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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 12377 for NEMO/trunk/tests/ISOMIP/EXPREF – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2020-02-12T15:39:06+01:00 (4 years ago)
Author:
acc
Message:

The big one. Merging all 2019 developments from the option 1 branch back onto the trunk.

This changeset reproduces 2019/dev_r11943_MERGE_2019 on the trunk using a 2-URL merge
onto a working copy of the trunk. I.e.:

svn merge --ignore-ancestry \

​svn+ssh://acc@forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/NEMO/trunk \
​svn+ssh://acc@forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019 ./

The --ignore-ancestry flag avoids problems that may otherwise arise from the fact that
the merge history been trunk and branch may have been applied in a different order but
care has been taken before this step to ensure that all applicable fixes and updates
are present in the merge branch.

The trunk state just before this step has been branched to releases/release-4.0-HEAD
and that branch has been immediately tagged as releases/release-4.0.2. Any fixes
or additions in response to tickets on 4.0, 4.0.1 or 4.0.2 should be done on
releases/release-4.0-HEAD. From now on future 'point' releases (e.g. 4.0.2) will
remain unchanged with periodic releases as needs demand. Note release-4.0-HEAD is a
transitional naming convention. Future full releases, say 4.2, will have a release-4.2
branch which fulfills this role and the first point release (e.g. 4.2.0) will be made
immediately following the release branch creation.

2020 developments can be started from any trunk revision later than this one.

Location:
NEMO/trunk
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • NEMO/trunk

    • Property svn:externals

      •  

        old new  
        33^/utils/build/mk@HEAD         mk 
        44^/utils/tools@HEAD            tools 
        5 ^/vendors/AGRIF/dev@HEAD      ext/AGRIF 
         5^/vendors/AGRIF/dev_r11615_ENHANCE-04_namelists_as_internalfiles_agrif@HEAD      ext/AGRIF 
        66^/vendors/FCM@HEAD            ext/FCM 
        77^/vendors/IOIPSL@HEAD         ext/IOIPSL 

  • NEMO/trunk/tests/ISOMIP/EXPREF/file_def_nemo-oce.xml

    r9572 r12377  
    2727     <field field_ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    2828          <!-- variable for ice shelf --> 
    29           <field field_ref="qlatisf"      name="sohflisf"  /> 
    30           <field field_ref="fwfisf"       name="sowflisf"  /> 
     29          <field field_ref="fwfisf_cav"       name="sowflisf"  /> 
    3130          <field field_ref="isfgammat"    name="sogammat"  /> 
    3231          <field field_ref="isfgammas"    name="sogammas"  /> 

  • NEMO/trunk/tests/ISOMIP/EXPREF/namelist_cfg

    r12206 r12377  
    4646   rn_rdt      = 1800.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    4747/ 
     48!----------------------------------------------------------------------- 
     49&namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: use namusr_def in namelist_cfg) 
     50!----------------------------------------------------------------------- 
     51/ 
     52!----------------------------------------------------------------------- 
     53&namtsd        !    Temperature & Salinity Data  (init/dmp)             (default: OFF) 
     54!----------------------------------------------------------------------- 
     55    
     56/ 
     57!----------------------------------------------------------------------- 
     58&namwad        !   Wetting and Drying (WaD)                             (default: OFF) 
     59!----------------------------------------------------------------------- 
     60/ 
     61!----------------------------------------------------------------------- 
     62&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              (ln_crs =T) 
     63!----------------------------------------------------------------------- 
     64/ 
     65!----------------------------------------------------------------------- 
     66&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d" default: PAPA station) 
     67!----------------------------------------------------------------------- 
     68/ 
     69!----------------------------------------------------------------------- 
     70&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d" default: OFF) 
     71!----------------------------------------------------------------------- 
     72/ 
     73!----------------------------------------------------------------------- 
     74&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d" default: OFF) 
     75!----------------------------------------------------------------------- 
     76 
     77/ 
     78 
    4879!!====================================================================== 
    4980!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  ***          !! 
    … …  
    5990!!   namsbc_rnf      river runoffs                                      (ln_rnf     =T) 
    6091!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure                               (ln_apr_dyn =T) 
    61 !!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing                         (ln_isfcav  =T : read (ln_read_cfg=T) or set or usr_def_zgr ) 
    62 !!   namsbc_iscpl    coupling option between land ice model and ocean   (ln_isfcav  =T) 
    6392!!   namsbc_wave     external fields from wave model                    (ln_wave    =T) 
    6493!!   namberg         iceberg floats                                     (ln_icebergs=T) 
    … …  
    6695! 
    6796!----------------------------------------------------------------------- 
    68 &namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    69 !----------------------------------------------------------------------- 
    70    nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation 
     97&namsbc        !   Surface Boundary Condition manager                   (default: NO selection) 
     98!----------------------------------------------------------------------- 
     99   nn_fsbc     = 1         !  frequency of SBC module call 
     100      !                    !  (control sea-ice & iceberg model call) 
    71101   ln_usr      = .true.    !  user defined formulation                  (T => check usrdef_sbc) 
    72    ln_isf      = .true.    !  ice shelf melting/freezing                (T => fill namsbc_isf) 
    73 / 
    74 !----------------------------------------------------------------------- 
    75 &namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (ln_isfcav =T : read (ln_read_cfg=T)  
    76 !-----------------------------------------------------------------------             or set or usr_def_zgr ) 
    77 !              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    78 !              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    79 ! nn_isf == 4 
    80    sn_fwfisf   = 'rnfisf'  ,         -12.      ,'sowflisf',     .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    81 ! nn_isf == 3 
    82    sn_rnfisf   = 'rnfisf'  ,         -12.      ,'sofwfisf',     .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    83 ! nn_isf == 2 and 3 
    84    sn_depmax_isf = 'rnfisf' ,        -12.      ,'sozisfmax' ,   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    85    sn_depmin_isf = 'rnfisf' ,        -12.      ,'sozisfmin' ,   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    86 ! nn_isf == 2 
    87    sn_Leff_isf = 'rnfisf'  ,         -12.      ,'Leff'    ,     .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    88 ! for all case 
    89    nn_isf      = 1         !  ice shelf melting/freezing 
    90                            !  1 = presence of ISF    2 = bg03 parametrisation  
    91                            !  3 = rnf file for isf   4 = ISF fwf specified 
    92                            !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    93 ! only for nn_isf = 1 or 2 
    94    rn_gammat0  = 1.0e-4   ! gammat coefficient used in blk formula 
    95    rn_gammas0  = 1.0e-4   ! gammas coefficient used in blk formula 
    96 ! only for nn_isf = 1 or 4 
    97    rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer    (Losh et al. 2008) 
    98                           ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
    99 ! only for nn_isf = 1 
    100    nn_isfblk   = 1        ! 1 ISOMIP  like: 2 equations formulation (Hunter et al., 2006) 
    101                           ! 2 ISOMIP+ like: 3 equations formulation (Asay-Davis et al., 2015) 
    102    nn_gammablk = 0        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s) 
    103                           ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
    104                           ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    (Holland et al. 1999) 
    105 / 
    106 !----------------------------------------------------------------------- 
    107 &namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                      
    108 !----------------------------------------------------------------------- 
    109 / 
     102/ 
     103!----------------------------------------------------------------------- 
     104&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation        (ln_flx =T) 
     105!----------------------------------------------------------------------- 
     106/ 
     107!----------------------------------------------------------------------- 
     108&namsbc_blk    !   namsbc_blk  generic Bulk formula                     (ln_blk =T) 
     109!----------------------------------------------------------------------- 
     110 
     111/ 
     112!----------------------------------------------------------------------- 
     113&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
     114!----------------------------------------------------------------------- 
     115 
     116/ 
     117!----------------------------------------------------------------------- 
     118&namsbc_sas    !   Stand-Alone Surface module: ocean data               (SAS_SRC  only) 
     119!----------------------------------------------------------------------- 
     120 
     121/ 
     122!----------------------------------------------------------------------- 
     123&namsbc_iif    !   Ice-IF : use observed ice cover                      (nn_ice = 1) 
     124!----------------------------------------------------------------------- 
     125/ 
     126!----------------------------------------------------------------------- 
     127&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr =T) 
     128!----------------------------------------------------------------------- 
     129    
     130/ 
     131!----------------------------------------------------------------------- 
     132&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr =T) 
     133!----------------------------------------------------------------------- 
     134 
     135/ 
     136!----------------------------------------------------------------------- 
     137&namsbc_rnf    !   runoffs                                              (ln_rnf =T) 
     138!----------------------------------------------------------------------- 
     139 
     140/ 
     141!----------------------------------------------------------------------- 
     142&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing           (ln_apr_dyn =T) 
     143!----------------------------------------------------------------------- 
     144 
     145/ 
     146!----------------------------------------------------------------------- 
     147&namisf       !  Top boundary layer (ISF)                               (default: OFF) 
     148!----------------------------------------------------------------------- 
     149   ! 
     150   ! ---------------- ice shelf load ------------------------------- 
     151   ! 
     152   ! 
     153   ! ---------------- ice shelf melt formulation ------------------------------- 
     154   ! 
     155   ln_isf = .true.           ! activate ice shelf module 
     156      cn_isfdir = './'           ! directory for all ice shelf input file 
     157      ! 
     158      ! ---------------- cavities opened ------------------------------- 
     159      ! 
     160      ln_isfcav_mlt = .true.    ! ice shelf melting into the cavity (need ln_isfcav = .true. in domain_cfg.nc) 
     161         cn_isfcav_mlt = '2eq'   ! ice shelf melting formulation (spe/2eq/3eq/oasis) 
     162         !                       ! spe = fwfisf is read from a forcing field 
     163         !                       ! 2eq = ISOMIP  like: 2 equations formulation (Hunter et al., 2006) 
     164         !                       ! 3eq = ISOMIP+ like: 3 equations formulation (Asay-Davis et al., 2015) 
     165         !                       ! oasis = fwfisf is given by oasis and pattern by file sn_isfcav_fwf 
     166         !              !  cn_isfcav_mlt = 2eq or 3eq cases: 
     167         cn_gammablk = 'spe'    ! scheme to compute gammat/s (spe,ad15,hj99) 
     168         !                       ! ad15 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
     169         !                       ! hj99 = velocity and stability dependent Gamma    (Holland et al. 1999) 
     170         rn_gammat0  = 1.e-4     ! gammat coefficient used in blk formula 
     171         rn_gammas0  = 1.e-4     ! gammas coefficient used in blk formula 
     172         ! 
     173         rn_htbl     =  30.      ! thickness of the top boundary layer    (Losh et al. 2008) 
     174         !                       ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
     175         ! 
     176/ 
     177!----------------------------------------------------------------------- 
     178&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     179!----------------------------------------------------------------------- 
     180/ 
     181!----------------------------------------------------------------------- 
     182&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: OFF) 
     183!----------------------------------------------------------------------- 
     184 
     185/ 
     186 
    110187!!====================================================================== 
    111188!!               ***  Lateral boundary condition  ***                 !! 
    … …  
    124201   rn_shlat    =    0.     !  free slip 
    125202/ 
     203!----------------------------------------------------------------------- 
     204&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
     205!----------------------------------------------------------------------- 
     206/ 
     207!----------------------------------------------------------------------- 
     208&nam_tide      !   tide parameters                                      (default: OFF) 
     209!----------------------------------------------------------------------- 
     210/ 
     211!----------------------------------------------------------------------- 
     212&nambdy        !  unstructured open boundaries                          (default: OFF) 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214/ 
     215!----------------------------------------------------------------------- 
     216&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       (see nam_bdy) 
     217!----------------------------------------------------------------------- 
     218 
     219/ 
     220!----------------------------------------------------------------------- 
     221&nambdy_tide   !  tidal forcing at open boundaries                      (default: OFF) 
     222!----------------------------------------------------------------------- 
     223/ 
     224 
    126225!!====================================================================== 
    127226!!                ***  Top/Bottom boundary condition  ***             !! 
    … …  
    145244/ 
    146245!----------------------------------------------------------------------- 
    147 &namdrg_top    !   TOP friction                                         (ln_isfcav=T) 
     246&namdrg_top    !   TOP friction                                         (ln_OFF =F & ln_isfcav=T) 
    148247!----------------------------------------------------------------------- 
    149248   rn_Cd0     =  2.5e-3    !  drag coefficient [-] 
    … …  
    156255/ 
    157256!----------------------------------------------------------------------- 
    158 &namdrg_bot    !   BOTTOM friction                                   
     257&namdrg_bot    !   BOTTOM friction                                      (ln_OFF =F) 
    159258!----------------------------------------------------------------------- 
    160259   rn_Cd0     =  1.e-3    !  drag coefficient [-] 
    … …  
    166265      rn_boost =  50.         !  local boost factor  [-] 
    167266/ 
     267!----------------------------------------------------------------------- 
     268&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
     269!----------------------------------------------------------------------- 
     270 
     271/ 
     272!----------------------------------------------------------------------- 
     273&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
     274!----------------------------------------------------------------------- 
     275/ 
     276 
    168277!!====================================================================== 
    169278!!                        Tracer (T-S) namelists                      !! 
    … …  
    178287! 
    179288!----------------------------------------------------------------------- 
    180 &nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: OFF) 
     289&nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: NO selection) 
    181290!----------------------------------------------------------------------- 
    182291   ln_eos80    = .true.          !  = Use EOS80 equation of state 
    … …  
    199308      rn_Ld        = 10.e+3         !  lateral diffusive length   [m] 
    200309/ 
     310!----------------------------------------------------------------------- 
     311&namtra_mle    !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper)       (default: OFF) 
     312!----------------------------------------------------------------------- 
     313/ 
     314!----------------------------------------------------------------------- 
     315&namtra_eiv    !   eddy induced velocity param.                         (default: OFF) 
     316!----------------------------------------------------------------------- 
     317/ 
     318!----------------------------------------------------------------------- 
     319&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: OFF) 
     320!----------------------------------------------------------------------- 
     321/ 
     322 
    201323!!====================================================================== 
    202324!!                      ***  Dynamics namelists  ***                  !! 
    … …  
    212334! 
    213335!----------------------------------------------------------------------- 
     336&nam_vvl       !   vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     337!----------------------------------------------------------------------- 
     338/ 
     339!----------------------------------------------------------------------- 
    214340&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
    215341!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    218344/ 
    219345!----------------------------------------------------------------------- 
    220 &namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: OFF) 
     346&namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: NO selection) 
    221347!----------------------------------------------------------------------- 
    222348   ln_dynvor_ene = .true.  !  energy conserving scheme 
    … …  
    241367      rn_Lv      = 10.e+3           !  lateral viscous length   [m] 
    242368/ 
     369!----------------------------------------------------------------------- 
     370&namdta_dyn    !   offline ocean input files                            (OFF_SRC only) 
     371!----------------------------------------------------------------------- 
     372 
     373/ 
     374 
    243375!!====================================================================== 
    244376!!                     vertical physics namelists                     !! 
    … …  
    253385! 
    254386!----------------------------------------------------------------------- 
    255 &namzdf        !   vertical physics                                     (default: NO selection) 
    256 !----------------------------------------------------------------------- 
    257    !                       ! type of vertical closure 
     387&namzdf        !   vertical physics manager                             (default: NO selection) 
     388!----------------------------------------------------------------------- 
     389   !                       ! type of vertical closure (required) 
    258390   ln_zdfcst   = .true.       !  constant mixing 
     391   ! 
     392   !                       ! convection 
    259393   ln_zdfevd   = .true.       !  enhanced vertical diffusion 
    260       nn_evdm     =    1         ! apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
    261       rn_evd      =   0.1        ! mixing coefficient [m2/s] 
     394   rn_evd      =  0.1         ! mixing coefficient [m2/s] 
     395   ! 
    262396   !                       ! coefficients 
    263    rn_avm0     =   1.e-3     !  vertical eddy viscosity   [m2/s] 
    264    rn_avt0     =   5.e-5     !  vertical eddy diffusivity [m2/s] 
    265 / 
     397   rn_avm0     =   1.e-3      !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst) 
     398   rn_avt0     =   5.e-5      !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst) 
     399/ 
     400!----------------------------------------------------------------------- 
     401&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       (ln_zdfric =T) 
     402!----------------------------------------------------------------------- 
     403/ 
     404!----------------------------------------------------------------------- 
     405&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  (ln_zdftke =T) 
     406!----------------------------------------------------------------------- 
     407/ 
     408!----------------------------------------------------------------------- 
     409&namzdf_gls    !   GLS vertical diffusion                               (ln_zdfgls =T) 
     410!----------------------------------------------------------------------- 
     411/ 
     412!----------------------------------------------------------------------- 
     413&namzdf_osm    !   OSM vertical diffusion                               (ln_zdfosm =T) 
     414!----------------------------------------------------------------------- 
     415/ 
     416!----------------------------------------------------------------------- 
     417&namzdf_iwm    !    internal wave-driven mixing parameterization        (ln_zdfiwm =T) 
     418!----------------------------------------------------------------------- 
     419/ 
     420 
    266421!!====================================================================== 
    267422!!                  ***  Diagnostics namelists  ***                   !! 
    … …  
    273428!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
    274429!!   namflo       float parameters                                      (default: OFF) 
    275 !!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               (default: OFF) 
    276430!!   nam_diadct   transports through some sections                      (default: OFF) 
    277431!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default: OFF) 
    … …  
    279433!!====================================================================== 
    280434! 
     435!----------------------------------------------------------------------- 
     436&namtrd        !   trend diagnostics                                    (default: OFF) 
     437!----------------------------------------------------------------------- 
     438/ 
     439!----------------------------------------------------------------------- 
     440&namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                        (default: OFF) 
     441!----------------------------------------------------------------------- 
     442/ 
     443!----------------------------------------------------------------------- 
     444&namhsb        !  Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
     445!----------------------------------------------------------------------- 
     446/ 
     447!----------------------------------------------------------------------- 
     448&namdiu        !   Cool skin and warm layer models                      (default: OFF) 
     449!----------------------------------------------------------------------- 
     450/ 
     451!----------------------------------------------------------------------- 
     452&namflo        !   float parameters                                     ("key_float") 
     453!----------------------------------------------------------------------- 
     454/ 
     455!----------------------------------------------------------------------- 
     456&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ("key_diaharm") 
     457!----------------------------------------------------------------------- 
     458/ 
     459!----------------------------------------------------------------------- 
     460&namdct        ! transports through some sections                       ("key_diadct") 
     461!----------------------------------------------------------------------- 
     462/ 
     463!----------------------------------------------------------------------- 
     464&nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
     465!----------------------------------------------------------------------- 
     466/ 
     467!----------------------------------------------------------------------- 
     468&nam_dia25h    !  25h Mean Output                                       (default: OFF) 
     469!----------------------------------------------------------------------- 
     470/ 
     471!----------------------------------------------------------------------- 
     472&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     473!----------------------------------------------------------------------- 
     474/ 
     475 
    281476!!====================================================================== 
    282477!!               ***  Observation & Assimilation  ***                 !! 
    … …  
    286481!!====================================================================== 
    287482! 
     483!----------------------------------------------------------------------- 
     484&namobs        !  observation usage switch                              (default: OFF) 
     485!----------------------------------------------------------------------- 
     486/ 
     487!----------------------------------------------------------------------- 
     488&nam_asminc    !   assimilation increments                              ('key_asminc') 
     489!----------------------------------------------------------------------- 
     490/ 
     491 
    288492!!====================================================================== 
    289493!!                  ***  Miscellaneous namelists  ***                 !! 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.