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Changeset 2823 for branches/2011/dev_r2787_PISCES_improvment/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces – NEMO

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2011-08-09T13:11:24+02:00 (13 years ago)
Author:
cetlod
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Add new parameterisation in PISCES, see ticket #854

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  • branches/2011/dev_r2787_PISCES_improvment/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    r2567 r2823  
    1515&nampisext     !   air-sea exchange 
    1616!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    17    atcco2     = 287.    ! atmospheric pCO2 
     17   ln_co2int  =  .false. ! read atm pco2 from a file (T) or constant (F) 
     18   atcco2     =  287.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F 
     19   clname     =  'atcco2.txt'  ! Name of atm pCO2 file - ln_co2int = T 
     20   nn_offset  =  0       ! Offset model-data start year - ln_co2int = T 
     21!                        ! If your model year is iyy, nn_offset=(years(1)-iyy)  
     22!                        ! then the first atmospheric CO2 record read is at years(1) 
     23/ 
     24!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     25&nampisatm     !  Atmospheric prrssure  
     26!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     27!              !  file name   ! frequency (hours) ! variable   ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     28!              !              !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     29   sn_patm     = 'presatm'    ,     -1            , 'patm'     ,  .true.      , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     30   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    1831/ 
    1932!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    2033&nampisbio     !   biological parameters 
    2134!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    22    part       =  0.85    ! part of calcite not dissolved in guts 
    2335   nrdttrc    =  4       ! time step frequency for biology 
    2436   wsbio      =  2.      ! POC sinking speed 
    2537   xkmort     =  1.E-7   ! half saturation constant for mortality 
    26    ferat3     =  3.E-6   ! Fe/C in zooplankton  
     38   ferat3     =  10.E-6  ! Fe/C in zooplankton  
    2739   wsbio2     =  30.     ! Big particles sinking speed 
    2840/ 
     
    3143!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    3244   conc0      =  2.e-6    ! Phosphate half saturation 
    33    conc1      =  10E-6    ! Phosphate half saturation for diatoms 
    34    conc2      =  0.01E-9  ! Iron half saturation for phyto 
    35    conc2m     =  0.08E-9  ! Max iron half saturation for phyto 
    36    conc3      =  0.1E-9   ! Iron half saturation for diatoms 
    37    conc3m     =  0.4E-9   ! Maxi iron half saturation for diatoms 
     45   conc1      =  8E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
     46   conc2      =  1E-9     ! Iron half saturation for phyto 
     47   conc2m     =  3E-9     ! Max iron half saturation for phyto 
     48   conc3      =  2E-9     ! Iron half saturation for diatoms 
     49   conc3m     =  8E-9     ! Maxi iron half saturation for diatoms 
    3850   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    39    concdnh4   =  5.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
     51   concdnh4   =  4.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    4052   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    4153   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4254   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.15     ! mean rain ratio 
     55   concfebac  =  3.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
     56   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
     57   qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
     58   caco3r     =  0.16     ! mean rain ratio 
    4459/ 
    4560!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    4661&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
    4762!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    48    pislope    =  3.       ! P-I slope   
    49    pislope2   =  3.       ! P-I slope  for diatoms 
     63   pislope    =  2.       ! P-I slope 
     64   pislope2   =  2.       ! P-I slope  for diatoms 
    5065   excret     =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
    5166   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
     67   bresp      =  0.00333  ! Basal respiration rate 
    5268   chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton 
    53    chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms 
    54    fecnm      =  10E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
    55    fecdm      =  15E-6    ! Minimum Fe/C in diatoms 
     69   chlcdm     =  0.04     ! Minimum Chl/C in diatoms 
     70   chlcmin    =  0.0033   ! Maximum Chl/c in phytoplankton 
     71   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
     72   fecdm      =  40E-6    ! Minimum Fe/C in diatoms 
    5673   grosip     =  0.151    ! mean Si/C ratio 
    5774/ 
     
    6885&nampismes     !   parameters for mesozooplankton 
    6986!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    70    grazrat2   =  0.7      ! maximal mesozoo grazing rate 
     87   part2      =  0.75    ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts 
     88   grazrat2   =  0.9      ! maximal mesozoo grazing rate 
    7189   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    72    mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate 
     90   mzrat2     =  0.04     ! mesozooplankton mortality rate 
    7391   xprefc     =  1.       ! zoo preference for phyto 
    74    xprefp     =  0.2      ! zoo preference for POC 
     92   xprefp     =  0.3      ! zoo preference for POC 
    7593   xprefz     =  1.       ! zoo preference for zoo 
    76    xprefpoc   =  0.2      ! zoo preference for poc 
     94   xprefpoc   =  0.3      ! zoo preference for poc 
     95   xthresh2   =  2E-7     ! Food threshold for grazing 
    7796   xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
    78    epsher2    =  0.33     ! Efficicency of Mesozoo growth  
     97   epsher2    =  0.3      ! Efficicency of Mesozoo growth 
    7998   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
    8099   unass2     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
    81    grazflux   =  5.e3     ! flux-feeding rate 
     100   grazflux   =  3.e3     ! flux-feeding rate 
    82101/ 
    83102!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    84103&nampiszoo     !   parameters for microzooplankton 
    85104!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    86    grazrat    =  4.0      ! maximal zoo grazing rate    
     105   part       =  0.5     ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa 
     106   grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate 
    87107   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    88108   mzrat      =  0.0      ! zooplankton mortality rate 
    89    xpref2c    =  0.1      ! Microzoo preference for POM  
    90    xpref2p    =  0.45     ! Microzoo preference for Nanophyto 
    91    xpref2d    =  0.45     ! Microzoo preference for Diatoms 
    92    xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing  
    93    epsher     =  0.33     ! Efficiency of microzoo growth 
     109   xpref2c    =  0.2      ! Microzoo preference for POM 
     110   xpref2p    =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto 
     111   xpref2d    =  0.6      ! Microzoo preference for Diatoms 
     112   xthresh    =  2E-7     ! Food threshold for feeding 
     113   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
     114   epsher     =  0.3      ! Efficiency of microzoo growth 
    94115   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM 
    95116   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo 
     
    98119&nampisrem     !   parameters for remineralization 
    99120!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    100    xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC 
     121   xremik    =  0.25      ! remineralization rate of DOC 
    101122   xremip    =  0.025     ! remineralisation rate of POC 
    102123   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate 
    103    xsirem    =  0.015     ! remineralization rate of Si 
     124   xsirem    =  0.003     ! remineralization rate of Si 
     125   xsiremlab =  0.025     ! fast remineralization rate of Si 
     126   xsilab    =  0.31      ! Fraction of labile biogenic silica 
    104127   xlam1     =  0.005     ! scavenging rate of Iron 
    105    oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia  
     128   oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia 
     129   ligand    =  0.6E-9    ! Ligands concentration 
    106130/ 
    107131!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    108132&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry 
    109133!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    110    kdca       =  0.327e3  ! calcite dissolution rate constant (1/time) 
     134   kdca       =  6.       ! calcite dissolution rate constant (1/time) 
    111135   nca        =  1.       ! order of dissolution reaction (dimensionless) 
    112136/ 
     
    114138&nampissed     !   parameters for inputs deposition 
    115139!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    116    ln_dustfer  =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    117    ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
     140!              !  file name        ! frequency (hours) ! variable   ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     141!              !                   !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     142   sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1            , 'dust'     ,  .true.      , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     143   sn_riverdic = 'river.orca'      ,    -12            , 'riverdic' ,  .false.     , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     144   sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    -12            , 'riverdoc' ,  .false.     , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     145   sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12            , 'ndep'     ,  .false.     , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     146   sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12            , 'bathy'    ,  .false.     , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     147! 
     148   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
     149   ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
     150   ln_river    =  .false.   ! boolean for river input of nutrients 
    118151   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    119    ln_sedinput =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
     152   ln_ironsed =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
    120153   sedfeinput  =  1E-9     ! Coastal release of Iron 
    121    dustsolub   =  0.014    ! Solubility of the dust 
     154   dustsolub   =  0.02     ! Solubility of the dust 
     155   wdust       =  2.0      ! Dust sinking speed 
     156   nitrfix     =  1E-7     ! Nitrogen fixation rate 
     157   diazolight  =  50.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2) 
     158   concfediaz  =  1.E-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron 
    122159/ 
    123160!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    140177/ 
    141178!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    142 &nampisdia     !   additional 2D/3D tracers diagnostics ("key_trc_diaadd") 
     179&nampisdia     !   additional 2D/3D tracers diagnostics  
    143180!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    144181   nn_writedia  =  1460   !  time step frequency for tracers diagnostics 
    145 ! 
    146182!              !    name   !           title of the field          !     units      ! 
    147183!              !           !                                       !                !   
     
    175211!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    176212   ln_pisdmp    =  .true.     !  Relaxation fo some tracers to a mean value 
    177    ln_pisclo    =  .false.    !  Restoring of tracer to initial value on closed sea ("key_dtatrc") 
    178 / 
     213/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.