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bio_medusa_mod.F90 in branches/UKMO/dev_r5518_medusa_chg_trc_bio_medusa/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA – NEMO

source: branches/UKMO/dev_r5518_medusa_chg_trc_bio_medusa/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA/bio_medusa_mod.F90 @ 8012

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Line 
1MODULE bio_medusa_mod
2   !!======================================================================
3   !!                      ***  MODULE  bio_medusa_mod  ***
4   !! MEDUSA variables   :  module for MEDUSA variables which are shared
5   !!                       across subroutines
6   !!======================================================================
7   !! History :
8   !!   -   ! 2017-04 (M. Stringer)        Code taken from trcbio_medusa.F90
9   !!----------------------------------------------------------------------
10#if defined key_medusa
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!   'key_medusa'                                           MEDUSA
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   USE par_kind,          ONLY: wp
15   
16   IMPLICIT NONE
17   PUBLIC
18
19   PUBLIC   bio_medusa_alloc     ! called by trcini.F90
20
21   !! model state variables
22   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zchn,zchd,zphn,zphd,zpds,zzmi
23   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zzme,zdet,zdtc,zdin,zsil,zfer
24# if defined key_roam
25   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zdic, zalk, zoxy
26   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ztmp, zsal
27# endif
28# if defined key_mocsy
29   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zpho
30# endif
31
32   !! integrated source and sink terms
33   REAL(wp) ::    b0
34
35   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fthetan,faln,fchn1,fchn
36   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fjln,fprn,frn
37   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fthetad,fald,fchd1,fchd
38   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fjld,fprd,frd
39
40   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fjlim_pn, fjlim_pd
41   !! AXY (03/02/11): add in Liebig terms
42   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fpnlim, fpdlim
43   !! AXY (16/07/09): add in Eppley curve functionality
44   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fun_T,xvpnT,xvpdT
45
46   !! AXY (16/05/11): per Katya's prompting, add in new T-dependence
47   !!                 for phytoplankton growth only (i.e. no change
48   !!                 for remineralisation)
49   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fun_Q10
50   !! AXY (01/03/10): add in mixed layer PP diagnostics
51   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fprn_ml,fprd_ml
52   !!
53   !! nutrient limiting factors
54   !! N and Fe (renaming ffln to ffln2 to avoid conflict with
55   !! ffln in module sms_medusa - marc 25/4/17)
56   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnln,ffln2
57   !! N, Fe and Si
58   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnld,ffld,fsld,fsld2
59   !!
60   !! silicon cycle
61   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsin,fnsi,fprds,fsdiss
62
63   !! iron cycle; includes parameters for Parekh et al. (2005) iron scheme
64   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffetop,ffebot,ffescav
65   !! Variable for iron-ligand system
66   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: xFree
67
68   !! Microzooplankton grazing
69   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fmi1,fmi,fgmipn,fgmid,fgmidc
70   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: finmi,ficmi,fstarmi,fmith
71   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fmigrow,fmiexcr,fmiresp
72   !!
73   !! Mesozooplankton grazing
74   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fme1,fme,fgmepn,fgmepd
75   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fgmepds,fgmezmi,fgmed,fgmedc
76   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: finme,ficme,fstarme,fmeth
77   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fmegrow,fmeexcr,fmeresp
78   !!
79   !! mortality/Remineralisation
80   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdpn,fdpd,fdpds,fdzmi,fdzme,fdd
81# if defined key_roam
82   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fddc
83# endif
84   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdpn2,fdpd2,fdpds2,fdzmi2,fdzme2
85   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fslown, fslowc
86   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fslownflux, fslowcflux
87   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregen,fregensi
88   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregenfast,fregenfastsi
89# if defined key_roam
90   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fregenfastc
91# endif
92
93   !! Particle flux
94   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fdep1,fcaco3
95   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempn,ftempsi,ftempfe
96   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftempc,ftempca
97   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminn,freminsi,freminfe
98   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: freminc,freminca
99   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffastn,ffastsi,ffastfe
100   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffastc,ffastca
101   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fprotf
102   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsedn,fsedsi,fsedfe,fsedc,fsedca
103   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fccd
104   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fccd_dep
105
106   !! AXY (08/07/11): fate of fast detritus reaching the seafloor
107   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ffast2slown,ffast2slowc
108
109   !! water column nutrient and flux integrals
110   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_n,ftot_si,ftot_fe
111   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fflx_n,fflx_si,fflx_fe
112   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fifd_n,fifd_si,fifd_fe
113   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fofd_n,fofd_si,fofd_fe
114# if defined key_roam
115   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_c,ftot_a,ftot_o2
116   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fflx_c,fflx_a,fflx_o2
117   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fifd_c,fifd_a,fifd_o2
118   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fofd_c,fofd_a,fofd_o2
119# endif
120
121   !! Zooplankton grazing integrals
122   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fzmi_i,fzmi_o,fzme_i,fzme_o
123
124   !! Limitation term temporary variables
125   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_pn,ftot_pd
126   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: ftot_zmi,ftot_zme,ftot_det,ftot_dtc
127
128   !! use biological fluxes (1) or not (0)
129   INTEGER  ::    ibio_switch
130   !!
131   !! diagnose fluxes (should only be used in 1D runs)
132   INTEGER                               :: idf, idfval
133
134   !! Nitrogen and silicon production and consumption
135   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fnit_prod,fnit_cons
136   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fsil_prod,fsil_cons
137
138   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_xco2a
139   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_ph,f_pco2w,f_h2co3
140   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_hco3,f_co3,f_co2flux
141   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_TDIC,f_TALK,f_dcf,f_henry
142   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_pp0
143   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_kw660,f_o2flux,f_o2sat
144   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_omcal,f_omarg
145
146   !! AXY (23/06/15): additional diagnostics for MOCSY and oxygen
147   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_fco2w,f_BetaD,f_rhosw,f_opres
148   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_insitut,f_pco2atm,f_fco2atm
149   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_schmidtco2,f_kwco2,f_K0
150   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_co2starair,f_dpco2,f_kwo2
151
152   INTEGER, ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)  :: iters 
153
154   !! Carbon, alkalinity production and consumption
155   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fcomm_resp
156   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fcar_prod,fcar_cons
157
158   !! Oxygen production and consumption (and non-consumption)
159   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: foxy_prod,foxy_cons,foxy_anox
160
161   !! Add DMS in MEDUSA for UKESM1 model
162   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: dms_surf
163   !! AXY (13/03/15): add in other DMS calculations
164   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: dms_andr,dms_simo,dms_aran,dms_hall
165
166   !! Benthic fluxes
167   INTEGER  ::    ibenthic
168   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_sbenin_n,f_sbenin_fe,f_sbenin_c
169   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_fbenin_n,f_fbenin_fe,f_fbenin_si
170   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_fbenin_c,f_fbenin_ca
171   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_n,f_benout_fe,f_benout_si 
172   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_c,f_benout_ca
173
174   !! Benthic fluxes of CaCO3 that shouldn't happen because of lysocline
175   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_benout_lyso_ca
176
177   !! riverine fluxes
178   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_runoff,f_riv_n,f_riv_si
179   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_c,f_riv_alk
180   !! AXY (19/07/12): variables for local riverine fluxes to handle
181   !! inputs below surface
182   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_loc_n,f_riv_loc_si
183   REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: f_riv_loc_c, f_riv_loc_alk
184
185   !! Jpalm -- 11-10-2015 -- adapt diag to iom_use
186   !! 2D var for diagnostics.
187   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fprn2d, fdpn2d, fprd2d, fdpd2d
188   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fprds2d, fsdiss2d, fgmipn2d
189   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fgmid2d, fdzmi2d, fgmepn2d
190   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fgmepd2d, fgmezmi2d, fgmed2d
191   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fdzme2d, fslown2d, fdd2d
192   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: ffetop2d, ffebot2d, ffescav2d
193   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fjln2d, fnln2d, ffln2d, fjld2d
194   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fnld2d, ffld2d, fsld2d2
195   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fsld2d, fregen2d, fregensi2d
196   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: ftempn2d, ftempsi2d, ftempfe2d
197   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: ftempc2d, ftempca2d, freminn2d
198   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: freminsi2d, freminfe2d
199   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: freminc2d, freminca2d
200   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zw2d
201# if defined key_roam
202   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: ffastca2d, rivn2d, rivsi2d
203   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: rivc2d, rivalk2d, fslowc2d
204   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fdpn22d, fdpd22d, fdzmi22d
205   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fdzme22d, zimesn2d, zimesd2d
206   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zimesc2d, zimesdc2d, ziexcr2d
207   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: ziresp2d, zigrow2d, zemesn2d
208   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zemesd2d, zemesc2d, zemesdc2d
209   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zeexcr2d, zeresp2d, zegrow2d
210   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: mdetc2d, gmidc2d, gmedc2d
211   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_pco2a2d, f_pco2w2d, f_co2flux2d
212   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_TDIC2d, f_TALK2d, f_kw6602d
213   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_pp02d, f_o2flux2d, f_o2sat2d
214   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: dms_andr2d, dms_simo2d, dms_aran2d
215   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: dms_hall2d, dms_surf2d
216   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: iben_n2d, iben_fe2d, iben_c2d
217   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: iben_si2d, iben_ca2d, oben_n2d
218   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: oben_fe2d, oben_c2d, oben_si2d
219   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: oben_ca2d, sfr_ocal2d
220   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: sfr_oarg2d, lyso_ca2d 
221   !! AXY (23/11/16): extra MOCSY diagnostics
222   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_xco2a_2d, f_fco2w_2d, f_fco2a_2d
223   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_ocnrhosw_2d, f_ocnschco2_2d
224   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_ocnkwco2_2d
225   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_ocnk0_2d, f_co2starair_2d
226   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: f_ocndpco2_2d
227# endif
228   !!
229   !! 3D var for diagnostics.
230   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: tpp3d, detflux3d, remin3dn
231   !!
232# if defined key_roam
233   !! AXY (04/11/16)
234   !! 2D var for new CMIP6 diagnostics (behind a key_roam ifdef
235   !! for simplicity)
236   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fgco2,intdissic,intdissin
237   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: intdissisi,inttalk,o2min,zo2min
238   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fbddtalk,fbddtdic,fbddtdife
239   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: fbddtdin,fbddtdisi
240   !!
241   !! 3D var for new CMIP6 diagnostics
242   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: tppd3
243   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: bddtalk3,bddtdic3,bddtdife3
244   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: bddtdin3, bddtdisi3
245   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: fd_nit3,fd_sil3,fd_car3,fd_cal3
246   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: co33,co3satarag3,co3satcalc3,dcalc3
247   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: expc3,expn3
248   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: fediss3,fescav3
249   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: migrazp3,migrazd3,megrazp3
250   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: megrazd3, megrazz3
251   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: o2sat3,pbsi3,pcal3,remoc3
252   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: pnlimj3,pnlimn3,pnlimfe3
253   REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: pdlimj3,pdlimn3,pdlimfe3,pdlimsi3
254# endif
255   !!----------------------------------------------------------------------
256   !! NEMO/TOP 3.3.1 , NEMO Consortium (2010)
257   !! $Id$
258   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
259   !!----------------------------------------------------------------------
260CONTAINS
261
262   INTEGER FUNCTION bio_medusa_alloc()
263      !!-------------------------------------------------------------------
264      !!                    *** ROUTINE bio_medusa_alloc ***
265      !!-------------------------------------------------------------------
266      USE lib_mpp,           ONLY: ctl_warn
267      USE par_oce,           ONLY: jpi, jpj
268!    USE par_trc
269      !!-------------------------------------------------------------------
270      !
271      ALLOCATE(zchn(jpi,jpj),zchd(jpi,jpj),zphn(jpi,jpj),             &
272               zphd(jpi,jpj),zpds(jpi,jpj),zzmi(jpi,jpj),             &
273               zzme(jpi,jpj),zdet(jpi,jpj),zdtc(jpi,jpj),             &
274               zdin(jpi,jpj),zsil(jpi,jpj),zfer(jpi,jpj),             &
275               zdic(jpi,jpj),zalk(jpi,jpj),zoxy(jpi,jpj),             &
276               ztmp(jpi,jpj),zsal(jpi,jpj),                           &
277               zpho(jpi,jpj),                                         &
278               fthetan(jpi,jpj),faln(jpi,jpj),fchn1(jpi,jpj),         &
279               fchn(jpi,jpj),fjln(jpi,jpj),fprn(jpi,jpj),             &
280               frn(jpi,jpj),                                          &
281               fthetad(jpi,jpj),fald(jpi,jpj),fchd1(jpi,jpj),         &
282               fchd(jpi,jpj),fjld(jpi,jpj),fprd(jpi,jpj),             &
283               frd(jpi,jpj),                                          &
284               fjlim_pn(jpi,jpj), fjlim_pd(jpi,jpj),                  &
285               fpnlim(jpi,jpj), fpdlim(jpi,jpj),                      &
286               fun_T(jpi,jpj),xvpnT(jpi,jpj),xvpdT(jpi,jpj),          &
287               fun_Q10(jpi,jpj),                                      &
288               fprn_ml(jpi,jpj),fprd_ml(jpi,jpj),                     &
289               fnln(jpi,jpj),ffln2(jpi,jpj),                          &
290               fnld(jpi,jpj),ffld(jpi,jpj),fsld(jpi,jpj),             &
291               fsld2(jpi,jpj),                                        &
292               fsin(jpi,jpj),fnsi(jpi,jpj),fprds(jpi,jpj),            &
293               fsdiss(jpi,jpj),                                       &
294               ffetop(jpi,jpj),ffebot(jpi,jpj),ffescav(jpi,jpj),      &
295               xFree(jpi,jpj),                                        &
296               fmi1(jpi,jpj),fmi(jpi,jpj),fgmipn(jpi,jpj),            &
297               fgmid(jpi,jpj),fgmidc(jpi,jpj),                        &
298               finmi(jpi,jpj),ficmi(jpi,jpj),fstarmi(jpi,jpj),        &
299               fmith(jpi,jpj),fmigrow(jpi,jpj),fmiexcr(jpi,jpj),      &
300               fmiresp(jpi,jpj),                                      &
301               fme1(jpi,jpj),fme(jpi,jpj),fgmepn(jpi,jpj),            &
302               fgmepd(jpi,jpj),fgmepds(jpi,jpj),fgmezmi(jpi,jpj),     &
303               fgmed(jpi,jpj),fgmedc(jpi,jpj),                        &
304               finme(jpi,jpj),ficme(jpi,jpj),fstarme(jpi,jpj),        &
305               fmeth(jpi,jpj),fmegrow(jpi,jpj),fmeexcr(jpi,jpj),      &
306               fmeresp(jpi,jpj),                                      &
307               fdpn(jpi,jpj),fdpd(jpi,jpj),fdpds(jpi,jpj),            &
308               fdzmi(jpi,jpj),fdzme(jpi,jpj),fdd(jpi,jpj),            &
309               fddc(jpi,jpj),                                         &
310               fdpn2(jpi,jpj),fdpd2(jpi,jpj),fdpds2(jpi,jpj),         &
311               fdzmi2(jpi,jpj),fdzme2(jpi,jpj),                       &
312               fslown(jpi,jpj),fslowc(jpi,jpj),                       &
313               fslownflux(jpi,jpj),fslowcflux(jpi,jpj),               &
314               fregen(jpi,jpj),fregensi(jpi,jpj),                     &
315               fregenfast(jpi,jpj),fregenfastsi(jpi,jpj),             &
316# if defined key_roam
317               fregenfastc(jpi,jpj),                                  &
318# endif
319               fdep1(jpi,jpj),fcaco3(jpi,jpj),                        &
320               ftempn(jpi,jpj),ftempsi(jpi,jpj),ftempfe(jpi,jpj),     &
321               ftempc(jpi,jpj),ftempca(jpi,jpj),                      &
322               freminn(jpi,jpj),freminsi(jpi,jpj),freminfe(jpi,jpj),  &
323               freminc(jpi,jpj),freminca(jpi,jpj),                    &
324               ffastn(jpi,jpj),ffastsi(jpi,jpj),ffastfe(jpi,jpj),     &
325               ffastc(jpi,jpj),ffastca(jpi,jpj),                      &
326               fprotf(jpi,jpj),                                       &
327               fsedn(jpi,jpj),fsedsi(jpi,jpj),fsedfe(jpi,jpj),        &
328               fsedc(jpi,jpj),fsedca(jpi,jpj),                        &
329               fccd(jpi,jpj),                                         &
330               fccd_dep(jpi,jpj),                                     &
331               ffast2slown(jpi,jpj),ffast2slowc(jpi,jpj),             &
332               ftot_n(jpi,jpj),ftot_si(jpi,jpj),ftot_fe(jpi,jpj),     &
333               fflx_n(jpi,jpj),fflx_si(jpi,jpj),fflx_fe(jpi,jpj),     &
334               fifd_n(jpi,jpj),fifd_si(jpi,jpj),fifd_fe(jpi,jpj),     &
335               fofd_n(jpi,jpj),fofd_si(jpi,jpj),fofd_fe(jpi,jpj),     &
336# if defined key_roam
337               ftot_c(jpi,jpj),ftot_a(jpi,jpj),ftot_o2(jpi,jpj),      &
338               fflx_c(jpi,jpj),fflx_a(jpi,jpj),fflx_o2(jpi,jpj),      &
339               fifd_c(jpi,jpj),fifd_a(jpi,jpj),fifd_o2(jpi,jpj),      &
340               fofd_c(jpi,jpj),fofd_a(jpi,jpj),fofd_o2(jpi,jpj),      &
341# endif
342               fzmi_i(jpi,jpj),fzmi_o(jpi,jpj),fzme_i(jpi,jpj),       &
343               fzme_o(jpi,jpj),                                       &
344               ftot_pn(jpi,jpj),ftot_pd(jpi,jpj),                     &
345               ftot_zmi(jpi,jpj),ftot_zme(jpi,jpj),ftot_det(jpi,jpj), &
346               ftot_dtc(jpi,jpj),                                     &
347               fnit_prod(jpi,jpj),fnit_cons(jpi,jpj),                 &
348               fsil_prod(jpi,jpj),fsil_cons(jpi,jpj),                 &
349               f_xco2a(jpi,jpj),                                      &
350               f_ph(jpi,jpj),f_pco2w(jpi,jpj),f_h2co3(jpi,jpj),       &
351               f_hco3(jpi,jpj),f_co3(jpi,jpj),f_co2flux(jpi,jpj),     &
352               f_TDIC(jpi,jpj),f_TALK(jpi,jpj),f_dcf(jpi,jpj),        &
353               f_henry(jpi,jpj),                                      &
354               f_pp0(jpi,jpj),                                        &
355               f_kw660(jpi,jpj),f_o2flux(jpi,jpj),f_o2sat(jpi,jpj),   &
356               f_omcal(jpi,jpj),f_omarg(jpi,jpj),                     &
357               f_fco2w(jpi,jpj),f_BetaD(jpi,jpj),f_rhosw(jpi,jpj),    &
358               f_opres(jpi,jpj),f_insitut(jpi,jpj),                   &
359               f_pco2atm(jpi,jpj),f_fco2atm(jpi,jpj),                 &
360               f_schmidtco2(jpi,jpj),f_kwco2(jpi,jpj),f_K0(jpi,jpj),  &
361               f_co2starair(jpi,jpj),f_dpco2(jpi,jpj),                &
362               f_kwo2(jpi,jpj),                                       &
363               iters(jpi,jpj),                                        &
364               fcomm_resp(jpi,jpj),                                   &
365               fcar_prod(jpi,jpj),fcar_cons(jpi,jpj),                 &
366               foxy_prod(jpi,jpj), foxy_cons(jpi,jpj),                &
367               foxy_anox(jpi,jpj),                                    &
368               dms_surf(jpi,jpj),                                     &
369               dms_andr(jpi,jpj),dms_simo(jpi,jpj),                   &
370               dms_aran(jpi,jpj),dms_hall(jpi,jpj),                   &
371               f_sbenin_n(jpi,jpj),f_sbenin_fe(jpi,jpj),              &
372               f_sbenin_c(jpi,jpj),                                   &
373               f_fbenin_n(jpi,jpj),f_fbenin_fe(jpi,jpj),              &
374               f_fbenin_si(jpi,jpj),                                  &
375               f_fbenin_c(jpi,jpj),f_fbenin_ca(jpi,jpj),              &
376               f_benout_n(jpi,jpj),f_benout_fe(jpi,jpj),              &
377               f_benout_si(jpi,jpj),                                  &
378               f_benout_c(jpi,jpj),f_benout_ca(jpi,jpj),              &
379               f_benout_lyso_ca(jpi,jpj),                             &
380               f_runoff(jpi,jpj),f_riv_n(jpi,jpj),f_riv_si(jpi,jpj),  &
381               f_riv_c(jpi,jpj),f_riv_alk(jpi,jpj),                   &
382               f_riv_loc_n(jpi,jpj),f_riv_loc_si(jpi,jpj),            &
383               f_riv_loc_c(jpi,jpj),f_riv_loc_alk(jpi,jpj),           &
384               STAT = bio_medusa_alloc)
385
386      !! Check that allocation was successful
387      IF ( bio_medusa_alloc /= 0 ) THEN 
388         CALL ctl_warn('bio_medusa_alloc: failed to allocate arrays')
389      END IF
390   
391   END FUNCTION bio_medusa_alloc
392
393#else
394   !!----------------------------------------------------------------------
395   !!  Empty module :                                          No MEDUSA
396   !!----------------------------------------------------------------------
397#endif 
398
399   !!======================================================================
400END MODULE bio_medusa_mod
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.