New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 11949 for NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src/TOP/PISCES/P4Z/p4zprod.F90 – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2019-11-22T15:29:17+01:00 (4 years ago)
Author:
acc
Message:

Merge in changes from 2019/dev_r10721_KERNEL-02_Storkey_Coward_IMMERSE_first_steps. This just creates a fresh copy of this branch to use as the merge base. See ticket #2341

Location:
NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src

    • Property svn:mergeinfo deleted
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src/TOP/PISCES/P4Z/p4zprod.F90

    r11536 r11949  
    5353CONTAINS 
    5454 
    55    SUBROUTINE p4z_prod( kt , knt ) 
     55   SUBROUTINE p4z_prod( kt , knt, Kbb, Kmm, Krhs ) 
    5656      !!--------------------------------------------------------------------- 
    5757      !!                     ***  ROUTINE p4z_prod  *** 
     
    6363      !!--------------------------------------------------------------------- 
    6464      INTEGER, INTENT(in) ::   kt, knt   ! 
     65      INTEGER, INTENT(in) ::   Kbb, Kmm, Krhs  ! time level indices 
    6566      ! 
    6667      INTEGER  ::   ji, jj, jk 
     
    119120               IF( etot_ndcy(ji,jj,jk) > 1.E-3 ) THEN 
    120121                  zval = MAX( 1., zstrn(ji,jj) ) 
    121                   IF( gdept_n(ji,jj,jk) <= hmld(ji,jj) ) THEN 
     122                  IF( gdept(ji,jj,jk,Kmm) <= hmld(ji,jj) ) THEN 
    122123                     zval = zval * MIN(1., heup_01(ji,jj) / ( hmld(ji,jj) + rtrn )) 
    123124                  ENDIF 
     
    140141            DO ji = 1, jpi 
    141142               IF( etot_ndcy(ji,jj,jk) > 1.E-3 ) THEN 
    142                   ztn         = MAX( 0., tsn(ji,jj,jk,jp_tem) - 15. ) 
     143                  ztn         = MAX( 0., ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) - 15. ) 
    143144                  zadap       = xadap * ztn / ( 2.+ ztn ) 
    144                   zconctemp   = MAX( 0.e0 , trb(ji,jj,jk,jpdia) - xsizedia ) 
    145                   zconctemp2  = trb(ji,jj,jk,jpdia) - zconctemp 
     145                  zconctemp   = MAX( 0.e0 , tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) - xsizedia ) 
     146                  zconctemp2  = tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) - zconctemp 
    146147                  ! 
    147148                  zpislopeadn(ji,jj,jk) = pislopen * ( 1.+ zadap  * EXP( -0.25 * enano(ji,jj,jk) ) )  & 
    148                   &                   * trb(ji,jj,jk,jpnch) /( trb(ji,jj,jk,jpphy) * 12. + rtrn) 
     149                  &                   * tr(ji,jj,jk,jpnch,Kbb) /( tr(ji,jj,jk,jpphy,Kbb) * 12. + rtrn) 
    149150                  ! 
    150                   zpislopeadd(ji,jj,jk) = (pislopen * zconctemp2 + pisloped * zconctemp) / ( trb(ji,jj,jk,jpdia) + rtrn )   & 
    151                   &                   * trb(ji,jj,jk,jpdch) /( trb(ji,jj,jk,jpdia) * 12. + rtrn) 
     151                  zpislopeadd(ji,jj,jk) = (pislopen * zconctemp2 + pisloped * zconctemp) / ( tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) + rtrn )   & 
     152                  &                   * tr(ji,jj,jk,jpdch,Kbb) /( tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) * 12. + rtrn) 
    152153               ENDIF 
    153154            END DO 
     
    204205                   !    Si/C is arbitrariliy increased for very high Si concentrations 
    205206                   !    to mimic the very high ratios observed in the Southern Ocean (silpot2) 
    206                   zlim  = trb(ji,jj,jk,jpsil) / ( trb(ji,jj,jk,jpsil) + xksi1 ) 
     207                  zlim  = tr(ji,jj,jk,jpsil,Kbb) / ( tr(ji,jj,jk,jpsil,Kbb) + xksi1 ) 
    207208                  zsilim = MIN( zprdia(ji,jj,jk) / ( zprmaxd(ji,jj,jk) + rtrn ), xlimsi(ji,jj,jk) ) 
    208209                  zsilfac = 4.4 * EXP( -4.23 * zsilim ) * MAX( 0.e0, MIN( 1., 2.2 * ( zlim - 0.5 ) )  ) + 1.e0 
    209                   zsiborn = trb(ji,jj,jk,jpsil) * trb(ji,jj,jk,jpsil) * trb(ji,jj,jk,jpsil) 
     210                  zsiborn = tr(ji,jj,jk,jpsil,Kbb) * tr(ji,jj,jk,jpsil,Kbb) * tr(ji,jj,jk,jpsil,Kbb) 
    210211                  IF (gphit(ji,jj) < -30 ) THEN 
    211212                    zsilfac2 = 1. + 2. * zsiborn / ( zsiborn + xksi2**3 ) 
     
    237238               IF( etot_ndcy(ji,jj,jk) > 1.E-3 ) THEN 
    238239                  !  production terms for nanophyto. (C) 
    239                   zprorcan(ji,jj,jk) = zprbio(ji,jj,jk)  * xlimphy(ji,jj,jk) * trb(ji,jj,jk,jpphy) * rfact2 
     240                  zprorcan(ji,jj,jk) = zprbio(ji,jj,jk)  * xlimphy(ji,jj,jk) * tr(ji,jj,jk,jpphy,Kbb) * rfact2 
    240241                  zpronewn(ji,jj,jk)  = zprorcan(ji,jj,jk)* xnanono3(ji,jj,jk) / ( xnanono3(ji,jj,jk) + xnanonh4(ji,jj,jk) + rtrn ) 
    241242                  ! 
    242                   zratio = trb(ji,jj,jk,jpnfe) / ( trb(ji,jj,jk,jpphy) * fecnm + rtrn ) 
     243                  zratio = tr(ji,jj,jk,jpnfe,Kbb) / ( tr(ji,jj,jk,jpphy,Kbb) * fecnm + rtrn ) 
    243244                  zmax   = MAX( 0., ( 1. - zratio ) / ABS( 1.05 - zratio ) )  
    244245                  zprofen(ji,jj,jk) = fecnm * zprmaxn(ji,jj,jk) * ( 1.0 - fr_i(ji,jj) )  & 
    245246                  &             * ( 4. - 4.5 * xlimnfe(ji,jj,jk) / ( xlimnfe(ji,jj,jk) + 0.5 ) )    & 
    246247                  &             * biron(ji,jj,jk) / ( biron(ji,jj,jk) + concnfe(ji,jj,jk) )  & 
    247                   &             * zmax * trb(ji,jj,jk,jpphy) * rfact2 
     248                  &             * zmax * tr(ji,jj,jk,jpphy,Kbb) * rfact2 
    248249                  !  production terms for diatoms (C) 
    249                   zprorcad(ji,jj,jk) = zprdia(ji,jj,jk) * xlimdia(ji,jj,jk) * trb(ji,jj,jk,jpdia) * rfact2 
     250                  zprorcad(ji,jj,jk) = zprdia(ji,jj,jk) * xlimdia(ji,jj,jk) * tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) * rfact2 
    250251                  zpronewd(ji,jj,jk) = zprorcad(ji,jj,jk) * xdiatno3(ji,jj,jk) / ( xdiatno3(ji,jj,jk) + xdiatnh4(ji,jj,jk) + rtrn ) 
    251252                  ! 
    252                   zratio = trb(ji,jj,jk,jpdfe) / ( trb(ji,jj,jk,jpdia) * fecdm + rtrn ) 
     253                  zratio = tr(ji,jj,jk,jpdfe,Kbb) / ( tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) * fecdm + rtrn ) 
    253254                  zmax   = MAX( 0., ( 1. - zratio ) / ABS( 1.05 - zratio ) )  
    254255                  zprofed(ji,jj,jk) = fecdm * zprmaxd(ji,jj,jk) * ( 1.0 - fr_i(ji,jj) )  & 
    255256                  &             * ( 4. - 4.5 * xlimdfe(ji,jj,jk) / ( xlimdfe(ji,jj,jk) + 0.5 ) )    & 
    256257                  &             * biron(ji,jj,jk) / ( biron(ji,jj,jk) + concdfe(ji,jj,jk) )  & 
    257                   &             * zmax * trb(ji,jj,jk,jpdia) * rfact2 
     258                  &             * zmax * tr(ji,jj,jk,jpdia,Kbb) * rfact2 
    258259               ENDIF 
    259260            END DO 
     
    270271                  zprod    = rday * zprorcan(ji,jj,jk) * zprnch(ji,jj,jk) * xlimphy(ji,jj,jk) 
    271272                  zprochln = chlcmin * 12. * zprorcan (ji,jj,jk) 
    272                   chlcnm_n   = MIN ( chlcnm, ( chlcnm / (1. - 1.14 / 43.4 *tsn(ji,jj,jk,jp_tem))) * (1. - 1.14 / 43.4 * 20.)) 
     273                  chlcnm_n   = MIN ( chlcnm, ( chlcnm / (1. - 1.14 / 43.4 *ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm))) * (1. - 1.14 / 43.4 * 20.)) 
    273274                  zprochln = zprochln + (chlcnm_n-chlcmin) * 12. * zprod / & 
    274275                                        & (  zpislopeadn(ji,jj,jk) * znanotot +rtrn) 
     
    277278                  zprod    = rday * zprorcad(ji,jj,jk) * zprdch(ji,jj,jk) * xlimdia(ji,jj,jk) 
    278279                  zprochld = chlcmin * 12. * zprorcad(ji,jj,jk) 
    279                   chlcdm_n   = MIN ( chlcdm, ( chlcdm / (1. - 1.14 / 43.4 * tsn(ji,jj,jk,jp_tem))) * (1. - 1.14 / 43.4 * 20.)) 
     280                  chlcdm_n   = MIN ( chlcdm, ( chlcdm / (1. - 1.14 / 43.4 * ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm))) * (1. - 1.14 / 43.4 * 20.)) 
    280281                  zprochld = zprochld + (chlcdm_n-chlcmin) * 12. * zprod / & 
    281282                                        & ( zpislopeadd(ji,jj,jk) * zdiattot +rtrn ) 
    282283                  !   Update the arrays TRA which contain the Chla sources and sinks 
    283                   tra(ji,jj,jk,jpnch) = tra(ji,jj,jk,jpnch) + zprochln * texcretn 
    284                   tra(ji,jj,jk,jpdch) = tra(ji,jj,jk,jpdch) + zprochld * texcretd 
     284                  tr(ji,jj,jk,jpnch,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpnch,Krhs) + zprochln * texcretn 
     285                  tr(ji,jj,jk,jpdch,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdch,Krhs) + zprochld * texcretd 
    285286               ENDIF 
    286287            END DO 
     
    296297                 zproreg2 = zprorcad(ji,jj,jk) - zpronewd(ji,jj,jk) 
    297298                 zdocprod = excretd * zprorcad(ji,jj,jk) + excretn * zprorcan(ji,jj,jk) 
    298                  tra(ji,jj,jk,jppo4) = tra(ji,jj,jk,jppo4) - zprorcan(ji,jj,jk) - zprorcad(ji,jj,jk) 
    299                  tra(ji,jj,jk,jpno3) = tra(ji,jj,jk,jpno3) - zpronewn(ji,jj,jk) - zpronewd(ji,jj,jk) 
    300                  tra(ji,jj,jk,jpnh4) = tra(ji,jj,jk,jpnh4) - zproreg - zproreg2 
    301                  tra(ji,jj,jk,jpphy) = tra(ji,jj,jk,jpphy) + zprorcan(ji,jj,jk) * texcretn 
    302                  tra(ji,jj,jk,jpnfe) = tra(ji,jj,jk,jpnfe) + zprofen(ji,jj,jk) * texcretn 
    303                  tra(ji,jj,jk,jpdia) = tra(ji,jj,jk,jpdia) + zprorcad(ji,jj,jk) * texcretd 
    304                  tra(ji,jj,jk,jpdfe) = tra(ji,jj,jk,jpdfe) + zprofed(ji,jj,jk) * texcretd 
    305                  tra(ji,jj,jk,jpdsi) = tra(ji,jj,jk,jpdsi) + zprorcad(ji,jj,jk) * zysopt(ji,jj,jk) * texcretd 
    306                  tra(ji,jj,jk,jpdoc) = tra(ji,jj,jk,jpdoc) + zdocprod 
    307                  tra(ji,jj,jk,jpoxy) = tra(ji,jj,jk,jpoxy) + o2ut * ( zproreg + zproreg2) & 
     299                 tr(ji,jj,jk,jppo4,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jppo4,Krhs) - zprorcan(ji,jj,jk) - zprorcad(ji,jj,jk) 
     300                 tr(ji,jj,jk,jpno3,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpno3,Krhs) - zpronewn(ji,jj,jk) - zpronewd(ji,jj,jk) 
     301                 tr(ji,jj,jk,jpnh4,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpnh4,Krhs) - zproreg - zproreg2 
     302                 tr(ji,jj,jk,jpphy,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpphy,Krhs) + zprorcan(ji,jj,jk) * texcretn 
     303                 tr(ji,jj,jk,jpnfe,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpnfe,Krhs) + zprofen(ji,jj,jk) * texcretn 
     304                 tr(ji,jj,jk,jpdia,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdia,Krhs) + zprorcad(ji,jj,jk) * texcretd 
     305                 tr(ji,jj,jk,jpdfe,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdfe,Krhs) + zprofed(ji,jj,jk) * texcretd 
     306                 tr(ji,jj,jk,jpdsi,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdsi,Krhs) + zprorcad(ji,jj,jk) * zysopt(ji,jj,jk) * texcretd 
     307                 tr(ji,jj,jk,jpdoc,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdoc,Krhs) + zdocprod 
     308                 tr(ji,jj,jk,jpoxy,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpoxy,Krhs) + o2ut * ( zproreg + zproreg2) & 
    308309                 &                   + ( o2ut + o2nit ) * ( zpronewn(ji,jj,jk) + zpronewd(ji,jj,jk) ) 
    309310                 ! 
    310311                 zfeup = texcretn * zprofen(ji,jj,jk) + texcretd * zprofed(ji,jj,jk) 
    311                  tra(ji,jj,jk,jpfer) = tra(ji,jj,jk,jpfer) - zfeup 
    312                  tra(ji,jj,jk,jpsil) = tra(ji,jj,jk,jpsil) - texcretd * zprorcad(ji,jj,jk) * zysopt(ji,jj,jk) 
    313                  tra(ji,jj,jk,jpdic) = tra(ji,jj,jk,jpdic) - zprorcan(ji,jj,jk) - zprorcad(ji,jj,jk) 
    314                  tra(ji,jj,jk,jptal) = tra(ji,jj,jk,jptal) + rno3 * ( zpronewn(ji,jj,jk) + zpronewd(ji,jj,jk) ) & 
     312                 tr(ji,jj,jk,jpfer,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpfer,Krhs) - zfeup 
     313                 tr(ji,jj,jk,jpsil,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpsil,Krhs) - texcretd * zprorcad(ji,jj,jk) * zysopt(ji,jj,jk) 
     314                 tr(ji,jj,jk,jpdic,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jpdic,Krhs) - zprorcan(ji,jj,jk) - zprorcad(ji,jj,jk) 
     315                 tr(ji,jj,jk,jptal,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jptal,Krhs) + rno3 * ( zpronewn(ji,jj,jk) + zpronewd(ji,jj,jk) ) & 
    315316                 &                                         - rno3 * ( zproreg + zproreg2 ) 
    316317              ENDIF 
     
    327328                    zdocprod = excretd * zprorcad(ji,jj,jk) + excretn * zprorcan(ji,jj,jk) 
    328329                    zfeup    = texcretn * zprofen(ji,jj,jk) + texcretd * zprofed(ji,jj,jk) 
    329                     tra(ji,jj,jk,jplgw) = tra(ji,jj,jk,jplgw) + zdocprod * ldocp - zfeup * plig(ji,jj,jk) * lthet 
     330                    tr(ji,jj,jk,jplgw,Krhs) = tr(ji,jj,jk,jplgw,Krhs) + zdocprod * ldocp - zfeup * plig(ji,jj,jk) * lthet 
    330331                    zpligprod1(ji,jj,jk) = zdocprod * ldocp 
    331332                    zpligprod2(ji,jj,jk) = zfeup * plig(ji,jj,jk) * lthet 
     
    412413             zw2d(:,:) = 0. 
    413414             DO jk = 1, jpkm1 
    414                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcan(:,:,jk) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert. integrated  primary produc. by nano 
     415               zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcan(:,:,jk) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert. integrated  primary produc. by nano 
    415416             ENDDO 
    416417             CALL iom_put( "INTPPPHYN" , zw2d ) 
     
    418419             zw2d(:,:) = 0. 
    419420             DO jk = 1, jpkm1 
    420                 zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcad(:,:,jk) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert. integrated  primary produc. by diatom 
     421                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcad(:,:,jk) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert. integrated  primary produc. by diatom 
    421422             ENDDO 
    422423             CALL iom_put( "INTPPPHYD" , zw2d ) 
     
    425426             zw2d(:,:) = 0. 
    426427             DO jk = 1, jpkm1 
    427                 zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zprorcan(:,:,jk) + zprorcad(:,:,jk) ) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert. integrated pp 
     428                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zprorcan(:,:,jk) + zprorcad(:,:,jk) ) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert. integrated pp 
    428429             ENDDO 
    429430             CALL iom_put( "INTPP" , zw2d ) 
     
    432433             zw2d(:,:) = 0. 
    433434             DO jk = 1, jpkm1 
    434                 zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zpronewn(:,:,jk) + zpronewd(:,:,jk) ) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert. integrated new prod 
     435                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zpronewn(:,:,jk) + zpronewd(:,:,jk) ) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert. integrated new prod 
    435436             ENDDO 
    436437             CALL iom_put( "INTPNEW" , zw2d ) 
     
    439440             zw2d(:,:) = 0. 
    440441             DO jk = 1, jpkm1 
    441                 zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zprofen(:,:,jk) + zprofed(:,:,jk) ) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert integr. bfe prod 
     442                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + ( zprofen(:,:,jk) + zprofed(:,:,jk) ) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk) ! vert integr. bfe prod 
    442443             ENDDO 
    443444            CALL iom_put( "INTPBFE" , zw2d ) 
     
    446447             zw2d(:,:) = 0. 
    447448             DO jk = 1, jpkm1 
    448                 zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcad(:,:,jk) * zysopt(:,:,jk) * e3t_n(:,:,jk) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert integr. bsi prod 
     449                zw2d(:,:) = zw2d(:,:) + zprorcad(:,:,jk) * zysopt(:,:,jk) * e3t(:,:,jk,Kmm) * zfact * tmask(:,:,jk)  ! vert integr. bsi prod 
    449450             ENDDO 
    450451             CALL iom_put( "INTPBSI" , zw2d ) 
     
    459460         WRITE(charout, FMT="('prod')") 
    460461         CALL prt_ctl_trc_info(charout) 
    461          CALL prt_ctl_trc(tab4d=tra, mask=tmask, clinfo=ctrcnm) 
     462         CALL prt_ctl_trc(tab4d=tr(:,:,:,:,Krhs), mask=tmask, clinfo=ctrcnm) 
    462463     ENDIF 
    463464      ! 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.