New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 7261 for branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2016-11-18T09:34:22+01:00 (7 years ago)
Author:
cbricaud
Message:

phaze the rest of NEMOGCM directory ( all except NEMO directory) of the CRS branch with nemo_v3_6_STABLE branch at rev 7213 (09-09-2016) (merge -r 5519:7213 )

Location:
branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG
Files:
1 added
19 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/EXP00/namelist_cfg

    r5602 r7261  
    200200/ 
    201201!----------------------------------------------------------------------- 
    202 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    203 !----------------------------------------------------------------------- 
    204 / 
    205 !----------------------------------------------------------------------- 
    206202&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    207203!----------------------------------------------------------------------- 
     
    369365/ 
    370366!----------------------------------------------------------------------- 
     367&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
     369/ 
     370!----------------------------------------------------------------------- 
    371371&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    372372!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/C1D_PAPA/EXP00/namelist_cfg

    r5602 r7261  
    141141&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    142142!----------------------------------------------------------------------- 
     143!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     144!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     145   sn_chl      ='chlorophyll_PAPASTATION', -1    , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    143146/ 
    144147!----------------------------------------------------------------------- 
     
    173176!----------------------------------------------------------------------- 
    174177&namcla        !   cross land advection 
    175 !----------------------------------------------------------------------- 
    176 / 
    177 !----------------------------------------------------------------------- 
    178 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    179178!----------------------------------------------------------------------- 
    180179/ 
     
    304303/ 
    305304!----------------------------------------------------------------------- 
     305&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     306!----------------------------------------------------------------------- 
     307/ 
     308!----------------------------------------------------------------------- 
    306309&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    307310!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/namelist_cfg

    r5602 r7261  
    160160/ 
    161161!----------------------------------------------------------------------- 
    162 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    163 !----------------------------------------------------------------------- 
    164 / 
    165 !----------------------------------------------------------------------- 
    166162&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    167163!----------------------------------------------------------------------- 
     
    304300/ 
    305301!----------------------------------------------------------------------- 
     302&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     303!----------------------------------------------------------------------- 
     304/ 
     305!----------------------------------------------------------------------- 
    306306&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    307307!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/namelist_cfg

    r5602 r7261  
    165165/ 
    166166!----------------------------------------------------------------------- 
    167 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 / 
    170 !----------------------------------------------------------------------- 
    171167&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    172168!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/cpp_GYRE_XIOS.fcm

    r4373 r7261  
    1  bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 
     1 bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi key_xios2 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist_cfg

    r5602 r7261  
    66!----------------------------------------------------------------------- 
    77   cn_exp      = "Agulhas" !  experience name  
    8    nn_itend    =     480   !  last  time step 
     8   nn_itend    =   10950   !  last  time step 
    99   nn_stock    =   10950   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1010   nn_write    =   10950   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef.xml

    r5602 r7261  
    153153  </context> 
    154154   
     155 <context id="1_nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
     156     
     157    <!-- $id$ --> 
     158     
     159    <!--  
     160============================================================================================================ 
     161=                                  definition of all existing variables                                    = 
     162=                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
     163============================================================================================================ 
     164    --> 
     165    <field_definition src="./field_def.xml"/> 
     166    <!--  
     167============================================================================================================ 
     168=                                           output files definition                                        = 
     169=                                            Define your own files                                         = 
     170=                                         put the variables you want...                                    = 
     171============================================================================================================ 
     172    --> 
     173     
     174    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
     175     
     176      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     177      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     178      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
     179      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
     180      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
     181      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
     182      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
     183      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
     184 
     185      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE." >  <!-- 5d files -->   
     186  
     187   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     188     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
     189     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     190     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     191     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
     192     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
     193     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
     194     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
     195     <field field_ref="mldkz5"       /> 
     196     <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     197     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     198     <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
     199     <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
     200     <field field_ref="saltflx"      name="sosflxdo"  /> 
     201     <field field_ref="taum"         name="taum" /> 
     202     <field field_ref="wspd"         name="sowindsp"  /> 
     203          <field field_ref="precip"       name="soprecip" /> 
     204   </file> 
     205 
     206   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     207     <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     208     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
     209     <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     210          <!-- variables available with MLE 
     211          <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
     212     --> 
     213   </file> 
     214    
     215   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     216     <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     217     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
     218     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     219          <!-- variables available with MLE 
     220          <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
     221     --> 
     222   </file> 
     223    
     224   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
     225     <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
     226     <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
     227   </file> 
     228<!-- 
     229   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
     230     <field field_ref="ice_pres"                     /> 
     231     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
     232     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
     233     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
     234     <field field_ref="ist_ipa"      /> 
     235     <field field_ref="uice_ipa"     /> 
     236     <field field_ref="vice_ipa"     /> 
     237     <field field_ref="utau_ice"     /> 
     238     <field field_ref="vtau_ice"     /> 
     239     <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
     240     <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
     241     <field field_ref="snowpre"      /> 
     242   </file> 
     243 
     244   <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
     245     <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
     246     <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
     247     <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
     248     <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
     249     <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
     250     <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
     251   </file> 
     252   --> 
     253      </file_group> 
     254 
     255 
     256      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
     257 
     258 
     259      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
     260      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
     261      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
     262      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
     263 
     264      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
     265      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
     266      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
     267      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
     268 
     269   </file_definition> 
     270     
     271    <!--  
     272============================================================================================================ 
     273= grid definition = = DO NOT CHANGE = 
     274============================================================================================================ 
     275    --> 
     276     
     277   <axis_definition>   
     278      <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
     279      <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
     280      <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
     281      <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
     282      <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
     283      <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     284   </axis_definition>  
     285     
     286   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
     287    
     288   <grid_definition>     
     289     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
     290     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
     291     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
     292     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
     293     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
     294     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
     295     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
     296     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     297    </grid_definition>    
     298  </context> 
    155299 
    156300  <context id="xios"> 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist_cfg

    r4990 r7261  
    165165/ 
    166166!----------------------------------------------------------------------- 
     167&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     168!----------------------------------------------------------------------- 
     169/ 
     170!----------------------------------------------------------------------- 
    167171&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    168172!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/iodef.xml

    r5602 r7261  
    6161   <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    6262     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     63          <field field_ref="emp_oce"      name="emp_oce"  long_name="Evap minus Precip over ocean"              /> 
     64          <field field_ref="emp_ice"      name="emp_ice"  long_name="Evap minus Precip over ice"                /> 
    6365     <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
    6466     <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
     
    8688     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" /> 
    8789     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" /> 
    88       <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" /> 
     90     <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" /> 
    8991   </file> 
    9092    
     
    9799     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
    98100     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
    99       <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
     101     <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
    100102   </file> 
    101103    
     
    114116          <field field_ref="iceconc"         name="siconc" /> 
    115117 
    116           <field field_ref="vfxbog"          name="vfxbog" /> 
    117           <field field_ref="vfxdyn"          name="vfxdyn" /> 
    118           <field field_ref="vfxopw"          name="vfxopw" /> 
    119           <field field_ref="vfxsni"          name="vfxsni" /> 
    120           <field field_ref="vfxsum"          name="vfxsum" /> 
    121           <field field_ref="vfxbom"          name="vfxbom" /> 
    122           <field field_ref="vfxres"          name="vfxres" /> 
    123118          <field field_ref="vfxice"          name="vfxice" /> 
    124119          <field field_ref="vfxsnw"          name="vfxsnw" /> 
    125120          <field field_ref="vfxsub"          name="vfxsub" /> 
     121          <field field_ref="vfxsub_err"      name="vfxsub_err" /> 
    126122          <field field_ref="vfxspr"          name="vfxspr" /> 
    127123 
     
    132128          <field field_ref="destrp"          name="destrp" /> 
    133129 
    134           <field field_ref="sfxbri"          name="sfxbri" /> 
    135           <field field_ref="sfxdyn"          name="sfxdyn" /> 
    136           <field field_ref="sfxres"          name="sfxres" /> 
    137           <field field_ref="sfxbog"          name="sfxbog" /> 
    138           <field field_ref="sfxbom"          name="sfxbom" /> 
    139           <field field_ref="sfxsum"          name="sfxsum" /> 
    140           <field field_ref="sfxsni"          name="sfxsni" /> 
    141           <field field_ref="sfxopw"          name="sfxopw" /> 
    142130          <field field_ref="sfx"             name="sfx"    /> 
    143131 
    144           <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"     /> 
    145           <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"     /> 
    146           <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"     /> 
    147           <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"     /> 
    148           <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"     /> 
    149132          <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"     /> 
    150133          <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"      /> 
    151           <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"     /> 
    152           <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"     /> 
    153           <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem" /> 
    154  
    155      <!-- ice-ocean heat flux from mass exchange --> 
    156           <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn" /> 
    157           <field field_ref="hfxres"          name="hfxres" /> 
    158           <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd" /> 
    159      <!-- ice-atm. heat flux from mass exchange --> 
    160           <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub" /> 
    161           <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr" /> 
     134 
    162135 
    163136     <!-- diags --> 
    164           <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc" /> 
    165           <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur" /> 
    166  
    167137          <field field_ref="isst"            name="sst"    /> 
    168138          <field field_ref="isss"            name="sss"    /> 
     
    207177          <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   /> 
    208178          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   /> 
     179          <field field_ref="bgheatfx"     name="bgheatfx"   /> 
    209180          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   /> 
    210181          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />  
     
    212183          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   /> 
    213184          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   /> 
     185          <field field_ref="bgfrchfx"     name="bgfrchfx"   /> 
    214186          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   /> 
    215187 
    216           <field field_ref="ibgvoltot"    name="ibgvoltot"  /> 
    217           <field field_ref="sbgvoltot"    name="sbgvoltot"  /> 
    218           <field field_ref="ibgarea"      name="ibgarea"    /> 
    219           <field field_ref="ibgsaline"    name="ibgsaline"  /> 
    220           <field field_ref="ibgtemper"    name="ibgtemper"  /> 
    221           <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"  /> 
    222           <field field_ref="sbgheatco"    name="sbgheatco"  /> 
    223           <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"  /> 
    224  
    225           <field field_ref="ibgvfx"       name="ibgvfx"     /> 
    226           <field field_ref="ibgvfxbog"    name="ibgvfxbog"  /> 
    227           <field field_ref="ibgvfxopw"    name="ibgvfxopw"  /> 
    228           <field field_ref="ibgvfxsni"    name="ibgvfxsni"  /> 
    229           <field field_ref="ibgvfxdyn"    name="ibgvfxdyn"  /> 
    230           <field field_ref="ibgvfxbom"    name="ibgvfxbom"  /> 
    231           <field field_ref="ibgvfxsum"    name="ibgvfxsum"  /> 
    232           <field field_ref="ibgvfxres"    name="ibgvfxres"  /> 
    233           <field field_ref="ibgvfxspr"    name="ibgvfxspr"  /> 
    234           <field field_ref="ibgvfxsnw"    name="ibgvfxsnw"  /> 
    235           <field field_ref="ibgvfxsub"    name="ibgvfxsub"  /> 
    236  
    237           <field field_ref="ibgsfx"       name="ibgsfx"     /> 
    238           <field field_ref="ibgsfxbri"    name="ibgsfxbri"  /> 
    239           <field field_ref="ibgsfxdyn"    name="ibgsfxdyn"  /> 
    240           <field field_ref="ibgsfxres"    name="ibgsfxres"  /> 
    241           <field field_ref="ibgsfxbog"    name="ibgsfxbog"  /> 
    242           <field field_ref="ibgsfxopw"    name="ibgsfxopw"  /> 
    243           <field field_ref="ibgsfxsni"    name="ibgsfxsni"  /> 
    244           <field field_ref="ibgsfxbom"    name="ibgsfxbom"  /> 
    245           <field field_ref="ibgsfxsum"    name="ibgsfxsum"  /> 
    246  
    247           <field field_ref="ibghfxdhc"    name="ibghfxdhc"  /> 
    248           <field field_ref="ibghfxspr"    name="ibghfxspr"  /> 
    249  
    250           <field field_ref="ibghfxres"    name="ibghfxres"  /> 
    251           <field field_ref="ibghfxsub"    name="ibghfxsub"  /> 
    252           <field field_ref="ibghfxdyn"    name="ibghfxdyn"  /> 
    253           <field field_ref="ibghfxthd"    name="ibghfxthd"  /> 
    254           <field field_ref="ibghfxsum"    name="ibghfxsum"  /> 
    255           <field field_ref="ibghfxbom"    name="ibghfxbom"  /> 
    256           <field field_ref="ibghfxbog"    name="ibghfxbog"  /> 
    257           <field field_ref="ibghfxdif"    name="ibghfxdif"  /> 
    258           <field field_ref="ibghfxopw"    name="ibghfxopw"  /> 
    259           <field field_ref="ibghfxout"    name="ibghfxout"  /> 
    260           <field field_ref="ibghfxin"     name="ibghfxin"   /> 
    261           <field field_ref="ibghfxsnw"    name="ibghfxsnw"  /> 
    262  
    263           <field field_ref="ibgfrcvol"    name="ibgfrcvol"  /> 
    264           <field field_ref="ibgfrcsfx"    name="ibgfrcsfx"  /> 
    265           <field field_ref="ibgvolgrm"    name="ibgvolgrm"  /> 
     188     <field field_ref="ibgvol_tot"   name="ibgvol_tot"  /> 
     189     <field field_ref="sbgvol_tot"   name="sbgvol_tot"  /> 
     190     <field field_ref="ibgarea_tot"  name="ibgarea_tot" /> 
     191     <field field_ref="ibgsalt_tot"  name="ibgsalt_tot" /> 
     192     <field field_ref="ibgheat_tot"  name="ibgheat_tot" /> 
     193     <field field_ref="sbgheat_tot"  name="sbgheat_tot" /> 
     194      
     195     <field field_ref="ibgvolume"    name="ibgvolume"   /> 
     196     <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"   /> 
     197     <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"   /> 
     198          <field field_ref="ibgheatfx"    name="ibgheatfx"   /> 
     199      
     200     <field field_ref="ibgfrcvoltop" name="ibgfrcvoltop" /> 
     201     <field field_ref="ibgfrcvolbot" name="ibgfrcvolbot" /> 
     202     <field field_ref="ibgfrctemtop" name="ibgfrctemtop" /> 
     203     <field field_ref="ibgfrctembot" name="ibgfrctembot" /> 
     204     <field field_ref="ibgfrcsal"    name="ibgfrcsal"    /> 
     205          <field field_ref="ibgfrchfxtop" name="ibgfrchfxtop" /> 
     206          <field field_ref="ibgfrchfxbot" name="ibgfrchfxbot" /> 
    266207 
    267208        </file> 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/namelist_cfg

    r4995 r7261  
    168168/ 
    169169!----------------------------------------------------------------------- 
     170&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     171!----------------------------------------------------------------------- 
     172/ 
     173!----------------------------------------------------------------------- 
    170174&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    171175!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/1_namelist_cfg

    r5602 r7261  
    55!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf,  
    66!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    7 !!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     7!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    88!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
    99!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp) 
     
    303303!!   namlbc        lateral momentum boundary condition 
    304304!!   namcla        cross land advection 
    305 !!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    306305!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif")  
    307306!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy") 
     
    319318!----------------------------------------------------------------------- 
    320319   nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
    321 / 
    322 !----------------------------------------------------------------------- 
    323 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    324 !----------------------------------------------------------------------- 
    325    ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    326    ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    327    ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition  
    328    nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    329                            !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    330    cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    331                            !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    332    rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    333    rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    334    rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    335    rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    336    rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    337    rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    338    rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    339    rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    340    rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    341                            !  = 1 the total volume remains constant 
    342320/ 
    343321!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/namelist_cfg

    r5602 r7261  
    136136/ 
    137137!----------------------------------------------------------------------- 
    138 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    139 !----------------------------------------------------------------------- 
    140 / 
    141 !----------------------------------------------------------------------- 
    142138&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    143139!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r7261  
    165165/ 
    166166!----------------------------------------------------------------------- 
     167&namzdf_tmx_new !  new tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx_new") 
     168!----------------------------------------------------------------------- 
     169/ 
     170!----------------------------------------------------------------------- 
    167171&namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    168172!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def.xml

    r6787 r7261  
    2323      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    2424         <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"   standard_name="cell_thickness"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     25         <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"   standard_name="ref_cell_thickness"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
    2526 
    2627         <field id="toce"         long_name="temperature"         standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     
    6970         <field id="alpha"        long_name="thermal expansion"                                                         unit="degC-1" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    7071         <field id="beta"         long_name="haline contraction"                                                        unit="1e3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    71          <field id="bn2"          long_name="squared Brunt-Vaisala frequency"                                           unit="s-1"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    7272         <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"        standard_name="sea_water_sigma_theta"   unit="kg/m3"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    7373 
     
    186186      <field_group id="SBC" grid_ref="grid_T_2D" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    187187         <field id="empmr"        long_name="Net Upward Water Flux"                standard_name="water_flux_out_of_sea_ice_and_sea_water"                              unit="kg/m2/s"   /> 
     188         <field id="empbmr"       long_name="Net Upward Water Flux at pre. tstep"  standard_name="water_flux_out_of_sea_ice_and_sea_water"                              unit="kg/m2/s"   /> 
     189         <field id="emp_oce"      long_name="Evap minus Precip over ocean"         standard_name="evap_minus_precip_over_sea_water"                                     unit="kg/m2/s"   /> 
     190         <field id="emp_ice"      long_name="Evap minus Precip over ice"           standard_name="evap_minus_precip_over_sea_ice"                                       unit="kg/m2/s"   /> 
    188191         <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                                                                                        unit="1e-3/m2/s" /> 
    189192         <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                                                                                        unit="kg/m2/s"   /> 
     
    235238         <field id="hflx_rain_cea" long_name="heat flux due to rainfall"                                standard_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        unit="W/m2"     /> 
    236239         <field id="hflx_evap_cea" long_name="heat flux due to evaporation"                             standard_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water"   unit="W/m2"     /> 
    237          <field id="hflx_snow_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"        standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                           unit="W/m2"     /> 
     240         <field id="hflx_snow_cea" long_name="heat flux due to snow falling"                            standard_name="heat_flux_onto_ocean_and_ice_due_to_snow_thermodynamics"                       unit="W/m2"     /> 
     241         <field id="hflx_snow_ai_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice"                standard_name="heat_flux_onto_ice_due_to_snow_thermodynamics"                                 unit="W/m2"     /> 
     242         <field id="hflx_snow_ao_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"     standard_name="heat_flux_onto_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                           unit="W/m2"     /> 
    238243         <field id="hflx_ice_cea"  long_name="heat flux due to ice thermodynamics"                      standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                        unit="W/m2"     /> 
    239244         <field id="hflx_rnf_cea"  long_name="heat flux due to runoffs"                                 standard_name="temperature_flux_due_to_runoff_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"          unit="W/m2"     /> 
     
    273278         <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                                                                                              unit="kg*degC/m2/s" /> 
    274279         <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                                                                                              unit="kg*1e-3/m2/s" />         
     280         <field id="rnf_x_sst"    long_name="Runoff term on SST"                                                                                                              unit="kg*degC/m2/s" /> 
     281         <field id="rnf_x_sss"    long_name="Runoff term on SSS"                                                                                                              unit="kg*1e-3/m2/s" /> 
    275282        
    276283         <field id="iceconc"      long_name="ice concentration"                                            standard_name="sea_ice_area_fraction"                              unit="%"            /> 
     
    287294         <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                                                                                               unit="1e-3"         /> 
    288295         <field id="miceage"      long_name="Mean ice age"                                                                                                                    unit="years"        /> 
     296         <field id="alb_ice"      long_name="Mean albedo over sea ice"                                                                                                        unit=""             /> 
     297         <field id="albedo"       long_name="Mean albedo over sea ice and ocean"                                                                                              unit=""             /> 
    289298 
    290299         <field id="iceage_cat"   long_name="Ice age for categories"                                       unit="days"   axis_ref="ncatice" /> 
     
    324333         <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    325334         <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     335         <field id="sfxsub"       long_name="salt flux from sublimation"                                   unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    326336         <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    327337 
     
    336346         <field id="vfxsnw"       long_name="snw melt/growth"                                              unit="m/day"   /> 
    337347         <field id="vfxsub"       long_name="snw sublimation"                                              unit="m/day"   /> 
     348         <field id="vfxsub_err"   long_name="excess of snw sublimation sent to ocean"                      unit="m/day"   /> 
    338349         <field id="vfxspr"       long_name="snw precipitation on ice"                                     unit="m/day"   /> 
     350         <field id="vfxthin"      long_name="daily thermo ice prod. for thin ice(<20cm) + open water"      unit="m/day"   /> 
    339351 
    340352         <field id="afxtot"       long_name="area tendency (total)"                                        unit="day-1"   /> 
     
    378390      <field_group id="grid_U"   grid_ref="grid_U_2D"> 
    379391         <field id="e3u"          long_name="U-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_U_3D" /> 
     392         <field id="e3u_0"        long_name="Initial U-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_U_3D"/> 
    380393         <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
    381394         <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     
    417430      <field_group id="grid_V"   grid_ref="grid_V_2D"> 
    418431         <field id="e3v"          long_name="V-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_V_3D" /> 
     432         <field id="e3v_0"        long_name="Initial V-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_V_3D"/> 
    419433         <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                               standard_name="surface_downward_y_stress"   unit="N/m2"                            /> 
    420434         <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     
    462476        <field id="woce_eiv"     long_name="EIV ocean vertical velocity"   standard_name="bolus_upward_sea_water_velocity"   unit="m/s" /> 
    463477 
    464         <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    465478        <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     479        <field id="logavt"       long_name="logarithm of vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
    466480        <field id="avm"          long_name="vertical eddy viscosity"     standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"   unit="m2/s" /> 
    467481 
     
    478492        <!-- avs: available with key_zdfddm --> 
    479493        <field id="avs"          long_name="salt vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"   unit="m2/s" /> 
     494        <field id="logavs"       long_name="logarithm of salt vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
    480495 
    481496        <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
     
    485500        <!-- avt_tide: available with key_zdftmx --> 
    486501        <field id="av_tide"      long_name="tidal vertical diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   unit="m2/s" /> 
     502 
     503       <!-- variables available with key_zdftmx_new --> 
     504        <field id="av_ratio"     long_name="S over T diffusivity ratio"            standard_name="salinity_over_temperature_diffusivity_ratio"                     unit="1"    /> 
     505        <field id="av_wave"      long_name="wave-induced vertical diffusivity"     standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_internal_waves"         unit="m2/s" /> 
     506        <field id="bn2"          long_name="squared Brunt-Vaisala frequency"       standard_name="squared_brunt_vaisala_frequency"                                 unit="s-1"  /> 
     507        <field id="bflx_tmx"     long_name="wave-induced buoyancy flux"            standard_name="buoyancy_flux_due_to_internal_waves"                             unit="W/kg" /> 
     508        <field id="pcmap_tmx"    long_name="power consumed by wave-driven mixing"  standard_name="vertically_integrated_power_consumption_by_wave_driven_mixing"   unit="W/m2"      grid_ref="grid_W_2D" /> 
     509        <field id="emix_tmx"     long_name="power density available for mixing"    standard_name="power_available_for_mixing_from_breaking_internal_waves"         unit="W/kg" /> 
    487510 
    488511        <!-- variables available with key_diaar5 -->    
     
    510533       <field id="bgtemper"     long_name="drift in global mean temperature wrt timestep 1"                 standard_name="change_over_time_in_sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     /> 
    511534       <field id="bgsaline"     long_name="drift in global mean salinity wrt timestep 1"                    standard_name="change_over_time_in_sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     /> 
    512        <field id="bgheatco"     long_name="drift in global mean heat content wrt timestep 1"                                                                                      unit="10^9J"    /> 
    513        <field id="bgsaltco"     long_name="drift in global mean salt content wrt timestep 1"                                                                                      unit="1e-3*m3"  /> 
     535       <field id="bgheatco"     long_name="drift in global mean heat content wrt timestep 1"                                                                                      unit="1.e20J"   /> 
     536       <field id="bgheatfx"     long_name="drift in global mean heat flux    wrt timestep 1"                                                                                      unit="W/m2"     /> 
     537       <field id="bgsaltco"     long_name="drift in global mean salt content wrt timestep 1"                                                                                      unit="1e-3*km3" /> 
    514538       <field id="bgvolssh"     long_name="drift in global mean ssh volume wrt timestep 1"                                                                                        unit="km3"      /> 
    515539         <field id="bgvole3t"     long_name="drift in global mean volume variation (e3t) wrt timestep 1"                                                                            unit="km3"      /> 
    516        <field id="bgvoltot"     long_name="drift in global mean volume wrt timestep 1"                                                                                            unit="km3"      /> 
    517          <!-- NOTE: No matching iom_put call --> 
    518        <field id="bgsshtot"     long_name="drift in global mean ssh wrt timestep 1"                         standard_name="global_average_sea_level_change"                       unit="m"        /> 
    519        <field id="bgfrcvol"     long_name="drift in global mean volume from forcing wrt timestep 1"                                                                               unit="km3"      /> 
    520        <field id="bgfrctem"     long_name="drift in global mean heat content from forcing wrt timestep 1"                                                                         unit="10^9J"    /> 
    521        <field id="bgfrcsal"     long_name="drift in global mean salt content from forcing wrt timestep 1"                                                                         unit="1e-3*km3" /> 
    522        <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface"                                                                                     unit="degC"     /> 
    523        <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface"                                                                                        unit="1e-3"     /> 
     540       <field id="bgfrcvol"     long_name="global mean volume from forcing"                                                                                                       unit="km3"      /> 
     541       <field id="bgfrctem"     long_name="global mean heat content from forcing"                                                                                                 unit="1.e20J"   /> 
     542         <field id="bgfrchfx"     long_name="global mean heat flux from forcing"                                                                                                    unit="W/m2"     /> 
     543       <field id="bgfrcsal"     long_name="global mean salt content from forcing"                                                                                                 unit="1e-3*km3" /> 
     544       <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface (no vvl)"                                                                            unit="degC"     /> 
     545       <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface (no vvl)"                                                                               unit="1e-3"     /> 
    524546      </field_group> 
    525547 
     
    528550      <field_group id="SBC_scalar"  domain_ref="1point" > 
    529551         <!-- available with ln_limdiaout --> 
    530          <field id="ibgvoltot"    long_name="global mean ice volume"                                 unit="km3"        /> 
    531          <field id="sbgvoltot"    long_name="global mean snow volume"                                unit="km3"        /> 
    532          <field id="ibgarea"      long_name="global mean ice area"                                   unit="km2"        /> 
    533          <field id="ibgsaline"    long_name="global mean ice salinity"                               unit="1e-3"       /> 
    534          <field id="ibgtemper"    long_name="global mean ice temperature"                            unit="degC"       /> 
    535          <field id="ibgheatco"    long_name="global mean ice heat content"                           unit="10^20J"     /> 
    536          <field id="sbgheatco"    long_name="global mean snow heat content"                          unit="10^20J"     /> 
    537          <field id="ibgsaltco"    long_name="global mean ice salt content"                           unit="1e-3*km3"   /> 
    538  
    539          <field id="ibgvfx"       long_name="global mean volume flux (emp)"                          unit="m/day"      /> 
    540          <field id="ibgvfxbog"    long_name="global mean volume flux (bottom growth)"                unit="m/day"      /> 
    541          <field id="ibgvfxopw"    long_name="global mean volume flux (open water growth)"            unit="m/day"      /> 
    542          <field id="ibgvfxsni"    long_name="global mean volume flux (snow-ice growth)"              unit="m/day"      /> 
    543          <field id="ibgvfxdyn"    long_name="global mean volume flux (dynamic growth)"               unit="m/day"      /> 
    544          <field id="ibgvfxbom"    long_name="global mean volume flux (bottom melt)"                  unit="m/day"      /> 
    545          <field id="ibgvfxsum"    long_name="global mean volume flux (surface melt)"                 unit="m/day"      /> 
    546          <field id="ibgvfxres"    long_name="global mean volume flux (resultant)"                    unit="m/day"      /> 
    547          <field id="ibgvfxspr"    long_name="global mean volume flux (snow precip)"                  unit="m/day"      /> 
    548          <field id="ibgvfxsnw"    long_name="global mean volume flux (snow melt)"                    unit="m/day"      /> 
    549          <field id="ibgvfxsub"    long_name="global mean volume flux (snow sublimation)"             unit="m/day"      /> 
    550  
    551          <field id="ibgsfx"       long_name="global mean salt flux (total)"                          unit="1e-3*m/day" /> 
    552          <field id="ibgsfxbri"    long_name="global mean salt flux (brines)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    553          <field id="ibgsfxdyn"    long_name="global mean salt flux (dynamic)"                        unit="1e-3*m/day" /> 
    554          <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean salt flux (resultant)"                      unit="1e-3*m/day" /> 
    555          <field id="ibgsfxbog"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    556          <field id="ibgsfxopw"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    557          <field id="ibgsfxsni"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    558          <field id="ibgsfxbom"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    559          <field id="ibgsfxsum"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
    560  
    561          <field id="ibghfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"                 unit="W"          /> 
    562          <field id="ibghfxspr"    long_name="Heat content of snow precip"                            unit="W"          /> 
    563  
    564          <field id="ibghfxthd"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during thermo"      unit="W"          /> 
    565          <field id="ibghfxsum"    long_name="heat fluxes causing surface ice melt"                   unit="W"          /> 
    566          <field id="ibghfxbom"    long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"                    unit="W"          /> 
    567          <field id="ibghfxbog"    long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"                  unit="W"          /> 
    568          <field id="ibghfxdif"    long_name="heat fluxes causing ice temperature change"             unit="W"          /> 
    569          <field id="ibghfxopw"    long_name="heat fluxes causing open water ice formation"           unit="W"          /> 
    570          <field id="ibghfxdyn"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during dynamic"     unit="W"          /> 
    571          <field id="ibghfxres"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during resultant"   unit="W"          /> 
    572          <field id="ibghfxsub"    long_name="heat fluxes from sublimation"                           unit="W"          /> 
    573          <field id="ibghfxsnw"    long_name="heat fluxes from snow-ocean exchange"                   unit="W"          /> 
    574          <field id="ibghfxout"    long_name="non solar heat fluxes received by the ocean"            unit="W"          /> 
    575          <field id="ibghfxin"     long_name="total heat fluxes at the ice surface"                   unit="W"          /> 
    576  
    577          <field id="ibgfrcvol"    long_name="global mean forcing volume (emp)"                       unit="km3"        /> 
    578          <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean forcing salt   (sfx)"                       unit="1e-3*km3"   /> 
    579          <field id="ibgvolgrm"    long_name="global mean ice growth+melt volume"                     unit="km3"        /> 
     552         <field id="ibgfrcvoltop"    long_name="global mean ice/snow forcing at interface ice/snow-atm (volume equivalent ocean volume)"   unit="km3"       /> 
     553         <field id="ibgfrcvolbot"    long_name="global mean ice/snow forcing at interface ice/snow-ocean (volume equivalent ocean volume)" unit="km3"       /> 
     554         <field id="ibgfrctemtop"    long_name="global mean heat on top of ice/snw/ocean-atm "                                             unit="1e20J"     /> 
     555         <field id="ibgfrctembot"    long_name="global mean heat below ice (on top of ocean) "                                             unit="1e20J"     /> 
     556         <field id="ibgfrcsal"       long_name="global mean ice/snow forcing (salt equivalent ocean volume)"                               unit="pss*km3"   /> 
     557         <field id="ibgfrchfxtop"    long_name="global mean heat flux on top of ice/snw/ocean-atm "                                        unit="W/m2"      /> 
     558         <field id="ibgfrchfxbot"    long_name="global mean heat flux below ice (on top of ocean) "                                        unit="W/m2"      /> 
     559  
     560         <field id="ibgvolume"    long_name="drift in ice/snow volume (equivalent ocean volume)"            unit="km3"        /> 
     561         <field id="ibgsaltco"    long_name="drift in ice salt content (equivalent ocean volume)"           unit="pss*km3"    /> 
     562         <field id="ibgheatco"    long_name="drift in ice/snow heat content"                                unit="1e20J"      /> 
     563         <field id="ibgheatfx"    long_name="drift in ice/snow heat flux"                                   unit="W/m2"       /> 
     564 
     565         <field id="ibgvol_tot"    long_name="global mean ice volume"                                       unit="km3"        /> 
     566         <field id="sbgvol_tot"    long_name="global mean snow volume"                                      unit="km3"        /> 
     567         <field id="ibgarea_tot"   long_name="global mean ice area"                                         unit="km2"        /> 
     568         <field id="ibgsalt_tot"   long_name="global mean ice salt content"                                 unit="1e-3*km3"   /> 
     569         <field id="ibgheat_tot"   long_name="global mean ice heat content"                                 unit="1e20J"      /> 
     570         <field id="sbgheat_tot"   long_name="global mean snow heat content"                                unit="1e20J"      /> 
    580571      </field_group> 
    581572   
     
    882873       <field id="Totlig"      long_name="Total ligand concentation"               unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    883874       <field id="Biron"       long_name="Bioavailable iron"                       unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    884        <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="mol/m2/s"                        /> 
     875       <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="molN/m2/s"                       /> 
     876       <field id="SedCal"      long_name="Calcite burial in the sediments"         unit="molC/m2/s"                       /> 
     877       <field id="SedSi"       long_name="Silicon burial in the sediments"         unit="molSi/m2/s"                      /> 
     878       <field id="SedC"        long_name="Organic C burial in the sediments"       unit="molC/m2/s"                       /> 
    885879       <field id="Ironice"     long_name="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="mol/m2/s"                        /> 
    886880       <field id="HYDR"        long_name="Iron input from hydrothemal vents"       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim3_ref

    r5602 r7261  
    2121   cn_icerst_outdir = "."          !  directory in which to write output ice restarts 
    2222   ln_limdyn     = .true.          !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
    23    rn_amax       = 0.999           !  maximum tolerated ice concentration  
     23   rn_amax_n     = 0.999           !  maximum tolerated ice concentration NH 
     24   rn_amax_s     = 0.999           !  maximum tolerated ice concentration SH 
    2425   ln_limdiahsb  = .false.         !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    2526   ln_limdiaout  = .true.          !  output the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     
    8586   rn_hnewice  = 0.1               !  thickness for new ice formation in open water (m) 
    8687   ln_frazil   = .false.           !  use frazil ice collection thickness as a function of wind (T) or not (F) 
    87    rn_maxfrazb = 0.0               !  maximum fraction of frazil ice collecting at the ice base 
     88   rn_maxfrazb = 1.0               !  maximum fraction of frazil ice collecting at the ice base 
    8889   rn_vfrazb   = 0.417             !  thresold drift speed for frazil ice collecting at the ice bottom (m/s) 
    8990   rn_Cfrazb   = 5.0               !  squeezing coefficient for frazil ice collecting at the ice bottom 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref

    r5602 r7261  
    6666   qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
    6767   caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     68   oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia 
    6869/ 
    6970!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    162163   xsiremlab =  0.03      ! fast remineralization rate of Si 
    163164   xsilab    =  0.5       ! Fraction of labile biogenic silica 
    164    oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia 
    165165/ 
    166166!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    r5602 r7261  
    55!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
    66!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    7 !!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     7!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    88!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
    99!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp) 
    1010!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    11 !!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
     11!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx, namzdf_tmx_new) 
    1212!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb, namsto) 
    1313!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl) 
     
    408408   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    409409   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration 
    410    nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
     410   nn_chldta   =      1    !  RGB : 2D Chl data (=1), 3D Chl data (=2) or cst value (=0) 
    411411   rn_abs      =   0.58    !  RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1) 
    412412   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
     
    500500&namsbc_alb    !   albedo parameters 
    501501!----------------------------------------------------------------------- 
    502    rn_cloud    =    0.06   !  cloud correction to snow and ice albedo 
    503    rn_albice   =    0.53   !  albedo of melting ice in the arctic and antarctic 
    504    rn_alphd    =    0.80   !  coefficients for linear interpolation used to 
    505    rn_alphc    =    0.65   !  compute albedo between two extremes values 
    506    rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
     502   nn_ice_alb  =    0   !  parameterization of ice/snow albedo 
     503                        !     0: Shine & Henderson-Sellers (JGR 1985) 
     504                        !     1: "home made" based on Brandt et al. (J. Climate 2005) 
     505                        !                         and Grenfell & Perovich (JGR 2004) 
     506   rn_albice   =  0.53  !  albedo of bare puddled ice (values from 0.49 to 0.58) 
     507                        !     0.53 (default) => if nn_ice_alb=0 
     508                        !     0.50 (default) => if nn_ice_alb=1 
    507509/ 
    508510!----------------------------------------------------------------------- 
     
    546548!!   namlbc        lateral momentum boundary condition 
    547549!!   namcla        cross land advection 
    548 !!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    549550!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif") 
    550551!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy") 
     
    563564!----------------------------------------------------------------------- 
    564565   nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
    565 / 
    566 !----------------------------------------------------------------------- 
    567 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    568 !----------------------------------------------------------------------- 
    569    ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    570    ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    571    ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition 
    572    nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    573                            !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    574    cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    575                            !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    576    rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    577    rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    578    rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    579    rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    580    rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    581    rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    582    rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    583    rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    584    rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    585                            !  = 1 the total volume remains constant 
    586566/ 
    587567!----------------------------------------------------------------------- 
     
    898878!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    899879!!====================================================================== 
    900 !!    namzdf        vertical physics 
    901 !!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
    902 !!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
    903 !!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
    904 !!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
    905 !!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     880!!    namzdf            vertical physics 
     881!!    namzdf_ric        richardson number dependent vertical mixing     ("key_zdfric") 
     882!!    namzdf_tke        TKE dependent vertical mixing                   ("key_zdftke") 
     883!!    namzdf_kpp        KPP dependent vertical mixing                   ("key_zdfkpp") 
     884!!    namzdf_ddm        double diffusive mixing parameterization        ("key_zdfddm") 
     885!!    namzdf_tmx        tidal mixing parameterization                   ("key_zdftmx") 
     886!!    namzdf_tmx_new    new tidal mixing parameterization               ("key_zdftmx_new") 
    906887!!====================================================================== 
    907888! 
     
    1010991   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    1011992/ 
    1012  
     993!----------------------------------------------------------------------- 
     994&namzdf_tmx_new    !   new tidal mixing parameterization                ("key_zdftmx_new") 
     995!----------------------------------------------------------------------- 
     996   nn_zpyc     = 1         !  pycnocline-intensified dissipation scales as N (=1) or N^2 (=2) 
     997   ln_mevar    = .true.    !  variable (T) or constant (F) mixing efficiency 
     998   ln_tsdiff   = .true.    !  account for differential T/S mixing (T) or not (F) 
     999/ 
    10131000!!====================================================================== 
    10141001!!                  ***  Miscellaneous namelists  *** 
     
    11961183   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations 
    11971184   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set 
    1198    !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set 
     1185   ln_cor     = .false.    ! Logical switch for Coriolis insitu data set 
    11991186   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set 
    12001187   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations 
    1201  
    12021188   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data 
    1203  
    12041189   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data 
    1205                            !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations 
    1206  
    1207    ln_sst     = .false.     ! Logical switch for SST observations 
    1208    ln_reysst  = .false.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    1209    ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations 
    1210  
     1190   ln_ssh     = .false.    ! Logical switch for SSH observations 
     1191   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations 
     1192   ln_reysst  = .false.    ! Logical switch for Reynolds observations 
     1193   ln_ghrsst  = .false.    ! Logical switch for GHRSST observations 
    12111194   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    1212                            !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations 
     1195   ln_sss     = .false.    ! Logical switch for SSS observations 
    12131196   ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations 
    1214                            !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations 
    1215                            !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur. 
    1216                            !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur. 
    1217                            !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP 
    1218                            !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    1219                            !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data 
    1220                            !     ln_grid_global          Global distribtion of observations 
    1221                            !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table 
    1222                            !     grid_search_file        Grid search lookup file header 
    1223                            !     enactfiles              ENACT input observation file names 
    1224                            !     coriofiles              Coriolis input observation file name 
    1225    !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name 
    1226    profbfiles = 'profiles_01.nc' 
    1227                            !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch 
    1228                            !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
    1229                            !     slafilespas             Passive SLA input observation file name 
    1230    !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name 
    1231    slafbfiles = 'sla_01.nc' 
    1232                            !     sstfiles                GHRSST input observation file name 
    1233    !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name 
    1234    sstfbfiles = 'sst_01.nc' 
    1235                            !     seaicefiles             Sea Ice input observation file names 
    1236    seaicefiles = 'seaice_01.nc' 
    1237                            !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    1238                            !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 
    1239                            !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name 
    1240                            !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name 
    1241                            !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name 
    1242                            !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1243                            !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1244                            !     n1dint                  Type of vertical interpolation method 
    1245                            !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method 
    1246                            !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch 
    1247    nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme 
    1248                            !     mdtcorr                 MDT  correction 
    1249                            !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction 
     1197   ln_vel3d   = .false.    ! Logical switch for velocity observations 
     1198   ln_velavcur= .false     ! Logical switch for velocity daily av. cur. 
     1199   ln_velhrcur= .false     ! Logical switch for velocity high freq. cur. 
     1200   ln_velavadcp = .false.  ! Logical switch for velocity daily av. ADCP 
     1201   ln_velhradcp = .false.  ! Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     1202   ln_velfb   = .false.    ! Logical switch for feedback velocity data 
     1203   ln_grid_global = .false. ! Global distribtion of observations 
     1204   ln_grid_search_lookup = .false. !  Logical switch for obs grid search w/lookup table 
     1205   grid_search_file = 'grid_search'  !  Grid search lookup file header 
     1206! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files 
     1207   enactfiles = 'enact.nc' !  ENACT input observation file names (specify full array in namelist_cfg) 
     1208   coriofiles = 'corio.nc' !  Coriolis input observation file name 
     1209   profbfiles = 'profiles_01.nc' ! Profile feedback input observation file name 
     1210   ln_profb_enatim = .false !        Enact feedback input time setting switch 
     1211   slafilesact = 'sla_act.nc' !  Active SLA input observation file names 
     1212   slafilespas = 'sla_pass.nc' ! Passive SLA input observation file names 
     1213   slafbfiles = 'sla_01.nc' ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file names 
     1214   sstfiles = 'ghrsst.nc'   ! GHRSST input observation file names 
     1215   sstfbfiles = 'sst_01.nc' ! Feedback SST input observation file names 
     1216   seaicefiles = 'seaice_01.nc' ! Sea Ice input observation file names 
     1217   velavcurfiles = 'velavcurfile.nc'  ! Vel. cur. daily av. input file name 
     1218   velhrcurfiles = 'velhrcurfile.nc'  ! Vel. cur. high freq. input file name 
     1219   velavadcpfiles = 'velavadcpfile.nc' ! Vel. ADCP daily av. input file name 
     1220   velhradcpfiles = 'velhradcpfile.nc' ! Vel. ADCP high freq. input file name 
     1221   velfbfiles = 'velfbfile.nc' ! Vel. feedback input observation file name 
     1222   dobsini = 20000101.000000  !  Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1223   dobsend = 20010101.000000  !  Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1224   n1dint = 0  !               Type of vertical interpolation method 
     1225   n2dint = 0  !               Type of horizontal interpolation method 
     1226   ln_nea = .false.   !        Rejection of observations near land switch 
     1227   nmsshc     = 0     !        MSSH correction scheme 
     1228   mdtcorr = 1.61     !        MDT  correction 
     1229   mdtcutoff = 65.0   !        MDT cutoff for computed correction 
    12501230   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias 
    12511231   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files 
    1252                            !     endailyavtypes   ENACT daily average types 
     1232   endailyavtypes = 820    ! ENACT daily average types - array (use namelist_cfg to set more values) 
    12531233   ln_grid_global = .true. 
    12541234   ln_grid_search_lookup = .false. 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref

    r5602 r7261  
    6262   rn_ahtrc_0       =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    6363   rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     64   rn_fact_lap      =     1.    !     enhanced zonal eddy diffusivity 
    6465/ 
    6566!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2015/dev_r5003_MERCATOR6_CRS/NEMOGCM/CONFIG/cfg.txt

    r5602 r7261  
    66GYRE_BFM OPA_SRC TOP_SRC 
    77AMM12 OPA_SRC 
     8ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    89ORCA2_LIM_PISCES OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
     10ORCA2_LIM3 OPA_SRC LIM_SRC_3 NST_SRC 
    911GYRE OPA_SRC 
    10 ORCA2_LIM3 OPA_SRC LIM_SRC_3 NST_SRC 
    1112ORCA2_LIM OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    12 ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.