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Changeset 3680 for branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml – NEMO

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2012-11-27T15:42:24+01:00 (11 years ago)
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rblod
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First commit of the final branch for 2012 (future nemo_3_5), see ticket #1028

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  • branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r3295 r3680  
    1919     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
    2020       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    21        <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    /> 
     21       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    2222       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    2323       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    … …  
    3838       <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
    3939       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    40        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" /> 
    41        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" /> 
     40       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3"   /> 
     41       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3"   /> 
    4242       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    4343       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    … …  
    4747 
    4848     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    49        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    50        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    51        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    52        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
    53        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    54        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    55        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    56        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    57        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    58        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    59        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    60        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    61        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    62        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    63        <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    64        <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    65        <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    66        <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    67        <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    68        <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    69        <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    70        <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    71        <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    72        <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    73        <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    74        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     /> 
    75        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     /> 
    76        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     /> 
    77        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
    78        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     /> 
    79        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     /> 
    80        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     /> 
    81        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
    82        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         /> 
    83        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         /> 
    84        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            /> 
    85        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     /> 
    86      </group> 
     49       <field id="PH"          description="PH"                                      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     50       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                            unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     51       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                          unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     52       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"  unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
     53       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"         unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     54       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"           unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     55       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     56       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"       unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     57       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"        unit="molSi/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     58       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"         unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     59       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"      unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     60       <field id="xfracal"     description="Calcifying fraction"                     unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     61       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                      unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     62       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     63       <field id="GRAZ1"       description="Grazing by microzooplankton"             unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     64       <field id="GRAZ2"       description="Grazing by mesozooplankton"              unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     65       <field id="REMIN"       description="Oxic remineralization of OM"             unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     66       <field id="DENIT"       description="Anoxic remineralization of OM"           unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     67       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation"                       unit="molN/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     68       <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                     unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     69       <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     70       <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     71       <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     72       <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     73       <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     74       <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     75       <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     76       <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     77       <field id="Fe2"         description="Iron II concentration"                   unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     78       <field id="Fe3"         description="Iron III concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     79       <field id="FeL1"        description="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     80       <field id="FeL2"        description="Complexed Iron concentration with L2"    unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     81       <field id="FeP"         description="Precipitated Iron III"                   unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     82       <field id="TL1"         description="Total L1 concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     83       <field id="TL2"         description="Total L2 concentration"                  unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     84       <field id="pdust"       description="dust concentration"                      unit="g/L"                          /> 
     85       <field id="Totlig"      description="Total ligand concentation"               unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     86       <field id="Biron"       description="Bioavailable iron"                       unit="nmol/L"     axis_ref="deptht" /> 
     87       <field id="Sdenit"      description="Nitrate reduction in the sediments"      unit="molN/m2/s"                    /> 
     88       <field id="Ironice"     description="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="molFe/m2/s"                   /> 
     89       <field id="HYDR"        description="Iron input from hydrothemal vents"       unit="molFe/m2/s"                   /> 
     90       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                     /> 
     91       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                     /> 
     92       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                     /> 
     93       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
     94       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                     /> 
     95       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                     /> 
     96       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
     97       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                               unit="uatm"                         /> 
     98       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                unit="uatm"                         /> 
     99       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                    unit="m"                            /> 
     100       <field id="Irondep"     description="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                     /> 
     101       <field id="Ironsed"     description="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"  axis_ref="deptht"  /> 
     102     </group>          
    87103 
    88104      <!-- scalar --> 
    … …  
    107123 
    108124      <group id="5d" output_freq="432000" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 5d files --> 
    109  
    110         <file id="5d_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" > 
    111           <field ref="Cflx"     /> 
    112           <field ref="Oflx"     /> 
    113           <field ref="Dpco2"    /> 
    114           <field ref="Dpo2"     /> 
    115           <field ref="Heup"     /> 
    116         </file> 
    117        
    118125      </group> 
    119126  
    120127      <group id="1m" output_freq="-1"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files --> 
    121128 
    122         <file id="1m_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" > 
    123           <field ref="DIC"      /> 
    124           <field ref="Alkalini" /> 
    125           <field ref="O2"       /> 
    126           <field ref="NCHL"     /> 
    127           <field ref="DCHL"     /> 
    128           <field ref="Fer"      /> 
    129           <field ref="NO3"      /> 
    130        </file> 
    131  
    132       </group> 
    133  
    134       <group id="2m" output_freq="-2"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2m files --> 
    135       </group> 
    136  
    137       <group id="3m" output_freq="-3"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 3m files --> 
    138       </group> 
    139  
    140       <group id="4m" output_freq="-4"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 4m files --> 
    141       </group> 
    142  
    143       <group id="6m" output_freq="-6"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 6m files --> 
    144       </group> 
    145  
    146       <group id="1y" output_freq="-12"    output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real yearly files --> 
    147          
    148         <file id="1y_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" > 
     129       <file id="1m_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" > 
    149130          <field ref="DIC"      /> 
    150131          <field ref="Alkalini" /> 
    … …  
    173154       </file> 
    174155 
    175        <file id="1y_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" > 
     156       <file id="1m_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" > 
    176157          <field ref="PH"       /> 
    177158          <field ref="CO3"      /> 
    178159          <field ref="CO3sat"   /> 
    179           <field ref="PAR"      /> 
     160          <field ref="PAR"   /> 
    180161          <field ref="PPPHY"    /> 
    181162          <field ref="PPPHY2"   /> 
    … …  
    185166          <field ref="PFeN"     /> 
    186167          <field ref="PFeD"     /> 
     168          <field ref="xfracal"  /> 
    187169          <field ref="PCAL"     /> 
    188170          <field ref="DCAL"     /> 
    189           <field ref="GRAZ"     /> 
    190           <field ref="Mumax"    /> 
    191           <field ref="MuN"      /> 
    192           <field ref="MuD"      /> 
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Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.