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2017-03-23T15:27:35+01:00 (4 years ago)
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flavoni
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#1873, update ORCA2_LIM3_CONFIG, and open bathy_meter.nc

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trunk/NEMOGCM
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  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/file_def_nemo.xml

    r7646 r7828  
    2929     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    3030     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    31       <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     31          <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    3232     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    3333     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3_PISCES/EXP00/file_def_nemo.xml

    r7635 r7828  
    7171     <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
    7272     <field field_ref="utau"         name="tauuo"    /> 
    73           <!-- available with key_diaar5 --> 
     73          <field field_ref="uocetr_eff"   name="uocetr_eff"  /> 
     74          <!-- available with diaar5 --> 
    7475     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" /> 
    7576     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" /> 
     
    8283     <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> 
    8384     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    /> 
    84           <!-- available with key_diaar5 --> 
     85          <field field_ref="vocetr_eff"   name="vocetr_eff"  /> 
     86          <!-- available with diaar5 --> 
    8587     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
    8688     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
    87       <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
     89          <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
    8890   </file> 
    8991    
     
    9395     <field field_ref="avt"          name="difvho"   /> 
    9496     <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" /> 
     97          <!-- variables available with key_zdftmx_new --> 
     98          <field field_ref="av_wave"      name="av_wave"    /> 
     99          <field field_ref="bn2"          name="bn2"        /> 
     100          <field field_ref="bflx_tmx"     name="bflx_tmx"   /> 
     101          <field field_ref="pcmap_tmx"    name="pcmap_tmx"  /> 
     102          <field field_ref="emix_tmx"     name="emix_tmx"   /> 
     103          <field field_ref="av_ratio"     name="av_ratio"   /> 
    95104   </file> 
    96105 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r7715 r7828  
    134134&namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    135135!----------------------------------------------------------------------- 
     136   ln_mle      = .true.   ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation 
    136137/ 
    137138!---------------------------------------------------------------------------------- 
     
    250251/ 
    251252!----------------------------------------------------------------------- 
     253&namzdf_tmx_new !   internal wave-driven mixing parameterization        ("key_zdftmx_new" & "key_zdfddm") 
     254!----------------------------------------------------------------------- 
     255   nn_zpyc     = 2         !  pycnocline-intensified dissipation scales as N (=1) or N^2 (=2) 
     256   ln_mevar    = .true.    !  variable (T) or constant (F) mixing efficiency 
     257   ln_tsdiff   = .true.    !  account for differential T/S mixing (T) or not (F) 
     258/ 
     259!----------------------------------------------------------------------- 
    252260&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    253261!----------------------------------------------------------------------- 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3_PISCES/cpp_ORCA2_LIM3_PISCES.fcm

    r7440 r7828  
    1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim3 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi key_top key_nosignedzero 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim3 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx_new key_iomput key_mpp_mpi key_top key_nosignedzero 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def_nemo-opa.xml

    r7788 r7828  
    9292         <field id="hc300"        long_name="Heat content 0-300m"                            standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
    9393 
    94          <!-- variables available with key_diaar5 --> 
     94         <!-- variables available with diaar5 --> 
    9595         <field id="botpres"      long_name="Sea Water Pressure at Sea Floor"   standard_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"   unit="dbar" /> 
    9696         <field id="sshdyn"       long_name="dynamic sea surface height"     standard_name="dynamic_sea_surface_height_above_geoid"     unit="m" /> 
     
    9898         <field id="tnpeo"      long_name="Tendency of ocean potential energy content"          unit="W/m2"                           /> 
    9999 
    100          <!-- variables available with key_vvl --> 
     100         <!-- variables available ln_linssh=.FALSE. --> 
    101101         <field id="tpt_dep"      long_name="T-point depth"                  standard_name="depth_below_geoid"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    102102         <field id="e3tdef"       long_name="T-cell thickness deformation"                                       unit="%"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     
    362362         <field id="vtbl"         long_name="meridional current in the Losh tbl"   unit="m/s" /> 
    363363 
    364          <!-- variables available with key_diaar5 --> 
     364         <!-- variables available with diaar5 --> 
    365365         <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"    standard_name="ocean_mass_y_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
    366366         <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"    standard_name="ocean_heat_y_transport"                          unit="W"                                /> 
     
    401401         <field id="av_tide"      long_name="tidal vertical diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   unit="m2/s" /> 
    402402 
    403          <!-- variables available with key_diaar5 -->    
     403         <!-- variables available with key_zdftmx_new --> 
     404         <field id="av_ratio"     long_name="S over T diffusivity ratio"            standard_name="salinity_over_temperature_diffusivity_ratio"                     unit="1"    /> 
     405         <field id="av_wave"      long_name="wave-induced vertical diffusivity"     standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_internal_waves"         unit="m2/s" /> 
     406         <field id="bflx_tmx"     long_name="wave-induced buoyancy flux"            standard_name="buoyancy_flux_due_to_internal_waves"                             unit="W/kg" /> 
     407         <field id="pcmap_tmx"    long_name="power consumed by wave-driven mixing"  standard_name="vertically_integrated_power_consumption_by_wave_driven_mixing"   unit="W/m2"      grid_ref="grid_W_2D" /> 
     408         <field id="emix_tmx"     long_name="power density available for mixing"    standard_name="power_available_for_mixing_from_breaking_internal_waves"         unit="W/kg" /> 
     409 
     410         <!-- variables available with diaar5 -->    
    404411         <field id="w_masstr"     long_name="vertical mass transport"             standard_name="upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
    405412         <field id="w_masstr2"    long_name="square of vertical mass transport"   standard_name="square_of_upward_ocean_mass_transport"   unit="kg2/s2" /> 
     
    438445         <field id="bgfrchfx"     long_name="global mean heat flux from forcing"                                                                                                    unit="W/m2"     /> 
    439446         <field id="bgfrcsal"     long_name="global mean salt content from forcing"                                                                                                 unit="1e-3*km3" /> 
    440          <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface (no vvl)"                                                                            unit="degC"     /> 
    441          <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface (no vvl)"                                                                               unit="1e-3"     /> 
     447         <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface (linssh true)"                                                                            unit="degC"     /> 
     448         <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface (linssh true)"                                                                               unit="1e-3"     /> 
    442449      </field_group> 
    443450   
     
    564571       <field id="ttrd_totad"    long_name="temperature-trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="degC/s"                        /> 
    565572       <field id="strd_totad"    long_name="salinity   -trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="1e-3/s"                        /> 
    566        <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="degC/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
    567        <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     573       <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (linssh true)"                                                                                unit="degC/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     574       <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (linssh true)"                                                                                unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
    568575       <field id="ttrd_ldf"      long_name="temperature-trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_horizontal_mixing"   unit="degC/s"                        /> 
    569576       <field id="strd_ldf"      long_name="salinity   -trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_horizontal_mixing"      unit="1e-3/s"                        /> 
     
    663670       <field id="petrd_yad"     long_name="pe-trend: j-advection"                unit="W/m^3"                        /> 
    664671       <field id="petrd_zad"     long_name="pe-trend: k-advection"                unit="W/m^3"                        /> 
    665        <field id="petrd_sad"     long_name="pe-trend: surface adv. (no-vvl)"      unit="W/m^3"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     672       <field id="petrd_sad"     long_name="pe-trend: surface adv. (linssh true)"      unit="W/m^3"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
    666673       <field id="petrd_ldf"     long_name="pe-trend: lateral  diffusion"         unit="W/m^3"                        /> 
    667674       <field id="petrd_zdf"     long_name="pe-trend: vertical diffusion"         unit="W/m^3"                        /> 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def_nemo-pisces.xml

    r7646 r7828  
    216216       <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    217217 
    218        <!-- dbio_T on T grid : variables available with key_diaar5 --> 
     218       <!-- dbio_T on T grid : variables available with diaar5 --> 
    219219       <field id="TPP"         long_name="Total Primary production of phyto"                   unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    220220       <field id="TPNEW"       long_name="New Primary production of phyto"                     unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
  • trunk/NEMOGCM/TOOLS/DOMAINcfg/README

    r7421 r7828  
    1515just run : 
    1616::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
    17 ./make_domain_cfg.exe 
     17mpirun -np 1 ./make_domain_cfg.exe 
    1818::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
    1919NOTA: it can be run in multiproc mode, but in output there will be domain_cfg_00xx.nc files 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.