source: utils/tools/NESTING/src/agrif_create_bathy.f90 @ 9749

Last change on this file since 9749 was 9749, checked in by jchanut, 3 years ago

NESTING tool: correct parent bathymetry update in case of nghost > 1. Output update zone in updated bathymetry file.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.1 KB
Line 
1!************************************************************************
2! Fortran 95 OPA Nesting tools                  *
3!                          *
4!     Copyright (C) 2005 Florian Lemarié (Florian.Lemarie@imag.fr)   *
5!                        Laurent Debreu (Laurent.Debreu@imag.fr)  *
6!************************************************************************
7!
8PROGRAM create_bathy
9  !
10  USE NETCDF
11  USE bilinear_interp
12  USE agrif_readwrite
13  USE agrif_partial_steps
14  USE agrif_connect_topo
15  !
16  IMPLICIT NONE
17  !
18  !************************************************************************
19  !                           *
20  ! PROGRAM  CREATE_BATHY                 *
21  !                           *
22  ! program to implement bathymetry interpolation to generate     *
23  ! child grid bathymetry file                  *
24  !                           *
25  ! various options :                     *
26  !                           *
27  ! 1- Interpolation directly from parent bathymetry file (z-coord)  *
28  ! 2- Use new topo file in meters (for example etopo)      *
29  !                           *
30  ! vertical coordinates permitted : z-coord and partial steps    *
31  ! sigma coordinates is not yet implemented          *
32  !                           *
33  !Interpolation is carried out using bilinear interpolation      *
34  !routine from SCRIP package or median average          *     
35  !                           *
36  !http://climate.lanl.gov/Software/SCRIP/            *
37  !************************************************************************
38  !
39  ! variables declaration
40  !     
41  CHARACTER(len=80) :: namelistname
42  CHARACTER*100 :: Childmeter_file,Childlevel_file,Child_coordinates,child_ps     
43  LOGICAL,DIMENSION(:,:),POINTER :: masksrc => NULL() 
44  LOGICAL :: identical_grids     
45  INTEGER,DIMENSION(:,:),ALLOCATABLE ::mask_oce,trouble_points
46  INTEGER :: i,j,num_links,nb,nbadd,status,narg,iargc     
47  INTEGER,DIMENSION(:),POINTER :: src_add,dst_add => NULL() 
48  INTEGER :: numlatfine,numlonfine,numlat,numlon,pos,pos2
49  REAL*8,DIMENSION(:,:),POINTER :: matrix,interpdata => NULL()     
50  REAL*8, DIMENSION(:,:),POINTER :: bathy_fin_constant => NULL() 
51  REAL*8,DIMENSION(:,:),ALLOCATABLE :: bathy_test,vardep,glamhr,gphihr
52  REAL*8,DIMENSION(:),ALLOCATABLE :: vardep1d
53  REAL*8, DIMENSION(:,:),POINTER :: gdepw_ps_interp => NULL() 
54  REAL*8, DIMENSION(:,:),POINTER :: save_gdepw,rx,ry,maskedtopo
55  REAL*8  :: Cell_lonmin,Cell_lonmax,Cell_latmin,Cell_latmax,wghts
56  LOGICAL :: Pacifique=.FALSE.
57  INTEGER :: boundary,xpos,ypos,iimin,iimax,jjmax,jjmin
58  INTEGER :: nbloops,nxhr,nyhr,ji,jj,nbiter,nbloopmax
59  INTEGER :: ipt,jpt,iloc,jloc
60  INTEGER, DIMENSION(2) :: i_min,i_max,j_min,j_max
61
62  TYPE(Coordinates) :: G0,G1 
63  !     
64  narg = iargc()     
65  IF (narg == 0) THEN
66     namelistname = 'namelist.input'
67  ELSE
68     CALL getarg(1,namelistname)
69  ENDIF
70  !
71  ! read input file (namelist.input)
72  !
73  CALL read_namelist(namelistname)
74  !     
75  ! define names of child grid files
76  !
77  CALL set_child_name(parent_coordinate_file,Child_coordinates) 
78  IF( TRIM(parent_meshmask_file) .NE. '/NULL' ) &
79       CALL set_child_name(parent_meshmask_file,Childlevel_file)           
80  !
81  !
82  !
83  !
84  !
85  !------------------------------------------------------------------
86  ! ****First option : no new topo file / no partial steps
87  ! interpolate levels directly from parent file
88  !------------------------------------------------------------------
89  !
90  !
91  !
92  !
93  !
94  !
95  IF(.NOT.new_topo .AND. .NOT.partial_steps) THEN     
96     !     
97     WRITE(*,*) 'First option'
98     !read coarse grid bathymetry and coordinates file
99     !           
100     WRITE(*,*) 'No new topo file ...'
101     status = Read_Coordinates(TRIM(parent_coordinate_file),G0)   
102     status = Read_bathy_level(TRIM(parent_meshmask_file),G0)
103     !           
104     IF( imax > SIZE(G0%glamt,1) .OR. jmax > SIZE(G0%glamt,2) .OR. &
105          imax <= imin .OR. jmax <= jmin ) THEN                   
106        WRITE(*,*) 'ERROR ***** bad child grid definition ...'
107        WRITE(*,*) 'please check imin,jmin,imax,jmax,jpizoom,jpjzoom values'       
108        WRITE(*,*) ' '
109        STOP
110     ENDIF
111     !
112     !read fine grid coordinates file
113     !     
114     status = Read_Coordinates(TRIM(Child_coordinates),G1,pacifique)
115     
116     IF( SIZE(G1%nav_lon,1) .NE. nxfin .OR. SIZE(G1%nav_lon,2) .NE. nyfin ) THEN
117        !
118        WRITE(*,*) 'ERROR ***** bad child coordinates file ...'
119        WRITE(*,*) ' '
120        WRITE(*,*) 'please check that child coordinates file '
121        WRITE(*,*) 'has been created with the same namelist '
122        WRITE(*,*) ' '
123        STOP
124        !
125     ENDIF
126     !
127     numlat =  SIZE(G0%nav_lat,2)
128     numlon =  SIZE(G0%nav_lat,1)   
129     numlatfine =  SIZE(G1%nav_lat,2)
130     numlonfine =  SIZE(G1%nav_lat,1) 
131     !           
132     ALLOCATE(masksrc(numlon,numlat))
133     !
134     ! create logical array masksrc
135     !
136     WHERE(G0%bathy_level.LE.0) 
137        masksrc = .FALSE.
138     ELSEWHERE
139        masksrc = .TRUE.
140     END WHERE
141
142     IF ( Pacifique ) THEN
143        WHERE(G0%nav_lon < 0.001) 
144           G0%nav_lon = G0%nav_lon + 360.
145        END WHERE
146     ENDIF
147
148
149     !-----------------         
150     ! compute remapping matrix thanks to SCRIP package
151     !
152     ! remapping process
153     !             
154     ALLOCATE(G1%bathy_meter(nxfin,nyfin))
155     CALL levels_to_meter(G0)
156     !             
157     !             Call levels_to_meter(G1)
158     !             
159     CALL get_remap_matrix(G0%nav_lat,G1%nav_lat,   &
160          G0%nav_lon,G1%nav_lon,   &
161          masksrc,matrix,src_add,dst_add)
162     CALL make_remap(G0%bathy_meter,G1%bathy_meter,nxfin,nyfin, &
163          matrix,src_add,dst_add) 
164     !                                 
165     !           
166     DEALLOCATE(masksrc)
167     !-----------------                                     
168     !     
169     !
170     ! compute constant bathymetry for Parent-Child bathymetry connection
171     !             
172     CALL init_constant_bathy(G0%bathy_meter,bathy_fin_constant)
173     !
174     boundary = npt_copy*irafx + nbghostcellsfine + 1 
175     !
176     ! connection carried out by copying parent grid values for the fine points
177     ! corresponding to 3 coarse grid cells at the boundaries
178     !                 
179     G1%bathy_meter(1:boundary,:) = bathy_fin_constant(1:boundary,:)
180     G1%bathy_meter(:,1:boundary) = bathy_fin_constant(:,1:boundary)
181     G1%bathy_meter(nxfin-boundary+1:nxfin,:) = bathy_fin_constant(nxfin-boundary+1:nxfin,:)
182     G1%bathy_meter(:,nyfin-boundary+1:nyfin) = bathy_fin_constant(:,nyfin-boundary+1:nyfin)
183     !                 
184     CALL smooth_topo(G1%bathy_meter(boundary:nxfin-boundary+1,boundary:nyfin-boundary+1),nbiter)
185     !             
186     CALL meter_to_levels(G1)
187     !             
188     DEALLOCATE(bathy_fin_constant)
189     !
190     !
191     !------------------------------------------------------------------
192     ! ****Second option : new topo file or/and partial steps     
193     !------------------------------------------------------------------
194     !
195     !
196     !
197     !
198     !
199     !
200     !
201     !
202  ELSE
203     !
204     WRITE(*,*) 'Second option : partial steps'
205     ! read fine and coarse grids coordinates file
206     !       
207     status = Read_Coordinates(TRIM(parent_coordinate_file),G0)
208     status = Read_Coordinates(TRIM(Child_coordinates),G1,Pacifique)
209     !                       
210     IF( imax > SIZE(G0%nav_lon,1) .OR. jmax > SIZE(G0%nav_lon,2) .OR. &
211          imax <= imin .OR. jmax <= jmin ) THEN                   
212        WRITE(*,*) 'ERROR ***** bad child grid definition ...'
213        WRITE(*,*) 'please check imin,jmin,imax,jmax,jpizoom,jpjzoom values'       
214        WRITE(*,*) ' '
215        STOP
216     ENDIF
217     !
218
219     
220     IF( SIZE(G1%nav_lon,1) .NE. nxfin .OR. SIZE(G1%nav_lon,2) .NE. nyfin ) THEN
221        !
222        WRITE(*,*) 'ERROR ***** bad child coordinates file ...'
223        WRITE(*,*) ' '
224        WRITE(*,*) 'please check that child coordinates file '
225        WRITE(*,*) 'has been created with the same namelist '
226        WRITE(*,*) ' '
227        STOP
228        !
229     ENDIF
230     !     
231     ! read coarse grid bathymetry file
232     !---
233     IF( new_topo ) THEN
234        WRITE(*,*) 'use new topo file : ',TRIM(elevation_database)
235        DEALLOCATE( G0%nav_lon, G0%nav_lat )
236        status = Read_bathy_meter(TRIM(elevation_database),G0,G1,Pacifique)
237     ELSE
238        WRITE(*,*) 'no new topo file'
239        status = Read_Bathymeter(TRIM(parent_bathy_meter),G0)
240        IF(Pacifique) THEN
241           WHERE(G0%nav_lon < 0.0001) 
242              G0%nav_lon = G0%nav_lon + 360.
243           END WHERE
244        ENDIF
245     ENDIF
246     !---           
247     numlatfine =  SIZE(G1%nav_lat,2)
248     numlonfine =  SIZE(G1%nav_lat,1) 
249     
250     !               
251     ALLOCATE(G1%bathy_meter(nxfin,nyfin))
252     G1%bathy_meter(:,:)=0.                       
253
254     WRITE(*,*) 'Interpolation of high resolution bathymetry on child grid'
255
256     IF( type_bathy_interp == 0 ) THEN
257        WRITE(*,*) 'Arithmetic average ...'
258     ELSE IF( type_bathy_interp == 1 ) THEN
259        WRITE(*,*) 'Median average ...'
260     ELSE IF( type_bathy_interp == 2 ) THEN     
261        WRITE(*,*) 'Bilinear interpolation ...'
262     ELSE     
263        WRITE(*,*) 'bad value for type_bathy_interp variable ( must be 0,1 or 2 )'
264        STOP
265     ENDIF
266     !
267     !************************************
268     !MEDIAN AVERAGE or ARITHMETIC AVERAGE
269     !************************************
270     !
271     IF( type_bathy_interp == 0 .OR. type_bathy_interp == 1 ) THEN 
272        !
273        ALLOCATE(trouble_points(nxfin,nyfin))
274        trouble_points = 0
275        !
276        !  POINT DETECTION
277        !
278        !                       
279        DO jj = 2,numlatfine
280           DO ji = 2,numlonfine
281              !       
282              ! FINE GRID CELLS DEFINITION               
283              !
284              Cell_lonmin = MIN(G1%glamf(ji-1,jj-1),G1%glamf(ji,jj-1),G1%glamf(ji,jj),G1%glamf(ji-1,jj))
285              Cell_lonmax = MAX(G1%glamf(ji-1,jj-1),G1%glamf(ji,jj-1),G1%glamf(ji,jj),G1%glamf(ji-1,jj))
286              Cell_latmin = MIN(G1%gphif(ji-1,jj-1),G1%gphif(ji,jj-1),G1%gphif(ji,jj),G1%gphif(ji-1,jj))
287              Cell_latmax = MAX(G1%gphif(ji-1,jj-1),G1%gphif(ji,jj-1),G1%gphif(ji,jj),G1%gphif(ji-1,jj)) 
288              !               
289              ! SEARCH FOR ALL POINTS CONTAINED IN THIS CELL
290              !
291              iimin = 1
292              DO WHILE( G0%nav_lon(iimin,1) < Cell_lonmin ) 
293                 iimin = iimin + 1
294              ENDDO
295              !               
296              jjmin = 1
297              DO WHILE( G0%nav_lat(iimin,jjmin) < Cell_latmin ) 
298                 jjmin = jjmin + 1
299              ENDDO
300              !               
301              iimax = iimin 
302              DO WHILE( G0%nav_lon(iimax,1) <= Cell_lonmax ) 
303                 iimax = iimax + 1
304              iimax = MIN( iimax,SIZE(G0%bathy_meter,1))
305              ENDDO
306              !                               
307              jjmax = jjmin 
308              DO WHILE( G0%nav_lat(iimax,jjmax) <= Cell_latmax ) 
309                 jjmax = jjmax + 1
310              jjmax = MIN( jjmax,SIZE(G0%bathy_meter,2))
311
312              ENDDO
313              !
314              iimax = iimax-1
315              jjmax = jjmax-1
316              !               
317              iimin = MAX( iimin,1 )
318              jjmin = MAX( jjmin,1 )
319              iimax = MIN( iimax,SIZE(G0%bathy_meter,1))
320              jjmax = MIN( jjmax,SIZE(G0%bathy_meter,2))
321
322              nxhr = iimax - iimin + 1
323              nyhr = jjmax - jjmin + 1                   
324
325              IF( nxhr == 0 .OR. nyhr == 0 ) THEN
326                 trouble_points(ji,jj) = 1
327              ELSE
328
329                 ALLOCATE( vardep(nxhr,nyhr) )
330                 ALLOCATE( mask_oce(nxhr,nyhr) )
331                 mask_oce = 0       
332
333                 vardep(:,:) = G0%bathy_meter(iimin:iimax,jjmin:jjmax)
334
335                 WHERE( vardep(:,:) .GT. 0. )  mask_oce = 1
336
337                 IF( SUM(mask_oce) == 0 ) THEN
338                    G1%bathy_meter(ji,jj) = 0.
339                 ELSE
340                    IF( type_bathy_interp == 0 ) THEN
341                       ! Arithmetic average                   
342                       G1%bathy_meter(ji,jj) = SUM (vardep(:,:)*mask_oce(:,:))/SUM(mask_oce)
343                    ELSE
344                       ! Median average         
345                       !
346                       vardep(:,:) = vardep(:,:)*mask_oce(:,:) - 100000*(1-mask_oce(:,:))
347                       ALLOCATE(vardep1d(nxhr*nyhr))
348                       vardep1d = RESHAPE(vardep,(/ nxhr*nyhr /) )
349                       CALL ssort(vardep1d,nxhr*nyhr)
350                       !
351                       ! Calculate median
352                       !
353                       IF (MOD(SUM(mask_oce),2) .NE. 0) THEN
354                          G1%bathy_meter(ji,jj) = vardep1d( SUM(mask_oce)/2 + 1)
355                       ELSE
356                          G1%bathy_meter(ji,jj) = ( vardep1d(SUM(mask_oce)/2) + vardep1d(SUM(mask_oce)/2+1) )/2.0
357                       END IF
358                       DEALLOCATE(vardep1d)   
359                    ENDIF
360                 ENDIF
361                 DEALLOCATE (mask_oce,vardep)
362
363              ENDIF
364           ENDDO
365        ENDDO
366
367        IF( SUM( trouble_points ) > 0 ) THEN
368           PRINT*,'too much empty cells, proceed to bilinear interpolation !!'
369           type_bathy_interp = 2
370        ENDIF
371
372     ENDIF
373
374     !
375     ! create logical array masksrc
376     !
377     IF( type_bathy_interp == 2) THEN 
378        !
379
380        !           
381        identical_grids = .FALSE.
382
383        IF( SIZE(G0%nav_lat,1) == SIZE(G1%nav_lat,1)  .AND.   &
384             SIZE(G0%nav_lat,2) == SIZE(G1%nav_lat,2)  .AND.   &
385             SIZE(G0%nav_lon,1) == SIZE(G1%nav_lon,1)  .AND.   &
386             SIZE(G0%nav_lon,2) == SIZE(G1%nav_lon,2)   ) THEN
387           IF( MAXVAL( ABS(G0%nav_lat(:,:)- G1%nav_lat(:,:)) ) < 0.0001 .AND.   &
388                MAXVAL( ABS(G0%nav_lon(:,:)- G1%nav_lon(:,:)) ) < 0.0001 ) THEN
389              G1%bathy_meter = G0%bathy_meter 
390              PRINT*,'same grid between ',elevation_database,' and child domain'   
391              identical_grids = .TRUE.                         
392           ENDIF
393        ENDIF
394
395
396        IF( .NOT. identical_grids ) THEN
397
398           ALLOCATE(masksrc(SIZE(G0%bathy_meter,1),SIZE(G0%bathy_meter,2)))
399           ALLOCATE(bathy_test(nxfin,nyfin))
400           !
401           !                    Where(G0%bathy_meter.le.0.00001)
402           !                   masksrc = .false.
403           !               ElseWhere
404           !
405           masksrc = .TRUE.
406           !
407           !               End where                       
408           !           
409           ! compute remapping matrix thanks to SCRIP package           
410           !                                 
411           CALL get_remap_matrix(G0%nav_lat,G1%nav_lat,   &
412                G0%nav_lon,G1%nav_lon,   &
413                masksrc,matrix,src_add,dst_add)
414           CALL make_remap(G0%bathy_meter,bathy_test,nxfin,nyfin, &
415                matrix,src_add,dst_add) 
416           !                                 
417           G1%bathy_meter = bathy_test               
418           !           
419           DEALLOCATE(masksrc)
420           DEALLOCATE(bathy_test) 
421
422        ENDIF
423        !           
424     ENDIF
425     !
426     !
427     !
428     !------------------------------------------------------------------------------------------
429     ! ! ****Third  option : Partial Steps
430     ! The code includes the
431     ! option to include partial cells at the bottom
432     ! in order to better resolve topographic variations
433     !------------------------------------------------------------------------------------------
434     !
435     ! At this step bathymetry in meters has already been interpolated on fine grid
436     !
437     !                   
438     IF( partial_steps ) THEN               
439        !                 
440        status = Read_Bathymeter(TRIM(parent_bathy_meter),G0)
441        DEALLOCATE(G0%nav_lat,G0%nav_lon)
442        status = Read_coordinates(TRIM(parent_coordinate_file),G0)
443        !------------------------                 
444        IF (.NOT.ASSOCIATED(G0%gdepw_ps)) &
445             ALLOCATE(G0%gdepw_ps(SIZE(G0%bathy_meter,1),SIZE(G0%bathy_meter,2)))
446        IF (.NOT.ASSOCIATED(G1%gdepw_ps)) &
447             ALLOCATE(G1%gdepw_ps(SIZE(G1%bathy_meter,1),SIZE(G1%bathy_meter,2)))                 
448        IF (.NOT.ASSOCIATED(gdepw_ps_interp)) &
449             ALLOCATE(gdepw_ps_interp(SIZE(G1%bathy_meter,1),SIZE(G1%bathy_meter,2)))
450        !
451        !                       
452        WRITE(*,*) 'Coarse grid : '
453        CALL get_partial_steps(G0) 
454        WRITE(*,*) ' '
455        WRITE(*,*) 'Fine grid : '
456        CALL get_partial_steps(G1)                 ! compute gdepw_ps for G1
457        CALL bathymetry_control(G0%Bathy_level)    !   
458        CALL Check_interp(G0,gdepw_ps_interp)      ! interpolation in connection zone (3 coarse grid cells)
459        !
460        boundary = npt_copy*irafx + nbghostcellsfine + 1                     
461! J chanut: exclude matching if no open boundaries
462        IF (.NOT.ASSOCIATED(G1%wgt)) &
463             ALLOCATE(G1%wgt(SIZE(G1%bathy_meter,1),SIZE(G1%bathy_meter,2)))
464        G1%wgt(:,:) = 0.
465        IF ((.NOT.ASSOCIATED(G0%wgt)).AND.bathy_update) THEN
466             ALLOCATE(G0%wgt(SIZE(G0%nav_lat,1),SIZE(G0%nav_lat,2)))
467             G0%wgt(:,:) = 0.
468        ENDIF
469
470        DO jj=1,nyfin
471          ! West
472          IF (gdepw_ps_interp(nbghostcellsfine+1,jj)>0.) THEN
473             G1%gdepw_ps(1:boundary,jj) = gdepw_ps_interp(1:boundary,jj) 
474             G1%wgt(1:boundary,jj) = 1.
475          ELSE
476             G1%gdepw_ps(1:nbghostcellsfine+1,jj)=0. 
477          ENDIF 
478          ! East
479          IF (gdepw_ps_interp(nxfin-nbghostcellsfine,jj)>0.) THEN
480             G1%gdepw_ps(nxfin-boundary+1:nxfin,jj)=gdepw_ps_interp(nxfin-boundary+1:nxfin,jj)
481             G1%wgt(nxfin-boundary+1:nxfin,jj) = 1.
482          ELSE
483             G1%gdepw_ps(nxfin-nbghostcellsfine:nxfin,jj) = 0.
484          ENDIF
485        END DO
486        DO ji=1,nxfin
487          ! South
488          IF (gdepw_ps_interp(ji,nbghostcellsfine+1)>0.) THEN
489             G1%gdepw_ps(ji,1:boundary) = gdepw_ps_interp(ji,1:boundary)
490             G1%wgt(ji,1:boundary) = 1.
491          ELSE
492             G1%gdepw_ps(ji,1:nbghostcellsfine+1)=0. 
493          ENDIF
494          ! North
495          IF (gdepw_ps_interp(ji,nyfin-nbghostcellsfine)>0.) THEN
496             G1%gdepw_ps(ji,nyfin-boundary+1:nyfin)=gdepw_ps_interp(ji,nyfin-boundary+1:nyfin)
497             G1%wgt(ji,nyfin-boundary+1:nyfin) = 1.
498          ELSE
499             G1%gdepw_ps(ji,nyfin-nbghostcellsfine:nyfin) = 0.
500          ENDIF
501        END DO
502       
503!        G1%gdepw_ps(1:boundary,:) = gdepw_ps_interp(1:boundary,:)
504!        G1%gdepw_ps(:,1:boundary) = gdepw_ps_interp(:,1:boundary)
505!        G1%gdepw_ps(nxfin-boundary+1:nxfin,:) = gdepw_ps_interp(nxfin-boundary+1:nxfin,:)
506!        G1%gdepw_ps(:,nyfin-boundary+1:nyfin) = gdepw_ps_interp(:,nyfin-boundary+1:nyfin)
507        !                   
508
509        IF(.NOT. smoothing) WRITE(*,*) 'No smoothing process only connection is carried out'
510        WRITE(*,*) ' linear connection on ',npt_connect,'coarse grid points'
511
512        !           
513        gdepw_ps_interp = 0.
514        CALL Check_interp(G0,gdepw_ps_interp)      ! interpolation in connection zone (3 coarse grid cells)
515        !
516        !
517        !
518        !
519        !                    LINEAR CONNECTION
520        !
521        !
522        !
523        !
524        !
525        wghts = 1.
526        DO ji = boundary + 1 , boundary + npt_connect * irafx
527            wghts = wghts - (1. / (npt_connect*irafx - 1. ) )
528            DO jj=1,nyfin
529               IF (G1%gdepw_ps(nbghostcellsfine+1,jj) > 0.) THEN
530                  G1%wgt(ji,jj) = MAX(wghts, G1%wgt(ji,jj)) 
531               ENDIF
532            END DO
533        END DO
534     
535        wghts = 1.
536        DO ji = nxfin - boundary , nxfin - boundary - npt_connect * irafx +1 , -1
537            wghts = wghts - (1. / (npt_connect*irafx - 1. ) )
538            DO jj=1,nyfin
539               IF (G1%gdepw_ps(nxfin-nbghostcellsfine,jj) > 0.) THEN
540                  G1%wgt(ji,jj) = MAX(wghts, G1%wgt(ji,jj))
541               ENDIF
542            END DO
543        END DO 
544
545        wghts = 1.
546        DO jj = boundary + 1 , boundary + npt_connect * irafy
547            wghts = wghts - (1. / (npt_connect*irafy - 1. ) )
548            DO ji=1,nxfin
549               IF (G1%gdepw_ps(ji,nbghostcellsfine+1) > 0.) THEN
550                  G1%wgt(ji,jj) = MAX(wghts, G1%wgt(ji,jj))
551               ENDIF
552            END DO
553        END DO
554
555        wghts = 1.
556        DO jj = nyfin - boundary , nyfin - boundary - npt_connect * irafy +1, -1
557            wghts = wghts - (1. / (npt_connect*irafy - 1. ) )
558            DO ji=1,nxfin
559               IF (G1%gdepw_ps(ji,nyfin-nbghostcellsfine) > 0.) THEN
560                  G1%wgt(ji,jj) = MAX(wghts, G1%wgt(ji,jj))
561               ENDIF
562            END DO
563        END DO
564
565        G1%gdepw_ps(:,:) = (1.-G1%wgt(:,:)) * G1%gdepw_ps(:,:) + gdepw_ps_interp(:,:)*G1%wgt(:,:)
566
567        G1%bathy_meter = G1%gdepw_ps
568        !                     
569        !
570! Chanut: remove smoothing if child grid bathymetry is found to already exist
571        IF(smoothing.AND.(.NOT.identical_grids)) THEN 
572
573           !
574           ! Smoothing to connect the connection zone (3 + npt_connect coarse grid cells) and the interior domain
575           !
576! Chanut: smoothing everywhere then discard result in connection zone
577           CALL smooth_topo(G1%gdepw_ps(1:nxfin,1:nyfin),nbiter)
578           WHERE (G1%wgt(:,:)==0.) G1%bathy_meter(:,:) = G1%gdepw_ps(:,:)
579!           boundary = (npt_copy+npt_connect)*irafx + nbghostcellsfine + 1
580!           CALL smooth_topo(G1%gdepw_ps(boundary:nxfin-boundary+1,boundary:nyfin-boundary+1),nbiter)
581!           G1%bathy_meter = G1%gdepw_ps                         
582        ENDIF
583
584
585        !
586       
587        ! Remove closed seas
588        !                           
589        IF (removeclosedseas) THEN
590           ALLOCATE(bathy_test(nxfin,nyfin))
591           bathy_test=0.
592           WHERE (G1%bathy_meter(1,:).GT.0.)
593              bathy_test(1,:)=1
594           END WHERE
595           WHERE (G1%bathy_meter(nxfin,:).GT.0.)
596              bathy_test(nxfin,:)=1
597           END WHERE
598           WHERE (G1%bathy_meter(:,1).GT.0.)
599              bathy_test(:,1)=1
600           END WHERE
601           WHERE (G1%bathy_meter(:,nyfin).GT.0.)
602              bathy_test(:,nyfin)=1
603           END WHERE
604           nbadd = 1
605           DO WHILE (nbadd.NE.0)
606              nbadd = 0
607              DO j=2,nyfin-1
608                 DO i=2,nxfin-1
609                    IF (G1%bathy_meter(i,j).GT.0.) THEN
610                       IF (MAX(bathy_test(i,j+1),bathy_test(i,j-1), &
611                            bathy_test(i-1,j),bathy_test(i+1,j)).EQ.1) THEN
612                          IF (bathy_test(i,j).NE.1.) nbadd = nbadd + 1
613                          bathy_test(i,j)=1.
614                       ENDIF
615
616                    ENDIF
617                 ENDDO
618              ENDDO
619           ENDDO
620           WHERE (bathy_test.EQ.0.)
621              G1%bathy_meter = 0.
622           END WHERE
623           DEALLOCATE(bathy_test)
624        ENDIF
625        !
626        ! Chanut: Compute partial step bathymetry once more
627        CALL get_partial_steps(G1)                 ! compute gdepw_ps for G1
628
629        IF(bathy_update) CALL Update_Parent_Bathy( G0,G1 ) 
630        !
631        CALL set_child_name(parent_bathy_meter,child_ps)
632        status = Write_Bathy_meter(TRIM(child_ps),G1)       
633
634        IF(bathy_update) status = Write_Bathy_meter(TRIM(updated_parent_file),G0)
635
636        CALL get_partial_steps(G1)
637        !
638        G1%bathy_level=NINT(G1%bathy_level)
639        !
640        IF( TRIM(parent_meshmask_file) .NE. '/NULL' ) &
641             status = Write_Bathy_level(TRIM(Childlevel_file),G1)
642        !
643        WRITE(*,*) '****** Bathymetry successfully created for partial cells ******'
644        WRITE(*,*) ' '
645        !
646        STOP         
647     ENDIF
648     !           
649     !--------------------------------end if partial steps------------------------------------
650     !
651     !
652     status = Read_bathy_level(TRIM(parent_meshmask_file),G0)
653     !           
654     CALL levels_to_meter(G0)
655     !
656     ! compute constant bathymetry for Parent-Child bathymetry connection
657     !             
658     WHERE( G0%bathy_meter < 0.000001 ) G0%bathy_meter = 0.
659
660     CALL init_constant_bathy(G0%bathy_meter,bathy_fin_constant)
661     !
662     boundary = npt_copy*irafx + nbghostcellsfine + 1   
663     !             
664     G1%bathy_meter(1:boundary,:) = bathy_fin_constant(1:boundary,:)
665     G1%bathy_meter(:,1:boundary) = bathy_fin_constant(:,1:boundary)
666     G1%bathy_meter(nxfin-boundary+1:nxfin,:) = bathy_fin_constant(nxfin-boundary+1:nxfin,:)
667     G1%bathy_meter(:,nyfin-boundary+1:nyfin) = bathy_fin_constant(:,nyfin-boundary+1:nyfin)
668     !
669     ! bathymetry smoothing
670     !                 
671     CALL smooth_topo(G1%bathy_meter(boundary:nxfin-boundary+1,boundary:nyfin-boundary+1),nbiter)
672     !
673     ! convert bathymetry from meters to levels
674     !
675     CALL meter_to_levels(G1) 
676     !           
677     DEALLOCATE(G1%bathy_meter)           
678     !             
679  ENDIF
680  !
681  !
682  ! make connection thanks to constant and interpolated bathymetry
683  !
684  !     
685  G1%bathy_level=NINT(G1%bathy_level)
686  !       
687  DO j=1,nyfin
688     DO i=1,nxfin
689        IF (g1%bathy_level(i,j).LT.0.) THEN
690           PRINT *,'error in ',i,j,g1%bathy_level(i,j)
691        ENDIF
692     ENDDO
693  ENDDO
694  !       
695  WHERE ((G1%bathy_level.LT.3.).AND.(G1%bathy_level.GT.0.))
696     G1%bathy_level=3
697  END WHERE
698  !
699  ! possibility to remove closed seas
700  !     
701  IF (removeclosedseas) THEN
702     ALLOCATE(bathy_test(nxfin,nyfin))
703
704     bathy_test=0.
705     WHERE (G1%bathy_level(1,:).GT.0.)
706        bathy_test(1,:)=1
707     END WHERE
708
709     WHERE (G1%bathy_level(nxfin,:).GT.0.)
710        bathy_test(nxfin,:)=1
711     END WHERE
712
713     WHERE (G1%bathy_level(:,1).GT.0.)
714        bathy_test(:,1)=1
715     END WHERE
716
717     WHERE (G1%bathy_level(:,nyfin).GT.0.)
718        bathy_test(:,nyfin)=1
719     END WHERE
720
721     nbadd = 1
722
723     DO WHILE (nbadd.NE.0)
724        nbadd = 0
725        DO j=2,nyfin-1
726           DO i=2,nxfin-1
727              IF (G1%bathy_level(i,j).GT.0.) THEN
728                 IF (MAX(bathy_test(i,j+1),bathy_test(i,j-1),bathy_test(i-1,j),bathy_test(i+1,j)).EQ.1) THEN
729                    IF (bathy_test(i,j).NE.1.) nbadd = nbadd + 1
730                    bathy_test(i,j)=1.
731                 ENDIF
732
733              ENDIF
734           ENDDO
735        ENDDO
736
737     ENDDO
738
739     WHERE (bathy_test.EQ.0.)
740        G1%bathy_level = 0.
741     END WHERE
742     DEALLOCATE(bathy_test)           
743  ENDIF
744
745
746  !
747  ! store interpolation result in output file
748  !
749  status = Write_Bathy_level(TRIM(Childlevel_file),G1)
750
751  WRITE(*,*) '****** Bathymetry successfully created for full cells ******'
752  WRITE(*,*) ' '
753
754  STOP
755END PROGRAM create_bathy
756
757
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.