Changeset 12348


Ignore:
Timestamp:
2020-01-28T17:16:19+01:00 (9 months ago)
Author:
aumont
Message:

update of the pisces reference namelist

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2019/dev_r11708_aumont_PISCES_QUOTA/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref

    r11536 r12348  
    5656   lthet      =  1.0      ! Proportional loss of ligands due to Fe uptake  
    5757!                         !  ln_p5z enabled 
    58    no3rat3    =  0.182    ! N/C ratio in zooplankton 
    59    po4rat3    =  0.0094   ! P/C ratio in zooplankton 
     58   no3rat3    =  0.151    ! N/C ratio in zooplankton 
     59   po4rat3    =  0.00943  ! P/C ratio in zooplankton 
    6060/ 
    6161!----------------------------------------------------------------------- 
     
    7575   xsizern    =  3.0      ! Size ratio for nanophytoplankton 
    7676   xsizerd    =  3.0      ! Size ratio for diatoms 
    77    xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
     77   xksi1      =  4.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    7878   xksi2      =  20E-6    ! half saturation constant for Si/C 
    7979   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
     
    8787!----------------------------------------------------------------------- 
    8888   concnno3   =  3e-6     ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    89    concpno3   =  1e-6 
    90    concdno3   =  4E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
    91    concnnh4   =  1.5E-6   ! NH4 half saturation for phyto 
    92    concpnh4   =  4E-7 
    93    concdnh4   =  2E-6     ! NH4 half saturation for diatoms 
     89   concpno3   =  8e-7 
     90   concdno3   =  5E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
     91   concnnh4   =  1E-6     ! NH4 half saturation for phyto 
     92   concpnh4   =  2.3E-7 
     93   concdnh4   =  1.7E-6   ! NH4 half saturation for diatoms 
    9494   concnpo4   =  3E-6     ! PO4 half saturation for phyto 
    95    concppo4   =  1.5E-6 
    96    concdpo4   =  4E-6     ! PO4 half saturation for diatoms 
     95   concppo4   =  8E-7 
     96   concdpo4   =  5E-6     ! PO4 half saturation for diatoms 
    9797   concnfer   =  3E-9   ! Iron half saturation for phyto 
    98    concpfer   =  1.5E-9 
    99    concdfer   =  4E-9   ! Iron half saturation for diatoms 
     98   concpfer   =  8E-10 
     99   concdfer   =  5E-9   ! Iron half saturation for diatoms 
    100100   concbfe    =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    101101   concbnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
     
    104104   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    105105   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
    106    xsizepic   =  1.E-6 
    107    xsizern    =  1.0      ! Size ratio for nanophytoplankton 
    108    xsizerp    =  1.0 
     106   xsizepic   =  5.E-7    ! Minimum size criteria for picophyto 
     107   xsizern    =  3.0      ! Size ratio for nanophytoplankton 
     108   xsizerp    =  2.0      ! Size ratio for picophytoplankton 
    109109   xsizerd    =  4.0      ! Size ratio for diatoms 
    110    xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
     110   xksi1      =  8.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    111111   xksi2      =  20E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    112112   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    113    caco3r     =  0.35     ! mean rain ratio 
     113   caco3r     =  0.5      ! mean rain ratio 
    114114   oxymin     =  1.E-6    ! Half-saturation constant for anoxia 
    115115/ 
     
    120120   qfpopt     =  7.E-6    ! Optimal Fe quota of picophyto 
    121121   qfdopt     =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
    122    qnnmin     =  0.29     ! Minimal N quota for nano 
    123    qnnmax     =  1.39     ! Maximal N quota for nano 
    124    qpnmin     =  0.28     ! Minimal P quota for nano 
    125    qpnmax     =  1.06     ! Maximal P quota for nano 
    126    qnpmin     =  0.42     ! Minimal N quota for pico 
    127    qnpmax     =  1.39     ! Maximal N quota for pico 
    128    qppmin     =  0.25     ! Minimal P quota for pico 
    129    qppmax     =  0.7      ! Maximal P quota for pico 
    130    qndmin     =  0.25     ! Minimal N quota for diatoms 
    131    qndmax     =  1.39     ! Maximal N quota for diatoms 
    132    qpdmin     =  0.29     ! Minimal P quota for diatoms 
    133    qpdmax     =  1.32     ! Maximal P quota for diatoms 
    134    qfnmax     =  40E-6    ! Maximal Fe quota for nano 
    135    qfpmax     =  40E-6    ! Maximal Fe quota for pico 
    136    qfdmax     =  40E-6    ! Maximal Fe quota for diatoms 
     122   qnnmin     =  0.61     ! Minimal N quota for nano 
     123   qnnmax     =  1.25     ! Maximal N quota for nano 
     124   qpnmin     =  0.24     ! Minimal P quota for nano 
     125   qpnmax     =  1.35     ! Maximal P quota for nano 
     126   qnpmin     =  1.04     ! Minimal N quota for pico 
     127   qnpmax     =  1.525    ! Maximal N quota for pico 
     128   qppmin     =  0.19     ! Minimal P quota for pico 
     129   qppmax     =  1.15     ! Maximal P quota for pico 
     130   qndmin     =  0.53     ! Minimal N quota for diatoms 
     131   qndmax     =  1.25     ! Maximal N quota for diatoms 
     132   qpdmin     =  0.24     ! Minimal P quota for diatoms 
     133   qpdmax     =  1.525    ! Maximal P quota for diatoms 
     134   qfnmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for nano 
     135   qfpmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for pico 
     136   qfdmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for diatoms 
    137137/ 
    138138!----------------------------------------------------------------------- 
     
    160160   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
    161161   fecdm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms 
    162    grosip     =  0.159    ! mean Si/C ratio 
     162   grosip     =  0.13     ! mean Si/C ratio 
    163163/ 
    164164!----------------------------------------------------------------------- 
    165165&namp5zprod    !   parameters for phytoplankton growth for PISCES quota- ln_p5z 
    166166!----------------------------------------------------------------------- 
    167    pislopen   =  3.       ! P-I slope 
    168    pislopep   =  3.       ! P-I slope for picophytoplankton 
    169    pisloped   =  3.       ! P-I slope  for diatoms 
     167   pislopen   =  4.       ! P-I slope of nanophytoplankton 
     168   pislopep   =  4.       ! P-I slope for picophytoplankton 
     169   pisloped   =  4.       ! P-I slope  for diatoms 
    170170   excretn    =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
    171171   excretp    =  0.05     ! excretion ratio of picophytoplankton 
     
    173173   xadap      =  0.       ! Adaptation factor to low light 
    174174   bresp      =  0.02     ! Basal respiration rate 
    175    thetannm   =  0.25     ! Maximum Chl/N in nanophytoplankton 
    176    thetanpm   =  0.25     ! Maximum Chl/N in picophytoplankton 
    177    thetandm   =  0.3      ! Maximum Chl/N in diatoms 
     175   thetannm   =  0.3      ! Maximum Chl/N in nanophytoplankton 
     176   thetanpm   =  0.3      ! Maximum Chl/N in picophytoplankton 
     177   thetandm   =  0.4      ! Maximum Chl/N in diatoms 
    178178   chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    179    grosip     =  0.131    ! mean Si/C ratio 
     179   grosip     =  0.11     ! mean Si/C ratio 
    180180/ 
    181181!----------------------------------------------------------------------- 
     
    194194   wchlp      =  0.01     ! quadratic mortality of picophytoplankton 
    195195   wchld      =  0.01     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    196    wchldm     =  0.02     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
     196   wchldm     =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    197197   mpratn     =  0.01     ! nanophytoplankton mortality rate 
    198198   mpratp     =  0.01     ! picophytoplankton mortality rate 
    199    mprat2     =  0.01     ! Diatoms mortality rate 
     199   mpratd     =  0.01     ! Diatoms mortality rate 
    200200/ 
    201201!----------------------------------------------------------------------- 
     
    226226!----------------------------------------------------------------------- 
    227227   part2      =  0.75     ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts 
    228    grazrat2   =  0.85     ! maximal mesozoo grazing rate 
     228   grazrat2   =  0.75     ! maximal mesozoo grazing rate 
    229229   bmetexc2   =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon  
    230230   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    231    mzrat2     =  0.02     ! mesozooplankton mortality rate 
     231   mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate 
    232232   xpref2d    =  1.       ! zoo preference for phyto 
    233    xpref2p    =  1.       ! zoo preference for POC 
     233   xpref2n    =  0.3      ! zoo preference for nano 
    234234   xpref2z    =  1.       ! zoo preference for zoo 
    235    xpref2m    =  0.2      ! meso preference for zoo 
     235   xpref2m    =  0.1      ! meso preference for zoo 
    236236   xpref2c    =  0.3      ! zoo preference for poc 
    237237   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton 
     
    243243   xkgraz2     =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
    244244   epsher2     =  0.5      ! Efficicency of Mesozoo growth 
    245    epsher2min  =  0.2     ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
     245   epsher2min  =  0.5     ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
    246246   ssigma2     =  0.5     ! Fraction excreted as semi-labile DOM 
    247247   srespir2    =  0.2     ! Active respiration 
     
    275275!----------------------------------------------------------------------- 
    276276   part       =  0.5      ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa 
    277    grazrat    =  2.75     ! maximal zoo grazing rate 
     277   grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate 
    278278   bmetexc    =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon 
    279279   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    280    mzrat      =  0.005    ! zooplankton mortality rate 
     280   mzrat      =  0.004    ! zooplankton mortality rate 
    281281   xprefc     =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
    282    xprefn     =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto 
    283    xprefp     =  1.6      ! Microzoo preference for picophyto 
    284    xprefd     =  1.0      ! Microzoo preference for Diatoms 
    285    xprefz     =  0.3      ! Microzoo preference for microzooplankton 
     282   xprefn     =  1.0      ! Microzoo preference for Nanophyto 
     283   xprefp     =  1.0      ! Microzoo preference for picophyto 
     284   xprefd     =  0.8      ! Microzoo preference for Diatoms 
     285   xprefz     =  0.1      ! Microzoo preference for microzooplankton 
    286286   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton 
    287287   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton 
     
    292292   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
    293293   epsher     =  0.5      ! Efficiency of microzoo growth 
    294    epshermin  =  0.2      ! Minimum efficiency of microzoo growth 
     294   epshermin  =  0.5      ! Minimum efficiency of microzoo growth 
    295295   ssigma     =  0.5      ! Fraction excreted as semi-labile DOM 
    296296   srespir    =  0.2      ! Active respiration 
     
    320320!                         ! ln_p5z 
    321321   xremikc   =  0.25      ! remineralization rate of DOC 
    322    xremikn   =  0.35      ! remineralization rate of DON 
     322   xremikn   =  0.3       ! remineralization rate of DON 
    323323   xremikp   =  0.4       ! remineralization rate of DOP 
    324 !   feratb    =  20E-6     ! Bacterial Fe/C ratio 
     324!   feratb    =  40E-6     ! Bacterial Fe/C ratio 
    325325!   xkferb    =  3E-10     ! Half-saturation constant for bact. Fe/C 
    326326/ 
     
    332332   rshape    =  1.0       ! Shape of the gamma function 
    333333!                         ! ln_p5z 
    334    xremipc   =  0.02      ! remineralisation rate of POC 
    335    xremipn   =  0.025     ! remineralisation rate of PON 
    336    xremipp   =  0.03      ! remineralisation rate of POP 
     334   xremipc   =  0.028     ! remineralisation rate of POC 
     335   xremipn   =  0.03      ! remineralisation rate of PON 
     336   xremipp   =  0.035     ! remineralisation rate of POP 
    337337/ 
    338338!----------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.