Changeset 5988


Ignore:
Timestamp:
2015-12-02T19:23:34+01:00 (5 years ago)
Author:
nicolasmartin
Message:

dev_r5092_CNRS18_TRUST Bug correction & updating trusting namelists

Location:
branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST
Files:
1 added
5 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST/inc/trusting_func.sh

    r5934 r5988  
    123123    ${get_io} > /dev/null 
    124124    [ $? -ne 0 ] && get_out 3 || echo 'Success' 
    125     [ $( find -name '*.gz' -print -quit ) ] && gunzip *.gz 
     125    [ $( find -name '*.gz' -print -quit ) ] && find . -name '*.gz' -exec gzip -d {} \; 
    126126 
    127127    ls -lh > inputs_list.txt 
  • branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST/inputs/AMM12/namelist_cfg

    r5703 r5988  
    1414   cn_ocerst_in   = "amm12_restart_oce" !  suffix of ocean restart name (input) 
    1515   cn_ocerst_out  = "restart_oce_out"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    16    nn_stock    =    1296         !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    17    nn_write    =     144         !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000)  
     16   nn_stock    =    1296         !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     17   nn_write    =     144         !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000)  
    1818/ 
    1919!----------------------------------------------------------------------- 
     
    7373/ 
    7474!----------------------------------------------------------------------- 
    75 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    76 !----------------------------------------------------------------------- 
    77    ln_bt_nn_auto =    .FALSE.          !  Set nn_baro automatically to be just below 
    78                                        !  a user defined maximum courant number (rn_bt_cmax) 
    79    nn_baro       =    30               !  Number of iterations of barotropic mode 
    80 / 
    81 !----------------------------------------------------------------------- 
    8275&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    8376               !   passive tracer coarsened online simulations 
     
    195188   rn_shlat    =     0     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
    196189                           !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    197 / 
    198 !----------------------------------------------------------------------- 
    199 &namcla        !   cross land advection 
    200 !----------------------------------------------------------------------- 
    201 / 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
    203 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    204 !----------------------------------------------------------------------- 
    205190/ 
    206191!----------------------------------------------------------------------- 
     
    282267&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    283268!----------------------------------------------------------------------- 
     269   ln_traadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     270      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     271      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     272      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     273      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    284274/ 
    285275!----------------------------------------------------------------------- 
     
    290280&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    291281!---------------------------------------------------------------------------------- 
    292    ln_traldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    293    ln_traldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
    294    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    295    rn_aht_0         =    50.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     282   !                       !  Operator type: 
     283   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     284   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     285   !                       !  Direction of action: 
     286   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     287   ln_traldf_hor   =  .true.   !  horizontal (geopotential) 
     288   ln_traldf_iso   =  .false.  !  iso-neutral 
     289   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral using Griffies triads 
     290   ! 
     291   !                       !  iso-neutral options:         
     292   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     293   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     294   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML     (triad only) 
     295   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     296   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom         (triad only) 
     297   ! 
     298   !                       !  Coefficients: 
     299   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     300   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     301   !                                !   =  0           constant  
     302   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     303   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     304   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     305   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     306   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     307   rn_aht_0        =   50.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     308   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     309/ 
     310!---------------------------------------------------------------------------------- 
     311&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     312!---------------------------------------------------------------------------------- 
     313   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    296314/ 
    297315!----------------------------------------------------------------------- 
     
    307325&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    308326!----------------------------------------------------------------------- 
     327   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     328   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     329   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     330   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     331      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    309332/ 
    310333!----------------------------------------------------------------------- 
     
    315338/ 
    316339!----------------------------------------------------------------------- 
    317 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    318 !----------------------------------------------------------------------- 
    319 !                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp") 
    320 !                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt") 
    321 !                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts") 
    322  
     340&namdyn_spg    !   surface pressure gradient  
     341!----------------------------------------------------------------------- 
     342   ln_dynspg_ts   = .true.    ! split-explicit free surface 
     343      ln_bt_auto    = .false.   ! Number of sub-step defined from: 
     344         nn_baro      = 30        ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds 
     345/ 
    323346!----------------------------------------------------------------------- 
    324347&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    325348!----------------------------------------------------------------------- 
    326349   !                       !  Type of the operator : 
    327    ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator 
    328    ln_dynldf_lap    =  .false.  !  bilaplacian operator 
     350   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     351   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     352   ln_dynldf_blp =  .true.     !  bilaplacian operator 
    329353   !                       !  Direction of action  : 
    330    ln_dynldf_level  =  .true.   !  iso-level 
    331    ln_dynldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    332                            !  Coefficient 
    333    rn_ahm_0_lap     = 60.0      !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    334    rn_ahm_0_blp     = -1.0e+10  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     354   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     355   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     356   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     357   !                       !  Coefficient 
     358   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     359   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     360   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     361   !                                !  =  0  constant  
     362   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     363   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     364   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     365   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     366   rn_ahm_0      =     60.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     367   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     368   rn_bhm_0      = 1.0e+10     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     369   ! 
     370   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
    335371/ 
    336372!----------------------------------------------------------------------- 
     
    350386!----------------------------------------------------------------------- 
    351387/ 
    352 !------------------------------------------------------------------------ 
    353 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    354 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    355 / 
    356388!----------------------------------------------------------------------- 
    357389&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     
    370402/ 
    371403!----------------------------------------------------------------------- 
    372 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    373 !----------------------------------------------------------------------- 
    374 / 
    375 !----------------------------------------------------------------------- 
    376404&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    377405!----------------------------------------------------------------------- 
     
    425453!----------------------------------------------------------------------- 
    426454/ 
    427 !----------------------------------------------------------------------- 
    428 &namsto       ! Stochastic parametrization of EOS 
    429 !----------------------------------------------------------------------- 
    430 / 
    431 !----------------------------------------------------------------------- 
    432 &nam_vvl    !   vertical coordinate options 
    433 !----------------------------------------------------------------------- 
    434 / 
  • branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST/inputs/ORCA2_LIM_PISCES/namelist_cfg

    r5703 r5988  
    5353/ 
    5454!----------------------------------------------------------------------- 
    55 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    56 !----------------------------------------------------------------------- 
    57 / 
    58 !----------------------------------------------------------------------- 
    5955&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    6056               !   passive tracer coarsened online simulations 
     
    9995/ 
    10096!----------------------------------------------------------------------- 
    101 &namcla        !   cross land advection 
    102 !----------------------------------------------------------------------- 
    103 / 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
    10597&nambfr        !   bottom friction 
    10698!----------------------------------------------------------------------- 
     
    121113&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    122114!----------------------------------------------------------------------- 
     115   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     116      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     117      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     118      nn_fct_zts =  0               !  > 1 , 2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     119      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    123120/ 
    124121!----------------------------------------------------------------------- 
     
    126123!----------------------------------------------------------------------- 
    127124/ 
    128 !----------------------------------------------------------------------- 
    129 &namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    130 !----------------------------------------------------------------------- 
    131 / 
    132125!---------------------------------------------------------------------------------- 
    133126&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    134127!---------------------------------------------------------------------------------- 
     128   !                       !  Operator type: 
     129   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     130   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     131   !                       !  Direction of action: 
     132   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     133   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     134   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     135   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     136   ! 
     137   !                       !  iso-neutral options:         
     138   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     139   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     140   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     141   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     142   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     143   ! 
     144   !                       !  Coefficients: 
     145   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     146   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     147   !                                !   =  0           constant 
     148   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     149   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     150   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     151   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     152   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     153   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     154   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     155/ 
     156!---------------------------------------------------------------------------------- 
     157&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     158!---------------------------------------------------------------------------------- 
     159   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     160   ln_ldfeiv_dia =.true.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     161   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     162   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     163   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     164   !                                !   =  0           constant 
     165   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     166   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     167   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     168   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    135169/ 
    136170!----------------------------------------------------------------------- 
     
    145179&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    146180!----------------------------------------------------------------------- 
     181   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     182   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     183   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     184   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     185      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    147186/ 
    148187!----------------------------------------------------------------------- 
     
    151190/ 
    152191!----------------------------------------------------------------------- 
     192&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
     194   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     195/ 
     196!----------------------------------------------------------------------- 
    153197&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    154198!----------------------------------------------------------------------- 
     199   !                       !  Type of the operator : 
     200   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     201   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     202   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     203   !                       !  Direction of action  : 
     204   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     205   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     206   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     207   !                       !  Coefficient 
     208   nn_ahm_ijk_t  = -30         !  space/time variation of eddy coef 
     209   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     210   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     211   !                                !  =  0  constant  
     212   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     213   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     214   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     215   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     216   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     217   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     218   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    155219/ 
    156220!----------------------------------------------------------------------- 
     
    169233&namzdf_tmx    !   tidal mixing parameterization                        ("key_zdftmx") 
    170234!----------------------------------------------------------------------- 
    171 / 
    172 !----------------------------------------------------------------------- 
    173 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    174 !----------------------------------------------------------------------- 
    175    nn_solv     =       2               !  elliptic solver: =2 successive-over-relaxation (sor) 
    176235/ 
    177236!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST/inputs/ORCA2_LIM_PISCES/namelist_top_cfg

    r5703 r5988  
    55&namtrc_run     !   run information 
    66!----------------------------------------------------------------------- 
    7 !   ln_top_euler  = .true.    !  use Euler time-stepping for TOP 
    87/ 
    98!----------------------------------------------------------------------- 
     
    6463&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    6564!----------------------------------------------------------------------- 
    66    ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
    67    ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
     65   ln_trcadv_mus  =  .true.  !  MUSCL scheme 
     66      ln_mus_ups  =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    6867/ 
    6968!----------------------------------------------------------------------- 
     
    8887!----------------------------------------------------------------------- 
    8988/ 
    90 !----------------------------------------------------------------------- 
    91 &namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    
    92 !----------------------------------------------------------------------- 
    93 / 
    94 !----------------------------------------------------------------------- 
    9589&namtrc_ice       !    Representation of sea ice growth & melt effects 
    9690!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5092_CNRS18_TRUST/NEMOGCM/TRUST/trusting.sh

    r5934 r5988  
    5454    ## If -v|--version option has been set, modify default SVN action on directories 
    5555    if   [ $( echo ${TRUS_SVNV} | grep  "HEAD\|up\|update"                     ) ]; then 
    56    TRUS_SVNA='svn update -r HEAD' 
     56   TRUS_SVNA='svn update -r HEAD --accept=theirs-conflict' 
    5757    elif [ $( echo ${TRUS_SVNV} | grep -o '{[0-9]\{4\}-[0-9]\{2\}-[0-9]\{2\}}' ) ]; then 
    5858   TRUS_SVNA='svn update -r     '$( echo ${TRUS_SVNV} | grep -o '{[0-9]\{4\}-[0-9]\{2\}-[0-9]\{2\}}' ) 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.