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2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22 
23   
24    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
25   
26      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
27      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
28      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
29      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
30      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
31      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->
32     
33      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files -->
34
35   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
36     <field field_ref="sst"          name="tos" />
37     <field field_ref="sss"          name="sos" />
38     <field field_ref="ssh"          name="zos" />
39   </file>
40
41   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
42     <field field_ref="ssu"          name="uos" />
43   </file>
44   
45   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
46     <field field_ref="ssv"          name="vos" />
47   </file>
48
49        <file id="file4" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" >
50          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
51          <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
52          <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
53          <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field>
54          <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
55          <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
56          <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field>
57          <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field>
58          <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field>
59          <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field>
60        <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field>
61                                                                                                                             </file>
62      </file_group>
63
64      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
65
66      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
67
68   <file id="file5" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
69     <field field_ref="toce"         name="thetao" />
70     <field field_ref="soce"         name="so"     />
71     <field field_ref="sst"          name="tos"    />
72     <field field_ref="sst2"         name="tossq"  />
73     <field field_ref="sss"          name="sos"    />
74     <field field_ref="ssh"          name="zos"    />
75     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"  />
76     <field field_ref="empmr"        name="wfo"    />
77     <field field_ref="qsr"          name="rsntds" />
78     <field field_ref="qt"           name="tohfls" />
79     <field field_ref="taum"     />
80     <field field_ref="mldkz5"   />
81     <field field_ref="mldr10_1" />
82   </file>
83   
84   <file id="file6" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
85     <field field_ref="uoce"         name="uo"     />
86     <field field_ref="ssu"          name="uos"    />
87     <field field_ref="utau"         name="tauuo"  />
88   </file>
89   
90   <file id="file7" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
91     <field field_ref="voce"         name="vo"     />
92     <field field_ref="ssv"          name="vos"    />
93     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"  />
94   </file>
95   
96   <file id="file8" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
97     <field field_ref="woce"         name="wo"     />
98     <field field_ref="avt"          name="difvho" />
99   </file>
100   
101   <file id="file9" name_suffix="_icemod" description="ice variables" >
102     <field field_ref="ice_pres"   />
103     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"    />
104     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"    />
105     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"    />
106     <field field_ref="ist_ipa"    />
107     <field field_ref="uice_ipa"   />
108     <field field_ref="vice_ipa"   />
109     <field field_ref="utau_ice"   />
110     <field field_ref="vtau_ice"   />
111     <field field_ref="qsr_io_cea" />
112     <field field_ref="qns_io_cea" />
113     <field field_ref="snowpre"    />
114   </file>
115   
116      </file_group>
117
118      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files -->
119
120   <file id="file10" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
121          <field field_ref="DIC"      />
122          <field field_ref="Alkalini" />
123          <field field_ref="O2"       />
124          <field field_ref="PO4"      />
125          <field field_ref="Si"       />
126          <field field_ref="Fer"      />
127          <field field_ref="NCHL"     />
128          <field field_ref="DCHL"     />
129          <field field_ref="NO3"      />
130   </file>
131   
132   <file id="file11" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
133          <field field_ref="Cflx"     />
134          <field field_ref="Dpco2"    />
135   </file>
136
137      </file_group>
138
139      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
140      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
141      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
142      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
143
144      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files -->
145
146   <file id="file12" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
147          <field field_ref="DIC"      />
148          <field field_ref="Alkalini" />
149          <field field_ref="O2"       />
150          <field field_ref="CaCO3"    />
151          <field field_ref="PO4"      />
152          <field field_ref="POC"      />
153          <field field_ref="Si"       />
154          <field field_ref="PHY"      />
155          <field field_ref="ZOO"      />
156          <field field_ref="DOC"      />
157          <field field_ref="PHY2"     />
158          <field field_ref="ZOO2"     />
159          <field field_ref="DSi"      />
160          <field field_ref="Fer"      />
161          <field field_ref="BFe"      />
162          <field field_ref="GOC"      />
163          <field field_ref="SFe"      />
164          <field field_ref="DFe"      />
165          <field field_ref="GSi"      />
166          <field field_ref="NFe"      />
167          <field field_ref="NCHL"     />
168          <field field_ref="DCHL"     />
169          <field field_ref="NO3"      />
170          <field field_ref="NH4"      />
171   </file>
172
173   <file id="file13" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
174          <field field_ref="PH"       />
175          <field field_ref="CO3"      />
176          <field field_ref="CO3sat"   />
177          <field field_ref="PAR"      />
178          <field field_ref="PPPHY"    />
179          <field field_ref="PPPHY2"   />
180          <field field_ref="PPNEWN"   />
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182          <field field_ref="PBSi"     />
183          <field field_ref="PFeN"     />
184          <field field_ref="PFeD"     />
185          <field field_ref="xfracal"  />
186          <field field_ref="PCAL"     />
187          <field field_ref="DCAL"     />
188          <field field_ref="GRAZ1"    />
189          <field field_ref="GRAZ2"    />
190          <field field_ref="EPC100"   />
191          <field field_ref="EPFE100"  />
192          <field field_ref="EPSI100"  />
193          <field field_ref="EPCAL100" />
194          <field field_ref="Cflx"     />
195          <field field_ref="Oflx"     />
196          <field field_ref="Kg"       />
197          <field field_ref="Dpco2"    />
198          <field field_ref="Dpo2"     />
199          <field field_ref="Heup"     />
200          <field field_ref="Irondep"  />
201          <field field_ref="Ironsed"  />
202          <field field_ref="Ironice"  />
203          <field field_ref="Nfix"     />
204          <field field_ref="MuN"      />
205          <field field_ref="MuD"      />
206          <field field_ref="LNnut"    />
207          <field field_ref="LDnut"    />
208          <field field_ref="LNFe"     />
209          <field field_ref="LDFe"     />
210          <field field_ref="LNlight"  />
211          <field field_ref="LDlight"  />
212          <field field_ref="pdust"    />
213          <field field_ref="Fe2"      />
214          <field field_ref="Fe3"      />
215          <field field_ref="FeL1"     />
216          <field field_ref="FeL2"     />
217          <field field_ref="FeP"      />
218          <field field_ref="TL1"      />
219          <field field_ref="TL2"      />
220          <field field_ref="Sdenit"   />
221          <field field_ref="Totlig"   />
222   </file>
223
224      </file_group>
225
226      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
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228      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
229
230   </file_definition>
231
232    <!--
233============================================================================================================
234= grid definition = = DO NOT CHANGE =
235============================================================================================================
236    -->
237   
238   <axis_definition> 
239      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" />
240      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" />
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244      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 />
245      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 />
246      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              />
247      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              />
248   </axis_definition> 
249   
250   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
251   
252   <grid_definition>   
253     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
254     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
255     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
256     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
257     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
258     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
259     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
260     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
261    </grid_definition> 
262 
263  </context>
264 
265
266  <context id="xios">
267
268      <variable_definition>
269   
270     <!--
271        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
272-->
273     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable>
274     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
275     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
276     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
277     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
278     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
279   
280      </variable_definition>
281               
282  </context>
283 
284</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.