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Changeset 7618 – NEMO

Changeset 7618


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2017-01-27T18:19:12+01:00 (7 years ago)
Author:
aumont
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update namelist_pisces in the quota code

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  • branches/CNRS/dev_r6270_PISCES_QUOTA/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES_QUOTA/EXP00/namelist_pisces_ref

    r7183 r7618  
    4949   niter1max  =  1        ! Maximum number of iterations for POC 
    5050   niter2max  =  1        ! Maximum number of iterations for GOC 
    51    wfep       =  0.2      ! FeP sinking speed 
    52    ldocp      =  1.E-5    ! Phyto ligand production per unit doc 
    53    ldocz      =  1.E-5    ! Zoo ligand production per unit doc 
    54    lthet      =  0.5      ! Proportional loss of ligands due to Fe uptake 
     51!   wfep       =  0.2      ! FeP sinking speed 
     52!   ldocp      =  1.E-5    ! Phyto ligand production per unit doc 
     53!   ldocz      =  1.E-5    ! Zoo ligand production per unit doc 
     54!   lthet      =  0.5      ! Proportional loss of ligands due to Fe uptake 
    5555/ 
    5656!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    5757&nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
    5858!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    59    concnno3   =  3e-6     ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
     59   concnno3   =  4e-6     ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    6060   concpno3   =  1e-6 
    6161   concdno3   =  4E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
    62    concnnh4   =  1.5E-6   ! NH4 half saturation for phyto 
    63    concpnh4   =  4E-7 
    64    concdnh4   =  2E-6     ! NH4 half saturation for diatoms 
    65    concnpo4   =  3E-6     ! PO4 half saturation for phyto 
    66    concppo4   =  1.5E-6 
     62   concnnh4   =  1.2E-6   ! NH4 half saturation for phyto 
     63   concpnh4   =  3E-7 
     64   concdnh4   =  1.2E-6     ! NH4 half saturation for diatoms 
     65   concnpo4   =  4E-6     ! PO4 half saturation for phyto 
     66   concppo4   =  1E-6 
    6767   concdpo4   =  4E-6     ! PO4 half saturation for diatoms 
    68    concnfer   =  3E-9   ! Iron half saturation for phyto 
    69    concpfer   =  1.5E-9 
     68   concnfer   =  4E-9   ! Iron half saturation for phyto 
     69   concpfer   =  1E-9 
    7070   concdfer   =  4E-9   ! Iron half saturation for diatoms 
    7171   concbfe    =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
     
    7676   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
    7777   xsizepic   =  1.E-6 
    78    xsizern    =  1.0      ! Size ratio for nanophytoplankton 
     78   xsizern    =  3.0      ! Size ratio for nanophytoplankton 
    7979   xsizerp    =  1.0 
    80    xsizerd    =  4.0      ! Size ratio for diatoms 
    81    xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
     80   xsizerd    =  3.0      ! Size ratio for diatoms 
     81   xksi1      =  8.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    8282   xksi2      =  20E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    8383   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
     
    9292   qnnmin     =  0.29 
    9393   qnnmax     =  1.39 
    94    qpnmin     =  0.28 
     94   qpnmin     =  0.24 
    9595   qpnmax     =  1.06 
    9696   qnpmin     =  0.42 
    9797   qnpmax     =  1.39 
    98    qppmin     =  0.25 
     98   qppmin     =  0.19 
    9999   qppmax     =  0.7 
    100100   qndmin     =  0.25 
    101101   qndmax     =  1.39 
    102    qpdmin     =  0.29 
     102   qpdmin     =  0.24 
    103103   qpdmax     =  1.32 
    104104   qfnmax     =  40E-6 
     
    119119&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
    120120!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    121    pislopen   =  3.       ! P-I slope 
    122    pislopep   =  3.       ! P-I slope for picophytoplankton 
    123    pisloped   =  3.       ! P-I slope  for diatoms 
     121   pislopen   =  4.       ! P-I slope 
     122   pislopep   =  4.       ! P-I slope for picophytoplankton 
     123   pisloped   =  4.       ! P-I slope  for diatoms 
    124124   xadap      =  0.       ! Adaptation factor to low light 
    125125   excretn    =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
     
    127127   excretd    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
    128128   bresp      =  0.02     ! Basal respiration rate 
    129    thetannm   =  0.25     ! Maximum Chl/N in nanophytoplankton 
    130    thetanpm   =  0.25     ! Maximum Chl/N in picophytoplankton 
    131    thetandm   =  0.3      ! Maximum Chl/N in diatoms 
     129   thetannm   =  0.3     ! Maximum Chl/N in nanophytoplankton 
     130   thetanpm   =  0.3     ! Maximum Chl/N in picophytoplankton 
     131   thetandm   =  0.35     ! Maximum Chl/N in diatoms 
    132132   chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    133    grosip     =  0.131    ! mean Si/C ratio 
     133   grosip     =  0.39     ! mean Si/C ratio 
    134134/ 
    135135!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    136136&nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks 
    137137!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    138    wchl       =  0.01    ! quadratic mortality of phytoplankton 
     138   wchl       =  0.01     ! quadratic mortality of phytoplankton 
    139139   wchlp      =  0.01 
    140140   wchld      =  0.01     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
     
    148148!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    149149   part2      =  0.75     ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts 
    150    grazrat2   =  0.85     ! maximal mesozoo grazing rate 
    151    bmetexc2   =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon  
     150   grazrat2   =  0.8      ! maximal mesozoo grazing rate 
     151   bmetexc2   =  .false.   ! Metabolic use of excess carbon  
    152152   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    153153   mzrat2     =  0.02     ! mesozooplankton mortality rate 
    154154   xpref2d    =  1.       ! zoo preference for phyto 
    155    xpref2p    =  1.       ! zoo preference for POC 
     155   xpref2p    =  0.8      ! zoo preference for POC 
    156156   xpref2z    =  1.       ! zoo preference for zoo 
    157157   xpref2m    =  0.2      ! meso preference for zoo 
    158    xpref2c    =  0.3      ! zoo preference for poc 
     158   xpref2c    =  0.2      ! zoo preference for poc 
    159159   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton 
    160160   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton 
     
    162162   xthresh2mes = 1E-8     ! meso feeding threshold for mesozooplankton 
    163163   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton 
    164    xthresh2    =  3E-7     ! Food threshold for grazing 
    165    xkgraz2     =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
    166    epsher2     =  0.5      ! Efficicency of Mesozoo growth 
     164   xthresh2    = 1E-8     ! Food threshold for grazing 
     165   xkgraz2     =  20.E-6  ! half sturation constant for meso grazing 
     166   epsher2     =  0.5     ! Efficicency of Mesozoo growth 
    167167   ssigma2     =  0.5     ! Fraction excreted as semi-labile DOM 
    168168   srespir2    =  0.2     ! Active respiration 
     
    176176!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    177177   part       =  0.5      ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa 
    178    grazrat    =  2.75     ! maximal zoo grazing rate 
    179    bmetexc    =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon 
     178   grazrat    =  2.5     ! maximal zoo grazing rate 
     179   bmetexc    =  .false.   ! Metabolic use of excess carbon 
    180180   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    181181   mzrat      =  0.005    ! zooplankton mortality rate 
    182182   xprefc     =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
    183183   xprefn     =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto 
    184    xprefp     =  1.6 
    185    xprefd     =  1.0      ! Microzoo preference for Diatoms 
    186    xprefz     =  0.3      ! Microzoo preference for microzooplankton 
     184   xprefp     =  1.4 
     185   xprefd     =  0.8      ! Microzoo preference for Diatoms 
     186   xprefz     =  0.1      ! Microzoo preference for microzooplankton 
    187187   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton 
    188188   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton 
     
    190190   xthreshzoo =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton 
    191191   xthreshpoc =  1.E-8    ! POC feeding threshold for microzooplankton 
    192    xthresh    =  3.E-7    ! Food threshold for feeding 
     192   xthresh    =  1.E-8    ! Food threshold for feeding 
    193193   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
    194194   epsher     =  0.5      ! Efficiency of microzoo growth 
     
    207207   xlam1     =  0.005     ! scavenging rate of Iron 
    208208   xlamdust  =  150.0     ! Scavenging rate of dust 
    209    ligand    =  0.6E-9    ! Ligands concentration  
     209   ligand    =  0.7E-9    ! Ligands concentration  
    210210   kfep      =  0.        ! Nanoparticle formation rate constant 
    211211 
     
    222222   oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia 
    223223   oxymin2   =  6.E-6     ! Minimum O2 concentration for oxic remin. 
    224    feratb    =  20E-6     ! Bacterial Fe/C ratio 
     224   feratb    =  10E-6     ! Bacterial Fe/C ratio 
    225225   xkferb    =  3E-10     ! Half-saturation constant for bact. Fe/C 
    226226/ 
     
    228228&nampispoc     !   parameters for organic particles 
    229229!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    230    xremipc   =  0.02      ! remineralisation rate of POC 
    231    xremipn   =  0.025     ! remineralisation rate of PON 
    232    xremipp   =  0.03      ! remineralisation rate of POP 
    233    jcpoc     =  15        ! Number of lability classes 
    234    rshape    =  1.0       ! Shape of the gamma function 
     230   xremipc   =  0.03      ! remineralisation rate of POC 
     231   xremipn   =  0.035     ! remineralisation rate of PON 
     232   xremipp   =  0.04      ! remineralisation rate of POP 
     233   jcpoc     =  15         ! Number of lability classes 
     234   rshape    =  1.0       ! Shape of the gamma function  
    235235/ 
    236236!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    275275   concfediaz  =  1.e-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron 
    276276   hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
    277    fep_rats    =  1.       ! Fep/Fer ratio from sed sources 
    278    fep_rath    =  1.       ! Fep/Fer ratio from sed hydro sources 
     277!   fep_rats    =  1.       ! Fep/Fer ratio from sed sources 
     278!   fep_rath    =  1.       ! Fep/Fer ratio from sed hydro sources 
    279279/ 
    280280!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    381381!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    382382   ln_pisdmp    =  .true.     !  Relaxation fo some tracers to a mean value 
    383    nn_pisdmp    =  5475       !  Frequency of Relaxation  
     383   nn_pisdmp    =  2190       !  Frequency of Relaxation  
    384384/ 
    385385!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.