      IF( kiomid > 0 ) THEN
1296         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1297            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1298            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1299            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
1300            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
1301            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )    CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r1d = pvar )
1302            CASE DEFAULT     
1303               CALL ctl_stop( 'iom_rp1d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1304            END SELECT
1305         ENDIF
1306      ENDIF
1307   END SUBROUTINE iom_rp1d
1308
1309   SUBROUTINE iom_rp2d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
1310      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1311      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1312      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1313      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1314      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(:,    :    ) ::   pvar     ! written field
1315      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1316      INTEGER :: ivid   ! variable id
1317      IF( kiomid > 0 ) THEN
1318         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1319            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1320            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1321            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
1322            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
1323            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )   CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r2d = pvar ) 
1324            CASE DEFAULT     
1325               CALL ctl_stop( 'iom_rp2d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
1326            END SELECT
1327         ENDIF
1328      ENDIF
1329   END SUBROUTINE iom_rp2d
1330
1331   SUBROUTINE iom_rp3d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
1332      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1333      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1334      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1335      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1336      REAL(wp)        , INTENT(in),       DIMENSION(:,:,:) ::   pvar     ! written field
1337      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1338      INTEGER :: ivid   ! variable id
1339      IF( kiomid > 0 ) THEN
1340         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1341            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1342            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
1343            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
1344            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
1345            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )   CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r3d = pvar )
1346            CASE DEFAULT     
1347               CALL ctl_stop( 'iom_rp3d: accepted IO library are only jpioipsl and jprstdimg' )
1348            END SELECT
1349         ENDIF
1350      ENDIF
1351   END SUBROUTINE iom_rp3d
1352
1353
1354   !!----------------------------------------------------------------------
1355   !!                   INTERFACE iom_put
1356   !!----------------------------------------------------------------------
1357   SUBROUTINE iom_p0d( cdname, pfield0d )
1358      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
1359      REAL(wp)        , INTENT(in) ::   pfield0d
1360      REAL(wp)        , DIMENSION(jpi,jpj) ::   zz     ! masson
1361#if defined key_iomput
1362      zz(:,:)=pfield0d
1363      CALL xios_send_field(cdname, zz)
1364      !CALL xios_send_field(cdname, (/pfield0d/))
1365#else
1366      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield0d   ! useless test to avoid compilation warnings
1367#endif
1368   END SUBROUTINE iom_p0d
1369
1370   SUBROUTINE iom_p1d( cdname, pfield1d )
1371      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdname
1372      REAL(wp),     DIMENSION(:), INTENT(in) ::   pfield1d
1373#if defined key_iomput
1374      CALL xios_send_field( cdname, RESHAPE( (/pfield1d/), (/1,1,SIZE(pfield1d)/) ) )
1375#else
1376      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield1d   ! useless test to avoid compilation warnings
1377#endif
1378   END SUBROUTINE iom_p1d
1379
1380   SUBROUTINE iom_p2d( cdname, pfield2d )
1381      CHARACTER(LEN=*)            , INTENT(in) ::   cdname
1382      REAL(wp),     DIMENSION(:,:), INTENT(in) ::   pfield2d
1383#if defined key_iomput
1384      CALL xios_send_field(cdname, pfield2d)
1385#else
1386      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield2d   ! useless test to avoid compilation warnings
1387#endif
1388   END SUBROUTINE iom_p2d
1389
1390   SUBROUTINE iom_p3d( cdname, pfield3d )
1391      CHARACTER(LEN=*)                , INTENT(in) ::   cdname
1392      REAL(wp),       DIMENSION(:,:,:), INTENT(in) ::   pfield3d
1393#if defined key_iomput
1394      CALL xios_send_field(cdname, pfield3d)
1395#else
1396      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield3d   ! useless test to avoid compilation warnings
1397#endif
1398   END SUBROUTINE iom_p3d
1399   !!----------------------------------------------------------------------
1400
1401#if defined key_iomput
1402
1403   SUBROUTINE iom_set_domain_attr( cdid, ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj, zoom_ibegin, zoom_jbegin, zoom_ni, zoom_nj,   &
1404      &                                    data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj, lonvalue, latvalue, mask,     &
1405      &                                    nvertex, bounds_lon, bounds_lat, area )
1406      CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
1407      INTEGER                  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj
1408      INTEGER                  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj
1409      INTEGER                  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   zoom_ibegin, zoom_jbegin, zoom_ni, zoom_nj, nvertex
1410      REAL(wp), DIMENSION(:)   , OPTIONAL, INTENT(in) ::   lonvalue, latvalue
1411      REAL(wp), DIMENSION(:,:) , OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds_lon, bounds_lat, area
1412#if ! defined key_xios2
1413     LOGICAL,  DIMENSION(:,:) , OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1414#else
1415      LOGICAL,  DIMENSION(:) , OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1416#endif
1417
1418#if ! defined key_xios2
1419      IF ( xios_is_valid_domain     (cdid) ) THEN
1420         CALL xios_set_domain_attr     ( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1421            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1422            &    zoom_ibegin=zoom_ibegin, zoom_jbegin=zoom_jbegin, zoom_ni=zoom_ni, zoom_nj=zoom_nj,                       &
1423            &    lonvalue=lonvalue, latvalue=latvalue, mask=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon=bounds_lon,                  &
1424            &    bounds_lat=bounds_lat, area=area )
1425     ENDIF
1426      IF ( xios_is_valid_domaingroup(cdid) ) THEN
1427         CALL xios_set_domaingroup_attr( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1428            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1429            &    zoom_ibegin=zoom_ibegin, zoom_jbegin=zoom_jbegin, zoom_ni=zoom_ni, zoom_nj=zoom_nj,                       &
1430            &    lonvalue=lonvalue, latvalue=latvalue, mask=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon=bounds_lon,                  &
1431            &    bounds_lat=bounds_lat, area=area )
1432      ENDIF
1433
1434#else
1435      IF ( xios_is_valid_domain     (cdid) ) THEN
1436         CALL xios_set_domain_attr     ( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1437            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1438            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,                  &
1439            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear')
1440      ENDIF
1441      IF ( xios_is_valid_domaingroup(cdid) ) THEN
1442         CALL xios_set_domaingroup_attr( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1443            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1444            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,                  &
1445            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear' )
1446      ENDIF
1447#endif
1448      CALL xios_solve_inheritance()
1449
1450   END SUBROUTINE iom_set_domain_attr
1451
1452#if defined key_xios2
1453  SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr( cdid, ibegin, jbegin, ni, nj)
1454     CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
1455     INTEGER                  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   ibegin, jbegin, ni, nj
1456
1457     IF ( xios_is_valid_zoom_domain     (cdid) ) THEN
1458         CALL xios_set_zoom_domain_attr     ( cdid, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni,    &
1459           &   nj=nj)
1460    ENDIF
1461  END SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr
1462#endif
1463
1464
1465   SUBROUTINE iom_set_axis_attr( cdid, paxis, bounds )
1466      CHARACTER(LEN=*)      , INTENT(in) ::   cdid
1467      REAL(wp), DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   paxis
1468      REAL(wp), DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds
1469      IF ( PRESENT(paxis) ) THEN
1470#if ! defined key_xios2
1471         IF ( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, size=SIZE(paxis), value=paxis )
1472         IF ( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, size=SIZE(paxis), value=paxis )
1473#else
1474         IF ( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
1475         IF ( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
1476#endif
1477      ENDIF
1478      IF ( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, bounds=bounds )
1479      IF ( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, bounds=bounds )
1480      CALL xios_solve_inheritance()
1481   END SUBROUTINE iom_set_axis_attr
1482
1483   SUBROUTINE iom_set_field_attr( cdid, freq_op, freq_offset )
1484      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1485#if ! defined key_xios2
1486      CHARACTER(LEN=*)   ,OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_op
1487      CHARACTER(LEN=*)   ,OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_offset
1488#else
1489      TYPE(xios_duration),OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_op
1490      TYPE(xios_duration),OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_offset
1491#endif
1492      IF ( xios_is_valid_field     (cdid) )   CALL xios_set_field_attr       &
1493    &     ( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1494      IF ( xios_is_valid_fieldgroup(cdid) )   CALL xios_set_fieldgroup_attr  &
1495    &                    ( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1496      CALL xios_solve_inheritance()
1497   END SUBROUTINE iom_set_field_attr
1498
1499   SUBROUTINE iom_set_file_attr( cdid, name, name_suffix )
1500      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1501      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   name, name_suffix
1502      IF ( xios_is_valid_file     (cdid) )   CALL xios_set_file_attr     ( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1503      IF ( xios_is_valid_filegroup(cdid) )   CALL xios_set_filegroup_attr( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1504      CALL xios_solve_inheritance()
1505   END SUBROUTINE iom_set_file_attr
1506
1507
1508   SUBROUTINE iom_get_file_attr( cdid, name, name_suffix, output_freq )
1509      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in ) ::   cdid
1510      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(out) ::   name, name_suffix
1511#if ! defined key_xios2
1512      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(out) ::    output_freq
1513#else
1514      TYPE(xios_duration)   ,OPTIONAL , INTENT(out) :: output_freq
1515#endif 
1516      LOGICAL                                 ::   llexist1,llexist2,llexist3
1517      !---------------------------------------------------------------------
1518      IF( PRESENT( name        ) )   name = ''          ! default values
1519      IF( PRESENT( name_suffix ) )   name_suffix = ''
1520#if ! defined key_xios2
1521      IF( PRESENT( output_freq ) )   output_freq = ''
1522#else
1523      IF( PRESENT( output_freq ) )   output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
1524#endif
1525      IF ( xios_is_valid_file     (cdid) ) THEN
1526         CALL xios_solve_inheritance()
1527         CALL xios_is_defined_file_attr     ( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1528         IF(llexist1)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name = name )
1529         IF(llexist2)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name_suffix = name_suffix )
1530         IF(llexist3)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, output_freq = output_freq )
1531      ENDIF
1532      IF ( xios_is_valid_filegroup(cdid) ) THEN
1533         CALL xios_solve_inheritance()
1534         CALL xios_is_defined_filegroup_attr( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1535         IF(llexist1)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name = name )
1536         IF(llexist2)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name_suffix = name_suffix )
1537         IF(llexist3)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, output_freq = output_freq )
1538      ENDIF
1539   END SUBROUTINE iom_get_file_attr
1540
1541
1542   SUBROUTINE iom_set_grid_attr( cdid, mask )
1543      CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
1544      LOGICAL, DIMENSION(:,:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1545#if ! defined key_xios2
1546      IF ( xios_is_valid_grid     (cdid) )   CALL xios_set_grid_attr     ( cdid, mask=mask )
1547      IF ( xios_is_valid_gridgroup(cdid) )   CALL xios_set_gridgroup_attr( cdid, mask=mask )
1548#else
1549      IF ( xios_is_valid_grid     (cdid) )   CALL xios_set_grid_attr     ( cdid, mask_3D=mask )
1550      IF ( xios_is_valid_gridgroup(cdid) )   CALL xios_set_gridgroup_attr( cdid, mask_3D=mask )
1551#endif
1552      CALL xios_solve_inheritance()
1553   END SUBROUTINE iom_set_grid_attr
1554
1555   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
1556      INTEGER         , INTENT(in) ::   kt 
1557      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
1558      !     
1559      CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
1560      CALL xios_update_calendar(kt)
1561      IF( cdname /= TRIM(cxios_context) ) CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
1562      !
1563   END SUBROUTINE iom_setkt
1564
1565   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
1566      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdname
1567      !
1568      IF( xios_is_valid_context(cdname) ) THEN
1569         CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
1570         CALL xios_context_finalize() ! finalize the context
1571         IF( cdname /= TRIM(cxios_context) ) CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
1572      ENDIF
1573      !
1574   END SUBROUTINE iom_context_finalize
1575
1576
1577   SUBROUTINE set_grid( cdgrd, plon, plat, lmask )
1578      !!----------------------------------------------------------------------
1579      !!                     ***  ROUTINE set_grid  ***
1580      !!
1581      !! ** Purpose :   define horizontal grids
1582      !!
1583      !!----------------------------------------------------------------------
1584      CHARACTER(LEN=1)            , INTENT(in) ::   cdgrd
1585      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plon
1586      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
1587      !
1588      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zmask
1589      INTEGER  :: ni,nj
1590      LOGICAL :: lmask
1591     
1592      ni=nlei-nldi+1 ; nj=nlej-nldj+1
1593
1594#if ! defined key_xios2
1595     CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-1, jbegin=njmpp+nldj-1, ni=ni, nj=nj)
1596#else
1597     CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
1598#endif     
1599      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
1600      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, lonvalue = RESHAPE(plon(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /)),   &
1601         &                                     latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
1602
1603      IF ( lmask ) THEN
1604         ! mask land points, keep values on coast line -> specific mask for U, V and W points
1605         SELECT CASE ( cdgrd )
1606         CASE('T')   ;   zmask(:,:,:)       = tmask(:,:,:)
1607         CASE('U')   ;   zmask(2:jpim1,:,:) = tmask(2:jpim1,:,:) + tmask(3:jpi,:,:)   ;   CALL lbc_lnk( zmask, 'U', 1. )
1608         CASE('V')   ;   zmask(:,2:jpjm1,:) = tmask(:,2:jpjm1,:) + tmask(:,3:jpj,:)   ;   CALL lbc_lnk( zmask, 'V', 1. )
1609         CASE('W')   ;   zmask(:,:,2:jpk  ) = tmask(:,:,1:jpkm1) + tmask(:,:,2:jpk)   ;   zmask(:,:,1) = tmask(:,:,1)
1610         END SELECT
1611         !
1612#if ! defined key_xios2
1613         CALL iom_set_domain_attr( "grid_"//cdgrd       , mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ni,nj    /)) /= 0. )
1614#else
1615         CALL iom_set_domain_attr( "grid_"//cdgrd       , mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ni*nj    /)) /= 0. )
1616#endif 
1617         CALL iom_set_grid_attr  ( "grid_"//cdgrd//"_3D", mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,:),(/ni,nj,jpk/)) /= 0. )
1618      ENDIF
1619     
1620   END SUBROUTINE set_grid
1621
1622
1623   SUBROUTINE set_grid_bounds( cdgrd, plon_cnr, plat_cnr, plon_pnt, plat_pnt )
1624      !!----------------------------------------------------------------------
1625      !!                   ***  ROUTINE set_grid_bounds  ***
1626      !!
1627      !! ** Purpose :   define horizontal grid corners
1628      !!
1629      !!----------------------------------------------------------------------
1630      CHARACTER(LEN=1) , INTENT(in) :: cdgrd
1631      !
1632      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in)           :: plon_cnr, plat_cnr  ! Lat/lon coordinates of a contiguous vertex of cell (i,j)
1633      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), OPTIONAL, INTENT(in) :: plon_pnt, plat_pnt  ! Lat/lon coordinates of the point of cell (i,j)
1634      !
1635      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:,:)   :: z_bnds      ! Lat/lon coordinates of the vertices of cell (i,j)
1636      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)       :: z_fld       ! Working array to determine where to rotate cells
1637      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)       :: z_rot       ! Lat/lon working array for rotation of cells
1638      !
1639      INTEGER :: icnr, jcnr                                      ! Offset such that the vertex coordinate (i+icnr,j+jcnr)
1640      !                                                          ! represents the bottom-left corner of cell (i,j)
1641      INTEGER :: ji, jj, jn, ni, nj
1642
1643      ALLOCATE( z_bnds(4,jpi,jpj,2), z_fld(jpi,jpj), z_rot(4,2)  )
1644
1645      ! Offset of coordinate representing bottom-left corner
1646      SELECT CASE ( TRIM(cdgrd) )
1647         CASE ('T', 'W', 'N')
1648            icnr = -1 ; jcnr = -1
1649         CASE ('U')
1650            icnr =  0 ; jcnr = -1
1651         CASE ('V')
1652            icnr = -1 ; jcnr =  0
1653      END SELECT
1654
1655      ni = nlei-nldi+1 ; nj = nlej-nldj+1  ! Dimensions of subdomain interior
1656
1657      z_fld(:,:) = 1._wp
1658      CALL lbc_lnk( z_fld, cdgrd, -1. )    ! Working array for location of northfold
1659
1660      ! Cell vertices that can be defined
1661      DO jj = 2, jpjm1
1662         DO ji = 2, jpim1
1663            z_bnds(1,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
1664            z_bnds(2,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
1665            z_bnds(3,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
1666            z_bnds(4,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
1667            z_bnds(1,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
1668            z_bnds(2,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
1669            z_bnds(3,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
1670            z_bnds(4,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
1671         END DO
1672      END DO
1673
1674      ! Cell vertices on boundries
1675      DO jn = 1, 4
1676         CALL lbc_lnk( z_bnds(jn,:,:,1), cdgrd, 1., pval=999._wp )
1677         CALL lbc_lnk( z_bnds(jn,:,:,2), cdgrd, 1., pval=999._wp )
1678      END DO
1679
1680      ! Zero-size cells at closed boundaries if cell points provided,
1681      ! otherwise they are closed cells with unrealistic bounds
1682      IF( PRESENT(plon_pnt) .AND. PRESENT(plat_pnt) ) THEN
1683         IF( (nbondi == -1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
1684            DO jn = 1, 4        ! (West or jpni = 1), closed E-W
1685               z_bnds(jn,1,:,1) = plat_pnt(1,:)  ;  z_bnds(jn,1,:,2) = plon_pnt(1,:)
1686            END DO
1687         ENDIF
1688         IF( (nbondi == 1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
1689            DO jn = 1, 4        ! (East or jpni = 1), closed E-W
1690               z_bnds(jn,nlci,:,1) = plat_pnt(nlci,:)  ;  z_bnds(jn,nlci,:,2) = plon_pnt(nlci,:)
1691            END DO
1692         ENDIF
1693         IF( nbondj == -1 .OR. (nbondj == 2 .AND. jperio /= 2) ) THEN
1694            DO jn = 1, 4        ! South or (jpnj = 1, not symmetric)
1695               z_bnds(jn,:,1,1) = plat_pnt(:,1)  ;  z_bnds(jn,:,1,2) = plon_pnt(:,1)
1696            END DO
1697         ENDIF
1698         IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio  < 3 ) THEN
1699            DO jn = 1, 4        ! (North or jpnj = 1), no north fold
1700               z_bnds(jn,:,nlcj,1) = plat_pnt(:,nlcj)  ;  z_bnds(jn,:,nlcj,2) = plon_pnt(:,nlcj)
1701            END DO
1702         ENDIF
1703      ENDIF
1704
1705      ! Rotate cells at the north fold
1706      IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio >= 3 ) THEN
1707         DO jj = 1, jpj
1708            DO ji = 1, jpi
1709               IF( z_fld(ji,jj) == -1. ) THEN
1710                  z_rot(1,:) = z_bnds(3,ji,jj,:) ; z_rot(2,:) = z_bnds(4,ji,jj,:)
1711                  z_rot(3,:) = z_bnds(1,ji,jj,:) ; z_rot(4,:) = z_bnds(2,ji,jj,:)
1712                  z_bnds(:,ji,jj,:) = z_rot(:,:)
1713               ENDIF
1714            END DO
1715         END DO
1716
1717      ! Invert cells at the symmetric equator
1718      ELSE IF( nbondj == 2 .AND. jperio == 2 ) THEN
1719         DO ji = 1, jpi
1720            z_rot(1:2,:) = z_bnds(3:4,ji,1,:)
1721            z_rot(3:4,:) = z_bnds(1:2,ji,1,:)
1722            z_bnds(:,ji,1,:) = z_rot(:,:)
1723         END DO
1724      ENDIF
1725
1726      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, bounds_lat = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ 4,ni*nj /)),           &
1727                                               bounds_lon = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,2),(/ 4,ni*nj /)), nvertex=4 )
1728
1729      DEALLOCATE( z_bnds, z_fld, z_rot ) 
1730
1731   END SUBROUTINE set_grid_bounds
1732
1733
1734   SUBROUTINE set_grid_znl( plat )
1735      !!----------------------------------------------------------------------
1736      !!                     ***  ROUTINE set_grid_znl  ***
1737      !!
1738      !! ** Purpose :   define grids for zonal mean
1739      !!
1740      !!----------------------------------------------------------------------
1741      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
1742      !
1743      REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE  ::   zlon
1744      INTEGER  :: ni,nj, ix, iy
1745
1746     
1747      ni=nlei-nldi+1 ; nj=nlej-nldj+1            ! define zonal mean domain (jpj*jpk)
1748      ALLOCATE( zlon(ni*nj) )       ;       zlon(:) = 0.
1749
1750      CALL dom_ngb( 180., 90., ix, iy, 'T' ) !  i-line that passes near the North Pole : Reference latitude (used in plots)
1751#if ! defined key_xios2
1752      CALL iom_set_domain_attr("gznl", ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-1, jbegin=njmpp+nldj-1, ni=ni, nj=nj)
1753      CALL iom_set_domain_attr("gznl", data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
1754      CALL iom_set_domain_attr("gznl", lonvalue = zlon,   &
1755         &                             latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
1756      !
1757      CALL iom_set_domain_attr ('ptr', zoom_ibegin=ix, zoom_nj=jpjglo)
1758#else
1759! Pas teste : attention aux indices !
1760      CALL iom_set_domain_attr("gznl", ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
1761      CALL iom_set_domain_attr("gznl", data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
1762      CALL iom_set_domain_attr("gznl", lonvalue = zlon,   &
1763         &                             latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
1764       CALL iom_set_zoom_domain_attr ("ptr", ibegin=ix-1, jbegin=0, ni=1, nj=jpjglo)
1765#endif
1766
1767      CALL iom_update_file_name('ptr')
1768      !
1769   END SUBROUTINE set_grid_znl
1770
1771   SUBROUTINE set_scalar
1772      !!----------------------------------------------------------------------
1773      !!                     ***  ROUTINE set_scalar  ***
1774      !!
1775      !! ** Purpose :   define fake grids for scalar point
1776      !!
1777      !!----------------------------------------------------------------------
1778      REAL(wp), DIMENSION(1)   ::   zz = 1.
1779      !!----------------------------------------------------------------------
1780#if ! defined key_xios2
1781      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', ni_glo=jpnij, nj_glo=1, ibegin=narea, jbegin=1, ni=1, nj=1)
1782#else
1783      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', ni_glo=jpnij, nj_glo=1, ibegin=narea-1, jbegin=0, ni=1, nj=1)
1784#endif
1785      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', data_dim=2, data_ibegin = 1, data_ni = 1, data_jbegin = 1, data_nj = 1)
1786     
1787      zz=REAL(narea,wp)
1788      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', lonvalue=zz, latvalue=zz)
1789     
1790   END SUBROUTINE set_scalar
1791
1792   SUBROUTINE set_1point
1793      !!----------------------------------------------------------------------
1794      !!                     ***  ROUTINE set_1point  ***
1795      !!
1796      !! ** Purpose :   define zoom grid for scalar fields
1797      !!
1798      !!----------------------------------------------------------------------
1799      REAL(wp), DIMENSION(1)   ::   zz = 1.
1800      INTEGER  :: ix, iy
1801      !!----------------------------------------------------------------------
1802      CALL dom_ngb( 180., 90., ix, iy, 'T' ) !  Nearest point to north pole should be ocean
1803      CALL iom_set_domain_attr('1point', zoom_ibegin=ix, zoom_jbegin=iy)
1804
1805   END SUBROUTINE set_1point
1806
1807
1808
1809   SUBROUTINE set_xmlatt
1810      !!----------------------------------------------------------------------
1811      !!                     ***  ROUTINE set_xmlatt  ***
1812      !!
1813      !! ** Purpose :   automatic definitions of some of the xml attributs...
1814      !!
1815      !!----------------------------------------------------------------------
1816      CHARACTER(len=1),DIMENSION( 3) ::   clgrd                    ! suffix name
1817      CHARACTER(len=256)             ::   clsuff                   ! suffix name
1818      CHARACTER(len=1)               ::   cl1                      ! 1 character
1819      CHARACTER(len=2)               ::   cl2                      ! 2 characters
1820      CHARACTER(len=3)               ::   cl3                      ! 3 characters
1821      INTEGER                        ::   ji, jg                   ! loop counters
1822      INTEGER                        ::   ix, iy                   ! i-,j- index
1823      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlontao                  ! longitudes of tao    moorings
1824      REAL(wp)        ,DIMENSION( 7) ::   zlattao                  ! latitudes  of tao    moorings
1825      REAL(wp)        ,DIMENSION( 4) ::   zlonrama                 ! longitudes of rama   moorings
1826      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlatrama                 ! latitudes  of rama   moorings
1827      REAL(wp)        ,DIMENSION( 3) ::   zlonpira                 ! longitudes of pirata moorings
1828      REAL(wp)        ,DIMENSION( 9) ::   zlatpira                 ! latitudes  of pirata moorings
1829#if  defined key_xios2
1830      TYPE(xios_duration)            ::   f_op, f_of
1831#endif
1832 
1833      !!----------------------------------------------------------------------
1834      !
1835      ! frequency of the call of iom_put (attribut: freq_op)
1836#if ! defined key_xios2
1837      WRITE(cl1,'(i1)')        1   ;   CALL iom_set_field_attr('field_definition', freq_op=cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1838      WRITE(cl1,'(i1)')  nn_fsbc   ;   CALL iom_set_field_attr('SBC'             , freq_op=cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1839      WRITE(cl1,'(i1)')  nn_fsbc   ;   CALL iom_set_field_attr('SBC_scalar'      , freq_op=cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1840      WRITE(cl1,'(i1)') nn_dttrc   ;   CALL iom_set_field_attr('ptrc_T'          , freq_op=cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1841      WRITE(cl1,'(i1)') nn_dttrc   ;   CALL iom_set_field_attr('diad_T'          , freq_op=cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1842#else
1843      f_op%timestep = 1        ;  f_of%timestep = 0  ; CALL iom_set_field_attr('field_definition', freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
1844      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep = 0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC'             , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
1845      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep = 0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC_scalar'      , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
1846      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep = 0  ; CALL iom_set_field_attr('ptrc_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
1847      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep = 0  ; CALL iom_set_field_attr('diad_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
1848#endif
1849       
1850      ! output file names (attribut: name)
1851      DO ji = 1, 9
1852         WRITE(cl1,'(i1)') ji 
1853         CALL iom_update_file_name('file'//cl1)
1854      END DO
1855      DO ji = 1, 99
1856         WRITE(cl2,'(i2.2)') ji 
1857         CALL iom_update_file_name('file'//cl2)
1858      END DO
1859      DO ji = 1, 999
1860         WRITE(cl3,'(i3.3)') ji 
1861         CALL iom_update_file_name('file'//cl3)
1862      END DO
1863
1864      ! Zooms...
1865      clgrd = (/ 'T', 'U', 'W' /) 
1866      DO jg = 1, SIZE(clgrd)                                                                   ! grid type
1867         cl1 = clgrd(jg)
1868         ! Equatorial section (attributs: jbegin, ni, name_suffix)
1869         CALL dom_ngb( 0., 0., ix, iy, cl1 )
1870#if ! defined key_xios2
1871         CALL iom_set_domain_attr ('Eq'//cl1, zoom_jbegin=iy, zoom_ni=jpiglo)
1872#else
1873         CALL iom_set_zoom_domain_attr ('Eq'//cl1, jbegin=iy-1, ni=jpiglo)
1874#endif
1875         CALL iom_get_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = clsuff             )
1876         CALL iom_set_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_Eq')
1877         CALL iom_update_file_name('Eq'//cl1)
1878      END DO
1879      ! TAO moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1880      zlontao = (/ 137.0, 147.0, 156.0, 165.0, -180.0, -170.0, -155.0, -140.0, -125.0, -110.0, -95.0 /)
1881      zlattao = (/  -8.0,  -5.0,  -2.0,   0.0,    2.0,    5.0,    8.0 /)
1882      CALL set_mooring( zlontao, zlattao )
1883      ! RAMA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1884      zlonrama = (/  55.0,  67.0, 80.5, 90.0 /)
1885      zlatrama = (/ -16.0, -12.0, -8.0, -4.0, -1.5, 0.0, 1.5, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0 /)
1886      CALL set_mooring( zlonrama, zlatrama )
1887      ! PIRATA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1888      zlonpira = (/ -38.0, -23.0, -10.0 /)
1889      zlatpira = (/ -19.0, -14.0,  -8.0, 0.0, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0, 20.0 /)
1890      CALL set_mooring( zlonpira, zlatpira )
1891
1892     
1893   END SUBROUTINE set_xmlatt
1894
1895
1896   SUBROUTINE set_mooring( plon, plat)
1897      !!----------------------------------------------------------------------
1898      !!                     ***  ROUTINE set_mooring  ***
1899      !!
1900      !! ** Purpose :   automatic definitions of moorings xml attributs...
1901      !!
1902      !!----------------------------------------------------------------------
1903      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in) ::  plon, plat           ! longitudes/latitudes oft the mooring
1904      !
1905!!$      CHARACTER(len=1),DIMENSION(4) ::   clgrd = (/ 'T', 'U', 'V', 'W' /)   ! suffix name
1906      CHARACTER(len=1),DIMENSION(1) ::   clgrd = (/ 'T' /)        ! suffix name
1907      CHARACTER(len=256)            ::   clname                   ! file name
1908      CHARACTER(len=256)            ::   clsuff                   ! suffix name
1909      CHARACTER(len=1)              ::   cl1                      ! 1 character
1910      CHARACTER(len=6)              ::   clon,clat                ! name of longitude, latitude
1911      INTEGER                       ::   ji, jj, jg               ! loop counters
1912      INTEGER                       ::   ix, iy                   ! i-,j- index
1913      REAL(wp)                      ::   zlon, zlat
1914      !!----------------------------------------------------------------------
1915      DO jg = 1, SIZE(clgrd)
1916         cl1 = clgrd(jg)
1917         DO ji = 1, SIZE(plon)
1918            DO jj = 1, SIZE(plat)
1919               zlon = plon(ji)
1920               zlat = plat(jj)
1921               ! modifications for RAMA moorings
1922               IF( zlon ==  67. .AND. zlat ==  15. )   zlon =  65.
1923               IF( zlon ==  90. .AND. zlat <=  -4. )   zlon =  95.
1924               IF( zlon ==  95. .AND. zlat ==  -4. )   zlat =  -5.
1925               ! modifications for PIRATA moorings
1926               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -19. )   zlon = -34.
1927               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -14. )   zlon = -32.
1928               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==  -8. )   zlon = -30.
1929               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==   0. )   zlon = -35.
1930               IF( zlon == -23. .AND. zlat ==  20. )   zlat =  21.
1931               IF( zlon == -10. .AND. zlat == -14. )   zlat = -10.
1932               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==  -8. )   zlat =  -6.
1933               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==   4. ) THEN   ;   zlon = 0.   ;   zlat = 0.   ;   ENDIF
1934               CALL dom_ngb( zlon, zlat, ix, iy, cl1 )
1935               IF( zlon >= 0. ) THEN 
1936                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT( zlon), 'e'
1937                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')       zlon , 'e'
1938                  ENDIF
1939               ELSE             
1940                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT(-zlon), 'w'
1941                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')      -zlon , 'w'
1942                  ENDIF
1943               ENDIF
1944               IF( zlat >= 0. ) THEN 
1945                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT( zlat), 'n'
1946                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')       zlat , 'n'
1947                  ENDIF
1948               ELSE             
1949                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT(-zlat), 's'
1950                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')      -zlat , 's'
1951                  ENDIF
1952               ENDIF
1953               clname = TRIM(ADJUSTL(clat))//TRIM(ADJUSTL(clon))
1954#if ! defined key_xios2
1955               CALL iom_set_domain_attr (TRIM(clname)//cl1, zoom_ibegin= ix, zoom_jbegin= iy)
1956#else
1957               CALL iom_set_zoom_domain_attr  (TRIM(clname)//cl1, ibegin= ix-1, jbegin= iy-1)
1958#endif
1959               CALL iom_get_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = clsuff                         )
1960               CALL iom_set_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_'//TRIM(clname))
1961               CALL iom_update_file_name(TRIM(clname)//cl1)
1962            END DO
1963         END DO
1964      END DO
1965     
1966   END SUBROUTINE set_mooring
1967
1968   
1969   SUBROUTINE iom_update_file_name( cdid )
1970      !!----------------------------------------------------------------------
1971      !!                     ***  ROUTINE iom_update_file_name  ***
1972      !!
1973      !! ** Purpose :   
1974      !!
1975      !!----------------------------------------------------------------------
1976      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1977      !
1978      CHARACTER(LEN=256) ::   clname
1979      CHARACTER(LEN=20)  ::   clfreq
1980      CHARACTER(LEN=20)  ::   cldate
1981      INTEGER            ::   idx
1982      INTEGER            ::   jn
1983      INTEGER            ::   itrlen
1984      INTEGER            ::   iyear, imonth, iday, isec
1985      REAL(wp)           ::   zsec
1986      LOGICAL            ::   llexist
1987#if  defined key_xios2
1988      TYPE(xios_duration)   ::   output_freq 
1989#endif     
1990      !!----------------------------------------------------------------------
1991
1992
1993      DO jn = 1,2
1994#if ! defined key_xios2
1995         IF( jn == 1 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name        = clname, output_freq = clfreq )
1996#else
1997         output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
1998         IF( jn == 1 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name        = clname, output_freq = output_freq )
1999#endif
2000         IF( jn == 2 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2001
2002         IF ( TRIM(clname) /= '' ) THEN
2003
2004            idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2005            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2006               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cexper)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2007               idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2008            END DO
2009
2010#if ! defined key_xios2
2011            idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2012            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2013               IF ( TRIM(clfreq) /= '' ) THEN
2014                  itrlen = LEN_TRIM(clfreq)
2015                  IF ( clfreq(itrlen-1:itrlen) == 'mo' ) clfreq = clfreq(1:itrlen-1)
2016                  clname = clname(1:idx-1)//TRIM(clfreq)//clname(idx+6:LEN_TRIM(clname))
2017               ELSE
2018                  CALL ctl_stop('error in the name of file id '//TRIM(cdid),   &
2019                     & ' attribute output_freq is undefined -> cannot replace @freq@ in '//TRIM(clname) )
2020               ENDIF
2021               idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2022            END DO
2023#else
2024            idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2025            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2026              IF ( output_freq%timestep /= 0) THEN
2027                  WRITE(clfreq,'(I18,A2)')INT(output_freq%timestep),'ts' 
2028                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2029              ELSE IF ( output_freq%hour /= 0 ) THEN
2030                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%hour),'h' 
2031                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2032              ELSE IF ( output_freq%day /= 0 ) THEN
2033                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%day),'d' 
2034                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2035              ELSE IF ( output_freq%month /= 0 ) THEN   
2036                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%month),'m' 
2037                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2038              ELSE IF ( output_freq%year /= 0 ) THEN   
2039                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%year),'y' 
2040                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2041              ELSE
2042                  CALL ctl_stop('error in the name of file id '//TRIM(cdid),   &
2043                     & ' attribute output_freq is undefined -> cannot replace @freq@ in '//TRIM(clname) )
2044              ENDIF
2045              clname = clname(1:idx-1)//TRIM(ADJUSTL(clfreq))//clname(idx+6:LEN_TRIM(clname))
2046              idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2047            END DO
2048#endif
2049            idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2050            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2051               cldate = iom_sdate( fjulday - rdttra(1) / rday )
2052               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+11:LEN_TRIM(clname))
2053               idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2054            END DO
2055
2056            idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2057            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2058               cldate = iom_sdate( fjulday - rdttra(1) / rday, ldfull = .TRUE. )
2059               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+15:LEN_TRIM(clname))
2060               idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2061            END DO
2062
2063            idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2064            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2065               cldate = iom_sdate( fjulday + rdttra(1) / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE. )
2066               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2067               idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2068            END DO
2069
2070            idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2071            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2072               cldate = iom_sdate( fjulday + rdttra(1) / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE., ldfull = .TRUE. )
2073               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+13:LEN_TRIM(clname))
2074               idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2075            END DO
2076
2077            IF( jn == 1 .AND. TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname)
2078            IF( jn == 1 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name        = clname )
2079            IF( jn == 2 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2080
2081         ENDIF
2082
2083      END DO
2084
2085   END SUBROUTINE iom_update_file_name
2086
2087
2088   FUNCTION iom_sdate( pjday, ld24, ldfull )
2089      !!----------------------------------------------------------------------
2090      !!                     ***  ROUTINE iom_sdate  ***
2091      !!
2092      !! ** Purpose :   send back the date corresponding to the given julian day
2093      !!
2094      !!----------------------------------------------------------------------
2095      REAL(wp), INTENT(in   )           ::   pjday         ! julian day
2096      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ld24          ! true to force 24:00 instead of 00:00
2097      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldfull        ! true to get the compleate date: yyyymmdd_hh:mm:ss
2098      !
2099      CHARACTER(LEN=20) ::   iom_sdate
2100      CHARACTER(LEN=50) ::   clfmt                         !  format used to write the date
2101      INTEGER           ::   iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec
2102      REAL(wp)          ::   zsec
2103      LOGICAL           ::   ll24, llfull
2104      !
2105      IF( PRESENT(ld24) ) THEN   ;   ll24 = ld24
2106      ELSE                       ;   ll24 = .FALSE.
2107      ENDIF
2108
2109      IF( PRESENT(ldfull) ) THEN   ;   llfull = ldfull
2110      ELSE                         ;   llfull = .FALSE.
2111      ENDIF
2112
2113      CALL ju2ymds( pjday, iyear, imonth, iday, zsec )
2114      isec = NINT(zsec)
2115
2116      IF ( ll24 .AND. isec == 0 ) THEN   ! 00:00 of the next day -> move to 24:00 of the current day
2117         CALL ju2ymds( pjday - 1., iyear, imonth, iday, zsec )
2118         isec = 86400
2119      ENDIF
2120
2121      IF( iyear < 10000 ) THEN   ;   clfmt = "i4.4,2i2.2"                ! format used to write the date
2122      ELSE                       ;   WRITE(clfmt, "('i',i1,',2i2.2')") INT(LOG10(REAL(iyear,wp))) + 1
2123      ENDIF
2124     
2125!$AGRIF_DO_NOT_TREAT     
2126! Should be fixed in the conv
2127      IF( llfull ) THEN
2128         clfmt = TRIM(clfmt)//",'_',i2.2,':',i2.2,':',i2.2"
2129         ihour   = isec / 3600
2130         isec    = MOD(isec, 3600)
2131         iminute = isec / 60
2132         isec    = MOD(isec, 60)
2133         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec    ! date of the end of run
2134      ELSE
2135         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday                          ! date of the end of run
2136      ENDIF
2137!$AGRIF_END_DO_NOT_TREAT     
2138
2139   END FUNCTION iom_sdate
2140
2141#else
2142
2143
2144   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
2145      INTEGER         , INTENT(in)::   kt 
2146      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2147      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) kt, cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2148   END SUBROUTINE iom_setkt
2149
2150   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
2151      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2152      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*)  cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2153   END SUBROUTINE iom_context_finalize
2154
2155#endif
2156
2157   LOGICAL FUNCTION iom_use( cdname )
2158      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2159#if defined key_iomput
2160      iom_use = xios_field_is_active( cdname )
2161#else
2162      iom_use = .FALSE.
2163#endif
2164   END FUNCTION iom_use
2165   
2166   !!======================================================================
2167END MODULE iom
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.