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Changeset 2528 for trunk/NEMOGCM/CONFIG – NEMO

Changeset 2528 for trunk/NEMOGCM/CONFIG


Ignore:
Timestamp:
2010-12-27T18:33:53+01:00 (13 years ago)
Author:
rblod
Message:

Update NEMOGCM from branch nemo_v3_3_beta

Location:
trunk/NEMOGCM/CONFIG
Files:
18 deleted
100 edited
12 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/AA_job

    • Property svn:eol-style deleted
    r2521 r2528  
    9595#- Namelist for the configuration  
    9696cp ${R_EXPER}/namelist namelist 
    97 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    98 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    99  
    10097ls -alF 
    10198 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/iodef.xml

    r1772 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    133133   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    134134   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    135    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
     135   <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                 /> 
    136136   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    137137   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    138    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
     138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
    139139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    150151   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    151152   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    152    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
     153   <field id="voce_eff"     description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                 /> 
    153154   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    154155   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    155    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
     156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
    156157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    166168      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    167169   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    168    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
     170   <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    169171   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    232233 
    233234      <group id="2d" output_freq="172800" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2d files --> 
    234  
    235         <file id="2d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    236           <field ref="sst"          name="sosstsst"  /> 
    237      <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    238      <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    239         </file> 
    240  
    241235      </group> 
    242236 
     
    249243     <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    250244     <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    251      <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
     245     <field ref="emp-rnf"      name="sowaflup"  /> 
    252246     <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    253      <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
     247     <field ref="emps-rnf"     name="sowaflcd"  /> 
    254248     <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    255249     <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/namelist

    • Property svn:eol-style deleted
    r2467 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    14 !  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
    1516 
    1617!!====================================================================== 
    1718!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1819!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     20!!   namrun        parameters of the run 
     21!!====================================================================== 
     22! 
    2223!----------------------------------------------------------------------- 
    2324&namrun        !   parameters of the run 
     
    2627   cn_exp      =  "GYRE"   !  experience name  
    2728   nn_it000    =       1   !  first time step 
    28    nn_itend    =    4320   !  last  time step (std 5475) 
    29    nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
     29   nn_itend    =    4320   !  last  time step 
     30   nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nn_rstctl=1) 
    3031   nn_leapy    =      30   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
     32   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
     33   nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nn_it000 is not compared to the restart file value 
     34                               !                  = 1 use nn_date0 in namelist (not the value in the restart file) 
     35                               !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
     36   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     37   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    3138   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    3239   nn_stock    =    4320   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    33    nn_write    =      60   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
     40   nn_write    =      60   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    3441   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    3542   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    3643   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
    37    nn_chunksz  = 0         !  chunksize (bytes) for NetCDF file (working only with iom_nf90 routines) 
    38    ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    39    nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
    40                                !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
    41                                !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    42    cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    43    cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    44 / 
     44   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
     45/ 
     46 
    4547!!====================================================================== 
    4648!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    4951!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    5052!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    51 !!====================================================================== 
    52  
     53!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     54!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     55!!====================================================================== 
     56! 
    5357!----------------------------------------------------------------------- 
    5458&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    6367   rn_sbot_min =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
    6468   rn_sbot_max = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
    65    rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    66    rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    67    rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     69   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=rn_theta<=20) 
     70   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=rn_thetb<= 1) 
     71   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<rn_max<1) 
    6872   ln_s_sigma  = .false.   !  hybrid s-sigma coordinates 
    6973   rn_bb       =    0.8    !  stretching with s-sigma 
     
    7377&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    7478!----------------------------------------------------------------------- 
    75    nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read(=1) the bathymetry file 
    76    nn_closea    =   0      !  closed seas and lakes are removed (=0) or kept (=1) from the ORCA domain 
    77    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
    78    rn_e3zps_min=    5.     !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
    79    rn_e3zps_rat=    0.1    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
     79   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
     80   nn_closea    =   0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     81   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     82   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     83   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     84   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1 
    8085                           ! 
    81    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0)   ==> 5760 
    82    nn_baro     =   60      !  number of barotropic time step (for the split explicit algorithm) ("key_dynspg_ts") 
     86   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     87   nn_baro     =   60      !  number of barotropic time step           ("key_dynspg_ts") 
    8388   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    8489   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    8590                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    86    rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
    87    rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
    88    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    89 / 
     91   rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     92   rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     93   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step (used if nn_acc=1) 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    90114!!====================================================================== 
    91115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    92116!!====================================================================== 
    93 !!   namsbc        surface boundary condition 
    94 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    95 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    96 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    97 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    98 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    99 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    100 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    101 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    102 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    103 !!====================================================================== 
    104  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    105131!----------------------------------------------------------------------- 
    106132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    107133!----------------------------------------------------------------------- 
    108134   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation  
    109                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    110    ln_ana      = .true.    !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    111    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    112    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    113    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    114    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .true.    !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    115142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    116143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    117                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
    118    nn_ico_cpl  = 0         !  ice-ocean coupling : =0 each nn_fsbc  
    119                            !                       =1 stresses recomputed each ocean time step ("key_lim3" only) 
    120                            !                       =2 combination of 0 and 1 cases             ("key_lim3" only) 
    121    ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    122    ln_rnf      = .false.   !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    123    ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
    124    nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked                              ,  
    125                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each nn_fsbc time step   , 
    126                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    127                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
     146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
     148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    128152/ 
    129153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    140164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    141165!----------------------------------------------------------------------- 
    142 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    143 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    144    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    145    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    146    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    147    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    148    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    149 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    150174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    151175/       
     
    153177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    154178!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    163    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    164 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    165189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    166190/ 
     
    168192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    169193!----------------------------------------------------------------------- 
    170 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    171 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    172    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    173    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    174    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    175    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    176    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    177    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    178    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    179    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    180    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    181 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    182206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    183    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    184    ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    185209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    186210/ 
    187211!----------------------------------------------------------------------- 
    188 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    189 !----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239   cn_snd_co2     = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
     240   cn_rcv_co2     = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    190241/ 
    191242!----------------------------------------------------------------------- 
    192243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    193244!----------------------------------------------------------------------- 
    194 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    195 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    196    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    197248  
    198249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    199250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
    200    ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
    201    ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
     251   ln_qsr_rgb  = .false.   !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
     252   ln_qsr_2bd  = .true.    !  2 bands              light penetration 
    202253   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
    203254   nn_chldta   =      0    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
     
    205256   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    206257   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
    207    rn_si2      =   62.0    !  3 bands: longest depth of extinction (for blue waveband & 0.01 mg/m2 Chl) 
    208258/ 
    209259!----------------------------------------------------------------------- 
    210260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    211261!----------------------------------------------------------------------- 
    212 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    213 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    214    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    215    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    216   
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',    -1    , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',     0    , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,     0    , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    217270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    218    ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    219    ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
    220    rn_hrnf      =   0.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     271   ln_rnf_emp   = .false.  !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     272   ln_rnf_mouth = .false.  !  specific treatment at rivers mouths 
     273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    221274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    222275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth = .false.   !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     279/ 
     280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    223289/ 
    224290!----------------------------------------------------------------------- 
    225291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    226292!----------------------------------------------------------------------- 
    227 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    228 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    229    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    230    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    231297     
    232298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    237303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    238304   ln_sssr_bnd =   .false. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    239    rn_sssr_bnd =   0.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
    240306/       
    241307!----------------------------------------------------------------------- 
     
    259325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    260326!!====================================================================== 
    261  
     327! 
    262328!----------------------------------------------------------------------- 
    263329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    274340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    275341!----------------------------------------------------------------------- 
    276     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    277     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    278     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    279     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    280346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    281     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    282348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    283     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    284     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    285     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    286     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    287     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    288     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    289     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    290     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    291     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    292358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    293359/ 
     
    295361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    296362!----------------------------------------------------------------------- 
    297     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    298     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    299     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    300     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s] 
    301367/ 
    302368!----------------------------------------------------------------------- 
    303369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    304370!----------------------------------------------------------------------- 
    305     filbdy_mask    =  ''                  !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    306     filbdy_data_T  = 'bdydata_grid_T.nc'  !  name of data file (T-points) 
    307     filbdy_data_U  = 'bdydata_grid_U.nc'  !  name of data file (U-points) 
    308     filbdy_data_V  = 'bdydata_grid_V.nc'  !  name of data file (V-points) 
    309     ln_bdy_clim    = .false.              !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    310     ln_bdy_vol     = .true.               !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    311     ln_bdy_mask    = .false.              !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    312     ln_bdy_tides   = .true.               !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    313     ln_bdy_dyn_fla = .true.               !  Apply Flather condition to velocities 
    314     ln_bdy_tra_frs = .false.              !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    315     ln_bdy_dyn_frs = .false.              !  Apply FRS condition to velocities 
    316     nbdy_dta       =  1                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    317                                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    318     nb_rimwidth    = 9                    !  width of the relaxation zone 
    319     volbdy         = 0                    !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    320                                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    321 / 
    322 !----------------------------------------------------------------------- 
    323 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    324 !----------------------------------------------------------------------- 
    325     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    326     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    327     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    328     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask     =  ''                     !  name of mask file (ln_mask=T) 
     372   cn_dta_frs_T= 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U= 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V= 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T= 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U= 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V= 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    329399/ 
    330400 
     
    333403!!====================================================================== 
    334404!!   nambfr        bottom friction 
    335 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                ("key_trabbc") 
    336 !!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl_dif","key_trabbl_adv") 
    337 !!====================================================================== 
    338  
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
     406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
     407!!====================================================================== 
     408! 
    339409!----------------------------------------------------------------------- 
    340410&nambfr        !   bottom friction 
     
    345415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
    346416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
    347    ln_bfr2d    =   .false. !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     417   ln_bfr2d    = .false.  !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    348418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d = .true.) 
    349419/ 
     
    351421&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    352422!----------------------------------------------------------------------- 
     423   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    353424   nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux  
    354425                           !     = 1 constant flux 
     
    359430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    360431!----------------------------------------------------------------------- 
    361 !                          !  diffusive bbl                             ("key_trabbl") 
    362 !                          !  advective bbl                             ("key_trabbl_adv") 
    363    rn_ahtbbl   =  10000.   !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    364 / 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
    365438!!====================================================================== 
    366439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    371444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    372445!!====================================================================== 
    373  
     446! 
    374447!----------------------------------------------------------------------- 
    375448&nameos        !   ocean physical parameters 
    376449!----------------------------------------------------------------------- 
    377    nn_eos      =    2      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     450   nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    378451                           !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    379452                           !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    380453                           !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    381    rn_alpha    =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
    382    rn_beta     =    7.7e-4 !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
     454   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     455   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    383456/ 
    384457!----------------------------------------------------------------------- 
     
    390463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    391464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    392466/ 
    393467!----------------------------------------------------------------------- 
    394468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    395469!----------------------------------------------------------------------- 
    396                            !  Type of the operator :  
    397    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    398    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    399                            !  Direction of action  : 
    400    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    401    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    402    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    403                            !  Coefficient 
    404    rn_aht_0         =  1000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    405    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    406    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coef. [m2/s]   (require "key_traldf_eiv") 
    407483/ 
    408484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    420496   nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    421497/ 
     498 
    422499!!====================================================================== 
    423500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    429506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    430507!!====================================================================== 
    431  
     508! 
    432509!----------------------------------------------------------------------- 
    433510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    469546&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    470547!----------------------------------------------------------------------- 
    471                            !  Type of the operator :  
     548   !                       !  Type of the operator :  
    472549   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    473550   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    474                            !  Direction of action  :  
     551   !                       !  Direction of action  :  
    475552   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    476553   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    477554   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    478                            !  Coefficient 
    479    rn_ahm_0    = 100000.        !  horizontal eddy viscosity   [m2/s] 
    480    rn_ahmb_0   =     0.         !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    481 / 
     555   !                       !  Coefficient 
     556   rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     557   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     558   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     559/ 
     560 
    482561!!====================================================================== 
    483562!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    484563!!====================================================================== 
    485 !!       namzdf        vertical physics 
    486 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    487 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    488 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    489 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    490 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    491 !!====================================================================== 
    492  
     564!!    namzdf        vertical physics 
     565!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     566!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     567!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     568!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     569!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     570!!====================================================================== 
     571! 
    493572!----------------------------------------------------------------------- 
    494573&namzdf        !   vertical physics 
     
    501580   nn_evdm     =    1      !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
    502581   rn_avevd    =  100.     !  evd mixing coefficient [m2/s] 
    503    ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative algorithm (T) or not (F) 
     582   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative Convective algorithm (T) or not (F) 
    504583   nn_npc      =    1            !  frequency of application of npc 
    505584   nn_npcp     =  365            !  npc control print frequency 
     
    519598   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
    520599   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
    521    rn_ebb      =   3.75    !  coef. of the surface input of tke 
    522    rn_emin     =   1.e-5   !  minimum value of tke [m2/s2] 
     600   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
     601   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
    523602   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
    524    rn_bshear   =   1.e-20  !  background shear (>0) 
    525603   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
    526604                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
    527605                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
    528                            !                 = 3 same criteria as case 2 but applied in a different way 
     606                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
    529607   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
    530    ln_mxl0     = .false.   !  mixing length scale surface value as function of wind stress (T) or not (F) 
    531    rn_lmin     =   0.4     !  interior buoyancy lenght scale minimum value 
    532    rn_lmin0    =   0.4     !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
    533    nn_etau     =   0       !  exponentially deceasing penetration of tke due to internal & intertial waves 
    534                            !        = 0 no penetration ( O(2 km) resolution) 
    535                            !        = 1 additional tke source (rn_efr * en) 
    536                            !        = 2 additional tke source (rn_efr * en) applied only at the base of the mixed layer 
    537                            !        = 3 additional tke source (HF contribution: mean of stress module - module of mean stress) 
    538    nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration 
     608   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     609   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     610   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     611   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     612   nn_etau     =   0       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     613                           !        = 0 no penetration 
     614                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     615                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     616                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     617   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     618   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    539619                           !        = 0  constant 10 m length scale 
    540                            !        = 1  0.5m at the equator to 30m at high latitudes 
    541                            !        = 2  30 meters constant depth penetration 
    542                            !  otion used only if nn_etau = 1 or 2:  
    543    rn_efr      =   0.05    !     fraction of surface tke value which penetrates inside the ocean 
    544                            !  otion used only if nn_etau = 3: 
    545    rn_addhft   =  -1.e-3   !     add offset   applied to the "mean of stress module - module of mean stress" (always kept > 0) 
    546    rn_sclhft   =   1.      !     scale factor applied to the "mean of stress module - module of mean stress" 
    547    ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation 
    548    rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     620                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    549621/ 
    550622!------------------------------------------------------------------------ 
    551 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionnally: 
     623&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    552624!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    553625   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing  
     
    562634/ 
    563635!----------------------------------------------------------------------- 
     636&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     637!----------------------------------------------------------------------- 
     638   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     639   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
     640   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     641   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     642   ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     643   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     644   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     645   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     646   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     647   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     648   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     649   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     650   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     651   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     652/ 
     653!----------------------------------------------------------------------- 
    564654&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
    565655!----------------------------------------------------------------------- 
     
    574664   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency 
    575665   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency  
    576    ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
     666   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    577667   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    578668/ 
     669 
    579670!!====================================================================== 
    580671!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    585676!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    586677!!====================================================================== 
    587  
     678! 
    588679!----------------------------------------------------------------------- 
    589680&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    602693&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    603694!----------------------------------------------------------------------- 
    604    cn_mpi_send =  'S'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
     695   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    605696                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    606697   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     
    626717   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    627718                           !     (no physical validity of the results) 
    628    nn_bit_cmp  =    0      !  bit comparison mode (1/0): CAUTION use zero except for test 
    629                            !     of comparison between single and multiple processor runs 
    630 / 
    631  
    632 !!====================================================================== 
    633 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    634 !!====================================================================== 
     719/ 
     720 
     721!!====================================================================== 
     722!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     723!!====================================================================== 
     724!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    635725!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    636 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    637726!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    638727!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    639 !!====================================================================== 
    640  
     728!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     729!!====================================================================== 
     730! 
     731!----------------------------------------------------------------------- 
     732&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     733!----------------------------------------------------------------------- 
     734   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     735   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     736   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     737                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     738                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     739   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     740                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     741/ 
    641742!----------------------------------------------------------------------- 
    642743&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    643 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     744!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    644745!----------------------------------------------------------------------- 
    645746   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    652753/ 
    653754!----------------------------------------------------------------------- 
    654 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    655 !----------------------------------------------------------------------- 
    656    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    657    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    658 / 
    659 !----------------------------------------------------------------------- 
    660755&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    661756!----------------------------------------------------------------------- 
    662     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    663     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    664     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    665     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    666     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     757   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     758   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     759   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     760   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     761   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    667762                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    668763/ 
     
    671766!----------------------------------------------------------------------- 
    672767   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    673    ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
    674    ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     768   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
     769   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    675770                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    676    nf_ptr     =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    677    nf_ptr_wri =  15        !  Frequency of ptr outputs 
    678 / 
     771   ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
     772   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
     773   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     774/ 
     775!----------------------------------------------------------------------- 
     776&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     777!----------------------------------------------------------------------- 
     778   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     779/ 
     780 
     781!!====================================================================== 
     782!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     783!!====================================================================== 
     784!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     785!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     786!!====================================================================== 
     787! 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
     789&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     790!----------------------------------------------------------------------- 
     791   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     792   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     793   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     794   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     795   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     796   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     797 
     798   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     799 
     800   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     801                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     802 
     803   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     804                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     805                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     806 
     807   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     808                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     809                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     810                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     811                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     812                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     813                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     814                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     815                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     816                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     817                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     818                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     819                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     820                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     821   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
     822   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     823                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     824                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     825                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     826   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
     827   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     828                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     829   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
     830   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
     831                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     832                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     833                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     834                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     835                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     836                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     837                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     838                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     839                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     840                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     841                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     842   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     843                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     844                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     845   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     846   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     847                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
     848   ln_grid_global = .true. 
     849   ln_grid_search_lookup = .false. 
     850/  
     851!----------------------------------------------------------------------- 
     852&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     853!----------------------------------------------------------------------- 
     854    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     855    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     856    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     857    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     858    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     859    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     860    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     861    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     862    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     866    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     867    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     868    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     869/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1552 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
    1935   
    20    
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/AA_job

    • Property svn:keywords set to Id
    r2521 r2528  
    9797cp ${R_EXPER}/namelist_top     namelist_top 
    9898cp ${R_EXPER}/namelist_lobster namelist_lobster 
    99 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    100 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    101  
    10299ls -alF 
    103100 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/iodef.xml

    r1802 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    133133   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    134134   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    135    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
     135   <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                  /> 
    136136   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    137137   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    138138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    139139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    150151   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    151152   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    152    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
     153   <field id="voce_eff"     description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                  /> 
    153154   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    154155   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    155156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    156157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    166168      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    167169   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    168    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
     170   <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    169171   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    272273 
    273274      <group id="2d" output_freq="172800" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2d files --> 
    274  
    275         <file id="2d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    276           <field ref="sst"          name="sosstsst"  /> 
    277           <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    278           <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    279         </file> 
    280  
    281        <file id="2d_ptrc_T" name="auto" description="lobster sms variables" > 
    282          <field ref="ZOO"      /> 
    283          <field ref="PHY"      /> 
    284          <field ref="NO3"      /> 
    285        </file> 
    286  
    287  
    288275      </group> 
    289276 
     
    296283          <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    297284          <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    298           <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
     285          <field ref="emp-rnf"      name="sowaflup"  /> 
    299286          <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    300           <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
     287          <field ref="emps-rnf"     name="sowaflcd"  /> 
    301288          <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    302289          <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/namelist_lobster

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/namelist_top

    • Property svn:keywords set to Id
    r1578 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtoptrc) 
    3 !! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtoptrd) 
    4 !!              6 - tracer advection                      (namtopadv) 
    5 !!              7 - tracer bottom boundary                (namtopbbl) 
    6 !!              8 - tracer lateral diffusion              (namtopldf) 
    7 !!              3 - tracer vertical physics               (namtopzdf) 
    8 !!              9 - tracer newtonian damping              (namtopdmp) 
     2!! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtrc    ) 
     3!! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtrc_trd) 
     4!!              3 - tracer advection                      (namtrc_adv) 
     5!!              4 - tracer lateral diffusion              (namtrc_ldf) 
     6!!              5 - tracer vertical physics               (namtrc_zdf) 
     7!!              6 - tracer newtonian damping              (namtrc_dmp) 
    98!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    109!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    11 &namtoptrc     !   tracers definition 
     10&namtrc     !   tracers definition 
    1211!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    13    ndttrc      =  1        !  time step frequency for passive tracers       
    14    nwritetrc   = 360       !  time step frequency for tracer outputs 
    15    ln_rsttr    = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    16    nrsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
     12   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers 
     13   nn_writetrc   =  360      !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     14   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
     15   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    1716                           !                  = 1 do not use the value in the restart file 
    1817                           !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    19    cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (input) 
    20    cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
     18   cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
     19   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
    2120! 
    2221!              ! name  !     title of the field       !   units       ! initial data ! save   ! 
    2322!              !       !                              !               ! from file    ! or not !  
    2423!              !       !                              !               ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DET' , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'ZOO' , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'PHY' , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'NO3' , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'NH4' , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'DOM' , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     24   sn_tracer(1)   = 'DET' , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     25   sn_tracer(2)   = 'ZOO' , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     26   sn_tracer(3)   = 'PHY' , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     27   sn_tracer(4)   = 'NO3' , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     28   sn_tracer(5)   = 'NH4' , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     29   sn_tracer(6)   = 'DOM' , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    3130/ 
    3231!----------------------------------------------------------------------- 
    33 &namtopadv    !   advection scheme for passive tracer  
     32&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer 
    3433!----------------------------------------------------------------------- 
    35    ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    36    ln_trcadv_tvd    =  .true.  !  TVD scheme    
    37    ln_trcadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme 
     34   ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
     35   ln_trcadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
     36   ln_trcadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
    3837   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    39    ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    40    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smolar. scheme  
    41    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smolar. scheme  
    42    crosster         =  .false.  !  computes Smolar crossterms (T) or not (F) 
     38   ln_trcadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
     39   ln_trcadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    4340/ 
    4441!----------------------------------------------------------------------- 
    45 &namtopbbl    !   bottom boundary layer scheme for passive tracer  
    46 !----------------------------------------------------------------------- 
    47    atrcbbl          = 1000.     !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    48 / 
    49 !----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namtopldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
     42&namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
    5143!----------------------------------------------------------------------- 
    5244   ln_trcldf_diff   =  .true.   !  performs lateral diffusion (T) or not (F) 
     
    5951   ln_trcldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    6052!                               !  Coefficient 
    61    ahtrc0      =   300.         !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    62    ahtrb0      =     0.         !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    63    aeivtr0     =  1000.         !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_trcldf_eiv") 
    64    trcrat      =  1.            !  ratio betweeen passive and active tracer diffusion coeff 
     53   rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    6554/ 
    6655!----------------------------------------------------------------------- 
    67 &namtopzdf        !   vertical physics 
     56&namtrc_zdf        !   vertical physics 
    6857!----------------------------------------------------------------------- 
    6958   ln_trczdf_exp   =  .false.  !  split explicit (T) or implicit (F) time stepping 
    70    n_trczdf_exp    =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
     59   nn_trczdf_exp   =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
    7160/ 
    7261!----------------------------------------------------------------------- 
    73 &namtoprad        !  treatment of negative concentrations  
     62&namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations 
    7463!----------------------------------------------------------------------- 
    75    ln_trcrad   =  .true.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
     64   ln_trcrad   =  .false.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    7665/ 
    7766!----------------------------------------------------------------------- 
    78 &namtopdmp        !   passive tracer newtonian damping                 ('key_trcdmp') 
     67&namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    ('key_tradmp && key_trcdmp') 
    7968!----------------------------------------------------------------------- 
    80    ndmptr      =   20      !  type of damping in passive tracers 
    81                            !     ='latitude', damping poleward of 'ndmp' degrees and function  
    82                            !                  of the distance-to-coast. Red and Med Seas as ndmptr=-1 
    83                            !     =-1 damping only in Med and Red Seas 
    84    ndmpftr     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    85    nmldmptr    =    1      !  type of damping: =0 damping throughout the water column 
    86                            !                   =1 no damping in the mixed layer defined by avt >5cm2/s ) 
    87                            !                   =2 no damping in the mixed layer defined rho<rho(surf)+.01 ) 
    88    sdmptr      =   50.     !  surface time scale for internal damping (days) 
    89    bdmptr      =  360.     !  bottom  time scale for internal damping (days) 
    90    hdmptr      =  800.     !  depth of transition between sdmptr and bdmptr (meters) 
     69   nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     70                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
     71                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     72   nn_zdmp_tr  =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     73                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     74                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     75   rn_surf_tr  =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
     76   rn_bot_tr   =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
     77   rn_dep_tr   =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
     78   nn_file_tr  =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    9179/ 
    9280!----------------------------------------------------------------------- 
    93 &namtoptrd       !   diagnostics on tracer trends 
     81&namtrc_trd       !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
    9482!                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    9583!---------------------------------------------------------------------- 
    96    ntrd_trc   =  360      !  time step frequency and tracers trends 
    97    nctls_trc  =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    98    ucf_trc    =  86400    !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     84   nn_trd_trc   =  360      !  time step frequency and tracers trends 
     85   nn_ctls_trc  =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     86   rn_ucf_trc   =  86400    !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    9987   ln_trdmld_trc_restart = .false.  !  restart for ML diagnostics 
    10088   ln_trdmld_trc_instant = .false.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    101    luttrd(1)  =   .true. 
    102    luttrd(2)  =   .true. 
    103    luttrd(3)  =   .true. 
    104    luttrd(4)  =   .true. 
    105    luttrd(5)  =   .true. 
    106    luttrd(6)  =   .true. 
     89   ln_trdtrc(1)  =   .true. 
     90   ln_trdtrc(2)  =   .true. 
     91   ln_trdtrc(3)  =   .true. 
     92   ln_trdtrc(4)  =   .true. 
     93   ln_trdtrc(5)  =   .true. 
     94   ln_trdtrc(6)  =   .true. 
    10795/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1552 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
    1935   
    20    
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist

    • Property svn:eol-style deleted
    r2467 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    14 !  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
    1516 
    1617!!====================================================================== 
    1718!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1819!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     20!!   namrun        parameters of the run 
     21!!====================================================================== 
     22! 
    2223!----------------------------------------------------------------------- 
    2324&namrun        !   parameters of the run 
    2425!----------------------------------------------------------------------- 
    2526   nn_no       =       0   !  job number 
    26    cn_exp      =  "Agulhas"!  experience name  
     27   cn_exp      = "Agulhas" !  experience name  
    2728   nn_it000    =       1   !  first time step 
    28    nn_itend    =   10950   !  last  time step (std 5475) 
    29    nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
     29   nn_itend    =   10950   !  last  time step 
     30   nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nn_rstctl=1) 
    3031   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
     32   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
     33   nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nn_it000 is not compared to the restart file value 
     34                               !                  = 1 use nn_date0 in namelist (not the value in the restart file) 
     35                               !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
     36   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     37   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    3138   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    3239   nn_stock    =   10950   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    33    nn_write    =   10950   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
     40   nn_write    =   10950   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    3441   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    3542   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    3643   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
    37    nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (working only with iom_nf90 routines) 
    38    ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    39    nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
    40                                !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
    41                                !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    42    cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    43    cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    44 / 
     44   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
     45/ 
     46 
    4547!!====================================================================== 
    4648!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    4951!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    5052!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    51 !!====================================================================== 
    52  
     53!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     54!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     55!!====================================================================== 
     56! 
    5357!----------------------------------------------------------------------- 
    5458&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    6367   rn_sbot_min =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
    6468   rn_sbot_max = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
    65    rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    66    rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    67    rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     69   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=rn_theta<=20) 
     70   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=rn_thetb<= 1) 
     71   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<rn_max<1) 
    6872   ln_s_sigma  = .false.   !  hybrid s-sigma coordinates 
    6973   rn_bb       =    0.8    !  stretching with s-sigma 
     
    7377&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    7478!----------------------------------------------------------------------- 
    75    nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read(=1) the bathymetry file 
    76    nn_closea   =    0      !  closed seas and lakes are removed (=0) or kept (=1) from the ORCA domain 
    77    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
    78    rn_e3zps_min=   20.     !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
    79    rn_e3zps_rat=    0.1    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
     79   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
     80   nn_closea    =   0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     81   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     82   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     83   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     84   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1 
    8085                           ! 
    81    rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0)   ==> 5760 
    82    nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step (for the split explicit algorithm) ("key_dynspg_ts") 
     86   rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     87   nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step           ("key_dynspg_ts") 
    8388   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    8489   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    8590                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    86    rn_rdtmin   = 14400.          !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
    87    rn_rdtmax   = 14400.          !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
    88    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    89 / 
     91   rn_rdtmin   = 14400.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     92   rn_rdtmax   = 14400.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     93   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    90114!!====================================================================== 
    91115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    92116!!====================================================================== 
    93 !!   namsbc        surface boundary condition 
    94 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    95 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    96 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    97 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    98 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    99 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    100 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    101 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    102 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    103 !!====================================================================== 
    104  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    105131!----------------------------------------------------------------------- 
    106132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    107133!----------------------------------------------------------------------- 
    108134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    109                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    110    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    111    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    112    ln_blk_clio = .true.    !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    113    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    114    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    115142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    116143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    117                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
    118    nn_ico_cpl  = 0         !  ice-ocean coupling : =0 each nn_fsbc  
    119                            !                       =1 stresses recomputed each ocean time step ("key_lim3" only) 
    120                            !                       =2 combination of 0 and 1 cases             ("key_lim3" only) 
    121    ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    122    ln_rnf      = .false.   !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    123    ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
     146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    124148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    125                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    126                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    127                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    128152/ 
    129153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    140164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    141165!----------------------------------------------------------------------- 
    142 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    143 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    144    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    145    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    146    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    147    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    148    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    149 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    150174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    151175/       
     
    153177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    154178!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    163    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    164 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    165189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    166190/ 
     
    168192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    169193!----------------------------------------------------------------------- 
    170 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    171 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    172    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    173    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    174    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    175    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    176    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    177    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    178    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    179    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    180    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    181 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    182206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    183    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    184    ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    185209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    186210/ 
    187211!----------------------------------------------------------------------- 
    188 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    189 !----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239   cn_snd_co2     = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
     240   cn_rcv_co2     = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    190241/ 
    191242!----------------------------------------------------------------------- 
    192243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    193244!----------------------------------------------------------------------- 
    194 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    195 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    196    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    197   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    198249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    199250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     
    201252   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    202253   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
    203    nn_chldta   =      0    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
     254   nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
    204255   rn_abs      =   0.58    !  RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1) 
    205256   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    206257   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
    207    rn_si2      =   62.0    !  3 bands: longest depth of extinction (for blue waveband & 0.01 mg/m2 Chl) 
    208258/ 
    209259!----------------------------------------------------------------------- 
    210260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    211261!----------------------------------------------------------------------- 
    212 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    213 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    214    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    215    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    216   
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',    -1    , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',     0    , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,     0    , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    217270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    218    ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    219    ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
     271   ln_rnf_emp   = .false.  !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     272   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
    220273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    221274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    222275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth = .false.   !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     279/ 
     280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    223289/ 
    224290!----------------------------------------------------------------------- 
    225291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    226292!----------------------------------------------------------------------- 
    227 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    228 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    229    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    230    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    231      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    232298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    233299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
    234    nn_sssr     =     0     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=1) or not (=0) 
     300   nn_sssr     =     2     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)  
     301                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0) 
    235302   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K] 
    236303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    237    ln_sssr_bnd =   .false. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    238    rn_sssr_bnd =   0.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     304   ln_sssr_bnd =   .true. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
    239306/       
    240307!----------------------------------------------------------------------- 
     
    258325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    259326!!====================================================================== 
    260  
     327! 
    261328!----------------------------------------------------------------------- 
    262329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    273340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    274341!----------------------------------------------------------------------- 
    275     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    276     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    277     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    278     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    279346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    280     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    281348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    282     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    283     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    284     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    285     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    286     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    287     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    288     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    289     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    290     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    291358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    292359/ 
     
    294361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    295362!----------------------------------------------------------------------- 
    296     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    297     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    298     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    299     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s] 
    300367/ 
    301368!----------------------------------------------------------------------- 
    302369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    303370!----------------------------------------------------------------------- 
    304     filbdy_mask    =  ''                  !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    305     filbdy_data_T  = 'bdydata_grid_T.nc'  !  name of data file (T-points) 
    306     filbdy_data_U  = 'bdydata_grid_U.nc'  !  name of data file (U-points) 
    307     filbdy_data_V  = 'bdydata_grid_V.nc'  !  name of data file (V-points) 
    308     ln_bdy_clim    = .false.              !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    309     ln_bdy_vol     = .true.               !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    310     ln_bdy_mask    = .false.              !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    311     ln_bdy_tides   = .true.               !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    312     ln_bdy_dyn_fla = .true.               !  Apply Flather condition to velocities 
    313     ln_bdy_tra_frs = .false.              !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    314     ln_bdy_dyn_frs = .false.              !  Apply FRS condition to velocities 
    315     nbdy_dta       =  1                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    316                                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    317     nb_rimwidth    = 9                    !  width of the relaxation zone 
    318     volbdy         = 0                    !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    319                                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    320 / 
    321 !----------------------------------------------------------------------- 
    322 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    323 !----------------------------------------------------------------------- 
    324     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    325     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    326     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    327     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask     =  ''                     !  name of mask file (ln_mask=T) 
     372   cn_dta_frs_T= 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U= 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V= 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T= 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U= 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V= 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    328399/ 
    329400 
     
    332403!!====================================================================== 
    333404!!   nambfr        bottom friction 
    334 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                ("key_trabbc") 
    335 !!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl_dif","key_trabbl_adv") 
    336 !!====================================================================== 
    337  
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
     406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
     407!!====================================================================== 
     408! 
    338409!----------------------------------------------------------------------- 
    339410&nambfr        !   bottom friction 
     
    343414   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case) 
    344415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
    345    rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
    346    ln_bfr2d    =   .false. !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    347    rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d = .true.) 
     416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     417   ln_bfr2d    = .false.  !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
    348419/ 
    349420!----------------------------------------------------------------------- 
    350421&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    351422!----------------------------------------------------------------------- 
     423   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    352424   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux  
    353425                           !     = 1 constant flux 
     
    358430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    359431!----------------------------------------------------------------------- 
    360 !                          !  diffusive bbl                             ("key_trabbl") 
    361 !                          !  advective bbl                             ("key_trabbl_adv") 
    362    rn_ahtbbl   =  10000.   !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    363 / 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
    364438!!====================================================================== 
    365439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    370444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    371445!!====================================================================== 
    372  
     446! 
    373447!----------------------------------------------------------------------- 
    374448&nameos        !   ocean physical parameters 
    375449!----------------------------------------------------------------------- 
    376    nn_eos      =    0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     450   nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    377451                           !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    378452                           !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    379453                           !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    380    rn_alpha    =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
    381    rn_beta     =    0.001  !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
     454   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     455   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    382456/ 
    383457!----------------------------------------------------------------------- 
     
    389463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    390464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    391466/ 
    392467!----------------------------------------------------------------------- 
    393468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    394469!----------------------------------------------------------------------- 
    395                            !  Type of the operator :  
    396    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    397    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    398                            !  Direction of action  : 
    399    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    400    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    401    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    402                            !  Coefficient 
    403    rn_aht_0         =  1000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    404    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    405    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    406483/ 
    407484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    417494   rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    418495   rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    419    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    420 / 
     496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     497/ 
     498 
    421499!!====================================================================== 
    422500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    428506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    429507!!====================================================================== 
    430  
     508! 
    431509!----------------------------------------------------------------------- 
    432510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    468546&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    469547!----------------------------------------------------------------------- 
    470                            !  Type of the operator :  
     548   !                       !  Type of the operator :  
    471549   ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    472550   ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator     
    473                            !  Direction of action  :  
     551   !                       !  Direction of action  :  
    474552   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    475553   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    476554   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    477                            !  Coefficient 
    478    rn_ahm_0    = -8.5e+11       !  horizontal eddy viscosity   [m2/s] 
    479    rn_ahmb_0   =     0.         !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    480 / 
     555   !                       !  Coefficient 
     556   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     557   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     558   rn_ahm_0_blp     = -8.5e+11  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     559/ 
     560 
    481561!!====================================================================== 
    482562!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    483563!!====================================================================== 
    484 !!       namzdf        vertical physics 
    485 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    486 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    487 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    488 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    489 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    490 !!====================================================================== 
    491  
     564!!    namzdf        vertical physics 
     565!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     566!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     567!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     568!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     569!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     570!!====================================================================== 
     571! 
    492572!----------------------------------------------------------------------- 
    493573&namzdf        !   vertical physics 
     
    500580   nn_evdm     =    0      !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
    501581   rn_avevd    =  100.     !  evd mixing coefficient [m2/s] 
    502    ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative algorithm (T) or not (F) 
     582   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative Convective algorithm (T) or not (F) 
    503583   nn_npc      =    1            !  frequency of application of npc 
    504584   nn_npcp     =  365            !  npc control print frequency 
     
    518598   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
    519599   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
    520    rn_ebb      =  60.      !  coef. of the surface input of tke 
     600   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
    521601   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
    522602   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
    523    rn_bshear   =   1.e-20  !  background shear (>0) 
    524603   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
    525604                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
    526605                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
    527                            !                 = 3 same criteria as case 2 but applied in a different way 
     606                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
    528607   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
    529    ln_mxl0     = .false.   !  mixing length scale surface value as function of wind stress (T) or not (F) 
    530    rn_lmin     =   0.001   !  interior buoyancy lenght scale minimum value 
    531    rn_lmin0    =   0.01    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
    532    nn_etau     =   0       !  exponentially deceasing penetration of tke due to internal & intertial waves 
    533                            !        = 0 no penetration ( O(2 km) resolution) 
    534                            !        = 1 additional tke source (rn_efr * en) 
    535                            !        = 2 additional tke source (rn_efr * en) applied only at the base of the mixed layer 
    536                            !        = 3 additional tke source (HF contribution: mean of stress module - module of mean stress) 
    537    nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration 
     608   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     609   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     610   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     611   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     612   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     613                           !        = 0 no penetration 
     614                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     615                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     616                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     617   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     618   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    538619                           !        = 0  constant 10 m length scale 
    539                            !        = 1  0.5m at the equator to 30m at high latitudes 
    540                            !        = 2  30 meters constant depth penetration 
    541                            !  otion used only if nn_etau = 1 or 2:  
    542    rn_efr      =   0.05    !     fraction of surface tke value which penetrates inside the ocean 
    543                            !  otion used only if nn_etau = 3: 
    544    rn_addhft   =  -1.e-3   !     add offset   applied to the "mean of stress module - module of mean stress" (always kept > 0) 
    545    rn_sclhft   =   1.      !     scale factor applied to the "mean of stress module - module of mean stress" 
    546    ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation 
    547    rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     620                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    548621/ 
    549622!------------------------------------------------------------------------ 
    550 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionnally: 
     623&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    551624!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    552625   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing  
     
    561634/ 
    562635!----------------------------------------------------------------------- 
     636&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     637!----------------------------------------------------------------------- 
     638   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     639   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
     640   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     641   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     642   ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     643   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     644   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     645   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     646   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     647   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     648   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     649   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     650   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     651   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     652/ 
     653!----------------------------------------------------------------------- 
    563654&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
    564655!----------------------------------------------------------------------- 
     
    573664   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency 
    574665   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency  
    575    ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
     666   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    576667   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    577668/ 
     669 
    578670!!====================================================================== 
    579671!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    584676!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    585677!!====================================================================== 
    586  
     678! 
    587679!----------------------------------------------------------------------- 
    588680&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    601693&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    602694!----------------------------------------------------------------------- 
    603    cn_mpi_send =  'S'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
     695   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    604696                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    605697   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     
    625717   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    626718                           !     (no physical validity of the results) 
    627    nn_bit_cmp  =    0      !  bit comparison mode (1/0): CAUTION use zero except for test 
    628                            !     of comparison between single and multiple processor runs 
    629 / 
    630  
    631 !!====================================================================== 
    632 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    633 !!====================================================================== 
     719/ 
     720 
     721!!====================================================================== 
     722!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     723!!====================================================================== 
     724!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    634725!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    635 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    636726!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    637727!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    638 !!====================================================================== 
    639  
     728!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     729!!====================================================================== 
     730! 
     731!----------------------------------------------------------------------- 
     732&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     733!----------------------------------------------------------------------- 
     734   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     735   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     736   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     737                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     738                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     739   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     740                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     741/ 
    640742!----------------------------------------------------------------------- 
    641743&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    642 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     744!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    643745!----------------------------------------------------------------------- 
    644746   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    651753/ 
    652754!----------------------------------------------------------------------- 
    653 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    654 !----------------------------------------------------------------------- 
    655    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    656    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    657 / 
    658 !----------------------------------------------------------------------- 
    659755&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    660756!----------------------------------------------------------------------- 
    661     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    662     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    663     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    664     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    665     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     757   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     758   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     759   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     760   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     761   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    666762                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    667763/ 
     
    670766!----------------------------------------------------------------------- 
    671767   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    672    ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
    673    ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     768   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
     769   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    674770                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    675    nf_ptr     =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    676    nf_ptr_wri =  15        !  Frequency of ptr outputs 
    677 / 
     771   ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
     772   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
     773   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     774/ 
     775!----------------------------------------------------------------------- 
     776&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     777!----------------------------------------------------------------------- 
     778   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     779/ 
     780 
     781!!====================================================================== 
     782!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     783!!====================================================================== 
     784!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     785!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     786!!====================================================================== 
     787! 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
     789&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     790!----------------------------------------------------------------------- 
     791   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     792   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     793   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     794   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     795   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     796   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     797 
     798   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     799 
     800   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     801                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     802 
     803   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     804                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     805                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     806 
     807   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     808                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     809                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     810                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     811                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     812                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     813                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     814                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     815                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     816                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     817                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     818                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     819                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     820                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     821   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
     822   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     823                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     824                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     825                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     826   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
     827   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     828                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     829   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
     830   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
     831                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     832                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     833                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     834                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     835                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     836                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     837                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     838                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     839                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     840                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     841                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     842   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     843                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     844                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     845   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     846   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     847                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
     848   ln_grid_global = .true. 
     849   ln_grid_search_lookup = .false. 
     850/  
     851!----------------------------------------------------------------------- 
     852&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     853!----------------------------------------------------------------------- 
     854    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     855    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     856    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     857    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     858    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     859    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     860    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     861    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     862    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     866    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     867    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     868    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     869/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist_ice_lim2

    • Property svn:keywords set to Id
    r1229 r2528  
    5252   ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    5353   ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
     54   nevp        =   360     !  number of EVP subcycling iterations 
     55   telast      =   3600    !  timescale for EVP elastic waves 
     56   alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of EVP int. stresses 
    5457/ 
    5558!----------------------------------------------------------------------- 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/AA_job

    • Property svn:eol-style deleted
    r2521 r2528  
    110110cp ${R_EXPER}/namelist_ice_lim2 namelist_ice  
    111111cp ${R_EXPER}/namelist namelist 
    112 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    113 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    114112 
    115113#- Namelist for ocean and ice (agrif fine grid) 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/AGRIF_FixedGrids.in

    • Property svn:eol-style deleted
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/EMPave_old.dat

    • Property svn:eol-style deleted
    • Property svn:executable deleted
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef.xml

    r1793 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    133133   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    134134   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    135    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
     135   <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                  /> 
    136136   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    137137   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    138    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    139    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
     139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    150151   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    151152   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    152    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
     153   <field id="voce_eff"     description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                  /> 
    153154   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    154155   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    155    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    156    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
     157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    166168      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    167169   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    168    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
     170   <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    169171   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    273274     <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    274275     <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    275      <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
     276     <field ref="emp-rnf"      name="sowaflup"  /> 
    276277     <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    277      <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
     278     <field ref="emps-rnf"     name="sowaflcd"  /> 
    278279     <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    279280     <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
     
    559560     
    560561  </context> 
    561    
    562   <context id="1_nemo"> 
    563      
    564     <!--  
    565 ============================================================================================================ 
    566 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    567 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    568 ============================================================================================================ 
    569     --> 
    570      
    571     <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined --> 
    572  
    573       <!-- T grid --> 
    574        
    575       <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    576    <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   /> 
    577          <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   /> 
    578    <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     /> 
    579    <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    /> 
    580    <field id="|sstgrad|"    description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   /> 
    581    <field id="|sstgrad|2"   description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 /> 
    582    <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      /> 
    583    <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     /> 
    584    <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        /> 
    585    <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       /> 
    586    <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        /> 
    587    <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        /> 
    588          <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  /> 
    589    <!-- next variables available with key_diahth --> 
    590    <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        /> 
    591    <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        /> 
    592    <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    593    <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    594    <field id="mld|dt|"      description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        /> 
    595    <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        /> 
    596    <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        /> 
    597    <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        /> 
    598    <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     /> 
    599    <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        /> 
    600         <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    601    <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    602    <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        /> 
    603    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    604    <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    605    <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  /> 
    606      </group> 
    607  
    608       <!-- SBC --> 
    609        
    610       <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    611  
    612    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    613    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    614    <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    615    <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
    616  
    617    <field id="qns+qsr"      description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     /> 
    618    <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     /> 
    619    <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     /> 
    620    <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     /> 
    621    <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     /> 
    622    <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  /> 
    623    <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     /> 
    624    <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      /> 
    625     
    626    <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
    627    <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    628    <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    629    <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    630    <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     /> 
    631    <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     /> 
    632  
    633    <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        /> 
    634  
    635    <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     /> 
    636    <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    637    <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    638    <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     /> 
    639     
    640    <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    641    <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    642     
    643    <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        /> 
    644    <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        /> 
    645    <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      /> 
    646     
    647    <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        /> 
    648    <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     /> 
    649    <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />       
    650    <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    651    <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    652     
    653    <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    654    <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    655     
    656    <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    657    <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    658  
    659    <!-- available key_coupled --> 
    660    <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    661    <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  /> 
    662    <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    663    <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        /> 
    664    <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  /> 
    665    <!-- available if key_coupled + conservative method --> 
    666    <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  /> 
    667    <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  /> 
    668    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    669    <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  /> 
    670    <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  /> 
    671    <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  /> 
    672    <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     /> 
    673    <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     /> 
    674    <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     /> 
    675    <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     /> 
    676    <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     /> 
    677    <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     /> 
    678    <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  /> 
    679    <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  /> 
    680    <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  /> 
    681    <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  /> 
    682    <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  /> 
    683  
    684       </group> 
    685  
    686       <!-- U grid --> 
    687        
    688       <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U"> 
    689    <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    690    <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    691    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
    692    <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    693    <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    694    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    695    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    696    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    697    <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    698    <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    699    <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    700    <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    701      </group> 
    702        
    703       <!-- V grid --> 
    704        
    705       <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V"> 
    706    <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    707    <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    708    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
    709    <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    710    <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    711    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    712    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    713    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    714    <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    715    <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    716    <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    717    <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    718       </group> 
    719        
    720       <!-- W grid --> 
    721        
    722       <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    723    <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    724    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
    725    <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    726    <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    727    <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    728    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    729    <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    730    <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
    731    <!-- avs: available with key_zdfddm --> 
    732    <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 /> 
    733    <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
    734    <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 /> 
    735    <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 /> 
    736    <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d --> 
    737    <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    738    <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    739    <!-- avt_tide: available with key_zdftmx --> 
    740    <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 /> 
    741    <!-- variables available with key_diaar5 -->    
    742    <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 /> 
    743    <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               /> 
    744       </group> 
    745            
    746       <!-- scalar --> 
    747        
    748       <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    749       <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" > 
    750    <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   /> 
    751    <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    /> 
    752    <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    /> 
    753    <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    /> 
    754    <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   /> 
    755    <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" /> 
    756    <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  /> 
    757    <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" /> 
    758       </group> 
    759  
    760     </field_definition> 
    761      
    762     <!--  
    763 ============================================================================================================ 
    764 =                                           output files definition                                        = 
    765 =                                            Define your own files                                         = 
    766 =                                         put the variables you want...                                    = 
    767 ============================================================================================================ 
    768     --> 
    769      
    770     <file_definition > 
    771  
    772       <group id="1h" output_freq="3600"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1h files --> 
    773       </group> 
    774        
    775       <group id="2h" output_freq="7200"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2h files --> 
    776       </group> 
    777        
    778       <group id="3h" output_freq="10800"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3h files --> 
    779       </group> 
    780        
    781       <group id="4h" output_freq="14400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 4h files --> 
    782       </group> 
    783        
    784       <group id="6h" output_freq="21600"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 6h files --> 
    785       </group> 
    786        
    787       <group id="1d" output_freq="86400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files --> 
    788      <!-- global file with different operations on data   --> 
    789     <file id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    790        <field ref="sst"    name="sst_1d_ave"                       />     <!-- mean --> 
    791        <field ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="t_max(X)" />     <!-- max --> 
    792      </file> 
    793       </group> 
    794        
    795       <group id="3d" output_freq="259200" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3d files --> 
    796       </group> 
    797        
    798       <group id="5d" output_freq="432000" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 5d files --> 
    799  
    800    <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    801      <field ref="toce"         name="votemper"  /> 
    802      <field ref="soce"         name="vosaline"  /> 
    803      <field ref="sst"          name="sosstsst"  /> 
    804      <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    805      <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    806      <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
    807      <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    808      <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
    809      <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    810      <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    811      <field ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    812      <field ref="ice_cover"    name="soicecov"  /> 
    813      <field ref="wspd"         name="sowindsp"  /> 
    814      <field ref="qrp"          name="sohefldp"  /> 
    815      <field ref="erp"          name="sowafldp"  /> 
    816      <field ref="mlddzt"       name="sothedep"  /> 
    817      <field ref="20d"          name="so20chgt"  /> 
    818      <field ref="28d"          name="so28chgt"  /> 
    819      <field ref="hc300"        name="sohtc300"  /> 
    820      <field ref="ist_ipa"      name="soicetem"  /> 
    821      <field ref="icealb_cea"   name="soicealb"  />    
    822    </file> 
    823     
    824    <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
    825      <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    826      <field ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    827    </file> 
    828     
    829    <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
    830      <field ref="voce"         name="vomecrty"  /> 
    831      <field ref="vtau"         name="sometauy"  /> 
    832    </file> 
    833     
    834    <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" > 
    835      <field ref="woce"         name="vovecrtz" /> 
    836      <field ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    837      <field ref="avt_evd"      name="votkeevd" /> 
    838      <field ref="avm"          name="votkeavm" /> 
    839      <field ref="avm_evd"      name="votkeevm" /> 
    840      <field ref="avs"          name="voddmavs" /> 
    841      <field ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    842    </file> 
    843     
    844 <!-- 
    845    <file id="5d_icemod" name="auto" description="ice variables" > 
    846      <field ref="ice_pres"                     /> 
    847      <field ref="snowthic_cea" name="isnowthi" /> 
    848      <field ref="icethic_cea"  name="iicethic" /> 
    849      <field ref="iceprod_cea"  name="iiceprod" /> 
    850      <field ref="ist_ipa"      name="iicetemp" /> 
    851      <field ref="ioceflxb"     name="ioceflxb" /> 
    852      <field ref="uice_ipa"     name="iicevelu" /> 
    853      <field ref="vice_ipa"     name="iicevelv" /> 
    854      <field ref="utau_ice"     name="iicestru" /> 
    855      <field ref="vtau_ice"     name="iicestrv" /> 
    856      <field ref="qsr_io_cea"   name="iicesflx" /> 
    857      <field ref="qns_io_cea"   name="iicenflx" /> 
    858      <field ref="snowpre"      name="isnowpre" /> 
    859    </file> 
    860 --> 
    861     
    862       </group> 
    863        
    864       <group id="1m" output_freq="-1"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files --> 
    865  
    866    <file id="1m_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    867      <field ref="sst"          name="sosstsst"  /> 
    868    </file>    
    869  
    870       </group> 
    871  
    872       <group id="2m" output_freq="-2"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2m files --> 
    873       </group> 
    874  
    875       <group id="3m" output_freq="-3"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 3m files --> 
    876       </group> 
    877  
    878       <group id="4m" output_freq="-4"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 4m files --> 
    879       </group> 
    880  
    881       <group id="6m" output_freq="-6"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 6m files --> 
    882       </group> 
    883  
    884       <group id="1y" output_freq="-12"    output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real yearly files --> 
    885  
    886    <file id="1y_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    887      <field ref="mldr10_1"     name="sobowlin"  operation="t_max(X)" /> 
    888    </file> 
    889  
    890       </group> 
    891  
    892       <group id="2y"  output_freq="-24"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2y files --> 
    893       </group> 
    894  
    895       <group id="5y"  output_freq="-60"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 5y files --> 
    896       </group> 
    897  
    898       <group id="10y" output_freq="-120"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 10y files --> 
    899       </group> 
    900  
    901     </file_definition> 
    902      
    903     <!--  
    904 ============================================================================================================ 
    905 =                                           grid definition                                                = 
    906 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    907 ============================================================================================================ 
    908     --> 
    909      
    910     <axis_definition>   
    911       <axis id="deptht" description="Vertical T levels" unit="m" positive=".false." /> 
    912       <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" positive=".false." /> 
    913       <axis id="depthv" description="Vertical V levels" unit="m" positive=".false." /> 
    914       <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" positive=".false." /> 
    915       <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" /> 
    916     </axis_definition>  
    917      
    918     <grid_definition> 
    919       <grid id="grid_T" description="grid T" > 
    920       </grid> 
    921  
    922       <grid id="grid_U" description="grid U" > 
    923       </grid> 
    924  
    925       <grid id="grid_V" description="grid V" > 
    926       </grid> 
    927  
    928       <grid id="grid_W" description="grid W" > 
    929       </grid> 
    930  
    931       <grid id="scalarpoint" description="scalar" > 
    932    <zoom id="1point" ibegin="1" jbegin="1" ni="1" nj="1" /> 
    933       </grid> 
    934  
    935     </grid_definition>     
    936      
    937   </context> 
    938    
     562 
    939563</simulation> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_ar5.xml

    r1772 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    133133   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    134134   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    135    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
     135   <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                 /> 
    136136   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    137137   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    138    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    139    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
     139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    150151   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    151152   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    152    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
     153   <field id="voce_eff"     description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                  /> 
    153154   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    154155   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    155    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    156    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
     157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    166168      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    167169   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    168    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
     170   <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    169171   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    265266       <field ref="calving"      name="ficeberg" description="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"                 level="1" /> 
    266267       <field ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" description="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
    267        <field ref="emp"          name="wfo"      description="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
     268       <field ref="emp-rnf"      name="wfo"      description="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
    268269       <!-- wfonocorr : water_flux_into_sea_water_without_flux_correction : emp - erp -->   
    269270       <field ref="erp"          name="wfcorr"   description="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 --> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist

    • Property svn:eol-style deleted
    r2467 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    14 !  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
    1516 
    1617!!====================================================================== 
    1718!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1819!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     20!!   namrun        parameters of the run 
     21!!====================================================================== 
     22! 
    2223!----------------------------------------------------------------------- 
    2324&namrun        !   parameters of the run 
     
    2728   nn_it000    =       1   !  first time step 
    2829   nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475) 
    29    nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
     30   nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nn_rstctl=1) 
    3031   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
     32   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
     33   nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nn_it000 is not compared to the restart file value 
     34                               !                  = 1 use nn_date0 in namelist (not the value in the restart file) 
     35                               !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
     36   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     37   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    3138   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    3239   nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    33    nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
     40   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    3441   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    3542   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    3643   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
    37    nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (working only with iom_nf90 routines) 
    38    ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    39    nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
    40                                !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
    41                                !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    42    cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    43    cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    44 / 
     44   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
     45/ 
     46 
    4547!!====================================================================== 
    4648!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    4951!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    5052!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    51 !!====================================================================== 
    52  
     53!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     54!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     55!!====================================================================== 
     56! 
    5357!----------------------------------------------------------------------- 
    5458&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    6367   rn_sbot_min =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
    6468   rn_sbot_max = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
    65    rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    66    rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    67    rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     69   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=rn_theta<=20) 
     70   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=rn_thetb<= 1) 
     71   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<rn_max<1) 
    6872   ln_s_sigma  = .false.   !  hybrid s-sigma coordinates 
    6973   rn_bb       =    0.8    !  stretching with s-sigma 
     
    7377&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    7478!----------------------------------------------------------------------- 
    75    nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read(=1) the bathymetry file 
    76    nn_closea   =    0      !  closed seas and lakes are removed (=0) or kept (=1) from the ORCA domain 
    77    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
    78    rn_e3zps_min=   20.     !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
    79    rn_e3zps_rat=    0.1    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
     79   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
     80   nn_closea    =   0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     81   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     82   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     83   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     84   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1 
    8085                           ! 
    81    rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0)   ==> 5760 
    82    nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step (for the split explicit algorithm) ("key_dynspg_ts") 
     86   rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     87   nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step           ("key_dynspg_ts") 
    8388   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    8489   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    8590                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    86    rn_rdtmin   = 28800.          !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
    87    rn_rdtmax   = 28800.          !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
    88    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    89 / 
     91   rn_rdtmin   = 28800.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     92   rn_rdtmax   = 28800.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     93   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    90114!!====================================================================== 
    91115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    92116!!====================================================================== 
    93 !!   namsbc        surface boundary condition 
    94 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    95 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    96 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    97 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    98 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    99 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    100 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    101 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    102 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    103 !!====================================================================== 
    104  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    105131!----------------------------------------------------------------------- 
    106132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    107133!----------------------------------------------------------------------- 
    108134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    109                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    110    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    111    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    112    ln_blk_clio = .true.    !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    113    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    114    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    115142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    116143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    117                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
    118    nn_ico_cpl  = 0         !  ice-ocean coupling : =0 each nn_fsbc  
    119                            !                       =1 stresses recomputed each ocean time step ("key_lim3" only) 
    120                            !                       =2 combination of 0 and 1 cases             ("key_lim3" only) 
    121    ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    122    ln_rnf      = .true.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    123    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    124148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    125                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    126                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    127                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    128152/ 
    129153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    140164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    141165!----------------------------------------------------------------------- 
    142 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    143 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    144    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    145    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    146    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    147    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    148    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    149 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    150174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    151175/       
     
    153177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    154178!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    163    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    164 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    165189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    166190/ 
     
    168192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    169193!----------------------------------------------------------------------- 
    170 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    171 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    172    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    173    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    174    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    175    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    176    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    177    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    178    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    179    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    180    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    181 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    182206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    183    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    184    ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    185209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    186210/ 
    187211!----------------------------------------------------------------------- 
    188 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    189 !----------------------------------------------------------------------- 
    190                                        ! send 
    191 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    192 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    193 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    194 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    195 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    196 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    197 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    198                                        ! receive 
    199 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    200 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    201 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    202 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    203 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    204 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    205 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    206 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    207 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    209 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    210 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    211 / 
    212 !----------------------------------------------------------------------- 
    213 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
    214 !----------------------------------------------------------------------- 
    215 cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
    216 cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239   cn_snd_co2     = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
     240   cn_rcv_co2     = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    217241/ 
    218242!----------------------------------------------------------------------- 
    219243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    220244!----------------------------------------------------------------------- 
    221 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    222 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    223    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    224   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    225249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    226250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     
    228252   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    229253   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
    230    nn_chldta   =      0    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
     254   nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
    231255   rn_abs      =   0.58    !  RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1) 
    232256   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    233257   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
    234    rn_si2      =   62.0    !  3 bands: longest depth of extinction (for blue waveband & 0.01 mg/m2 Chl) 
    235258/ 
    236259!----------------------------------------------------------------------- 
    237260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    238261!----------------------------------------------------------------------- 
    239 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    240 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    241    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    242    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    243   
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',    -1    , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',     0    , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,     0    , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    244270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    245    ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    246    ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
     271   ln_rnf_emp   = .false.  !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     272   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
    247273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    248274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    249275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth = .false.   !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     279/ 
     280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    250289/ 
    251290!----------------------------------------------------------------------- 
    252291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    253292!----------------------------------------------------------------------- 
    254 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    255 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    256    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    257    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    258      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    259298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    260299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     
    286325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    287326!!====================================================================== 
    288  
     327! 
    289328!----------------------------------------------------------------------- 
    290329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    301340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    302341!----------------------------------------------------------------------- 
    303     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    304     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    305     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    306     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    307346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    308     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    309348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    310     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    311     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    312     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    313     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    314     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    315     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    316     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    317     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    318     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    319358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    320359/ 
     
    322361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    323362!----------------------------------------------------------------------- 
    324     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    325     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    326     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    327     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s] 
    328367/ 
    329368!----------------------------------------------------------------------- 
    330369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    331370!----------------------------------------------------------------------- 
    332     filbdy_mask    =  ''                  !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    333     filbdy_data_T  = 'bdydata_grid_T.nc'  !  name of data file (T-points) 
    334     filbdy_data_U  = 'bdydata_grid_U.nc'  !  name of data file (U-points) 
    335     filbdy_data_V  = 'bdydata_grid_V.nc'  !  name of data file (V-points) 
    336     ln_bdy_clim    = .false.              !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    337     ln_bdy_vol     = .true.               !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    338     ln_bdy_mask    = .false.              !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    339     ln_bdy_tides   = .true.               !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    340     ln_bdy_dyn_fla = .true.               !  Apply Flather condition to velocities 
    341     ln_bdy_tra_frs = .false.              !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    342     ln_bdy_dyn_frs = .false.              !  Apply FRS condition to velocities 
    343     nbdy_dta       =  1                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    344                                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    345     nb_rimwidth    = 9                    !  width of the relaxation zone 
    346     volbdy         = 0                    !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    347                                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    348 / 
    349 !----------------------------------------------------------------------- 
    350 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    351 !----------------------------------------------------------------------- 
    352     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    353     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    354     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    355     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask     =  ''                     !  name of mask file (ln_mask=T) 
     372   cn_dta_frs_T= 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U= 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V= 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T= 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U= 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V= 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    356399/ 
    357400 
     
    360403!!====================================================================== 
    361404!!   nambfr        bottom friction 
    362 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                ("key_trabbc") 
    363 !!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl_dif","key_trabbl_adv") 
    364 !!====================================================================== 
    365  
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
     406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
     407!!====================================================================== 
     408! 
    366409!----------------------------------------------------------------------- 
    367410&nambfr        !   bottom friction 
     
    371414   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case) 
    372415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
    373    rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
    374    ln_bfr2d    =   .false. !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    375    rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d = .true.) 
     416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     417   ln_bfr2d    = .false.  !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
    376419/ 
    377420!----------------------------------------------------------------------- 
    378421&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    379422!----------------------------------------------------------------------- 
     423   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    380424   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux  
    381425                           !     = 1 constant flux 
     
    386430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    387431!----------------------------------------------------------------------- 
    388 !                          !  diffusive bbl                             ("key_trabbl") 
    389 !                          !  advective bbl                             ("key_trabbl_adv") 
    390    rn_ahtbbl   =  10000.   !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    391 / 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
    392438!!====================================================================== 
    393439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    398444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    399445!!====================================================================== 
    400  
     446! 
    401447!----------------------------------------------------------------------- 
    402448&nameos        !   ocean physical parameters 
    403449!----------------------------------------------------------------------- 
    404    nn_eos      =    0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     450   nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    405451                           !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    406452                           !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    407453                           !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    408    rn_alpha    =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
    409    rn_beta     =    0.001  !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
     454   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     455   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    410456/ 
    411457!----------------------------------------------------------------------- 
     
    417463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    418464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    419466/ 
    420467!----------------------------------------------------------------------- 
    421468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    422469!----------------------------------------------------------------------- 
    423                            !  Type of the operator :  
    424    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    425    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    426                            !  Direction of action  : 
    427    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    428    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    429    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    430                            !  Coefficient 
    431    rn_aht_0         =  2000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    432    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    433    rn_aeiv_0        =  2000.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    434483/ 
    435484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    445494   rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    446495   rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    447    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    448 / 
     496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     497/ 
     498 
    449499!!====================================================================== 
    450500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    456506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    457507!!====================================================================== 
    458  
     508! 
    459509!----------------------------------------------------------------------- 
    460510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    496546&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    497547!----------------------------------------------------------------------- 
    498                            !  Type of the operator :  
     548   !                       !  Type of the operator :  
    499549   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    500550   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    501                            !  Direction of action  :  
     551   !                       !  Direction of action  :  
    502552   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    503553   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    504554   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    505                            !  Coefficient 
    506    rn_ahm_0    = 40000.         !  horizontal eddy viscosity   [m2/s] 
    507    rn_ahmb_0   =     0.         !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    508 / 
     555   !                       !  Coefficient 
     556   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     557   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     558   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     559/ 
     560 
    509561!!====================================================================== 
    510562!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    511563!!====================================================================== 
    512 !!       namzdf        vertical physics 
    513 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    514 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    515 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    516 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    517 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    518 !!====================================================================== 
    519  
     564!!    namzdf        vertical physics 
     565!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     566!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     567!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     568!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     569!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     570!!====================================================================== 
     571! 
    520572!----------------------------------------------------------------------- 
    521573&namzdf        !   vertical physics 
     
    528580   nn_evdm     =    0      !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
    529581   rn_avevd    =  100.     !  evd mixing coefficient [m2/s] 
    530    ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative algorithm (T) or not (F) 
     582   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative Convective algorithm (T) or not (F) 
    531583   nn_npc      =    1            !  frequency of application of npc 
    532584   nn_npcp     =  365            !  npc control print frequency 
     
    546598   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
    547599   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
    548    rn_ebb      =  60.      !  coef. of the surface input of tke 
     600   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
    549601   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
    550602   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
    551    rn_bshear   =   1.e-20  !  background shear (>0) 
    552603   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
    553604                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
    554605                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
    555                            !                 = 3 same criteria as case 2 but applied in a different way 
     606                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
    556607   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
    557    ln_mxl0     = .false.   !  mixing length scale surface value as function of wind stress (T) or not (F) 
    558    rn_lmin     =   0.001   !  interior buoyancy lenght scale minimum value 
    559    rn_lmin0    =   0.01    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
    560    nn_etau     =   0       !  exponentially deceasing penetration of tke due to internal & intertial waves 
    561                            !        = 0 no penetration ( O(2 km) resolution) 
    562                            !        = 1 additional tke source (rn_efr * en) 
    563                            !        = 2 additional tke source (rn_efr * en) applied only at the base of the mixed layer 
    564                            !        = 3 additional tke source (HF contribution: mean of stress module - module of mean stress) 
    565    nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration 
     608   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     609   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     610   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     611   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     612   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     613                           !        = 0 no penetration 
     614                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     615                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     616                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     617   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     618   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    566619                           !        = 0  constant 10 m length scale 
    567                            !        = 1  0.5m at the equator to 30m at high latitudes 
    568                            !        = 2  30 meters constant depth penetration 
    569                            !  otion used only if nn_etau = 1 or 2:  
    570    rn_efr      =   0.05    !     fraction of surface tke value which penetrates inside the ocean 
    571                            !  otion used only if nn_etau = 3: 
    572    rn_addhft   =  -1.e-3   !     add offset   applied to the "mean of stress module - module of mean stress" (always kept > 0) 
    573    rn_sclhft   =   1.      !     scale factor applied to the "mean of stress module - module of mean stress" 
    574    ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation 
    575    rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     620                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    576621/ 
    577622!------------------------------------------------------------------------ 
    578 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionnally: 
     623&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    579624!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    580625   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing  
     
    589634/ 
    590635!----------------------------------------------------------------------- 
     636&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     637!----------------------------------------------------------------------- 
     638   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     639   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
     640   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     641   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     642   ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     643   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     644   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     645   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     646   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     647   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     648   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     649   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     650   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     651   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     652/ 
     653!----------------------------------------------------------------------- 
    591654&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
    592655!----------------------------------------------------------------------- 
     
    601664   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency 
    602665   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency  
    603    ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
     666   ln_tmx_itf  = .true.    !  ITF specific parameterisation 
    604667   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    605668/ 
     669 
    606670!!====================================================================== 
    607671!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    612676!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    613677!!====================================================================== 
    614  
     678! 
    615679!----------------------------------------------------------------------- 
    616680&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    629693&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    630694!----------------------------------------------------------------------- 
    631    cn_mpi_send =  'S'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
     695   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    632696                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    633697   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     
    653717   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    654718                           !     (no physical validity of the results) 
    655    nn_bit_cmp  =    0      !  bit comparison mode (1/0): CAUTION use zero except for test 
    656                            !     of comparison between single and multiple processor runs 
    657 / 
    658  
    659 !!====================================================================== 
    660 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    661 !!====================================================================== 
     719/ 
     720 
     721!!====================================================================== 
     722!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     723!!====================================================================== 
     724!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    662725!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    663 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    664726!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    665727!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    666 !!====================================================================== 
    667  
     728!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     729!!====================================================================== 
     730! 
     731!----------------------------------------------------------------------- 
     732&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     733!----------------------------------------------------------------------- 
     734   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     735   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     736   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     737                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     738                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     739   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     740                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     741/ 
    668742!----------------------------------------------------------------------- 
    669743&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    670 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     744!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    671745!----------------------------------------------------------------------- 
    672746   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    679753/ 
    680754!----------------------------------------------------------------------- 
    681 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    682 !----------------------------------------------------------------------- 
    683    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    684    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    685 / 
    686 !----------------------------------------------------------------------- 
    687755&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    688756!----------------------------------------------------------------------- 
    689     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    690     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    691     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    692     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    693     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     757   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     758   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     759   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     760   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     761   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    694762                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    695763/ 
     
    697765&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    698766!----------------------------------------------------------------------- 
    699    ln_diaptr  = .true.     !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     767   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    700768   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    701769   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    702770                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    703771   ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    704    nf_ptr     =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    705    nf_ptr_wri =  15        !  Frequency of ptr outputs 
    706 / 
     772   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
     773   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     774/ 
     775!----------------------------------------------------------------------- 
     776&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     777!----------------------------------------------------------------------- 
     778   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     779/ 
     780 
     781!!====================================================================== 
     782!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     783!!====================================================================== 
     784!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     785!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     786!!====================================================================== 
     787! 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
     789&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     790!----------------------------------------------------------------------- 
     791   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     792   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     793   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     794   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     795   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     796   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     797 
     798   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     799 
     800   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     801                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     802 
     803   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     804                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     805                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     806 
     807   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     808                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     809                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     810                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     811                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     812                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     813                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     814                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     815                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     816                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     817                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     818                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     819                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     820                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     821   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
     822   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     823                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     824                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     825                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     826   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
     827   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     828                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     829   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
     830   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
     831                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     832                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     833                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     834                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     835                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     836                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     837                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     838                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     839                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     840                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     841                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     842   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     843                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     844                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     845   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     846   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     847                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
     848   ln_grid_global = .true. 
     849   ln_grid_search_lookup = .false. 
     850/  
     851!----------------------------------------------------------------------- 
     852&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     853!----------------------------------------------------------------------- 
     854    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     855    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     856    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     857    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     858    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     859    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     860    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     861    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     862    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     866    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     867    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     868    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     869/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist_ice_lim2

    • Property svn:eol-style deleted
    r1233 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/LIM2 : 1 - dynamics/advection/thermo          (namicerun) 
     2!! NEMO/LIM-2 : 1 - dynamics/advection/thermo          (namicerun) 
    33!! namelists    2 - ice intialisation                  (namiceini) 
    44!!              3 - ice dynamic                        (namicedyn) 
    5 !!              5 - ice advection                      (namicetrp) 
    6 !!              6 - thermodynamic                      (namicethd) 
    7 !!              7 - ice salinity                       (namicesal) 
    8 !!              8 - mechanical redistribution of ice   (namiceitdme) 
    9 !!              3 - ice diagnostics                    (namicedia) 
    10 !!              9 - ice outputs                        (namiceout) 
     5!!              4 - ice advection                      (namicetrp) 
     6!!              5 - thermodynamic                      (namicethd) 
     7!!              6 - ice damping                        (namice_dmp) 
     8!!              7 - ice diagnostics                    (namicedia) 
     9!!              8 - ice outputs                        (namiceout) 
    1110!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1211 
     
    1615   cn_icerst_in  = "restart_ice_in"   !  suffix of ice restart name (input) 
    1716   cn_icerst_out = "restart_ice"      !  suffix of ice restart name (output) 
    18    ln_limdyn   = .true.    !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
    19    ln_limdmp   = .false.   !  restoring ice thickness and fraction leads (T) or not (F) 
    20    acrit       = 1.0e-06   , 1.0e-06   ! minimum fraction for leads in the Northern (Southern) Hemisphere 
    21    hsndif      =  0.0      !  computation of temperature in snow (=0.0) or not 
    22    hicdif      =  0.0      !  computation of temperature in ice  (=0.0) or not (=9999.0) 
     17   ln_limdyn     = .true.             !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
     18   ln_limdmp     = .false.            !  restoring ice thickness and fraction leads   (T => fill  namice_dmp) 
     19   acrit         = 1.0e-06 , 1.0e-06  !  minimum lead fraction in the Northern & Southern Hemispheres 
     20   hsndif        =  0.e0              !  computation of temperature in snow (=0.0) or not 
     21   hicdif        =  0.e0              !  computation of temperature in ice  (=0.0) or not (=9999.0) 
    2322/ 
    2423!----------------------------------------------------------------------- 
    2524&namiceini     !   ice initialisation 
    2625!----------------------------------------------------------------------- 
    27    ln_limini   = .false.   !  read the ice initial state in the file 'Ice_initialization.nc' (T) or not (F) 
     26   ln_limini   = .false.   !  read the initial state in 'Ice_initialization.nc' (T) or not (F) 
    2827   ttest       =  2.0      !  threshold water temperature for initial sea ice 
    2928   hninn       =  0.5      !  initial snow thickness in the north 
     
    5251   ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    5352   ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
     53   nevp        =   360     !  number of EVP subcycling iterations 
     54   telast      =   3600    !  timescale for EVP elastic waves 
     55   alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of EVP int. stresses 
    5456/ 
    5557!----------------------------------------------------------------------- 
    5658&namicetrp     !   ice transport 
    5759!----------------------------------------------------------------------- 
    58    bound       =   0.      !  boundary conditions (=0.0 no-slip, =1.0 free-slip) 
     60   bound       =   0.0     !  boundary conditions (=0. no-slip, =1. free-slip) 
    5961/ 
    6062!----------------------------------------------------------------------- 
    6163&namicethd     !   ice thermodynamic 
    6264!----------------------------------------------------------------------- 
    63 !  hmelt       : maximum melting at the bottom 
    64 !  hiccrit(1/2): ice thickness for lateral accretion in the Northern (Southern) Hemisphere 
    65 !                caution 1.0, 1.0 best value to be used!!! (gilles G.) 
    66 !  hicmin      : ice thickness corr. to max. energy stored in brine pocket 
    67 !  hiclim      : minimum ice thickness 
    68 !  amax        : maximum lead fraction 
    69 !  swiqst      : energy stored in brine pocket (=1) or not (=0)    
    70 !  sbeta       : numerical caracteritic of the scheme for diffusion in ice 
    71 !               Cranck-Nicholson (=0.5), implicit (=1), explicit (=0) 
    72 !  parlat      : percentage of energy used for lateral ablation 
    73 !  hakspl      : slope of distr. for Hakkinen-Mellor's lateral melting 
    74 !  hibspl      : slope of distribution for Hibler's lateral melting 
    75 !  exld        : exponent for leads-closure rate 
    76 !  hakdif      : coefficient for diffusions of ice and snow 
    77 !  thth         : threshold thickness for comp. of eq. thermal conductivity 
    78 !  hnzst       : thickness of the surf. layer in temp. computation 
    79 !  parsub      : switch for snow sublimation or not 
    80 !  alphs       : coefficient for snow density when snow ice formation 
    81 !  
    8265   hmelt       = -0.15     !  maximum melting at the bottom 
    8366   hiccrit     = 0.3 , 0.3 !  ice thickness for lateral accretion in the Northern (Southern) Hemisphere 
     67   !                       !  (caution 1.0, 1.0 best value to be used!!! (gilles G.)) 
    8468   hicmin      = 0.2       !  ice thickness corr. to max. energy stored in brine pocket 
    8569   hiclim      = 0.05      !  minimum ice thickness 
     
    9983/ 
    10084!----------------------------------------------------------------------- 
     85&namice_dmp    !   damping of sea ice alone open boundaries 
     86!              !   (hard coded damping area: check if it fit your config) 
     87!----------------------------------------------------------------------- 
     88!              !  file name   ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     89!              !              !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     90   sn_hicif    = 'ice_damping',  -1.              , 'hicif'  ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     91   sn_cnf      = 'ice_damping',  -1.              , 'frld'   ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     92! 
     93   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
    10196&namicedia     !   ice diagnostics 
    10297!----------------------------------------------------------------------- 
    103    fmtinf      ='1PE13.5 ' !  format of the output values 
    104    nfrinf      = 4         !  number of variables written in one line 
    105    ntmoy       = 1         !  instantaneous values of ice evolution or averaging 
    106    ninfo       = 1         !  frequency of ouputs on file ice_evolu in case of averaging 
     98   fmtinf      = '1PE13.5' !  format of the output values 
     99   nfrinf      =  4        !  number of variables written in one line 
     100   ntmoy       =  1        !  instantaneous values of ice evolution or averaging 
     101   ninfo       =  1        !  frequency of ouputs on file ice_evolu in case of averaging 
    107102/ 
    108103!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    109104&namiceout     !   parameters for outputs 
    110105!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     106!              !         title of the field           !  name     !   units   !  save  ! multipl. ! additive ! 
     107!              !                                      !           !           ! or not !  factor  !  factor  ! 
     108   field_1     = 'Snow thickness                     ', 'isnowthi', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     109   field_2     = 'Ice thickness                      ', 'iicethic', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     110   field_3     = 'Ice produced                       ', 'iiceprod', 'm/kt    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     111   field_4     = 'Ice concentration                  ', 'ileadfra', '%       ',    1   , -1.0     ,    1.0 
     112   field_5     = 'Ice temperature                    ', 'iicetemp', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
     113   field_6     = 'Oceanic flux at the ice base       ', 'ioceflxb', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     114   field_7     = 'Ice velocity u                     ', 'iicevelu', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     115   field_8     = 'Ice velocity v                     ', 'iicevelv', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     116   field_9     = 'Sea surface temperature            ', 'isstempe', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
     117   field_10    = 'Sea surface salinity               ', 'isssalin', 'PSU     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     118   field_11    = 'Total flux at ocean surface        ', 'iocetflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     119   field_12    = 'Solar flux at ocean surface        ', 'iocesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     120   field_13    = 'Non-solar flux at ocean surface    ', 'iocwnsfl', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     121   field_14    = 'Salt flux at ocean surface         ', 'iocesafl', 'kg/m2/kt',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     122   field_15    = 'Wind stress u                      ', 'iocestru', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     123   field_16    = 'Wind stress v                      ', 'iocestrv', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0  
     124   field_17    = 'Solar flux at ice/ocean surface    ', 'iicesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     125   field_18    = 'Non-solar flux at ice/ocean surface', 'iicenflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     126   field_19    = 'Snow precipitation                 ', 'isnowpre', 'kg/day  ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
     127! 
    111128   noumef      =   19      !  number of fields 
    112 ! 
    113 !           !         title of the field           !  name     !   units   !  save  ! multipl. ! additive ! 
    114 !           !                                      !           !           ! or not !  factor  !  factor  ! 
    115    field_1  = 'Snow thickness                     ', 'isnowthi', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    116    field_2  = 'Ice thickness                      ', 'iicethic', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    117    field_3  = 'Ice produced                       ', 'iiceprod', 'm/kt    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    118    field_4  = 'Ice concentration                  ', 'ileadfra', '%       ',    1   , -1.0     ,    1.0 
    119    field_5  = 'Ice temperature                    ', 'iicetemp', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    120    field_6  = 'Oceanic flux at the ice base       ', 'ioceflxb', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    121    field_7  = 'Ice velocity u                     ', 'iicevelu', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    122    field_8  = 'Ice velocity v                     ', 'iicevelv', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    123    field_9  = 'Sea surface temperature            ', 'isstempe', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    124    field_10 = 'Sea surface salinity               ', 'isssalin', 'PSU     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    125    field_11 = 'Total flux at ocean surface        ', 'iocetflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    126    field_12 = 'Solar flux at ocean surface        ', 'iocesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    127    field_13 = 'Non-solar flux at ocean surface    ', 'iocwnsfl', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    128    field_14 = 'Salt flux at ocean surface         ', 'iocesafl', 'kg/m2/kt',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    129    field_15 = 'Wind stress u                      ', 'iocestru', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    130    field_16 = 'Wind stress v                      ', 'iocestrv', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0  
    131    field_17 = 'Solar flux at ice/ocean surface    ', 'iicesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    132    field_18 = 'Non-solar flux at ice/ocean surface', 'iicenflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    133    field_19 = 'Snow precipitation                 ', 'isnowpre', 'kg/day  ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    134129/       
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist_ice_lim3

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1552 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
    1935   
    20    
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/README

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/fig_ht_fromQ.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/getname.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/plt_bsf.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/plt_msf.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_com.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plots.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plots.sh

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/time_series.sh

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_EMP.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_ICE.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_Q.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_S.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_SSH.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_T.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_U.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/ts_mean_V.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_ANT_Icethick_MARS.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_ANT_Icethick_SEPT.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_ARC_Icethick_MARS.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_ARC_Icethick_SEPT.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_EXP1_S_ARC_z105.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_EXP2_S_ARC_z105.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Emp.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Eq_S.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Eq_T.pro

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  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Eq_U.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Erp.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Iceleadfrac_MARS.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Iceleadfrac_SEPT.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Med_S_depth.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Med_S_tongue.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_PHCXX_PHCYY_ANT_Icethick.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_PHCXX_PHCYY_ARC_Icethick.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_Qnet.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_SSS.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_SST.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_S_z105.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_TS_ZGlobm.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_T_z105.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_ZonMxl.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_mxl10.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_zonal_S.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/xxx_zonal_T.pro

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IGCM00/COMP/lim2.card

    • Property svn:keywords set to Id
    r1764 r2528  
    2121 
    2222[OutputFiles] 
    23 List=   (${PREFIX_WFI1}_icemod.nc, ${R_OUT_ICE_WFI1}/${PREFIX}_${WFI1}_icemod.nc, Post_5D_icemod) 
     23List=   (${PREFIX_WFI1}_icemod.nc, ${R_OUT_ICE_WFI1}/${PREFIX}_${WFI1}_icemod.nc, Post_1M_icemod) 
    2424 
    2525[Post_1M_icemod] 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IGCM00/COMP/lim2.driver

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IGCM00/COMP/opa9.card

    • Property svn:keywords set to Id
    r1891 r2528  
    5454            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sst_data.nc, .),\ 
    5555       (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/subbasins.nc, .),\ 
    56             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/chlaseawifs_c1m-99-05_smooth_ORCA_R2.nc, chlorophyll.nc),\ 
    57             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/Tides_K1_drg_ORCA_R2.nc, K1rowdrg.nc),\ 
    58             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/Tides_M2_drg_ORCA_R2.nc, M2rowdrg.nc),\ 
    59             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/tmaskitf_ORCA2_bis.nc, mask_itf.nc),\ 
     56            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/chlorophyll.nc, .),\ 
     57            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/K1rowdrg.nc, .),\ 
     58            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/M2rowdrg.nc, .),\ 
     59            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/mask_itf.nc, .),\ 
    6060            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/kRGB61.txt, .) 
    6161 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IGCM00/COMP/opa9.driver

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IGCM00/config.card

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/AA_job

    • Property svn:keywords set to Id
    r2521 r2528  
    113113cp ${R_EXPER}/namelist_pisces     namelist_pisces 
    114114cp ${R_EXPER}/kRGB61.txt          kRGB61.txt 
    115 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    116 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    117115 
    118116ls -alF 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/EMPave_old.dat

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r2521 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    133133   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    134134   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    135    <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean current along i-axis"        unit="m/s"                  /> 
     135   <field id="uoce_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                 /> 
    136136   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    137137   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    138    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    139    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
     139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    150151   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    151152   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    152    <field id="voce_eff"     description="Effective ocean current along j-axis"        unit="m/s"                  /> 
     153   <field id="voce_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"      unit="m3/s"                 /> 
    153154   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    154155   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    155    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    156    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
     157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    166168      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    167169   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    168    <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical velocity"           unit="m/s"                  /> 
     170   <field id="woce_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    169171   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    205206 
    206207     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    207        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" /> 
     208       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    208209       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    209        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mol-C/L" /> 
    210        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    211        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    212        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    213        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    214        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    215        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    216        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    217        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    218        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    219        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    220        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" /> 
    221        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    222        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    223        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    224        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" /> 
    225        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" /> 
    226        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    227        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    228        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    229        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    230        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
     210       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
     211       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     212       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     213       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
     214       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="molSi/L" /> 
     215       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
     216       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
     217       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="molC/L" /> 
     218       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     219       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
     220       <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
     221       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
     222       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
     223       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
     224       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
     225       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
     226       <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
     227       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     228       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
     229       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
     230       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     231       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    231232     </group> 
    232233 
    233       <!-- diad on T grid --> 
     234      <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc --> 
    234235 
    235236     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    236        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"            axis_ref="deptht" /> 
    237        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    238        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    239        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"         axis_ref="deptht" /> 
    240        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    241        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    242        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    243        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    244        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    245        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    246        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    247        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    248        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    249        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    250        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol-N/m2/s"      /> 
    251        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol-C/m2/s"      /> 
    252        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
    253        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol-Si/m2/s"     /> 
    254        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol-C/m2/s"      /> 
    255        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s"      /> 
    256        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s" /> 
    257        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" /> 
    258        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm" /> 
    259        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm" /> 
    260        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m" /> 
    261        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s" /> 
     237       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
     238       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     239       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     240       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
     241       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     242       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     243       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     244       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     245       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     246       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     247       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     248       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     249       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     250       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     251       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
     252       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
     253       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
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     255       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
     256       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
     257       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
     258       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
     259       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
     260       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
     261       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
     262       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"    /> 
    262263     </group> 
    263264        
     
    333334     <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    334335     <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    335      <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
     336     <field ref="emp-rnf"      name="sowaflup"  /> 
    336337     <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    337      <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
     338     <field ref="emps-rnf"     name="sowaflcd"  /> 
    338339     <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    339340     <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
     
    691692      </grid> 
    692693 
     694 
    693695    </grid_definition>     
    694696     
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/kRGB61.txt

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    • Property svn:keywords set to Id
    r1798 r2528  
    4141   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4242   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     43   caco3r     =  0.15     ! mean rain ratio 
    4444/ 
    4545!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    115115!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    116116   ln_dustfer  =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    117    ln_river    =  .false.  ! boolean for river input of nutrients 
     117   ln_river    =  .true.  ! boolean for river input of nutrients 
    118118   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    119119   ln_sedinput =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_top

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
    r1646 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtoptrc) 
    3 !! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtoptrd) 
    4 !!              6 - tracer advection                      (namtopadv) 
    5 !!              7 - tracer bottom boundary                (namtopbbl) 
    6 !!              8 - tracer lateral diffusion              (namtopldf) 
    7 !!              3 - tracer vertical physics               (namtopzdf) 
    8 !!              9 - tracer newtonian damping              (namtopdmp) 
     2!! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtrc    ) 
     3!! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtrc_trd) 
     4!!              3 - tracer advection                      (namtrc_adv) 
     5!!              4 - tracer lateral diffusion              (namtrc_ldf) 
     6!!              5 - tracer vertical physics               (namtrc_zdf) 
     7!!              6 - tracer newtonian damping              (namtrc_dmp) 
    98!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    109!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    11 &namtoptrc     !   tracers definition 
     10&namtrc     !   tracers definition 
    1211!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    13    ndttrc      =  1        !  time step frequency for passive tracers       
    14    nwritetrc   =  5475     !  time step frequency for tracer outputs 
    15    ln_rsttr    = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    16    nrsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
     12   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers       
     13   nn_writetrc   =  5475     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     14   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
     15   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    1716                           !                  = 1 do not use the value in the restart file 
    1817                           !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    19    cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (input) 
    20    cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
     18   cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
     19   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
    2120! 
    2221!              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
    2322!              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
    2423!              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    31    tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    32    tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    33    tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    34    tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    35    tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    36    tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    37    tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    38    tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    39    tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    40    tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    41    tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    42    tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    43    tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    44    tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    45    tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    46    tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    47    tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    48    tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     24   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     25   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
     26   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     27   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     28   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     29   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     30   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     31   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     32   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     33   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     34   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     35   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     36   sn_tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     37   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     38   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     39   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     40   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     41   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     42   sn_tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     43   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     44   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     46   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     47   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4948/ 
    5049!----------------------------------------------------------------------- 
    51 &namtopadv    !   advection scheme for passive tracer  
     50&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    5251!----------------------------------------------------------------------- 
    5352   ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    54    ln_trcadv_tvd    =  .false.  !  TVD scheme    
     53   ln_trcadv_tvd    =  .false.  !  TVD scheme 
    5554   ln_trcadv_muscl  =  .true.   !  MUSCL scheme 
    5655   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    57    ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    58    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smol-Car. scheme  
    59    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smol-Car. scheme  
    60    crosster         =  .false.  !  computes Smol-Car crossterms (T) or not (F) 
     56   ln_trcadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
     57   ln_trcadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    6158/ 
    6259!----------------------------------------------------------------------- 
    63 &namtopbbl    !   bottom boundary layer scheme for passive tracer  
    64 !----------------------------------------------------------------------- 
    65    atrcbbl          = 1000.     !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    66 / 
    67 !----------------------------------------------------------------------- 
    68 &namtopldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
     60&namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
    6961!----------------------------------------------------------------------- 
    7062   ln_trcldf_diff   =  .true.   !  performs lateral diffusion (T) or not (F) 
     
    7769   ln_trcldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    7870!                               !  Coefficient 
    79    ahtrc0      =  2000.         !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    80    ahtrb0      =     0.         !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    81    aeivtr0     =  2000.         !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_trcldf_eiv") 
    82    trcrat      =  1.            !  ratio betweeen passive and active tracer diffusion coeff 
     71   rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    8372/ 
    8473!----------------------------------------------------------------------- 
    85 &namtopzdf        !   vertical physics 
     74&namtrc_zdf        !   vertical physics 
    8675!----------------------------------------------------------------------- 
    8776   ln_trczdf_exp   =  .false.  !  split explicit (T) or implicit (F) time stepping 
    88    n_trczdf_exp    =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
     77   nn_trczdf_exp   =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
    8978/ 
    9079!----------------------------------------------------------------------- 
    91 &namtoprad        !  treatment of negative concentrations  
     80&namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations  
    9281!----------------------------------------------------------------------- 
    9382   ln_trcrad   =  .true.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    9483/ 
    9584!----------------------------------------------------------------------- 
    96 &namtopdmp        !   passive tracer newtonian damping                 ('key_trcdmp') 
     85&namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    ('key_tradmp && key_trcdmp') 
    9786!----------------------------------------------------------------------- 
    98    ndmptr      =   20      !  type of damping in passive tracers 
    99                            !     ='latitude', damping poleward of 'ndmp' degrees and function  
    100                            !                  of the distance-to-coast. Red and Med Seas as ndmptr=-1 
    101                            !     =-1 damping only in Med and Red Seas 
    102    ndmpftr     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    103    nmldmptr    =    1      !  type of damping: =0 damping throughout the water column 
    104                            !                   =1 no damping in the mixed layer defined by avt >5cm2/s ) 
    105                            !                   =2 no damping in the mixed layer defined rho<rho(surf)+.01 ) 
    106    sdmptr      =   50.     !  surface time scale for internal damping (days) 
    107    bdmptr      =  360.     !  bottom  time scale for internal damping (days) 
    108    hdmptr      =  800.     !  depth of transition between sdmptr and bdmptr (meters) 
     87   nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     88                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
     89                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     90   nn_zdmp_tr  =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     91                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     92                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     93   rn_surf_tr  =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
     94   rn_bot_tr   =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
     95   rn_dep_tr   =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
     96   nn_file_tr  =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    10997/ 
    11098!----------------------------------------------------------------------- 
    111 &namtoptrd       !   diagnostics on tracer trends 
     99&namtrc_trd       !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
    112100!                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    113101!---------------------------------------------------------------------- 
    114    ntrd_trc   =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
    115    nctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    116    ucf_trc    =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     102   nn_trd_trc  =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
     103   nn_ctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     104   rn_ucf_trc  =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    117105   ln_trdmld_trc_restart = .false.  !  restart for ML diagnostics 
    118106   ln_trdmld_trc_instant = .true.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    119    luttrd(1)  =   .true. 
    120    luttrd(2)  =   .true. 
    121    luttrd(3)  =   .false. 
    122    luttrd(4)  =   .false. 
    123    luttrd(5)  =   .false. 
    124    luttrd(6)  =   .false. 
    125    luttrd(7)  =   .false. 
    126    luttrd(8)  =   .false. 
    127    luttrd(9)  =   .false. 
    128    luttrd(10) =   .false. 
    129    luttrd(11) =   .false. 
    130    luttrd(12) =   .false. 
    131    luttrd(13) =   .false. 
    132    luttrd(14) =   .false. 
    133    luttrd(15) =   .false. 
    134    luttrd(16) =   .false. 
    135    luttrd(17) =   .false. 
    136    luttrd(18) =   .false. 
    137    luttrd(19) =   .false. 
    138    luttrd(20) =   .false. 
    139    luttrd(21) =   .false. 
    140    luttrd(22) =   .false. 
    141    luttrd(23) =   .true. 
    142    luttrd(24) =   .false. 
     107   ln_trdtrc(1)  =   .true. 
     108   ln_trdtrc(2)  =   .true. 
     109   ln_trdtrc(3)  =   .false. 
     110   ln_trdtrc(4)  =   .false. 
     111   ln_trdtrc(5)  =   .false. 
     112   ln_trdtrc(6)  =   .false. 
     113   ln_trdtrc(7)  =   .false. 
     114   ln_trdtrc(8)  =   .false. 
     115   ln_trdtrc(9)  =   .false. 
     116   ln_trdtrc(10) =   .false. 
     117   ln_trdtrc(11) =   .false. 
     118   ln_trdtrc(12) =   .false. 
     119   ln_trdtrc(13) =   .false. 
     120   ln_trdtrc(14) =   .false. 
     121   ln_trdtrc(15) =   .false. 
     122   ln_trdtrc(16) =   .false. 
     123   ln_trdtrc(17) =   .false. 
     124   ln_trdtrc(18) =   .false. 
     125   ln_trdtrc(19) =   .false. 
     126   ln_trdtrc(20) =   .false. 
     127   ln_trdtrc(21) =   .false. 
     128   ln_trdtrc(22) =   .false. 
     129   ln_trdtrc(23) =   .true. 
     130   ln_trdtrc(24) =   .false. 
    143131/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1552 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
    1935   
    20    
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/lim2.card

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/lim2.driver

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/opa9.card

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/opa9.driver

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/pisces.card

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/COMP/pisces.driver

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/README

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/IGCM00/config.card

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/AA_job

    • Property svn:keywords set to Id
    r2521 r2528  
    113113cp ${R_EXPER}/namelist_pisces     namelist_pisces 
    114114cp ${R_EXPER}/kRGB61.txt          kRGB61.txt 
    115 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    116 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    117115 
    118116ls -alF 
     
    122120Rapatrie ${R_TMP} INPUTS_DYNA_v3.tar 
    123121Rapatrie ${R_TMP} INPUTS_PISCES_v3.tar 
    124 \mv NEMOV3_mesh_mask.nc mesh_mask.nc 
    125122 
    126123ls -alF 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r1837 r2528  
    1616  
    1717      <!-- ptrc on T grid --> 
    18            
    19      <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    20        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" /> 
     18  
     19     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
     20       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    2121       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    22        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mol-C/L" /> 
    23        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    24        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    25        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    26        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    27        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    28        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    29        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    30        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    31        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    32        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    33        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" /> 
    34        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    35        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    36        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    37        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" /> 
    38        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" /> 
    39        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    40        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    41        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    42        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    43        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
     22       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
     23       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     24       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     25       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
     26       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="molSi/L" /> 
     27       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
     28       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
     29       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="molC/L" /> 
     30       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     31       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
     32       <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
     33       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
     34       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
     35       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
     36       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
     37       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
     38       <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
     39       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     40       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
     41       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
     42       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     43       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    4444     </group> 
    4545 
    46       <!-- diad on T grid --> 
     46      <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc --> 
    4747 
    4848     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    49        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"            axis_ref="deptht" /> 
    50        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    51        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    52        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"         axis_ref="deptht" /> 
    53        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    54        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    55        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    56        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    57        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    58        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    59        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    60        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    61        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    62        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    63        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol-N/m2/s"      /> 
    64        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol-C/m2/s"      /> 
    65        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
    66        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol-Si/m2/s"     /> 
    67        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol-C/m2/s"      /> 
    68        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s" /> 
    69        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s" /> 
    70        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" /> 
    71        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm" /> 
    72        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm" /> 
    73        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m" /> 
    74        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s" /> 
    75      </group> 
     49       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
     50       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     51       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     52       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
     53       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     54       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     55       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     56       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     57       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     58       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     59       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     60       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     61       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     62       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     63       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
     64       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
     65       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
     66       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="molSi/m2/s"     /> 
     67       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
     68       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
     69       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
     70       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
     71       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
     72       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
     73       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
     74       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"    /> 
     75     </group>          
    7676 
    7777      <!-- scalar --> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/kRGB61.txt

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
    r1798 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - miscellaneous    (namctl,nammpp) 
    4 !!              3 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
    5 !!              6 - Tracer           (nameos, namcla, namqsr) 
    6 !!              7 - Inputs dynamics  (namdyna) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
     4!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     7!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     8!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     9!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp) 
     10!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
     11!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    715!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    8 !  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
    916 
    1017!!====================================================================== 
    1118!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1219!!====================================================================== 
    13 !!   namrun            parameters of the run 
    14 !!====================================================================== 
    15  
     20!!   namrun        parameters of the run 
     21!!====================================================================== 
     22! 
    1623!----------------------------------------------------------------------- 
    1724&namrun        !   parameters of the run 
    1825!----------------------------------------------------------------------- 
    19    no          =       0   !  job number 
    20    cexper      =  "PISCES"  !  experience name  
     26   nn_no       =       0   !  job number 
     27   cn_exp      =  "ORCA2P"  !  experience name  
     28   nn_it000    =       1   !  first time step 
     29   nn_itend    =    1460   !  last  time step (std 5475) 
     30   nn_date0    =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
     31   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
     32   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
     33   nn_stock    =    1460   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     34   nn_write    =    1460   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
     35   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
     36   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     37   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
     38   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (working only with iom_nf90 routines) 
    2139   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    22    nrstdt      =       0   !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
    23                            !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
    24                            !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    25    nit000      =       1   !  first time step 
    26    nitend      =     1460  !  last  time step 
    27    ndate0      =  010101   !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
    28    nleapy      =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    29    ninist      =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    30    nstock      =     1460  !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    31    nwrite      =     1460  !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
    32    ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    33 / 
    34 !----------------------------------------------------------------------- 
    35 &namctl       !   Control prints & Benchmark 
    36 !----------------------------------------------------------------------- 
    37    ln_ctl     = .false.    !  trends control print (expensive!) 
    38    nprint     =    0       !  level of print (0 no extra print) 
    39    nictls     =    1       !  start i indice of control sum (use to compare mono versus 
    40    nictle     =    182       !  end   i indice of control sum        multi processor runs 
    41    njctls     =    1       !  start j indice of control               over a subdomain) 
    42    njctle     =    149       !  end   j indice of control  
    43    isplt      =    1       !  number of processors in i-direction 
    44    jsplt      =    1       !  number of processors in j-direction 
    45    nbench     =    0       !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    46 / 
    47 !----------------------------------------------------------------------- 
    48 &nammpp      !   Massively Parallel Processing                         ("key_mpp_mpi) 
    49 !----------------------------------------------------------------------- 
    50    c_mpi_send =  'S'       !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    51                            !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    52 / 
    53 !----------------------------------------------------------------------- 
    54 &namzgr       !   vertical coordinate 
     40   nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
     41                               !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
     42                               !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
     43   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     44   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     45/ 
     46 
     47!!====================================================================== 
     48!!                      ***  Domain namelists  *** 
     49!!====================================================================== 
     50!!   namzgr       vertical coordinate 
     51!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
     52!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     53!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     54!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     55!!====================================================================== 
     56! 
     57!----------------------------------------------------------------------- 
     58&namzgr        !   vertical coordinate 
    5559!----------------------------------------------------------------------- 
    5660   ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
     
    5963/ 
    6064!----------------------------------------------------------------------- 
    61 &namzgr_sco   !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    62 !----------------------------------------------------------------------- 
    63    sbot_min    =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
    64    sbot_max    = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
    65    theta       =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    66    thetb       =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    67    r_max       =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     65&namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
     66!----------------------------------------------------------------------- 
     67   rn_sbot_min =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
     68   rn_sbot_max = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
     69   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
     70   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
     71   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     72   ln_s_sigma  = .false.   !  hybrid s-sigma coordinates 
     73   rn_bb       =    0.8    !  stretching with s-sigma 
     74   rn_hc       =  150.0    !  critical depth with s-sigma  
    6875/ 
    6976!----------------------------------------------------------------------- 
    7077&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    7178!----------------------------------------------------------------------- 
    72    e3zps_min   =    25.    !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
    73    e3zps_rat   =    0.2    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
    74    nmsh        =    1      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
    75    nacc        =    0      !  =1 acceleration of convergence method used, rdt < rdttra(k) 
    76                            !  =0, no acceleration, rdt = rdttra 
    77    atfp        =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    78    rdt         = 21600.    !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0) 
    79    rdtmin      = 21600.    !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
    80    rdtmax      = 21600.    !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
    81    rdth        =  800.     !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    82 / 
    83 !----------------------------------------------------------------------- 
    84 &namtraldf    !   lateral diffusion scheme for tracer 
    85 !----------------------------------------------------------------------- 
    86 !                               !  Type of the operator : 
    87    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator 
    88    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator 
    89                                 !  Direction of action  : 
    90    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level 
    91    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    92    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    93 !                               !  Coefficient 
    94    aht0        =  2000.         !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    95    ahtb0       =     0.         !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    96    aeiv0       =  2000.         !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    97 / 
    98 !----------------------------------------------------------------------- 
    99 &namcla        !   cross land advection 
    100 !----------------------------------------------------------------------- 
    101    n_cla       =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
    102 / 
    103 !----------------------------------------------------------------------- 
    104 &namqsr        !   penetrative solar radiation 
    105 !----------------------------------------------------------------------- 
     79   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
     80   nn_closea   =    0      !  closed seas and lakes are removed (=0) or kept (=1) from the ORCA domain 
     81   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
     82   rn_hmin     =   -3.     !  minimum depth of the ocean (>0) or minimum number of ocean level (<0) 
     83   rn_e3zps_min=   20.     !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
     84   rn_e3zps_rat=    0.1    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
     85                           ! 
     86   rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0)   ==> 5760 
     87   nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step (for the split explicit algorithm) ("key_dynspg_ts") 
     88   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
     89   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
     90                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra 
     91   rn_rdtmin   = 21600.          !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
     92   rn_rdtmax   = 21600.          !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
     93   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
     114!!====================================================================== 
     115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
     116!!====================================================================== 
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
     131!----------------------------------------------------------------------- 
     132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
     133!----------------------------------------------------------------------- 
     134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
     142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
     143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
     148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     152/ 
     153!----------------------------------------------------------------------- 
     154&namsbc_ana    !   analytical surface boundary condition 
     155!----------------------------------------------------------------------- 
     156   nn_tau000   =   0       !  gently increase the stress over the first ntau_rst time-steps 
     157   rn_utau0    =   0.5     !  uniform value for the i-stress 
     158   rn_vtau0    =   0.e0    !  uniform value for the j-stress 
     159   rn_qns0     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux 
     160   rn_qsr0     =   0.e0    !  uniform value for the solar radiation 
     161   rn_emp0     =   0.e0    !  uniform value for the freswater budget (E-P) 
     162/ 
     163!----------------------------------------------------------------------- 
     164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
     165!----------------------------------------------------------------------- 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
     174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
     175/       
     176!----------------------------------------------------------------------- 
     177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
     178!----------------------------------------------------------------------- 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
     189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
     190/ 
     191!----------------------------------------------------------------------- 
     192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
     206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
     209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
     210/ 
     211!----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     240cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
     241/ 
     242!----------------------------------------------------------------------- 
     243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
     244!----------------------------------------------------------------------- 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
     249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     250   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
     251   ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
     252   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    106253   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
     254   nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
    107255   rn_abs      =   0.58    !  RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1) 
    108256   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    109    rn_si2      =   62.0    !  3 bands: longest depth of extinction (for blue waveband & 0.01 mg/m2 Chl) 
    110  
     257   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
     258/ 
     259!----------------------------------------------------------------------- 
     260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
     261!----------------------------------------------------------------------- 
     262!              !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly'   ,        -1         , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly'   ,         0         , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'               ,        24         , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'               ,        24         , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'               ,         0         , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
     270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     272   ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
     273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
     275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth =  .false.  !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   =  .false.  !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   =  .false.  !  read in salinity information for runoff 
     279/ 
     280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     289/ 
     290!----------------------------------------------------------------------- 
     291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
     292!----------------------------------------------------------------------- 
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
     298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     300   nn_sssr     =     2     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)  
     301                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0) 
     302   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K] 
     303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
     304   ln_sssr_bnd =   .true.  !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     306/       
     307!----------------------------------------------------------------------- 
     308&namsbc_alb    !   albedo parameters 
     309!----------------------------------------------------------------------- 
     310   rn_cloud    =    0.06   !  cloud correction to snow and ice albedo  
     311   rn_albice   =    0.53   !  albedo of melting ice in the arctic and antarctic 
     312   rn_alphd    =    0.80   !  coefficients for linear interpolation used to 
     313   rn_alphc    =    0.65   !  compute albedo between two extremes values  
     314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
     315/ 
     316 
     317!!====================================================================== 
     318!!               ***  Lateral boundary condition  *** 
     319!!====================================================================== 
     320!!   namlbc        lateral momentum boundary condition 
     321!!   namcla        cross land advection 
     322!!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc") 
     323!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif")  
     324!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy") 
     325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
     326!!====================================================================== 
     327! 
     328!----------------------------------------------------------------------- 
     329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     330!----------------------------------------------------------------------- 
     331   rn_shlat    =    2.     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
     332                           !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
     333/ 
     334!----------------------------------------------------------------------- 
     335&namcla        !   cross land advection 
     336!----------------------------------------------------------------------- 
     337   nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
     338/ 
     339!----------------------------------------------------------------------- 
     340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
     341!----------------------------------------------------------------------- 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     358                           !  = 1 the total volume remains constant 
     359/ 
     360!----------------------------------------------------------------------- 
     361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
     362!----------------------------------------------------------------------- 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true.  !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     367/ 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
     369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
     370!----------------------------------------------------------------------- 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     399/ 
     400 
     401!!====================================================================== 
     402!!                 ***  Bottom boundary condition  *** 
     403!!====================================================================== 
     404!!   nambfr        bottom friction 
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
     406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
     407!!====================================================================== 
     408! 
     409!----------------------------------------------------------------------- 
     410&nambfr        !   bottom friction 
     411!----------------------------------------------------------------------- 
     412   nn_bfr      =    1      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction 
     413                           !                              = 2 : nonlinear friction 
     414   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case) 
     415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
     416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
     417   ln_bfr2d    =   .false. !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d = .true.) 
     419/ 
     420!----------------------------------------------------------------------- 
     421&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
     422!----------------------------------------------------------------------- 
     423   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
     424   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux  
     425                           !     = 1 constant flux 
     426                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2)  
     427   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2] 
     428/ 
     429!----------------------------------------------------------------------- 
     430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
     431!----------------------------------------------------------------------- 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
     438!!====================================================================== 
     439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     440!!====================================================================== 
     441!!   nameos        equation of state 
     442!!   namtra_adv    advection scheme 
     443!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme 
     444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
     445!!====================================================================== 
     446 
    111447!----------------------------------------------------------------------- 
    112448&nameos        !   ocean physical parameters 
    113449!----------------------------------------------------------------------- 
    114    neos        =    0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     450   nn_eos      =    0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    115451                           !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    116452                           !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    117453                           !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    118    ralpha      =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
    119    rbeta       =    0.001  !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
    120 / 
    121 !----------------------------------------------------------------------- 
    122 &namdyn        !   offline parameters  
    123 !----------------------------------------------------------------------- 
    124     ndtadyn   =  73        ! number of period in the file for one year     
    125     ndtatot   =  73        ! total number of period in the file     
    126     nsptint   =  1         ! indicator for time interpolation     
    127     nficdyn   =  2         ! number of file to read     
     454   rn_alpha    =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
     455   rn_beta     =    0.001  !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
     456/ 
     457!----------------------------------------------------------------------- 
     458&namtra_adv    !   advection scheme for tracer  
     459!----------------------------------------------------------------------- 
     460   ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
     461   ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme                 
     462   ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme              
     463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
     464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
     466/ 
     467!----------------------------------------------------------------------- 
     468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
     469!----------------------------------------------------------------------- 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     483/ 
     484!----------------------------------------------------------------------- 
     485&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      ('key_tradmp') 
     486!----------------------------------------------------------------------- 
     487   nn_hdmp     =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     488                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
     489                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     490   nn_zdmp     =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     491                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     492                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     493   rn_surf     =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
     494   rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
     495   rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
     496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     497/ 
     498 
     499!!====================================================================== 
     500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     501!!====================================================================== 
     502!!   namdyn_adv    formulation of the momentum advection 
     503!!   namdyn_vor    advection scheme 
     504!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient 
     505!!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (CPP key only) 
     506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
     507!!   namdyn        offline: dynamics read in files                      ("key_offline") 
     508!!====================================================================== 
     509! 
     510!----------------------------------------------------------------------- 
     511&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     512!----------------------------------------------------------------------- 
     513   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F)   
     514   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
     515   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme  
     516 
     517!----------------------------------------------------------------------- 
     518&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
     519!----------------------------------------------------------------------- 
     520   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme   
     521   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme     
     522   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme                
     523   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme   
     524/ 
     525!----------------------------------------------------------------------- 
     526&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
     527!----------------------------------------------------------------------- 
     528   ln_hpg_zco  = .false.   !  z-coordinate - full steps                    
     529   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
     530   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     531   ln_hpg_hel  = .false.   !  s-coordinate (helsinki modification) 
     532   ln_hpg_wdj  = .false.   !  s-coordinate (weighted density jacobian) 
     533   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
     534   ln_hpg_rot  = .false.   !  s-coordinate (ROTated axes scheme) 
     535   rn_gamma    = 0.e0      !  weighting coefficient (wdj scheme) 
     536   ln_dynhpg_imp = .false. !  time stepping: semi-implicit time scheme  (T) 
     537                                 !           centered      time scheme  (F) 
     538/ 
     539!----------------------------------------------------------------------- 
     540!namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
     541!----------------------------------------------------------------------- 
     542!                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp") 
     543!                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt") 
     544!                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts") 
     545 
     546!----------------------------------------------------------------------- 
     547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
     548!----------------------------------------------------------------------- 
     549   !                       !  Type of the operator :  
     550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
     551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
     552   !                       !  Direction of action  :  
     553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
     554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
     555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     556   !                       !  Coefficient 
     557   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     560/ 
     561!----------------------------------------------------------------------- 
     562&namdyn        !   offline dynamics read in files                       ("key_offline") 
     563!----------------------------------------------------------------------- 
     564    ndtadyn   =  73        ! number of period in the file for one year 
     565    ndtatot   =  73        ! total number of period in the file 
     566    nsptint   =  1         ! indicator for time interpolation 
    128567    lperdyn   = .true.     ! periodicity of the unique file (T) 
    129 !                          ! F  (default)   computed with Blanke' scheme  
    130     cfile_grid_T = 'NEMOV3_5d_21210101_21211231_grid_T.nc' ! name of grid_T file 
    131     cfile_grid_U = 'NEMOV3_5d_21210101_21211231_grid_U.nc' ! name of grid_U file 
    132     cfile_grid_V = 'NEMOV3_5d_21210101_21211231_grid_V.nc' ! name of grid_V file 
    133     cfile_grid_W = 'NEMOV3_5d_21210101_21211231_grid_W.nc' ! name of grid_W file 
    134 / 
    135  
     568                           ! F  (default)   computed with Blanke' scheme 
     569    cfile_grid_T = 'dyna_grid_T.nc' ! name of grid_T file 
     570    cfile_grid_U = 'dyna_grid_U.nc' ! name of grid_U file 
     571    cfile_grid_V = 'dyna_grid_V.nc' ! name of grid_V file 
     572    cfile_grid_W = 'dyna_grid_W.nc' ! name of grid_W file 
     573/ 
     574 
     575!!====================================================================== 
     576!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
     577!!====================================================================== 
     578!!    namzdf        vertical physics 
     579!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     580!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     581!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     582!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     583!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     584!!====================================================================== 
     585! 
     586!----------------------------------------------------------------------- 
     587&namzdf        !   vertical physics 
     588!----------------------------------------------------------------------- 
     589   rn_avm0     =   1.2e-4  !  vertical eddy viscosity   [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst") 
     590   rn_avt0     =   1.2e-5  !  vertical eddy diffusivity [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst") 
     591   nn_avb      =    0      !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0) 
     592   nn_havtb    =    0      !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0) 
     593   ln_zdfevd   = .true.    !  enhanced vertical diffusion (evd) (T) or not (F) 
     594   nn_evdm     =    0      !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
     595   rn_avevd    =  100.     !  evd mixing coefficient [m2/s] 
     596   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative algorithm (T) or not (F) 
     597   nn_npc      =    1            !  frequency of application of npc 
     598   nn_npcp     =  365            !  npc control print frequency 
     599   ln_zdfexp   = .false.   !  time-stepping: split-explicit (T) or implicit (F) time stepping 
     600   nn_zdfexp   =    3            !  number of sub-timestep for ln_zdfexp=T 
     601/ 
     602!----------------------------------------------------------------------- 
     603&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       ("key_zdfric" ) 
     604!----------------------------------------------------------------------- 
     605   rn_avmri    = 100.e-4   !  maximum value of the vertical viscosity 
     606   rn_alp      =   5.      !  coefficient of the parameterization 
     607   nn_ric      =   2       !  coefficient of the parameterization 
     608/ 
     609!----------------------------------------------------------------------- 
     610&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  ("key_zdftke") 
     611!----------------------------------------------------------------------- 
     612   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
     613   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
     614   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
     615   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
     616   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
     617   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
     618                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
     619                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
     620                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
     621   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
     622   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     623   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     624   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     625   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     626   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     627                           !        = 0 no penetration 
     628                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     629                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     630                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     631   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     632   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
     633                           !        = 0  constant 10 m length scale 
     634                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
     635/ 
     636!------------------------------------------------------------------------ 
     637&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionnally: 
     638!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
     639   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing  
     640   rn_difmiw   =  1.0e-04  !  constant internal wave viscosity [m2/s] 
     641   rn_difsiw   =  0.1e-04  !  constant internal wave diffusivity [m2/s] 
     642   rn_riinfty  =  0.8      !  local Richardson Number limit for shear instability 
     643   rn_difri    =  0.0050   !  maximum shear mixing at Rig = 0    [m2/s] 
     644   rn_bvsqcon  = -0.01e-07 !  Brunt-Vaisala squared for maximum convection [1/s2]  
     645   rn_difcon   =  1.       !  maximum mixing in interior convection [m2/s]  
     646   nn_avb      =  0        !  horizontal averaged (=1) or not (=0) on avt and amv 
     647   nn_ave      =  1        !  constant (=0) or profile (=1) background on avt 
     648/ 
     649!----------------------------------------------------------------------- 
     650&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     651!----------------------------------------------------------------------- 
     652   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     653   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
     654   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     655   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     656   ln_crban      = .TRUE.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     657   ln_sigpsi     = .TRUE.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     658   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     659   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     660   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     661   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     662   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     663   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     664   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     665   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     666/ 
     667!----------------------------------------------------------------------- 
     668&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
     669!----------------------------------------------------------------------- 
     670   rn_avts     = 1.e-4     !  maximum avs (vertical mixing on salinity) 
     671   rn_hsbfr    = 1.6       !  heat/salt buoyancy flux ratio 
     672/ 
     673!----------------------------------------------------------------------- 
     674&namzdf_tmx    !   tidal mixing parameterization                        ("key_zdftmx") 
     675!----------------------------------------------------------------------- 
     676   rn_htmx     = 500.      !  vertical decay scale for turbulence (meters) 
     677   rn_n2min    = 1.e-8     !  threshold of the Brunt-Vaisala frequency (s-1) 
     678   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency 
     679   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency  
     680   ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
     681   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
     682/ 
     683 
     684!!====================================================================== 
     685!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     686!!====================================================================== 
     687!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi) 
     688!!   nammpp_dyndist    Massively Parallel domain decomposition          ("key_agrif" && "key_mpp_dyndist") 
     689!!   namctl            Control prints & Benchmark 
     690!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
     691!!====================================================================== 
     692! 
     693!----------------------------------------------------------------------- 
     694&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     695!----------------------------------------------------------------------- 
     696   nn_solv     =      1    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
     697                           !                   =2 successive-over-relaxation (sor) 
     698   nn_sol_arp  =      0    !  absolute/relative (0/1) precision convergence test 
     699   rn_eps      =  1.e-6    !  absolute precision of the solver 
     700   nn_nmin     =    300    !  minimum of iterations for the SOR solver 
     701   nn_nmax     =    800    !  maximum of iterations for the SOR solver 
     702   nn_nmod     =     10    !  frequency of test for the SOR solver 
     703   rn_resmax   =  1.e-10   !  absolute precision for the SOR solver 
     704   rn_sor      =  1.92     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
     705/ 
     706!----------------------------------------------------------------------- 
     707&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
     708!----------------------------------------------------------------------- 
     709   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
     710                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
     711   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     712/ 
     713!----------------------------------------------------------------------- 
     714&nammpp_dyndist !   Massively Parallel Distribution for AGRIF zoom      ("key_agrif" && "key_mpp_dyndist") 
     715!----------------------------------------------------------------------- 
     716   jpni        =    1      !  jpni   number of processors following i 
     717   jpnj        =    1      !  jpnj   number of processors following j 
     718   jpnij       =    1      !  jpnij  number of local domains 
     719/ 
     720!----------------------------------------------------------------------- 
     721&namctl        !   Control prints & Benchmark 
     722!----------------------------------------------------------------------- 
     723   ln_ctl      = .false.   !  trends control print (expensive!) 
     724   nn_print    =    0      !  level of print (0 no extra print) 
     725   nn_ictls    =    0      !  start i indice of control sum (use to compare mono versus 
     726   nn_ictle    =    0      !  end   i indice of control sum        multi processor runs 
     727   nn_jctls    =    0      !  start j indice of control               over a subdomain) 
     728   nn_jctle    =    0      !  end   j indice of control 
     729   nn_isplt    =    1      !  number of processors in i-direction 
     730   nn_jsplt    =    1      !  number of processors in j-direction 
     731   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
     732                           !     (no physical validity of the results) 
     733/ 
     734 
     735!!====================================================================== 
     736!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     737!!====================================================================== 
     738!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
     739!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
     740!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
     741!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
     742!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     743!!====================================================================== 
     744! 
     745!----------------------------------------------------------------------- 
     746&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     747!----------------------------------------------------------------------- 
     748   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     749   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     750   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     751                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     752                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     753   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     754                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     755/ 
     756!----------------------------------------------------------------------- 
     757&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
     758!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
     759!----------------------------------------------------------------------- 
     760   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     761   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     762   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     763   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
     764   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
     765   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
     766   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     767/ 
     768!----------------------------------------------------------------------- 
     769&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
     770!----------------------------------------------------------------------- 
     771   ln_rstflo  = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     772   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     773   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     774   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     775   ln_flork4  = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     776                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
     777                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
     778/ 
     779!----------------------------------------------------------------------- 
     780&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
     781!----------------------------------------------------------------------- 
     782   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     783   ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
     784   ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     785                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
     786   ln_ptrcomp = .false.    !  Add decomposition : overturning 
     787   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
     788   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     789/ 
     790!----------------------------------------------------------------------- 
     791&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     792!----------------------------------------------------------------------- 
     793   ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     794/ 
     795 
     796!!====================================================================== 
     797!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     798!!====================================================================== 
     799!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     800!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     801!!====================================================================== 
     802! 
     803!----------------------------------------------------------------------- 
     804 &namobs      !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     805!----------------------------------------------------------------------- 
     806   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     807   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     808   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     809   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     810   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     811   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     812 
     813   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     814 
     815   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     816                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     817 
     818   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     819                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     820                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     821 
     822   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     823                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     824                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     825                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     826                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     827                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     828                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     829                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     830                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     831                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     832                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     833                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     834                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     835                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     836   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
     837   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     838                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     839                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     840                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     841   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
     842   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     843                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     844   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
     845   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
     846                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     847                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     848                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     849                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     850                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     851                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     852                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     853                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     854                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     855                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     856                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     857   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     858                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     859                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     860   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     861   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     862                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
     863   ln_grid_global = .true. 
     864   ln_grid_search_lookup = .false. 
     865/  
     866!----------------------------------------------------------------------- 
     867&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     868!----------------------------------------------------------------------- 
     869    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     870    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     871    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     872    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     873    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     874    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     875    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     876    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     877    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     878    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     879    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     880    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     881    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     882    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     883    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     884/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    • Property svn:keywords set to Id
    r1802 r2528  
    4141   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4242   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     43   caco3r     =  0.15     ! mean rain ratio 
    4444/ 
    4545!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    115115!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    116116   ln_dustfer  =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    117    ln_river    =  .false.   ! boolean for river input of nutrients 
     117   ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
    118118   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    119119   ln_sedinput =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_top

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
    r1751 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtoptrc) 
    3 !! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtoptrd) 
    4 !!              6 - tracer advection                      (namtopadv) 
    5 !!              7 - tracer bottom boundary                (namtopbbl) 
    6 !!              8 - tracer lateral diffusion              (namtopldf) 
    7 !!              3 - tracer vertical physics               (namtopzdf) 
    8 !!              9 - tracer newtonian damping              (namtopdmp) 
     2!! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtrc    ) 
     3!! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtrc_trd) 
     4!!              3 - tracer advection                      (namtrc_adv) 
     5!!              4 - tracer lateral diffusion              (namtrc_ldf) 
     6!!              5 - tracer vertical physics               (namtrc_zdf) 
     7!!              6 - tracer newtonian damping              (namtrc_dmp) 
    98!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    109!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    11 &namtoptrc     !   tracers definition 
     10&namtrc     !   tracers definition 
    1211!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    13    ndttrc      =  1        !  time step frequency for passive tracers       
    14    nwritetrc   =  1460     !  time step frequency for tracer outputs 
    15    ln_rsttr    = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    16    nrsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
     12   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers       
     13   nn_writetrc   =  1460     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     14   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
     15   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    1716                           !                  = 1 do not use the value in the restart file 
    1817                           !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    19    cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (input) 
    20    cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
     18   cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
     19   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
    2120! 
    2221!              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
    2322!              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
    2423!              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    31    tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    32    tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    33    tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    34    tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    35    tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    36    tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    37    tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    38    tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    39    tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    40    tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    41    tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    42    tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    43    tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    44    tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    45    tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    46    tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    47    tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    48    tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     24   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     25   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
     26   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     27   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     28   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     29   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     30   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     31   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     32   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     33   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     34   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     35   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     36   sn_tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     37   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     38   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     39   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     40   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     41   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     42   sn_tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     43   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     44   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     46   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
     47   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4948/ 
    5049!----------------------------------------------------------------------- 
    51 &namtopadv    !   advection scheme for passive tracer  
     50&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    5251!----------------------------------------------------------------------- 
    5352   ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    54    ln_trcadv_tvd    =  .false.  !  TVD scheme    
     53   ln_trcadv_tvd    =  .false.  !  TVD scheme 
    5554   ln_trcadv_muscl  =  .true.   !  MUSCL scheme 
    5655   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    57    ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    58    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smol-Car. scheme  
    59    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smol-Car. scheme  
    60    crosster         =  .false.  !  computes Smol-Car crossterms (T) or not (F) 
     56   ln_trcadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
     57   ln_trcadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    6158/ 
    6259!----------------------------------------------------------------------- 
    63 &namtopbbl    !   bottom boundary layer scheme for passive tracer  
    64 !----------------------------------------------------------------------- 
    65    atrcbbl          = 1000.     !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    66 / 
    67 !----------------------------------------------------------------------- 
    68 &namtopldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
     60&namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
    6961!----------------------------------------------------------------------- 
    7062   ln_trcldf_diff   =  .true.   !  performs lateral diffusion (T) or not (F) 
     
    7769   ln_trcldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    7870!                               !  Coefficient 
    79    ahtrc0      =  2000.         !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    80    ahtrb0      =     0.         !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    81    aeivtr0     =  2000.         !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_trcldf_eiv") 
    82    trcrat      =  1.            !  ratio betweeen passive and active tracer diffusion coeff 
     71   rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    8372/ 
    8473!----------------------------------------------------------------------- 
    85 &namtopzdf        !   vertical physics 
     74&namtrc_zdf        !   vertical physics 
    8675!----------------------------------------------------------------------- 
    8776   ln_trczdf_exp   =  .false.  !  split explicit (T) or implicit (F) time stepping 
    88    n_trczdf_exp    =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
     77   nn_trczdf_exp   =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
    8978/ 
    9079!----------------------------------------------------------------------- 
    91 &namtoprad        !  treatment of negative concentrations  
     80&namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations  
    9281!----------------------------------------------------------------------- 
    9382   ln_trcrad   =  .true.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    9483/ 
    9584!----------------------------------------------------------------------- 
    96 &namtopdmp        !   passive tracer newtonian damping                 ('key_trcdmp') 
     85&namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    ('key_tradmp && key_trcdmp') 
    9786!----------------------------------------------------------------------- 
    98    ndmptr      =   20      !  type of damping in passive tracers 
    99                            !     ='latitude', damping poleward of 'ndmp' degrees and function  
    100                            !                  of the distance-to-coast. Red and Med Seas as ndmptr=-1 
    101                            !     =-1 damping only in Med and Red Seas 
    102    ndmpftr     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    103    nmldmptr    =    1      !  type of damping: =0 damping throughout the water column 
    104                            !                   =1 no damping in the mixed layer defined by avt >5cm2/s ) 
    105                            !                   =2 no damping in the mixed layer defined rho<rho(surf)+.01 ) 
    106    sdmptr      =   50.     !  surface time scale for internal damping (days) 
    107    bdmptr      =  360.     !  bottom  time scale for internal damping (days) 
    108    hdmptr      =  800.     !  depth of transition between sdmptr and bdmptr (meters) 
     87   nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     88                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
     89                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     90   nn_zdmp_tr  =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     91                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     92                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     93   rn_surf_tr  =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
     94   rn_bot_tr   =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
     95   rn_dep_tr   =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
     96   nn_file_tr  =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    10997/ 
    11098!----------------------------------------------------------------------- 
    111 &namtoptrd       !   diagnostics on tracer trends 
     99&namtrc_trd       !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
    112100!                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    113101!---------------------------------------------------------------------- 
    114    ntrd_trc   =  1460      !  time step frequency and tracers trends 
    115    nctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    116    ucf_trc    =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     102   nn_trd_trc  =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
     103   nn_ctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     104   rn_ucf_trc  =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    117105   ln_trdmld_trc_restart = .false.  !  restart for ML diagnostics 
    118106   ln_trdmld_trc_instant = .true.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    119    luttrd(1)  =   .true. 
    120    luttrd(2)  =   .true. 
    121    luttrd(3)  =   .false. 
    122    luttrd(4)  =   .false. 
    123    luttrd(5)  =   .false. 
    124    luttrd(6)  =   .false. 
    125    luttrd(7)  =   .false. 
    126    luttrd(8)  =   .false. 
    127    luttrd(9)  =   .false. 
    128    luttrd(10) =   .false. 
    129    luttrd(11) =   .false. 
    130    luttrd(12) =   .false. 
    131    luttrd(13) =   .false. 
    132    luttrd(14) =   .false. 
    133    luttrd(15) =   .false. 
    134    luttrd(16) =   .false. 
    135    luttrd(17) =   .false. 
    136    luttrd(18) =   .false. 
    137    luttrd(19) =   .false. 
    138    luttrd(20) =   .false. 
    139    luttrd(21) =   .false. 
    140    luttrd(22) =   .false. 
    141    luttrd(23) =   .true. 
    142    luttrd(24) =   .false. 
     107   ln_trdtrc(1)  =   .true. 
     108   ln_trdtrc(2)  =   .true. 
     109   ln_trdtrc(3)  =   .false. 
     110   ln_trdtrc(4)  =   .false. 
     111   ln_trdtrc(5)  =   .false. 
     112   ln_trdtrc(6)  =   .false. 
     113   ln_trdtrc(7)  =   .false. 
     114   ln_trdtrc(8)  =   .false. 
     115   ln_trdtrc(9)  =   .false. 
     116   ln_trdtrc(10) =   .false. 
     117   ln_trdtrc(11) =   .false. 
     118   ln_trdtrc(12) =   .false. 
     119   ln_trdtrc(13) =   .false. 
     120   ln_trdtrc(14) =   .false. 
     121   ln_trdtrc(15) =   .false. 
     122   ln_trdtrc(16) =   .false. 
     123   ln_trdtrc(17) =   .false. 
     124   ln_trdtrc(18) =   .false. 
     125   ln_trdtrc(19) =   .false. 
     126   ln_trdtrc(20) =   .false. 
     127   ln_trdtrc(21) =   .false. 
     128   ln_trdtrc(22) =   .false. 
     129   ln_trdtrc(23) =   .true. 
     130   ln_trdtrc(24) =   .false. 
    143131/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1552 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
     35   
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/IGCM00/COMP/pisces.card

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/IGCM00/COMP/pisces.driver

    • Property svn:executable deleted
    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/IGCM00/README

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/IGCM00/config.card

    • Property svn:keywords set to Id
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/POMME/EXP00/AA_job

    • Property svn:keywords set to Id
    r2521 r2528  
    109109#- Namelist for ocean 
    110110cp ${R_EXPER}/namelist namelist 
    111 cp ${R_EXPER}/iodef.xml . 
    112 cp ${R_EXPER}/xmlio_server.def . 
    113111 
    114112#- Files for the configuration and ocean dynamics 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/POMME/EXP00/iodef.xml

    r1772 r2528  
    5454      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    5555 
    56    <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
     56   <field id="emp-rnf"      description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     57   <field id="emps-rnf"     description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    5858   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5959   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
     
    138138   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    139139   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
     140   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    140141   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    141142   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    155156   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    156157   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
     158   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    157159   <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    158160   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
     
    170172   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    171173   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    172    <field id="woce_bbl"     description="BBL ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    173174   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    174175   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
     
    220221   <field ref="sss"          name="sosaline"  /> 
    221222   <field ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
    222    <field ref="emp"          name="sowaflup"  /> 
     223   <field ref="emp-rnf"      name="sowaflup"  /> 
    223224   <field ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    224    <field ref="emps"         name="sowaflcd"  /> 
     225   <field ref="emps-rnf"     name="sowaflcd"  /> 
    225226   <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  /> 
    226227   <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/POMME/EXP00/namelist

    • Property svn:keywords set to Id
    r2467 r2528  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    14 !  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
    1516 
    1617!!====================================================================== 
    1718!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1819!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     20!!   namrun        parameters of the run 
     21!!====================================================================== 
     22! 
    2223!----------------------------------------------------------------------- 
    2324&namrun        !   parameters of the run 
     
    2627   cn_exp      = "POMM025" !  experience name  
    2728   nn_it000    =       1   !  first time step 
    28    nn_itend    =   21900   !  last  time step (std 5475) 
    29    nn_date0    =  19880101 !  initial calendar date yymmdd (used if nrstdt=1) 
     29   nn_itend    =   21900   !  last  time step 
     30   nn_date0    =  19880101 !  initial calendar date yymmdd (used if nn_rstctl=1) 
    3031   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    31    nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    32    nn_stock    =   21900   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    33    nn_write    =     300   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000) 
    34    ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    35    ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    36    ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
    37    nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (working only with iom_nf90 routines) 
    3832   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    39    nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nit000 is not compared to the restart file value 
    40                                !                  = 1 use ndate0 in namelist (not the value in the restart file) 
     33   nn_rstctl   =       0       !  restart control = 0 nn_it000 is not compared to the restart file value 
     34                               !                  = 1 use nn_date0 in namelist (not the value in the restart file) 
    4135                               !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    4236   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    4337   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    44 / 
     38   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
     39   nn_stock    =   21900   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     40   nn_write    =     300   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
     41   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
     42   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     43   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
     44   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
     45/ 
     46 
    4547!!====================================================================== 
    4648!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    4951!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    5052!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    51 !!====================================================================== 
    52  
     53!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     54!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     55!!====================================================================== 
     56! 
    5357!----------------------------------------------------------------------- 
    5458&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    6367   rn_sbot_min =  300.     !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m) 
    6468   rn_sbot_max = 5250.     !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m) 
    65    rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    66    rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    67    rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1) 
     69   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=rn_theta<=20) 
     70   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=rn_thetb<= 1) 
     71   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<rn_max<1) 
    6872   ln_s_sigma  = .false.   !  hybrid s-sigma coordinates 
    6973   rn_bb       =    0.8    !  stretching with s-sigma 
     
    7377&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    7478!----------------------------------------------------------------------- 
    75    nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read(=1) the bathymetry file 
    76    nn_closea   =    0      !  closed seas and lakes are removed (=0) or kept (=1) from the ORCA domain 
    77    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file (coordinates, scale factors, masks) or not (=0) 
    78    rn_e3zps_min=   25.     !  the thickness of the partial step is set larger than the minimum 
    79    rn_e3zps_rat=    0.2    !  of e3zps_min and e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<e3zps_rat<1) 
     79   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
     80   nn_closea    =   0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     81   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     82   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     83   rn_e3zps_min=   25.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     84   rn_e3zps_rat=    0.2    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat * e3t   (N.B. 0<rn_e3zps_rat<1) 
    8085                           ! 
    8186   rn_rdt      = 1440.     !  time step for the dynamics (and tracer if nacc=0)   ==> 5760 
    82    nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step (for the split explicit algorithm) ("key_dynspg_ts") 
     87   nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step           ("key_dynspg_ts") 
    8388   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    8489   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    8590                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    86    rn_rdtmin   = 1440.          !  minimum time step on tracers (used if nacc=1) 
    87    rn_rdtmax   = 1440.          !  maximum time step on tracers (used if nacc=1) 
    88    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    89 / 
     91   rn_rdtmin   = 1440.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     92   rn_rdtmax   = 1440.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     93   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    90114!!====================================================================== 
    91115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    92116!!====================================================================== 
    93 !!   namsbc        surface boundary condition 
    94 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    95 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    96 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    97 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    98 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    99 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    100 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    101 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    102 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    103 !!====================================================================== 
    104  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    105131!----------------------------------------------------------------------- 
    106132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    107133!----------------------------------------------------------------------- 
    108134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    109                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    110    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    111    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    112    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    113    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    114    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    115142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    116143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    117                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
    118    nn_ico_cpl  = 0         !  ice-ocean coupling : =0 each nn_fsbc  
    119                            !                       =1 stresses recomputed each ocean time step ("key_lim3" only) 
    120                            !                       =2 combination of 0 and 1 cases             ("key_lim3" only) 
    121    ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    122    ln_rnf      = .false.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    123    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
     146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    124148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    125                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    126                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    127                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    128152/ 
    129153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    133157   rn_utau0    =   0.5     !  uniform value for the i-stress 
    134158   rn_vtau0    =   0.e0    !  uniform value for the j-stress 
    135    rn_q     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux 
     159   rn_qns0     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux 
    136160   rn_qsr0     =   0.e0    !  uniform value for the solar radiation 
    137161   rn_emp0     =   0.e0    !  uniform value for the freswater budget (E-P) 
     
    140164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    141165!----------------------------------------------------------------------- 
    142 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    143 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    144    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    145    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    146    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    147    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    148    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    149 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    150174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    151175/       
     
    153177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    154178!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    163    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    164 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    165189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    166190/ 
     
    168192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    169193!----------------------------------------------------------------------- 
    170 !              !   file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    171 !              !                  !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    172    sn_wndi     = 'u10_1988'       ,       24          , 'u10'      ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    173    sn_wndj     = 'v10_1988'       ,       24          , 'v10'      ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    174    sn_qsr      = 'radsw_1988'     ,       24          , 'radsw'    ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    175    sn_qlw      = 'radlw_1988'     ,       24          , 'radlw'    ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    176    sn_tair     = 't2_1988.nc'     ,       24          , 't2'       ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    177    sn_humi     = 'q2_1988'        ,       24          , 'q2'       ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    178    sn_prec     = 'precip_1988.nc' ,       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    179    sn_snow     = 'precip_1988.nc' ,       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    180    sn_tdif     = 'taudif_core'    ,       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  ,   'yearly'  ,'' 
    181 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    182206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    183207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    184    ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
     208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    185209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    186210/ 
    187211!----------------------------------------------------------------------- 
    188 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    189 !----------------------------------------------------------------------- 
    190                                        ! send 
    191 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    192 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    193 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    194 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    195 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    196 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    197 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    198                                        ! receive 
    199 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    200 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    201 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    202 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    203 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    204 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    205 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    206 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    207 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    209 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    210 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    211 / 
    212 !----------------------------------------------------------------------- 
    213 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
    214 !----------------------------------------------------------------------- 
    215 cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
    216 cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239   cn_snd_co2     = 'coupled'         ! send    : 'none' 'coupled' 
     240   cn_rcv_co2     = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    217241/ 
    218242!----------------------------------------------------------------------- 
    219243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    220244!----------------------------------------------------------------------- 
    221 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    222 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    223    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    224248  
    225249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    226    ln_traqsr   = .false.    !  Light penetration (T) or not (F) 
    227    ln_qsr_rgb  = .false.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
     250   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
     251   ln_qsr_rgb  = .false.   !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
    228252   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    229253   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
     
    232256   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    233257   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
    234    rn_si2      =   62.0    !  3 bands: longest depth of extinction (for blue waveband & 0.01 mg/m2 Chl) 
    235258/ 
    236259!----------------------------------------------------------------------- 
    237260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    238261!----------------------------------------------------------------------- 
    239 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    240 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    241    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    242    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    243   
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',    -1    , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',     0    , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,     0    , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    244270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    245    ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    246    ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
    247    rn_hrnf      =  0.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     271   ln_rnf_emp   = .false.  !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     272   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
     273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    248274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    249275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth =  .false.  !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   =  .false.  !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   =  .false.  !  read in salinity information for runoff 
     279/ 
     280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    250289/ 
    251290!----------------------------------------------------------------------- 
    252291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    253292!----------------------------------------------------------------------- 
    254 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    255 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    256    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    257    sn_sss      = 'sss_1m'     ,        -1         ,  'vosaline',     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    258      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         , 'vosaline',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    259298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    260299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
    261    nn_sssr     =     1     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)  
     300   nn_sssr     =     2     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)  
    262301                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0) 
    263302   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K] 
    264    rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day/psu] 
     303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    265304   ln_sssr_bnd =   .true.  !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    266305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     
    286325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    287326!!====================================================================== 
    288  
     327! 
    289328!----------------------------------------------------------------------- 
    290329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    301340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    302341!----------------------------------------------------------------------- 
    303     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    304     ln_vol_cst = .false.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    305     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    306     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst  = .false.   !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    307346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    308     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    309348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    310     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    311     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    312     rn_dpnin   =   30.     !     -           -         -       north   -      - 
    313     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    314     rn_dpeob   = 1500.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    315     rn_dpwob   =  150.     !     -           -         -     west    -      - 
    316     rn_dpnob   =  150.     !     -           -         -     north   -      - 
    317     rn_dpsob   =  150.     !     -           -         -     south   -      - 
    318     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =   30.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 1500.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =  150.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    =  150.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =  150.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    319358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    320359/ 
     
    322361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    323362!----------------------------------------------------------------------- 
    324     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    325     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    326     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    327     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    328367/ 
    329368!----------------------------------------------------------------------- 
    330369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    331370!----------------------------------------------------------------------- 
    332     filbdy_mask    =  ''                  !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    333     filbdy_data_T  = 'bdydata_grid_T.nc'  !  name of data file (T-points) 
    334     filbdy_data_U  = 'bdydata_grid_U.nc'  !  name of data file (U-points) 
    335     filbdy_data_V  = 'bdydata_grid_V.nc'  !  name of data file (V-points) 
    336     ln_bdy_clim    = .false.              !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    337     ln_bdy_vol     = .true.               !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    338     ln_bdy_mask    = .false.              !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    339     ln_bdy_tides   = .true.               !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    340     ln_bdy_dyn_fla = .true.               !  Apply Flather condition to velocities 
    341     ln_bdy_tra_frs = .false.              !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    342     ln_bdy_dyn_frs = .false.              !  Apply FRS condition to velocities 
    343     nbdy_dta       =  1                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    344                                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    345     nb_rimwidth    = 9                    !  width of the relaxation zone 
    346     volbdy         = 0                    !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    347                                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    348 / 
    349 !----------------------------------------------------------------------- 
    350 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    351 !----------------------------------------------------------------------- 
    352     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    353     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    354     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    355     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask     =  ''                     !  name of mask file (ln_mask=T) 
     372   cn_dta_frs_T= 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U= 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V= 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T= 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U= 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V= 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    356399/ 
    357400 
     
    360403!!====================================================================== 
    361404!!   nambfr        bottom friction 
    362 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                ("key_trabbc") 
    363 !!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl_dif","key_trabbl_adv") 
    364 !!====================================================================== 
    365  
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
     406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
     407!!====================================================================== 
     408! 
    366409!----------------------------------------------------------------------- 
    367410&nambfr        !   bottom friction 
    368411!----------------------------------------------------------------------- 
    369    nn_bfr      =    2      !  type of bottom friction :   = 0 : no   slip,  = 2 : nonlinear friction 
    370                            !                              = 3 : free slip,  = 1 :    linear friction 
     412   nn_bfr      =    2      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction 
     413                           !                              = 2 : nonlinear friction 
    371414   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case) 
    372415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
    373    rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
     416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     417   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
    374419/ 
    375420!----------------------------------------------------------------------- 
    376421&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    377422!----------------------------------------------------------------------- 
     423   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    378424   nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux  
    379425                           !     = 1 constant flux 
     
    384430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    385431!----------------------------------------------------------------------- 
    386 !                          !  diffusive bbl                             ("key_trabbl") 
    387 !                          !  advective bbl                             ("key_trabbl_adv") 
    388    rn_ahtbbl   =  10000.   !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    389 / 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
    390438!!====================================================================== 
    391439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    396444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    397445!!====================================================================== 
    398  
     446! 
    399447!----------------------------------------------------------------------- 
    400448&nameos        !   ocean physical parameters 
    401449!----------------------------------------------------------------------- 
    402    nn_eos      =    0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     450   nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    403451                           !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    404452                           !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    405453                           !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    406    rn_alpha    =    2.e-4  !  thermal expension coefficient (neos= 1 or 2) 
    407    rn_beta     =    0.001  !  saline  expension coefficient (neos= 2) 
     454   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     455   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    408456/ 
    409457!----------------------------------------------------------------------- 
     
    415463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    416464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    417466/ 
    418467!----------------------------------------------------------------------- 
    419468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    420469!----------------------------------------------------------------------- 
    421                            !  Type of the operator :  
    422    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    423    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    424                            !  Direction of action  : 
    425    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    426    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    427    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    428                            !  Coefficient 
    429    rn_aht_0         =   300.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    430    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    431    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =   300.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    432483/ 
    433484!----------------------------------------------------------------------- 
    434485&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      ('key_tradmp') 
    435486!----------------------------------------------------------------------- 
    436    nn_hdmp     =   1       !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     487   nn_hdmp     =    1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    437488                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    438489                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     
    445496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    446497/ 
     498 
    447499!!====================================================================== 
    448500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    454506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    455507!!====================================================================== 
    456  
     508! 
    457509!----------------------------------------------------------------------- 
    458510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    494546&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    495547!----------------------------------------------------------------------- 
    496                            !  Type of the operator :  
     548   !                       !  Type of the operator :  
    497549   ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    498550   ln_dynldf_bilap  =  .true.  !  bilaplacian operator     
    499                            !  Direction of action  :  
     551   !                       !  Direction of action  :  
    500552   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    501553   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    502554   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    503                            !  Coefficient 
    504    rn_ahm_0    = -1.5e11        !  horizontal eddy viscosity   [m2/s] 
    505    rn_ahmb_0   =    500.        !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    506 / 
     555   !                       !  Coefficient 
     556   rn_ahm_0_lap     =     0.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     557   rn_ahmb_0        =    500.   !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     558   rn_ahm_0_blp     = -1.5e11   !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     559/ 
     560 
    507561!!====================================================================== 
    508562!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    509563!!====================================================================== 
    510 !!       namzdf        vertical physics 
    511 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    512 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    513 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    514 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    515 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    516 !!====================================================================== 
    517  
     564!!    namzdf        vertical physics 
     565!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     566!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     567!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     568!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     569!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     570!!====================================================================== 
     571! 
    518572!----------------------------------------------------------------------- 
    519573&namzdf        !   vertical physics 
     
    544598   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
    545599   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
    546    rn_ebb      =   3.75    !  coef. of the surface input of tke 
     600   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
    547601   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
    548602   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
    549    rn_bshear   =   1.e-20  !  background shear (>0) 
    550    nn_mxl      =   3       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
     603   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
    551604                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
    552605                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
    553                            !                 = 3 same criteria as case 2 but applied in a different way 
     606                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
    554607   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
    555    ln_mxl0     = .false.   !  mixing length scale surface value as function of wind stress (T) or not (F) 
    556    rn_lmin     =   0.4     !  interior buoyancy lenght scale minimum value 
    557    rn_lmin0    =   0.4     !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
    558    nn_etau     =   0       !  exponentially deceasing penetration of tke due to internal & intertial waves 
    559                            !        = 0 no penetration ( O(2 km) resolution) 
    560                            !        = 1 additional tke source (rn_efr * en) 
    561                            !        = 2 additional tke source (rn_efr * en) applied only at the base of the mixed layer 
    562                            !        = 3 additional tke source (HF contribution: mean of stress module - module of mean stress) 
    563    nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration 
     608   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     609   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     610   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     611   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     612   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     613                           !        = 0 no penetration 
     614                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     615                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     616                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     617   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     618   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    564619                           !        = 0  constant 10 m length scale 
    565                            !        = 1  0.5m at the equator to 30m at high latitudes 
    566                            !        = 2  30 meters constant depth penetration 
    567                            !  otion used only if nn_etau = 1 or 2:  
    568    rn_efr      =   0.05    !     fraction of surface tke value which penetrates inside the ocean 
    569                            !  otion used only if nn_etau = 3: 
    570    rn_addhft   =  -1.e-3   !     add offset   applied to the "mean of stress module - module of mean stress" (always kept > 0) 
    571    rn_sclhft   =   1.      !     scale factor applied to the "mean of stress module - module of mean stress" 
    572    ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation 
    573    rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     620                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    574621/ 
    575622!------------------------------------------------------------------------ 
    576 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionnally: 
     623&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    577624!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    578625   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing  
     
    587634/ 
    588635!----------------------------------------------------------------------- 
     636&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     637!----------------------------------------------------------------------- 
     638   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     639   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
     640   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     641   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     642   ln_crban      = .TRUE.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     643   ln_sigpsi     = .TRUE.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     644   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     645   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     646   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     647   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     648   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     649   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     650   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     651   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     652/ 
     653!----------------------------------------------------------------------- 
    589654&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
    590655!----------------------------------------------------------------------- 
     
    599664   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency 
    600665   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency  
    601    ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
     666   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    602667   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    603668/ 
     669 
    604670!!====================================================================== 
    605671!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    610676!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    611677!!====================================================================== 
    612  
     678! 
    613679!----------------------------------------------------------------------- 
    614680&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    627693&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    628694!----------------------------------------------------------------------- 
    629    cn_mpi_send =  'S'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
     695   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    630696                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    631697   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     
    651717   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    652718                           !     (no physical validity of the results) 
    653    nn_bit_cmp  =    0      !  bit comparison mode (1/0): CAUTION use zero except for test 
    654                            !     of comparison between single and multiple processor runs 
    655 / 
    656  
    657 !!====================================================================== 
    658 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    659 !!====================================================================== 
     719/ 
     720 
     721!!====================================================================== 
     722!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     723!!====================================================================== 
     724!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    660725!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    661 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    662726!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    663727!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    664 !!====================================================================== 
    665  
     728!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     729!!====================================================================== 
     730! 
     731!----------------------------------------------------------------------- 
     732&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     733!----------------------------------------------------------------------- 
     734   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     735   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     736   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     737                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     738                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     739   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     740                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     741/ 
    666742!----------------------------------------------------------------------- 
    667743&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    668 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     744!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    669745!----------------------------------------------------------------------- 
    670746   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    677753/ 
    678754!----------------------------------------------------------------------- 
    679 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    680 !----------------------------------------------------------------------- 
    681    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    682    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    683 / 
    684 !----------------------------------------------------------------------- 
    685755&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    686756!----------------------------------------------------------------------- 
    687     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    688     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    689     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    690     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    691     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     757   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     758   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     759   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     760   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     761   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    692762                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    693763/ 
     
    699769   ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    700770                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    701    nf_ptr     =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    702    nf_ptr_wri =  15        !  Frequency of ptr outputs 
    703 / 
     771   ln_ptrcomp = .false.    !  Add decomposition : overturning 
     772   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
     773   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     774/ 
     775!----------------------------------------------------------------------- 
     776&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     777!----------------------------------------------------------------------- 
     778   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     779/ 
     780 
     781!!====================================================================== 
     782!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     783!!====================================================================== 
     784!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     785!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     786!!====================================================================== 
     787! 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
     789&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     790!----------------------------------------------------------------------- 
     791   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     792   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     793   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     794   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     795   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     796   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     797 
     798   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     799 
     800   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     801                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     802 
     803   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     804                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     805                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     806 
     807   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     808                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     809                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     810                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     811                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     812                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     813                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     814                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     815                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     816                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     817                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     818                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     819                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     820                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     821   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
     822   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     823                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     824                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     825                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     826   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
     827   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     828                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     829   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
     830   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
     831                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     832                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     833                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     834                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     835                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     836                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     837                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     838                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     839                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     840                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     841                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     842   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     843                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     844                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     845   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     846   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     847                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
     848   ln_grid_global = .true. 
     849   ln_grid_search_lookup = .false. 
     850/  
     851!----------------------------------------------------------------------- 
     852&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     853!----------------------------------------------------------------------- 
     854    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     855    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     856    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     857    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     858    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     859    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     860    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     861    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     862    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     866    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     867    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     868    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     869/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/POMME/EXP00/xmlio_server.def

    • Property svn:keywords set to Id
    r1647 r2528  
    1717  global_mpi_buffer_size = 512 
    1818 
     19 
     20!!====================================================================== 
     21!!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
     22!!====================================================================== 
     23!----------------------------------------------------------------------- 
     24&namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings 
     25                !  (benign if "key_netcdf4" is not used) 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
     28   nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
     29   nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
     30                              !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     31                              !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     32   ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     33                              !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files   
     34/ 
    1935   
    20    
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.