source: branches/UKMO/r6232_tracer_advection/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/SED/sedwri.F90 @ 9295

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1MODULE sedwri
2#if defined key_sed
3   !!======================================================================
4   !!                     ***  MODULE  sedwri  ***
5   !!         Sediment diagnostics :  write sediment output files
6   !!======================================================================
7   USE sed
8   USE sedarr
9   USE ioipsl
10   USE dianam    ! build name of file (routine)
11
12   IMPLICIT NONE
13   PRIVATE
14
15   !! * Accessibility
16   PUBLIC sed_wri 
17
18   INTEGER  :: nised
19   INTEGER  :: nhorised
20   INTEGER  :: ndimt52
21   INTEGER  :: ndimt51
22   INTEGER  :: ndepsed
23   REAL(wp) :: zjulian
24   INTEGER, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) :: ndext52 
25   INTEGER, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) :: ndext51
26
27   !! $Id$
28CONTAINS
29
30   !!----------------------------------------------------------------------
31   !!                                                   NetCDF output file
32   !!----------------------------------------------------------------------
33   SUBROUTINE sed_wri( kt )
34      !!----------------------------------------------------------------------
35      !!                   ***  ROUTINE sed_wri  ***
36      !!
37      !! ** Purpose :  output of sediment passive tracer
38      !!
39      !!   History :
40      !!        !  06-07  (C. Ethe)  original
41      !!----------------------------------------------------------------------
42
43      INTEGER, INTENT(in) :: kt
44
45      CHARACTER(len = 60)  ::  clhstnam, clop
46      INTEGER  :: ji, jk, js, jw, jn
47      REAL(wp) :: zsto,zout, zdt
48      INTEGER  :: iimi, iima, ijmi, ijma,ipk, it, itmod
49      CHARACTER(len = 20)  ::  cltra , cltrau
50      CHARACTER(len = 80)  ::  cltral
51      REAL(wp)  :: zrate
52      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zdta, zflx
53
54      !!-------------------------------------------------------------------
55
56
57      ! Initialisation
58      ! -----------------
59      IF( kt == nittrc000 )   ALLOCATE( ndext52(jpij*jpksed), ndext51(jpij) )
60
61      ! Define frequency of output and means
62      zdt = dtsed
63      IF( ln_mskland )   THEN   ;   clop = "only(x)"   ! put 1.e+20 on land (very expensive!!)
64      ELSE                      ;   clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time)
65      ENDIF
66#if defined key_diainstant
67      zsto = nwrised * zdt
68      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
69#else
70      zsto = zdt
71      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
72#endif
73      zout = nwrised * zdt
74
75      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
76      iimi = 1      ;      iima = jpi
77      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
78      ipk = jpksed
79
80      ! define time axis
81      it = kt
82      itmod = kt - nitsed000 + 1
83
84
85      ! 1.  Initilisations
86      ! -----------------------------------------------------------------
87      WRITE(numsed,*) ' '
88      WRITE(numsed,*) 'sed_wri kt = ', kt
89      WRITE(numsed,*) ' '
90     
91      ALLOCATE( zdta(jpoce,jpksed) )    ;   ALLOCATE( zflx(jpoce,jpwatp1) )
92
93
94      ! 2.  Back to 2D geometry
95      ! -----------------------------------------------------------------
96      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,1) , iarroce(1:jpoce), &
97         &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsopal ) )
98     
99      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,2) , iarroce(1:jpoce), &
100         &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsclay ) )
101     
102      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,3) , iarroce(1:jpoce), &
103         &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jspoc  ) )
104     
105      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,4) , iarroce(1:jpoce), &
106         &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jscal  ) )   
107           
108      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,5) , iarroce(1:jpoce), &
109         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwsil  )  )
110     
111      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,6)  , iarroce(1:jpoce), &
112         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwoxy  ) )
113     
114      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,7)  , iarroce(1:jpoce), &
115         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwdic  ) )
116     
117      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,8)  , iarroce(1:jpoce), &
118         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwno3  ) )
119     
120      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,9)  , iarroce(1:jpoce), &
121         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwpo4  ) )
122     
123      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,10)  , iarroce(1:jpoce), &
124         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwalk  ) )
125     
126      CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,11)  , iarroce(1:jpoce), &
127         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwc13  ) )
128     
129      ! porosity
130      zdta(:,:) = 0.
131      DO jk = 1, jpksed
132         DO ji = 1, jpoce
133            zdta(ji,jk) = -LOG10( hipor(ji,jk) / densSW(ji) )
134         ENDDO
135      ENDDO
136      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi3d(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,1)  , iarroce(1:jpoce), &
137         &                   zdta(1:jpoce,1:jpksed)  )
138     
139      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi3d(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,2)  , iarroce(1:jpoce), &
140         &                   co3por(1:jpoce,1:jpksed)  )
141     
142     
143      ! computation of delta 13C
144      zdta(:,:) = 0.
145      DO jk = 1, jpksed
146         DO ji = 1, jpoce
147            zdta(ji,jk) = ( ( pwcp(ji,jk,jwc13) / pwcp(ji,jk,jwdic) / pdb ) - 1. ) &
148               &              * 1000.
149         ENDDO
150      ENDDO
151      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi3d(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,3)  , iarroce(1:jpoce), &
152         &                   zdta(1:jpoce,1:jpksed)  )
153     
154 
155      zflx(:,:) = 0.   
156      ! Calculation of fluxes mol/cm2/s
157      DO jw = 1, jpwat
158         DO ji = 1, jpoce
159            zflx(ji,jw) = ( pwcp(ji,1,jw) - pwcp_dta(ji,jw) ) &
160               &         * 1.e-3 * dzkbot(ji) / dtsed
161         ENDDO
162      ENDDO
163      ! Calculation of accumulation rate per dt
164      DO js = 1, jpsol
165         zrate =  mol_wgt(js) / ( dens * por1(jpksed) ) / dtsed
166         DO ji = 1, jpoce
167            zflx(ji,jpwatp1) = zflx(ji,jpwatp1) + ( tosed(ji,js) - fromsed(ji,js) ) * zrate
168         ENDDO
169      ENDDO
170
171      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,1), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,1)  )
172      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,2), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,2)  )
173      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,3), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,3)  )
174      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,4), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,4)  )
175      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,5), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,5)  )
176      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,6), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,6)  )
177      CALL unpack_arr( jpoce, flxsedi2d(1:jpi,1:jpj,7), iarroce(1:jpoce), zflx(1:jpoce,8)  )
178
179
180      ! 3. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
181      ! -----------------------------------------------------------------
182
183      IF( kt == nitsed000 ) THEN
184
185         ! Define the NETCDF files       
186         CALL ymds2ju ( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
187         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
188         CALL dia_nam ( clhstnam, nwrised, 'sed_T' )
189         CALL histbeg ( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,     &
190            &             iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,         &
191            &             nitsed000-1, zjulian, zdt,  nhorised, nised , domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
192         CALL histvert( nised,'deptht','Vertic.sed.T levels','m',ipk, profsed, ndepsed, 'down' )
193         CALL wheneq  ( jpi*jpj*ipk, tmasksed, 1, 1., ndext52, ndimt52 )
194         CALL wheneq  ( jpi*jpj, tmasksed(:,:,1), 1, 1., ndext51, ndimt51 )
195
196         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
197
198         DO jn = 1, jptrased
199            cltra  = sedtrcd(jn)   ! short title for sediment variable
200            cltral = sedtrcl(jn)   ! long title for  sediment variable
201            cltrau = sedtrcu(jn)   ! unit for  sediment variable
202
203            CALL histdef( nised, cltra,cltral,cltrau, jpi, jpj, nhorised, &
204               &          ipk, 1, ipk, ndepsed, 32, clop, zsto, zout )
205         ENDDO
206
207         ! 3D diagnostic
208         DO jn = 1, jpdia3dsed
209            cltra  = seddia3d(jn)   ! short title for 3D diagnostic
210            cltral = seddia3l(jn)   ! long title for 3D diagnostic
211            cltrau = seddia3u(jn)   ! UNIT for 3D diagnostic
212
213            CALL histdef( nised, cltra,cltral,cltrau, jpi, jpj, nhorised, &
214               &          ipk, 1, ipk, ndepsed, 32, clop, zsto, zout  )
215         ENDDO
216
217         ! Fluxes
218         DO jn = 1, jpdia2dsed
219            cltra  = seddia2d(jn)   ! short title for 2D diagnostic
220            cltral = seddia2l(jn)   ! long title for 2D diagnostic
221            cltrau = seddia2u(jn)   ! UNIT for 2D diagnostic
222           
223            CALL histdef( nised, cltra,cltral,cltrau, jpi, jpj, nhorised, &
224               &          1, 1, 1, -99, 32, clop, zsto, zout )
225         ENDDO
226
227
228         CALL histend( nised, snc4set )
229
230         WRITE(numsed,*)
231         WRITE(numsed,*) 'End of NetCDF sediment output file Initialization'
232
233       ENDIF
234
235       ! Start writing data
236       ! ---------------------
237       DO jn = 1, jptrased
238          cltra = sedtrcd(jn) ! short title for 3D diagnostic
239          CALL histwrite( nised, cltra, it, trcsedi(:,:,:,jn), ndimt52, ndext52 )
240       END DO
241
242       DO jn = 1, jpdia3dsed
243          cltra = seddia3d(jn) ! short title for 3D diagnostic
244          CALL histwrite( nised, cltra, it, flxsedi3d(:,:,:,jn), ndimt52, ndext52 )
245       END DO
246
247       DO jn = 1, jpdia2dsed
248             cltra = seddia2d(jn) ! short title for 2D diagnostic
249             CALL histwrite( nised, cltra, it, flxsedi2d(:,:,jn  ), ndimt51, ndext51 )
250       END DO
251
252
253      ! 3. Closing all files
254      ! --------------------
255      IF( kt == nitsedend  ) THEN
256          CALL histclo( nised )
257      ENDIF
258
259      DEALLOCATE( zdta )    ;   DEALLOCATE( zflx )
260
261   END SUBROUTINE sed_wri
262
263#else
264   !!======================================================================
265   !! MODULE sedwri  :   Dummy module
266   !!======================================================================
267   !! $Id$
268CONTAINS
269   SUBROUTINE sed_wri( kt )         ! Empty routine
270      INTEGER, INTENT(in) :: kt
271      WRITE(*,*) 'sed_adv: You should not have seen this print! error?', kt
272   END SUBROUTINE sed_wri
273
274   !!======================================================================
275#endif
276
277END MODULE sedwri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.