New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 12805 for NEMO/branches – NEMO

Changeset 12805 for NEMO/branches


Ignore:
Timestamp:
2020-04-23T11:20:03+02:00 (4 years ago)
Author:
dancopsey
Message:

Merged in NEMO_4.0.1_GO8_package

Location:
NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch
Files:
13 edited
2 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/cfgs/SHARED/field_def_nemo-oce.xml

    r12774 r12805  
    2020      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    2121        <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                    standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    22         <field id="e3ts"         long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_SFC"/> 
     22        <field id="e3t_surf"     long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_surface_extract"/> 
    2323        <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness"    unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    2424        <field id="e3tb"         long_name="bottom T-cell thickness"             standard_name="bottom_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_2D"/>  
     
    8585        <field id="mldr10_1max"  long_name="Max of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="maximum"                                                                          /> 
    8686        <field id="mldr10_1min"  long_name="Min of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="minimum"                                                                          /> 
     87         <field id="mldzint_1"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     88         <field id="mldzint_2"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     89         <field id="mldzint_3"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     90         <field id="mldzint_4"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     91         <field id="mldzint_5"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     92         <field id="mldhtc_1"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     93         <field id="mldhtc_2"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     94         <field id="mldhtc_3"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     95         <field id="mldhtc_4"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     96         <field id="mldhtc_5"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    8797        <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"                 standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    8898        <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"                                                                                                                   unit="1e-3*kg/m2" /> 
     
    394404 
    395405 
     406        <field id="uoce2_e3u"    long_name="ocean current along i-axis squared (thickness weighted)"                                            unit="m3/s2"      grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * uoce * e3u </field> 
    396407        <field id="ssu"          long_name="ocean surface current along i-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
    397408        <field id="sbu"          long_name="ocean bottom current along i-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     
    451462        <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
    452463        <field id="voce_e3v"     long_name="ocean current along j-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D"  > voce * e3v </field> 
     464        <field id="voce2_e3v"    long_name="ocean current along j-axis squared (thickness weighted)"                                            unit="m3/s2"      grid_ref="grid_V_3D"  > voce * voce * e3v </field> 
    453465        <field id="ssv"          long_name="ocean surface current along j-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
    454466        <field id="sbv"          long_name="ocean bottom current along j-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     
    549561      <field id="ahmf_2d"      long_name=" surface f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s" /> 
    550562      <field id="ahmf_3d"      long_name=" 3D      f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     563 
     564      <!-- product fields --> 
     565      <field_group id="diaprod"> 
     566   <field id="ut"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature"      unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     567        <field id="ut_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature * e3u"  unit="degree_C m2/s"   grid_ref="grid_U_3D" > ut * e3u </field > 
     568   <field id="us"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_salinity"                   unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     569        <field id="us_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_salinity * e3u"             unit="PSU m2/s"      grid_ref="grid_U_3D" > us * e3u </field > 
     570   <field id="urhop"        long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_density"          unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     571        <field id="urhop_e3u"    long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_density * e3u"    unit="(kg/m3).(m2/s)"   grid_ref="grid_U_3D" > urhop * e3u </field > 
     572   <field id="vt"           long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_temperature"      unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     573        <field id="vt_e3v"       long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_temperature * e3v"  unit="degree_C m2/s"   grid_ref="grid_V_3D" > vt * e3v </field > 
     574   <field id="vs"           long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_salinity"                   unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     575        <field id="vs_e3v"       long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_salinity * e3t"             unit="PSU m2/s"      grid_ref="grid_V_3D" > vs * e3v </field > 
     576   <field id="vrhop"        long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_density"          unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     577        <field id="vrhop_e3v"    long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_density * e3t"    unit="(kg/m3).(m2/s)"  grid_ref="grid_V_3D" > vrhop * e3v </field > 
     578   <field id="wt"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_potential_temperature" unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     579   <field id="ws"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_salinity"              unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     580   <field id="wrhop"        long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_potential_density"     unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     581   <field id="uv"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_sea_water_y_velocity"       unit="m2/s2   "      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     582   <field id="uw"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_sea_water_x_velocity"  unit="m2/s2   "      grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     583   <field id="vw"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_sea_water_y_velocity"  unit="m2/s2"         grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     584      </field_group> 
    551585 
    552586      <field_group id="scalar"  grid_ref="grid_scalar"  > 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/cfgs/SHARED/grid_def_nemo.xml

    r12331 r12805  
    6161         <domain domain_ref="grid_T" /> 
    6262         <axis axis_ref="nfloat" /> 
     63       </grid> 
     64      <!-- scalars --> 
     65      <grid id="grid_scalar" > 
     66        <scalar/> 
     67      </grid> 
     68        <!--  --> 
     69       <grid id="grid_EqT" > 
     70         <domain id="EqT" /> 
     71       </grid> 
     72        <!--  --> 
     73       <grid id="gznl_T_2D"> 
     74         <domain id="ptr" /> 
     75       </grid> 
     76        <!--  --> 
     77       <grid id="gznl_T_3D"> 
     78         <domain id="ptr" /> 
     79         <axis axis_ref="deptht" /> 
     80       </grid> 
     81        <!--  --> 
     82       <grid id="gznl_W_2D"> 
     83         <domain id="ptr" /> 
     84       </grid> 
     85        <!--  --> 
     86       <grid id="gznl_W_3D"> 
     87         <domain id="ptr" /> 
     88         <axis axis_ref="depthw" /> 
     89       </grid> 
     90       <grid id="vert_sum"> 
     91         <domain id="grid_T"/> 
     92         <scalar> 
     93            <reduce_axis operation="sum" /> 
     94         </scalar> 
     95       </grid> 
     96       <grid id="zoom_300"> 
     97         <domain id="grid_T" /> 
     98         <axis axis_ref="deptht300"/> 
     99       </grid> 
     100       <grid id="zoom_300_sum"> 
     101         <domain id="grid_T" /> 
     102         <scalar> 
     103            <reduce_axis operation="sum" /> 
     104         </scalar> 
     105       </grid> 
     106       <grid id="grid_T_surface_extract"> 
     107         <domain id="grid_T" /> 
     108         <axis   axis_ref="deptht_surface" /> 
    63109       </grid> 
    64110        <!--  --> 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/ICE/icerst.F90

    r12801 r12805  
    2323   USE in_out_manager ! I/O manager 
    2424   USE iom            ! I/O manager library 
     25   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2526   USE lib_mpp        ! MPP library 
    2627   USE lib_fortran    ! fortran utilities (glob_sum + no signed zero) 
     
    4849      INTEGER, INTENT(in) ::   kt       ! number of iteration 
    4950      ! 
     51      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     52      REAL (wp)           ::   zsec 
     53      REAL (wp)           ::   zfjulday 
    5054      CHARACTER(len=20)   ::   clkt     ! ocean time-step define as a character 
    5155      CHARACTER(len=50)   ::   clname   ! ice output restart file name 
     
    6367         IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN 
    6468            ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...) 
    65             IF( nitrst > 99999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
    66             ELSE                           ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     69            IF ( ln_rstdate ) THEN 
     70               zfjulday = fjulday + (2*nn_fsbc+1)*rdt / rday 
     71               IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     72               CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     73               WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     74            ELSE 
     75               IF( nitrst > 99999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
     76               ELSE                           ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     77               ENDIF 
    6778            ENDIF 
    6879            ! create the file 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/ICE/icewri.F90

    r12801 r12805  
    104104      IF( iom_use('snwthic' ) )   CALL iom_put( 'snwthic', hm_s        * zmsk00 )                                           ! snw thickness 
    105105      IF( iom_use('icebrv'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv' , bvm_i* 100. * zmsk00 )                                           ! brine volume 
    106       IF( iom_use('iceage'  ) )   CALL iom_put( 'iceage' , om_i / rday * zmsk15 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk15 ) )          ! ice age 
     106      IF( iom_use('iceage'  ) )   CALL iom_put( 'iceage' , om_i / rday * zmsk15 )                                           ! ice age 
    107107      IF( iom_use('icehnew' ) )   CALL iom_put( 'icehnew', ht_i_new             )                                           ! new ice thickness formed in the leads 
    108108      IF( iom_use('snwvolu' ) )   CALL iom_put( 'snwvolu', vt_s        * zmsksn )                                           ! snow volume 
     
    119119      IF( iom_use('icevlid' ) )   CALL iom_put( 'icevlid', vt_il  * zmsk00      )                                           ! melt pond lid total volume per unit area 
    120120      ! salt 
    121       IF( iom_use('icesalt' ) )   CALL iom_put( 'icesalt', sm_i                 * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) ) ! mean ice salinity 
     121      IF( iom_use('icesalt' ) )   CALL iom_put( 'icesalt', sm_i                 * zmsk00 )                                  ! mean ice salinity 
    122122      IF( iom_use('icesalm' ) )   CALL iom_put( 'icesalm', st_i * rhoi * 1.0e-3 * zmsk00 )                                  ! Mass of salt in sea ice per cell area 
    123123      ! heat 
    124       IF( iom_use('icetemp' ) )   CALL iom_put( 'icetemp', ( tm_i  - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! ice mean temperature 
    125       IF( iom_use('snwtemp' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp', ( tm_s  - rt0 ) * zmsksn + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksn ) )      ! snw mean temperature 
    126       IF( iom_use('icettop' ) )   CALL iom_put( 'icettop', ( tm_su - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the ice surface 
    127       IF( iom_use('icetbot' ) )   CALL iom_put( 'icetbot', ( t_bo  - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the ice bottom 
    128       IF( iom_use('icetsni' ) )   CALL iom_put( 'icetsni', ( tm_si - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the snow-ice interface 
     124      IF( iom_use('icetemp' ) )   CALL iom_put( 'icetemp', ( tm_i  - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! ice mean temperature 
     125      IF( iom_use('snwtemp' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp', ( tm_s  - rt0 ) * zmsksn  )                                      ! snw mean temperature 
     126      IF( iom_use('icettop' ) )   CALL iom_put( 'icettop', ( tm_su - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the ice surface 
     127      IF( iom_use('icetbot' ) )   CALL iom_put( 'icetbot', ( t_bo  - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the ice bottom 
     128      IF( iom_use('icetsni' ) )   CALL iom_put( 'icetsni', ( tm_si - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the snow-ice interface 
    129129      IF( iom_use('icehc'   ) )   CALL iom_put( 'icehc'  ,  -et_i          * zmsk00 )                                       ! ice heat content 
    130130      IF( iom_use('snwhc'   ) )   CALL iom_put( 'snwhc'  ,  -et_s          * zmsksn )                                       ! snow heat content 
     
    153153      IF( iom_use('icemask_cat' ) )   CALL iom_put( 'icemask_cat' ,                  zmsk00l                                   ) ! ice mask 0% 
    154154      IF( iom_use('iceconc_cat' ) )   CALL iom_put( 'iceconc_cat' , a_i            * zmsk00l                                   ) ! area for categories 
    155       IF( iom_use('icethic_cat' ) )   CALL iom_put( 'icethic_cat' , h_i            * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! thickness for categories 
    156       IF( iom_use('snwthic_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwthic_cat' , h_s            * zmsksnl + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksnl ) ) ! snow depth for categories 
    157       IF( iom_use('icesalt_cat' ) )   CALL iom_put( 'icesalt_cat' , s_i            * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! salinity for categories 
    158       IF( iom_use('iceage_cat'  ) )   CALL iom_put( 'iceage_cat'  , o_i / rday     * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! ice age 
     155      IF( iom_use('icethic_cat' ) )   CALL iom_put( 'icethic_cat' , h_i            * zmsk00l                                   ) ! thickness for categories 
     156      IF( iom_use('snwthic_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwthic_cat' , h_s            * zmsksnl                                   ) ! snow depth for categories 
     157      IF( iom_use('icesalt_cat' ) )   CALL iom_put( 'icesalt_cat' , s_i            * zmsk00l                                   ) ! salinity for categories 
     158      IF( iom_use('iceage_cat'  ) )   CALL iom_put( 'iceage_cat'  , o_i / rday     * zmsk00l                                   ) ! ice age 
    159159      IF( iom_use('icetemp_cat' ) )   CALL iom_put( 'icetemp_cat' , ( SUM( t_i, dim=3 ) * r1_nlay_i - rt0 ) & 
    160          &                                                                         * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! ice temperature 
     160         &                                                                         * zmsk00l                                   ) ! ice temperature 
    161161      IF( iom_use('snwtemp_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp_cat' , ( SUM( t_s, dim=3 ) * r1_nlay_s - rt0 ) & 
    162          &                                                                         * zmsksnl + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksnl ) ) ! snow temperature 
    163       IF( iom_use('icettop_cat' ) )   CALL iom_put( 'icettop_cat' , ( t_su - rt0 ) * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! surface temperature 
    164       IF( iom_use('icebrv_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv_cat'  ,   bv_i * 100.  * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! brine volume 
     162         &                                                                         * zmsksnl                                   ) ! snow temperature 
     163      IF( iom_use('icettop_cat' ) )   CALL iom_put( 'icettop_cat' , ( t_su - rt0 ) * zmsk00l                                   ) ! surface temperature 
     164      IF( iom_use('icebrv_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv_cat'  ,   bv_i * 100.  * zmsk00l                                   ) ! brine volume 
    165165      IF( iom_use('iceapnd_cat' ) )   CALL iom_put( 'iceapnd_cat' ,   a_ip         * zmsk00l                                   ) ! melt pond frac for categories 
    166166      IF( iom_use('icehpnd_cat' ) )   CALL iom_put( 'icehpnd_cat' ,   h_ip         * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! melt pond thickness for categories 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/DOM/domain.F90

    r12801 r12805  
    292292         &             nn_it000, nn_itend , nn_date0    , nn_time0     , nn_leapy  , nn_istate ,     & 
    293293         &             nn_stock, nn_write , ln_mskland  , ln_clobber   , nn_chunksz, nn_euler  ,     & 
    294          &             ln_cfmeta, ln_iscpl, ln_xios_read, nn_wxios 
     294         &             ln_cfmeta, ln_iscpl, ln_xios_read, nn_wxios, ln_rstdate 
    295295      NAMELIST/namdom/ ln_linssh, rn_isfhmin, rn_rdt, rn_atfp, ln_crs, ln_meshmask 
    296296#if defined key_netcdf4 
     
    340340#endif 
    341341         WRITE(numout,*) '      mask land points                ln_mskland      = ', ln_mskland 
     342         WRITE(numout,*) '      date-stamp restart files        ln_rstdate = ', ln_rstdate 
    342343         WRITE(numout,*) '      additional CF standard metadata ln_cfmeta       = ', ln_cfmeta 
    343344         WRITE(numout,*) '      overwrite an existing file      ln_clobber      = ', ln_clobber 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/DOM/dommsk.F90

    r12801 r12805  
    3232   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link) 
    3333   USE lib_mpp        ! Massively Parallel Processing library 
     34   USE iom             ! For shlat2d 
     35   USE fldread         ! for sn_shlat2d 
    3436 
    3537   IMPLICIT NONE 
     
    9294      INTEGER  ::   iktop, ikbot   !   -       - 
    9395      INTEGER  ::   ios, inum 
    94       REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   zwf   ! 2D workspace 
    95       !! 
    96       NAMELIST/namlbc/ rn_shlat, ln_vorlat 
     96      !! 
     97      INTEGER  :: inum             !  logical unit for shlat2d 
     98      REAL(wp) :: zshlat           !: locally modified shlat for some strait 
     99      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zshlat2d 
     100      LOGICAL                         :: ln_shlat2d 
     101      CHARACTER(len = 256)            :: cn_shlat2d_file, cn_shlat2d_var   
     102      !! 
     103      NAMELIST/namlbc/ rn_shlat, ln_vorlat, ln_shlat2d, cn_shlat2d_file, cn_shlat2d_var 
    97104      NAMELIST/nambdy/ ln_bdy ,nb_bdy, ln_coords_file, cn_coords_file,         & 
    98105         &             ln_mask_file, cn_mask_file, cn_dyn2d, nn_dyn2d_dta,     & 
     
    121128      ! 
    122129      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    123       IF     (      rn_shlat == 0.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  free-slip' 
    124       ELSEIF (      rn_shlat == 2.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  no-slip' 
    125       ELSEIF ( 0. < rn_shlat .AND. rn_shlat < 2. ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  partial-slip' 
    126       ELSEIF ( 2. < rn_shlat                     ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  strong-slip' 
     130 
     131      IF ( ln_shlat2d ) THEN 
     132         IF(lwp) WRITE(numout,*) '         READ shlat as a 2D coefficient in a file ' 
     133         ALLOCATE( zshlat2d(jpi,jpj) ) 
     134         CALL iom_open(TRIM(cn_shlat2d_file), inum) 
     135         CALL iom_get (inum, jpdom_data, TRIM(cn_shlat2d_var), zshlat2d, 1) ! 
     136         CALL iom_close(inum) 
    127137      ELSE 
    128          CALL ctl_stop( 'dom_msk: wrong value for rn_shlat (i.e. a negalive value). We stop.' ) 
     138         IF     (      rn_shlat == 0.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  free-slip' 
     139         ELSEIF (      rn_shlat == 2.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  no-slip' 
     140         ELSEIF ( 0. < rn_shlat .AND. rn_shlat < 2. ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  partial-slip' 
     141         ELSEIF ( 2. < rn_shlat                     ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  strong-slip' 
     142         ELSE 
     143            CALL ctl_stop( 'dom_msk: wrong value for rn_shlat (i.e. a negalive value). We stop.' ) 
     144         ENDIF 
    129145      ENDIF 
    130146 
     
    241257      ! Lateral boundary conditions on velocity (modify fmask) 
    242258      ! ---------------------------------------   
    243       IF( rn_shlat /= 0 ) THEN      ! Not free-slip lateral boundary condition 
    244          ! 
    245          ALLOCATE( zwf(jpi,jpj) ) 
     259      IF( rn_shlat /= 0 .or. ln_shlat2d ) THEN      ! Not free-slip lateral boundary condition everywhere 
    246260         ! 
    247261         DO jk = 1, jpk 
    248             zwf(:,:) = fmask(:,:,jk)          
    249             DO jj = 2, jpjm1 
    250                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    251                   IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    252                      fmask(ji,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,jj), zwf(ji,jj+1),   & 
    253                         &                                           zwf(ji-1,jj), zwf(ji,jj-1)  )  ) 
    254                   ENDIF 
     262            IF (  ln_shlat2d ) THEN 
     263               DO jj = 2, jpjm1 
     264                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     265                     IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
     266                        fmask(ji,jj,jk) = zshlat2d(ji,jj) * MIN( 1._wp , MAX( umask(ji,jj,jk), umask(ji,jj+1,jk),   & 
     267                           &                                                  vmask(ji,jj,jk), vmask(ji+1,jj,jk)  )  ) 
     268                     ENDIF 
     269                  END DO 
    255270               END DO 
    256             END DO 
     271            ELSE 
     272               DO jj = 2, jpjm1 
     273                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     274                     IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
     275                        fmask(ji,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( umask(ji,jj,jk), umask(ji,jj+1,jk),   & 
     276                           &                                           vmask(ji,jj,jk), vmask(ji+1,jj,jk)   )  ) 
     277                     ENDIF 
     278                  END DO 
     279               END DO 
     280            ENDIF 
    257281            DO jj = 2, jpjm1 
    258282               IF( fmask(1,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    259                   fmask(1  ,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(2,jj), zwf(1,jj+1), zwf(1,jj-1) ) ) 
     283                  fmask(1  ,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(2,jj,jk), umask(1,jj+1,jk), umask(1,jj,jk) ) ) 
    260284               ENDIF 
    261285               IF( fmask(jpi,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    262                   fmask(jpi,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(jpi,jj+1), zwf(jpim1,jj), zwf(jpi,jj-1) ) ) 
     286                  fmask(jpi,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( umask(jpi,jj+1,jk), vmask(jpim1,jj,jk), umask(jpi,jj-1,jk) ) ) 
    263287               ENDIF 
    264288            END DO          
    265289            DO ji = 2, jpim1 
    266290               IF( fmask(ji,1,jk) == 0._wp ) THEN 
    267                   fmask(ji, 1 ,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,1), zwf(ji,2), zwf(ji-1,1) ) ) 
     291                  fmask(ji, 1 ,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(ji+1,1,jk), umask(ji,2,jk), vmask(ji,1,jk) ) ) 
    268292               ENDIF 
    269293               IF( fmask(ji,jpj,jk) == 0._wp ) THEN 
    270                   fmask(ji,jpj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,jpj), zwf(ji-1,jpj), zwf(ji,jpjm1) ) ) 
     294                  fmask(ji,jpj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(ji+1,jpj,jk), vmask(ji-1,jpj,jk), umask(ji,jpjm1,jk) ) ) 
    271295               ENDIF 
    272296            END DO 
     
    281305         END DO 
    282306         ! 
    283          DEALLOCATE( zwf ) 
     307         IF( ln_shlat2d ) DEALLOCATE( zshlat2d ) 
    284308         ! 
    285309         CALL lbc_lnk( 'dommsk', fmask, 'F', 1._wp )      ! Lateral boundary conditions on fmask 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/ICB/icbrst.F90

    r12801 r12805  
    2525   USE netcdf         ! netcdf routines for IO 
    2626   USE iom 
     27   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2728   USE icb_oce        ! define iceberg arrays 
    2829   USE icbutl         ! iceberg utility routines 
     
    190191      INTEGER ::   jn   ! dummy loop index 
    191192      INTEGER ::   ix_dim, iy_dim, ik_dim, in_dim 
    192       CHARACTER(len=256)     :: cl_path 
    193       CHARACTER(len=256)     :: cl_filename 
     193      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     194      REAL (wp)           ::   zsec 
     195      REAL (wp)           ::   zfjulday 
     196      CHARACTER(len=256)  :: cl_path 
     197      CHARACTER(len=256)  :: cl_filename 
     198      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character 
    194199      TYPE(iceberg), POINTER :: this 
    195200      TYPE(point)  , POINTER :: pt 
     
    206211         cl_path = TRIM(cn_ocerst_outdir) 
    207212         IF( cl_path(LEN_TRIM(cl_path):) /= '/' ) cl_path = TRIM(cl_path) // '/' 
     213         IF ( ln_rstdate ) THEN 
     214            zfjulday = fjulday + rdt / rday 
     215            IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     216            CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     217            WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     218         ELSE 
     219            IF( kt > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) kt 
     220            ELSE                        ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') kt 
     221            ENDIF 
     222         ENDIF 
    208223         IF( lk_mpp ) THEN 
    209             WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",I8.8,"_restart_",I4.4,".nc")') TRIM(cexper), kt, narea-1 
     224            WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",A,"_restart_",I4.4,".nc")') TRIM(cexper), TRIM(ADJUSTL(clkt)), narea-1 
    210225         ELSE 
    211             WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",I8.8,"_restart.nc")') TRIM(cexper), kt 
     226            WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",A,"_restart.nc")') TRIM(cexper), TRIM(ADJUSTL(clkt)) 
    212227         ENDIF 
    213228         IF ( lwp .AND. nn_verbose_level >= 0) WRITE(numout,'(2a)') 'icebergs, write_restart: creating ',  & 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/IOM/in_out_manager.F90

    r12801 r12805  
    4040   INTEGER, DIMENSION(10) :: nn_stocklist  !: restart dump times 
    4141   LOGICAL       ::   ln_mskland       !: mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     42   LOGICAL       ::   ln_rstdate       !: T=> stamp output restart files with date instead of timestep 
    4243   LOGICAL       ::   ln_cfmeta        !: output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    4344   LOGICAL       ::   ln_clobber       !: clobber (overwrite) an existing file 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/IOM/restart.F90

    r12801 r12805  
    2727   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2828   USE iom             ! I/O module 
     29   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2930   USE diurnal_bulk 
    3031   USE lib_mpp         ! distribued memory computing library 
     
    5960      INTEGER, INTENT(in) ::   kt     ! ocean time-step 
    6061      !! 
     62      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     63      REAL (wp)           ::   zsec 
     64      REAL (wp)           ::   zfjulday 
    6165      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character 
    6266      CHARACTER(LEN=50)   ::   clname   ! ocean output restart file name 
     
    9094         IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN  
    9195            ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...) 
    92             IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
    93             ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     96            IF ( ln_rstdate ) THEN 
     97               zfjulday = fjulday + rdt / rday 
     98               IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     99               CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     100               WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     101            ELSE 
     102               IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
     103               ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     104               ENDIF 
    94105            ENDIF 
    95106            ! create the file 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/TRA/trabbl.F90

    r12801 r12805  
    513513      IF( tra_bbl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'tra_bbl_init : unable to allocate arrays' ) 
    514514      ! 
    515       IF( nn_bbl_adv == 1 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using upper velocity' 
    516       IF( nn_bbl_adv == 2 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using velocity = F( delta rho)' 
     515      IF(lwp) THEN 
     516         IF( nn_bbl_adv == 1 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using upper velocity' 
     517         IF( nn_bbl_adv == 2 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using velocity = F( delta rho)' 
     518      ENDIF 
    517519      ! 
    518520      !                             !* vertical index of  "deep" bottom u- and v-points 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/ZDF/zdfmxl.F90

    r12801 r12805  
    1515   USE trc_oce  , ONLY: l_offline         ! ocean space and time domain variables 
    1616   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics 
     17   USE eosbn2         ! for zdf_mxl_zint 
    1718   ! 
    1819   USE in_out_manager ! I/O manager 
     
    3132   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   hmlp    !: mixed layer depth  (rho=rho0+zdcrit) [m]   (used by LDF) 
    3233   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   hmlpt   !: depth of the last T-point inside the mixed layer [m] (used by LDF) 
     34   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE,       DIMENSION(:,:) ::   hmld_zint  !: vertically-interpolated mixed layer depth   [m] 
     35   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE,       DIMENSION(:,:) ::   htc_mld    ! Heat content of hmld_zint 
     36   LOGICAL, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)    :: ll_found   ! Is T_b to be found by interpolation ? 
     37   LOGICAL, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  :: ll_belowml ! Flag points below mixed layer when ll_found=F 
    3338 
    3439   REAL(wp), PUBLIC ::   rho_c = 0.01_wp    !: density criterion for mixed layer depth 
    3540   REAL(wp), PUBLIC ::   avt_c = 5.e-4_wp   ! Kz criterion for the turbocline depth 
     41 
     42   TYPE, PUBLIC :: MXL_ZINT   !: Structure for MLD defs 
     43      INTEGER   :: mld_type   ! mixed layer type      
     44      REAL(wp)  :: zref       ! depth of initial T_ref 
     45      REAL(wp)  :: dT_crit    ! Critical temp diff 
     46      REAL(wp)  :: iso_frac   ! Fraction of rn_dT_crit  
     47   END TYPE MXL_ZINT 
    3648 
    3749   !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    4860      zdf_mxl_alloc = 0      ! set to zero if no array to be allocated 
    4961      IF( .NOT. ALLOCATED( nmln ) ) THEN 
    50          ALLOCATE( nmln(jpi,jpj), hmld(jpi,jpj), hmlp(jpi,jpj), hmlpt(jpi,jpj), STAT= zdf_mxl_alloc ) 
     62         ALLOCATE( nmln(jpi,jpj), hmld(jpi,jpj), hmlp(jpi,jpj), hmlpt(jpi,jpj), hmld_zint(jpi,jpj),     & 
     63   &          htc_mld(jpi,jpj), ll_found(jpi,jpj), ll_belowml(jpi,jpj,jpk), STAT= zdf_mxl_alloc )          
    5164         ! 
    5265         CALL mpp_sum ( 'zdfmxl', zdf_mxl_alloc ) 
     
    137150      ENDIF 
    138151      ! 
     152      ! Vertically-interpolated mixed-layer depth diagnostic 
     153      CALL zdf_mxl_zint( kt ) 
     154      ! 
    139155      IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=REAL(nmln,wp), clinfo1=' nmln : ', tab2d_2=hmlp, clinfo2=' hmlp : ' ) 
    140156      ! 
    141157   END SUBROUTINE zdf_mxl 
     158 
     159   SUBROUTINE zdf_mxl_zint_mld( sf )  
     160      !!----------------------------------------------------------------------------------  
     161      !!                    ***  ROUTINE zdf_mxl_zint_mld  ***  
     162      !                                                                         
     163      !   Calculate vertically-interpolated mixed layer depth diagnostic.  
     164      !             
     165      !   This routine can calculate the mixed layer depth diagnostic suggested by 
     166      !   Kara et al, 2000, JGR, 105, 16803, but is more general and can calculate 
     167      !   vertically-interpolated mixed-layer depth diagnostics with other parameter 
     168      !   settings set in the namzdf_mldzint namelist.   
     169      !  
     170      !   If mld_type=1 the mixed layer depth is calculated as the depth at which the   
     171      !   density has increased by an amount equivalent to a temperature difference of   
     172      !   0.8C at the surface.  
     173      !  
     174      !   For other values of mld_type the mixed layer is calculated as the depth at   
     175      !   which the temperature differs by 0.8C from the surface temperature.   
     176      !                                                                         
     177      !   David Acreman, Daley Calvert                                       
     178      !  
     179      !!-----------------------------------------------------------------------------------  
     180 
     181      TYPE(MXL_ZINT), INTENT(in)  :: sf 
     182 
     183      ! Diagnostic criteria 
     184      INTEGER   :: nn_mld_type   ! mixed layer type      
     185      REAL(wp)  :: rn_zref       ! depth of initial T_ref 
     186      REAL(wp)  :: rn_dT_crit    ! Critical temp diff 
     187      REAL(wp)  :: rn_iso_frac   ! Fraction of rn_dT_crit used 
     188 
     189      ! Local variables 
     190      REAL(wp), PARAMETER :: zepsilon = 1.e-30          ! local small value 
     191      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ikmt          ! number of active tracer levels  
     192      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ik_ref        ! index of reference level  
     193      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ik_iso        ! index of last uniform temp level  
     194      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zT            ! Temperature or density  
     195      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: ppzdep        ! depth for use in calculating d(rho)  
     196      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zT_ref        ! reference temperature  
     197      REAL    :: zT_b                                   ! base temperature  
     198      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zdTdz         ! gradient of zT  
     199      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zmoddT        ! Absolute temperature difference  
     200      REAL    :: zdz                                    ! depth difference  
     201      REAL    :: zdT                                    ! temperature difference  
     202      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zdelta_T      ! difference critereon  
     203      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zRHO1, zRHO2  ! Densities  
     204      INTEGER :: ji, jj, jk                             ! loop counter  
     205 
     206      !!-------------------------------------------------------------------------------------  
     207      !   
     208      ! Unpack structure 
     209      nn_mld_type = sf%mld_type 
     210      rn_zref     = sf%zref 
     211      rn_dT_crit  = sf%dT_crit 
     212      rn_iso_frac = sf%iso_frac 
     213 
     214      ! Set the mixed layer depth criterion at each grid point  
     215      IF( nn_mld_type == 0 ) THEN 
     216         zdelta_T(:,:) = rn_dT_crit 
     217         zT(:,:,:) = rhop(:,:,:) 
     218      ELSE IF( nn_mld_type == 1 ) THEN 
     219         ppzdep(:,:)=0.0  
     220         call eos ( tsn(:,:,1,:), ppzdep(:,:), zRHO1(:,:) )  
     221! Use zT temporarily as a copy of tsn with rn_dT_crit added to SST  
     222! [assumes number of tracers less than number of vertical levels]  
     223         zT(:,:,1:jpts)=tsn(:,:,1,1:jpts)  
     224         zT(:,:,jp_tem)=zT(:,:,1)+rn_dT_crit  
     225         CALL eos( zT(:,:,1:jpts), ppzdep(:,:), zRHO2(:,:) )  
     226         zdelta_T(:,:) = abs( zRHO1(:,:) - zRHO2(:,:) ) * rau0  
     227         ! RHO from eos (2d version) doesn't calculate north or east halo:  
     228         CALL lbc_lnk( 'zdfmxl', zdelta_T, 'T', 1. )  
     229         zT(:,:,:) = rhop(:,:,:)  
     230      ELSE  
     231         zdelta_T(:,:) = rn_dT_crit                       
     232         zT(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem)                            
     233      END IF  
     234 
     235      ! Calculate the gradient of zT and absolute difference for use later  
     236      DO jk = 1 ,jpk-2  
     237         zdTdz(:,:,jk)  =    ( zT(:,:,jk+1) - zT(:,:,jk) ) / e3w_n(:,:,jk+1)  
     238         zmoddT(:,:,jk) = abs( zT(:,:,jk+1) - zT(:,:,jk) )  
     239      END DO  
     240 
     241      ! Find density/temperature at the reference level (Kara et al use 10m).           
     242      ! ik_ref is the index of the box centre immediately above or at the reference level  
     243      ! Find rn_zref in the array of model level depths and find the ref     
     244      ! density/temperature by linear interpolation.                                    
     245      DO jk = jpkm1, 2, -1  
     246         WHERE ( gdept_n(:,:,jk) > rn_zref )  
     247           ik_ref(:,:) = jk - 1  
     248           zT_ref(:,:) = zT(:,:,jk-1) + zdTdz(:,:,jk-1) * ( rn_zref - gdept_n(:,:,jk-1) )  
     249         END WHERE  
     250      END DO  
     251 
     252      ! If the first grid box centre is below the reference level then use the  
     253      ! top model level to get zT_ref  
     254      WHERE ( gdept_n(:,:,1) > rn_zref )   
     255         zT_ref = zT(:,:,1)  
     256         ik_ref = 1  
     257      END WHERE  
     258 
     259      ! The number of active tracer levels is 1 less than the number of active w levels  
     260      ikmt(:,:) = mbkt(:,:) - 1  
     261 
     262      ! Initialize / reset 
     263      ll_found(:,:) = .false. 
     264 
     265      IF ( rn_iso_frac - zepsilon > 0. ) THEN 
     266         ! Search for a uniform density/temperature region where adjacent levels           
     267         ! differ by less than rn_iso_frac * deltaT.                                       
     268         ! ik_iso is the index of the last level in the uniform layer   
     269         ! ll_found indicates whether the mixed layer depth can be found by interpolation  
     270         ik_iso(:,:)   = ik_ref(:,:)  
     271         DO jj = 1, nlcj  
     272            DO ji = 1, nlci  
     273!CDIR NOVECTOR  
     274               DO jk = ik_ref(ji,jj), ikmt(ji,jj)-1  
     275                  IF ( zmoddT(ji,jj,jk) > ( rn_iso_frac * zdelta_T(ji,jj) ) ) THEN  
     276                     ik_iso(ji,jj)   = jk  
     277                     ll_found(ji,jj) = ( zmoddT(ji,jj,jk) > zdelta_T(ji,jj) )  
     278                     EXIT  
     279                  END IF  
     280               END DO  
     281            END DO  
     282         END DO  
     283 
     284         ! Use linear interpolation to find depth of mixed layer base where possible  
     285         hmld_zint(:,:) = rn_zref  
     286         DO jj = 1, jpj  
     287            DO ji = 1, jpi  
     288               IF (ll_found(ji,jj) .and. tmask(ji,jj,1) == 1.0) THEN  
     289                  zdz =  abs( zdelta_T(ji,jj) / zdTdz(ji,jj,ik_iso(ji,jj)) )  
     290                  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,ik_iso(ji,jj)) + zdz  
     291               END IF  
     292            END DO  
     293         END DO  
     294      END IF 
     295 
     296      ! If ll_found = .false. then calculate MLD using difference of zdelta_T     
     297      ! from the reference density/temperature  
     298  
     299! Prevent this section from working on land points  
     300      WHERE ( tmask(:,:,1) /= 1.0 )  
     301         ll_found = .true.  
     302      END WHERE  
     303  
     304      DO jk=1, jpk  
     305         ll_belowml(:,:,jk) = abs( zT(:,:,jk) - zT_ref(:,:) ) >= zdelta_T(:,:)   
     306      END DO  
     307  
     308! Set default value where interpolation cannot be used (ll_found=false)   
     309      DO jj = 1, jpj  
     310         DO ji = 1, jpi  
     311            IF ( .not. ll_found(ji,jj) )  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,ikmt(ji,jj))  
     312         END DO  
     313      END DO  
     314 
     315      DO jj = 1, jpj  
     316         DO ji = 1, jpi  
     317!CDIR NOVECTOR  
     318            DO jk = ik_ref(ji,jj)+1, ikmt(ji,jj)  
     319               IF ( ll_found(ji,jj) ) EXIT  
     320               IF ( ll_belowml(ji,jj,jk) ) THEN                 
     321                  zT_b = zT_ref(ji,jj) + zdelta_T(ji,jj) * SIGN(1.0, zdTdz(ji,jj,jk-1) )  
     322                  zdT  = zT_b - zT(ji,jj,jk-1)                                       
     323                  zdz  = zdT / zdTdz(ji,jj,jk-1)                                        
     324                  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,jk-1) + zdz  
     325                  EXIT                                                    
     326               END IF  
     327            END DO  
     328         END DO  
     329      END DO  
     330 
     331      hmld_zint(:,:) = hmld_zint(:,:)*tmask(:,:,1)  
     332      !   
     333   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint_mld 
     334 
     335   SUBROUTINE zdf_mxl_zint_htc( kt ) 
     336      !!---------------------------------------------------------------------- 
     337      !!                  ***  ROUTINE zdf_mxl_zint_htc  *** 
     338      !!  
     339      !! ** Purpose :    
     340      !! 
     341      !! ** Method  :    
     342      !!---------------------------------------------------------------------- 
     343 
     344      INTEGER, INTENT(in) ::   kt   ! ocean time-step index 
     345 
     346      INTEGER :: ji, jj, jk 
     347      INTEGER :: ikmax 
     348      REAL(wp) :: zc, zcoef 
     349      ! 
     350      INTEGER,  ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   ilevel 
     351      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   zthick_0, zthick 
     352 
     353      !!---------------------------------------------------------------------- 
     354 
     355      IF( .NOT. ALLOCATED(ilevel) ) THEN 
     356         ALLOCATE( ilevel(jpi,jpj), zthick_0(jpi,jpj), & 
     357         &         zthick(jpi,jpj), STAT=ji ) 
     358         IF( lk_mpp  )   CALL mpp_sum( 'zdfmxl', ji ) 
     359         IF( ji /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_mxl_zint_htc : unable to allocate arrays' ) 
     360      ENDIF 
     361 
     362      ! Find last whole model T level above the MLD 
     363      ilevel(:,:)   = 0 
     364      zthick_0(:,:) = 0._wp 
     365 
     366      DO jk = 1, jpkm1   
     367         DO jj = 1, jpj 
     368            DO ji = 1, jpi                     
     369               zthick_0(ji,jj) = zthick_0(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) 
     370               IF( zthick_0(ji,jj) < hmld_zint(ji,jj) )   ilevel(ji,jj) = jk 
     371            END DO 
     372         END DO 
     373         WRITE(numout,*) 'zthick_0(jk =',jk,') =',zthick_0(2,2) 
     374         WRITE(numout,*) 'gdepw_n(jk+1 =',jk+1,') =',gdepw_n(2,2,jk+1) 
     375      END DO 
     376 
     377      ! Surface boundary condition 
     378      IF( ln_linssh ) THEN  ;   zthick(:,:) = sshn(:,:)   ;   htc_mld(:,:) = tsn(:,:,1,jp_tem) * sshn(:,:) * tmask(:,:,1)    
     379      ELSE                  ;   zthick(:,:) = 0._wp       ;   htc_mld(:,:) = 0._wp                                    
     380      ENDIF 
     381 
     382      ! Deepest whole T level above the MLD 
     383      ikmax = MIN( MAXVAL( ilevel(:,:) ), jpkm1 ) 
     384 
     385      ! Integration down to last whole model T level 
     386      DO jk = 1, ikmax 
     387         DO jj = 1, jpj 
     388            DO ji = 1, jpi 
     389               zc = e3t_n(ji,jj,jk) * REAL( MIN( MAX( 0, ilevel(ji,jj) - jk + 1 ) , 1  )  )    ! 0 below ilevel 
     390               zthick(ji,jj) = zthick(ji,jj) + zc 
     391               htc_mld(ji,jj) = htc_mld(ji,jj) + zc * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk) 
     392            END DO 
     393         END DO 
     394      END DO 
     395 
     396      ! Subsequent partial T level 
     397      zthick(:,:) = hmld_zint(:,:) - zthick(:,:)   !   remaining thickness to reach MLD 
     398 
     399      DO jj = 1, jpj 
     400         DO ji = 1, jpi 
     401            htc_mld(ji,jj) = htc_mld(ji,jj) + tsn(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1,jp_tem)  &  
     402      &                      * MIN( e3t_n(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1), zthick(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1) 
     403         END DO 
     404      END DO 
     405 
     406      WRITE(numout,*) 'htc_mld(after) =',htc_mld(2,2) 
     407 
     408      ! Convert to heat content 
     409      zcoef = rau0 * rcp 
     410      htc_mld(:,:) = zcoef * htc_mld(:,:) 
     411 
     412   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint_htc 
     413 
     414   SUBROUTINE zdf_mxl_zint( kt ) 
     415      !!---------------------------------------------------------------------- 
     416      !!                  ***  ROUTINE zdf_mxl_zint  *** 
     417      !!  
     418      !! ** Purpose :    
     419      !! 
     420      !! ** Method  :    
     421      !!---------------------------------------------------------------------- 
     422 
     423      INTEGER, INTENT(in) ::   kt   ! ocean time-step index 
     424 
     425      INTEGER :: ios 
     426      INTEGER :: jn 
     427 
     428      INTEGER :: nn_mld_diag = 0    ! number of diagnostics 
     429 
     430      CHARACTER(len=1) :: cmld 
     431 
     432      TYPE(MXL_ZINT) :: sn_mld1, sn_mld2, sn_mld3, sn_mld4, sn_mld5 
     433      TYPE(MXL_ZINT), SAVE, DIMENSION(5) ::   mld_diags 
     434 
     435      NAMELIST/namzdf_mldzint/ nn_mld_diag, sn_mld1, sn_mld2, sn_mld3, sn_mld4, sn_mld5 
     436 
     437      !!---------------------------------------------------------------------- 
     438       
     439      IF( kt == nit000 ) THEN 
     440         REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namzdf_mldzint in reference namelist  
     441         READ  ( numnam_ref, namzdf_mldzint, IOSTAT = ios, ERR = 901) 
     442901      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf_mldzint in reference namelist' ) 
     443 
     444         REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namzdf_mldzint in configuration namelist  
     445         READ  ( numnam_cfg, namzdf_mldzint, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
     446902      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf_mldzint in configuration namelist' ) 
     447         IF(lwm) WRITE ( numond, namzdf_mldzint ) 
     448 
     449         IF( nn_mld_diag > 5 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_mxl_ini: Specify no more than 5 MLD definitions' ) 
     450 
     451         mld_diags(1) = sn_mld1 
     452         mld_diags(2) = sn_mld2 
     453         mld_diags(3) = sn_mld3 
     454         mld_diags(4) = sn_mld4 
     455         mld_diags(5) = sn_mld5 
     456 
     457         IF( lwp .AND. (nn_mld_diag > 0) ) THEN 
     458            WRITE(numout,*) '=============== Vertically-interpolated mixed layer ================' 
     459            WRITE(numout,*) '(Diagnostic number, nn_mld_type, rn_zref, rn_dT_crit, rn_iso_frac)' 
     460            DO jn = 1, nn_mld_diag 
     461               WRITE(numout,*) 'MLD criterion',jn,':' 
     462               WRITE(numout,*) '    nn_mld_type =', mld_diags(jn)%mld_type 
     463               WRITE(numout,*) '    rn_zref ='    , mld_diags(jn)%zref 
     464               WRITE(numout,*) '    rn_dT_crit =' , mld_diags(jn)%dT_crit 
     465               WRITE(numout,*) '    rn_iso_frac =', mld_diags(jn)%iso_frac 
     466            END DO 
     467            WRITE(numout,*) '====================================================================' 
     468         ENDIF 
     469      ENDIF 
     470 
     471      IF( nn_mld_diag > 0 ) THEN 
     472         DO jn = 1, nn_mld_diag 
     473            WRITE(cmld,'(I1)') jn 
     474            IF( iom_use( "mldzint_"//cmld ) .OR. iom_use( "mldhtc_"//cmld ) ) THEN 
     475               CALL zdf_mxl_zint_mld( mld_diags(jn) ) 
     476 
     477               IF( iom_use( "mldzint_"//cmld ) ) THEN 
     478                  CALL iom_put( "mldzint_"//cmld, hmld_zint(:,:) ) 
     479               ENDIF 
     480 
     481               IF( iom_use( "mldhtc_"//cmld ) )  THEN 
     482                  CALL zdf_mxl_zint_htc( kt ) 
     483                  CALL iom_put( "mldhtc_"//cmld , htc_mld(:,:)   ) 
     484               ENDIF 
     485            ENDIF 
     486         END DO 
     487      ENDIF 
     488 
     489   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint 
    142490 
    143491   !!====================================================================== 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/step.F90

    r12803 r12805  
    210210      IF( ln_diaptr  )   CALL dia_ptr                 ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics 
    211211      IF( ln_diaharm )   CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis 
     212                         CALL dia_prod( kstp )        ! ocean model: product diagnostics 
    212213                         CALL dia_wri ( kstp )        ! ocean model: outputs 
    213214      ! 
  • NEMO/branches/UKMO/r4.0-HEAD_r12713_dan_test_clems_branch/src/OCE/step_oce.F90

    r12801 r12805  
    8080   USE diahsb          ! heat, salt and volume budgets    (dia_hsb routine) 
    8181   USE diaharm 
     82   USE diaprod 
    8283   USE diacfl 
    8384   USE diaobs          ! Observation operator 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.