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1MODULE p4zbio
2   !!======================================================================
3   !!                         ***  MODULE p4zbio  ***
4   !! TOP :   PISCES bio-model
5   !!======================================================================
6   !! History :   1.0  !  2004     (O. Aumont) Original code
7   !!             2.0  !  2007-12  (C. Ethe, G. Madec)  F90
8   !!----------------------------------------------------------------------
9#if defined key_pisces
10   !!----------------------------------------------------------------------
11   !!   'key_pisces'                                       PISCES bio-model
12   !!----------------------------------------------------------------------
13   !!   p4z_bio        :   computes the interactions between the different
14   !!                      compartments of PISCES
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   USE oce_trc         !  shared variables between ocean and passive tracers
17   USE trc             !  passive tracers common variables
18   USE sms_pisces      !  PISCES Source Minus Sink variables
19   USE p4zsink         !  vertical flux of particulate matter due to sinking
20   USE p4zopt          !  optical model
21   USE p4zlim          !  Co-limitations of differents nutrients
22   USE p4zprod         !  Growth rate of the 2 phyto groups
23   USE p4zmort         !  Mortality terms for phytoplankton
24   USE p4zmicro        !  Sources and sinks of microzooplankton
25   USE p4zmeso         !  Sources and sinks of mesozooplankton
26   USE p4zrem          !  Remineralisation of organic matter
27   USE p4zfechem
28   USE prtctl_trc      !  print control for debugging
29   USE iom             !  I/O manager
30 
31   IMPLICIT NONE
32   PRIVATE
33
34   PUBLIC  p4z_bio   
35
36   !!* Substitution
37#  include "top_substitute.h90"
38   !!----------------------------------------------------------------------
39   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
40   !! $Id$
41   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
42   !!----------------------------------------------------------------------
43
44CONTAINS
45
46   SUBROUTINE p4z_bio ( kt, knt )
47      !!---------------------------------------------------------------------
48      !!                     ***  ROUTINE p4z_bio  ***
49      !!
50      !! ** Purpose :   Ecosystem model in the whole ocean: computes the
51      !!              different interactions between the different compartments
52      !!              of PISCES
53      !!
54      !! ** Method  : - ???
55      !!---------------------------------------------------------------------
56      INTEGER, INTENT(in) :: kt, knt
57      INTEGER             :: ji, jj, jk, jn
58      CHARACTER (len=25) :: charout
59
60      !!---------------------------------------------------------------------
61      !
62      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('p4z_bio')
63      !
64      !     ASSIGN THE SHEAR RATE THAT IS USED FOR AGGREGATION
65      !     OF PHYTOPLANKTON AND DETRITUS
66
67      xdiss(:,:,:) = 1.
68!!gm the use of nmld should be better here?
69      DO jk = 2, jpkm1
70         DO jj = 1, jpj
71            DO ji = 1, jpi
72               IF( fsdepw(ji,jj,jk+1) > hmld(ji,jj) )   xdiss(ji,jj,jk) = 0.01
73            END DO
74         END DO
75      END DO
76
77         
78      CALL p4z_opt  ( kt, knt )     ! Optic: PAR in the water column
79      CALL p4z_sink ( kt, knt )     ! vertical flux of particulate organic matter
80      CALL p4z_fechem(kt, knt )     ! Iron chemistry/scavenging
81      CALL p4z_lim  ( kt, knt )     ! co-limitations by the various nutrients
82      CALL p4z_prod ( kt, knt )     ! phytoplankton growth rate over the global ocean.
83      !                             ! (for each element : C, Si, Fe, Chl )
84      CALL p4z_mort ( kt      )     ! phytoplankton mortality
85     !                             ! zooplankton sources/sinks routines
86      CALL p4z_micro( kt, knt )           ! microzooplankton
87      CALL p4z_meso ( kt, knt )           ! mesozooplankton
88      CALL p4z_rem  ( kt, knt )     ! remineralization terms of organic matter+scavenging of Fe
89      !                             ! test if tracers concentrations fall below 0.
90      !                                                             !
91      IF(ln_ctl)   THEN  ! print mean trends (used for debugging)
92         WRITE(charout, FMT="('bio ')")
93         CALL prt_ctl_trc_info(charout)
94         CALL prt_ctl_trc(tab4d=tra, mask=tmask, clinfo=ctrcnm)
95      ENDIF
96      !
97      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('p4z_bio')
98      !
99   END SUBROUTINE p4z_bio
100
101#else
102   !!======================================================================
103   !!  Dummy module :                                   No PISCES bio-model
104   !!======================================================================
105CONTAINS
106   SUBROUTINE p4z_bio                         ! Empty routine
107   END SUBROUTINE p4z_bio
108#endif 
109
110   !!======================================================================
111END MODULE p4zbio
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.