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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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Changeset 12193 for NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs – NEMO

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Timestamp:
2019-12-11T17:15:54+01:00 (4 years ago)
Author:
davestorkey
Message:

2019/dev_r11943_MERGE_2019: Merge in dev_r12072_TOP-01_ENHANCE-11_cethe

Location:
NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs
Files:
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  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/AGRIF_DEMO/EXPREF/1_context_nemo.xml

    r9930 r12193  
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    4639 
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  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/AGRIF_DEMO/EXPREF/2_context_nemo.xml

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     7    <!-- $id$ --> 
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  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/AGRIF_DEMO/EXPREF/3_context_nemo.xml

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    1821<!-- Fields definition --> 
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  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/AMM12/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
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    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
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    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable>           
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    1922    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     
    2124<!-- Files definition --> 
    2225    <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    23     <!--  
    24 ============================================================================================================ 
    25 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    26 ============================================================================================================ 
    27     --> 
    28      
    29     <axis_definition> 
    30       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    31       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    32       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="-"                 /> 
    35       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
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    38       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    39     </axis_definition> 
     26 
     27<!-- Axis definition --> 
     28    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4029  
     30<!-- Domain definition --> 
    4131    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     32 
     33<!-- Grids definition --> 
     34    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
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    43     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
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    4537</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/C1D_PAPA/EXPREF/context_nemo.xml

    r9930 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
     8 
    89<!-- Fields definition --> 
    910    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     
    1112<!-- Files definition --> 
    1213    <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    13     <!--  
    14 ============================================================================================================ 
    15 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    16 ============================================================================================================ 
    17     --> 
    18      
    19     <axis_definition> 
    20       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    21       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    22       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
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    25       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"               /> 
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    27       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"            /> 
    28       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"            /> 
    29     </axis_definition> 
     14 
     15<!-- Axis definition --> 
     16    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    3017  
     18<!-- Domain definition --> 
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     20 
     21<!-- Grids definition --> 
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    3223   
    33     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
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     24 
    3525</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/GYRE_BFM/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
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    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
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     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>      <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    2023    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    2124 
     25 
    2226<!-- Files definition --> 
    23     <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>      
    24     <!--  
    25 ============================================================================================================ 
    26 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    27 ============================================================================================================ 
    28     --> 
    29      
    30     <axis_definition> 
    31       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
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     27    <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     28 
     29<!-- Axis definition --> 
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    4131  
     32<!-- Domain definition --> 
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     35<!-- Grids definition --> 
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    44     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4538 
    4639</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/GYRE_PISCES/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
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    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
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     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>      <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    2023    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    2124 
     25 
    2226<!-- Files definition --> 
    23     <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>      
    24     <!--  
    25 ============================================================================================================ 
    26 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    27 ============================================================================================================ 
    28     --> 
    29      
    30     <axis_definition> 
    31       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
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    34       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
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    36       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
    37       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
    38       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    39       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    40     </axis_definition> 
     27    <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
     28 
     29<!-- Axis definition --> 
     30    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4131  
     32<!-- Domain definition --> 
    4233    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     34 
     35<!-- Grids definition --> 
     36    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4337   
    44     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4538 
    4639</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_ICE_PISCES/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     -->  
    20     <field_definition src="./field_def_nemo-ice.xml"/>    <!--  NEMO sea-ice model      -->  
    21     <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/> <!--  NEMO ocean biology      -->  
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     23    <field_definition src="./field_def_nemo-ice.xml"/>    <!--  NEMO sea-ice model      --> 
     24    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/> <!--  NEMO ocean biology      --> 
    2225 
    2326<!-- Files definition --> 
    24     <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics      -->  
    25     <file_definition src="./file_def_nemo-ice.xml"/>     <!--  NEMO sea-ice model       -->  
    26     <file_definition src="./file_def_nemo-pisces.xml"/>  <!--  NEMO ocean biology       -->  
    27     <!--  
    28 ============================================================================================================ 
    29 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    30 ============================================================================================================ 
    31     --> 
    32      
    33     <axis_definition> 
    34       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    36       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    37       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    38       <axis id="profsed" long_name="Vertical S levels" unit="cm" positive="down"/> 
    39       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="-"                 /> 
    40       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
    41       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
    42       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    43       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    44     </axis_definition> 
     27    <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics      --> 
     28    <file_definition src="./file_def_nemo-ice.xml"/>     <!--  NEMO sea-ice model       --> 
     29    <file_definition src="./file_def_nemo-pisces.xml"/>  <!--  NEMO ocean biology       --> 
     30 
     31 
     32<!-- Axis definition --> 
     33    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4534  
     35<!-- Domain definition --> 
    4636    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     37 
     38<!-- Grids definition --> 
     39    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4740   
    48     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    49      
     41 
    5042</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_ICE_PISCES/EXPREF/file_def_nemo-ice.xml

    r12153 r12193  
    123123   <file_group id="3h"  output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    124124   <file_group id="4h"  output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    125    <file_group id="6h"  output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->         
    126    <file_group id="1m"  output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
     125   <file_group id="6h"  output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->       
     126 
     127   <file_group id="1m"  output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
     128 
     129     <!-- To compute transport through straits : need to read ice mask at ice iteration at freq_offset = 1mo - nn_fsbc 
     130      <file id="file23" name_suffix="_strait_ice" description="transport variables through straits" > 
     131          <field field_ref="strait_mifl"      name="simassacrossline"  freq_offset="1mo-4ts" /> 
     132          <field field_ref="strait_msfl"      name="snmassacrossline"  freq_offset="1mo-4ts" /> 
     133          <field field_ref="strait_arfl"      name="siareaacrossline"  freq_offset="1mo-4ts" /> 
     134        </file> 
     135     --> 
     136 
     137    </file_group> 
     138 
    127139   <file_group id="2m"  output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    128140   <file_group id="3m"  output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
     
    133145   <file_group id="5y"  output_freq="5y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    134146   <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    135     
     147  
     148   <!-- To compute transport through straits : need to read ice mask at ice iteration at freq_offset = - nn_fsbc + 1 
     149   <file id="maskMFO" name="maskMFO" enabled="true" mode="read" output_freq="1mo" cyclic="true"  > 
     150      <field id="maskMFO_u_ice" operation="instant"  freq_offset="-3ts"  grid_ref="grid_U_4strait_ice" /> 
     151      <field id="maskMFO_v_ice" operation="instant"  freq_offset="-3ts"  grid_ref="grid_V_4strait_ice" /> 
     152   </file> 
     153 
     154     --> 
    136155 </file_definition> 
    137156  
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_ICE_PISCES/EXPREF/file_def_nemo-oce.xml

    r11536 r12193  
    9393          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"    /> 
    9494          <field field_ref="bgfrchfx"     name="bgfrchfx"    /> 
    95           <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"    /> 
     95     <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"    /> 
     96 
     97     <field field_ref="masstot"      name="masso"  /> 
     98          <field field_ref="voltot"       name="volo"  /> 
     99          <field field_ref="sshthster"    name="zostoga"  /> 
     100          <field field_ref="temptot"      name="bigthetaoga"  /> 
     101          <field field_ref="saltot"       name="soga"  /> 
     102          <field field_ref="ssttot"       name="tosga"  /> 
    96103        </file> 
    97104 
     
    100107 
    101108      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
     109 
     110        <file id="file16" name_suffix="_diaptr2D" description="zonal mean variables" > 
     111          <field field_ref="sophtove"    name="htovovrt"      grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     112          <field field_ref="sopstove"    name="sltovovrt"     grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     113          <field field_ref="sophtgyre"   name="htovgyre"      grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     114          <field field_ref="sopstgyre"   name="sltogyre"      grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     115          <field field_ref="sophtbtr"    name="htbtr"         grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     116          <field field_ref="sopstbtr"    name="sltbtr"        grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     117          <field field_ref="sophtadv"    name="htadv"         grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     118          <field field_ref="sopstadv"    name="sltadv"        grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     119          <field field_ref="sophtldf"    name="htldf"         grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     120          <field field_ref="sopstldf"    name="sltldf"        grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     121          <field field_ref="sophtvtr"    name="hfbasin"       grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     122          <field field_ref="sopstvtr"    name="sltbasin"      grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     123          <field field_ref="sophteiv"    name="hfbasinpmadv"  grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     124          <field field_ref="sopsteiv"    name="sltbasinpmadv" grid_ref="grid_ptr_T_2D"  /> 
     125        </file> 
     126 
     127 
     128         <file id="file17" name_suffix="_diaptr3D" description="zonal mean variables" > 
     129          <field field_ref="zomsf"       name="msftyz"        grid_ref="grid_ptr_W_3D"  /> 
     130          <field field_ref="zotem"       name="znltem"        grid_ref="grid_ptr_T_3D"  /> 
     131          <field field_ref="zosal"       name="znlsal"        grid_ref="grid_ptr_T_3D"  /> 
     132          <field field_ref="zosrf"       name="znlsrf"        grid_ref="grid_ptr_T_3D"  /> 
     133        </file> 
     134 
     135      <!--   
     136         <file id="file18" name_suffix="_strait_oce" description="transport variables through straits" > 
     137           <field field_ref="masstr_strait"        name="mfo"               /> 
     138         </file>      
     139      --> 
     140 
    102141      </file_group> 
    103142 
    104143      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
    105144      </file_group> 
    106     
     145 
     146      <!--  To compute transport through straits : need to read mask file ( every month is the best otherwise costly ) 
     147 
     148      <file id="maskMFO"  name="maskMFO" enabled="true" mode="read" output_freq="1mo" cyclic="true"  > 
     149        <field id="maskMFO_u" operation="instant" freq_offset="1mo" grid_ref="grid_U_4strait" /> 
     150        <field id="maskMFO_v" operation="instant" freq_offset="1mo" grid_ref="grid_V_4strait" /> 
     151      </file> 
     152 
     153    --> 
     154 
    107155       
    108156      <file_group id="1ts" output_freq="1ts" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_ICE_PISCES/EXPREF/namelist_pisces_cfg

    r10227 r12193  
    8080/ 
    8181!----------------------------------------------------------------------- 
    82 &nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     82&nampisbc      !   parameters for inputs deposition 
     83!----------------------------------------------------------------------- 
     84   sn_dust     = 'dust.orca.new'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     85   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
     86   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     87   ln_hydrofe  =  .true.   ! boolean for from hydrothermal vents 
     88/ 
     89!----------------------------------------------------------------------- 
     90&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
    8391!----------------------------------------------------------------------- 
    8492/ 
     
    94102&nampisdmp     !   Damping  
    95103!----------------------------------------------------------------------- 
     104   nn_pisdmp    =  5840       !  Frequency of Relaxation 
    96105/ 
    97106!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_ICE_PISCES/EXPREF/namelist_top_cfg

    r11536 r12193  
    2020! 
    2121   ln_trcdta     =  .true.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    22 !                 !           !                                          !             ! 
    23 !                 !    name   !           title of the field             !   units     ! initial data from file or not ! 
    24 !                 !           !                                          !             ! 
    25    sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    26    sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true. 
    27    sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    28    sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. 
    29    sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    30    sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. 
    31    sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    32    sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' , .false. 
    33    sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. 
    34    sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    35    sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. 
    36    sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. 
    37    sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. 
    38    sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    39    sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. 
    40    sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. 
    41    sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. 
    42    sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' , .false. 
    43    sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' , .false. 
    44    sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' , .false. 
    45    sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. 
    46    sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. 
    47    sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    48    sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' , .false. 
     22   ln_trcbc      =  .true.   !  Enables Boundary conditions 
     23!                !           !                                           !             !        ! 
     24!                !    name   !           title of the field              !   units     ! init    ! sbc    ! cbc    !  obc  !  
     25   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false.  
     26   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   , .true.  , .false., .true. , .false. 
     27   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .false., .false.  
     28   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     29   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     30   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     31   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     32   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     33   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     34   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false. 
     35   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     36   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     37   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     38   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     39   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     40   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     41   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     42   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     43   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     44   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     45   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     46   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     47   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     48   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
    4949/ 
    5050!----------------------------------------------------------------------- 
     
    7777&namtrc_adv      !   advection scheme for passive tracer                (default: NO selection) 
    7878!----------------------------------------------------------------------- 
    79    ln_trcadv_mus =  .true.  !  MUSCL scheme 
     79   ln_trcadv_mus =  .true.   !  MUSCL scheme 
    8080      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    8181/ 
     
    8383&namtrc_ldf      !   lateral diffusion scheme for passive tracer        (default: NO selection) 
    8484!----------------------------------------------------------------------- 
    85    ln_trcldf_tra   = .true.      !  use active tracer setting 
     85   ln_trcldf_tra   =  .true.     !  use active tracer setting 
    8686/ 
    8787!----------------------------------------------------------------------- 
     
    108108&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    109109!----------------------------------------------------------------------- 
     110!                !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     111!                !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     112   sn_trcsbc(5)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustpo4'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     113   sn_trcsbc(7)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustsi'      ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     114   sn_trcsbc(14) = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustfer'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     115   sn_trcsbc(23) = 'ndeposition.orca',      -12          , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     116   rn_trsfac(5)  = 8.264e-02   !  (  0.021 / 31. * 122 ) 
     117   rn_trsfac(7)  = 3.313e-01     !  ( 8.8   / 28.1 ) 
     118   rn_trsfac(14) = 6.266e-04   !  (  0.035 / 55.85 ) 
     119   rn_trsfac(23) =  5.4464e-01  !  ( From kgN m-2 s-1 to molC l-1 ====> zfact = 7.625/14 ) 
     120   rn_sbc_time   =  1.          !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     121   ! 
     122   sn_trccbc(1)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     123   sn_trccbc(2)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     124   sn_trccbc(5)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     125   sn_trccbc(7)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     126   sn_trccbc(10) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     127   sn_trccbc(14) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     128   sn_trccbc(23) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     129   rn_trcfac(1)  = 8.333e+01   !  ( data in Mg/m2/yr : 1e3/12/ryyss) 
     130   rn_trcfac(2)  = 8.333e+01   !  ( 1e3 /12 ) 
     131   rn_trcfac(5)  = 3.935e+04   !  ( 1e3 / 31. * 122 ) 
     132   rn_trcfac(7)  = 3.588e+01   !  ( 1e3 / 28.1 ) 
     133   rn_trcfac(10) = 8.333e+01   !  ( 1e3 / 12 
     134   rn_trcfac(14) = 4.166e-03   !  ( 1e3 / 12 * 5e-5 ) 
     135   rn_trcfac(23) = 5.446e+02   !  (  1e3 / 14 * 7.625 ) 
     136   rn_cbc_time   = 3.1536e+7   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a year) 
    110137/ 
    111138!---------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    20     <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     23    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/> <!--  NEMO ocean biology      --> 
    2124 
    2225<!-- Files definition --> 
    23     <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    24     <!--  
    25 ============================================================================================================ 
    26 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    27 ============================================================================================================ 
    28     --> 
    29      
    30     <axis_definition> 
    31       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    32       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="profsed" long_name="Vertical S levels" unit="cm" positive="down"/> 
    36       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="-"                 /> 
    37       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
    38       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
    39       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    40       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    41     </axis_definition> 
     26    <file_definition src="./file_def_nemo-pisces.xml"/>  <!--  NEMO ocean biology       --> 
     27 
     28 
     29<!-- Axis definition --> 
     30    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4231  
     32<!-- Domain definition --> 
    4333    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     34 
     35<!-- Grids definition --> 
     36    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4437   
    45     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    46      
     38 
    4739</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_pisces_cfg

    r10227 r12193  
    8181/ 
    8282!----------------------------------------------------------------------- 
    83 &nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     83&nampisbc      !   parameters for inputs deposition 
     84!----------------------------------------------------------------------- 
     85   sn_dust     = 'dust.orca.new'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     86   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
     87   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     88   ln_hydrofe  =  .true.   ! boolean for from hydrothermal vents 
     89/ 
     90!----------------------------------------------------------------------- 
     91&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
    8492!----------------------------------------------------------------------- 
    8593/ 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_top_cfg

    r11536 r12193  
    1919   ln_c14        =  .false. 
    2020! 
    21    ln_trcdta     =  .true.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    22 !                !           !                                         !            !                               ! 
    23 !                !    name   !           title of the field            !   units    ! initial data from file or not !  
    24    sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    25    sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true. 
    26    sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    27    sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    28    sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    29    sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    30    sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    31    sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    32    sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    33    sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    34    sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    35    sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    36    sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    37    sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    38    sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    39    sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    40    sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    41    sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    42    sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false. 
    43    sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    44    sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    45    sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    46    sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    47    sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false. 
     21   ln_trcdta     =  .true.   !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
     22   ln_trcbc      =  .true.   !  Enables Boundary conditions 
     23!                !           !                                           !             !         ! 
     24!                !    name   !           title of the field              !   units     ! init    ! sbc    ! cbc    !  obc  !  
     25   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false.  
     26   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   , .true.  , .false., .true. , .false. 
     27   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .false., .false.  
     28   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     29   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     30   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     31   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     32   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     33   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     34   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false. 
     35   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     36   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     37   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     38   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     39   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     40   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     41   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     42   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     43   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     44   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     45   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     46   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     47   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     48   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
    4849/ 
    4950!----------------------------------------------------------------------- 
     
    107108&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    108109!----------------------------------------------------------------------- 
     110!                !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     111!                !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     112   sn_trcsbc(5)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustpo4'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     113   sn_trcsbc(7)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustsi'      ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     114   sn_trcsbc(14) = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustfer'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     115   sn_trcsbc(23) = 'ndeposition.orca',      -12          , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     116   rn_trsfac(5)  = 8.264e-02   !  (  0.021 / 31. * 122 ) 
     117   rn_trsfac(7)  = 3.313e-01     !  ( 8.8   / 28.1 ) 
     118   rn_trsfac(14) = 6.266e-04   !  (  0.035 / 55.85 ) 
     119   rn_trsfac(23) =  5.4464e-01  !  ( From kgN m-2 s-1 to molC l-1 ====> zfact = 7.625/14 ) 
     120   rn_sbc_time   =  1.          !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     121   ! 
     122   sn_trccbc(1)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     123   sn_trccbc(2)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     124   sn_trccbc(5)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     125   sn_trccbc(7)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     126   sn_trccbc(10) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     127   sn_trccbc(14) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     128   sn_trccbc(23) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     129   rn_trcfac(1)  = 8.333e+01   !  ( data in Mg/m2/yr : 1e3/12/ryyss) 
     130   rn_trcfac(2)  = 8.333e+01   !  ( 1e3 /12 ) 
     131   rn_trcfac(5)  = 3.935e+04   !  ( 1e3 / 31. * 122 ) 
     132   rn_trcfac(7)  = 3.588e+01   !  ( 1e3 / 28.1 ) 
     133   rn_trcfac(10) = 8.333e+01   !  ( 1e3 / 12 
     134   rn_trcfac(14) = 4.166e-03   !  ( 1e3 / 12 * 5e-5 ) 
     135   rn_trcfac(23) = 5.446e+02   !  (  1e3 / 14 * 7.625 ) 
     136   rn_cbc_time   = 3.1536e+7   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a year) 
    109137/ 
    110138!---------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_OFF_TRC/EXPREF/context_nemo.xml

    r11536 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    20     <field_definition src="./field_def_nemo-innerttrc.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     23    <field_definition src="./field_def_nemo-innerttrc.xml"/> <!--  NEMO ocean biology      --> 
    2124 
    2225<!-- Files definition --> 
    23     <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    24     <!--  
    25 ============================================================================================================ 
    26 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    27 ============================================================================================================ 
    28     --> 
    29      
    30     <axis_definition> 
    31       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    32       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="-"                 /> 
    36       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
    37       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
    38       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    39       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    40     </axis_definition> 
     26    <file_definition src="./file_def_nemo-innerttrc.xml"/>  <!--  NEMO ocean biology       --> 
     27 
     28 
     29<!-- Axis definition --> 
     30    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4131  
     32<!-- Domain definition --> 
    4233    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     34 
     35<!-- Grids definition --> 
     36    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4337   
    44     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    45      
     38 
    4639</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/ORCA2_SAS_ICE/EXPREF/context_nemo.xml

    r9930 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    1922    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     
    2326    <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics      --> 
    2427    <file_definition src="./file_def_nemo-ice.xml"/>     <!--  NEMO sea-ice model       --> 
    25     <!--  
    26 ============================================================================================================ 
    27 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    28 ============================================================================================================ 
    29     --> 
    30      
    31     <axis_definition> 
    32       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
    36       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="-"                 /> 
    37       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
    38       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
    39       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    40       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    41     </axis_definition> 
     28 
     29 
     30<!-- Axis definition --> 
     31    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4232  
     33<!-- Domain definition --> 
    4334    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     35 
     36<!-- Grids definition --> 
     37    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4438   
    45     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4639 
    4740</context> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/domain_def_nemo.xml

    r11536 r12193  
    99       <zoom_domain ibegin="1" jbegin="1" ni="2" nj="3"/> 
    1010     </domain> 
     11 
     12      <domain id="1point" domain_ref="grid_T" > 
     13         <zoom_domain ibegin="139" jbegin="119" ni="1" nj="1"/> 
     14      </domain> 
     15 
    1116 
    1217     <!--   Eq section --> 
     
    176181     <domain id="EqW" domain_ref="grid_W" > <zoom_domain id="EqW"/> </domain> 
    177182 
    178       
    179      <!--   zonal mean grid   --> 
    180      <domain id="gznl" long_name="gznl"/> 
    181      <domain id="znl_T" domain_ref="gznl" > <zoom_domain id="znl_T"/> </domain> 
    182      <domain id="znl_W" domain_ref="gznl" > <zoom_domain id="znl_W"/> </domain> 
     183              <!--   zonal mean grid   --> 
     184     <domain_group id="gznl"> 
     185        <domain id="gznl" long_name="gznl"/> 
     186        <domain id="ptr" domain_ref="gznl" >  
     187            <zoom_domain id="ptr" ibegin="0000" jbegin="0" ni="1" nj="0000" />  
     188        </domain> 
     189      </domain_group> 
    183190 
    184191      
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/field_def_nemo-ice.xml

    r12182 r12193  
    230230 
    231231     <!-- momentum (advection) --> 
    232      <field id="xmtrpice"     long_name="X-component of ice mass transport"                       standard_name="ice_x_transport"                       unit="kg/s" /> 
     232        <field id="xmtrpice"     long_name="X-component of ice mass transport"                       standard_name="ice_x_transport"                       unit="kg/s" /> 
    233233          <field id="ymtrpice"     long_name="Y-component of ice mass transport"                       standard_name="ice_y_transport"                       unit="kg/s" /> 
    234234          <field id="xmtrpsnw"     long_name="X-component of snw mass transport"                       standard_name="snw_x_transport"                       unit="kg/s" /> 
     
    237237          <field id="yatrp"        long_name="Y-component of ice area transport"                       standard_name="area_y_transport"                      unit="m2/s" /> 
    238238          <field id="xmtrptot"     long_name="X-component of sea-ice mass transport"                   standard_name="sea_ice_x_transport"                   unit="kg/s" > xmtrpice + xmtrpsnw </field> 
    239           <field id="ymtrptot"     long_name="Y-component of sea-ice mass transport"                   standard_name="sea_ice_y_transport"                   unit="kg/s" > ymtrpice + ymtrpsnw </field> 
    240      
     239        <field id="ymtrptot"     long_name="Y-component of sea-ice mass transport"                   standard_name="sea_ice_y_transport"                   unit="kg/s" > ymtrpice + ymtrpsnw </field> 
     240 
     241     <!-- Ice transport through straits" --> 
     242         <field id="xmtrpice_ave"     long_name="Monthly average of x-ice mass transport"   field_ref="xmtrpice"          grid_ref="grid_U_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @xmtrpice </field> 
     243         <field id="xmtrpice_section"                                                                                     grid_ref="grid_U_scalar"  > xmtrpice_ave </field> 
     244         <field id="xmtrpice_strait"                                                        field_ref="xmtrpice_section"  grid_ref="grid_U_4strait_ice"  /> 
     245         <field id="xstrait_mifl"                                                           field_ref="xmtrpice_strait"   grid_ref="grid_U_4strait_ice_hsum" unit="kg/s" detect_missing_value="true" > this * maskMFO_u_ice </field> 
     246 
     247         <field id="ymtrpice_ave"     long_name="Monthly average of y-ice mass transport"   field_ref="ymtrpice"          grid_ref="grid_V_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @ymtrpice </field> 
     248         <field id="ymtrpice_section"                                                                                     grid_ref="grid_V_scalar"  > ymtrpice_ave </field> 
     249         <field id="ymtrpice_strait"                                                        field_ref="ymtrpice_section"  grid_ref="grid_V_4strait_ice"  /> 
     250    <field id="ystrait_mifl"                                                           field_ref="ymtrpice_strait"   grid_ref="grid_V_4strait_ice_hsum" unit="kg/s" detect_missing_value="true"  > this * maskMFO_v_ice </field> 
     251 
     252         <field id="xmtrpsnw_ave"     long_name="Monthly average of x-snow mass transport"  field_ref="xmtrpsnw"          grid_ref="grid_U_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @xmtrpsnw </field> 
     253         <field id="xmtrpsnw_section"                                                                                     grid_ref="grid_U_scalar"  > xmtrpsnw_ave </field> 
     254         <field id="xmtrpsnw_strait"                                                        field_ref="xmtrpsnw_section"  grid_ref="grid_U_4strait_ice"  /> 
     255         <field id="xstrait_msfl"                                                           field_ref="xmtrpsnw_strait"   grid_ref="grid_U_4strait_ice_hsum" unit="kg/s" detect_missing_value="true" > this * maskMFO_u_ice </field> 
     256 
     257         <field id="ymtrpsnw_ave"     long_name="Monthly average of y-snow mass transport"  field_ref="ymtrpsnw"          grid_ref="grid_V_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @ymtrpsnw </field> 
     258         <field id="ymtrpsnw_section"                                                                                     grid_ref="grid_V_scalar"  > ymtrpsnw_ave </field> 
     259         <field id="ymtrpsnw_strait"                                                        field_ref="ymtrpsnw_section"  grid_ref="grid_V_4strait_ice"  /> 
     260    <field id="ystrait_msfl"                                                           field_ref="ymtrpsnw_strait"   grid_ref="grid_V_4strait_ice_hsum" unit="kg/s" detect_missing_value="true"  > this * maskMFO_v_ice </field> 
     261 
     262         <field id="xatrp_ave"        long_name="Monthly average of x-ice area transport"   field_ref="xatrp"             grid_ref="grid_U_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @xatrp </field> 
     263         <field id="xatrp_section"                                                                                        grid_ref="grid_U_scalar"  > xatrp_ave </field> 
     264         <field id="xatrp_strait"                                                           field_ref="xatrp_section"     grid_ref="grid_U_4strait_ice"  /> 
     265         <field id="xstrait_arfl"                                                           field_ref="xatrp_strait"      grid_ref="grid_U_4strait_ice_hsum" unit="kg/s" detect_missing_value="true" > this * maskMFO_u_ice </field> 
     266 
     267         <field id="yatrp_ave"        long_name="Monthly average of y-ice area transport"   field_ref="yatrp"             grid_ref="grid_V_2D"        freq_op="1mo" freq_offset="_reset_"  > @yatrp </field> 
     268         <field id="yatrp_section"                                                                                        grid_ref="grid_V_scalar"  > yatrp_ave </field> 
     269         <field id="yatrp_strait"                                                           field_ref="yatrp_section"     grid_ref="grid_V_4strait_ice"  /> 
     270    <field id="ystrait_arfl"                                                           field_ref="yatrp_strait"      grid_ref="grid_V_4strait_ice_hsum" unit="m2/s" detect_missing_value="true"  > this * maskMFO_v_ice </field> 
     271 
     272         <field id="strait_mifl"      long_name="Sea ice mass flux through straits"      standard_name="sea_ice_mass_transport_across_line"   unit="kg/s"  freq_op="1mo"  grid_ref="grid_4strait_ice" > xstrait_mifl + ystrait_mifl </field> 
     273         <field id="strait_msfl"      long_name="Snow mass flux through straits"         standard_name="snow_mass_transport_across_line"      unit="kg/s"  freq_op="1mo"  grid_ref="grid_4strait_ice" > xstrait_msfl + ystrait_msfl </field> 
     274    <field id="strait_arfl"      long_name="Sea ice area flux through straits"      standard_name="sea_area_mass_transport_across_line"  unit="m2/s"  freq_op="1mo"  grid_ref="grid_4strait_ice" > xstrait_arfl + ystrait_arfl </field> 
     275 
    241276   </field_group> <!-- SBC_2D --> 
    242277 
     
    298333          <field id="sbgheat_tot"     long_name="global mean snow heat content"                                                             unit="1e20J"    /> 
    299334 
    300      <!-- available later --> 
    301      <!-- 
    302           <field id="strait_mifl"     long_name="Sea ice mass flux through straits"      standard_name="sea_ice_mass_transport_across_line" unit="kg/s"  grid_ref="grid_4strait" /> 
    303           <field id="strait_arfl"     long_name="Sea ice area flux through straits"      standard_name="sea_ice_area_transport_across_line" unit="m2/s"  grid_ref="grid_4strait" />   
    304           <field id="strait_msfl"     long_name="Sea ice snow flux through straits"      standard_name="snow_mass_transport_across_line"    unit="kg/s"  grid_ref="grid_4strait" /> 
    305           --> 
    306335   </field_group> 
    307336   
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    r12182 r12193  
    1919       
    2020      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    21         <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                    standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    22         <field id="e3t_surf"     long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_SFC"/> 
    23         <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    24  
     21        <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                    standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     22        <field id="e3ts"         long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_SFC"/> 
     23        <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness"    unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     24        <field id="e3tb"         long_name="bottom T-cell thickness"             standard_name="bottom_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_2D"/>  
     25        <field id="e3t_300"      field_ref="e3t"                grid_ref="grid_T_zoom_300"       detect_missing_value="true" /> 
     26        <field id="e3t_vsum300"  field_ref="e3t_300"            grid_ref="grid_T_vsum"   detect_missing_value="true" /> 
     27   <field id="masscello"    long_name="Sea Water Mass per unit area"   standard_name="sea_water_mass_per_unit_area"   unit="kg/m2"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     28        <field id="volcello"     long_name="Ocean Volume"                   standard_name="ocean_volume"   unit="m3"       grid_ref="grid_T_3D"/>  
    2529        <field id="toce"         long_name="temperature"                         standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    2630        <field id="toce_e3t"     long_name="temperature (thickness weighted)"                                                      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce * e3t </field > 
    2731        <field id="soce"         long_name="salinity"                            standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    2832        <field id="soce_e3t"     long_name="salinity    (thickness weighted)"                                                      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     33 
     34        <field id="toce_e3t_300"      field_ref="toce_e3t"          unit="degree_C"     grid_ref="grid_T_zoom_300"      detect_missing_value="true" /> 
     35        <field id="toce_e3t_vsum300"  field_ref="toce_e3t_300"      unit="degress_C*m"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" /> 
     36        <field id="toce_vmean300"     field_ref="toce_e3t_vsum300"  unit="degree_C"     grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > toce_e3t_vsum300/e3t_vsum300 </field> 
     37 
    2938 
    3039        <!-- t-eddy viscosity coefficients (ldfdyn) --> 
     
    5463        <field id="taubot"       long_name="bottom stress module"                                                                                   unit="N/m2"     />  
    5564 
     65         <!-- Case EOS = TEOS-10 : output potential temperature --> 
     66   <field id="toce_pot"     long_name="Sea Water Potential Temperature"              standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     67        <field id="sst_pot"      long_name="potential sea surface temperature"             standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
     68        <field id="tosmint_pot"  long_name="vertical integral of potential temperature times density"   standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
     69 
     70 
    5671        <field id="ssh"          long_name="sea surface height"                                 standard_name="sea_surface_height_above_geoid"             unit="m" /> 
    5772        <field id="ssh2"         long_name="square of sea surface height"                       standard_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"   unit="m2" > ssh * ssh </field > 
     
    93108        <field id="topthdep"     long_name="Top of Thermocline Depth (dT = -0.2 wrt 10m)"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_temperature"                                unit="m"                         /> 
    94109        <field id="pycndep"      long_name="Pycnocline Depth (dsigma[dT=-0.2] wrt 10m)"     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
    95         <field id="BLT"          long_name="Barrier Layer Thickness"                                                                                                                          unit="m"                          > topthdep - pycndep </field> 
     110        <field id="BLT"          long_name="Barrier Layer Thickness"                                                                                                                          unit="m"   > topthdep - pycndep </field> 
    96111        <field id="tinv"         long_name="Max of vertical invertion of temperature"                                                                                                         unit="degC"                      /> 
    97112        <field id="depti"        long_name="Depth of max. vert. inv. of temperature"                                                                                                          unit="m"                         /> 
    98         <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_20C" /> 
    99         <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_28C" /> 
     113   <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"   axis_ref="iax_20C" /> 
     114        <field id="26d"          long_name="Depth of 26C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"   axis_ref="iax_26C"   /> 
     115        <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"   axis_ref="iax_28C" /> 
    100116        <field id="hc300"        long_name="Heat content 0-300m"                            standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
     117        <field id="hc700"        long_name="Heat content 0-700m"                            standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
     118        <field id="hc2000"       long_name="Heat content 0-2000m"                           standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
    101119 
    102120        <!-- variables available with diaar5 --> 
     
    321339 
    322340          <!-- available if key_oasis3 + conservative method --> 
    323           <field id="rain"          long_name="Liquid precipitation"                                     standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
     341     <field id="rain"          long_name="Liquid precipitation"                                     standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
     342          <field id="rain_ao_cea"   long_name="Liquid precipitation over ice-free ocean (cell average)"  standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
    324343          <field id="evap_ao_cea"   long_name="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"           standard_name="water_evaporation_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    325344          <field id="isnwmlt_cea"   long_name="Snow over Ice melting (cell average)"                     standard_name="surface_snow_melt_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     
    362381   </field_group> 
    363382    
     383   <!-- scalar variables --> 
     384   <field_group id="SBC_0D"  grid_ref="grid_1point" > 
     385   </field_group> 
    364386 
    365387      </field_group> <!-- SBC --> 
     
    410432       
    411433      <field_group id="grid_U"   grid_ref="grid_U_2D"> 
    412         <field id="e3u"          long_name="U-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_U_3D" /> 
    413         <field id="e3u_0"        long_name="Initial U-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_U_3D"/> 
    414         <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
    415         <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
    416         <field id="uoce_e3u"     long_name="ocean current along i-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * e3u </field> 
     434        <field id="e2u"           long_name="U-cell width in meridional direction"                   standard_name="cell_width"                  unit="m"                               /> 
     435        <field id="e3u"           long_name="U-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_U_3D" /> 
     436        <field id="e3u_0"         long_name="Initial U-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_U_3D"/> 
     437        <field id="utau"          long_name="Wind Stress along i-axis"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
     438        <field id="uoce"          long_name="ocean current along i-axis"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     439      <field id="uoce_e3u"      long_name="ocean current along i-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * e3u </field> 
     440      <field id="uoce_e3u_vsum" long_name="ocean current along i-axis * e3u summed on the vertical"  field_ref="uoce_e3u"    unit="m3/s"       grid_ref="grid_U_vsum"/> 
     441        <field id="uocetr_vsum"   long_name="ocean transport along i-axis  summed on the vertical"         field_ref="e2u"       unit="m3/s"> this * uoce_e3u_vsum  </field>  
     442 
     443        <field id="uocetr_vsum_op"    long_name="ocean current along i-axis * e3u * e2u summed on the vertical"  read_access="true"  freq_op="1mo"    field_ref="e2u"       unit="m3/s"> @uocetr_vsum </field> 
     444        <field id="uocetr_vsum_cumul" long_name="ocean current along i-axis * e3u * e2u cumulated from southwest point" freq_offset="_reset_" operation="instant" freq_op="1mo"  unit="m3/s" />  
     445        <field id="msftbarot"         long_name="ocean_barotropic_mass_streamfunction"   unit="kg s-1" > uocetr_vsum_cumul * $rau0 </field> 
     446 
     447 
    417448        <field id="ssu"          long_name="ocean surface current along i-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
    418449        <field id="sbu"          long_name="ocean bottom current along i-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     
    434465 
    435466        <!-- uoce_eiv: available EIV (ln_ldfeiv=T and ln_ldfeiv_dia=T) --> 
    436         <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"   standard_name="bolus_sea_water_x_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     467      <field id="uoce_eiv"      long_name="EIV ocean current along i-axis"                                  standard_name="bolus_sea_water_x_velocity"                     unit="m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     468        <field id="ueiv_masstr"   long_name="EIV Ocean Mass X Transport"                                      standard_name="bolus_ocean_mass_x_transport"                   unit="kg/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
     469        <field id="ueiv_heattr"   long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"                         standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="W"                         /> 
     470        <field id="ueiv_salttr"   long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"                         standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="Kg"                        /> 
     471        <field id="ueiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"                         standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="W"     grid_ref="grid_U_3D" /> 
     472        <field id="ueiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"                         standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="kg"    grid_ref="grid_U_3D" /> 
    437473 
    438474        <!-- uoce_bbl: available with ln_trabbl=T and nn_bbl_adv=1 --> 
     
    448484        <field id="utbl"         long_name="zonal current in the Losh tbl"     unit="m/s" /> 
    449485 
    450         <field id="u_masstr"      long_name="Ocean Mass X Transport"                                          standard_name="ocean_mass_x_transport"                         unit="kg/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
     486        <!-- variables available with diaar5 --> 
     487        <field id="u_masstr"      long_name="Ocean Mass X Transport"                                          standard_name="ocean_mass_x_transport"                         unit="kg/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    451488        <field id="u_masstr_vint" long_name="vertical integral of ocean eulerian mass transport along i-axis" standard_name="vertical_integral_of_ocean_mass_x_transport"    unit="kg/s"                      /> 
    452489        <field id="u_heattr"      long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"                      standard_name="ocean_heat_x_transport"                         unit="W"                         /> 
     
    454491        <field id="uadv_heattr"   long_name="ocean advective heat transport along i-axis"                     standard_name="advectice_ocean_heat_x_transport"               unit="W"                         /> 
    455492        <field id="uadv_salttr"   long_name="ocean advective salt transport along i-axis"                     standard_name="advectice_ocean_salt_x_transport"               unit="1e-3*kg/s"                 /> 
    456         <field id="ueiv_heattr"   long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"                         standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="W"                         /> 
    457         <field id="ueiv_salttr"   long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"                         standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="Kg"                        /> 
    458         <field id="ueiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"                         standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="W"    grid_ref="grid_U_3D" /> 
    459         <field id="ueiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"                         standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"  unit="kg"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
    460493        <field id="udiff_heattr"  long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis"                     standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"        unit="W"                         /> 
    461494        <field id="udiff_salttr"  long_name="ocean diffusion salt transport along i-axis"                     standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_diffusion"        unit="1e-3*kg/s"                 /> 
     
    465498       
    466499      <field_group id="grid_V"   grid_ref="grid_V_2D"> 
     500        <field id="e1v"          long_name="V-cell width in longitudinal direction"                 standard_name="cell_width"                  unit="m"                              /> 
    467501        <field id="e3v"          long_name="V-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_V_3D" /> 
    468502        <field id="e3v_0"        long_name="Initial V-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_V_3D" /> 
     
    489523 
    490524        <!-- voce_eiv: available EIV (ln_ldfeiv=T and ln_ldfeiv_dia=T)  --> 
    491         <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"   standard_name="bolus_sea_water_y_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     525   <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"  standard_name="bolus_sea_water_y_velocity"     unit="m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     526        <field id="veiv_masstr"  long_name="EIV Ocean Mass Y Transport"      standard_name="bolus_ocean_mass_y_transport"   unit="kg/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
     527        <field id="veiv_heattr"   long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                         /> 
     528        <field id="veiv_salttr"   long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"       standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="Kg"                        /> 
     529        <field id="veiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"    grid_ref="grid_V_3D" /> 
     530        <field id="veiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"       standard_name="ocean_salt_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     531 
    492532 
    493533        <!-- voce_bbl: available with ln_trabbl=T and nn_bbl_adv=1 --> 
     
    509549        <field id="vadv_heattr"   long_name="ocean advective heat transport along j-axis"   standard_name="advectice_ocean_heat_y_transport"                unit="W"                         /> 
    510550        <field id="vadv_salttr"   long_name="ocean advective salt transport along j-axis"   standard_name="advectice_ocean_salt_y_transport"                unit="1e-3*kg/s"                 /> 
    511         <field id="veiv_heattr"   long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                         /> 
    512         <field id="veiv_salttr"   long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"       standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="Kg"                        /> 
    513         <field id="veiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"    grid_ref="grid_V_3D" /> 
    514         <field id="veiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"       standard_name="ocean_salt_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
    515551        <field id="vdiff_heattr"  long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis"   standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"         unit="W"                         /> 
    516552        <field id="vdiff_salttr"  long_name="ocean diffusion salt transport along j-axis"   standard_name="ocean_salt_y_transport_due_to_diffusion"         unit="1e-3*kg/s"                 /> 
     
    521557      <field_group id="grid_W" grid_ref="grid_W_3D"> 
    522558        <field id="e3w"          long_name="W-cell thickness"                              standard_name="cell_thickness"                         unit="m"    /> 
    523         <field id="woce"         long_name="ocean vertical velocity"                       standard_name="upward_sea_water_velocity"              unit="m/s"  /> 
     559   <field id="woce"         long_name="ocean vertical velocity"                       standard_name="upward_sea_water_velocity"              unit="m/s"  /> 
     560   <field id="woce_e3w"     long_name="ocean vertical velocity * e3w"                                                                        unit="m2/s"  > woce * e3w </field>   
    524561        <field id="wocetr_eff"   long_name="effective ocean vertical transport"                                                                   unit="m3/s" /> 
    525562 
    526563        <!-- woce_eiv: available with EIV  (ln_ldfeiv=T and ln_ldfeiv_dia=T)  --> 
    527564        <field id="woce_eiv"     long_name="EIV ocean vertical velocity"                    standard_name="bolus_upward_sea_water_velocity"       unit="m/s"  /> 
    528  
    529         <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"                      standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     565        <field id="weiv_masstr"  long_name="EIV Upward Ocean Mass Transport"  standard_name="bolus_upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
     566        <field id="weiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport"    standard_name="ocean_heat_z_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"    /> 
     567        <field id="weiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport"    standard_name="ocean_salt_z_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   /> 
     568 
     569   <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"                      standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     570        <field id="avt_e3w"      long_name="vertical heat diffusivity * e3w"                unit="m3/s" > avt * e3w </field>      
    530571        <field id="logavt"       long_name="logarithm of vertical eddy diffusivity"         standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
    531572        <field id="avm"          long_name="vertical eddy viscosity"                        standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"   unit="m2/s" /> 
     573        <field id="avm_e3w"      long_name="vertical eddy viscosity * e3w"   unit="m3/s" > avm * e3w </field>  
    532574 
    533575        <!-- avs: /= avt with ln_zdfddm=T --> 
    534576        <field id="avs"          long_name="salt vertical eddy diffusivity"                 standard_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
    535         <field id="logavs"       long_name="logarithm of salt vertical eddy diffusivity"    standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     577        <field id="avs_e3w"      long_name="vertical salt diffusivity * e3w"   unit="m3/s" > avs * e3w </field>  
     578   <field id="logavs"       long_name="logarithm of salt vertical eddy diffusivity"    standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
    536579 
    537580        <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
    538581        <field id="avt_evd"      long_name="convective enhancement of vertical diffusivity" standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_convection"     unit="m2/s" /> 
    539         <field id="avm_evd"      long_name="convective enhancement of vertical viscosity"   standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_convection"   unit="m2/s" /> 
     582        <field id="avt_evd_e3w"  long_name="convective enhancement to vertical diffusivity * e3w "    unit="m3/s" > avt_evd * e3w </field>  
     583   <field id="avm_evd"      long_name="convective enhancement of vertical viscosity"   standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_convection"   unit="m2/s" /> 
    540584 
    541585        <!-- avt_tide: available with ln_zdfiwm=T --> 
     
    568612        <field id="masstot"    long_name="global total mass"                            standard_name="sea_water_mass"                                 unit="kg"   /> 
    569613        <field id="temptot"    long_name="global mean temperature"                      standard_name="sea_water_potential_temperature"                unit="degC" /> 
    570         <field id="saltot"     long_name="global mean salinity"                         standard_name="sea_water_salinity"                             unit="1e-3" /> 
    571         <field id="fram_trans" long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait"   standard_name="sea_ice_transport_across_line"                  unit="kg/s" /> 
     614   <field id="saltot"     long_name="global mean salinity"                         standard_name="sea_water_salinity"                             unit="1e-3" /> 
     615        <field id="ssttot"     long_name="global mean sea surface temperature"          standard_name="sea_water_conservative_temperature"             unit="degC" /> 
     616         <!-- EOS = TEOS-10 --> 
     617        <field id="temptot_pot" long_name="global mean potential temperature"            standard_name="sea_water_potential_temperature"               unit="degC" /> 
    572618 
    573619         <!-- available with ln_diahsb --> 
     
    586632        <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface (linssh true)"                                                                          unit="1e-3"     /> 
    587633      </field_group> 
    588        
    589       <!-- variables available with ln_floats --> 
     634 
     635 
     636      <!-- transects --> 
     637      <field_group id="oce_straits"> 
     638         <field id="uoce_e3u_ave"         long_name="Monthly average of u*e3u"                        field_ref="uoce_e3u"                    freq_op="1mo"   freq_offset="_reset_" > @uoce_e3u </field> 
     639         <field id="uoce_e3u_ave_vsum"    long_name="Vertical sum of u*e3u"                           field_ref="uoce_e3u_ave"         grid_ref="grid_U_vsum"     /> 
     640         <field id="uocetr_vsum_section"  long_name="Total 2D transport in i-direction"               field_ref="uoce_e3u_ave_vsum"    grid_ref="grid_U_scalar"  detect_missing_value="true"> this * e2u </field> 
     641         <field id="uocetr_strait"        long_name="Total transport across lines in i-direction"     field_ref="uocetr_vsum_section"  grid_ref="grid_U_4strait" /> 
     642         <field id="u_masstr_strait"      long_name="Sea water transport across line in i-direction"  field_ref="uocetr_strait"        grid_ref="grid_U_4strait_hsum" unit="kg/s"> this * maskMFO_u * $rau0 </field> 
     643 
     644         <field id="voce_e3v_ave"         long_name="Monthly average of v*e3v"                        field_ref="voce_e3v"                    freq_op="1mo"   freq_offset="_reset_" > @voce_e3v </field> 
     645         <field id="voce_e3v_ave_vsum"    long_name="Vertical sum of v*e3v"                           field_ref="voce_e3v_ave"         grid_ref="grid_V_vsum"      /> 
     646         <field id="vocetr_vsum_section"  long_name="Total 2D transport of in j-direction"            field_ref="voce_e3v_ave_vsum"    grid_ref="grid_V_scalar"  detect_missing_value="true"> this * e1v </field> 
     647         <field id="vocetr_strait"        long_name="Total transport across lines in j-direction"     field_ref="vocetr_vsum_section"  grid_ref="grid_V_4strait"  /> 
     648         <field id="v_masstr_strait"      long_name="Sea water transport across line in j-direction"  field_ref="vocetr_strait"        grid_ref="grid_V_4strait_hsum" unit="kg/s"> this * maskMFO_v * $rau0 </field> 
     649 
     650         <field id="masstr_strait"        long_name="Sea water transport across line"                                                  grid_ref="grid_4strait"  > u_masstr_strait + v_masstr_strait </field> 
     651      </field_group> 
     652 
     653       
     654      <!-- variables available with key_float --> 
    590655 
    591656      <field_group id="floatvar" grid_ref="grid_T_nfloat"  operation="instant" > 
     
    621686      <!-- Poleward transport : ptr -->      
    622687      <field_group id="diaptr" >   
    623         <field id="zomsfglo"          long_name="Meridional Stream-Function: Global"           unit="Sv"        grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    624         <field id="zomsfatl"          long_name="Meridional Stream-Function: Atlantic"         unit="Sv"        grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    625         <field id="zomsfpac"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific"          unit="Sv"        grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    626         <field id="zomsfind"          long_name="Meridional Stream-Function: Indian"           unit="Sv"        grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    627         <field id="zomsfipc"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific+Indian"   unit="Sv"        grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    628         <field id="zotemglo"          long_name="Zonal Mean Temperature : Global"              unit="degree_C"  grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    629         <field id="zotematl"          long_name="Zonal Mean Temperature : Atlantic"            unit="degree_C"  grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    630         <field id="zotempac"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific"             unit="degree_C"  grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    631         <field id="zotemind"          long_name="Zonal Mean Temperature : Indian"              unit="degree_C"  grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    632         <field id="zotemipc"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific+Indian"      unit="degree_C"  grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    633         <field id="zosalglo"          long_name="Zonal Mean Salinity : Global"                 unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    634         <field id="zosalatl"          long_name="Zonal Mean Salinity : Atlantic"               unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    635         <field id="zosalpac"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific"                unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    636         <field id="zosalind"          long_name="Zonal Mean Salinity : Indian"                 unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    637         <field id="zosalipc"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific+Indian"         unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    638         <field id="zosrfglo"          long_name="Zonal Mean Surface"                           unit="m2"        grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    639         <field id="zosrfatl"          long_name="Zonal Mean Surface : Atlantic"                unit="m2"        grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    640         <field id="zosrfpac"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific"                 unit="m2"        grid_ref="gznl_T_3D" /> 
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     702        <field id="sophteiv"      long_name="Heat Transport from mesoscale eddy advection: All basins"     unit="PW"         grid_ref="grid_znl_T_2D" /> 
     703        <field id="sopsteiv"      long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection : All basins"    unit="Giga g/s"   grid_ref="grid_znl_T_2D" /> 
     704   <field id="sopstadv"      long_name="Advective Salt Transport"                                     unit="Giga g/s"   grid_ref="grid_znl_T_2D" /> 
     705        <field id="sophtgyre"     long_name="Overturning heat transport due to gyre" field_ref="sophtove"  unit="W"          grid_ref="grid_znl_T_2D" > sophtvtr - sophtove  </field> 
     706   <field id="sopstgyre"     long_name="Overturning salt transport due to gyre" field_ref="sopstove"  unit="kg/s"       grid_ref="grid_znl_T_2D" > sophtvtr - sopstove  </field> 
     707       </field_group> 
     708 
     709       <field_group id="constant_fields"  grid_ref="grid_T_2D"  operation="once" > 
     710         <field id="bathy"       long_name="Sea floor depth below geoid"               standard_name="sea_floor_depth_below_geoid"               unit="m"/> 
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     712         <field id="hfgeou"      long_name="Upward geothermal heat flux at sea floor"  standard_name="upward_geothermal_heat_flux_at_sea_floor"  unit="W/m2"/> 
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     714       </field_group> 
     715 
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    724746     <field id="ttrd_totad"    long_name="temperature-trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="degC/s"                        /> 
    725747     <field id="strd_totad"    long_name="salinity   -trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="1e-3/s"                        /> 
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    727      <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (linssh true)"                                                                                unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     748     <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (linssh true)"                                                                           unit="degC/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     749     <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (linssh true)"                                                                           unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
    728750     <field id="ttrd_ldf"      long_name="temperature-trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_horizontal_mixing"   unit="degC/s"                        /> 
    729751     <field id="strd_ldf"      long_name="salinity   -trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_horizontal_mixing"      unit="1e-3/s"                        /> 
     
    782804     <field id="ttrd_npc_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_npc * e3t </field> 
    783805     <field id="strd_npc_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_npc * e3t </field> 
    784      <field id="ttrd_qns_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_qns * e3t_surf </field> 
    785      <field id="strd_cdt_e3t"      unit="degC/s * m"  >  strd_cdt * e3t_surf </field> 
     806     <field id="ttrd_qns_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_qns * e3ts </field> 
     807     <field id="strd_cdt_e3t"      unit="degC/s * m"  >  strd_cdt * e3ts </field> 
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    787809     <field id="ttrd_bbc_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_bbc * e3t </field> 
     
    9851007    <field_group id="groupU" > 
    9861008      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    987       <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    9881009      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    9891010    </field_group> 
     
    9911012    <field_group id="groupV" > 
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    9941014      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
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    6666       <field id="NO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     
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     101       <field id="PCHL"         long_name="Picophytoplankton Chl biomass"            unit="gChl/m3" /> 
    102102       <field id="PCHL_e3t"     long_name="PCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PCHL * e3t </field > 
    103103 
     
    230230       <field id="Kg"          long_name="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                   /> 
    231231       <field id="Dpco2"       long_name="Delta CO2"                               unit="uatm"                            /> 
     232       <field id="pCO2sea"     long_name="surface ocean pCO2"                      unit="uatm"                            /> 
    232233       <field id="Dpo2"        long_name="Delta O2"                                unit="uatm"                            /> 
    233234       <field id="Heup"        long_name="Euphotic layer depth"                    unit="m"                               /> 
     235       <field id="AtmCo2"      long_name="Atmospheric CO2 concentration"           unit="ppm"                               /> 
    234236       <field id="Irondep"     long_name="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                        /> 
    235237       <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    236       <field id="FESCAV"      long_name="Scavenging of Iron"                      unit="mmol-Fe/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     238       <field id="FESCAV"      long_name="Scavenging of Iron"                      unit="mmol-Fe/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    237239       <field id="FECOLL"      long_name="Colloidal Pumping of FeL"                unit="mmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    238240       <field id="LGWCOLL"     long_name="Coagulation loss of ligands"             unit="mmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     
    249251       <field id="FEZOO"       long_name="microzooplankton iron recycling rate"    unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    250252       <field id="FEZOO2"      long_name="mesozooplankton iron recycling rate"     unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     253 
     254       <!-- PISCES tracers trends --> 
     255       <field id="INTdtAlk"    long_name="Vertically int. of change of alkalinity"             unit="mol/m2/s"                       /> 
     256       <field id="INTdtDIC"    long_name="Vertically int. of change of dissic    "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     257       <field id="INTdtFer"    long_name="Vertically int. of change of iron      "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     258       <field id="INTdtDIN"    long_name="Vertically int. of change of nitrogen  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     259       <field id="INTdtDIP"    long_name="Vertically int. of change of phophate  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     260       <field id="INTdtSil"    long_name="Vertically int. of change of silicon   "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     261 
    251262 
    252263       <!-- dbio_T on T grid : variables available with diaar5 --> 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/grid_def_nemo.xml

    r12182 r12193  
    1  
     1<!-- 
     2============================================================================================================ 
     3= grid definition = = DO NOT CHANGE = 
     4============================================================================================================ 
     5    --> 
     6  
    27    <grid_definition>     
    38 
    49        <!--  --> 
    510       <grid id="grid_T_2D" > 
    6          <domain id="grid_T" /> 
     11         <domain domain_ref="grid_T" /> 
    712       </grid> 
    813        <!--  --> 
    914       <grid id="grid_T_ncatice" > 
    10          <domain id="grid_T" /> 
    11          <axis id="ncatice" /> 
     15         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     16         <axis axis_ref="ncatice" /> 
    1217       </grid> 
    1318        <!--  --> 
    1419       <grid id="grid_T_3D" > 
    15          <domain id="grid_T" /> 
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     20         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     21         <axis axis_ref="deptht" /> 
    1722       </grid> 
    1823        <!--  --> 
     
    2328        <!--  --> 
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    25          <domain id="grid_U" /> 
     30         <domain domain_ref="grid_U" /> 
    2631       </grid> 
    2732        <!--  --> 
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    29          <domain id="grid_U" /> 
    30          <axis id="depthu" /> 
     34         <domain domain_ref="grid_U" /> 
     35         <axis axis_ref="depthu" /> 
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    3237        <!--  --> 
    3338       <grid id="grid_V_2D" > 
    34          <domain id="grid_V" /> 
     39         <domain domain_ref="grid_V" /> 
    3540       </grid> 
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    3742       <grid id="grid_V_3D" > 
    38          <domain id="grid_V" /> 
    39          <axis id="depthv" /> 
     43         <domain domain_ref="grid_V" /> 
     44         <axis axis_ref="depthv" /> 
    4045       </grid> 
    4146        <!--  --> 
    4247       <grid id="grid_W_2D" > 
    43          <domain id="grid_W" /> 
     48         <domain domain_ref="grid_W" /> 
    4449       </grid> 
    4550        <!--  --> 
    4651       <grid id="grid_W_3D" > 
    47          <domain id="grid_W" /> 
    48          <axis id="depthw" /> 
     52         <domain domain_ref="grid_W" /> 
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     54       </grid> 
     55        <!--  --> 
     56       <grid id="grid_1point" > 
     57         <domain domain_ref="1point"/> 
    4958       </grid> 
    5059        <!--  --> 
     
    5362         <axis id="nfloat" /> 
    5463       </grid> 
     64 
     65       <!-- ABL grid definition --> 
     66       <grid id="grid_TA_2D"> 
     67         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     68       </grid> 
     69       <grid id="grid_TA_3D"> 
     70         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     71         <axis  id="ght_abl" /> 
     72       </grid> 
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     74         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     75         <axis  id="ghw_abl" /> 
     76       </grid> 
     77       <!--  --> 
     78       <grid id="grid_EqT" > 
     79         <domain domain_ref="EqT" /> 
     80       </grid> 
     81        <!--  --> 
     82 
     83 
     84       <grid id="grid_znl_T_2D"> 
     85         <domain domain_ref="gznl" /> 
     86         <axis axis_ref="basin" /> 
     87       </grid> 
     88 
     89       <grid id="grid_znl_T_3D"> 
     90         <domain domain_ref="gznl" /> 
     91         <axis axis_ref="deptht"  /> 
     92         <axis axis_ref="basin" /> 
     93       </grid> 
     94 
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     96         <domain domain_ref="gznl" /> 
     97         <axis axis_ref="depthw"  /> 
     98         <axis axis_ref="basin" /> 
     99       </grid> 
     100 
     101      <grid id="grid_ptr_T_2D"> 
     102         <domain domain_ref="ptr" /> 
     103         <axis axis_ref="basin" /> 
     104       </grid> 
     105 
     106       <grid id="grid_ptr_T_3D"> 
     107         <domain  domain_ref="ptr" /> 
     108         <axis axis_ref="deptht"  /> 
     109         <axis axis_ref="basin" /> 
     110       </grid> 
     111 
     112       <grid id="grid_ptr_W_3D"> 
     113         <domain  domain_ref="ptr" /> 
     114         <axis axis_ref="depthw"  /> 
     115         <axis axis_ref="basin" /> 
     116       </grid> 
     117 
     118       <grid id="grid_T_SFC"> 
     119         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     120         <scalar> 
     121           <extract_axis position="0" /> 
     122         </scalar> 
     123       </grid> 
     124 
     125       <grid id="grid_T_vsum"> 
     126         <domain domain_ref="grid_T"/> 
     127         <scalar> 
     128            <reduce_axis operation="sum" /> 
     129         </scalar> 
     130       </grid> 
     131 
     132       <grid id="grid_U_vsum"> 
     133         <domain domain_ref="grid_U"/> 
     134         <scalar> 
     135            <reduce_axis operation="sum" /> 
     136         </scalar> 
     137       </grid> 
     138 
     139       <grid id="grid_V_vsum"> 
     140         <domain domain_ref="grid_V"/> 
     141         <scalar> 
     142            <reduce_axis operation="sum" /> 
     143         </scalar> 
     144       </grid> 
     145 
     146       <!-- for ORCA2 grid  --> 
     147       <grid id="cumul_U"> 
     148         <axis axis_ref="cumul_U" n_glo="182" > 
     149           <reduce_domain local="true" operation="sum" direction="jDir" /> 
     150           <reduce_axis operation="sum" /> 
     151         </axis> 
     152         <axis axis_ref="depthu" /> 
     153       </grid> 
     154 
     155       <!-- for eORCA1 grid 
     156 
     157       <grid id="cumul_U"> 
     158         <axis axis_ref="cumul_U" n_glo="362" > 
     159           <reduce_domain local="true" operation="sum" direction="jDir" /> 
     160           <reduce_axis operation="sum" /> 
     161         </axis> 
     162         <axis axis_ref="depthu" /> 
     163       </grid> 
     164 
     165      --> 
     166 
     167 
     168       <grid id="grid_T_zoom_300"> 
     169         <domain domain_ref="grid_T" /> 
     170         <axis axis_ref="deptht300" /> 
     171       </grid> 
     172 
     173       <grid id="grid_U_scalar" > 
     174         <domain domain_ref="grid_U" /> 
     175         <scalar/> 
     176       </grid> 
     177 
     178       <grid id="grid_V_scalar" > 
     179         <domain domain_ref="grid_V" /> 
     180         <scalar/> 
     181       </grid> 
     182  
     183       <grid id="grid_U_4strait"> 
     184         <domain domain_ref="grid_U" /> 
     185         <axis axis_ref="section"> 
     186           <duplicate_scalar/> 
     187         </axis> 
     188       </grid> 
     189  
     190       <grid id="grid_V_4strait"> 
     191         <domain domain_ref="grid_V" /> 
     192         <axis axis_ref="section"> 
     193           <duplicate_scalar/> 
     194         </axis> 
     195       </grid> 
     196  
     197       <grid id="grid_U_4strait_hsum"> 
     198         <scalar > 
     199           <reduce_domain operation="sum" local="true"/> 
     200           <reduce_scalar operation="sum" /> 
     201         </scalar> 
     202         <axis axis_ref="section"/> 
     203       </grid> 
     204  
     205       <grid id="grid_V_4strait_hsum"> 
     206         <scalar > 
     207           <reduce_domain operation="sum" local="true"/> 
     208           <reduce_scalar operation="sum" /> 
     209         </scalar> 
     210         <axis axis_ref="section"/> 
     211       </grid> 
     212  
     213       <grid id="grid_4strait"> 
     214         <axis axis_ref="section"/> 
     215       </grid> 
     216 
     217      <grid id="grid_U_4strait_ice"> 
     218        <domain domain_ref="grid_U" /> 
     219        <axis axis_ref="section_ice"> 
     220          <duplicate_scalar/> 
     221        </axis> 
     222      </grid> 
     223 
     224      <grid id="grid_V_4strait_ice"> 
     225        <domain domain_ref="grid_V" /> 
     226        <axis axis_ref="section_ice"> 
     227         <duplicate_scalar/> 
     228        </axis> 
     229      </grid> 
     230 
     231      <grid id="grid_U_4strait_ice_hsum"> 
     232        <scalar > 
     233         <reduce_domain operation="sum" local="true"/> 
     234         <reduce_scalar operation="sum" /> 
     235        </scalar> 
     236        <axis axis_ref="section_ice"/> 
     237      </grid> 
     238 
     239     <grid id="grid_V_4strait_ice_hsum"> 
     240        <scalar > 
     241         <reduce_domain operation="sum" local="true"/> 
     242         <reduce_scalar operation="sum" /> 
     243        </scalar> 
     244        <axis axis_ref="section_ice"/> 
     245     </grid> 
     246 
     247     <grid id="grid_4strait_ice"> 
     248       <axis axis_ref="section_ice"/> 
     249     </grid> 
     250  
    55251      <!-- scalars --> 
    56252      <grid id="grid_scalar" > 
    57253        <scalar/> 
    58254      </grid> 
    59  
    60        <!-- ABL grid definition --> 
    61        <grid id="grid_TA_2D"> 
    62          <domain domain_ref="grid_T" /> 
    63        </grid> 
    64        <grid id="grid_TA_3D"> 
    65          <domain domain_ref="grid_T" /> 
    66          <axis  id="ght_abl" /> 
    67        </grid> 
    68        <grid id="grid_WA_3D"> 
    69          <domain domain_ref="grid_T" /> 
    70          <axis  id="ghw_abl" /> 
    71        </grid> 
    72        <!--  --> 
    73  
    74     </grid_definition> 
    75      
     255  
     256    </grid_definition>    
     257  
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref

    r11536 r12193  
    3434!              !  file name   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    3535!              !              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    36    sn_patm     = 'presatm'    ,     -1.           , 'patm'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    37    sn_atmco2   = 'presatmco2' ,     -1.           , 'xco2'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     36   sn_patm     = 'presatm'    ,     -1            , 'patm'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     37   sn_atmco2   = 'presatmco2' ,     -1            , 'xco2'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    3838   cn_dir      = './'     !  root directory for the location of the dynamical files 
    3939! 
     
    141141!              !  file name       ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    142142!              !                  !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    143    sn_par      = 'par.orca'       ,     24.           , 'fr_par'  ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     143   sn_par      = 'par.orca'       ,     24            , 'fr_par'  ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    144144   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    145145   ln_varpar   =  .true.   ! boolean for PAR variable 
     
    343343/ 
    344344!----------------------------------------------------------------------- 
    345 &nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     345&nampisbc     !   parameters for inputs deposition 
    346346!----------------------------------------------------------------------- 
    347347!              !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    348348!              !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    349    sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1.           , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    350    sn_solub    = 'solubility.orca' ,    -12.           , 'solubility1' ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    351    sn_riverdic = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    352    sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    353    sn_riverdin = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    354    sn_riverdon = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdon'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    355    sn_riverdip = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    356    sn_riverdop = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdop'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    357    sn_riverdsi = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    358    sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12.           , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    359    sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12.           , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    360    sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12.           , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     349   sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     350   sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12            , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     351   sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12            , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    361352! 
    362353   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    363    ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    364    ln_solub    =  .true.   ! boolean for variable solubility of atm. Iron 
    365    ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
    366    ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    367354   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
    368355   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     
    370357   sedfeinput  =  2.e-9    ! Coastal release of Iron 
    371358   distcoast   =  5.e3     ! Distance off the coast for Iron from sediments 
    372    dustsolub   =  0.02     ! Solubility of the dusta 
    373359   mfrac       =  0.035    ! Fe mineral fraction of dust 
    374360   wdust       =  2.0      ! Dust sinking speed  
    375361   icefeinput  =  15.e-9   ! Iron concentration in sea ice 
     362   hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
     363!                          ! ln_ligand 
     364   lgw_rath    =  0.5      ! Weak ligand ratio from sed hydro sources  
     365/ 
     366!----------------------------------------------------------------------- 
     367&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
    376369   nitrfix     =  1.e-7    ! Nitrogen fixation rate 
    377370   diazolight  =  50.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2) 
    378371   concfediaz  =  1.e-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron 
    379    hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
    380 !                          ! ln_ligand 
    381    lgw_rath    =  0.5      ! Weak ligand ratio from sed hydro sources  
    382372/ 
    383373!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/namelist_ref

    r12182 r12193  
    437437      ln_sssr_bnd =  .true.   !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    438438      rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     439      nn_sssr_ice =   1       ! control of sea surface restoring under sea-ice 
     440                              ! 0 = no restoration under ice : * (1-icefrac) 
     441                              ! 1 = restoration everywhere  
     442                              ! >1 = enhanced restoration under ice : 1+(nn_icedmp-1)*icefrac 
    439443 
    440444   cn_dir      = './'      !  root directory for the SST/SSS data location 
     
    12151219!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    12161220!!gm 
    1217 !----------------------------------------------------------------------- 
    1218 &namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                        (default: OFF) 
    1219 !----------------------------------------------------------------------- 
    1220    ln_diaptr   = .false.   !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    1221    ln_subbas   = .false.   !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    12221221/ 
    12231222!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SHARED/namelist_top_ref

    r11949 r12193  
    4040   ln_trcdmp     =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    4141   ln_trcdmp_clo =  .false.  !  damping term (T) or not (F) on closed seas 
     42   ln_trcbc      =  .false.  !  Surface, Lateral or Open Boundaries conditions 
    4243   ! 
    4344   jp_dia3d      = 0         ! Number of 3D diagnostic variables 
     
    134135   cn_dir_obc    =  './'     !  root directory for the location of OPEN data files 
    135136   ln_rnf_ctl    = .false.   !  Remove runoff dilution on tracers with absent river load 
    136    rn_bc_time    =  86400.   !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     137   rn_sbc_time   =  86400.   !  Time scaling factor for SBC data (seconds in a day) 
     138   rn_cbc_time   =  86400.   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a day) 
    137139/ 
    138140!---------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/cfgs/SPITZ12/EXPREF/context_nemo.xml

    r9930 r12193  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    1922    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     
    2326    <file_definition src="./file_def_nemo-oce.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics      --> 
    2427    <file_definition src="./file_def_nemo-ice.xml"/>     <!--  NEMO sea-ice model       --> 
    25     <!--  
    26 ============================================================================================================ 
    27 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    28 ============================================================================================================ 
    29     --> 
    30      
    31     <axis_definition> 
    32       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
    36       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="-"                 /> 
    37       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
    38       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
    39       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    40       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    41     </axis_definition> 
     28 
     29 
     30<!-- Axis definition --> 
     31    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4232  
     33<!-- Domain definition --> 
    4334    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     35 
     36<!-- Grids definition --> 
     37    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4438   
    45     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4639 
    4740</context> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.