source: trunk/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trc.F90 @ 6140

Last change on this file since 6140 was 6140, checked in by timgraham, 5 years ago

Merge of branches/2015/dev_merge_2015 back into trunk. Merge excludes NEMOGCM/TOOLS/OBSTOOLS/ for now due to issues with the change of file type. Will sort these manually with further commits.

Branch merged as follows:
In the working copy of branch ran:
svn merge svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk@HEAD
Small conflicts due to bug fixes applied to trunk since the dev_merge_2015 was copied. Bug fixes were applied to the branch as well so these were easy to resolve.
Branch committed at this stage

In working copy run:
svn switch svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
to switch working copy

Run:
svn merge —reintegrate svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2015/dev_merge_2015
to merge the branch into the trunk and then commit - no conflicts at this stage.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 17.4 KB
Line 
1MODULE trc
2   !!======================================================================
3   !!                      ***  MODULE  trc  ***
4   !! Passive tracers   :  module for tracers defined
5   !!======================================================================
6   !! History :   OPA  !  1996-01  (M. Levy)  Original code
7   !!              -   !  2000-04  (O. Aumont, M.A. Foujols)  HAMOCC3 and P3ZD
8   !!   NEMO      1.0  !  2004-03  (C. Ethe)  Free form and module
9   !!----------------------------------------------------------------------
10#if defined key_top
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!   'key_top'                                                TOP models
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   USE par_oce
15   USE par_trc
16#if defined key_bdy
17   USE bdy_oce, only: nb_bdy, OBC_DATA
18#endif
19   
20   IMPLICIT NONE
21   PUBLIC
22
23   PUBLIC   trc_alloc   ! called by nemogcm.F90
24
25   !! parameters for the control of passive tracers
26   !! ---------------------------------------------   
27   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numnat_ref = -1   !: logical unit for the reference passive tracer namelist_top_ref
28   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numnat_cfg = -1   !: logical unit for the reference passive tracer namelist_top_cfg
29   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numont     = -1   !: logical unit for the reference passive tracer namelist output output.namelist.top
30   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numstr        !: logical unit for tracer statistics
31   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numrtr        !: logical unit for trc restart (read )
32   INTEGER, PUBLIC                                                 ::   numrtw        !: logical unit for trc restart ( write )
33
34   !! passive tracers fields (before,now,after)
35   !! --------------------------------------------------
36   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)               ::  trai           !: initial total tracer
37   REAL(wp), PUBLIC                                                ::  areatot        !: total volume
38   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:  )         ::  cvol           !: volume correction -degrad option-
39   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:)         ::  trn            !: tracer concentration for now time step
40   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:)         ::  tra            !: tracer concentration for next time step
41   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:)         ::  trb            !: tracer concentration for before time step
42   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:  )         ::  sbc_trc_b      !: Before sbc fluxes for tracers
43   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:  )         ::  sbc_trc        !: Now sbc fluxes for tracers
44
45   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:  )         ::  trc_i          !: prescribed tracer concentration in sea ice for SBC
46   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:  )         ::  trc_o          !: prescribed tracer concentration in ocean for SBC
47   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nn_ice_tr      !: handling of sea ice tracers
48
49   !! interpolated gradient
50   !!-------------------------------------------------- 
51   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)           ::  gtru           !: hor. gradient at u-points at bottom ocean level
52   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)           ::  gtrv           !: hor. gradient at v-points at bottom ocean level
53   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)           ::  gtrui          !: hor. gradient at u-points at top    ocean level
54   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)           ::  gtrvi          !: hor. gradient at v-points at top    ocean level
55   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)             ::  qsr_mean        !: daily mean qsr
56   
57   !! passive tracers  (input and output)
58   !! ------------------------------------------ 
59   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  ln_rsttr       !: boolean term for restart i/o for passive tracers (namelist)
60   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  lrst_trc       !: logical to control the trc restart write
61   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nn_writetrc    !: time step frequency for concentration outputs (namelist)
62   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nutwrs         !: output FILE for passive tracers restart
63   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nutrst         !: logical unit for restart FILE for passive tracers
64   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nn_rsttr       !: control of the time step ( 0 or 1 ) for pass. tr.
65   CHARACTER(len = 80) , PUBLIC                                    ::  cn_trcrst_in   !: suffix of pass. tracer restart name (input)
66   CHARACTER(len = 256), PUBLIC                                    ::  cn_trcrst_indir  !: restart input directory
67   CHARACTER(len = 80) , PUBLIC                                    ::  cn_trcrst_out  !: suffix of pass. tracer restart name (output)
68   CHARACTER(len = 256), PUBLIC                                    ::  cn_trcrst_outdir  !: restart output directory
69   REAL(wp)            , PUBLIC                                    ::  rdttrc         !: passive tracer time step
70   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  ln_top_euler  !: boolean term for euler integration
71   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  ln_trcdta      !: Read inputs data from files
72   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  ln_trcdmp      !: internal damping flag
73   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  ln_trcdmp_clo  !: internal damping flag on closed seas
74   INTEGER             , PUBLIC                                    ::  nittrc000       !: first time step of passive tracers model
75   LOGICAL             , PUBLIC                                    ::  l_trcdm2dc     !: Diurnal cycle for TOP
76
77   !! Information for the ice module for tracers
78   !! ------------------------------------------
79   TYPE TRC_I_NML                    !--- Ice tracer namelist structure
80         REAL(wp)         :: trc_ratio  ! ice-ocean trc ratio
81         REAL(wp)         :: trc_prescr ! prescribed ice trc cc
82         CHARACTER(len=2) :: ctrc_o     ! choice of ocean trc cc
83   END TYPE
84
85   REAL(wp), DIMENSION(jptra), PUBLIC         :: trc_ice_ratio, & ! ice-ocean tracer ratio
86                                                 trc_ice_prescr   ! prescribed ice trc cc
87   CHARACTER(len=2), DIMENSION(jptra), PUBLIC :: cn_trc_o ! choice of ocean tracer cc
88
89   !! information for outputs
90   !! --------------------------------------------------
91   TYPE, PUBLIC :: PTRACER                                                            !: Passive tracer type
92       CHARACTER(len = 20)  :: clsname  !: short name
93       CHARACTER(len = 80)  :: cllname  !: long name
94       CHARACTER(len = 20)  :: clunit   !: unit
95       LOGICAL              :: llinit   !: read in a file or not
96#if defined  key_my_trc
97       LOGICAL              :: llsbc   !: read in a file or not
98       LOGICAL              :: llcbc   !: read in a file or not
99       LOGICAL              :: llobc   !: read in a file or not
100#endif
101       LOGICAL              :: llsave   !: save the tracer or not
102   END TYPE PTRACER
103   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ctrcnm         !: tracer name
104   CHARACTER(len = 80), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ctrcln         !: trccer field long name
105   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ctrcun         !: tracer unit
106   LOGICAL            , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ln_trc_wri     !: save the tracer or not
107
108   TYPE, PUBLIC :: DIAG                                                               !: passive trcacer ddditional diagnostic type
109      CHARACTER(len = 20)  :: sname    !: short name
110      CHARACTER(len = 80)  :: lname    !: long name
111      CHARACTER(len = 20)  :: units    !: unit
112   END TYPE DIAG
113
114   !! information for inputs
115   !! --------------------------------------------------
116   LOGICAL            , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ln_trc_ini     !: Initialisation from data input file
117   LOGICAL            , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ln_trc_obc     !: Use open boundary condition data
118   LOGICAL            , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ln_trc_sbc     !: Use surface boundary condition data
119   LOGICAL            , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)    ::  ln_trc_cbc     !: Use coastal boundary condition data
120
121   !! additional 2D/3D outputs namelist
122   !! --------------------------------------------------
123   REAL(wp)           , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,  :) ::   trc2d         !: additional 2d outputs array
124   REAL(wp)           , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::   trc3d         !: additional 3d outputs array
125   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc2d        !: 2d field short name
126   CHARACTER(len = 80), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc2l        !: 2d field long name
127   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc2u        !: 2d field unit
128   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc3d        !: 3d field short name
129   CHARACTER(len = 80), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc3l        !: 3d field long name
130   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::   ctrc3u        !: 3d field unit
131   LOGICAL            , PUBLIC                                        ::  ln_diatrc      !: boolean term for additional diagnostic
132   INTEGER            , PUBLIC                                        ::  nn_writedia    !: frequency of additional outputs
133
134   !! Biological trends
135   !! -----------------
136   LOGICAL            , PUBLIC                                        ::  ln_diabio      !: boolean term for biological diagnostic
137   INTEGER            , PUBLIC                                        ::  nn_writebio    !: frequency of biological outputs
138   REAL(wp)           , PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::  trbio          !: biological trends
139   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::  ctrbio         !: bio field short name
140   CHARACTER(len = 80), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::  ctrbil         !: bio field long name
141   CHARACTER(len = 20), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)       ::  ctrbiu         !: bio field unit
142
143   !! variables to average over physics over passive tracer sub-steps.
144   !! ----------------------------------------------------------------
145   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  un_tm       !: i-horizontal velocity average     [m/s]
146   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  vn_tm       !: j-horizontal velocity average     [m/s]
147   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::  tsn_tm      !: t/s average     [m/s]
148   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  avt_tm      !: vertical diffusivity coeff. at  w-point   [m2/s]
149   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  rhop_tm     !:
150# if defined key_zdfddm
151   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  avs_tm      !: vertical double diffusivity coeff. at w-point   [m/s]
152# endif
153#if defined key_trabbl
154   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  ahu_bbl_tm  !: u-, w-points
155   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  ahv_bbl_tm  !: j-direction slope at u-, w-points
156   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  utr_bbl_tm  !: j-direction slope at u-, w-points
157   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  vtr_bbl_tm  !: j-direction slope at u-, w-points
158#endif
159   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  sshn_tm     !: average ssh for the now step [m]
160   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  sshb_hold   !:hold sshb from the beginning of each sub-stepping[m] 
161
162   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  rnf_tm     !: river runoff
163   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  h_rnf_tm   !: depth in metres to the bottom of the relevant grid box
164   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  hmld_tm    !: mixed layer depth average [m]
165   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  fr_i_tm    !: average ice fraction     [m/s]
166   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  emp_tm     !: freshwater budget: volume flux [Kg/m2/s]
167   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  fmmflx_tm  !: freshwater budget: freezing/melting [Kg/m2/s]
168   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  emp_b_hold !: hold emp from the beginning of each sub-stepping[m] 
169   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  qsr_tm     !: solar radiation average [m]
170   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  wndm_tm    !: 10m wind average [m]
171   !
172
173   ! Temporary physical arrays for sub_stepping
174   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::  tsn_temp
175   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  un_temp,vn_temp,wn_temp     !: hold current values of avt, un, vn, wn
176   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  avt_temp, rhop_temp     !: hold current values of avt, un, vn, wn
177   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  sshn_temp, sshb_temp, ssha_temp, rnf_temp,h_rnf_temp
178   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  hdivn_temp, rotn_temp
179   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  hdivb_temp, rotb_temp
180   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  hmld_temp, qsr_temp, fr_i_temp,wndm_temp
181   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  emp_temp, fmmflx_temp, emp_b_temp
182   !
183#if defined key_trabbl
184   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)     ::  ahu_bbl_temp, ahv_bbl_temp, utr_bbl_temp, vtr_bbl_temp !: hold current values
185#endif
186   !
187# if defined key_zdfddm
188   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::  avs_temp      !: salinity vertical diffusivity coeff. at w-point   [m/s]
189# endif
190   !
191#if defined key_bdy
192   CHARACTER(len=20), PUBLIC, ALLOCATABLE,  SAVE,  DIMENSION(:)   ::  cn_trc_dflt          ! Default OBC condition for all tracers
193   CHARACTER(len=20), PUBLIC, ALLOCATABLE,  SAVE,  DIMENSION(:)   ::  cn_trc               ! Choice of boundary condition for tracers
194   INTEGER,           PUBLIC, ALLOCATABLE,  SAVE,  DIMENSION(:)   ::  nn_trcdmp_bdy        !: =T Tracer damping
195   ! External data structure of BDY for TOP. Available elements: cn_obc, ll_trc, trcnow, dmp
196   TYPE(OBC_DATA),    PUBLIC, ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:), TARGET ::  trcdta_bdy           !: bdy external data (local process)
197#endif
198   !
199
200   !!----------------------------------------------------------------------
201   !! NEMO/TOP 3.3.1 , NEMO Consortium (2010)
202   !! $Id$
203   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
204   !!----------------------------------------------------------------------
205CONTAINS
206
207   INTEGER FUNCTION trc_alloc()
208      !!-------------------------------------------------------------------
209      !!                    *** ROUTINE trc_alloc ***
210      !!-------------------------------------------------------------------
211      USE lib_mpp, ONLY: ctl_warn
212      !!-------------------------------------------------------------------
213      !
214      ALLOCATE( trn(jpi,jpj,jpk,jptra), trb(jpi,jpj,jpk,jptra), tra(jpi,jpj,jpk,jptra),       & 
215         &      trc_i(jpi,jpj,jptra)  , trc_o(jpi,jpj,jptra)                          ,       &
216         &      gtru (jpi,jpj,jptra)  , gtrv (jpi,jpj,jptra)                          ,       &
217         &      gtrui(jpi,jpj,jptra)  , gtrvi(jpi,jpj,jptra)                          ,       &
218         &      sbc_trc_b(jpi,jpj,jptra), sbc_trc(jpi,jpj,jptra)                      ,       & 
219         &      cvol(jpi,jpj,jpk)     , trai(jptra)                                   ,       &
220         &      ctrcnm(jptra)         , ctrcln(jptra)         , ctrcun(jptra)         ,       & 
221         &      ln_trc_ini(jptra)     , ln_trc_wri(jptra)     , qsr_mean(jpi,jpj)     ,       &
222#if defined key_my_trc
223         &      ln_trc_sbc(jptra)     , ln_trc_cbc(jptra)     , ln_trc_obc(jptra)     ,       &
224#endif
225#if defined key_bdy
226         &      cn_trc_dflt(nb_bdy)   , cn_trc(nb_bdy)        , nn_trcdmp_bdy(nb_bdy) ,       &
227         &      trcdta_bdy(jptra,nb_bdy)                                              ,       &
228#endif
229         &      STAT = trc_alloc  )
230
231      IF( trc_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('trc_alloc: failed to allocate arrays')
232      !
233   END FUNCTION trc_alloc
234
235#else
236   !!----------------------------------------------------------------------
237   !!  Empty module :                                     No passive tracer
238   !!----------------------------------------------------------------------
239#endif
240
241   !!======================================================================
242END MODULE trc
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.