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update IO for VVL compatibility, see ticket #1474

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1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22 
23   
24    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
25   
26      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
27      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
28      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
29      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
30      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
31      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->
32     
33      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files -->
34
35   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
36     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       />
37     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          />
38     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                />
39   </file>
40
41   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
42     <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    />
43   </file>
44   
45   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
46     <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    />
47   </file>
48
49        <file id="file4" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" >
50          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
51          <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
52          <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
53          <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field>
54          <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
55          <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
56          <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field>
57          <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field>
58          <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field>
59        <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field>
60                                                                                                                             </file>
61      </file_group>
62
63      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
64
65      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
66
67   <file id="file5" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" >
68     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               />
69     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            />
70     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       />
71     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             />
72     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          />
73     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                />
74     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      />
75     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     />
76     <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           />
77     <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          />
78     <field field_ref="taum"         />
79     <field field_ref="mldkz5"       />
80     <field field_ref="mldr10_1"     />
81           <!-- variables available with MLE
82          <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     />
83      -->
84   </file>
85   
86   <file id="file6" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" >
87     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      />
88     <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    />
89     <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" />
90          <!-- variables available with MLE
91          <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" />
92     -->
93   </file>
94   
95   <file id="file7" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" >
96     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      />
97     <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    />
98     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" />
99          <!-- variables available with MLE
100          <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" />
101     -->
102   </file>
103   
104   <file id="file8" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" >
105     <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         />
106     <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" />
107   </file>
108   
109   <file id="file9" name_suffix="_icemod" description="ice variables" >
110     <field field_ref="ice_pres"                     />
111     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   />
112     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        />
113     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        />
114     <field field_ref="ist_ipa"      />
115     <field field_ref="uice_ipa"     />
116     <field field_ref="vice_ipa"     />
117     <field field_ref="utau_ice"     />
118     <field field_ref="vtau_ice"     />
119     <field field_ref="qsr_io_cea"   />
120     <field field_ref="qns_io_cea"   />
121     <field field_ref="snowpre"      />
122   </file>
123   
124      </file_group>
125
126      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files -->
127
128   <file id="file10" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
129          <field field_ref="DIC"      />
130          <field field_ref="Alkalini" />
131          <field field_ref="O2"       />
132          <field field_ref="PO4"      />
133          <field field_ref="Si"       />
134          <field field_ref="Fer"      />
135          <field field_ref="NCHL"     />
136          <field field_ref="DCHL"     />
137          <field field_ref="NO3"      />
138   </file>
139   
140   <file id="file11" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
141          <field field_ref="Cflx"     />
142          <field field_ref="Dpco2"    />
143   </file>
144
145      </file_group>
146
147      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
148      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
149      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
150      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
151
152      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files -->
153
154   <file id="file12" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
155          <field field_ref="DIC"      />
156          <field field_ref="Alkalini" />
157          <field field_ref="O2"       />
158          <field field_ref="CaCO3"    />
159          <field field_ref="PO4"      />
160          <field field_ref="POC"      />
161          <field field_ref="Si"       />
162          <field field_ref="PHY"      />
163          <field field_ref="ZOO"      />
164          <field field_ref="DOC"      />
165          <field field_ref="PHY2"     />
166          <field field_ref="ZOO2"     />
167          <field field_ref="DSi"      />
168          <field field_ref="Fer"      />
169          <field field_ref="BFe"      />
170          <field field_ref="GOC"      />
171          <field field_ref="SFe"      />
172          <field field_ref="DFe"      />
173          <field field_ref="GSi"      />
174          <field field_ref="NFe"      />
175          <field field_ref="NCHL"     />
176          <field field_ref="DCHL"     />
177          <field field_ref="NO3"      />
178          <field field_ref="NH4"      />
179   </file>
180
181   <file id="file13" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
182          <field field_ref="PH"       />
183          <field field_ref="CO3"      />
184          <field field_ref="CO3sat"   />
185          <field field_ref="PAR"      />
186          <field field_ref="PPPHY"    />
187          <field field_ref="PPPHY2"   />
188          <field field_ref="PPNEWN"   />
189          <field field_ref="PPNEWD"   />
190          <field field_ref="PBSi"     />
191          <field field_ref="PFeN"     />
192          <field field_ref="PFeD"     />
193          <field field_ref="xfracal"  />
194          <field field_ref="PCAL"     />
195          <field field_ref="DCAL"     />
196          <field field_ref="GRAZ1"    />
197          <field field_ref="GRAZ2"    />
198          <field field_ref="EPC100"   />
199          <field field_ref="EPFE100"  />
200          <field field_ref="EPSI100"  />
201          <field field_ref="EPCAL100" />
202          <field field_ref="Cflx"     />
203          <field field_ref="Oflx"     />
204          <field field_ref="Kg"       />
205          <field field_ref="Dpco2"    />
206          <field field_ref="Dpo2"     />
207          <field field_ref="Heup"     />
208          <field field_ref="Irondep"  />
209          <field field_ref="Ironsed"  />
210          <field field_ref="Ironice"  />
211          <field field_ref="Nfix"     />
212          <field field_ref="MuN"      />
213          <field field_ref="MuD"      />
214          <field field_ref="LNnut"    />
215          <field field_ref="LDnut"    />
216          <field field_ref="LNFe"     />
217          <field field_ref="LDFe"     />
218          <field field_ref="LNlight"  />
219          <field field_ref="LDlight"  />
220          <field field_ref="pdust"    />
221          <field field_ref="Fe2"      />
222          <field field_ref="Fe3"      />
223          <field field_ref="FeL1"     />
224          <field field_ref="FeL2"     />
225          <field field_ref="FeP"      />
226          <field field_ref="TL1"      />
227          <field field_ref="TL2"      />
228          <field field_ref="Sdenit"   />
229          <field field_ref="Totlig"   />
230   </file>
231
232      </file_group>
233
234      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
235      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
236      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
237
238   </file_definition>
239
240    <!--
241============================================================================================================
242= grid definition = = DO NOT CHANGE =
243============================================================================================================
244    -->
245   
246   <axis_definition> 
247      <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" />
248      <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" />
249      <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" />
250      <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" />
251      <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  />
252      <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  />
253   </axis_definition> 
254   
255   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
256   
257   <grid_definition>   
258     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
259     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
260     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
261     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
262     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
263     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
264     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
265     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
266    </grid_definition> 
267 
268  </context>
269 
270
271  <context id="xios">
272
273      <variable_definition>
274   
275     <!--
276        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
277-->
278     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable>
279     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
280     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
281     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
282     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
283     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
284   
285      </variable_definition>
286               
287  </context>
288 
289</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.