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Changeset 14072 for NEMO/trunk/cfgs/SHARED/field_def_nemo-pisces.xml – NEMO

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2020-12-04T08:48:38+01:00 (3 years ago)
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laurent
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Merging branch "2020/dev_r13648_ASINTER-04_laurent_bulk_ice", ticket #2369

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    r12377 r14072  
    1 <?xml version="1.0"?>  
    2     <!-- $id$ --> 
    3      
    4     <!--  
     1<?xml version="1.0"?> 
     2<!-- $id$ --> 
     3 
     4<!-- 
    55============================================================================================================ 
    66=                                  definition of all existing variables                                    = 
    77=                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    88============================================================================================================ 
    9     --> 
    10    <field_definition level="1" prec="4" operation="average" enabled=".TRUE." default_value="1.e20" > <!-- time step automaticaly defined --> 
    11  
    12     <!--  
    13 ============================================================================================================ 
    14                                      Biogeochemistry model variables 
    15 ============================================================================================================ 
    16     --> 
    17  
    18       <!-- ptrc on T grid --> 
    19  
    20      <field_group id="ptrc_T" grid_ref="grid_T_3D"> 
    21        <!-- PISCES standard : variables available with ln_p4z  --> 
    22        <field id="DIC"          long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    23        <field id="DIC_e3t"      long_name="DIC * e3t"                                unit="mmol/m2" > DIC * e3t </field > 
    24        <field id="Alkalini"     long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    25        <field id="Alkalini_e3t" long_name="Alkalini * e3t"                           unit="mmol/m2"  > Alkalini * e3t </field > 
    26        <field id="O2"           long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    27        <field id="O2_e3t"       long_name="O2 * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > O2 * e3t </field > 
    28        <field id="CaCO3"        long_name="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    29        <field id="CaCO3_e3t"    long_name="CaCO3 * e3t"                              unit="mmol/m2"  > CaCO3 * e3t </field > 
    30        <field id="PO4"          long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    31        <field id="PO4_e3t"      long_name="PO4 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PO4 * e3t </field > 
    32        <field id="POC"          long_name="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    33        <field id="POC_e3t"      long_name="POC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > POC * e3t </field > 
    34        <field id="Si"           long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    35        <field id="Si_e3t"       long_name="Si * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > Si * e3t </field > 
    36        <field id="PHY"          long_name="(Nano)Phytoplankton Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    37        <field id="PHY_e3t"      long_name="PHY * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PHY * e3t </field > 
    38        <field id="ZOO"          long_name="(Micro)Zooplankton Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    39        <field id="ZOO_e3t"      long_name="ZOO2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > ZOO * e3t </field > 
    40        <field id="DOC"          long_name="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    41        <field id="DOC_e3t"      long_name="DOC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DOC * e3t </field > 
    42        <field id="PHY2"         long_name="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    43        <field id="PHY2_e3t"     long_name="PHY2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHY2 * e3t </field > 
    44        <field id="ZOO2"         long_name="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
    45        <field id="ZOO2_e3t"     long_name="ZOO2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > ZOO2 * e3t </field > 
    46        <field id="DSi"          long_name="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    47        <field id="DSi_e3t"      long_name="Dsi * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DSi * e3t </field > 
    48        <field id="Fer"          long_name="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
    49        <field id="Fer_e3t"      long_name="Fer * e3t"                                unit="mmol/m2"  > Fer * e3t </field > 
    50        <field id="BFe"          long_name="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    51        <field id="BFe_e3t"      long_name="BFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > BFe * e3t </field > 
    52        <field id="GOC"          long_name="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    53        <field id="GOC_e3t"      long_name="GOC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GOC * e3t </field > 
    54        <field id="SFe"          long_name="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    55        <field id="SFe_e3t"      long_name="SFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > SFe * e3t </field > 
    56        <field id="DFe"          long_name="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
    57        <field id="DFe_e3t"      long_name="DFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DFe * e3t </field > 
    58        <field id="GSi"          long_name="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
    59        <field id="GSi_e3t"      long_name="GSi * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GSi * e3t </field > 
    60        <field id="NFe"          long_name="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    61        <field id="NFe_e3t"      long_name="NFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NFe * e3t </field > 
    62        <field id="NCHL"         long_name="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/m3"   /> 
    63        <field id="NCHL_e3t"     long_name="NCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > NCHL * e3t </field > 
    64        <field id="DCHL"         long_name="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/m3"   /> 
    65        <field id="DCHL_e3t"     long_name="DCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DCHL * e3t </field > 
    66        <field id="NO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    67        <field id="NO3_e3t"      long_name="NO3 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NO3 * e3t </field > 
    68        <field id="NH4"          long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    69        <field id="NH4_e3t"      long_name="NH4 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NH4 * e3t </field > 
    70  
    71        <!-- PISCES quota : variables available with ln_p5z  --> 
    72  
    73        <field id="DON"          long_name="Dissolved organic N Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    74        <field id="DON_e3t"      long_name="DON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DON * e3t </field > 
    75        <field id="DOP"          long_name="Dissolved organic P Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    76        <field id="DOP_e3t"      long_name="DOP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DOP * e3t </field > 
    77        <field id="PON"          long_name="Small PON Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    78        <field id="PON_e3t"      long_name="PON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PON * e3t </field > 
    79        <field id="POP"          long_name="Small POP Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    80        <field id="POP_e3t"      long_name="POP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > POP * e3t </field > 
    81        <field id="GON"          long_name="Big PON Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    82        <field id="GON_e3t"      long_name="GON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GON * e3t </field > 
    83        <field id="GOP"          long_name="Big POP Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    84        <field id="GOP_e3t"      long_name="GOP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GOP * e3t </field > 
    85        <field id="PHYN"         long_name="Nanophytoplankton N biomass"              unit="mmol/m3" /> 
    86        <field id="PHYN_e3t"     long_name="PHYN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHYN * e3t </field > 
    87        <field id="PHYP"         long_name="Nanophytoplankton P biomass"              unit="mmol/m3" /> 
    88        <field id="PHYP_e3t"     long_name="PHYP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHYP * e3t </field > 
    89        <field id="DIAN"         long_name="Diatoms N biomass"                        unit="mmol/m3" /> 
    90        <field id="DIAN_e3t"     long_name="DIAN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DIAN * e3t </field > 
    91        <field id="DIAP"         long_name="Diatoms P biomass"                        unit="mmol/m3" /> 
    92        <field id="DIAP_e3t"     long_name="DIAP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DIAP * e3t </field > 
    93        <field id="PIC"          long_name="Picophytoplankton C biomass"              unit="mmol/m3" /> 
    94        <field id="PIC_e3t"      long_name="PIC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PIC * e3t </field > 
    95        <field id="PICN"         long_name="Picophytoplankton N biomass"              unit="mmol/m3" /> 
    96        <field id="PICN_e3t"     long_name="PICN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PICN * e3t </field > 
    97        <field id="PICP"         long_name="Picophytoplankton P biomass"              unit="mmol/m3" /> 
    98        <field id="PICP_e3t"     long_name="PICP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PICP * e3t </field > 
    99        <field id="PFe"          long_name="Picophytoplankton Fe biomass"             unit="mmol/m3" /> 
    100        <field id="PFe_e3t"      long_name="PFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PFe * e3t </field > 
    101        <field id="PCHL"         long_name="Picophytoplankton Chl biomass"            unit="gChl/m3" /> 
    102        <field id="PCHL_e3t"     long_name="PCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PCHL * e3t </field > 
    103  
    104       <!-- PISCES with ligand parametisation : variables available namelist paramter ln_ligand --> 
    105        <field id="LGW"         long_name="Weak ligands concentration"                unit="mmol/m3" /> 
    106        <field id="LGW_e3t"     long_name="LGW * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > LGW * e3t </field > 
    107  
    108        <!-- PISCES light : variables available with ln_p2z  --> 
    109        <field id="DET"         long_name="Detritus"                                 unit="mmol-N/m3" /> 
    110        <field id="DET_e3t"     long_name="DET * e3t"                                unit="mmol-N/m2"  > DET * e3t </field > 
    111        <field id="DOM"         long_name="Dissolved Organic Matter"                 unit="mmol-N/m3" /> 
    112        <field id="DOM_e3t"     long_name="DOM * e3t"                                unit="mmol-N/m2"  > DOM * e3t </field > 
    113  
    114      </field_group> 
    115  
    116      <!-- SEDIMENT variables on T sediment grid  --> 
    117      <field_group id="sed_T" grid_ref="grid_T_3DS"> 
    118        <field id="SedDIC"          long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    119        <field id="SedAlkalini"     long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    120        <field id="SedO2"           long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    121        <field id="SedCaCO3"        long_name="Calcite Concentration"                    unit="%" /> 
    122        <field id="SedPOS"          long_name="Semi-ref POC Concentration"               unit="%" /> 
    123        <field id="SedPOR"          long_name="Refractory POC Concentration"             unit="%" /> 
    124        <field id="SedPO4"          long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    125        <field id="SedPOC"          long_name="Labile POC Concentration"                 unit="%" /> 
    126        <field id="SedSil"          long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    127        <field id="SedFe2"          long_name="Fe2+ Concentration"                       unit="mmol/m3" /> 
    128        <field id="SedBSi"          long_name="Biogenic Silicate Concentration"          unit="%" /> 
    129        <field id="SedNO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    130        <field id="SedNH4"          long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    131        <field id="SedH2S"          long_name="H2S Concentration"                        unit="mmol/m3" /> 
    132        <field id="SedSO4"          long_name="SO4 Concentration"                        unit="mmol/m3" /> 
    133        <field id="SedClay"         long_name="Clay Concentration"                       unit="%" /> 
    134        <field id="SedFeO"          long_name="Fe(OH)3 Concentration"                    unit="%" /> 
    135        <field id="SedFeS"          long_name="FeS Concentration"                        unit="%" /> 
    136        <field id="SedpH"           long_name="PH"                                       unit="1"          /> 
    137        <field id="SedCO3por"       long_name="Bicarbonates"                             unit="mol/m3" /> 
    138      </field_group> 
    139  
    140      <!-- SEDIMENT additional variables on T sediment grid  --> 
    141      <field_group id="Diag_S" grid_ref="grid_T_2D"> 
    142        <field id="FlxSi"       long_name="Si sediment flux"                        unit="mol/cm2/s"     /> 
    143        <field id="FlxO2"       long_name="O2 sediment flux"                        unit="mol/cm2/s"     /> 
    144        <field id="FlxDIC"      long_name="DIC sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
    145        <field id="FlxNO3"      long_name="NO3 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
    146        <field id="FlxPO4"      long_name="PO4 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
    147        <field id="FlxAlkalini" long_name="Alkalinity sediment flux"                unit="mol/cm2/s"     /> 
    148        <field id="FlxNH4"      long_name="Ammonium sediment flux"                  unit="mol/cm2/s"     /> 
    149        <field id="FlxH2S"      long_name="H2S sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
    150        <field id="FlxSO4"      long_name="SO4 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
    151        <field id="FlxFe2"      long_name="Fe2+ sediment flux"                      unit="mol/cm2/s"     /> 
    152        <field id="Flxtot"      long_name="Sediment net burial rate"                unit="cm/s"     /> 
    153        <field id="dzdep"       long_name="Sedimentation rate"                      unit="cm/s"     /> 
    154        <field id="sflxclay"    long_name="Clay sedimentation rate"                 unit="g/m2/s"     /> 
    155        <field id="sflxcal"     long_name="Calcite sedimentation rate"              unit="mol/m2/s"     /> 
    156        <field id="sflxbsi"     long_name="BSi Sedimentation rate"                  unit="mol/m2/s"     /> 
    157        <field id="sflxpoc"     long_name="POC Sedimentation rate"                  unit="mol/m2/s"     /> 
    158        <field id="sflxfeo"     long_name="Fe(OH)3 Sedimentation rate"              unit="mol/m2/s"     /> 
    159 </field_group> 
    160  
    161      <!-- PISCES additional diagnostics on T grid  --> 
    162  
    163      <field_group id="diad_T" grid_ref="grid_T_2D"> 
    164        <field id="PH"          long_name="PH"                                      unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    165        <field id="CO3"         long_name="Bicarbonates"                            unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    166        <field id="CO3sat"      long_name="CO3 saturation"                          unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    167        <field id="PAR"         long_name="Photosynthetically Available Radiation"  unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
    168        <field id="PARDM"       long_name="Daily mean PAR"                          unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
    169        <field id="PPPHYN"      long_name="Primary production of nanophyto"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    170        <field id="PPPHYP"      long_name="Primary production of picophyto"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    171        <field id="PPPHYD"      long_name="Primary production of diatoms"           unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    172        <field id="PPNEWN"      long_name="New Primary production of nanophyto"     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    173        <field id="PPNEWP"      long_name="New Primary production of picophyto"     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    174        <field id="PPNEWD"      long_name="New Primary production of diatoms"       unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    175        <field id="PBSi"        long_name="Primary production of Si diatoms"        unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    176        <field id="PFeN"        long_name="Primary production of nano iron"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    177        <field id="PFeP"        long_name="Primary production of pico iron"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    178        <field id="PFeD"        long_name="Primary production of diatoms iron"      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    179        <field id="xfracal"     long_name="Calcifying fraction"                     unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    180        <field id="PCAL"        long_name="Calcite production"                      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    181        <field id="DCAL"        long_name="Calcite dissolution"                     unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    182        <field id="GRAZ1"       long_name="Grazing by microzooplankton"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    183        <field id="GRAZ2"       long_name="Grazing by mesozooplankton"              unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    184        <field id="REMIN"       long_name="Oxic remineralization of OM"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    185        <field id="DENIT"       long_name="Anoxic remineralization of OM"           unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    186        <field id="REMINP"       long_name="Oxic remineralization rate of POC"      unit="d-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    187        <field id="REMING"       long_name="Oxic remineralization rate of GOC"      unit="d-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    188        <field id="Nfix"        long_name="Nitrogen fixation"                       unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    189        <field id="Mumax"       long_name="Maximum growth rate"                     unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    190        <field id="MuN"         long_name="Realized growth rate for nanophyto"      unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    191        <field id="MuP"         long_name="Realized growth rate for picophyto"      unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    192        <field id="MuD"         long_name="Realized growth rate for diatomes"       unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    193        <field id="MunetN"      long_name="Net growth rate for nanophyto"           unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    194        <field id="MunetP"      long_name="Net growth rate for picophyto"           unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    195        <field id="MunetD"      long_name="Net growth rate for diatomes"            unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    196        <field id="LNnut"       long_name="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    197        <field id="LPnut"       long_name="Nutrient limitation term in Picophyto"   unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    198        <field id="LDnut"       long_name="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    199        <field id="LNFe"        long_name="Iron limitation term in Nanophyto"       unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    200        <field id="LPFe"        long_name="Iron limitation term in Picophyto"       unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    201        <field id="LDFe"        long_name="Iron limitation term in Diatoms"         unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    202        <field id="LNlight"     long_name="Light limitation term in Nanophyto"      unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    203        <field id="LPlight"     long_name="Light limitation term in Picophyto"      unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    204        <field id="LDlight"     long_name="Light limitation term in Diatoms"        unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
    205        <field id="SIZEN"       long_name="Mean relative size of nanophyto."        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    206        <field id="SIZEP"       long_name="Mean relative size of picophyto."        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    207        <field id="SIZED"       long_name="Mean relative size of diatoms"           unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    208        <field id="Fe3"         long_name="Iron III concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    209        <field id="FeL1"        long_name="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    210        <field id="TL1"         long_name="Total L1 concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    211        <field id="pdust"       long_name="dust concentration"                      unit="g/m3"                            /> 
    212        <field id="Totlig"      long_name="Total ligand concentation"               unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    213        <field id="Biron"       long_name="Bioavailable iron"                       unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    214        <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="mol/m2/s"                        /> 
    215        <field id="Ironice"     long_name="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="mol/m2/s"                        /> 
    216        <field id="SedCal"      long_name="Calcite burial in the sediments"         unit="molC/m2/s"                       /> 
    217        <field id="SedSi"       long_name="Silicon burial in the sediments"         unit="molSi/m2/s"                      /> 
    218        <field id="SedC"        long_name="Organic C burial in the sediments"       unit="molC/m2/s"                       /> 
    219        <field id="HYDR"        long_name="Iron input from hydrothemal vents"       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    220        <field id="EPC100"      long_name="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                        /> 
    221        <field id="EPFE100"     long_name="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                        /> 
    222        <field id="EPSI100"     long_name="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                        /> 
    223        <field id="EPCAL100"    long_name="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                        /> 
    224        <field id="EXPC"        long_name="Export of carbon"                        unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    225        <field id="EXPFE"       long_name="Export of biogenic iron"                 unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    226        <field id="EXPSI"       long_name="Export of Silicate"                      unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    227        <field id="EXPCAL"      long_name="Export of Calcite"                       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    228        <field id="Cflx"        long_name="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                        /> 
    229        <field id="Oflx"        long_name="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                        /> 
    230        <field id="Kg"          long_name="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                   /> 
    231        <field id="Dpco2"       long_name="Delta CO2"                               unit="uatm"                            /> 
    232        <field id="pCO2sea"     long_name="surface ocean pCO2"                      unit="uatm"                            /> 
    233        <field id="Dpo2"        long_name="Delta O2"                                unit="uatm"                            /> 
    234        <field id="Heup"        long_name="Euphotic layer depth"                    unit="m"                               /> 
    235        <field id="AtmCo2"      long_name="Atmospheric CO2 concentration"           unit="ppm"                               /> 
    236        <field id="Irondep"     long_name="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                        /> 
    237        <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    238        <field id="FESCAV"      long_name="Scavenging of Iron"                      unit="mmol-Fe/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    239        <field id="FECOLL"      long_name="Colloidal Pumping of FeL"                unit="mmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    240        <field id="LGWCOLL"     long_name="Coagulation loss of ligands"             unit="mmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    241        <field id="REMINF"      long_name="Oxic remineralization suppy of Fe"       unit="mmol-Fe/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    242        <field id="BACT"        long_name="Bacterial Biomass"                       unit="mmol/m3"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    243        <field id="FEBACT"      long_name="Bacterial uptake of Fe"                  unit="molFe/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    244        <field id="LPRODR"      long_name="OM remineralisation ligand production rate" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    245        <field id="LPRODP"      long_name="phytoplankton ligand production rate"    unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    246        <field id="LIGREM"      long_name="Remineralisation loss of ligands"        unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    247        <field id="LIGPR"       long_name="Photochemical loss of ligands"           unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    248        <field id="LDETP"       long_name="Ligand destruction during phytoplankton uptake" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    249        <field id="LPRODZ2"     long_name="mesozooplankton ligand production rate"  unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    250        <field id="LPRODZ"      long_name="microzooplankton ligand production rate" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    251        <field id="FEZOO"       long_name="microzooplankton iron recycling rate"    unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    252        <field id="FEZOO2"      long_name="mesozooplankton iron recycling rate"     unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    253  
    254        <!-- PISCES tracers trends --> 
    255        <field id="INTdtAlk"    long_name="Vertically int. of change of alkalinity"             unit="mol/m2/s"                       /> 
    256        <field id="INTdtDIC"    long_name="Vertically int. of change of dissic    "             unit="mol/m2/s"                       /> 
    257        <field id="INTdtFer"    long_name="Vertically int. of change of iron      "             unit="mol/m2/s"                       /> 
    258        <field id="INTdtDIN"    long_name="Vertically int. of change of nitrogen  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
    259        <field id="INTdtDIP"    long_name="Vertically int. of change of phophate  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
    260        <field id="INTdtSil"    long_name="Vertically int. of change of silicon   "             unit="mol/m2/s"                       /> 
    261  
    262  
    263        <!-- dbio_T on T grid : variables available with diaar5 --> 
    264        <field id="TPP"         long_name="Total Primary production of phyto"                   unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    265        <field id="TPNEW"       long_name="New Primary production of phyto"                     unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    266        <field id="TPBFE"       long_name="Total biogenic iron production"                      unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    267        <field id="INTDIC"      long_name="DIC content"                                         unit="kg/m2"                          /> 
    268        <field id="O2MIN"       long_name="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol/m3"                          /> 
    269        <field id="ZO2MIN"      long_name="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"                              /> 
    270        <field id="INTNFIX"     long_name="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > Nfix * e3t </field > 
    271        <field id="INTPPPHYN"   long_name="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYN * e3t </field > 
    272        <field id="INTPPPHYD"   long_name="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYD * e3t </field >                     
    273        <field id="INTPPPHYP"   long_name="Vertically integrated primary production by picophy" unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYP * e3t </field >                     
    274        <field id="INTPP"       long_name="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPP * e3t </field >                             
    275        <field id="INTPNEW"     long_name="Vertically integrated new primary production"        unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPNEW * e3t </field >                 
    276        <field id="INTPBFE"     long_name="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPBFE * e3t </field >                            
    277        <field id="INTPBSI"     long_name="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PBSi * e3t </field >                            
    278  
    279        <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
    280        <field id="FNO3PHY"     long_name="FNO3PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
    281        <field id="FNH4PHY"     long_name="FNH4PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
    282        <field id="FNH4NO3"     long_name="FNH4NO3"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
    283        <field id="TNO3PHY"     long_name="TNO3PHY"                                 unit=""  />  
    284        <field id="TNH4PHY"     long_name="TNH4PHY"                                 unit=""  />  
    285        <field id="TPHYDOM"     long_name="TPHYDOM"                                 unit=""  />  
    286        <field id="TPHYNH4"     long_name="TPHYNH4"                                 unit=""  />  
    287        <field id="TPHYZOO"     long_name="TPHYZOO"                                 unit=""  />  
    288        <field id="TPHYDET"     long_name="TPHYDET"                                 unit=""  />  
    289        <field id="TDETZOO"     long_name="TDETZOO"                                 unit=""  />  
    290        <field id="TZOODET"     long_name="TZOODET"                                 unit=""  />  
    291        <field id="TZOOBOD"     long_name="TZOOBOD"                                 unit=""  />  
    292        <field id="TZOONH4"     long_name="TZOONH4"                                 unit=""  />  
    293        <field id="TZOODOM"     long_name="TZOODOM"                                 unit=""  />  
    294        <field id="TNH4NO3"     long_name="TNH4NO3"                                 unit=""  />  
    295        <field id="TDOMNH4"     long_name="TDOMNH4"                                 unit=""  />  
    296        <field id="TDETNH4"     long_name="TDETNH4"                                 unit=""  />  
    297        <field id="TPHYTOT"     long_name="TPHYTOT"                                 unit=""  />  
    298        <field id="TZOOTOT"     long_name="TZOOTOT"                                 unit=""  />  
    299        <field id="SEDPOC"      long_name="SEDPOC"                                  unit=""  />  
    300        <field id="TDETSED"     long_name="TDETSED"                                 unit=""  />  
    301      </field_group> 
    302  
    303      <field_group id="tracer_scalar"  grid_ref="grid_scalar"  > 
    304      <!-- PISCES scalar  --> 
    305        <field id="pno3tot"         long_name="Global mean nitrate concentration"                  unit="mol/m3"   /> 
    306        <field id="ppo4tot"         long_name="global mean phosphorus concentration"               unit="mol/m3"   /> 
    307        <field id="psiltot"         long_name="Global mean silicate concentration"                 unit="mol/m3"   /> 
    308        <field id="palktot"         long_name="Global mean alkalinity concentration"               unit="mol/m3"   /> 
    309        <field id="pfertot"         long_name="Global mean iron concentration"                     unit="mol/m3"   /> 
    310        <field id="tcflx"           long_name="Total Flux of Carbon out of the ocean"              unit="mol/s"   /> 
    311        <field id="tcflxcum"        long_name="Cumulative total Flux of Carbon out of the ocean"   unit="mol/s"   /> 
    312        <field id="tcexp"           long_name="Total Carbon export at 100m"                        unit="mol/s"   /> 
    313        <field id="tintpp"          long_name="Global total integrated primary production"         unit="mol/s"   /> 
    314        <field id="tnfix"           long_name="Global total nitrogen fixation"                     unit="mol/s"   /> 
    315        <field id="tdenit"          long_name="Total denitrification"                              unit="mol/s"   /> 
    316      </field_group> 
    317  
    318    </field_definition> 
     9--> 
     10<field_definition level="1" prec="4" operation="average" enabled=".TRUE." default_value="1.e20" > <!-- time step automaticaly defined --> 
     11 
     12  <!-- 
     13      ============================================================================================================ 
     14      Biogeochemistry model variables 
     15      ============================================================================================================ 
     16  --> 
     17 
     18  <!-- ptrc on T grid --> 
     19 
     20  <field_group id="ptrc_T" grid_ref="grid_T_3D"> 
     21    <!-- PISCES standard : variables available with ln_p4z  --> 
     22    <field id="DIC"          long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     23    <field id="DIC_e3t"      long_name="DIC * e3t"                                unit="mmol/m2" > DIC * e3t </field > 
     24    <field id="Alkalini"     long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     25    <field id="Alkalini_e3t" long_name="Alkalini * e3t"                           unit="mmol/m2"  > Alkalini * e3t </field > 
     26    <field id="O2"           long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
     27    <field id="O2_e3t"       long_name="O2 * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > O2 * e3t </field > 
     28    <field id="CaCO3"        long_name="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     29    <field id="CaCO3_e3t"    long_name="CaCO3 * e3t"                              unit="mmol/m2"  > CaCO3 * e3t </field > 
     30    <field id="PO4"          long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     31    <field id="PO4_e3t"      long_name="PO4 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PO4 * e3t </field > 
     32    <field id="POC"          long_name="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     33    <field id="POC_e3t"      long_name="POC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > POC * e3t </field > 
     34    <field id="Si"           long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     35    <field id="Si_e3t"       long_name="Si * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > Si * e3t </field > 
     36    <field id="PHY"          long_name="(Nano)Phytoplankton Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     37    <field id="PHY_e3t"      long_name="PHY * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PHY * e3t </field > 
     38    <field id="ZOO"          long_name="(Micro)Zooplankton Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     39    <field id="ZOO_e3t"      long_name="ZOO2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > ZOO * e3t </field > 
     40    <field id="DOC"          long_name="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     41    <field id="DOC_e3t"      long_name="DOC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DOC * e3t </field > 
     42    <field id="PHY2"         long_name="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     43    <field id="PHY2_e3t"     long_name="PHY2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHY2 * e3t </field > 
     44    <field id="ZOO2"         long_name="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
     45    <field id="ZOO2_e3t"     long_name="ZOO2 * e3t"                               unit="mmol/m2"  > ZOO2 * e3t </field > 
     46    <field id="DSi"          long_name="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     47    <field id="DSi_e3t"      long_name="Dsi * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DSi * e3t </field > 
     48    <field id="Fer"          long_name="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
     49    <field id="Fer_e3t"      long_name="Fer * e3t"                                unit="mmol/m2"  > Fer * e3t </field > 
     50    <field id="BFe"          long_name="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     51    <field id="BFe_e3t"      long_name="BFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > BFe * e3t </field > 
     52    <field id="GOC"          long_name="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     53    <field id="GOC_e3t"      long_name="GOC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GOC * e3t </field > 
     54    <field id="SFe"          long_name="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     55    <field id="SFe_e3t"      long_name="SFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > SFe * e3t </field > 
     56    <field id="DFe"          long_name="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
     57    <field id="DFe_e3t"      long_name="DFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DFe * e3t </field > 
     58    <field id="GSi"          long_name="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
     59    <field id="GSi_e3t"      long_name="GSi * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GSi * e3t </field > 
     60    <field id="NFe"          long_name="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     61    <field id="NFe_e3t"      long_name="NFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NFe * e3t </field > 
     62    <field id="NCHL"         long_name="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/m3"   /> 
     63    <field id="NCHL_e3t"     long_name="NCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > NCHL * e3t </field > 
     64    <field id="DCHL"         long_name="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/m3"   /> 
     65    <field id="DCHL_e3t"     long_name="DCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DCHL * e3t </field > 
     66    <field id="NO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     67    <field id="NO3_e3t"      long_name="NO3 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NO3 * e3t </field > 
     68    <field id="NH4"          long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     69    <field id="NH4_e3t"      long_name="NH4 * e3t"                                unit="mmol/m2"  > NH4 * e3t </field > 
     70 
     71    <!-- PISCES quota : variables available with ln_p5z  --> 
     72 
     73    <field id="DON"          long_name="Dissolved organic N Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     74    <field id="DON_e3t"      long_name="DON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DON * e3t </field > 
     75    <field id="DOP"          long_name="Dissolved organic P Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     76    <field id="DOP_e3t"      long_name="DOP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > DOP * e3t </field > 
     77    <field id="PON"          long_name="Small PON Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     78    <field id="PON_e3t"      long_name="PON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PON * e3t </field > 
     79    <field id="POP"          long_name="Small POP Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     80    <field id="POP_e3t"      long_name="POP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > POP * e3t </field > 
     81    <field id="GON"          long_name="Big PON Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     82    <field id="GON_e3t"      long_name="GON * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GON * e3t </field > 
     83    <field id="GOP"          long_name="Big POP Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     84    <field id="GOP_e3t"      long_name="GOP * e3t"                                unit="mmol/m2"  > GOP * e3t </field > 
     85    <field id="PHYN"         long_name="Nanophytoplankton N biomass"              unit="mmol/m3" /> 
     86    <field id="PHYN_e3t"     long_name="PHYN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHYN * e3t </field > 
     87    <field id="PHYP"         long_name="Nanophytoplankton P biomass"              unit="mmol/m3" /> 
     88    <field id="PHYP_e3t"     long_name="PHYP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PHYP * e3t </field > 
     89    <field id="DIAN"         long_name="Diatoms N biomass"                        unit="mmol/m3" /> 
     90    <field id="DIAN_e3t"     long_name="DIAN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DIAN * e3t </field > 
     91    <field id="DIAP"         long_name="Diatoms P biomass"                        unit="mmol/m3" /> 
     92    <field id="DIAP_e3t"     long_name="DIAP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > DIAP * e3t </field > 
     93    <field id="PIC"          long_name="Picophytoplankton C biomass"              unit="mmol/m3" /> 
     94    <field id="PIC_e3t"      long_name="PIC * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PIC * e3t </field > 
     95    <field id="PICN"         long_name="Picophytoplankton N biomass"              unit="mmol/m3" /> 
     96    <field id="PICN_e3t"     long_name="PICN * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PICN * e3t </field > 
     97    <field id="PICP"         long_name="Picophytoplankton P biomass"              unit="mmol/m3" /> 
     98    <field id="PICP_e3t"     long_name="PICP * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PICP * e3t </field > 
     99    <field id="PFe"          long_name="Picophytoplankton Fe biomass"             unit="mmol/m3" /> 
     100    <field id="PFe_e3t"      long_name="PFe * e3t"                                unit="mmol/m2"  > PFe * e3t </field > 
     101    <field id="PCHL"         long_name="Picophytoplankton Chl biomass"            unit="gChl/m3" /> 
     102    <field id="PCHL_e3t"     long_name="PCHL * e3t"                               unit="mmol/m2"  > PCHL * e3t </field > 
     103 
     104    <!-- PISCES with ligand parametisation : variables available namelist paramter ln_ligand --> 
     105    <field id="LGW"         long_name="Weak ligands concentration"                unit="mmol/m3" /> 
     106    <field id="LGW_e3t"     long_name="LGW * e3t"                                 unit="mmol/m2"  > LGW * e3t </field > 
     107 
     108    <!-- PISCES light : variables available with ln_p2z  --> 
     109    <field id="DET"         long_name="Detritus"                                 unit="mmol-N/m3" /> 
     110    <field id="DET_e3t"     long_name="DET * e3t"                                unit="mmol-N/m2"  > DET * e3t </field > 
     111    <field id="DOM"         long_name="Dissolved Organic Matter"                 unit="mmol-N/m3" /> 
     112    <field id="DOM_e3t"     long_name="DOM * e3t"                                unit="mmol-N/m2"  > DOM * e3t </field > 
     113 
     114  </field_group> 
     115 
     116  <!-- SEDIMENT variables on T sediment grid  --> 
     117  <field_group id="sed_T" grid_ref="grid_T_3DS"> 
     118    <field id="SedDIC"          long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     119    <field id="SedAlkalini"     long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     120    <field id="SedO2"           long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
     121    <field id="SedCaCO3"        long_name="Calcite Concentration"                    unit="%" /> 
     122    <field id="SedPOS"          long_name="Semi-ref POC Concentration"               unit="%" /> 
     123    <field id="SedPOR"          long_name="Refractory POC Concentration"             unit="%" /> 
     124    <field id="SedPO4"          long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     125    <field id="SedPOC"          long_name="Labile POC Concentration"                 unit="%" /> 
     126    <field id="SedSil"          long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     127    <field id="SedFe2"          long_name="Fe2+ Concentration"                       unit="mmol/m3" /> 
     128    <field id="SedBSi"          long_name="Biogenic Silicate Concentration"          unit="%" /> 
     129    <field id="SedNO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     130    <field id="SedNH4"          long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     131    <field id="SedH2S"          long_name="H2S Concentration"                        unit="mmol/m3" /> 
     132    <field id="SedSO4"          long_name="SO4 Concentration"                        unit="mmol/m3" /> 
     133    <field id="SedClay"         long_name="Clay Concentration"                       unit="%" /> 
     134    <field id="SedFeO"          long_name="Fe(OH)3 Concentration"                    unit="%" /> 
     135    <field id="SedFeS"          long_name="FeS Concentration"                        unit="%" /> 
     136    <field id="SedpH"           long_name="PH"                                       unit="1"          /> 
     137    <field id="SedCO3por"       long_name="Bicarbonates"                             unit="mol/m3" /> 
     138  </field_group> 
     139 
     140  <!-- SEDIMENT additional variables on T sediment grid  --> 
     141  <field_group id="Diag_S" grid_ref="grid_T_2D"> 
     142    <field id="FlxSi"       long_name="Si sediment flux"                        unit="mol/cm2/s"     /> 
     143    <field id="FlxO2"       long_name="O2 sediment flux"                        unit="mol/cm2/s"     /> 
     144    <field id="FlxDIC"      long_name="DIC sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
     145    <field id="FlxNO3"      long_name="NO3 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
     146    <field id="FlxPO4"      long_name="PO4 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
     147    <field id="FlxAlkalini" long_name="Alkalinity sediment flux"                unit="mol/cm2/s"     /> 
     148    <field id="FlxNH4"      long_name="Ammonium sediment flux"                  unit="mol/cm2/s"     /> 
     149    <field id="FlxH2S"      long_name="H2S sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
     150    <field id="FlxSO4"      long_name="SO4 sediment flux"                       unit="mol/cm2/s"     /> 
     151    <field id="FlxFe2"      long_name="Fe2+ sediment flux"                      unit="mol/cm2/s"     /> 
     152    <field id="Flxtot"      long_name="Sediment net burial rate"                unit="cm/s"     /> 
     153    <field id="dzdep"       long_name="Sedimentation rate"                      unit="cm/s"     /> 
     154    <field id="sflxclay"    long_name="Clay sedimentation rate"                 unit="g/m2/s"     /> 
     155    <field id="sflxcal"     long_name="Calcite sedimentation rate"              unit="mol/m2/s"     /> 
     156    <field id="sflxbsi"     long_name="BSi Sedimentation rate"                  unit="mol/m2/s"     /> 
     157    <field id="sflxpoc"     long_name="POC Sedimentation rate"                  unit="mol/m2/s"     /> 
     158    <field id="sflxfeo"     long_name="Fe(OH)3 Sedimentation rate"              unit="mol/m2/s"     /> 
     159  </field_group> 
     160 
     161  <!-- PISCES additional diagnostics on T grid  --> 
     162 
     163  <field_group id="diad_T" grid_ref="grid_T_2D"> 
     164    <field id="PH"          long_name="PH"                                      unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     165    <field id="CO3"         long_name="Bicarbonates"                            unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
     166    <field id="CO3sat"      long_name="CO3 saturation"                          unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
     167    <field id="PAR"         long_name="Photosynthetically Available Radiation"  unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     168    <field id="PARDM"       long_name="Daily mean PAR"                          unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     169    <field id="PPPHYN"      long_name="Primary production of nanophyto"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     170    <field id="PPPHYP"      long_name="Primary production of picophyto"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     171    <field id="PPPHYD"      long_name="Primary production of diatoms"           unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     172    <field id="PPNEWN"      long_name="New Primary production of nanophyto"     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     173    <field id="PPNEWP"      long_name="New Primary production of picophyto"     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     174    <field id="PPNEWD"      long_name="New Primary production of diatoms"       unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     175    <field id="PBSi"        long_name="Primary production of Si diatoms"        unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     176    <field id="PFeN"        long_name="Primary production of nano iron"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     177    <field id="PFeP"        long_name="Primary production of pico iron"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     178    <field id="PFeD"        long_name="Primary production of diatoms iron"      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     179    <field id="xfracal"     long_name="Calcifying fraction"                     unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     180    <field id="PCAL"        long_name="Calcite production"                      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     181    <field id="DCAL"        long_name="Calcite dissolution"                     unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     182    <field id="GRAZ1"       long_name="Grazing by microzooplankton"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     183    <field id="GRAZ2"       long_name="Grazing by mesozooplankton"              unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     184    <field id="REMIN"       long_name="Oxic remineralization of OM"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     185    <field id="DENIT"       long_name="Anoxic remineralization of OM"           unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     186    <field id="REMINP"       long_name="Oxic remineralization rate of POC"      unit="d-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     187    <field id="REMING"       long_name="Oxic remineralization rate of GOC"      unit="d-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     188    <field id="Nfix"        long_name="Nitrogen fixation"                       unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     189    <field id="Mumax"       long_name="Maximum growth rate"                     unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     190    <field id="MuN"         long_name="Realized growth rate for nanophyto"      unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     191    <field id="MuP"         long_name="Realized growth rate for picophyto"      unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     192    <field id="MuD"         long_name="Realized growth rate for diatomes"       unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     193    <field id="MunetN"      long_name="Net growth rate for nanophyto"           unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     194    <field id="MunetP"      long_name="Net growth rate for picophyto"           unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     195    <field id="MunetD"      long_name="Net growth rate for diatomes"            unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     196    <field id="LNnut"       long_name="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     197    <field id="LPnut"       long_name="Nutrient limitation term in Picophyto"   unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     198    <field id="LDnut"       long_name="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     199    <field id="LNFe"        long_name="Iron limitation term in Nanophyto"       unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     200    <field id="LPFe"        long_name="Iron limitation term in Picophyto"       unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     201    <field id="LDFe"        long_name="Iron limitation term in Diatoms"         unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     202    <field id="LNlight"     long_name="Light limitation term in Nanophyto"      unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     203    <field id="LPlight"     long_name="Light limitation term in Picophyto"      unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     204    <field id="LDlight"     long_name="Light limitation term in Diatoms"        unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     205    <field id="SIZEN"       long_name="Mean relative size of nanophyto."        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     206    <field id="SIZEP"       long_name="Mean relative size of picophyto."        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     207    <field id="SIZED"       long_name="Mean relative size of diatoms"           unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     208    <field id="Fe3"         long_name="Iron III concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     209    <field id="FeL1"        long_name="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     210    <field id="TL1"         long_name="Total L1 concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     211    <field id="pdust"       long_name="dust concentration"                      unit="g/m3"                            /> 
     212    <field id="Totlig"      long_name="Total ligand concentation"               unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     213    <field id="Biron"       long_name="Bioavailable iron"                       unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     214    <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="mol/m2/s"                        /> 
     215    <field id="Ironice"     long_name="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="mol/m2/s"                        /> 
     216    <field id="SedCal"      long_name="Calcite burial in the sediments"         unit="molC/m2/s"                       /> 
     217    <field id="SedSi"       long_name="Silicon burial in the sediments"         unit="molSi/m2/s"                      /> 
     218    <field id="SedC"        long_name="Organic C burial in the sediments"       unit="molC/m2/s"                       /> 
     219    <field id="HYDR"        long_name="Iron input from hydrothemal vents"       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     220    <field id="EPC100"      long_name="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                        /> 
     221    <field id="EPFE100"     long_name="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                        /> 
     222    <field id="EPSI100"     long_name="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                        /> 
     223    <field id="EPCAL100"    long_name="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                        /> 
     224    <field id="EXPC"        long_name="Export of carbon"                        unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     225    <field id="EXPFE"       long_name="Export of biogenic iron"                 unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     226    <field id="EXPSI"       long_name="Export of Silicate"                      unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     227    <field id="EXPCAL"      long_name="Export of Calcite"                       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     228    <field id="Cflx"        long_name="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                        /> 
     229    <field id="Oflx"        long_name="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                        /> 
     230    <field id="Kg"          long_name="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                   /> 
     231    <field id="Dpco2"       long_name="Delta CO2"                               unit="uatm"                            /> 
     232    <field id="pCO2sea"     long_name="surface ocean pCO2"                      unit="uatm"                            /> 
     233    <field id="Dpo2"        long_name="Delta O2"                                unit="uatm"                            /> 
     234    <field id="Heup"        long_name="Euphotic layer depth"                    unit="m"                               /> 
     235    <field id="AtmCo2"      long_name="Atmospheric CO2 concentration"           unit="ppm"                               /> 
     236    <field id="Irondep"     long_name="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                        /> 
     237    <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     238    <field id="FESCAV"      long_name="Scavenging of Iron"                      unit="mmol-Fe/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     239    <field id="FECOLL"      long_name="Colloidal Pumping of FeL"                unit="mmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     240    <field id="LGWCOLL"     long_name="Coagulation loss of ligands"             unit="mmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     241    <field id="REMINF"      long_name="Oxic remineralization suppy of Fe"       unit="mmol-Fe/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     242    <field id="BACT"        long_name="Bacterial Biomass"                       unit="mmol/m3"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     243    <field id="FEBACT"      long_name="Bacterial uptake of Fe"                  unit="molFe/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     244    <field id="LPRODR"      long_name="OM remineralisation ligand production rate" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     245    <field id="LPRODP"      long_name="phytoplankton ligand production rate"    unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     246    <field id="LIGREM"      long_name="Remineralisation loss of ligands"        unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     247    <field id="LIGPR"       long_name="Photochemical loss of ligands"           unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     248    <field id="LDETP"       long_name="Ligand destruction during phytoplankton uptake" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     249    <field id="LPRODZ2"     long_name="mesozooplankton ligand production rate"  unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     250    <field id="LPRODZ"      long_name="microzooplankton ligand production rate" unit="nmol-L/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     251    <field id="FEZOO"       long_name="microzooplankton iron recycling rate"    unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     252    <field id="FEZOO2"      long_name="mesozooplankton iron recycling rate"     unit="nmol-FeL/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     253 
     254    <!-- PISCES tracers trends --> 
     255    <field id="INTdtAlk"    long_name="Vertically int. of change of alkalinity"             unit="mol/m2/s"                       /> 
     256    <field id="INTdtDIC"    long_name="Vertically int. of change of dissic    "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     257    <field id="INTdtFer"    long_name="Vertically int. of change of iron      "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     258    <field id="INTdtDIN"    long_name="Vertically int. of change of nitrogen  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     259    <field id="INTdtDIP"    long_name="Vertically int. of change of phophate  "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     260    <field id="INTdtSil"    long_name="Vertically int. of change of silicon   "             unit="mol/m2/s"                       /> 
     261 
     262 
     263    <!-- dbio_T on T grid : variables available with diaar5 --> 
     264    <field id="TPP"         long_name="Total Primary production of phyto"                   unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     265    <field id="TPNEW"       long_name="New Primary production of phyto"                     unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     266    <field id="TPBFE"       long_name="Total biogenic iron production"                      unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     267    <field id="INTDIC"      long_name="DIC content"                                         unit="kg/m2"                          /> 
     268    <field id="O2MIN"       long_name="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol/m3"                          /> 
     269    <field id="ZO2MIN"      long_name="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"                              /> 
     270    <field id="INTNFIX"     long_name="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > Nfix * e3t </field > 
     271    <field id="INTPPPHYN"   long_name="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYN * e3t </field > 
     272    <field id="INTPPPHYD"   long_name="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYD * e3t </field > 
     273    <field id="INTPPPHYP"   long_name="Vertically integrated primary production by picophy" unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PPPHYP * e3t </field > 
     274    <field id="INTPP"       long_name="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPP * e3t </field > 
     275    <field id="INTPNEW"     long_name="Vertically integrated new primary production"        unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPNEW * e3t </field > 
     276    <field id="INTPBFE"     long_name="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > TPBFE * e3t </field > 
     277    <field id="INTPBSI"     long_name="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_vsum"  detect_missing_value="true" > PBSi * e3t </field > 
     278 
     279    <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
     280    <field id="FNO3PHY"     long_name="FNO3PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     281    <field id="FNH4PHY"     long_name="FNH4PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" /> 
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     283    <field id="TNO3PHY"     long_name="TNO3PHY"                                 unit=""  /> 
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Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.