New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5098 – NEMO

Changeset 5098


Ignore:
Timestamp:
2015-02-20T20:11:47+01:00 (9 years ago)
Author:
mathiot
Message:

add wmask, wumask, wvmask and restore loop order and add flag to ignore specific isf code if no isf

Location:
branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO
Files:
33 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OFF_SRC/dtadyn.F90

    r4990 r5098  
    537537      CALL eos_rab( pts, rab_n )       ! now local thermal/haline expension ratio at T-points 
    538538      CALL bn2    ( pts, rab_n, rn2  ) ! now    Brunt-Vaisala 
    539       IF( ln_zps )   & ! Partial steps: before Horizontal DErivative 
    540         &    CALL zps_hde( kt, jpts, pts, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    541         &                                        rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   &             ! 
    542         &                                 gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     539        ! Partial steps: before Horizontal DErivative 
    543540        ! only gtsu, gtsv, rhd, gru , grv are used  
     541      IF( ln_zps )    CALL zps_hde    ( kt, jpts, pts, gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient 
     542        &                                         rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     543      IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     544         &            CALL zps_hde_isf( kt, jpts, pts, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     545         &                                        rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     546         &                                 gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the first ocean level 
     547 
    544548 
    545549 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ASM/asminc.F90

    r4998 r5098  
    746746 
    747747 
    748             IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d ) & 
    749                &  CALL zps_hde( nit000, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    750                &                rhd, gru , grv, aru, arv, gzu, gzv, ge3ru, ge3rv,  &             ! 
    751                &                gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     748            IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d )                     & 
     749               &  CALL zps_hde    ( kt, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     750               &                              rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     751            IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND. ln_isfcav)      & 
     752               &  CALL zps_hde_isf( nit000, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     753               &                                  rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     754               &                           gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    752755 
    753756#if defined key_zdfkpp 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/diawri.F90

    r4990 r5098  
    145145         z3d(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem) * fse3t_n(:,:,:) 
    146146         CALL iom_put( "toce" , z3d                        )   ! heat content 
    147          DO jj = 1, jpj 
    148             DO ji = 1, jpi 
    149                z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_tem) * fse3t_n(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    150             END DO 
    151          END DO   
    152          CALL iom_put( "sst"  , z2d(:,:)                 )   ! sea surface heat content       
    153          DO jj = 1, jpj 
    154             DO ji = 1, jpi 
    155                z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_tem)**2 * fse3t_n(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    156             END DO 
    157          END DO   
    158          CALL iom_put( "sst2" , z2d(:,:)      )   ! sea surface content of squared temperature 
     147         CALL iom_put( "sst"  , z3d(:,:,1)                 )   ! sea surface heat content 
     148         z3d(:,:,1) = tsn(:,:,1,jp_tem) * z3d(:,:,1) 
     149         CALL iom_put( "sst2" , z3d(:,:,1)                 )   ! sea surface content of squared temperature 
    159150         z3d(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_sal) * fse3t_n(:,:,:)             
    160151         CALL iom_put( "soce" , z3d                        )   ! salinity content 
    161          DO jj = 1, jpj 
    162             DO ji = 1, jpi 
    163                z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_sal) * fse3t_n(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    164             END DO 
    165          END DO   
    166          CALL iom_put( "sss"  , z2d(:,:)                 )   ! sea surface salinity content 
    167          DO jj = 1, jpj 
    168             DO ji = 1, jpi 
    169                z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_sal)**2 * fse3t_n(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    170             END DO 
    171          END DO   
    172          CALL iom_put( "sss2" , z2d(:,:)                 )   ! sea surface content of squared salinity 
     152         CALL iom_put( "sss"  , z3d(:,:,1)                 )   ! sea surface salinity content 
     153         z3d(:,:,1) = tsn(:,:,1,jp_sal) * z3d(:,:,1) 
     154         CALL iom_put( "sss2" , z3d(:,:,1)                 )   ! sea surface content of squared salinity 
    173155      ELSE 
    174          CALL iom_put( "toce" , tsn(:,:,:,jp_tem)        )   ! temperature 
    175          IF ( iom_use("sst") ) THEN 
    176             DO jj = 1, jpj 
    177                DO ji = 1, jpi 
    178                   z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_tem) 
    179                END DO 
    180             END DO 
    181             CALL iom_put( "sst"  , z2d(:,:)            ) ! sea surface temperature 
    182          ENDIF 
    183          IF ( iom_use("sst2") )   CALL iom_put( "sst2" , z2d(:,:) * z2d(:,:) ) ! square of sea surface temperature 
     156         CALL iom_put( "toce" , tsn(:,:,:,jp_tem)          )   ! temperature 
     157         CALL iom_put( "sst"  , tsn(:,:,1,jp_tem)          )   ! sea surface temperature 
     158         CALL iom_put( "sst2" , tsn(:,:,1,jp_tem) * tsn(:,:,1,jp_tem) ) ! square of sea surface temperature 
    184159         CALL iom_put( "soce" , tsn(:,:,:,jp_sal)          )   ! salinity 
    185          IF ( iom_use("sss") ) THEN 
    186             DO jj = 1, jpj 
    187                DO ji = 1, jpi 
    188                   z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,mikt(ji,jj),jp_sal) 
    189                END DO 
    190             END DO 
    191             CALL iom_put( "sss"  , z2d(:,:)            ) ! sea surface salinity 
    192          ENDIF 
    193          CALL iom_put( "sss2" , z2d(:,:) * z2d(:,:) ) ! square of sea surface salinity 
     160         CALL iom_put( "sss"  , tsn(:,:,1,jp_sal)          )   ! sea surface salinity 
     161         CALL iom_put( "sss2" , tsn(:,:,1,jp_sal) * tsn(:,:,1,jp_sal) ) ! square of sea surface salinity 
    194162      END IF 
    195163      IF( lk_vvl .AND. (.NOT. ln_dynadv_vec) ) THEN 
    … …  
    199167         CALL iom_put( "uoce" , umask(:,:,:) * un(:,:,:)                  )    ! i-current 
    200168         CALL iom_put( "voce" , vmask(:,:,:) * vn(:,:,:)                  )    ! j-current 
    201          IF ( iom_use("ssu") ) THEN 
    202             DO jj = 1, jpj 
    203                DO ji = 1, jpi 
    204                   z2d(ji,jj) = un(ji,jj,miku(ji,jj)) 
    205                END DO 
    206             END DO 
    207             CALL iom_put( "ssu"   , z2d                                    )    ! i-current 
    208          ENDIF 
    209          IF ( iom_use("ssv") ) THEN 
    210             DO jj = 1, jpj 
    211                DO ji = 1, jpi 
    212                   z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,mikv(ji,jj)) 
    213                END DO 
    214             END DO 
    215             CALL iom_put( "ssv"   , z2d                                    )    ! j-current 
    216          ENDIF 
    217169      ENDIF 
    218170      CALL iom_put(    "avt"  , avt                        )    ! T vert. eddy diff. coef. 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/dom_oce.F90

    r4990 r5098  
    262262 
    263263   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:), TARGET :: tmask, umask, vmask, fmask   !: land/ocean mask at T-, U-, V- and F-pts 
     264   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:), TARGET :: wmask, wumask, wvmask        !: land/ocean mask at WT-, WU- and WV-pts 
    264265 
    265266   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) ::   tpol, fpol          !: north fold mask (jperio= 3 or 4) 
    … …  
    332333   INTEGER FUNCTION dom_oce_alloc() 
    333334      !!---------------------------------------------------------------------- 
    334       INTEGER, DIMENSION(11) :: ierr 
     335      INTEGER, DIMENSION(12) :: ierr 
    335336      !!---------------------------------------------------------------------- 
    336337      ierr(:) = 0 
    … …  
    400401         &      vmask(jpi,jpj,jpk) , fmask(jpi,jpj,jpk), STAT=ierr(11) ) 
    401402 
     403      ALLOCATE( wmask(jpi,jpj,jpk) , wumask(jpi,jpj,jpk), wvmask(jpi,jpj,jpk) , STAT=ierr(12) ) 
     404 
    402405#if defined key_noslip_accurate 
    403       ALLOCATE( npcoa(4,jpk), nicoa(2*(jpi+jpj),4,jpk), njcoa(2*(jpi+jpj),4,jpk), STAT=ierr(11) ) 
     406      ALLOCATE( npcoa(4,jpk), nicoa(2*(jpi+jpj),4,jpk), njcoa(2*(jpi+jpj),4,jpk), STAT=ierr(12) ) 
    404407#endif 
    405408      ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/dommsk.F90

    r4990 r5098  
    281281      CALL lbc_lnk( fmask_i, 'F', 1._wp ) 
    282282 
     283      ! 3. Ocean/land mask at wu-, wv- and w points  
     284      !---------------------------------------------- 
     285      wmask (:,:,1) = tmask(:,:,1) ! ???????? 
     286      wumask(:,:,1) = umask(:,:,1) ! ???????? 
     287      wvmask(:,:,1) = vmask(:,:,1) ! ???????? 
     288      DO jk=2,jpk 
     289         wmask (:,:,jk)=tmask(:,:,jk) * tmask(:,:,jk-1) 
     290         wumask(:,:,jk)=umask(:,:,jk) * umask(:,:,jk-1)    
     291         wvmask(:,:,jk)=vmask(:,:,jk) * vmask(:,:,jk-1) 
     292      END DO 
    283293 
    284294      ! 4. ocean/land mask for the elliptic equation 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/domvvl.F90

    r4998 r5098  
    88   !!            3.3  !  2011-10  (M. Leclair) totally rewrote domvvl: 
    99   !!                                          vvl option includes z_star and z_tilde coordinates 
     10   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) add ice shelf capability 
    1011   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1112   !!   'key_vvl'                              variable volume 
    … …  
    125126      INTEGER ::   ji,jj,jk 
    126127      INTEGER ::   ii0, ii1, ij0, ij1 
     128      REAL(wp)::   zcoef 
    127129      !!---------------------------------------------------------------------- 
    128130      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('dom_vvl_init') 
    … …  
    164166      ! t- and w- points depth 
    165167      ! ---------------------- 
     168      ! set the isf depth as it is in the initial step 
    166169      fsdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_n(:,:,1) 
    167170      fsdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
    … …  
    169172      fsdept_b(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_b(:,:,1) 
    170173      fsdepw_b(:,:,1) = 0.0_wp 
    171       DO jj = 1,jpj 
    172          DO ji = 1,jpi 
    173             DO jk = 2,mikt(ji,jj)-1 
    174                fsdept_n(ji,jj,jk) = gdept_0(ji,jj,jk) 
    175                fsdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    176                fsde3w_n(ji,jj,jk) = gdept_0(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    177                fsdept_b(ji,jj,jk) = gdept_0(ji,jj,jk) 
    178                fsdepw_b(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    179             END DO 
    180             IF (mikt(ji,jj) .GT. 1) THEN 
    181                jk = mikt(ji,jj) 
    182                fsdept_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) + 0.5_wp * fse3w_n(ji,jj,jk) 
    183                fsdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    184                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk  ) - sshn   (ji,jj) 
    185                fsdept_b(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) + 0.5_wp * fse3w_b(ji,jj,jk) 
    186                fsdepw_b(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    187             END IF 
    188             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpk 
    189                fsdept_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk-1) + fse3w_n(ji,jj,jk) 
     174 
     175      DO jk = 2, jpk 
     176         DO jj = 1,jpj 
     177            DO ji = 1,jpi 
     178              !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
     179                                                     ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf) 
     180                                                     ! 0.5 where jk = mikt   
     181               zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
    190182               fsdepw_n(ji,jj,jk) = fsdepw_n(ji,jj,jk-1) + fse3t_n(ji,jj,jk-1) 
    191                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk  ) - sshn   (ji,jj) 
    192                fsdept_b(ji,jj,jk) = fsdept_b(ji,jj,jk-1) + fse3w_b(ji,jj,jk) 
     183               fsdept_n(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_n(ji,jj,jk))  & 
     184                   &                + (1-zcoef) * ( fsdept_n(ji,jj,jk-1) +       fse3w_n(ji,jj,jk))  
     185               fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    193186               fsdepw_b(ji,jj,jk) = fsdepw_b(ji,jj,jk-1) + fse3t_b(ji,jj,jk-1) 
     187               fsdept_b(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_b(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_b(ji,jj,jk))  & 
     188                   &                + (1-zcoef) * ( fsdept_b(ji,jj,jk-1) +       fse3w_b(ji,jj,jk))  
    194189            END DO 
    195190         END DO 
    … …  
    590585      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: z_e3t_def 
    591586      INTEGER                             :: ji,jj,jk       ! dummy loop indices 
     587      REAL(wp)                            :: zcoef 
    592588      !!---------------------------------------------------------------------- 
    593589 
    … …  
    638634      ! t- and w- points depth 
    639635      ! ---------------------- 
     636      ! set the isf depth as it is in the initial step 
    640637      fsdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_n(:,:,1) 
    641638      fsdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
    642639      fsde3w_n(:,:,1) = fsdept_n(:,:,1) - sshn(:,:) 
    643       DO jj = 1,jpj 
    644          DO ji = 1,jpi 
    645             DO jk = 2,mikt(ji,jj)-1 
    646                fsdept_n(ji,jj,jk) = gdept_0(ji,jj,jk) 
    647                fsdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    648                fsde3w_n(ji,jj,jk) = gdept_0(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    649             END DO 
    650             IF (mikt(ji,jj) .GT. 1) THEN 
    651                jk = mikt(ji,jj) 
    652                fsdept_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) + 0.5_wp * fse3w_n(ji,jj,jk) 
    653                fsdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_0(ji,jj,jk) 
    654                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk  ) - sshn   (ji,jj) 
    655             END IF 
    656             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpk 
    657                fsdept_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk-1) + fse3w_n(ji,jj,jk) 
     640 
     641      DO jk = 2, jpk 
     642         DO jj = 1,jpj 
     643            DO ji = 1,jpi 
     644              !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
     645                                                                 ! 1 for jk = mikt 
     646               zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
    658647               fsdepw_n(ji,jj,jk) = fsdepw_n(ji,jj,jk-1) + fse3t_n(ji,jj,jk-1) 
    659                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk  ) - sshn   (ji,jj) 
     648               fsdept_n(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_n(ji,jj,jk))  & 
     649                   &                + (1-zcoef) * ( fsdept_n(ji,jj,jk-1) +       fse3w_n(ji,jj,jk))  
     650               fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    660651            END DO 
    661652         END DO 
    662653      END DO 
     654 
    663655      ! Local depth and Inverse of the local depth of the water column at u- and v- points 
    664656      ! ---------------------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/domzgr.F90

    r5040 r5098  
    1717   !!            3.4  ! 2012-08  (J. Siddorn) added Siddorn and Furner stretching function 
    1818   !!            3.4  ! 2012-12  (R. Bourdalle-Badie and G. Reffray)  modify C1D case   
     19   !!            3.6  ! 2014-11  (P. Mathiot and C. Harris) add ice shelf capabilitye   
    1920   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2021 
    … …  
    3536   USE oce               ! ocean variables 
    3637   USE dom_oce           ! ocean domain 
    37    USE sbc_oce           ! surface variable (isf) 
    3838   USE closea            ! closed seas 
    3939   USE c1d               ! 1D vertical configuration 
    … …  
    472472         ! 
    473473         ! (ISF) TODO build ice draft netcdf file for isomip and build the corresponding part of code 
    474          IF( cp_cfg == "isomip" ) THEN  
     474         IF( cp_cfg == "isomip" .AND. ln_isfcav ) THEN  
    475475           !  
    476476           risfdep(:,:)=200.e0  
    … …  
    482482            WHERE( bathy(:,:) <= 0._wp )  risfdep(:,:) = 0._wp  
    483483           !  
    484          ELSEIF ( cp_cfg == "isomip2" ) THEN 
     484         ELSEIF ( cp_cfg == "isomip2" .AND. ln_isfcav ) THEN 
    485485         !  
    486486            risfdep(:,:)=0.e0 
    … …  
    584584      IF ( .not. ln_sco ) THEN                                !==  set a minimum depth  ==! 
    585585         ! patch to avoid case bathy = ice shelf draft and bathy between 0 and zhmin 
    586          WHERE (bathy == risfdep) 
    587             bathy   = 0.0_wp ; risfdep = 0.0_wp 
    588          END WHERE 
     586         IF ( ln_isfcav ) THEN 
     587            WHERE (bathy == risfdep) 
     588               bathy   = 0.0_wp ; risfdep = 0.0_wp 
     589            END WHERE 
     590         END IF 
    589591         ! end patch 
    590592         IF( rn_hmin < 0._wp ) THEN    ;   ik = - INT( rn_hmin )                                      ! from a nb of level 
    … …  
    964966      INTEGER  ::   ik, it           ! temporary integers 
    965967      INTEGER  ::   id, jd, nprocd 
     968      LOGICAL  ::   ll_print         ! Allow  control print for debugging 
     969      REAL(wp) ::   ze3tp , ze3wp    ! Last ocean level thickness at T- and W-points 
     970      REAL(wp) ::   zdepwp, zdepth   ! Ajusted ocean depth to avoid too small e3t 
     971      REAL(wp) ::   zmax, zmin       ! Maximum and minimum depth 
     972      REAL(wp) ::   zdiff            ! temporary scalar 
     973      REAL(wp) ::   zrefdep          ! temporary scalar 
     974      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  zprt 
     975      !!--------------------------------------------------------------------- 
     976      ! 
     977      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('zgr_zps') 
     978      ! 
     979      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zprt ) 
     980      ! 
     981      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
     982      IF(lwp) WRITE(numout,*) '    zgr_zps : z-coordinate with partial steps' 
     983      IF(lwp) WRITE(numout,*) '    ~~~~~~~ ' 
     984      IF(lwp) WRITE(numout,*) '              mbathy is recomputed : bathy_level file is NOT used' 
     985 
     986      ll_print = .FALSE.                   ! Local variable for debugging 
     987       
     988      IF(lwp .AND. ll_print) THEN          ! control print of the ocean depth 
     989         WRITE(numout,*) 
     990         WRITE(numout,*) 'dom_zgr_zps:  bathy (in hundred of meters)' 
     991         CALL prihre( bathy, jpi, jpj, 1,jpi, 1, 1, jpj, 1, 1.e-2, numout ) 
     992      ENDIF 
     993 
     994 
     995      ! bathymetry in level (from bathy_meter) 
     996      ! =================== 
     997      zmax = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)        ! maximum depth (i.e. the last ocean level thickness <= 2*e3t_1d(jpkm1) ) 
     998      bathy(:,:) = MIN( zmax ,  bathy(:,:) )    ! bounded value of bathy (min already set at the end of zgr_bat) 
     999      WHERE( bathy(:,:) == 0._wp )   ;   mbathy(:,:) = 0       ! land  : set mbathy to 0 
     1000      ELSE WHERE                     ;   mbathy(:,:) = jpkm1   ! ocean : initialize mbathy to the max ocean level 
     1001      END WHERE 
     1002 
     1003      ! Compute mbathy for ocean points (i.e. the number of ocean levels) 
     1004      ! find the number of ocean levels such that the last level thickness 
     1005      ! is larger than the minimum of e3zps_min and e3zps_rat * e3t_1d (where 
     1006      ! e3t_1d is the reference level thickness 
     1007      DO jk = jpkm1, 1, -1 
     1008         zdepth = gdepw_1d(jk) + MIN( e3zps_min, e3t_1d(jk)*e3zps_rat ) 
     1009         WHERE( 0._wp < bathy(:,:) .AND. bathy(:,:) <= zdepth )   mbathy(:,:) = jk-1 
     1010      END DO 
     1011 
     1012      IF ( ln_isfcav ) CALL zgr_isf 
     1013 
     1014      ! Scale factors and depth at T- and W-points 
     1015      DO jk = 1, jpk                        ! intitialization to the reference z-coordinate 
     1016         gdept_0(:,:,jk) = gdept_1d(jk) 
     1017         gdepw_0(:,:,jk) = gdepw_1d(jk) 
     1018         e3t_0  (:,:,jk) = e3t_1d  (jk) 
     1019         e3w_0  (:,:,jk) = e3w_1d  (jk) 
     1020      END DO 
     1021      !  
     1022      DO jj = 1, jpj 
     1023         DO ji = 1, jpi 
     1024            ik = mbathy(ji,jj) 
     1025            IF( ik > 0 ) THEN               ! ocean point only 
     1026               ! max ocean level case 
     1027               IF( ik == jpkm1 ) THEN 
     1028                  zdepwp = bathy(ji,jj) 
     1029                  ze3tp  = bathy(ji,jj) - gdepw_1d(ik) 
     1030                  ze3wp = 0.5_wp * e3w_1d(ik) * ( 1._wp + ( ze3tp/e3t_1d(ik) ) ) 
     1031                  e3t_0(ji,jj,ik  ) = ze3tp 
     1032                  e3t_0(ji,jj,ik+1) = ze3tp 
     1033                  e3w_0(ji,jj,ik  ) = ze3wp 
     1034                  e3w_0(ji,jj,ik+1) = ze3tp 
     1035                  gdepw_0(ji,jj,ik+1) = zdepwp 
     1036                  gdept_0(ji,jj,ik  ) = gdept_1d(ik-1) + ze3wp 
     1037                  gdept_0(ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik) + ze3tp 
     1038                  ! 
     1039               ELSE                         ! standard case 
     1040                  IF( bathy(ji,jj) <= gdepw_1d(ik+1) ) THEN  ;   gdepw_0(ji,jj,ik+1) = bathy(ji,jj) 
     1041                  ELSE                                       ;   gdepw_0(ji,jj,ik+1) = gdepw_1d(ik+1) 
     1042                  ENDIF 
     1043!gm Bug?  check the gdepw_1d 
     1044                  !       ... on ik 
     1045                  gdept_0(ji,jj,ik) = gdepw_1d(ik) + ( gdepw_0(ji,jj,ik+1) - gdepw_1d(ik) )   & 
     1046                     &                             * ((gdept_1d(     ik  ) - gdepw_1d(ik) )   & 
     1047                     &                             / ( gdepw_1d(     ik+1) - gdepw_1d(ik) )) 
     1048                  e3t_0(ji,jj,ik) = e3t_1d (ik) * ( gdepw_0 (ji,jj,ik+1) - gdepw_1d(ik) )   &  
     1049                     &                          / ( gdepw_1d(      ik+1) - gdepw_1d(ik) )  
     1050                  e3w_0(ji,jj,ik) = 0.5_wp * ( gdepw_0(ji,jj,ik+1) + gdepw_1d(ik+1) - 2._wp * gdepw_1d(ik) )   & 
     1051                     &                     * ( e3w_1d(ik) / ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_1d(ik) ) ) 
     1052                  !       ... on ik+1 
     1053                  e3w_0  (ji,jj,ik+1) = e3t_0  (ji,jj,ik) 
     1054                  e3t_0  (ji,jj,ik+1) = e3t_0  (ji,jj,ik) 
     1055                  gdept_0(ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik) + e3t_0(ji,jj,ik) 
     1056               ENDIF 
     1057            ENDIF 
     1058         END DO 
     1059      END DO 
     1060      ! 
     1061      it = 0 
     1062      DO jj = 1, jpj 
     1063         DO ji = 1, jpi 
     1064            ik = mbathy(ji,jj) 
     1065            IF( ik > 0 ) THEN               ! ocean point only 
     1066               e3tp (ji,jj) = e3t_0(ji,jj,ik) 
     1067               e3wp (ji,jj) = e3w_0(ji,jj,ik) 
     1068               ! test 
     1069               zdiff= gdepw_0(ji,jj,ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik  ) 
     1070               IF( zdiff <= 0._wp .AND. lwp ) THEN  
     1071                  it = it + 1 
     1072                  WRITE(numout,*) ' it      = ', it, ' ik      = ', ik, ' (i,j) = ', ji, jj 
     1073                  WRITE(numout,*) ' bathy = ', bathy(ji,jj) 
     1074                  WRITE(numout,*) ' gdept_0 = ', gdept_0(ji,jj,ik), ' gdepw_0 = ', gdepw_0(ji,jj,ik+1), ' zdiff = ', zdiff 
     1075                  WRITE(numout,*) ' e3tp    = ', e3t_0  (ji,jj,ik), ' e3wp    = ', e3w_0  (ji,jj,ik  ) 
     1076               ENDIF 
     1077            ENDIF 
     1078         END DO 
     1079      END DO 
     1080      ! 
     1081      IF ( ln_isfcav ) THEN 
     1082      ! (ISF) Definition of e3t, u, v, w for ISF case 
     1083         DO jj = 1, jpj  
     1084            DO ji = 1, jpi  
     1085               ik = misfdep(ji,jj)  
     1086               IF( ik > 1 ) THEN               ! ice shelf point only  
     1087                  IF( risfdep(ji,jj) < gdepw_1d(ik) )  risfdep(ji,jj)= gdepw_1d(ik)  
     1088                  gdepw_0(ji,jj,ik) = risfdep(ji,jj)  
     1089!gm Bug?  check the gdepw_0  
     1090               !       ... on ik  
     1091                  gdept_0(ji,jj,ik) = gdepw_1d(ik+1) - ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_0(ji,jj,ik) )   &  
     1092                     &                               * ( gdepw_1d(ik+1) - gdept_1d(ik)      )   &  
     1093                     &                               / ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_1d(ik)      )  
     1094                  e3t_0  (ji,jj,ik  ) = gdepw_1d(ik+1) - gdepw_0(ji,jj,ik)  
     1095                  e3w_0  (ji,jj,ik+1) = gdept_1d(ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik) 
     1096 
     1097                  IF( ik + 1 == mbathy(ji,jj) ) THEN               ! ice shelf point only (2 cell water column)  
     1098                     e3w_0  (ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik)  
     1099                  ENDIF  
     1100               !       ... on ik / ik-1  
     1101                  e3w_0  (ji,jj,ik  ) = 2._wp * (gdept_0(ji,jj,ik) - gdepw_0(ji,jj,ik))  
     1102                  e3t_0  (ji,jj,ik-1) = gdepw_0(ji,jj,ik) - gdepw_1d(ik-1) 
     1103! The next line isn't required and doesn't affect results - included for consistency with bathymetry code  
     1104                  gdept_0(ji,jj,ik-1) = gdept_1d(ik-1) 
     1105               ENDIF  
     1106            END DO  
     1107         END DO  
     1108      !  
     1109         it = 0  
     1110         DO jj = 1, jpj  
     1111            DO ji = 1, jpi  
     1112               ik = misfdep(ji,jj)  
     1113               IF( ik > 1 ) THEN               ! ice shelf point only  
     1114                  e3tp (ji,jj) = e3t_0(ji,jj,ik  )  
     1115                  e3wp (ji,jj) = e3w_0(ji,jj,ik+1 )  
     1116               ! test  
     1117                  zdiff= gdept_0(ji,jj,ik) - gdepw_0(ji,jj,ik  )  
     1118                  IF( zdiff <= 0. .AND. lwp ) THEN   
     1119                     it = it + 1  
     1120                     WRITE(numout,*) ' it      = ', it, ' ik      = ', ik, ' (i,j) = ', ji, jj  
     1121                     WRITE(numout,*) ' risfdep = ', risfdep(ji,jj)  
     1122                     WRITE(numout,*) ' gdept = ', gdept_0(ji,jj,ik), ' gdepw = ', gdepw_0(ji,jj,ik+1), ' zdiff = ', zdiff  
     1123                     WRITE(numout,*) ' e3tp  = ', e3tp(ji,jj), ' e3wp  = ', e3wp(ji,jj)  
     1124                  ENDIF  
     1125               ENDIF  
     1126            END DO  
     1127         END DO  
     1128      END IF 
     1129      ! END (ISF) 
     1130 
     1131      ! Scale factors and depth at U-, V-, UW and VW-points 
     1132      DO jk = 1, jpk                        ! initialisation to z-scale factors 
     1133         e3u_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1134         e3v_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1135         e3uw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
     1136         e3vw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
     1137      END DO 
     1138      DO jk = 1,jpk                         ! Computed as the minimum of neighbooring scale factors 
     1139         DO jj = 1, jpjm1 
     1140            DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
     1141               e3u_0 (ji,jj,jk) = MIN( e3t_0(ji,jj,jk), e3t_0(ji+1,jj,jk) ) 
     1142               e3v_0 (ji,jj,jk) = MIN( e3t_0(ji,jj,jk), e3t_0(ji,jj+1,jk) ) 
     1143               e3uw_0(ji,jj,jk) = MIN( e3w_0(ji,jj,jk), e3w_0(ji+1,jj,jk) ) 
     1144               e3vw_0(ji,jj,jk) = MIN( e3w_0(ji,jj,jk), e3w_0(ji,jj+1,jk) ) 
     1145            END DO 
     1146         END DO 
     1147      END DO 
     1148      !IF ( ln_isfcav ) THEN 
     1149      ! (ISF) define e3uw (adapted for 2 cells in the water column) 
     1150         DO jk = 2,jpk                           
     1151            DO jj = 1, jpjm1  
     1152               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt.  
     1153                  e3uw_0(ji,jj,jk) = MIN( gdept_0(ji,jj,jk), gdept_0(ji+1,jj  ,jk) ) & 
     1154                    &   - MAX( gdept_0(ji,jj,jk-1), gdept_0(ji+1,jj  ,jk-1) ) 
     1155                  e3vw_0(ji,jj,jk) = MIN( gdept_0(ji,jj,jk), gdept_0(ji  ,jj+1,jk) ) & 
     1156                    &   - MAX( gdept_0(ji,jj,jk-1), gdept_0(ji  ,jj+1,jk-1) ) 
     1157               END DO  
     1158            END DO  
     1159         END DO 
     1160      !END IF 
     1161      !End (ISF) 
     1162       
     1163      CALL lbc_lnk( e3u_0 , 'U', 1._wp )   ;   CALL lbc_lnk( e3uw_0, 'U', 1._wp )   ! lateral boundary conditions 
     1164      CALL lbc_lnk( e3v_0 , 'V', 1._wp )   ;   CALL lbc_lnk( e3vw_0, 'V', 1._wp ) 
     1165      ! 
     1166      DO jk = 1, jpk                        ! set to z-scale factor if zero (i.e. along closed boundaries) 
     1167         WHERE( e3u_0 (:,:,jk) == 0._wp )   e3u_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1168         WHERE( e3v_0 (:,:,jk) == 0._wp )   e3v_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1169         WHERE( e3uw_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3uw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
     1170         WHERE( e3vw_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3vw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
     1171      END DO 
     1172       
     1173      ! Scale factor at F-point 
     1174      DO jk = 1, jpk                        ! initialisation to z-scale factors 
     1175         e3f_0(:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1176      END DO 
     1177      DO jk = 1, jpk                        ! Computed as the minimum of neighbooring V-scale factors 
     1178         DO jj = 1, jpjm1 
     1179            DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
     1180               e3f_0(ji,jj,jk) = MIN( e3v_0(ji,jj,jk), e3v_0(ji+1,jj,jk) ) 
     1181            END DO 
     1182         END DO 
     1183      END DO 
     1184      CALL lbc_lnk( e3f_0, 'F', 1._wp )       ! Lateral boundary conditions 
     1185      ! 
     1186      DO jk = 1, jpk                        ! set to z-scale factor if zero (i.e. along closed boundaries) 
     1187         WHERE( e3f_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3f_0(:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
     1188      END DO 
     1189!!gm  bug ? :  must be a do loop with mj0,mj1 
     1190      !  
     1191      e3t_0(:,mj0(1),:) = e3t_0(:,mj0(2),:)     ! we duplicate factor scales for jj = 1 and jj = 2 
     1192      e3w_0(:,mj0(1),:) = e3w_0(:,mj0(2),:)  
     1193      e3u_0(:,mj0(1),:) = e3u_0(:,mj0(2),:)  
     1194      e3v_0(:,mj0(1),:) = e3v_0(:,mj0(2),:)  
     1195      e3f_0(:,mj0(1),:) = e3f_0(:,mj0(2),:)  
     1196 
     1197      ! Control of the sign 
     1198      IF( MINVAL( e3t_0  (:,:,:) ) <= 0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   e3t_0 <= 0' ) 
     1199      IF( MINVAL( e3w_0  (:,:,:) ) <= 0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   e3w_0 <= 0' ) 
     1200      IF( MINVAL( gdept_0(:,:,:) ) <  0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   gdept_0 <  0' ) 
     1201      IF( MINVAL( gdepw_0(:,:,:) ) <  0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   gdepw_0 <  0' ) 
     1202      
     1203      ! Compute gdep3w_0 (vertical sum of e3w) 
     1204      IF ( ln_isfcav ) THEN 
     1205         WHERE (misfdep == 0) misfdep = 1 
     1206         DO jj = 1,jpj 
     1207            DO ji = 1,jpi 
     1208               gdep3w_0(ji,jj,1) = 0.5_wp * e3w_0(ji,jj,1) 
     1209               DO jk = 2, misfdep(ji,jj) 
     1210                  gdep3w_0(ji,jj,jk) = gdep3w_0(ji,jj,jk-1) + e3w_0(ji,jj,jk)  
     1211               END DO 
     1212               IF (misfdep(ji,jj) .GE. 2) gdep3w_0(ji,jj,misfdep(ji,jj)) = risfdep(ji,jj) + 0.5_wp * e3w_0(ji,jj,misfdep(ji,jj)) 
     1213               DO jk = misfdep(ji,jj) + 1, jpk 
     1214                  gdep3w_0(ji,jj,jk) = gdep3w_0(ji,jj,jk-1) + e3w_0(ji,jj,jk)  
     1215               END DO 
     1216            END DO 
     1217         END DO 
     1218      ELSE ! no cavity 
     1219         gdep3w_0(:,:,1) = 0.5_wp * e3w_0(:,:,1) 
     1220         DO jk = 2, jpk 
     1221            gdep3w_0(:,:,jk) = gdep3w_0(:,:,jk-1) + e3w_0(:,:,jk) 
     1222         END DO 
     1223      END IF 
     1224      !                                               ! ================= ! 
     1225      IF(lwp .AND. ll_print) THEN                     !   Control print   ! 
     1226         !                                            ! ================= ! 
     1227         DO jj = 1,jpj 
     1228            DO ji = 1, jpi 
     1229               ik = MAX( mbathy(ji,jj), 1 ) 
     1230               zprt(ji,jj,1) = e3t_0   (ji,jj,ik) 
     1231               zprt(ji,jj,2) = e3w_0   (ji,jj,ik) 
     1232               zprt(ji,jj,3) = e3u_0   (ji,jj,ik) 
     1233               zprt(ji,jj,4) = e3v_0   (ji,jj,ik) 
     1234               zprt(ji,jj,5) = e3f_0   (ji,jj,ik) 
     1235               zprt(ji,jj,6) = gdep3w_0(ji,jj,ik) 
     1236            END DO 
     1237         END DO 
     1238         WRITE(numout,*) 
     1239         WRITE(numout,*) 'domzgr e3t(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,1),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1240         WRITE(numout,*) 
     1241         WRITE(numout,*) 'domzgr e3w(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,2),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1242         WRITE(numout,*) 
     1243         WRITE(numout,*) 'domzgr e3u(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,3),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1244         WRITE(numout,*) 
     1245         WRITE(numout,*) 'domzgr e3v(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,4),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1246         WRITE(numout,*) 
     1247         WRITE(numout,*) 'domzgr e3f(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,5),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1248         WRITE(numout,*) 
     1249         WRITE(numout,*) 'domzgr gdep3w(mbathy)'   ;   CALL prihre(zprt(:,:,6),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
     1250      ENDIF   
     1251      ! 
     1252      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zprt ) 
     1253      ! 
     1254      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('zgr_zps') 
     1255      ! 
     1256   END SUBROUTINE zgr_zps 
     1257 
     1258   SUBROUTINE zgr_isf 
     1259      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1260      !!                    ***  ROUTINE zgr_bat_ctl  *** 
     1261      !!    
     1262      !! ** Purpose :   check the bathymetry in levels 
     1263      !!    
     1264      !! ** Method  :   THe water column have to contained at least 2 cells 
     1265      !!                Bathymetry and isfdraft are modified (dig/close) to respect 
     1266      !!                this criterion. 
     1267      !!                  
     1268      !!    
     1269      !! ** Action  : - test compatibility between isfdraft and bathy  
     1270      !!              - bathy and isfdraft are modified 
     1271      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1272      !!    
     1273      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jl   ! dummy loop indices 
     1274      INTEGER  ::   ik, it           ! temporary integers 
     1275      INTEGER  ::   id, jd, nprocd 
    9661276      INTEGER  ::   icompt, ibtest, ibtestim1, ibtestip1, ibtestjm1, ibtestjp1   ! (ISF) 
    9671277      LOGICAL  ::   ll_print         ! Allow  control print for debugging 
    … …  
    9711281      REAL(wp) ::   zdiff            ! temporary scalar 
    9721282      REAL(wp) ::   zrefdep          ! temporary scalar 
    973       REAL(wp) ::   zbathydiff, zrisfdepdiff  
    974       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   ::   zrisfdep, zbathy, zmask   ! 3D workspace (ISH) 
    975       INTEGER , POINTER, DIMENSION(:,:)   ::   zmbathy, zmisfdep   ! 3D workspace (ISH) 
    976       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  zprt 
     1283      REAL(wp) ::   zbathydiff, zrisfdepdiff  ! isf temporary scalar 
     1284      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   ::   zrisfdep, zbathy, zmask   ! 2D workspace (ISH) 
     1285      INTEGER , POINTER, DIMENSION(:,:)   ::   zmbathy, zmisfdep         ! 2D workspace (ISH) 
    9771286      !!--------------------------------------------------------------------- 
    9781287      ! 
    979       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('zgr_zps') 
    980       ! 
    981       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zprt ) 
     1288      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('zgr_isf') 
     1289      ! 
    9821290      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zbathy, zmask, zrisfdep) 
    983       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zmbathy, zmisfdep) 
    984       ! 
    985       IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    986       IF(lwp) WRITE(numout,*) '    zgr_zps : z-coordinate with partial steps' 
    987       IF(lwp) WRITE(numout,*) '    ~~~~~~~ ' 
    988       IF(lwp) WRITE(numout,*) '              mbathy is recomputed : bathy_level file is NOT used' 
    989  
    990       ll_print = .FALSE.                   ! Local variable for debugging 
    991        
    992       IF(lwp .AND. ll_print) THEN          ! control print of the ocean depth 
    993          WRITE(numout,*) 
    994          WRITE(numout,*) 'dom_zgr_zps:  bathy (in hundred of meters)' 
    995          CALL prihre( bathy, jpi, jpj, 1,jpi, 1, 1, jpj, 1, 1.e-2, numout ) 
    996       ENDIF 
    997  
    998       ! bathymetry in level (from bathy_meter) 
    999       ! =================== 
    1000       zmax = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)        ! maximum depth (i.e. the last ocean level thickness <= 2*e3t_1d(jpkm1) ) 
    1001       bathy(:,:) = MIN( zmax ,  bathy(:,:) )    ! bounded value of bathy (min already set at the end of zgr_bat) 
    1002       WHERE( bathy(:,:) == 0._wp )   ;   mbathy(:,:) = 0       ! land  : set mbathy to 0 
    1003       ELSE WHERE                     ;   mbathy(:,:) = jpkm1   ! ocean : initialize mbathy to the max ocean level 
    1004       END WHERE 
    1005  
    1006       ! Compute mbathy for ocean points (i.e. the number of ocean levels) 
    1007       ! find the number of ocean levels such that the last level thickness 
    1008       ! is larger than the minimum of e3zps_min and e3zps_rat * e3t_1d (where 
    1009       ! e3t_1d is the reference level thickness 
    1010       DO jk = jpkm1, 1, -1 
    1011          zdepth = gdepw_1d(jk) + MIN( e3zps_min, e3t_1d(jk)*e3zps_rat ) 
    1012          WHERE( 0._wp < bathy(:,:) .AND. bathy(:,:) <= zdepth )   mbathy(:,:) = jk-1 
    1013       END DO 
     1291      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zmisfdep, zmbathy ) 
     1292 
     1293 
    10141294      ! (ISF) compute misfdep 
    10151295      WHERE( risfdep(:,:) == 0._wp .AND. bathy(:,:) .NE. 0) ;   misfdep(:,:) = 1   ! open water : set misfdep to 1   
    … …  
    14751755      ENDIF  
    14761756 
    1477       ! Scale factors and depth at T- and W-points 
    1478       DO jk = 1, jpk                        ! intitialization to the reference z-coordinate 
    1479          gdept_0(:,:,jk) = gdept_1d(jk) 
    1480          gdepw_0(:,:,jk) = gdepw_1d(jk) 
    1481          e3t_0  (:,:,jk) = e3t_1d  (jk) 
    1482          e3w_0  (:,:,jk) = e3w_1d  (jk) 
    1483       END DO 
    1484       !  
    1485       DO jj = 1, jpj 
    1486          DO ji = 1, jpi 
    1487             ik = mbathy(ji,jj) 
    1488             IF( ik > 0 ) THEN               ! ocean point only 
    1489                ! max ocean level case 
    1490                IF( ik == jpkm1 ) THEN 
    1491                   zdepwp = bathy(ji,jj) 
    1492                   ze3tp  = bathy(ji,jj) - gdepw_1d(ik) 
    1493                   ze3wp = 0.5_wp * e3w_1d(ik) * ( 1._wp + ( ze3tp/e3t_1d(ik) ) ) 
    1494                   e3t_0(ji,jj,ik  ) = ze3tp 
    1495                   e3t_0(ji,jj,ik+1) = ze3tp 
    1496                   e3w_0(ji,jj,ik  ) = ze3wp 
    1497                   e3w_0(ji,jj,ik+1) = ze3tp 
    1498                   gdepw_0(ji,jj,ik+1) = zdepwp 
    1499                   gdept_0(ji,jj,ik  ) = gdept_1d(ik-1) + ze3wp 
    1500                   gdept_0(ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik) + ze3tp 
    1501                   ! 
    1502                ELSE                         ! standard case 
    1503                   IF( bathy(ji,jj) <= gdepw_1d(ik+1) ) THEN  ;   gdepw_0(ji,jj,ik+1) = bathy(ji,jj) 
    1504                   ELSE                                       ;   gdepw_0(ji,jj,ik+1) = gdepw_1d(ik+1) 
    1505                   ENDIF 
    1506 !gm Bug?  check the gdepw_1d 
    1507                   !       ... on ik 
    1508                   gdept_0(ji,jj,ik) = gdepw_1d(ik) + ( gdepw_0(ji,jj,ik+1) - gdepw_1d(ik) )   & 
    1509                      &                             * ((gdept_1d(     ik  ) - gdepw_1d(ik) )   & 
    1510                      &                             / ( gdepw_1d(     ik+1) - gdepw_1d(ik) )) 
    1511                   e3t_0(ji,jj,ik) = e3t_1d (ik) * ( gdepw_0 (ji,jj,ik+1) - gdepw_1d(ik) )   &  
    1512                      &                          / ( gdepw_1d(      ik+1) - gdepw_1d(ik) )  
    1513                   e3w_0(ji,jj,ik) = 0.5_wp * ( gdepw_0(ji,jj,ik+1) + gdepw_1d(ik+1) - 2._wp * gdepw_1d(ik) )   & 
    1514                      &                     * ( e3w_1d(ik) / ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_1d(ik) ) ) 
    1515                   !       ... on ik+1 
    1516                   e3w_0  (ji,jj,ik+1) = e3t_0  (ji,jj,ik) 
    1517                   e3t_0  (ji,jj,ik+1) = e3t_0  (ji,jj,ik) 
    1518                   gdept_0(ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik) + e3t_0(ji,jj,ik) 
    1519                ENDIF 
    1520             ENDIF 
    1521          END DO 
    1522       END DO 
    1523       ! 
    1524       it = 0 
    1525       DO jj = 1, jpj 
    1526          DO ji = 1, jpi 
    1527             ik = mbathy(ji,jj) 
    1528             IF( ik > 0 ) THEN               ! ocean point only 
    1529                e3tp (ji,jj) = e3t_0(ji,jj,ik) 
    1530                e3wp (ji,jj) = e3w_0(ji,jj,ik) 
    1531                ! test 
    1532                zdiff= gdepw_0(ji,jj,ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik  ) 
    1533                IF( zdiff <= 0._wp .AND. lwp ) THEN  
    1534                   it = it + 1 
    1535                   WRITE(numout,*) ' it      = ', it, ' ik      = ', ik, ' (i,j) = ', ji, jj 
    1536                   WRITE(numout,*) ' bathy = ', bathy(ji,jj) 
    1537                   WRITE(numout,*) ' gdept_0 = ', gdept_0(ji,jj,ik), ' gdepw_0 = ', gdepw_0(ji,jj,ik+1), ' zdiff = ', zdiff 
    1538                   WRITE(numout,*) ' e3tp    = ', e3t_0  (ji,jj,ik), ' e3wp    = ', e3w_0  (ji,jj,ik  ) 
    1539                ENDIF 
    1540             ENDIF 
    1541          END DO 
    1542       END DO 
    1543       ! 
    1544       ! (ISF) Definition of e3t, u, v, w for ISF case 
    1545       DO jj = 1, jpj  
    1546          DO ji = 1, jpi  
    1547             ik = misfdep(ji,jj)  
    1548             IF( ik > 1 ) THEN               ! ice shelf point only  
    1549                IF( risfdep(ji,jj) < gdepw_1d(ik) )  risfdep(ji,jj)= gdepw_1d(ik)  
    1550                gdepw_0(ji,jj,ik) = risfdep(ji,jj)  
    1551 !gm Bug?  check the gdepw_0  
    1552                !       ... on ik  
    1553                gdept_0(ji,jj,ik) = gdepw_1d(ik+1) - ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_0(ji,jj,ik) )   &  
    1554                   &                               * ( gdepw_1d(ik+1) - gdept_1d(ik)      )   &  
    1555                   &                               / ( gdepw_1d(ik+1) - gdepw_1d(ik)      )  
    1556                e3t_0  (ji,jj,ik  ) = gdepw_1d(ik+1) - gdepw_0(ji,jj,ik)  
    1557                e3w_0  (ji,jj,ik+1) = gdept_1d(ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik) 
    1558  
    1559                IF( ik + 1 == mbathy(ji,jj) ) THEN               ! ice shelf point only (2 cell water column)  
    1560                   e3w_0  (ji,jj,ik+1) = gdept_0(ji,jj,ik+1) - gdept_0(ji,jj,ik)  
    1561                 ENDIF  
    1562                !       ... on ik / ik-1  
    1563                e3w_0  (ji,jj,ik  ) = 2._wp * (gdept_0(ji,jj,ik) - gdepw_0(ji,jj,ik))  
    1564                e3t_0  (ji,jj,ik-1) = gdepw_0(ji,jj,ik) - gdepw_1d(ik-1) 
    1565 ! The next line isn't required and doesn't affect results - included for consistency with bathymetry code  
    1566                gdept_0(ji,jj,ik-1) = gdept_1d(ik-1) 
    1567             ENDIF  
    1568          END DO  
    1569       END DO  
    1570       !  
    1571       it = 0  
    1572       DO jj = 1, jpj  
    1573          DO ji = 1, jpi  
    1574             ik = misfdep(ji,jj)  
    1575             IF( ik > 1 ) THEN               ! ice shelf point only  
    1576                e3tp (ji,jj) = e3t_0(ji,jj,ik  )  
    1577                e3wp (ji,jj) = e3w_0(ji,jj,ik+1 )  
    1578                ! test  
    1579                zdiff= gdept_0(ji,jj,ik) - gdepw_0(ji,jj,ik  )  
    1580                IF( zdiff <= 0. .AND. lwp ) THEN   
    1581                   it = it + 1  
    1582                   WRITE(numout,*) ' it      = ', it, ' ik      = ', ik, ' (i,j) = ', ji, jj  
    1583                   WRITE(numout,*) ' risfdep = ', risfdep(ji,jj)  
    1584                   WRITE(numout,*) ' gdept = ', gdept_0(ji,jj,ik), ' gdepw = ', gdepw_0(ji,jj,ik+1), ' zdiff = ', zdiff  
    1585                   WRITE(numout,*) ' e3tp  = ', e3tp(ji,jj), ' e3wp  = ', e3wp(ji,jj)  
    1586                ENDIF  
    1587             ENDIF  
    1588          END DO  
    1589       END DO  
    1590       ! END (ISF) 
    1591  
    1592       ! Scale factors and depth at U-, V-, UW and VW-points 
    1593       DO jk = 1, jpk                        ! initialisation to z-scale factors 
    1594          e3u_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1595          e3v_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1596          e3uw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
    1597          e3vw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
    1598       END DO 
    1599       DO jk = 1,jpk                         ! Computed as the minimum of neighbooring scale factors 
    1600          DO jj = 1, jpjm1 
    1601             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    1602                e3u_0 (ji,jj,jk) = MIN( e3t_0(ji,jj,jk), e3t_0(ji+1,jj,jk) ) 
    1603                e3v_0 (ji,jj,jk) = MIN( e3t_0(ji,jj,jk), e3t_0(ji,jj+1,jk) ) 
    1604                e3uw_0(ji,jj,jk) = MIN( e3w_0(ji,jj,jk), e3w_0(ji+1,jj,jk) ) 
    1605                e3vw_0(ji,jj,jk) = MIN( e3w_0(ji,jj,jk), e3w_0(ji,jj+1,jk) ) 
    1606             END DO 
    1607          END DO 
    1608       END DO 
    1609       ! (ISF) define e3uw 
    1610       DO jk = 2,jpk                           
    1611          DO jj = 1, jpjm1  
    1612             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt.  
    1613                e3uw_0(ji,jj,jk) = MIN( gdept_0(ji,jj,jk), gdept_0(ji+1,jj  ,jk) ) & 
    1614                  &   - MAX( gdept_0(ji,jj,jk-1), gdept_0(ji+1,jj  ,jk-1) ) 
    1615                e3vw_0(ji,jj,jk) = MIN( gdept_0(ji,jj,jk), gdept_0(ji  ,jj+1,jk) ) & 
    1616                  &   - MAX( gdept_0(ji,jj,jk-1), gdept_0(ji  ,jj+1,jk-1) ) 
    1617             END DO  
    1618          END DO  
    1619       END DO 
    1620       !End (ISF) 
    1621        
    1622       CALL lbc_lnk( e3u_0 , 'U', 1._wp )   ;   CALL lbc_lnk( e3uw_0, 'U', 1._wp )   ! lateral boundary conditions 
    1623       CALL lbc_lnk( e3v_0 , 'V', 1._wp )   ;   CALL lbc_lnk( e3vw_0, 'V', 1._wp ) 
    1624       ! 
    1625       DO jk = 1, jpk                        ! set to z-scale factor if zero (i.e. along closed boundaries) 
    1626          WHERE( e3u_0 (:,:,jk) == 0._wp )   e3u_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1627          WHERE( e3v_0 (:,:,jk) == 0._wp )   e3v_0 (:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1628          WHERE( e3uw_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3uw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
    1629          WHERE( e3vw_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3vw_0(:,:,jk) = e3w_1d(jk) 
    1630       END DO 
    1631        
    1632       ! Scale factor at F-point 
    1633       DO jk = 1, jpk                        ! initialisation to z-scale factors 
    1634          e3f_0(:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1635       END DO 
    1636       DO jk = 1, jpk                        ! Computed as the minimum of neighbooring V-scale factors 
    1637          DO jj = 1, jpjm1 
    1638             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    1639                e3f_0(ji,jj,jk) = MIN( e3v_0(ji,jj,jk), e3v_0(ji+1,jj,jk) ) 
    1640             END DO 
    1641          END DO 
    1642       END DO 
    1643       CALL lbc_lnk( e3f_0, 'F', 1._wp )       ! Lateral boundary conditions 
    1644       ! 
    1645       DO jk = 1, jpk                        ! set to z-scale factor if zero (i.e. along closed boundaries) 
    1646          WHERE( e3f_0(:,:,jk) == 0._wp )   e3f_0(:,:,jk) = e3t_1d(jk) 
    1647       END DO 
    1648 !!gm  bug ? :  must be a do loop with mj0,mj1 
    1649       !  
    1650       e3t_0(:,mj0(1),:) = e3t_0(:,mj0(2),:)     ! we duplicate factor scales for jj = 1 and jj = 2 
    1651       e3w_0(:,mj0(1),:) = e3w_0(:,mj0(2),:)  
    1652       e3u_0(:,mj0(1),:) = e3u_0(:,mj0(2),:)  
    1653       e3v_0(:,mj0(1),:) = e3v_0(:,mj0(2),:)  
    1654       e3f_0(:,mj0(1),:) = e3f_0(:,mj0(2),:)  
    1655  
    1656       ! Control of the sign 
    1657       IF( MINVAL( e3t_0  (:,:,:) ) <= 0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   e3t_0 <= 0' ) 
    1658       IF( MINVAL( e3w_0  (:,:,:) ) <= 0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   e3w_0 <= 0' ) 
    1659       IF( MINVAL( gdept_0(:,:,:) ) <  0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   gdept_0 <  0' ) 
    1660       IF( MINVAL( gdepw_0(:,:,:) ) <  0._wp )   CALL ctl_stop( '    zgr_zps :   e r r o r   gdepw_0 <  0' ) 
    1661       
    1662       ! Compute gdep3w_0 (vertical sum of e3w) 
    1663       WHERE (misfdep == 0) misfdep = 1 
    1664       DO jj = 1,jpj 
    1665          DO ji = 1,jpi 
    1666             gdep3w_0(ji,jj,1) = 0.5_wp * e3w_0(ji,jj,1) 
    1667             DO jk = 2, misfdep(ji,jj) 
    1668                gdep3w_0(ji,jj,jk) = gdep3w_0(ji,jj,jk-1) + e3w_0(ji,jj,jk)  
    1669             END DO 
    1670             IF (misfdep(ji,jj) .GE. 2) gdep3w_0(ji,jj,misfdep(ji,jj)) = risfdep(ji,jj) + 0.5_wp * e3w_0(ji,jj,misfdep(ji,jj)) 
    1671             DO jk = misfdep(ji,jj) + 1, jpk 
    1672                gdep3w_0(ji,jj,jk) = gdep3w_0(ji,jj,jk-1) + e3w_0(ji,jj,jk)  
    1673             END DO 
    1674         END DO 
    1675       END DO 
    1676       !                                               ! ================= ! 
    1677       IF(lwp .AND. ll_print) THEN                     !   Control print   ! 
    1678          !                                            ! ================= ! 
    1679          DO jj = 1,jpj 
    1680             DO ji = 1, jpi 
    1681                ik = MAX( mbathy(ji,jj), 1 ) 
    1682                zprt(ji,jj,1) = e3t_0   (ji,jj,ik) 
    1683                zprt(ji,jj,2) = e3w_0   (ji,jj,ik) 
    1684                zprt(ji,jj,3) = e3u_0   (ji,jj,ik) 
    1685                zprt(ji,jj,4) = e3v_0   (ji,jj,ik) 
    1686                zprt(ji,jj,5) = e3f_0   (ji,jj,ik) 
    1687                zprt(ji,jj,6) = gdep3w_0(ji,jj,ik) 
    1688             END DO 
    1689          END DO 
    1690          WRITE(numout,*) 
    1691          WRITE(numout,*) 'domzgr e3t(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,1),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1692          WRITE(numout,*) 
    1693          WRITE(numout,*) 'domzgr e3w(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,2),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1694          WRITE(numout,*) 
    1695          WRITE(numout,*) 'domzgr e3u(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,3),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1696          WRITE(numout,*) 
    1697          WRITE(numout,*) 'domzgr e3v(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,4),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1698          WRITE(numout,*) 
    1699          WRITE(numout,*) 'domzgr e3f(mbathy)'      ;   CALL prihre(zprt(:,:,5),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1700          WRITE(numout,*) 
    1701          WRITE(numout,*) 'domzgr gdep3w(mbathy)'   ;   CALL prihre(zprt(:,:,6),jpi,jpj,1,jpi,1,1,jpj,1,1.e-3,numout) 
    1702       ENDIF   
    1703       ! 
    1704       CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zprt ) 
    17051757      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zmask, zbathy, zrisfdep ) 
    17061758      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zmisfdep, zmbathy ) 
    1707       ! 
    1708       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('zgr_zps') 
    1709       ! 
    1710    END SUBROUTINE zgr_zps 
     1759 
     1760      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('zgr_isf') 
     1761       
     1762   END SUBROUTINE 
    17111763 
    17121764   SUBROUTINE zgr_sco 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/istate.F90

    r4990 r5098  
    137137         CALL eos( tsb, rhd, rhop, gdept_0(:,:,:) )        ! before potential and in situ densities 
    138138#if ! defined key_c1d 
    139          IF( ln_zps )    CALL zps_hde( nit000, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    140             &                                      rhd, gru , grv, aru, arv, gzu, gzv, ge3ru, ge3rv,  &             ! 
    141             &                                      gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     139         IF( ln_zps )    CALL zps_hde    ( nit000, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     140            &                                            rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     141         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     142            &            CALL zps_hde_isf( nit000, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     143            &                                            rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     144            &                                     gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    142145#endif 
    143146         !    

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/divcur.F90

    r4990 r5098  
    1717   !!            3.3  ! 2010-09  (D.Storkey and E.O'Dea) bug fixes for BDY module 
    1818   !!             -   ! 2010-10  (R. Furner, G. Madec) runoff and cla added directly here 
     19   !!            3.6  ! 2014-11  (P. Mathiot)          isf            added directly here 
    1920   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2021 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynbfr.F90

    r4990 r5098  
    8080              ua(ji,jj,ikbu) = ua(ji,jj,ikbu) + MAX(  bfrua(ji,jj) / fse3u(ji,jj,ikbu) , zm1_2dt  ) * ub(ji,jj,ikbu) 
    8181              va(ji,jj,ikbv) = va(ji,jj,ikbv) + MAX(  bfrva(ji,jj) / fse3v(ji,jj,ikbv) , zm1_2dt  ) * vb(ji,jj,ikbv) 
    82                
    83               ! (ISF) stability criteria for top friction 
    84               ikbu = miku(ji,jj)          ! first wet ocean u- & v-levels 
    85               ikbv = mikv(ji,jj) 
    86               ! 
    87               ! Apply stability criteria on absolute value  : abs(bfr/e3) < 1/(2dt) => bfr/e3 > -1/(2dt) 
    88               ua(ji,jj,ikbu) = ua(ji,jj,ikbu) + MAX(  tfrua(ji,jj) / fse3u(ji,jj,ikbu) , zm1_2dt  ) * ub(ji,jj,ikbu) & 
    89                  &             * (1.-umask(ji,jj,1)) 
    90               va(ji,jj,ikbv) = va(ji,jj,ikbv) + MAX(  tfrva(ji,jj) / fse3v(ji,jj,ikbv) , zm1_2dt  ) * vb(ji,jj,ikbv) & 
    91                  &             * (1.-vmask(ji,jj,1)) 
    92               ! (ISF) 
    93                
    9482           END DO 
    9583        END DO 
     84         
     85        IF ( ln_isfcav ) THEN 
     86           DO jj = 2, jpjm1 
     87              DO ji = 2, jpim1 
     88                 ! (ISF) stability criteria for top friction 
     89                 ikbu = miku(ji,jj)          ! first wet ocean u- & v-levels 
     90                 ikbv = mikv(ji,jj) 
     91                 ! 
     92                 ! Apply stability criteria on absolute value  : abs(bfr/e3) < 1/(2dt) => bfr/e3 > -1/(2dt) 
     93                 ua(ji,jj,ikbu) = ua(ji,jj,ikbu) + MAX(  tfrua(ji,jj) / fse3u(ji,jj,ikbu) , zm1_2dt  ) * ub(ji,jj,ikbu) & 
     94                    &             * (1.-umask(ji,jj,1)) 
     95                 va(ji,jj,ikbv) = va(ji,jj,ikbv) + MAX(  tfrva(ji,jj) / fse3v(ji,jj,ikbv) , zm1_2dt  ) * vb(ji,jj,ikbv) & 
     96                    &             * (1.-vmask(ji,jj,1)) 
     97                 ! (ISF) 
     98              END DO 
     99           END DO 
     100        END IF 
    96101 
    97102        ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynhpg.F90

    r4990 r5098  
    1616   !!            3.4  !  2011-11  (H. Liu) hpg_prj: Original code for s-coordinates 
    1717   !!                 !           (A. Coward) suppression of hel, wdj and rot options 
     18   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) hpg_isf: original code for ice shelf cavity 
    1819   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1920 
    … …  
    2526   !!       hpg_zps  : z-coordinate plus partial steps (interpolation) 
    2627   !!       hpg_sco  : s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     28   !!       hpg_isf  : s-coordinate (sco formulation) adapted to ice shelf 
    2729   !!       hpg_djc  : s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    2830   !!       hpg_prj  : s-coordinate (Pressure Jacobian with Cubic polynomial) 
    … …  
    5557   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_hpg_djc      !: s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    5658   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_hpg_prj      !: s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
     59   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_hpg_isf      !: s-coordinate similar to sco modify for isf 
    5760   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_dynhpg_imp   !: semi-implicite hpg flag 
    5861 
    … …  
    97100      CASE (  3 )   ;   CALL hpg_djc    ( kt )      ! s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    98101      CASE (  4 )   ;   CALL hpg_prj    ( kt )      ! s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
     102      CASE (  5 )   ;   CALL hpg_isf    ( kt )      ! s-coordinate similar to sco modify for ice shelf 
    99103      END SELECT 
    100104      ! 
    … …  
    128132      !! 
    129133      NAMELIST/namdyn_hpg/ ln_hpg_zco, ln_hpg_zps, ln_hpg_sco,     & 
    130          &                 ln_hpg_djc, ln_hpg_prj, ln_dynhpg_imp 
     134         &                 ln_hpg_djc, ln_hpg_prj, ln_hpg_isf, ln_dynhpg_imp 
    131135      !!---------------------------------------------------------------------- 
    132136      ! 
    … …  
    148152         WRITE(numout,*) '      z-coord. - partial steps (interpolation)          ln_hpg_zps    = ', ln_hpg_zps 
    149153         WRITE(numout,*) '      s-coord. (standard jacobian formulation)          ln_hpg_sco    = ', ln_hpg_sco 
     154         WRITE(numout,*) '      s-coord. (standard jacobian formulation) for isf  ln_hpg_isf    = ', ln_hpg_isf 
    150155         WRITE(numout,*) '      s-coord. (Density Jacobian: Cubic polynomial)     ln_hpg_djc    = ', ln_hpg_djc 
    151156         WRITE(numout,*) '      s-coord. (Pressure Jacobian: Cubic polynomial)    ln_hpg_prj    = ', ln_hpg_prj 
    … …  
    158163                           & either  ln_hpg_sco or  ln_hpg_prj instead') 
    159164      ! 
    160       IF( lk_vvl .AND. .NOT. (ln_hpg_sco.OR.ln_hpg_prj) )   & 
     165      IF( lk_vvl .AND. .NOT. (ln_hpg_sco.OR.ln_hpg_prj.OR.ln_hpg_isf) )   & 
    161166         &   CALL ctl_stop('dyn_hpg_init : variable volume key_vvl requires:& 
    162167                           & the standard jacobian formulation hpg_sco or & 
    … …  
    169174      IF( ln_hpg_djc )   nhpg = 3 
    170175      IF( ln_hpg_prj )   nhpg = 4 
     176      IF( ln_hpg_isf )   nhpg = 5 
    171177      ! 
    172178      !                               ! Consistency check 
    … …  
    177183      IF( ln_hpg_djc )   ioptio = ioptio + 1 
    178184      IF( ln_hpg_prj )   ioptio = ioptio + 1 
     185      IF( ln_hpg_isf )   ioptio = ioptio + 1 
    179186      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'NO or several hydrostatic pressure gradient options used' ) 
    180       IF( (ln_hpg_zco .OR. ln_hpg_zps .OR. ln_hpg_djc .OR. ln_hpg_prj ) .AND. nn_isf .NE. 0 )   & 
    181           &  CALL ctl_stop( 'Only hpg_sco has been corrected to work with ice shelf cavity.' ) 
     187      IF( ( .NOT. ln_hpg_isf ) .AND. ln_isfcav )   & 
     188          &  CALL ctl_stop( 'Only hpg_isf has been corrected to work with ice shelf cavity.' ) 
    182189      ! 
    183190   END SUBROUTINE dyn_hpg_init 
    … …  
    345352   END SUBROUTINE hpg_zps 
    346353 
    347  
    348354   SUBROUTINE hpg_sco( kt ) 
    349355      !!--------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    366372      INTEGER, INTENT(in) ::   kt    ! ocean time-step index 
    367373      !! 
     374      INTEGER  ::   ji, jj, jk                 ! dummy loop indices 
     375      REAL(wp) ::   zcoef0, zuap, zvap, znad   ! temporary scalars 
     376      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  zhpi, zhpj 
     377      !!---------------------------------------------------------------------- 
     378      ! 
     379      CALL wrk_alloc( jpi,jpj,jpk, zhpi, zhpj ) 
     380      ! 
     381      IF( kt == nit000 ) THEN 
     382         IF(lwp) WRITE(numout,*) 
     383         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dyn:hpg_sco : hydrostatic pressure gradient trend' 
     384         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~   s-coordinate case, OPA original scheme used' 
     385      ENDIF 
     386 
     387      ! Local constant initialization 
     388      zcoef0 = - grav * 0.5_wp 
     389      ! To use density and not density anomaly 
     390      IF ( lk_vvl ) THEN   ;     znad = 1._wp          ! Variable volume 
     391      ELSE                 ;     znad = 0._wp         ! Fixed volume 
     392      ENDIF 
     393 
     394      ! Surface value 
     395      DO jj = 2, jpjm1 
     396         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     397            ! hydrostatic pressure gradient along s-surfaces 
     398            zhpi(ji,jj,1) = zcoef0 / e1u(ji,jj) * ( fse3w(ji+1,jj  ,1) * ( znad + rhd(ji+1,jj  ,1) )   & 
     399               &                                  - fse3w(ji  ,jj  ,1) * ( znad + rhd(ji  ,jj  ,1) ) ) 
     400            zhpj(ji,jj,1) = zcoef0 / e2v(ji,jj) * ( fse3w(ji  ,jj+1,1) * ( znad + rhd(ji  ,jj+1,1) )   & 
     401               &                                  - fse3w(ji  ,jj  ,1) * ( znad + rhd(ji  ,jj  ,1) ) ) 
     402            ! s-coordinate pressure gradient correction 
     403            zuap = -zcoef0 * ( rhd   (ji+1,jj,1) + rhd   (ji,jj,1) + 2._wp * znad )   & 
     404               &           * ( fsde3w(ji+1,jj,1) - fsde3w(ji,jj,1) ) / e1u(ji,jj) 
     405            zvap = -zcoef0 * ( rhd   (ji,jj+1,1) + rhd   (ji,jj,1) + 2._wp * znad )   & 
     406               &           * ( fsde3w(ji,jj+1,1) - fsde3w(ji,jj,1) ) / e2v(ji,jj) 
     407            ! add to the general momentum trend 
     408            ua(ji,jj,1) = ua(ji,jj,1) + zhpi(ji,jj,1) + zuap 
     409            va(ji,jj,1) = va(ji,jj,1) + zhpj(ji,jj,1) + zvap 
     410         END DO 
     411      END DO 
     412 
     413      ! interior value (2=<jk=<jpkm1) 
     414      DO jk = 2, jpkm1 
     415         DO jj = 2, jpjm1 
     416            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     417               ! hydrostatic pressure gradient along s-surfaces 
     418               zhpi(ji,jj,jk) = zhpi(ji,jj,jk-1) + zcoef0 / e1u(ji,jj)   & 
     419                  &           * (  fse3w(ji+1,jj,jk) * ( rhd(ji+1,jj,jk) + rhd(ji+1,jj,jk-1) + 2*znad )   & 
     420                  &              - fse3w(ji  ,jj,jk) * ( rhd(ji  ,jj,jk) + rhd(ji  ,jj,jk-1) + 2*znad )  ) 
     421               zhpj(ji,jj,jk) = zhpj(ji,jj,jk-1) + zcoef0 / e2v(ji,jj)   & 
     422                  &           * (  fse3w(ji,jj+1,jk) * ( rhd(ji,jj+1,jk) + rhd(ji,jj+1,jk-1) + 2*znad )   & 
     423                  &              - fse3w(ji,jj  ,jk) * ( rhd(ji,jj,  jk) + rhd(ji,jj  ,jk-1) + 2*znad )  ) 
     424               ! s-coordinate pressure gradient correction 
     425               zuap = -zcoef0 * ( rhd   (ji+1,jj  ,jk) + rhd   (ji,jj,jk) + 2._wp * znad )   & 
     426                  &           * ( fsde3w(ji+1,jj  ,jk) - fsde3w(ji,jj,jk) ) / e1u(ji,jj) 
     427               zvap = -zcoef0 * ( rhd   (ji  ,jj+1,jk) + rhd   (ji,jj,jk) + 2._wp * znad )   & 
     428                  &           * ( fsde3w(ji  ,jj+1,jk) - fsde3w(ji,jj,jk) ) / e2v(ji,jj) 
     429               ! add to the general momentum trend 
     430               ua(ji,jj,jk) = ua(ji,jj,jk) + zhpi(ji,jj,jk) + zuap 
     431               va(ji,jj,jk) = va(ji,jj,jk) + zhpj(ji,jj,jk) + zvap 
     432            END DO 
     433         END DO 
     434      END DO 
     435      ! 
     436      CALL wrk_dealloc( jpi,jpj,jpk, zhpi, zhpj ) 
     437      ! 
     438   END SUBROUTINE hpg_sco 
     439 
     440   SUBROUTINE hpg_isf( kt ) 
     441      !!--------------------------------------------------------------------- 
     442      !!                  ***  ROUTINE hpg_sco  *** 
     443      !! 
     444      !! ** Method  :   s-coordinate case. Jacobian scheme. 
     445      !!      The now hydrostatic pressure gradient at a given level, jk, 
     446      !!      is computed by taking the vertical integral of the in-situ 
     447      !!      density gradient along the model level from the suface to that 
     448      !!      level. s-coordinates (ln_sco): a corrective term is added 
     449      !!      to the horizontal pressure gradient : 
     450      !!         zhpi = grav .....  + 1/e1u mi(rhd) di[ grav dep3w ] 
     451      !!         zhpj = grav .....  + 1/e2v mj(rhd) dj[ grav dep3w ] 
     452      !!      add it to the general momentum trend (ua,va). 
     453      !!         ua = ua - 1/e1u * zhpi 
     454      !!         va = va - 1/e2v * zhpj 
     455      !!      iceload is added and partial cell case are added to the top and bottom 
     456      !!       
     457      !! ** Action : - Update (ua,va) with the now hydrastatic pressure trend 
     458      !!---------------------------------------------------------------------- 
     459      INTEGER, INTENT(in) ::   kt    ! ocean time-step index 
     460      !! 
    368461      INTEGER  ::   ji, jj, jk, iku, ikv, ikt, iktp1i, iktp1j                 ! dummy loop indices 
    369462      REAL(wp) ::   zcoef0, zuap, zvap, znad, ze3wu, ze3wv, zuapint, zvapint, zhpjint, zhpiint, zdzwt, zdzwtjp1, zdzwtip1             ! temporary scalars 
    … …  
    379472     IF( kt == nit000 ) THEN 
    380473         IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    381          IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dyn:hpg_sco : hydrostatic pressure gradient trend' 
     474         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dyn:hpg_isf : hydrostatic pressure gradient trend for ice shelf' 
    382475         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~   s-coordinate case, OPA original scheme used' 
    383476      ENDIF 
    … …  
    565658!================================================================================== 
    566659 
    567 # if defined key_vectopt_loop 
    568          jj = 1 
    569          DO ji = jpi+2, jpij-jpi-1   ! vector opt. (forced unrolling) 
    570 # else 
    571660      DO jj = 2, jpjm1 
    572661         DO ji = 2, jpim1 
    573 # endif 
    574662            iku = mbku(ji,jj) 
    575663            ikv = mbkv(ji,jj) 
    … …  
    598686               va(ji,jj,ikv)   =  va(ji,jj,ikv) + zhpj(ji,jj,ikv) + zvap 
    599687            END IF 
    600 # if ! defined key_vectopt_loop 
    601          END DO 
    602 # endif 
     688         END DO 
    603689      END DO 
    604690      
    … …  
    610696      CALL wrk_dealloc( jpi,jpj, ze3w, zp, zrhdtop_isf, zrhdtop_oce, ziceload, zdept, zpshpi, zpshpj) 
    611697      ! 
    612    END SUBROUTINE hpg_sco 
     698   END SUBROUTINE hpg_isf 
    613699 
    614700 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynspg.F90

    r4990 r5098  
    250250      IF( ( ioptio > 1 .AND. .NOT. lk_esopa ) .OR. ( ioptio == 0 .AND. .NOT. lk_c1d ) )   & 
    251251           &   CALL ctl_stop( ' Choose only one surface pressure gradient scheme with a key cpp' ) 
    252       IF( ( lk_dynspg_ts .OR. lk_dynspg_exp ) .AND. nn_isf .NE. 0 )   & 
     252      IF( ( lk_dynspg_ts .OR. lk_dynspg_exp ) .AND. ln_isfcav )   & 
    253253           &   CALL ctl_stop( ' dynspg_ts and dynspg_exp not tested with ice shelf cavity ' ) 
    254254      ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynspg_ts.F90

    r5032 r5098  
    2222   USE dom_oce         ! ocean space and time domain 
    2323   USE sbc_oce         ! surface boundary condition: ocean 
     24   USE sbcisf          ! ice shelf variable (fwfisf) 
    2425   USE dynspg_oce      ! surface pressure gradient variables 
    2526   USE phycst          ! physical constants 
    … …  
    453454      !                                         ! Surface net water flux and rivers 
    454455      IF (ln_bt_fw) THEN 
    455          zssh_frc(:,:) = zraur * ( emp(:,:) - rnf(:,:) ) 
     456         zssh_frc(:,:) = zraur * ( emp(:,:) - rnf(:,:) + rdivisf * fwfisf(:,:) ) 
    456457      ELSE 
    457          zssh_frc(:,:) = zraur * z1_2 * (emp(:,:) + emp_b(:,:) - rnf(:,:) - rnf_b(:,:)) 
     458         zssh_frc(:,:) = zraur * z1_2 * (  emp(:,:) + emp_b(:,:) - rnf(:,:) - rnf_b(:,:)   & 
     459                &                        + rdivisf * ( fwfisf(:,:) + fwfisf_b(:,:) )       ) 
    458460      ENDIF 
    459461#if defined key_asminc 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynzad.F90

    r4990 r5098  
    9090         DO jj = 2, jpjm1                 ! vertical momentum advection at w-point 
    9191            DO ji = fs_2, fs_jpim1        ! vector opt. 
    92                zwuw(ji,jj,jk) = ( zww(ji+1,jj  ) + zww(ji,jj) ) * ( un(ji,jj,jk-1)-un(ji,jj,jk) ) 
    93                zwvw(ji,jj,jk) = ( zww(ji  ,jj+1) + zww(ji,jj) ) * ( vn(ji,jj,jk-1)-vn(ji,jj,jk) ) 
     92               zwuw(ji,jj,jk) = ( zww(ji+1,jj  ) + zww(ji,jj) ) * ( un(ji,jj,jk-1)-un(ji,jj,jk) ) !* wumask(ji,jj,jk) 
     93               zwvw(ji,jj,jk) = ( zww(ji  ,jj+1) + zww(ji,jj) ) * ( vn(ji,jj,jk-1)-vn(ji,jj,jk) ) !* wvmask(ji,jj,jk) 
    9494            END DO   
    9595         END DO    
    … …  
    228228            DO jj = 2, jpjm1                 ! vertical momentum advection at w-point 
    229229               DO ji = fs_2, fs_jpim1        ! vector opt. 
    230                   zwuw(ji,jj,jk) = ( zww(ji+1,jj  ,jk) + zww(ji,jj,jk) ) * ( zus(ji,jj,jk-1,jtn)-zus(ji,jj,jk,jtn) ) 
    231                   zwvw(ji,jj,jk) = ( zww(ji  ,jj+1,jk) + zww(ji,jj,jk) ) * ( zvs(ji,jj,jk-1,jtn)-zvs(ji,jj,jk,jtn) ) 
     230                  zwuw(ji,jj,jk) = ( zww(ji+1,jj  ,jk) + zww(ji,jj,jk) ) * ( zus(ji,jj,jk-1,jtn)-zus(ji,jj,jk,jtn) ) !* wumask(ji,jj,jk) 
     231                  zwvw(ji,jj,jk) = ( zww(ji  ,jj+1,jk) + zww(ji,jj,jk) ) * ( zvs(ji,jj,jk-1,jtn)-zvs(ji,jj,jk,jtn) ) !* wvmask(ji,jj,jk) 
    232232               END DO   
    233233            END DO    

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynzdf_imp.F90

    r4990 r5098  
    105105               avmu(ji,jj,ikbu+1) = -bfrua(ji,jj) * fse3uw(ji,jj,ikbu+1) 
    106106               avmv(ji,jj,ikbv+1) = -bfrva(ji,jj) * fse3vw(ji,jj,ikbv+1) 
    107                ikbu = miku(ji,jj)       ! ocean top level at u- and v-points  
    108                ikbv = mikv(ji,jj)       ! (first wet ocean u- and v-points) 
    109                IF (ikbu .GE. 2) avmu(ji,jj,ikbu) = -tfrua(ji,jj) * fse3uw(ji,jj,ikbu) 
    110                IF (ikbv .GE. 2) avmv(ji,jj,ikbv) = -tfrva(ji,jj) * fse3vw(ji,jj,ikbv) 
    111             END DO 
    112          END DO 
     107            END DO 
     108         END DO 
     109         IF ( ln_isfcav ) THEN 
     110            DO jj = 2, jpjm1 
     111               DO ji = 2, jpim1 
     112                  ikbu = miku(ji,jj)       ! ocean top level at u- and v-points  
     113                  ikbv = mikv(ji,jj)       ! (first wet ocean u- and v-points) 
     114                  IF (ikbu .GE. 2) avmu(ji,jj,ikbu) = -tfrua(ji,jj) * fse3uw(ji,jj,ikbu) 
     115                  IF (ikbv .GE. 2) avmv(ji,jj,ikbv) = -tfrva(ji,jj) * fse3vw(ji,jj,ikbv) 
     116               END DO 
     117            END DO 
     118         END IF 
    113119      ENDIF 
    114120 
    … …  
    168174               zcoef = - p2dt / ze3ua       
    169175               zzwi          = zcoef * avmu (ji,jj,jk  ) / fse3uw(ji,jj,jk  ) 
    170                zwi(ji,jj,jk) = zzwi  * umask(ji,jj,jk) 
     176               zwi(ji,jj,jk) = zzwi  * wumask(ji,jj,jk) 
    171177               zzws          = zcoef * avmu (ji,jj,jk+1) / fse3uw(ji,jj,jk+1)  
    172                zws(ji,jj,jk) = zzws  * umask(ji,jj,jk+1) 
    173                zwd(ji,jj,jk) = 1._wp - zwi(ji,jj,jk) - zzws 
     178               zws(ji,jj,jk) = zzws  * wumask(ji,jj,jk+1) 
     179               zwd(ji,jj,jk) = 1._wp - zzwi - zzws 
    174180            END DO 
    175181         END DO 
    … …  
    198204      ! 
    199205      !==  First recurrence : Dk = Dk - Lk * Uk-1 / Dk-1   (increasing k)  == 
    200       DO jj = 2, jpjm1    
    201          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    202             DO jk = miku(ji,jj)+1, jpkm1 
     206      DO jk = 2, jpkm1 
     207         DO jj = 2, jpjm1    
     208            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    203209               zwd(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwd(ji,jj,jk-1) 
    204210            END DO 
    … …  
    208214      DO jj = 2, jpjm1        !==  second recurrence:    SOLk = RHSk - Lk / Dk-1  Lk-1  == 
    209215         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    210             ze3ua =  ( 1._wp - r_vvl ) * fse3u_n(ji,jj,miku(ji,jj)) + r_vvl   * fse3u_a(ji,jj,miku(ji,jj))  
    211216#if defined key_dynspg_ts 
    212             ua(ji,jj,miku(ji,jj)) = ua(ji,jj,miku(ji,jj)) + p2dt * 0.5_wp * ( utau_b(ji,jj) + utau(ji,jj) )   & 
    213                &                                      / ( ze3ua * rau0 )  
     217            ze3ua =  ( 1._wp - r_vvl ) * fse3u_n(ji,jj,1) + r_vvl   * fse3u_a(ji,jj,1)  
     218            ua(ji,jj,1) = ua(ji,jj,1) + p2dt * 0.5_wp * ( utau_b(ji,jj) + utau(ji,jj) )   & 
     219               &                                      / ( ze3ua * rau0 ) * umask(ji,jj,1)  
    214220#else 
    215             ua(ji,jj,miku(ji,jj)) = ub(ji,jj,miku(ji,jj)) & 
    216                &                   + p2dt *(ua(ji,jj,miku(ji,jj)) +  0.5_wp * ( utau_b(ji,jj) + utau(ji,jj) )   & 
    217                &                                  / ( fse3u(ji,jj,miku(ji,jj)) * rau0     ) )  
    218 #endif 
    219             DO jk = miku(ji,jj)+1, jpkm1 
     221            ua(ji,jj,1) = ub(ji,jj,1) & 
     222               &                   + p2dt *(ua(ji,jj,1) +  0.5_wp * ( utau_b(ji,jj) + utau(ji,jj) )   & 
     223               &                                      / ( fse3u(ji,jj,1) * rau0     ) * umask(ji,jj,1) )  
     224#endif 
     225         END DO 
     226      END DO 
     227      DO jk = 2, jpkm1 
     228         DO jj = 2, jpjm1 
     229            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    220230#if defined key_dynspg_ts 
    221231               zrhs = ua(ji,jj,jk)   ! zrhs=right hand side 
    … …  
    231241         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    232242            ua(ji,jj,jpkm1) = ua(ji,jj,jpkm1) / zwd(ji,jj,jpkm1) 
    233             DO jk = jpk-2, miku(ji,jj), -1 
     243         END DO 
     244      END DO 
     245      DO jk = jpk-2, 1, -1 
     246         DO jj = 2, jpjm1 
     247            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    234248               ua(ji,jj,jk) = ( ua(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk) * ua(ji,jj,jk+1) ) / zwd(ji,jj,jk) 
    235249            END DO 
    … …  
    260274               zcoef = - p2dt / ze3va 
    261275               zzwi          = zcoef * avmv (ji,jj,jk  ) / fse3vw(ji,jj,jk  ) 
    262                zwi(ji,jj,jk) =  zzwi * vmask(ji,jj,jk) 
     276               zwi(ji,jj,jk) =  zzwi * wvmask(ji,jj,jk) 
    263277               zzws          = zcoef * avmv (ji,jj,jk+1) / fse3vw(ji,jj,jk+1) 
    264                zws(ji,jj,jk) =  zzws * vmask(ji,jj,jk+1) 
    265                zwd(ji,jj,jk) = 1._wp - zwi(ji,jj,jk) - zzws 
     278               zws(ji,jj,jk) =  zzws * wvmask(ji,jj,jk+1) 
     279               zwd(ji,jj,jk) = 1._wp - zzwi - zzws 
    266280            END DO 
    267281         END DO 
    … …  
    290304      ! 
    291305      !==  First recurrence : Dk = Dk - Lk * Uk-1 / Dk-1   (increasing k)  == 
    292       DO jj = 2, jpjm1    
    293          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    294             DO jk = mikv(ji,jj)+1, jpkm1         
     306      DO jk = 2, jpkm1         
     307         DO jj = 2, jpjm1    
     308            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    295309               zwd(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwd(ji,jj,jk-1) 
    296310            END DO 
    … …  
    300314      DO jj = 2, jpjm1        !==  second recurrence:    SOLk = RHSk - Lk / Dk-1  Lk-1  == 
    301315         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    302             ze3va =  ( 1._wp - r_vvl ) * fse3v_n(ji,jj,mikv(ji,jj)) + r_vvl   * fse3v_a(ji,jj,mikv(ji,jj))  
    303316#if defined key_dynspg_ts             
    304             va(ji,jj,mikv(ji,jj)) = va(ji,jj,mikv(ji,jj)) + p2dt * 0.5_wp * ( vtau_b(ji,jj) + vtau(ji,jj) )   & 
     317            ze3va =  ( 1._wp - r_vvl ) * fse3v_n(ji,jj,1) + r_vvl   * fse3v_a(ji,jj,1)  
     318            va(ji,jj,1) = va(ji,jj,1) + p2dt * 0.5_wp * ( vtau_b(ji,jj) + vtau(ji,jj) )   & 
    305319               &                                      / ( ze3va * rau0 )  
    306320#else 
    307             va(ji,jj,mikv(ji,jj)) = vb(ji,jj,mikv(ji,jj)) & 
    308                &                   + p2dt *(va(ji,jj,mikv(ji,jj)) +  0.5_wp * ( vtau_b(ji,jj) + vtau(ji,jj) )   & 
    309                &                                                       / ( fse3v(ji,jj,mikv(ji,jj)) * rau0     )  ) 
    310 #endif 
    311             DO jk = mikv(ji,jj)+1, jpkm1 
     321            va(ji,jj,1) = vb(ji,jj,1) & 
     322               &                   + p2dt *(va(ji,jj,1) +  0.5_wp * ( vtau_b(ji,jj) + vtau(ji,jj) )   & 
     323               &                                                       / ( fse3v(ji,jj,1) * rau0     )  ) 
     324#endif 
     325         END DO 
     326      END DO 
     327      DO jk = 2, jpkm1 
     328         DO jj = 2, jpjm1 
     329            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    312330#if defined key_dynspg_ts 
    313331               zrhs = va(ji,jj,jk)   ! zrhs=right hand side 
    … …  
    323341         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    324342            va(ji,jj,jpkm1) = va(ji,jj,jpkm1) / zwd(ji,jj,jpkm1) 
    325             DO jk = jpk-2, mikv(ji,jj), -1 
     343         END DO 
     344      END DO 
     345      DO jk = jpk-2, 1, -1 
     346         DO jj = 2, jpjm1 
     347            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    326348               va(ji,jj,jk) = ( va(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk) * va(ji,jj,jk+1) ) / zwd(ji,jj,jk) 
    327349            END DO 
    … …  
    349371              avmu(ji,jj,ikbu+1) = 0.e0 
    350372              avmv(ji,jj,ikbv+1) = 0.e0 
    351               ikbu = miku(ji,jj)         ! ocean top level at u- and v-points  
    352               ikbv = mikv(ji,jj)         ! (first wet ocean u- and v-points) 
    353               IF (ikbu > 1) avmu(ji,jj,ikbu) = 0.e0 
    354               IF (ikbv > 1) avmv(ji,jj,ikbv) = 0.e0 
    355373           END DO 
    356374        END DO 
     375        IF (ln_isfcav) THEN 
     376           DO jj = 2, jpjm1 
     377              DO ji = 2, jpim1 
     378                 ikbu = miku(ji,jj)         ! ocean top level at u- and v-points  
     379                 ikbv = mikv(ji,jj)         ! (first wet ocean u- and v-points) 
     380                 IF (ikbu > 1) avmu(ji,jj,ikbu) = 0.e0 
     381                 IF (ikbv > 1) avmv(ji,jj,ikbv) = 0.e0 
     382              END DO 
     383           END DO 
     384        END IF 
    357385      ENDIF 
    358386      ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/LDF/ldfslp.F90

    r5016 r5098  
    143143               DO ji = 1, jpim1 
    144144! IF should be useless check zpshde (PM) 
    145                IF ( mbku(ji,jj) > 1 ) zgru(ji,jj,mbku(ji,jj)) = gru(ji,jj) 
    146                IF ( mbkv(ji,jj) > 1 ) zgrv(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = grv(ji,jj) 
     145                  zgru(ji,jj,mbku(ji,jj)) = gru(ji,jj) 
     146                  zgrv(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = grv(ji,jj) 
     147               END DO 
     148            END DO 
     149         ENDIF 
     150         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav ) THEN           ! partial steps correction at the bottom ocean level 
     151            DO jj = 1, jpjm1 
     152               DO ji = 1, jpim1 
    147153               IF ( miku(ji,jj) > 1 ) zgru(ji,jj,miku(ji,jj)) = grui(ji,jj)  
    148154               IF ( mikv(ji,jj) > 1 ) zgrv(ji,jj,mikv(ji,jj)) = grvi(ji,jj) 
    … …  
    151157         ENDIF 
    152158         ! 
    153          zdzr(:,:,1) = 0._wp        !==   Local vertical density gradient at T-point   == !   (evaluated from N^2) 
    154          DO jk = 1, jpkm1 
     159         !==   Local vertical density gradient at T-point   == !   (evaluated from N^2) 
     160         ! surface initialisation  
     161         zdzr(:,:,1) = 0._wp  
     162         ! interior value 
     163         DO jk = 2, jpkm1 
    155164            !                                ! zdzr = d/dz(prd)= - ( prd ) / grav * mk(pn2) -- at t point 
    156165            !                                !   trick: tmask(ik  )  = 0   =>   all pn2   = 0   =>   zdzr = 0 
    … …  
    161170               &                 * ( pn2(:,:,jk) + pn2(:,:,jk+1) ) * ( 1._wp - 0.5_wp * tmask(:,:,jk+1) ) 
    162171         END DO 
    163          ! surface initialisation  
    164          DO jj = 1, jpjm1 
    165             DO ji = 1, jpim1 
    166               zdzr(ji,jj,1:mikt(ji,jj)) = 0._wp 
    167             END DO 
    168          END DO 
     172         IF ( ln_isfcav ) THEN 
     173         ! if isf need to overwrite the interior value at at the first ocean point 
     174            DO jj = 1, jpjm1 
     175               DO ji = 1, jpim1 
     176                  zdzr(ji,jj,1:mikt(ji,jj)) = 0._wp 
     177               END DO 
     178            END DO 
     179         END IF 
    169180         ! 
    170181         !                          !==   Slopes just below the mixed layer   ==! 
    … …  
    210221                     &                 + zfi  * uslpml(ji,jj)                                                     & 
    211222                     &                        * zdepu / MAX( zhmlpu(ji,jj), 5._wp ) 
    212                   zwz(ji,jj,jk) = zwz(ji,jj,jk) * umask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj,jk-1) 
     223                  zwz(ji,jj,jk) = zwz(ji,jj,jk) * wumask(ji,jj,jk) 
    213224                  zww(ji,jj,jk) = ( 1. - zfj) * zav / ( zbv - zeps )                                              & 
    214225                     &                 + zfj  * vslpml(ji,jj)                                                     & 
    215226                     &                        * zdepv / MAX( zhmlpv(ji,jj), 5._wp )  
    216                   zww(ji,jj,jk) = zww(ji,jj,jk) * vmask(ji,jj,jk) * vmask(ji,jj,jk-1) 
     227                  zww(ji,jj,jk) = zww(ji,jj,jk) * wvmask(ji,jj,jk) 
    217228                   
    218229                  
    … …  
    301312                  zck = ( fsdepw(ji,jj,jk) - fsdepw(ji,jj,mikt(ji,jj) ) ) / MAX( hmlp(ji,jj), 10._wp ) 
    302313                  zwz(ji,jj,jk) = (  zai / ( zbi - zeps ) * ( 1._wp - zfk ) & 
    303                      &            + zck * wslpiml(ji,jj) * zfk  ) * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) 
     314                     &            + zck * wslpiml(ji,jj) * zfk  ) * wmask(ji,jj,jk) 
    304315                  zww(ji,jj,jk) = (  zaj / ( zbj - zeps ) * ( 1._wp - zfk ) & 
    305                      &            + zck * wslpjml(ji,jj) * zfk  ) * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) 
     316                     &            + zck * wslpjml(ji,jj) * zfk  ) * wmask(ji,jj,jk) 
    306317 
    307318!!gm  modif to suppress omlmask....  (as in Griffies operator) 
    … …  
    356367                  zck =   ( umask(ji,jj,jk) + umask(ji-1,jj,jk) )   & 
    357368                     &  * ( vmask(ji,jj,jk) + vmask(ji,jj-1,jk) ) * 0.25 
    358                   wslpi(ji,jj,jk) = wslpi(ji,jj,jk) * zck * tmask(ji,jj,jk-1) * tmask(ji,jj,jk) 
    359                   wslpj(ji,jj,jk) = wslpj(ji,jj,jk) * zck * tmask(ji,jj,jk-1) * tmask(ji,jj,jk) 
     369                  wslpi(ji,jj,jk) = wslpi(ji,jj,jk) * zck * wmask(ji,jj,jk) 
     370                  wslpj(ji,jj,jk) = wslpj(ji,jj,jk) * zck * wmask(ji,jj,jk) 
    360371               END DO 
    361372            END DO 
    … …  
    423434                  vslp(ji,jj,jk) = -1./e2v(ji,jj) * ( fsdept_b(ji,jj+1,jk) - fsdept_b(ji ,jj ,jk) ) * vmask(ji,jj,jk)  
    424435                  wslpi(ji,jj,jk) = -1./e1t(ji,jj) * ( fsdepw_b(ji+1,jj,jk) - fsdepw_b(ji-1,jj,jk) ) & 
    425                     &                              * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) * 0.5  
     436                    &                              * wmask(ji,jj,jk) * 0.5  
    426437                  wslpj(ji,jj,jk) = -1./e2t(ji,jj) * ( fsdepw_b(ji,jj+1,jk) - fsdepw_b(ji,jj-1,jk) ) & 
    427                     &                              * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) * 0.5  
     438                    &                              * wmask(ji,jj,jk) * 0.5  
    428439               END DO  
    429440            END DO  
    … …  
    794805            zbj = MIN(  zbw , -100._wp* ABS( zaj ) , -7.e+3_wp/fse3w(ji,jj,ik)* ABS( zaj )  ) 
    795806            !                        !- i- & j-slope at w-points (wslpiml, wslpjml) 
    796             wslpiml(ji,jj) = zai / ( zbi - zeps ) * tmask (ji,jj,ik) 
    797             wslpjml(ji,jj) = zaj / ( zbj - zeps ) * tmask (ji,jj,ik) 
     807            wslpiml(ji,jj) = zai / ( zbi - zeps ) * wmask (ji,jj,ik) 
     808            wslpjml(ji,jj) = zaj / ( zbj - zeps ) * wmask (ji,jj,ik) 
    798809         END DO 
    799810      END DO 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbc_oce.F90

    r4990 r5098  
    9898   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   emp_tot           !: total E-P over ocean and ice                 [Kg/m2/s] 
    9999   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   fmmflx            !: freshwater budget: freezing/melting          [Kg/m2/s] 
    100    REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   rnf    , rnf_b    !: river runoff   [Kg/m2/s]   
     100   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   rnf    , rnf_b    !: river runoff        [Kg/m2/s]   
     101   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   fwfisf , fwfisf_b !: ice shelf melting   [Kg/m2/s]   
    101102   !! 
    102103   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::  sbc_tsc, sbc_tsc_b  !: sbc content trend                      [K.m/s] jpi,jpj,jpts 
    … …  
    147148         &      sfx    (jpi,jpj) , sfx_b(jpi,jpj) , emp_tot(jpi,jpj), fmmflx(jpi,jpj), STAT=ierr(2) ) 
    148149         ! 
    149       ALLOCATE( rnf  (jpi,jpj) , sbc_tsc  (jpi,jpj,jpts) , qsr_hc  (jpi,jpj,jpk) ,     & 
    150          &      rnf_b(jpi,jpj) , sbc_tsc_b(jpi,jpj,jpts) , qsr_hc_b(jpi,jpj,jpk) , STAT=ierr(3) ) 
     150      ALLOCATE( fwfisf  (jpi,jpj), rnf  (jpi,jpj) , sbc_tsc  (jpi,jpj,jpts) , qsr_hc  (jpi,jpj,jpk) ,     & 
     151         &      fwfisf_b(jpi,jpj), rnf_b(jpi,jpj) , sbc_tsc_b(jpi,jpj,jpts) , qsr_hc_b(jpi,jpj,jpk) , STAT=ierr(3) ) 
    151152         ! 
    152153      ALLOCATE( tprecip(jpi,jpj) , sprecip(jpi,jpj) , fr_i(jpi,jpj) ,     & 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbcfwb.F90

    r4990 r5098  
    88   !!            3.0  ! 2006-08  (G. Madec)  Surface module 
    99   !!            3.2  ! 2009-07  (C. Talandier) emp mean s spread over erp area  
     10   !!            3.6  ! 2014-11  (P. Mathiot  ) add ice shelf melting 
    1011   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1112 
    … …  
    158159            zsurf_pos = glob_sum( e1e2t(:,:)*ztmsk_pos(:,:) ) 
    159160            !                                                  ! fwf global mean (excluding ocean to ice/snow exchanges)  
    160             z_fwf     = glob_sum( e1e2t(:,:) * ( emp(:,:) - rnf(:,:) - snwice_fmass(:,:) ) ) / area 
     161            z_fwf     = glob_sum( e1e2t(:,:) * ( emp(:,:) - rnf(:,:) + rdivisf * fwfisf(:,:) - snwice_fmass(:,:) ) ) / area 
    161162            !             
    162163            IF( z_fwf < 0._wp ) THEN         ! spread out over >0 erp area to increase evaporation 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbcisf.F90

    r4990 r5098  
    77   !! History :  3.2   !  2011-02  (C.Harris  ) Original code isf cav 
    88   !!            X.X   !  2006-02  (C. Wang   ) Original code bg03 
    9    !!            3.4   !  2013-03  (P. Mathiot) Merging 
     9   !!            3.4   !  2013-03  (P. Mathiot) Merging + parametrization 
    1010   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1111 
    … …  
    3737 
    3838   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   risf_tsc_b, risf_tsc    
    39    REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   fwfisf_b, fwfisf  !: evaporation damping   [kg/m2/s] 
    40    REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   qisf            !: net heat flux from ice shelf 
     39   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   qisf              !: net heat flux from ice shelf 
    4140   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_hisf_tbl                 !: thickness of top boundary layer [m] 
    4241   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_divisf                   !: flag to correct divergence  
    … …  
    309308      sbc_isf_alloc = 0       ! set to zero if no array to be allocated 
    310309      IF( .NOT. ALLOCATED( qisf ) ) THEN 
    311          ALLOCATE(  risf_tsc(jpi,jpj,jpts), risf_tsc_b(jpi,jpj,jpts)              , & 
    312                &    qisf(jpi,jpj)     , fwfisf(jpi,jpj)     , fwfisf_b(jpi,jpj)   , & 
    313                &    rhisf_tbl(jpi,jpj), r1_hisf_tbl(jpi,jpj), rzisf_tbl(jpi,jpj)  , & 
    314                &    ttbl(jpi,jpj)     , stbl(jpi,jpj)       , utbl(jpi,jpj)       , & 
    315                &    vtbl(jpi, jpj)    , risfLeff(jpi,jpj)   , rhisf_tbl_0(jpi,jpj), & 
    316                &    ralpha(jpi,jpj)   , misfkt(jpi,jpj)     , misfkb(jpi,jpj)     , & 
     310         ALLOCATE(  risf_tsc(jpi,jpj,jpts), risf_tsc_b(jpi,jpj,jpts), qisf(jpi,jpj)   , & 
     311               &    rhisf_tbl(jpi,jpj)    , r1_hisf_tbl(jpi,jpj), rzisf_tbl(jpi,jpj)  , & 
     312               &    ttbl(jpi,jpj)         , stbl(jpi,jpj)       , utbl(jpi,jpj)       , & 
     313               &    vtbl(jpi, jpj)        , risfLeff(jpi,jpj)   , rhisf_tbl_0(jpi,jpj), & 
     314               &    ralpha(jpi,jpj)       , misfkt(jpi,jpj)     , misfkb(jpi,jpj)     , & 
    317315               &    STAT= sbc_isf_alloc ) 
    318316         ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbcmod.F90

    r4990 r5098  
    1313   !!            3.4  ! 2011-11  (C. Harris) CICE added as an option 
    1414   !!            3.5  ! 2012-11  (A. Coward, G. Madec) Rethink of heat, mass and salt surface fluxes 
     15   !!            3.6  ! 2014-11  (P. Mathiot, C. Harris) add ice shelves melting                     
    1516   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1617 
    … …  
    179180         IF( sbc_isf_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'sbc_init : unable to allocate sbc_isf arrays' ) 
    180181         fwfisf  (:,:) = 0.0_wp 
     182         fwfisf_b(:,:) = 0.0_wp 
    181183      END IF 
    182184      IF( nn_ice == 0  )   fr_i(:,:) = 0.e0        ! no ice in the domain, ice fraction is always zero 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_tvd.F90

    r4990 r5098  
    106106      ENDIF 
    107107      ! 
    108       zwi(:,:,:) = 0.e0 ; zwz(:,:,:) = 0.e0 
     108      zwi(:,:,:) = 0.e0 ;  
    109109      ! 
    110110      !                                                          ! =========== 
    111111      DO jn = 1, kjpt                                            ! tracer loop 
    112112         !                                                       ! =========== 
    113          ! 1. Bottom value : flux set to zero 
     113         ! 1. Bottom and k=1 value : flux set to zero 
    114114         ! ---------------------------------- 
    115115         zwx(:,:,jpk) = 0.e0    ;    zwz(:,:,jpk) = 0.e0 
    116116         zwy(:,:,jpk) = 0.e0    ;    zwi(:,:,jpk) = 0.e0 
    117  
     117           
     118         zwz(:,:,1  ) = 0._wp 
    118119         ! 2. upstream advection with initial mass fluxes & intermediate update 
    119120         ! -------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    134135 
    135136         ! upstream tracer flux in the k direction 
     137         ! Interior value 
     138         DO jk = 2, jpkm1 
     139            DO jj = 1, jpj 
     140               DO ji = 1, jpi 
     141                  zfp_wk = pwn(ji,jj,jk) + ABS( pwn(ji,jj,jk) ) 
     142                  zfm_wk = pwn(ji,jj,jk) - ABS( pwn(ji,jj,jk) ) 
     143                  zwz(ji,jj,jk) = 0.5 * ( zfp_wk * ptb(ji,jj,jk,jn) + zfm_wk * ptb(ji,jj,jk-1,jn) ) * wmask(ji,jj,jk) 
     144               END DO 
     145            END DO 
     146         END DO 
    136147         ! Surface value 
    137148         IF( lk_vvl ) THEN    
    138149            DO jj = 1, jpj 
    139150               DO ji = 1, jpi 
    140                   zwz(ji,jj, mikt(ji,jj) ) = 0.e0                         ! volume variable 
     151                  zwz(ji,jj, mikt(ji,jj) ) = 0.e0          ! volume variable 
    141152               END DO 
    142153            END DO 
    … …  
    148159            END DO    
    149160         ENDIF 
    150          ! Interior value 
    151          DO jj = 1, jpj 
    152             DO ji = 1, jpi 
    153                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
    154                   zfp_wk = pwn(ji,jj,jk) + ABS( pwn(ji,jj,jk) ) 
    155                   zfm_wk = pwn(ji,jj,jk) - ABS( pwn(ji,jj,jk) ) 
    156                   zwz(ji,jj,jk) = 0.5 * ( zfp_wk * ptb(ji,jj,jk,jn) + zfm_wk * ptb(ji,jj,jk-1,jn) ) 
    157                END DO 
    158             END DO 
    159          END DO 
    160161 
    161162         ! total advective trend 
    … …  
    202203       
    203204         ! antidiffusive flux on k 
    204          zwz(:,:,1) = 0.e0         ! Surface value 
    205          ! 
     205         ! Interior value 
     206         DO jk = 2, jpkm1                     
     207            DO jj = 1, jpj 
     208               DO ji = 1, jpi 
     209                  zwz(ji,jj,jk) = 0.5 * pwn(ji,jj,jk) * ( ptn(ji,jj,jk,jn) + ptn(ji,jj,jk-1,jn) ) - zwz(ji,jj,jk) 
     210               END DO 
     211            END DO 
     212         END DO 
     213         ! surface value 
    206214         DO jj = 1, jpj 
    207215            DO ji = 1, jpi 
    208                ik=mikt(ji,jj) 
    209                ! surface value 
    210                zwz(ji,jj,1:ik) = 0.e0 
    211                ! Interior value 
    212                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1                     
    213                   zwz(ji,jj,jk) = 0.5 * pwn(ji,jj,jk) * ( ptn(ji,jj,jk,jn) + ptn(ji,jj,jk-1,jn) ) - zwz(ji,jj,jk) 
    214                END DO 
     216               zwz(ji,jj,mikt(ji,jj)) = 0.e0 
    215217            END DO 
    216218         END DO 
    … …  
    580582         &        paft * tmask + zbig * ( 1._wp - tmask )  ) 
    581583 
    582       DO jj = 2, jpjm1 
    583          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    584             DO jk = mikt(ji,jj), jpkm1 
    585                ikm1 = MAX(jk-1,mikt(ji,jj)) 
     584      DO jk = 1, jpkm1 
     585         DO jj = 2, jpjm1 
     586            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     587               ikm1 = MAX(jk-1,1) 
    586588               z2dtt = p2dt(jk) 
    587589                

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_bilap.F90

    r4990 r5098  
    116116               END DO 
    117117            END DO 
    118  
    119118            !                          !==  Laplacian  ==! 
    120119            ! 
    … …  
    125124               END DO 
    126125            END DO 
     126            ! 
    127127            IF( ln_zps ) THEN                ! set gradient at partial step level (last ocean level) 
    128128               DO jj = 1, jpjm1 
    … …  
    130130                     IF( mbku(ji,jj) == jk )  ztu(ji,jj,jk) = zeeu(ji,jj) * pgu(ji,jj,jn) 
    131131                     IF( mbkv(ji,jj) == jk )  ztv(ji,jj,jk) = zeev(ji,jj) * pgv(ji,jj,jn) 
    132                      ! (ISH) 
    133                      IF( miku(ji,jj) == jk )  ztu(ji,jj,jk) = zeeu(ji,jj) * pgui(ji,jj,jn) 
    134                      IF( mikv(ji,jj) == jk )  ztu(ji,jj,jk) = zeev(ji,jj) * pgvi(ji,jj,jn) 
    135132                  END DO 
    136133               END DO 
    137134            ENDIF 
     135            ! (ISH) 
     136            IF( ln_zps .AND. ln_isfcav ) THEN ! set gradient at partial step level (first ocean level in a cavity) 
     137               DO jj = 1, jpjm1 
     138                  DO ji = 1, jpim1 
     139                     IF( miku(ji,jj) == MAX(jk,2) )  ztu(ji,jj,jk) = zeeu(ji,jj) * pgui(ji,jj,jn) 
     140                     IF( mikv(ji,jj) == MAX(jk,2) )  ztu(ji,jj,jk) = zeev(ji,jj) * pgvi(ji,jj,jn) 
     141                  END DO 
     142               END DO 
     143            ENDIF 
     144            ! 
    138145            DO jj = 2, jpjm1                 ! Second derivative (divergence) time the eddy diffusivity coefficient 
    139146               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_iso.F90

    r4990 r5098  
    106106      ! 
    107107      INTEGER  ::  ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices 
     108      INTEGER  ::  ikt 
    108109      REAL(wp) ::  zmsku, zabe1, zcof1, zcoef3   ! local scalars 
    109110      REAL(wp) ::  zmskv, zabe2, zcof2, zcoef4   !   -      - 
    … …  
    149150            END DO 
    150151         END DO 
     152 
     153         ! partial cell correction 
    151154         IF( ln_zps ) THEN      ! partial steps correction at the last ocean level  
    152155            DO jj = 1, jpjm1 
    153156               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    154157! IF useless if zpshde defines pgu everywhere 
    155                   IF (mbku(ji,jj) > 1) zdit(ji,jj,mbku(ji,jj)) = pgu(ji,jj,jn)           
    156                   IF (mbkv(ji,jj) > 1) zdjt(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = pgv(ji,jj,jn) 
    157                   ! (ISF) 
     158                  zdit(ji,jj,mbku(ji,jj)) = pgu(ji,jj,jn)           
     159                  zdjt(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = pgv(ji,jj,jn) 
     160               END DO 
     161            END DO 
     162         ENDIF 
     163         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav ) THEN      ! partial steps correction at the first wet level beneath a cavity 
     164            DO jj = 1, jpjm1 
     165               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    158166                  IF (miku(ji,jj) > 1) zdit(ji,jj,miku(ji,jj)) = pgui(ji,jj,jn)           
    159167                  IF (mikv(ji,jj) > 1) zdjt(ji,jj,mikv(ji,jj)) = pgvi(ji,jj,jn)      
    160168               END DO 
    161169            END DO 
    162          ENDIF 
     170         END IF 
    163171 
    164172         !!---------------------------------------------------------------------- 
    165173         !!   II - horizontal trend  (full) 
    166174         !!---------------------------------------------------------------------- 
    167 !CDIR PARALLEL DO PRIVATE( zdk1t )  
    168          !                                                ! =============== 
    169          DO jj = 1, jpj                                 ! Horizontal slab 
    170             !                                             ! =============== 
    171             DO ji = 1, jpi   ! vector opt. 
    172                DO jk = mikt(ji,jj), jpkm1 
    173                ! 1. Vertical tracer gradient at level jk and jk+1 
    174                ! ------------------------------------------------ 
    175                ! surface boundary condition: zdkt(jk=1)=zdkt(jk=2) 
    176                   zdk1t(ji,jj,jk) = ( ptb(ji,jj,jk,jn) - ptb(ji,jj,jk+1,jn) ) * tmask(ji,jj,jk+1) 
    177                ! 
    178                   IF( jk == mikt(ji,jj) ) THEN  ;   zdkt(ji,jj,jk) = zdk1t(ji,jj,jk) 
    179                   ELSE                          ;   zdkt(ji,jj,jk) = ( ptb(ji,jj,jk-1,jn) - ptb(ji,jj,jk,jn) ) * tmask(ji,jj,jk) 
    180                   ENDIF 
     175!!!!!!!!!!CDIR PARALLEL DO PRIVATE( zdk1t )  
     176            ! 1. Vertical tracer gradient at level jk and jk+1 
     177            ! ------------------------------------------------ 
     178         !  
     179         ! interior value  
     180         DO jk = 2, jpkm1                
     181            DO jj = 1, jpj 
     182               DO ji = 1, jpi   ! vector opt. 
     183                  zdk1t(ji,jj,jk) = ( ptb(ji,jj,jk,jn  ) - ptb(ji,jj,jk+1,jn) ) * wmask(ji,jj,jk+1) 
     184                  ! 
     185                  zdkt(ji,jj,jk)  = ( ptb(ji,jj,jk-1,jn) - ptb(ji,jj,jk,jn  ) ) * wmask(ji,jj,jk) 
    181186               END DO 
    182187            END DO 
    183188         END DO 
     189            ! surface boundary condition: zdkt(jk=1)=zdkt(jk=2) 
     190         zdk1t(:,:,1) = ( ptb(:,:,1,jn  ) - ptb(:,:,2,jn) ) * wmask(:,:,2) 
     191         zdkt (:,:,1) = zdk1t(:,:,1) 
     192         IF ( ln_isfcav ) THEN 
     193            DO jj = 1, jpj 
     194               DO ji = 1, jpi   ! vector opt. 
     195                  ikt = mikt(ji,jj) ! surface level 
     196                  zdk1t(ji,jj,ikt) = ( ptb(ji,jj,ikt,jn  ) - ptb(ji,jj,ikt+1,jn) ) * wmask(ji,jj,ikt+1) 
     197                  zdkt (ji,jj,ikt) = zdk1t(ji,jj,ikt) 
     198               END DO 
     199            END DO 
     200         END IF 
    184201 
    185202            ! 2. Horizontal fluxes 
    186203            ! --------------------    
    187          DO jj = 1 , jpjm1 
    188             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    189                DO jk = mikt(ji,jj), jpkm1 
     204         DO jk = 1, jpkm1 
     205            DO jj = 1 , jpjm1 
     206               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    190207                  zabe1 = ( fsahtu(ji,jj,jk) + pahtb0 ) * re2u_e1u(ji,jj) * fse3u_n(ji,jj,jk) 
    191208                  zabe2 = ( fsahtv(ji,jj,jk) + pahtb0 ) * re1v_e2v(ji,jj) * fse3v_n(ji,jj,jk) 
    … …  
    208225               END DO 
    209226            END DO 
    210          END DO 
    211227 
    212228            ! II.4 Second derivative (divergence) and add to the general trend 
    213229            ! ---------------------------------------------------------------- 
    214          DO jj = 2 , jpjm1 
    215             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    216                DO jk = mikt(ji,jj), jpkm1 
    217                   zbtr = 1.0 / ( e1t(ji,jj) * e2t(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) ) 
     230            DO jj = 2 , jpjm1 
     231               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     232                  zbtr = 1.0 / ( e12t(ji,jj) * fse3t_n(ji,jj,jk) ) 
    218233                  ztra = zbtr * ( zftu(ji,jj,jk) - zftu(ji-1,jj,jk) + zftv(ji,jj,jk) - zftv(ji,jj-1,jk)  ) 
    219234                  pta(ji,jj,jk,jn) = pta(ji,jj,jk,jn) + ztra 
    … …  
    278293            DO jj = 2, jpjm1 
    279294               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    280                   zcoef0 = - fsahtw(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) 
     295                  zcoef0 = - fsahtw(ji,jj,jk) * wmask(ji,jj,jk) 
    281296                  ! 
    282297                  zmsku = 1./MAX(   umask(ji  ,jj,jk-1) + umask(ji-1,jj,jk)      & 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_lap.F90

    r4990 r5098  
    102102               END DO 
    103103            END DO 
    104             IF( ln_zps ) THEN      ! set gradient at partial step level 
     104            IF( ln_zps ) THEN      ! set gradient at partial step level for the last ocean cell 
    105105               DO jj = 1, jpjm1 
    106106                  DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    … …  
    116116                        ztv(ji,jj,jk) = zabe2 * pgv(ji,jj,jn) 
    117117                     ENDIF 
    118                       
    119                      ! (ISH) 
     118                  END DO 
     119               END DO 
     120            ENDIF 
     121            ! (ISH) 
     122            IF( ln_zps .AND. ln_isfcav ) THEN      ! set gradient at partial step level for the first ocean cell 
     123                                                   ! into a cavity 
     124               DO jj = 1, jpjm1 
     125                  DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    120126                     ! ice shelf level level MAX(2,jk) => only where ice shelf 
    121127                     iku = miku(ji,jj)  

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/trasbc.F90

    r4990 r5098  
    99   !!            3.3  !  2010-04  (M. Leclair, G. Madec)  Forcing averaged over 2 time steps 
    1010   !!             -   !  2010-09  (C. Ethe, G. Madec) Merge TRA-TRC 
     11   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) isf melting forcing  
    1112   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1213 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/trazdf_imp.F90

    r4990 r5098  
    122122            DO jj=1, jpj 
    123123               DO ji=1, jpi 
    124                   zwt(ji,jj,1:mikt(ji,jj)) = 0._wp 
     124                  zwt(ji,jj,1) = 0._wp 
    125125               END DO 
    126126            END DO 
    … …  
    184184            DO jj = 2, jpjm1 
    185185               DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    186                   zwt(ji,jj,1:mikt(ji,jj)) = zwd(ji,jj,1:mikt(ji,jj)) 
    187                   DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
     186                  zwt(ji,jj,1) = zwd(ji,jj,1) 
     187               END DO 
     188            END DO 
     189            DO jk = 2, jpkm1 
     190               DO jj = 2, jpjm1 
     191                  DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    188192                     zwt(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwt(ji,jj,jk-1) 
    189193                  END DO 
    … …  
    196200         DO jj = 2, jpjm1 
    197201            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    198                ze3tb = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t_b(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    199                ze3tn = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t(ji,jj,mikt(ji,jj)) 
    200                pta(ji,jj,mikt(ji,jj),jn) = ze3tb * ptb(ji,jj,mikt(ji,jj),jn)                     & 
    201                   &                      + p2dt(mikt(ji,jj)) * ze3tn * pta(ji,jj,mikt(ji,jj),jn) 
    202                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
     202               ze3tb = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t_b(ji,jj,1) 
     203               ze3tn = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t(ji,jj,1) 
     204               pta(ji,jj,1,jn) = ze3tb * ptb(ji,jj,1,jn)                     & 
     205                  &                      + p2dt(1) * ze3tn * pta(ji,jj,1,jn) 
     206            END DO 
     207         END DO 
     208         DO jk = 2, jpkm1 
     209            DO jj = 2, jpjm1 
     210               DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    203211                  ze3tb = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t_b(ji,jj,jk) 
    204212                  ze3tn = ( 1. - r_vvl ) + r_vvl * fse3t  (ji,jj,jk) 
    … …  
    213221            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    214222               pta(ji,jj,jpkm1,jn) = pta(ji,jj,jpkm1,jn) / zwt(ji,jj,jpkm1) * tmask(ji,jj,jpkm1) 
    215                DO jk = jpk-2, mikt(ji,jj), -1 
     223            END DO 
     224         END DO 
     225         DO jk = jpk-2, 1, -1 
     226            DO jj = 2, jpjm1 
     227               DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    216228                  pta(ji,jj,jk,jn) = ( pta(ji,jj,jk,jn) - zws(ji,jj,jk) * pta(ji,jj,jk+1,jn) )   & 
    217229                     &             / zwt(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/zpshde.F90

    r4990 r5098  
    88   !!             -   !  2004-03  (C. Ethe)  adapted for passive tracers 
    99   !!            3.3  !  2010-05  (C. Ethe, G. Madec)  merge TRC-TRA  
     10   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) Add zps_hde_isf (needed to open a cavity) 
    1011   !!====================================================================== 
    1112    
    … …  
    2728   PRIVATE 
    2829 
    29    PUBLIC   zps_hde    ! routine called by step.F90 
     30   PUBLIC   zps_hde     ! routine called by step.F90 
     31   PUBLIC   zps_hde_isf ! routine called by step.F90 
    3032 
    3133   !! * Substitutions 
    … …  
    4042 
    4143   SUBROUTINE zps_hde( kt, kjpt, pta, pgtu, pgtv,   & 
    42       &                          prd, pgru, pgrv, pmru, pmrv, pgzu, pgzv, pge3ru, pge3rv,  & 
    43       &                   sgtu, sgtv, sgru, sgrv, smru, smrv, sgzu, sgzv, sge3ru, sge3rv ) 
     44      &                          prd, pgru, pgrv    ) 
    4445      !!---------------------------------------------------------------------- 
    4546      !!                     ***  ROUTINE zps_hde  *** 
    … …  
    8283      !! 
    8384      !! ** Action  : compute for top and bottom interfaces 
    84       !!              - pgtu, pgtv, sgtu, sgtv: horizontal gradient of tracer at u- & v-points 
    85       !!              - pgru, pgrv, sgru, sgtv: horizontal gradient of rho (if present) at u- & v-points 
    86       !!              - pmru, pmrv, smru, smrv: horizontal sum of rho at u- & v- point (used in dynhpg with vvl) 
    87       !!              - pgzu, pgzv, sgzu, sgzv: horizontal gradient of z at u- and v- point (used in dynhpg with vvl) 
    88       !!              - pge3ru, pge3rv, sge3ru, sge3rv: horizontal gradient of rho weighted by local e3w at u- & v-points  
     85      !!              - pgtu, pgtv: horizontal gradient of tracer at u- & v-points 
     86      !!              - pgru, pgrv: horizontal gradient of rho (if present) at u- & v-points 
    8987      !!---------------------------------------------------------------------- 
    9088      INTEGER                              , INTENT(in   )           ::  kt          ! ocean time-step index 
    … …  
    9290      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,kjpt), INTENT(in   )           ::  pta         ! 4D tracers fields 
    9391      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,    kjpt), INTENT(  out)           ::  pgtu, pgtv  ! hor. grad. of ptra at u- & v-pts  
    94       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,    kjpt), INTENT(  out)           ::  sgtu, sgtv  ! hor. grad. of stra at u- & v-pts (ISF) 
    9592      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(in   ), OPTIONAL ::  prd         ! 3D density anomaly fields 
    9693      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgru, pgrv      ! hor. grad of prd at u- & v-pts (bottom) 
    97       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pmru, pmrv      ! hor. sum  of prd at u- & v-pts (bottom) 
    98       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgzu, pgzv      ! hor. grad of z   at u- & v-pts (bottom) 
    99       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pge3ru, pge3rv  ! hor. grad of prd weighted by local e3w at u- & v-pts (bottom) 
    100       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  sgru, sgrv      ! hor. grad of prd at u- & v-pts (top) 
    101       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  smru, smrv      ! hor. sum  of prd at u- & v-pts (top) 
    102       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  sgzu, sgzv      ! hor. grad of z   at u- & v-pts (top) 
    103       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  sge3ru, sge3rv  ! hor. grad of prd weighted by local e3w at u- & v-pts (top) 
    10494      ! 
    10595      INTEGER  ::   ji, jj, jn      ! Dummy loop indices 
    … …  
    113103      ! 
    114104      pgtu(:,:,:)=0.0_wp ; pgtv(:,:,:)=0.0_wp ; 
    115       sgtu(:,:,:)=0.0_wp ; sgtv(:,:,:)=0.0_wp ; 
     105      zti (:,:,:)=0.0_wp ; ztj (:,:,:)=0.0_wp ; 
     106      zhi (:,:  )=0.0_wp ; zhj (:,:  )=0.0_wp ; 
     107      ! 
     108      DO jn = 1, kjpt      !==   Interpolation of tracers at the last ocean level   ==! 
     109         ! 
     110         DO jj = 1, jpjm1 
     111            DO ji = 1, jpim1 
     112               iku = mbku(ji,jj)   ;   ikum1 = MAX( iku - 1 , 1 )    ! last and before last ocean level at u- & v-points 
     113               ikv = mbkv(ji,jj)   ;   ikvm1 = MAX( ikv - 1 , 1 )    ! if level first is a p-step, ik.m1=1 
     114               ! (ISF) case partial step top and bottom in adjacent cell in vertical 
     115               ! cannot used e3w because if 2 cell water column, we have ps at top and bottom 
     116               ! in this case e3w(i,j) - e3w(i,j+1) is not the distance between Tj~ and Tj 
     117               ! the only common depth between cells (i,j) and (i,j+1) is gdepw_0 
     118               ze3wu  = (gdept_0(ji+1,jj,iku) - gdepw_0(ji+1,jj,iku)) - (gdept_0(ji,jj,iku) - gdepw_0(ji,jj,iku)) 
     119               ze3wv  = (gdept_0(ji,jj+1,ikv) - gdepw_0(ji,jj+1,ikv)) - (gdept_0(ji,jj,ikv) - gdepw_0(ji,jj,ikv)) 
     120               ! 
     121               ! i- direction 
     122               IF( ze3wu >= 0._wp ) THEN      ! case 1 
     123                  zmaxu =  ze3wu / fse3w(ji+1,jj,iku) 
     124                  ! interpolated values of tracers 
     125                  zti (ji,jj,jn) = pta(ji+1,jj,iku,jn) + zmaxu * ( pta(ji+1,jj,ikum1,jn) - pta(ji+1,jj,iku,jn) ) 
     126                  ! gradient of  tracers 
     127                  pgtu(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( zti(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,iku,jn) ) 
     128               ELSE                           ! case 2 
     129                  zmaxu = -ze3wu / fse3w(ji,jj,iku) 
     130                  ! interpolated values of tracers 
     131                  zti (ji,jj,jn) = pta(ji,jj,iku,jn) + zmaxu * ( pta(ji,jj,ikum1,jn) - pta(ji,jj,iku,jn) ) 
     132                  ! gradient of tracers 
     133                  pgtu(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( pta(ji+1,jj,iku,jn) - zti(ji,jj,jn) ) 
     134               ENDIF 
     135               ! 
     136               ! j- direction 
     137               IF( ze3wv >= 0._wp ) THEN      ! case 1 
     138                  zmaxv =  ze3wv / fse3w(ji,jj+1,ikv) 
     139                  ! interpolated values of tracers 
     140                  ztj (ji,jj,jn) = pta(ji,jj+1,ikv,jn) + zmaxv * ( pta(ji,jj+1,ikvm1,jn) - pta(ji,jj+1,ikv,jn) ) 
     141                  ! gradient of tracers 
     142                  pgtv(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( ztj(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,ikv,jn) ) 
     143               ELSE                           ! case 2 
     144                  zmaxv =  -ze3wv / fse3w(ji,jj,ikv) 
     145                  ! interpolated values of tracers 
     146                  ztj (ji,jj,jn) = pta(ji,jj,ikv,jn) + zmaxv * ( pta(ji,jj,ikvm1,jn) - pta(ji,jj,ikv,jn) ) 
     147                  ! gradient of tracers 
     148                  pgtv(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( pta(ji,jj+1,ikv,jn) - ztj(ji,jj,jn) ) 
     149               ENDIF 
     150            END DO 
     151         END DO 
     152         CALL lbc_lnk( pgtu(:,:,jn), 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pgtv(:,:,jn), 'V', -1. )   ! Lateral boundary cond. 
     153         ! 
     154      END DO 
     155 
     156      ! horizontal derivative of density anomalies (rd) 
     157      IF( PRESENT( prd ) ) THEN         ! depth of the partial step level 
     158         pgru(:,:)=0.0_wp   ; pgrv(:,:)=0.0_wp ;  
     159         DO jj = 1, jpjm1 
     160            DO ji = 1, jpim1 
     161               iku = mbku(ji,jj) 
     162               ikv = mbkv(ji,jj) 
     163               ze3wu  = (gdept_0(ji+1,jj,iku) - gdepw_0(ji+1,jj,iku)) - (gdept_0(ji,jj,iku) - gdepw_0(ji,jj,iku)) 
     164               ze3wv  = (gdept_0(ji,jj+1,ikv) - gdepw_0(ji,jj+1,ikv)) - (gdept_0(ji,jj,ikv) - gdepw_0(ji,jj,ikv)) 
     165 
     166               IF( ze3wu >= 0._wp ) THEN   ;   zhi(ji,jj) = fsdept(ji+1,jj,iku) - ze3wu     ! i-direction: case 1 
     167               ELSE                        ;   zhi(ji,jj) = fsdept(ji  ,jj,iku) + ze3wu    ! -     -      case 2 
     168               ENDIF 
     169               IF( ze3wv >= 0._wp ) THEN   ;   zhj(ji,jj) = fsdept(ji,jj+1,ikv) - ze3wv    ! j-direction: case 1 
     170               ELSE                        ;   zhj(ji,jj) = fsdept(ji,jj  ,ikv) + ze3wv    ! -     -      case 2 
     171               ENDIF 
     172            END DO 
     173         END DO 
     174          
     175         ! Compute interpolated rd from zti, ztj for the 2 cases at the depth of the partial 
     176         ! step and store it in  zri, zrj for each  case 
     177         CALL eos( zti, zhi, zri )   
     178         CALL eos( ztj, zhj, zrj ) 
     179 
     180         ! Gradient of density at the last level  
     181         DO jj = 1, jpjm1 
     182            DO ji = 1, jpim1 
     183               iku = mbku(ji,jj) ; ikum1 = MAX( iku - 1 , 1 )    ! last and before last ocean level at u- & v-points 
     184               ikv = mbkv(ji,jj) ; ikvm1 = MAX( ikv - 1 , 1 )    ! last and before last ocean level at u- & v-points 
     185               ze3wu  = (gdept_0(ji+1,jj,iku) - gdepw_0(ji+1,jj,iku)) - (gdept_0(ji,jj,iku) - gdepw_0(ji,jj,iku)) 
     186               ze3wv  = (gdept_0(ji,jj+1,ikv) - gdepw_0(ji,jj+1,ikv)) - (gdept_0(ji,jj,ikv) - gdepw_0(ji,jj,ikv)) 
     187               IF( ze3wu >= 0._wp ) THEN ; pgru(ji,jj) = umask(ji,jj,iku) * ( zri(ji  ,jj) - prd(ji,jj,iku) )   ! i: 1 
     188               ELSE                      ; pgru(ji,jj) = umask(ji,jj,iku) * ( prd(ji+1,jj,iku) - zri(ji,jj) )   ! i: 2 
     189               ENDIF 
     190               IF( ze3wv >= 0._wp ) THEN ; pgrv(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv) * ( zrj(ji,jj  ) - prd(ji,jj,ikv) )   ! j: 1 
     191               ELSE                      ; pgrv(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv) * ( prd(ji,jj+1,ikv) - zrj(ji,jj) )   ! j: 2 
     192               ENDIF 
     193            END DO 
     194         END DO 
     195         CALL lbc_lnk( pgru   , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pgrv   , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
     196         ! 
     197      END IF 
     198      ! 
     199      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop( 'zps_hde') 
     200      ! 
     201   END SUBROUTINE zps_hde 
     202   ! 
     203   SUBROUTINE zps_hde_isf( kt, kjpt, pta, pgtu, pgtv,   & 
     204      &                          prd, pgru, pgrv, pmru, pmrv, pgzu, pgzv, pge3ru, pge3rv,  & 
     205      &                   pgtui, pgtvi, pgrui, pgrvi, pmrui, pmrvi, pgzui, pgzvi, pge3rui, pge3rvi ) 
     206      !!---------------------------------------------------------------------- 
     207      !!                     ***  ROUTINE zps_hde  *** 
     208      !!                     
     209      !! ** Purpose :   Compute the horizontal derivative of T, S and rho 
     210      !!      at u- and v-points with a linear interpolation for z-coordinate 
     211      !!      with partial steps. 
     212      !! 
     213      !! ** Method  :   In z-coord with partial steps, scale factors on last  
     214      !!      levels are different for each grid point, so that T, S and rd  
     215      !!      points are not at the same depth as in z-coord. To have horizontal 
     216      !!      gradients again, we interpolate T and S at the good depth :  
     217      !!      Linear interpolation of T, S    
     218      !!         Computation of di(tb) and dj(tb) by vertical interpolation: 
     219      !!          di(t) = t~ - t(i,j,k) or t(i+1,j,k) - t~ 
     220      !!          dj(t) = t~ - t(i,j,k) or t(i,j+1,k) - t~ 
     221      !!         This formulation computes the two cases: 
     222      !!                 CASE 1                   CASE 2   
     223      !!         k-1  ___ ___________   k-1   ___ ___________ 
     224      !!                    Ti  T~                  T~  Ti+1 
     225      !!                  _____                        _____ 
     226      !!         k        |   |Ti+1     k           Ti |   | 
     227      !!                  |   |____                ____|   | 
     228      !!              ___ |   |   |           ___  |   |   | 
     229      !!                   
     230      !!      case 1->   e3w(i+1) >= e3w(i) ( and e3w(j+1) >= e3w(j) ) then 
     231      !!          t~ = t(i+1,j  ,k) + (e3w(i+1) - e3w(i)) * dk(Ti+1)/e3w(i+1) 
     232      !!        ( t~ = t(i  ,j+1,k) + (e3w(j+1) - e3w(j)) * dk(Tj+1)/e3w(j+1)  ) 
     233      !!          or 
     234      !!      case 2->   e3w(i+1) <= e3w(i) ( and e3w(j+1) <= e3w(j) ) then 
     235      !!          t~ = t(i,j,k) + (e3w(i) - e3w(i+1)) * dk(Ti)/e3w(i ) 
     236      !!        ( t~ = t(i,j,k) + (e3w(j) - e3w(j+1)) * dk(Tj)/e3w(j ) ) 
     237      !!          Idem for di(s) and dj(s)           
     238      !! 
     239      !!      For rho, we call eos which will compute rd~(t~,s~) at the right 
     240      !!      depth zh from interpolated T and S for the different formulations 
     241      !!      of the equation of state (eos). 
     242      !!      Gradient formulation for rho : 
     243      !!          di(rho) = rd~ - rd(i,j,k)   or   rd(i+1,j,k) - rd~ 
     244      !! 
     245      !! ** Action  : compute for top and bottom interfaces 
     246      !!              - pgtu, pgtv, pgtui, pgtvi: horizontal gradient of tracer at u- & v-points 
     247      !!              - pgru, pgrv, pgrui, pgtvi: horizontal gradient of rho (if present) at u- & v-points 
     248      !!              - pmru, pmrv, pmrui, pmrvi: horizontal sum of rho at u- & v- point (used in dynhpg with vvl) 
     249      !!              - pgzu, pgzv, pgzui, pgzvi: horizontal gradient of z at u- and v- point (used in dynhpg with vvl) 
     250      !!              - pge3ru, pge3rv, pge3rui, pge3rvi: horizontal gradient of rho weighted by local e3w at u- & v-points  
     251      !!---------------------------------------------------------------------- 
     252      INTEGER                              , INTENT(in   )           ::  kt          ! ocean time-step index 
     253      INTEGER                              , INTENT(in   )           ::  kjpt        ! number of tracers 
     254      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,kjpt), INTENT(in   )           ::  pta         ! 4D tracers fields 
     255      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,    kjpt), INTENT(  out)           ::  pgtu, pgtv  ! hor. grad. of ptra at u- & v-pts  
     256      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,    kjpt), INTENT(  out)           ::  pgtui, pgtvi  ! hor. grad. of stra at u- & v-pts (ISF) 
     257      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(in   ), OPTIONAL ::  prd         ! 3D density anomaly fields 
     258      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgru, pgrv      ! hor. grad of prd at u- & v-pts (bottom) 
     259      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pmru, pmrv      ! hor. sum  of prd at u- & v-pts (bottom) 
     260      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgzu, pgzv      ! hor. grad of z   at u- & v-pts (bottom) 
     261      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pge3ru, pge3rv  ! hor. grad of prd weighted by local e3w at u- & v-pts (bottom) 
     262      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgrui, pgrvi      ! hor. grad of prd at u- & v-pts (top) 
     263      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pmrui, pmrvi      ! hor. sum  of prd at u- & v-pts (top) 
     264      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pgzui, pgzvi      ! hor. grad of z   at u- & v-pts (top) 
     265      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj         ), INTENT(  out), OPTIONAL ::  pge3rui, pge3rvi  ! hor. grad of prd weighted by local e3w at u- & v-pts (top) 
     266      ! 
     267      INTEGER  ::   ji, jj, jn      ! Dummy loop indices 
     268      INTEGER  ::   iku, ikv, ikum1, ikvm1,ikup1, ikvp1   ! partial step level (ocean bottom level) at u- and v-points 
     269      REAL(wp) ::  ze3wu, ze3wv, zmaxu, zmaxv, zdzwu, zdzwv, zdzwuip1, zdzwvjp1  ! temporary scalars 
     270      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)      ::  zri, zrj, zhi, zhj   ! NB: 3rd dim=1 to use eos 
     271      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,kjpt) ::  zti, ztj             !  
     272      !!---------------------------------------------------------------------- 
     273      ! 
     274      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start( 'zps_hde_isf') 
     275      ! 
     276      pgtu(:,:,:)=0.0_wp ; pgtv(:,:,:)=0.0_wp ; 
     277      pgtui(:,:,:)=0.0_wp ; pgtvi(:,:,:)=0.0_wp ; 
    116278      zti (:,:,:)=0.0_wp ; ztj (:,:,:)=0.0_wp ; 
    117279      zhi (:,:  )=0.0_wp ; zhj (:,:  )=0.0_wp ; 
    … …  
    256418                  zti(ji,jj,jn) = pta(ji+1,jj,iku,jn) + zmaxu * ( pta(ji+1,jj,iku+1,jn) - pta(ji+1,jj,iku,jn) ) 
    257419                  ! gradient of tracers 
    258                   sgtu(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( zti(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,iku,jn) ) 
     420                  pgtui(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( zti(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,iku,jn) ) 
    259421               ELSE                           ! case 2 
    260422                  zmaxu = - ze3wu / fse3w(ji,jj,iku+1) 
    … …  
    262424                  zti(ji,jj,jn) = pta(ji,jj,iku,jn) + zmaxu * ( pta(ji,jj,iku+1,jn) - pta(ji,jj,iku,jn) ) 
    263425                  ! gradient of  tracers 
    264                   sgtu(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( pta(ji+1,jj,iku,jn) - zti(ji,jj,jn) ) 
     426                  pgtui(ji,jj,jn) = umask(ji,jj,iku) * ( pta(ji+1,jj,iku,jn) - zti(ji,jj,jn) ) 
    265427               ENDIF 
    266428               ! 
    … …  
    271433                  ztj(ji,jj,jn) = pta(ji,jj+1,ikv,jn) + zmaxv * ( pta(ji,jj+1,ikv+1,jn) - pta(ji,jj+1,ikv,jn) ) 
    272434                  ! gradient of tracers 
    273                   sgtv(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( ztj(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,ikv,jn) ) 
     435                  pgtvi(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( ztj(ji,jj,jn) - pta(ji,jj,ikv,jn) ) 
    274436               ELSE                           ! case 2 
    275437                  zmaxv =  - ze3wv / fse3w(ji,jj,ikv+1) 
    … …  
    277439                  ztj(ji,jj,jn) = pta(ji,jj,ikv,jn) + zmaxv * ( pta(ji,jj,ikv+1,jn) - pta(ji,jj,ikv,jn) ) 
    278440                  ! gradient of tracers 
    279                   sgtv(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( pta(ji,jj+1,ikv,jn) - ztj(ji,jj,jn) ) 
     441                  pgtvi(ji,jj,jn) = vmask(ji,jj,ikv) * ( pta(ji,jj+1,ikv,jn) - ztj(ji,jj,jn) ) 
    280442               ENDIF 
    281443            END DO!! 
    282444         END DO!! 
    283          CALL lbc_lnk( sgtu(:,:,jn), 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( sgtv(:,:,jn), 'V', -1. )   ! Lateral boundary cond. 
     445         CALL lbc_lnk( pgtui(:,:,jn), 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pgtvi(:,:,jn), 'V', -1. )   ! Lateral boundary cond. 
    284446         ! 
    285447      END DO 
    … …  
    287449      ! horizontal derivative of density anomalies (rd) 
    288450      IF( PRESENT( prd ) ) THEN         ! depth of the partial step level 
    289          sgru(:,:)  =0.0_wp ; sgrv(:,:)  =0.0_wp ; 
    290          sgzu(:,:)  =0.0_wp ; sgzv(:,:)  =0.0_wp ; 
    291          smru(:,:)  =0.0_wp ; smru(:,:)  =0.0_wp ; 
    292          sge3ru(:,:)=0.0_wp ; sge3rv(:,:)=0.0_wp ; 
     451         pgrui(:,:)  =0.0_wp ; pgrvi(:,:)  =0.0_wp ; 
     452         pgzui(:,:)  =0.0_wp ; pgzvi(:,:)  =0.0_wp ; 
     453         pmrui(:,:)  =0.0_wp ; pmrui(:,:)  =0.0_wp ; 
     454         pge3rui(:,:)=0.0_wp ; pge3rvi(:,:)=0.0_wp ; 
    293455 
    294456         DO jj = 1, jpjm1 
    … …  
    321483               ze3wv  = (gdepw_0(ji,jj+1,ikv+1) - gdept_0(ji,jj+1,ikv)) - (gdepw_0(ji,jj,ikv+1) - gdept_0(ji,jj,ikv)) 
    322484               IF( ze3wu >= 0._wp ) THEN 
    323                  sgzu  (ji,jj) = (fsde3w(ji+1,jj,iku) + ze3wu) - fsde3w(ji,jj,iku) 
    324                  sgru  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( zri(ji,jj) - prd(ji,jj,iku) )          ! i: 1 
    325                  smru  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( zri(ji,jj) + prd(ji,jj,iku) )          ! i: 1  
    326                  sge3ru(ji,jj) = umask(ji,jj,iku+1)                                                                  & 
     485                 pgzui  (ji,jj) = (fsde3w(ji+1,jj,iku) + ze3wu) - fsde3w(ji,jj,iku) 
     486                 pgrui  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( zri(ji,jj) - prd(ji,jj,iku) )          ! i: 1 
     487                 pmrui  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( zri(ji,jj) + prd(ji,jj,iku) )          ! i: 1  
     488                 pge3rui(ji,jj) = umask(ji,jj,iku+1)                                                                  & 
    327489                                * ( (fse3w(ji+1,jj,iku+1) - ze3wu) * (zri(ji,jj    ) + prd(ji+1,jj,iku+1) + 2._wp)   & 
    328490                                   - fse3w(ji  ,jj,iku+1)          * (prd(ji,jj,iku) + prd(ji  ,jj,iku+1) + 2._wp)   ) ! i: 1 
    329491               ELSE 
    330                  sgzu  (ji,jj) = fsde3w(ji+1,jj,iku) - (fsde3w(ji,jj,iku) - ze3wu) 
    331                  sgru  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( prd(ji+1,jj,iku) - zri(ji,jj) )      ! i: 2 
    332                  smru  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( prd(ji+1,jj,iku) + zri(ji,jj) )      ! i: 2 
    333                  sge3ru(ji,jj) = umask(ji,jj,iku+1)                                                                   & 
     492                 pgzui  (ji,jj) = fsde3w(ji+1,jj,iku) - (fsde3w(ji,jj,iku) - ze3wu) 
     493                 pgrui  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( prd(ji+1,jj,iku) - zri(ji,jj) )      ! i: 2 
     494                 pmrui  (ji,jj) = umask(ji,jj,iku)   * ( prd(ji+1,jj,iku) + zri(ji,jj) )      ! i: 2 
     495                 pge3rui(ji,jj) = umask(ji,jj,iku+1)                                                                   & 
    334496                                * (  fse3w(ji+1,jj,iku+1)          * (prd(ji+1,jj,iku) + prd(ji+1,jj,iku+1) + 2._wp)  & 
    335497                                   -(fse3w(ji  ,jj,iku+1) + ze3wu) * (zri(ji,jj      ) + prd(ji  ,jj,iku+1) + 2._wp)  )     ! i: 2 
    336498               ENDIF 
    337499               IF( ze3wv >= 0._wp ) THEN 
    338                  sgzv  (ji,jj) = (fsde3w(ji,jj+1,ikv) + ze3wv) - fsde3w(ji,jj,ikv)  
    339                  sgrv  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( zrj(ji,jj  ) - prd(ji,jj,ikv) )        ! j: 1 
    340                  smrv  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( zrj(ji,jj  ) + prd(ji,jj,ikv) )        ! j: 1 
    341                  sge3rv(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv+1)                                                                  &  
     500                 pgzvi  (ji,jj) = (fsde3w(ji,jj+1,ikv) + ze3wv) - fsde3w(ji,jj,ikv)  
     501                 pgrvi  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( zrj(ji,jj  ) - prd(ji,jj,ikv) )        ! j: 1 
     502                 pmrvi  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( zrj(ji,jj  ) + prd(ji,jj,ikv) )        ! j: 1 
     503                 pge3rvi(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv+1)                                                                  &  
    342504                                * ( (fse3w(ji,jj+1,ikv+1) - ze3wv) * ( zrj(ji,jj    ) + prd(ji,jj+1,ikv+1) + 2._wp)  & 
    343505                                   - fse3w(ji,jj  ,ikv+1)          * ( prd(ji,jj,ikv) + prd(ji,jj  ,ikv+1) + 2._wp)  ) ! j: 1 
    344506                                  ! + 2 due to the formulation in density and not in anomalie in hpg sco 
    345507               ELSE 
    346                  sgzv  (ji,jj) = fsde3w(ji,jj+1,ikv) - (fsde3w(ji,jj,ikv) - ze3wv) 
    347                  sgrv  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( prd(ji,jj+1,ikv) - zrj(ji,jj) )     ! j: 2 
    348                  smrv  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( prd(ji,jj+1,ikv) + zrj(ji,jj) )     ! j: 2 
    349                  sge3rv(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv+1)                                                                   & 
     508                 pgzvi  (ji,jj) = fsde3w(ji,jj+1,ikv) - (fsde3w(ji,jj,ikv) - ze3wv) 
     509                 pgrvi  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( prd(ji,jj+1,ikv) - zrj(ji,jj) )     ! j: 2 
     510                 pmrvi  (ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv)   * ( prd(ji,jj+1,ikv) + zrj(ji,jj) )     ! j: 2 
     511                 pge3rvi(ji,jj) = vmask(ji,jj,ikv+1)                                                                   & 
    350512                                * (  fse3w(ji,jj+1,ikv+1)          * ( prd(ji,jj+1,ikv) + prd(ji,jj+1,ikv+1) + 2._wp) & 
    351513                                   -(fse3w(ji,jj  ,ikv+1) + ze3wv) * ( zrj(ji,jj      ) + prd(ji,jj  ,ikv+1) + 2._wp) )  ! j: 2 
    … …  
    353515            END DO 
    354516         END DO 
    355          CALL lbc_lnk( sgru   , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( sgrv   , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
    356          CALL lbc_lnk( smru   , 'U',  1. )   ;   CALL lbc_lnk( smrv   , 'V',  1. )   ! Lateral boundary conditions 
    357          CALL lbc_lnk( sgzu   , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( sgzv   , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
    358          CALL lbc_lnk( sge3ru , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( sge3rv , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
     517         CALL lbc_lnk( pgrui   , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pgrvi   , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
     518         CALL lbc_lnk( pmrui   , 'U',  1. )   ;   CALL lbc_lnk( pmrvi   , 'V',  1. )   ! Lateral boundary conditions 
     519         CALL lbc_lnk( pgzui   , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pgzvi   , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
     520         CALL lbc_lnk( pge3rui , 'U', -1. )   ;   CALL lbc_lnk( pge3rvi , 'V', -1. )   ! Lateral boundary conditions 
    359521         ! 
    360522      END IF   
    361523      ! 
    362       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop( 'zps_hde') 
    363       ! 
    364    END SUBROUTINE zps_hde 
    365  
     524      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop( 'zps_hde_isf') 
     525      ! 
     526   END SUBROUTINE zps_hde_isf 
    366527   !!====================================================================== 
    367528END MODULE zpshde 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdfddm.F90

    r4990 r5098  
    156156         END DO 
    157157         ! mask zmsk in order to have avt and avs masked 
    158          zmsks(:,:) = zmsks(:,:) * tmask(:,:,jk) 
     158         zmsks(:,:) = zmsks(:,:) * wmask(:,:,jk) 
    159159 
    160160 
    … …  
    191191               avmu(ji,jj,jk) = MAX( avmu(ji,jj,jk),    & 
    192192                  &                  avt(ji,jj,jk), avt(ji+1,jj,jk),   & 
    193                   &                  avs(ji,jj,jk), avs(ji+1,jj,jk) )  * umask(ji,jj,jk) 
     193                  &                  avs(ji,jj,jk), avs(ji+1,jj,jk) )  * wumask(ji,jj,jk) 
    194194               avmv(ji,jj,jk) = MAX( avmv(ji,jj,jk),    & 
    195195                  &                  avt(ji,jj,jk), avt(ji,jj+1,jk),   & 
    196                   &                  avs(ji,jj,jk), avs(ji,jj+1,jk) )  * vmask(ji,jj,jk) 
     196                  &                  avs(ji,jj,jk), avs(ji,jj+1,jk) )  * wvmask(ji,jj,jk) 
    197197            END DO 
    198198         END DO 
    … …  
    255255      IF( zdf_ddm_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_ddm_init : unable to allocate arrays' ) 
    256256      !                               ! initialization to masked Kz 
    257       avs(:,:,:) = rn_avt0 * tmask(:,:,:)  
     257      avs(:,:,:) = rn_avt0 * wmask(:,:,:)  
    258258      ! 
    259259   END SUBROUTINE zdf_ddm_init 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdftke.F90

    r4990 r5098  
    2626   !!                 !                                + cleaning of the parameters + bugs correction 
    2727   !!            3.3  !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase 
     28   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) add ice shelf capability 
    2829   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2930#if defined key_zdftke   ||   defined key_esopa 
    … …  
    236237      zfact3 = 0.5_wp       * rn_ediss 
    237238      ! 
     239      ! 
    238240      !                     !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< 
    239241      !                     !  Surface boundary condition on tke 
    240242      !                     !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< 
     243      DO jj = 2, jpjm1            ! en(mikt(ji,jj))   = rn_emin 
     244         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     245               en(ji,jj,mikt(ji,jj))=rn_emin 
     246         END DO 
     247      END DO 
    241248      DO jj = 2, jpjm1            ! en(1)   = rn_ebb taum / rau0  (min value rn_emin0) 
    242249         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    243             IF (mikt(ji,jj) .GT. 1) THEN 
    244                en(ji,jj,mikt(ji,jj))=rn_emin 
    245             ELSE 
    246                en(ji,jj,1) = MAX( rn_emin0, zbbrau * taum(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,1) 
    247             END IF 
     250            en(ji,jj,1) = MAX( rn_emin0, zbbrau * taum(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,1) 
    248251         END DO 
    249252      END DO 
    … …  
    301304         END DO 
    302305         zcof = 0.016 / SQRT( zrhoa * zcdrag ) 
     306!CDIR NOVERRCHK 
    303307         DO jk = 2, jpkm1         !* TKE Langmuir circulation source term added to en 
    304             DO jj = 2, jpjm1 
     308!CDIR NOVERRCHK 
     309            DO jj = 2, jpjm1 
     310!CDIR NOVERRCHK 
    305311               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    306312                  zus  = zcof * SQRT( taum(ji,jj) )           ! Stokes drift 
    … …  
    309315                  zwlc = zind * rn_lc * zus * SIN( rpi * fsdepw(ji,jj,jk) / zhlc(ji,jj) ) 
    310316                  !                                           ! TKE Langmuir circulation source term 
    311                   en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + rdt * ( zwlc * zwlc * zwlc ) / zhlc(ji,jj) * tmask(ji,jj,jk) 
     317                  en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + rdt * ( zwlc * zwlc * zwlc ) / zhlc(ji,jj) * wmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
    312318               END DO 
    313319            END DO 
    … …  
    338344      END DO 
    339345      ! 
    340       DO jj = 2, jpjm1 
    341          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    342             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1           !* Matrix and right hand side in en 
     346      DO jk = 2, jpkm1           !* Matrix and right hand side in en 
     347         DO jj = 2, jpjm1 
     348            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    343349               zcof   = zfact1 * tmask(ji,jj,jk) 
    344350               zzd_up = zcof * ( avm  (ji,jj,jk+1) + avm  (ji,jj,jk  ) )   &  ! upper diagonal 
    … …  
    357363               en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + rdt * (  zesh2  -   avt(ji,jj,jk) * rn2(ji,jj,jk)    & 
    358364                  &                                 + zfact3 * dissl(ji,jj,jk) * en (ji,jj,jk)  ) & 
    359                   &                                 * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) 
    360             END DO 
    361             !                          !* Matrix inversion from level 2 (tke prescribed at level 1) 
    362             DO jk = mikt(ji,jj)+2, jpkm1                             ! First recurrence : Dk = Dk - Lk * Uk-1 / Dk-1 
     365                  &                                 * wmask(ji,jj,jk) 
     366            END DO 
     367         END DO 
     368      END DO 
     369      !                          !* Matrix inversion from level 2 (tke prescribed at level 1) 
     370      DO jk = 3, jpkm1                             ! First recurrence : Dk = Dk - Lk * Uk-1 / Dk-1 
     371         DO jj = 2, jpjm1 
     372            DO ji = fs_2, fs_jpim1    ! vector opt. 
    363373               zdiag(ji,jj,jk) = zdiag(ji,jj,jk) - zd_lw(ji,jj,jk) * zd_up(ji,jj,jk-1) / zdiag(ji,jj,jk-1) 
    364374            END DO 
    365             ! Second recurrence : Lk = RHSk - Lk / Dk-1 * Lk-1 
    366             zd_lw(ji,jj,mikt(ji,jj)+1) = en(ji,jj,mikt(ji,jj)+1) - zd_lw(ji,jj,mikt(ji,jj)+1) * en(ji,jj,mikt(ji,jj))    ! Surface boudary conditions on tke 
    367             ! 
    368             DO jk = mikt(ji,jj)+2, jpkm1 
     375         END DO 
     376      END DO 
     377      ! 
     378      ! Second recurrence : Lk = RHSk - Lk / Dk-1 * Lk-1 
     379      DO jj = 2, jpjm1 
     380         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     381            zd_lw(ji,jj,2) = en(ji,jj,2) - zd_lw(ji,jj,2) * en(ji,jj,1)    ! Surface boudary conditions on tke 
     382         END DO 
     383      END DO 
     384      DO jk = 3, jpkm1 
     385         DO jj = 2, jpjm1 
     386            DO ji = fs_2, fs_jpim1    ! vector opt. 
    369387               zd_lw(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) - zd_lw(ji,jj,jk) / zdiag(ji,jj,jk-1) *zd_lw(ji,jj,jk-1) 
    370388            END DO 
    371             ! 
    372             ! thrid recurrence : Ek = ( Lk - Uk * Ek+1 ) / Dk 
     389         END DO 
     390      END DO 
     391      ! 
     392      ! thrid recurrence : Ek = ( Lk - Uk * Ek+1 ) / Dk 
     393      DO jj = 2, jpjm1 
     394         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    373395            en(ji,jj,jpkm1) = zd_lw(ji,jj,jpkm1) / zdiag(ji,jj,jpkm1) 
    374             ! 
    375             DO jk = jpk-2, mikt(ji,jj)+1, -1 
     396         END DO 
     397      END DO 
     398      DO jk = jpk-2, 2, -1 
     399         DO jj = 2, jpjm1 
     400            DO ji = fs_2, fs_jpim1    ! vector opt. 
    376401               en(ji,jj,jk) = ( zd_lw(ji,jj,jk) - zd_up(ji,jj,jk) * en(ji,jj,jk+1) ) / zdiag(ji,jj,jk) 
    377402            END DO 
    378             ! 
    379             DO jk = mikt(ji,jj), jpkm1                             ! set the minimum value of tke 
    380                en(ji,jj,jk) = MAX( en(ji,jj,jk), rn_emin ) * tmask(ji,jj,jk) 
     403         END DO 
     404      END DO 
     405      DO jk = 2, jpkm1                             ! set the minimum value of tke 
     406         DO jj = 2, jpjm1 
     407            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     408               en(ji,jj,jk) = MAX( en(ji,jj,jk), rn_emin ) * wmask(ji,jj,jk) 
    381409            END DO 
    382410         END DO 
    … …  
    391419               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    392420                  en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + rn_efr * en(ji,jj,1) * EXP( -fsdepw(ji,jj,jk) / htau(ji,jj) )   & 
    393                      &                                 * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) )  * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
     421                     &                                 * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) )  * wmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
    394422               END DO 
    395423            END DO 
    … …  
    400428               jk = nmln(ji,jj) 
    401429               en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + rn_efr * en(ji,jj,1) * EXP( -fsdepw(ji,jj,jk) / htau(ji,jj) )   & 
    402                   &                                 * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) )  * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
     430                  &                                 * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) )  * wmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
    403431            END DO 
    404432         END DO 
    … …  
    416444                  zdif = rhftau_scl * MAX( 0._wp, zdif + rhftau_add )  ! apply some modifications... 
    417445                  en(ji,jj,jk) = en(ji,jj,jk) + zbbrau * zdif * EXP( -fsdepw(ji,jj,jk) / htau(ji,jj) )   & 
    418                      &                        * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk-1) * tmask(ji,jj,1) 
     446                     &                        * ( 1._wp - fr_i(ji,jj) ) * wmask(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,1) 
    419447               END DO 
    420448            END DO 
    … …  
    484512      !                     !* Buoyancy length scale: l=sqrt(2*e/n**2) 
    485513      ! 
     514      ! initialisation of interior minimum value (avoid a 2d loop with mikt) 
     515      zmxlm(:,:,:)  = rmxl_min     
     516      zmxld(:,:,:)  = rmxl_min 
     517      ! 
    486518      IF( ln_mxl0 ) THEN            ! surface mixing length = F(stress) : l=vkarmn*2.e5*taum/(rau0*g) 
    487519         DO jj = 2, jpjm1 
    488520            DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    489                IF (mikt(ji,jj) .GT. 1) THEN 
    490                   zmxlm(ji,jj,mikt(ji,jj)) = rmxl_min 
    491                ELSE 
    492                   zraug = vkarmn * 2.e5_wp / ( rau0 * grav ) 
    493                   zmxlm(ji,jj,mikt(ji,jj)) = MAX( rn_mxl0, zraug * taum(ji,jj) ) 
    494                END IF 
     521               zraug = vkarmn * 2.e5_wp / ( rau0 * grav ) 
     522               zmxlm(ji,jj,1) = MAX( rn_mxl0, zraug * taum(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) ) 
    495523            END DO 
    496524         END DO 
    497525      ELSE  
    498          DO jj = 2, jpjm1 
    499             DO ji = fs_2, fs_jpim1                         ! surface set to the minimum value 
    500                zmxlm(ji,jj,mikt(ji,jj)) = MAX( tmask(ji,jj,1) * rn_mxl0, rmxl_min) 
    501             END DO 
    502          END DO 
     526         zmxlm(:,:,1) = rn_mxl0 
    503527      ENDIF 
    504       zmxlm(:,:,jpk)  = rmxl_min     ! last level set to the interior minium value 
    505       ! 
    506 !CDIR NOVERRCHK 
    507       DO jj = 2, jpjm1 
    508 !CDIR NOVERRCHK 
    509          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    510             !CDIR NOVERRCHK 
    511             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1              ! interior value : l=sqrt(2*e/n^2) 
     528      ! 
     529!CDIR NOVERRCHK 
     530      DO jk = 2, jpkm1              ! interior value : l=sqrt(2*e/n^2) 
     531!CDIR NOVERRCHK 
     532         DO jj = 2, jpjm1 
     533!CDIR NOVERRCHK 
     534            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    512535               zrn2 = MAX( rn2(ji,jj,jk), rsmall ) 
    513                zmxlm(ji,jj,jk) = MAX(  rmxl_min,  SQRT( 2._wp * en(ji,jj,jk) / zrn2 )  ) 
    514             END DO 
    515             zmxld(ji,jj,mikt(ji,jj)) = zmxlm(ji,jj,mikt(ji,jj))   ! surface set to the minimum value  
     536               zmxlm(ji,jj,jk) = MAX(  rmxl_min,  SQRT( 2._wp * en(ji,jj,jk) / zrn2 ) ) 
     537            END DO 
    516538         END DO 
    517539      END DO 
    … …  
    519541      !                     !* Physical limits for the mixing length 
    520542      ! 
    521       zmxld(:,:, 1 ) = zmxlm(:,:,1)   ! surface set to the zmxlm   value 
     543      zmxld(:,:,1  ) = zmxlm(:,:,1)   ! surface set to the minimum value  
    522544      zmxld(:,:,jpk) = rmxl_min       ! last level  set to the minimum value 
    523545      ! 
    524546      SELECT CASE ( nn_mxl ) 
    525547      ! 
     548      ! where wmask = 0 set zmxlm == fse3w 
    526549      CASE ( 0 )           ! bounded by the distance to surface and bottom 
    527          DO jj = 2, jpjm1 
    528             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    529                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
     550         DO jk = 2, jpkm1 
     551            DO jj = 2, jpjm1 
     552               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    530553                  zemxl = MIN( fsdepw(ji,jj,jk) - fsdepw(ji,jj,mikt(ji,jj)), zmxlm(ji,jj,jk),   & 
    531554                  &            fsdepw(ji,jj,mbkt(ji,jj)+1) - fsdepw(ji,jj,jk) ) 
    532                   zmxlm(ji,jj,jk) = zemxl 
    533                   zmxld(ji,jj,jk) = zemxl 
     555                  ! wmask prevent zmxlm = 0 if jk = mikt(ji,jj) 
     556                  zmxlm(ji,jj,jk) = zemxl * wmask(ji,jj,jk) + MIN(zmxlm(ji,jj,jk),fse3w(ji,jj,jk)) * (1 - wmask(ji,jj,jk)) 
     557                  zmxld(ji,jj,jk) = zemxl * wmask(ji,jj,jk) + MIN(zmxlm(ji,jj,jk),fse3w(ji,jj,jk)) * (1 - wmask(ji,jj,jk)) 
    534558               END DO 
    535559            END DO 
    … …  
    537561         ! 
    538562      CASE ( 1 )           ! bounded by the vertical scale factor 
    539          DO jj = 2, jpjm1 
    540             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    541                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
     563         DO jk = 2, jpkm1 
     564            DO jj = 2, jpjm1 
     565               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    542566                  zemxl = MIN( fse3w(ji,jj,jk), zmxlm(ji,jj,jk) ) 
    543567                  zmxlm(ji,jj,jk) = zemxl 
    … …  
    548572         ! 
    549573      CASE ( 2 )           ! |dk[xml]| bounded by e3t : 
    550          DO jj = 2, jpjm1 
    551             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    552                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1         ! from the surface to the bottom : 
     574         DO jk = 2, jpkm1         ! from the surface to the bottom : 
     575            DO jj = 2, jpjm1 
     576               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    553577                  zmxlm(ji,jj,jk) = MIN( zmxlm(ji,jj,jk-1) + fse3t(ji,jj,jk-1), zmxlm(ji,jj,jk) ) 
    554578               END DO 
    555                DO jk = jpkm1, mikt(ji,jj)+1, -1     ! from the bottom to the surface : 
     579            END DO 
     580         END DO 
     581         DO jk = jpkm1, 2, -1     ! from the bottom to the surface : 
     582            DO jj = 2, jpjm1 
     583               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    556584                  zemxl = MIN( zmxlm(ji,jj,jk+1) + fse3t(ji,jj,jk+1), zmxlm(ji,jj,jk) ) 
    557585                  zmxlm(ji,jj,jk) = zemxl 
    … …  
    562590         ! 
    563591      CASE ( 3 )           ! lup and ldown, |dk[xml]| bounded by e3t : 
    564          DO jj = 2, jpjm1 
    565             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    566                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1         ! from the surface to the bottom : lup 
     592         DO jk = 2, jpkm1         ! from the surface to the bottom : lup 
     593            DO jj = 2, jpjm1 
     594               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    567595                  zmxld(ji,jj,jk) = MIN( zmxld(ji,jj,jk-1) + fse3t(ji,jj,jk-1), zmxlm(ji,jj,jk) ) 
    568596               END DO 
    569                DO jk = jpkm1, mikt(ji,jj)+1, -1     ! from the bottom to the surface : ldown 
     597            END DO 
     598         END DO 
     599         DO jk = jpkm1, 2, -1     ! from the bottom to the surface : ldown 
     600            DO jj = 2, jpjm1 
     601               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    570602                  zmxlm(ji,jj,jk) = MIN( zmxlm(ji,jj,jk+1) + fse3t(ji,jj,jk+1), zmxlm(ji,jj,jk) ) 
    571603               END DO 
    … …  
    604636               zsqen = SQRT( en(ji,jj,jk) ) 
    605637               zav   = rn_ediff * zmxlm(ji,jj,jk) * zsqen 
    606                avm  (ji,jj,jk) = MAX( zav,                  avmb(jk) ) * tmask(ji,jj,jk) 
    607                avt  (ji,jj,jk) = MAX( zav, avtb_2d(ji,jj) * avtb(jk) ) * tmask(ji,jj,jk) 
     638               avm  (ji,jj,jk) = MAX( zav,                  avmb(jk) ) * wmask(ji,jj,jk) 
     639               avt  (ji,jj,jk) = MAX( zav, avtb_2d(ji,jj) * avtb(jk) ) * wmask(ji,jj,jk) 
    608640               dissl(ji,jj,jk) = zsqen / zmxld(ji,jj,jk) 
    609641            END DO 
    … …  
    612644      CALL lbc_lnk( avm, 'W', 1. )      ! Lateral boundary conditions (sign unchanged) 
    613645      ! 
    614       DO jj = 2, jpjm1 
    615          DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    616             DO jk = miku(ji,jj)+1, jpkm1            !* vertical eddy viscosity at u- and v-points 
    617                avmu(ji,jj,jk) = 0.5 * ( avm(ji,jj,jk) + avm(ji+1,jj  ,jk) ) * umask(ji,jj,jk) 
    618             END DO 
    619             DO jk = mikv(ji,jj)+1, jpkm1 
    620                avmv(ji,jj,jk) = 0.5 * ( avm(ji,jj,jk) + avm(ji  ,jj+1,jk) ) * vmask(ji,jj,jk) 
     646      DO jk = 2, jpkm1            !* vertical eddy viscosity at wu- and wv-points 
     647         DO jj = 2, jpjm1 
     648            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     649               avmu(ji,jj,jk) = 0.5 * ( avm(ji,jj,jk) + avm(ji+1,jj  ,jk) ) * wumask(ji,jj,jk) 
     650               avmv(ji,jj,jk) = 0.5 * ( avm(ji,jj,jk) + avm(ji  ,jj+1,jk) ) * wvmask(ji,jj,jk) 
    621651            END DO 
    622652         END DO 
    … …  
    625655      ! 
    626656      IF( nn_pdl == 1 ) THEN      !* Prandtl number case: update avt 
    627          DO jj = 2, jpjm1 
    628             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    629                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
     657         DO jk = 2, jpkm1 
     658            DO jj = 2, jpjm1 
     659               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    630660                  zcoef = avm(ji,jj,jk) * 2._wp * fse3w(ji,jj,jk) * fse3w(ji,jj,jk) 
    631661                  !                                          ! shear 
    … …  
    639669!!gm and even better with the use of the "true" ri_crit=0.22222...  (this change the results!) 
    640670!!gm              zpdlr = MAX(  0.1_wp,  ri_crit / MAX( ri_crit , zri )  ) 
    641                   avt(ji,jj,jk)   = MAX( zpdlr * avt(ji,jj,jk), avtb_2d(ji,jj) * avtb(jk) ) * tmask(ji,jj,jk) 
     671                  avt(ji,jj,jk)   = MAX( zpdlr * avt(ji,jj,jk), avtb_2d(ji,jj) * avtb(jk) ) * wmask(ji,jj,jk) 
    642672# if defined key_c1d 
    643                   e_pdl(ji,jj,jk) = zpdlr * tmask(ji,jj,jk)  ! c1d configuration : save masked Prandlt number 
    644                   e_ric(ji,jj,jk) = zri   * tmask(ji,jj,jk)  ! c1d config. : save Ri 
     673                  e_pdl(ji,jj,jk) = zpdlr * wmask(ji,jj,jk)  ! c1d configuration : save masked Prandlt number 
     674                  e_ric(ji,jj,jk) = zri   * wmask(ji,jj,jk)  ! c1d config. : save Ri 
    645675# endif 
    646676              END DO 
    … …  
    749779      !                               !* set vertical eddy coef. to the background value 
    750780      DO jk = 1, jpk 
    751          avt (:,:,jk) = avtb(jk) * tmask(:,:,jk) 
    752          avm (:,:,jk) = avmb(jk) * tmask(:,:,jk) 
    753          avmu(:,:,jk) = avmb(jk) * umask(:,:,jk) 
    754          avmv(:,:,jk) = avmb(jk) * vmask(:,:,jk) 
     781         avt (:,:,jk) = avtb(jk) * wmask (:,:,jk) 
     782         avm (:,:,jk) = avmb(jk) * wmask (:,:,jk) 
     783         avmu(:,:,jk) = avmb(jk) * wumask(:,:,jk) 
     784         avmv(:,:,jk) = avmb(jk) * wvmask(:,:,jk) 
    755785      END DO 
    756786      dissl(:,:,:) = 1.e-12_wp 
    … …  
    808838           en(:,:,:) = rn_emin * tmask(:,:,:) 
    809839           DO jk = 1, jpk                           ! set the Kz to the background value 
    810               avt (:,:,jk) = avtb(jk) * tmask(:,:,jk) 
    811               avm (:,:,jk) = avmb(jk) * tmask(:,:,jk) 
    812               avmu(:,:,jk) = avmb(jk) * umask(:,:,jk) 
    813               avmv(:,:,jk) = avmb(jk) * vmask(:,:,jk) 
     840              avt (:,:,jk) = avtb(jk) * wmask (:,:,jk) 
     841              avm (:,:,jk) = avmb(jk) * wmask (:,:,jk) 
     842              avmu(:,:,jk) = avmb(jk) * wumask(:,:,jk) 
     843              avmv(:,:,jk) = avmb(jk) * wvmask(:,:,jk) 
    814844           END DO 
    815845        ENDIF 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdftmx.F90

    r5021 r5098  
    126126      zkz(:,:) = 0.e0               !* Associated potential energy consummed over the whole water column 
    127127      DO jk = 2, jpkm1 
    128          zkz(:,:) = zkz(:,:) + fse3w(:,:,jk) * MAX( 0.e0, rn2(:,:,jk) ) * rau0 * zav_tide(:,:,jk)* tmask(:,:,jk) * tmask(:,:,jk-1) 
     128         zkz(:,:) = zkz(:,:) + fse3w(:,:,jk) * MAX( 0.e0, rn2(:,:,jk) ) * rau0 * zav_tide(:,:,jk) * wmask(:,:,jk) 
    129129      END DO 
    130130 
    … …  
    135135      END DO 
    136136 
    137       DO jj = 1, jpj                !* Here zkz should be equal to en_tmx ==> multiply by en_tmx/zkz to recover en_tmx 
    138          DO ji = 1, jpi 
    139             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1     !* Mutiply by zkz to recover en_tmx, BUT bound by 30/6 ==> zav_tide bound by 300 cm2/s 
    140                zav_tide(ji,jj,jk) = zav_tide(ji,jj,jk) * MIN( zkz(ji,jj), 30./6. )   !kz max = 300 cm2/s 
     137      DO jk = 2, jpkm1     !* Mutiply by zkz to recover en_tmx, BUT bound by 30/6 ==> zav_tide bound by 300 cm2/s 
     138         DO jj = 1, jpj                !* Here zkz should be equal to en_tmx ==> multiply by en_tmx/zkz to recover en_tmx 
     139            DO ji = 1, jpi 
     140               zav_tide(ji,jj,jk) = zav_tide(ji,jj,jk) * MIN( zkz(ji,jj), 30./6. ) * wmask(ji,jj,jk)  !kz max = 300 cm2/s 
    141141            END DO 
    142142         END DO 
    … …  
    166166      !                          !   Update  mixing coefs  !                           
    167167      !                          ! ----------------------- ! 
    168       DO jj = 1, jpj                !* Here zkz should be equal to en_tmx ==> multiply by en_tmx/zkz to recover en_tmx 
    169          DO ji = 1, jpi 
    170             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1              !* update momentum & tracer diffusivity with tidal mixing 
    171                avt(ji,jj,jk) = avt(ji,jj,jk) + zav_tide(ji,jj,jk) 
    172                avm(ji,jj,jk) = avm(ji,jj,jk) + zav_tide(ji,jj,jk) 
     168      DO jk = 2, jpkm1              !* update momentum & tracer diffusivity with tidal mixing 
     169         DO jj = 1, jpj                !* Here zkz should be equal to en_tmx ==> multiply by en_tmx/zkz to recover en_tmx 
     170            DO ji = 1, jpi 
     171               avt(ji,jj,jk) = avt(ji,jj,jk) + zav_tide(ji,jj,jk) * wmask(ji,jj,jk) 
     172               avm(ji,jj,jk) = avm(ji,jj,jk) + zav_tide(ji,jj,jk) * wmask(ji,jj,jk) 
    173173            END DO 
    174174         END DO 
    175175      END DO 
    176176       
    177       DO jj = 2, jpjm1 
    178          DO ji = fs_2, fs_jpim1  ! vector opt. 
    179             DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1              !* update momentum & tracer diffusivity with tidal mixing 
    180                avmu(ji,jj,jk) = avmu(ji,jj,jk) + 0.5 * ( zav_tide(ji,jj,jk) + zav_tide(ji+1,jj  ,jk) ) * umask(ji,jj,jk) 
    181                avmv(ji,jj,jk) = avmv(ji,jj,jk) + 0.5 * ( zav_tide(ji,jj,jk) + zav_tide(ji  ,jj+1,jk) ) * vmask(ji,jj,jk) 
     177      DO jk = 2, jpkm1              !* update momentum & tracer diffusivity with tidal mixing 
     178         DO jj = 2, jpjm1 
     179            DO ji = fs_2, fs_jpim1  ! vector opt. 
     180               avmu(ji,jj,jk) = avmu(ji,jj,jk) + 0.5 * ( zav_tide(ji,jj,jk) + zav_tide(ji+1,jj  ,jk) ) * wumask(ji,jj,jk) 
     181               avmv(ji,jj,jk) = avmv(ji,jj,jk) + 0.5 * ( zav_tide(ji,jj,jk) + zav_tide(ji  ,jj+1,jk) ) * wvmask(ji,jj,jk) 
    182182            END DO 
    183183         END DO 
    … …  
    457457         ztpc = 0.e0 
    458458         zpc(:,:,:) = MAX(rn_n2min,rn2(:,:,:)) * zav_tide(:,:,:) 
    459          DO jj = 1, jpj 
    460             DO ji = 1, jpi 
    461                DO jk= mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
    462                   ztpc = ztpc + fse3w(ji,jj,jk) * e1t(ji,jj) * e2t(ji,jj) * zpc(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) * tmask_i(ji,jj) 
     459         DO jk= 2, jpkm1 
     460            DO jj = 1, jpj 
     461               DO ji = 1, jpi 
     462                  ztpc = ztpc + fse3w(ji,jj,jk) * e1t(ji,jj) * e2t(ji,jj) * zpc(ji,jj,jk) * wmask(ji,jj,jk) * tmask_i(ji,jj) 
    463463               END DO 
    464464            END DO 
    … …  
    473473         zav_tide(:,:,:) = MIN( zav_tide(:,:,:), 60.e-4 )    
    474474         zkz(:,:) = 0.e0 
    475          DO jj = 1, jpj 
    476             DO ji = 1, jpi 
    477                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
    478                zkz(ji,jj) = zkz(ji,jj) + fse3w(ji,jj,jk) * MAX( 0.e0, rn2(ji,jj,jk) ) * rau0 * zav_tide(ji,jj,jk)* tmask(ji,jj,jk) 
     475         DO jk = 2, jpkm1 
     476            DO jj = 1, jpj 
     477               DO ji = 1, jpi 
     478                  zkz(ji,jj) = zkz(ji,jj) + fse3w(ji,jj,jk) * MAX( 0.e0, rn2(ji,jj,jk) ) * rau0 * zav_tide(ji,jj,jk)* wmask(ji,jj,jk) 
    479479               END DO 
    480480            END DO 
    … …  
    498498         WRITE(numout,*) '          Min de zkz ', ztpc, ' Max = ', maxval(zkz(:,:) ) 
    499499 
    500          DO jj = 1, jpj 
    501             DO ji = 1, jpi 
    502                DO jk = mikt(ji,jj)+1, jpkm1 
    503                   zav_tide(ji,jj,jk) = zav_tide(ji,jj,jk) * MIN( zkz(ji,jj), 30./6. )   !kz max = 300 cm2/s 
     500         DO jk = 2, jpkm1 
     501            DO jj = 1, jpj 
     502               DO ji = 1, jpi 
     503                  zav_tide(ji,jj,jk) = zav_tide(ji,jj,jk) * MIN( zkz(ji,jj), 30./6. ) * wmask(ji,jj,jk)  !kz max = 300 cm2/s 
    504504               END DO 
    505505            END DO 
    … …  
    510510            DO jj = 1, jpj 
    511511               DO ji = 1, jpi 
    512                   ztpc = ztpc + fse3w(ji,jj,jk) * e1t(ji,jj) * e2t(ji,jj) * zpc(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) * tmask_i(ji,jj) 
     512                  ztpc = ztpc + fse3w(ji,jj,jk) * e1t(ji,jj) * e2t(ji,jj) * zpc(ji,jj,jk) * wmask(ji,jj,jk) * tmask_i(ji,jj) 
    513513               END DO 
    514514            END DO 
    … …  
    519519         DO jk = 1, jpk 
    520520            ze_z =                  SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * zav_tide(:,:,jk)     * tmask_i(:,:) )   & 
    521                &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * tmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
     521               &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * wmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
    522522            ztpc = 1.E50 
    523523            DO jj = 1, jpj 
    … …  
    540540            END DO 
    541541            ze_z =                  SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * zkz(:,:)     * tmask_i(:,:) )   & 
    542                &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * tmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
     542               &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * wmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
    543543            WRITE(numout,*) '                jk= ', jk,'   ', ze_z * 1.e4,' cm2/s' 
    544544         END DO 
    … …  
    546546            zkz(:,:) = az_tmx(:,:,jk) /rn_n2min 
    547547            ze_z =                  SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * zkz(:,:)     * tmask_i(:,:) )   & 
    548                &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * tmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
     548               &     / MAX( 1.e-20, SUM( e1t(:,:) * e2t(:,:) * wmask (:,:,jk) * tmask_i(:,:) ) ) 
    549549            WRITE(numout,*)  
    550550            WRITE(numout,*) '          N2 min - jk= ', jk,'   ', ze_z * 1.e4,' cm2/s min= ',MINVAL(zkz)*1.e4,   & 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/step.F90

    r5012 r5098  
    122122      IF( lk_zdfkpp  )   CALL zdf_kpp( kstp )            ! KPP closure scheme for Kz 
    123123      IF( lk_zdfcst  ) THEN                              ! Constant Kz (reset avt, avm[uv] to the background value) 
    124          avt (:,:,:) = rn_avt0 * tmask(:,:,:) 
    125          avmu(:,:,:) = rn_avm0 * umask(:,:,:) 
    126          avmv(:,:,:) = rn_avm0 * vmask(:,:,:) 
     124         avt (:,:,:) = rn_avt0 * wmask (:,:,:) 
     125         avmu(:,:,:) = rn_avm0 * wumask(:,:,:) 
     126         avmv(:,:,:) = rn_avm0 * wvmask(:,:,:) 
    127127      ENDIF 
    128128      IF( ln_rnf_mouth ) THEN                         ! increase diffusivity at rivers mouths 
    … …  
    145145      ! 
    146146      IF( lk_ldfslp ) THEN                            ! slope of lateral mixing 
    147                          CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )             ! before in situ density 
    148          IF( ln_zps )    CALL zps_hde( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    149             &                                      rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   &             ! 
    150             &                               gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     147                         CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )               ! before in situ density 
     148         IF( ln_zps )    CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient 
     149            &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     150         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     151            &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     152            &                                          rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     153            &                                   gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the first ocean level 
    151154         IF( ln_traldf_grif ) THEN                           ! before slope for Griffies operator 
    152155                         CALL ldf_slp_grif( kstp ) 
    … …  
    177180          ! is necessary to compute momentum advection for the rhs of barotropic loop: 
    178181                            CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) ) ! now in situ density for hpg computation 
    179             IF( ln_zps )    CALL zps_hde( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    180                &                                      rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   &             ! 
    181                &                               gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     182            IF( ln_zps )    CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     183               &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     184            IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     185               &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     186               &                                          rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     187               &                                   gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    182188 
    183189                                  ua(:,:,:) = 0.e0             ! set dynamics trends to zero 
    … …  
    253259                             CALL tra_nxt( kstp )                ! tracer fields at next time step 
    254260                             CALL eos    ( tsa, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) )  ! Time-filtered in situ density for hpg computation 
    255          IF( ln_zps      )   CALL zps_hde( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    256             &                                      rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   &             ! 
    257             &                               gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     261            IF( ln_zps )     CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     262               &                                           rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     263            IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     264               &             CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     265               &                                           rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     266               &                                    gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    258267      ELSE                                                  ! centered hpg  (eos then time stepping) 
    259268         IF ( .NOT. lk_dynspg_ts ) THEN                     ! eos already called in time-split case 
    260269                             CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) )  ! now in situ density for hpg computation 
    261          IF( ln_zps      )   CALL zps_hde( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &        ! Partial steps: before horizontal gradient 
    262          &                                      rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   &             ! 
    263          &                               gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi  )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     270         IF( ln_zps )        CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     271            &                                              rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     272         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     273               &             CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     274               &                                           rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     275               &                                    gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    264276         ENDIF 
    265277         IF( ln_zdfnpc   )   CALL tra_npc( kstp )                ! update after fields by non-penetrative convection 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trctrp.F90

    r4990 r5098  
    8282      IF( .NOT. Agrif_Root())   CALL Agrif_Update_Trc( kstp )   ! Update tracer at AGRIF zoom boundaries : children only 
    8383#endif 
    84          IF( ln_zps    )        CALL zps_hde( kstp, jptra, trn, pgtu=gtru, pgtv=gtrv, sgtu=gtrui, sgtv=gtrvi )  ! Partial steps: now horizontal gradient of passive 
     84 
     85         IF( ln_zps )    CALL zps_hde    ( kstp, jptra, trn, gtru, gtrv )   ! Partial steps: now horizontal gradient of passive 
     86         IF( ln_zps .AND. ln_isfcav) & 
     87            &            CALL zps_hde_isf( kstp, jptra, trn, pgtu=gtru, pgtv=gtrv, pgtui=gtrui, pgtvi=gtrvi )  ! Partial steps: now horizontal gradient of passive 
    8588                                                                ! tracers at the bottom ocean level 
    8689         ! 

  • branches/2015/dev_r5094_UKMO_ISFCLEAN/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcini.F90

    r4990 r5098  
    144144      tra(:,:,:,:) = 0._wp 
    145145      IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d )   &              ! Partial steps: before horizontal gradient of passive 
    146         &    CALL zps_hde( nit000, jptra, trn, pgtu=gtru, pgtv=gtrv, sgtu=gtrui, sgtv=gtrvi )       ! tracers at the bottom ocean level 
     146        &    CALL zps_hde    ( nit000, jptra, trn, gtru, gtrv  )  ! Partial steps: before horizontal gradient 
     147      IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND. ln_isfcav) & 
     148        &    CALL zps_hde_isf( nit000, jptra, trn, pgtu=gtru, pgtv=gtrv, pgtui=gtrui, pgtvi=gtrvi )       ! tracers at the bottom ocean level 
     149 
    147150 
    148151      ! 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.