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2018-05-03T11:21:13+02:00 (3 years ago)
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cetlod
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dev_merge_2017 : validation of Offline configurations

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branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM
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  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/context_nemo.xml

    r7646 r9539  
    77<!-- $id$ --> 
    88<!-- Fields definition --> 
     9    <field_definition src="./field_def_nemo-opa.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    910    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    1011 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/file_def_nemo.xml

    r7646 r9539  
    88    --> 
    99 
    10    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
     10   <file_definition type="one_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    1111     
    1212      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r9527 r9539  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/OPA  :  ORCA2_OFF_PISCES configuration namelist: overwrite SHARED/namelist_ref 
     2!! NEMO/OCE :   Reference namelist_ref                                !! 
     3!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     4!! NEMO/OPA  :  1 - Domain & run manager (namrun, namcfg, namdom, namtsd, namcrs, namc1d, namc1d_uvd) 
     5!! namelists    2 - Surface boundary (namsbc, namsbc_flx, namsbc_blk, namsbc_cpl, 
     6!!                                    namsbc_sas, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
     7!!                                    namsbc_isf, namsbc_iscpl, namsbc_apr,  
     8!!                                    namsbc_ssr, namsbc_wave, namberg) 
     9!!              3 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     10!!              4 - top/bot boundary (namdrg, namdrg_top, namdrg_bot, nambbc, nambbl) 
     11!!              5 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_eiv, namtra_dmp) 
     12!!              6 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
     13!!              7 - Vertical physics (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_gls, namzdf_iwm) 
     14!!              8 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb) 
     15!!              9 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
     16!!             10 - miscellaneous    (nammpp, namctl, namsto) 
    317!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    418 
     
    923!!   namdom       space and time domain 
    1024!!   namcfg       parameters of the configuration                       (default: user defined GYRE) 
     25!!   namwad       Wetting and drying                                    (default: OFF) 
     26!!   namtsd       data: temperature & salinity                          (default: OFF) 
     27!!   namcrs       coarsened grid (for outputs and/or TOP)               (ln_crs =T) 
     28!!   namc1d       1D configuration options                              ("key_c1d") 
     29!!   namc1d_dyndmp 1D newtonian damping applied on currents             ("key_c1d") 
     30!!   namc1d_uvd   1D data (currents)                                    ("key_c1d") 
    1131!!====================================================================== 
    1232! 
     
    1434&namrun        !   parameters of the run 
    1535!----------------------------------------------------------------------- 
    16    cn_exp      =  "PISCES"  !  experience name  
    17    nn_it000    =       1    !  first time step 
    18    nn_itend    =    1460    !  last  time step (std 5475) 
    19    nn_stock    =    1460    !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     36   cn_exp      =  "PISCES"   !  experience name 
     37   nn_it000    =       1     !  first time step 
     38   nn_itend    =    1460     !  last  time step (std 5475) 
     39   nn_date0    =  010101     !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1) 
     40   nn_stock    =    1460     !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     41   ln_mskland  = .true.      !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     42   ln_cfmeta   = .true.      !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
     43   ln_clobber  = .true.      !  clobber (overwrite) an existing file 
    2044/ 
    2145!----------------------------------------------------------------------- 
     
    2448   ln_linssh   = .true.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
    2549   ! 
    26    rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    27 / 
    28 !----------------------------------------------------------------------- 
    29 &namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: user defined GYRE) 
    30 !----------------------------------------------------------------------- 
    31    ln_read_cfg = .true.    !  (=T) read the domain configuration file 
    32       cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"    ! domain configuration filename 
     50   rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics and tracer 
     51/ 
     52!----------------------------------------------------------------------- 
     53&namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: use namusr_def in namelist_cfg) 
     54!----------------------------------------------------------------------- 
     55   ln_read_cfg = .true.   !  (=T) read the domain configuration file 
     56      !                    !  (=F) user defined configuration           (F => create/check namusr_def) 
     57      cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"   ! domain configuration filename 
     58      ! 
     59/ 
     60!----------------------------------------------------------------------- 
     61&namtsd        !    Temperature & Salinity Data  (init/dmp)             (default: OFF) 
     62!----------------------------------------------------------------------- 
     63/ 
     64!----------------------------------------------------------------------- 
     65&namwad        !   Wetting and Drying (WaD)                             (default: OFF) 
     66!----------------------------------------------------------------------- 
     67/ 
     68!----------------------------------------------------------------------- 
     69&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              (ln_crs =T) 
     70!----------------------------------------------------------------------- 
     71/ 
     72!----------------------------------------------------------------------- 
     73&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d" default: PAPA station) 
     74!----------------------------------------------------------------------- 
     75/ 
     76!----------------------------------------------------------------------- 
     77&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d" default: OFF) 
     78!----------------------------------------------------------------------- 
     79/ 
     80!----------------------------------------------------------------------- 
     81&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d" default: OFF) 
     82!----------------------------------------------------------------------- 
    3383/ 
    3484 
     
    53103! 
    54104!----------------------------------------------------------------------- 
    55 &namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
     105&namsbc        !   Surface Boundary Condition manager                   (default: NO selection) 
    56106!----------------------------------------------------------------------- 
    57107   nn_fsbc     = 1         !  frequency of SBC module call 
    58    ln_blk      = .true.    !  Bulk formulation                          (T => fill namsbc_blk ) 
    59    ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration in the ocean            (T => fill namtra_qsr) 
    60 / 
    61 !----------------------------------------------------------------------- 
    62 &namsbc_blk   !   namsbc_blk  generic Bulk formula                      (ln_blk =T) 
    63 !----------------------------------------------------------------------- 
    64    ln_NCAR     = .true.   ! "NCAR"      algorithm   (Large and Yeager 2008) 
    65  
    66    cn_dir      = './'      !  root directory for the bulk data location 
    67    !___________!_________________________!___________________!___________!_____________!________!___________!______________________________________!__________!_______________! 
    68    !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ !       weights filename               ! rotation ! land/sea mask ! 
    69    !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                                      ! pairing  !    filename   ! 
    70    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'U_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Uwnd'   , '' 
    71    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'V_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Vwnd'   , '' 
    72    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'SWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    73    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'LWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    74    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'T_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    75    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'Q_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    76    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'PRC_MOD1',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    77    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'SNOW'    ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    78    sn_slp      = 'slp.15JUNE2009_fill'        ,    6         , 'SLP'     ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    79    sn_tdif     = 'taudif_core'                ,   24         , 'taudif'  ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     108      !                    !  (control sea-ice & iceberg model call) 
     109                     ! Type of air-sea fluxes  
     110   ln_usr      = .true.   !  user defined formulation                  (T => check usrdef_sbc) 
     111/ 
     112!----------------------------------------------------------------------- 
     113&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation        (ln_flx =T) 
     114!----------------------------------------------------------------------- 
     115/ 
     116!----------------------------------------------------------------------- 
     117&namsbc_blk    !   namsbc_blk  generic Bulk formula                     (ln_blk =T) 
     118!----------------------------------------------------------------------- 
     119/ 
     120!----------------------------------------------------------------------- 
     121&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
     122!----------------------------------------------------------------------- 
     123/ 
     124!----------------------------------------------------------------------- 
     125&namsbc_sas    !   Stand-Alone Surface module: ocean data               (SAS_SRC  only) 
     126!----------------------------------------------------------------------- 
     127/ 
     128!----------------------------------------------------------------------- 
     129&namsbc_iif    !   Ice-IF : use observed ice cover                      (nn_ice = 1) 
     130!----------------------------------------------------------------------- 
    80131/ 
    81132!----------------------------------------------------------------------- 
    82133&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr =T) 
    83134!----------------------------------------------------------------------- 
    84    !                       ! type of penetration                        (default: NO selection) 
    85    ln_qsr_rgb  = .true.       !  RGB light penetration (Red-Green-Blue) 
    86    ! 
    87    nn_chldta   =      1       !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
    88  
    89    cn_dir = './'  !  root directory for the chlorophyl data location 
    90    !___________!_________________________!___________________!___________!_____________!________!___________!__________________!__________!_______________! 
    91    !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    92    !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    93    sn_chl      ='chlorophyll'            ,        -1         , 'CHLA'    ,   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     135   !                       !  type of penetration                        (default: NO selection) 
     136   ln_qsr_2bd  = .true.      !  2BD light penetration (two bands) 
     137/ 
     138!----------------------------------------------------------------------- 
     139&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr =T) 
     140!----------------------------------------------------------------------- 
     141/ 
     142!----------------------------------------------------------------------- 
     143&namsbc_rnf    !   runoffs                                              (ln_rnf =T) 
     144!----------------------------------------------------------------------- 
     145/ 
     146!----------------------------------------------------------------------- 
     147&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing           (ln_apr_dyn =T) 
     148!----------------------------------------------------------------------- 
     149/ 
     150!----------------------------------------------------------------------- 
     151&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (ln_isfcav =T : read (ln_read_cfg=T)  
     152!-----------------------------------------------------------------------             or set or usr_def_zgr ) 
     153/ 
     154!----------------------------------------------------------------------- 
     155&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                     (ln_isfcav =T : read (ln_read_cfg=T)  
     156!-----------------------------------------------------------------------             or set or usr_def_zgr ) 
     157/ 
     158!----------------------------------------------------------------------- 
     159&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     160!----------------------------------------------------------------------- 
     161/ 
     162!----------------------------------------------------------------------- 
     163&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: OFF) 
     164!----------------------------------------------------------------------- 
    94165/ 
    95166 
     
    98169!!                                                                    !! 
    99170!!   namlbc        lateral momentum boundary condition                  (default: NO selection) 
    100 !!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif") 
     171!!   namagrif      agrif nested grid   (read by child model only)       ("key_agrif") 
    101172!!   nam_tide      Tidal forcing                                        (default: OFF) 
    102173!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         (default: OFF) 
     
    108179&namlbc        !   lateral momentum boundary condition                  (default: NO selection) 
    109180!----------------------------------------------------------------------- 
    110    rn_shlat    =    2.     !  no slip 
    111 / 
    112  
    113 !!====================================================================== 
    114 !!                     TOP OFF-line namelists                         !! 
     181   !                       !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
     182   rn_shlat    =  2        !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
     183/ 
     184!----------------------------------------------------------------------- 
     185&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
     186!----------------------------------------------------------------------- 
     187/ 
     188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&nam_tide      !   tide parameters                                      (default: OFF) 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191/ 
     192!----------------------------------------------------------------------- 
     193&nambdy        !  unstructured open boundaries                          (default: OFF) 
     194!----------------------------------------------------------------------- 
     195/ 
     196!----------------------------------------------------------------------- 
     197&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       (see nam_bdy) 
     198!----------------------------------------------------------------------- 
     199/ 
     200!----------------------------------------------------------------------- 
     201&nambdy_tide   !  tidal forcing at open boundaries                      (default: OFF) 
     202!----------------------------------------------------------------------- 
     203/ 
     204 
     205!!====================================================================== 
     206!!                ***  Top/Bottom boundary condition  ***             !! 
     207!!                                                                    !! 
     208!!   namdrg        top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
     209!!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_OFF=F & ln_isfcav=T) 
     210!!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_OFF=F) 
     211!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
     212!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
     213!!====================================================================== 
     214! 
     215!----------------------------------------------------------------------- 
     216&namdrg        !   top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
     217!----------------------------------------------------------------------- 
     218/ 
     219!----------------------------------------------------------------------- 
     220&namdrg_top    !   TOP friction                                         (ln_OFF =F & ln_isfcav=T) 
     221!----------------------------------------------------------------------- 
     222/ 
     223!----------------------------------------------------------------------- 
     224&namdrg_bot    !   BOTTOM friction                                      (ln_OFF =F) 
     225!----------------------------------------------------------------------- 
     226/ 
     227!----------------------------------------------------------------------- 
     228&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
     229!----------------------------------------------------------------------- 
     230/ 
     231!----------------------------------------------------------------------- 
     232&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
     233!----------------------------------------------------------------------- 
     234/ 
     235 
     236!!====================================================================== 
     237!!                        Tracer (T-S) namelists                      !! 
    115238!!                                                                    !! 
    116239!!   nameos        equation of state                                    (default: NO selection) 
    117 !!   namtra_ldf       lateral diffusion scheme                          (default: NO selection) 
    118 !!   namdta_dyn    offline TOP: ocean state read in files               (OFF_SRC only) 
    119 !!====================================================================== 
    120 ! 
    121 !----------------------------------------------------------------------- 
    122 &nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: OFF) 
    123 !----------------------------------------------------------------------- 
    124    ln_teos10    = .true.         !  = Use TEOS-10 equation of state 
     240!!   namtra_adv    advection scheme                                     (default: NO selection) 
     241!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme                             (default: NO selection) 
     242!!   namtra_mle    mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.)          (default: OFF) 
     243!!   namtra_eiv    eddy induced velocity param.                         (default: OFF) 
     244!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              (default: OFF) 
     245!!====================================================================== 
     246! 
     247!----------------------------------------------------------------------- 
     248&nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: NO selection) 
     249!----------------------------------------------------------------------- 
     250   ln_teos10   = .true.         !  = Use TEOS-10 
     251/ 
     252!----------------------------------------------------------------------- 
     253&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO selection) 
     254!----------------------------------------------------------------------- 
    125255/ 
    126256!----------------------------------------------------------------------- 
    127257&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO selection) 
    128258!----------------------------------------------------------------------- 
    129    ln_traldf_lap   = .true.    !    laplacian operator 
    130    ln_traldf_iso   = .true.    !  iso-neutral (Standard operator) 
    131    ln_traldf_msc   = .true.    !  Method of Stabilizing Correction      (both operators) 
     259   !                       !  Operator type: 
     260   ln_traldf_lap   = .true.   !    laplacian operator 
     261   ! 
     262   !                       !  Direction of action: 
     263   ln_traldf_iso   = .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     264   ! 
    132265   !                       !  Coefficients: 
    133    nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
    134       !                             !   = 20     aht = 1/2  Ud. max(e1,e2) 
    135       rn_Ud        = 0.018          !  lateral diffusive velocity [m/s] (nn_aht_ijk_t= 0, 10, 20, 30) 
     266   nn_aht_ijk_t    = 20         !  space/time variation of eddy coefficient: 
     267      !                             !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     268      !                             !   =  0           constant  
     269      !                             !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     270      !                             !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     271      !                             !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     272      !                             !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d 
     273      !                             !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing) 
     274      !                        !  time invariant coefficients:  aht0 = 1/2  Ud*Ld   (lap case)  
     275      !                             !                           or   = 1/12 Ud*Ld^3 (blp case) 
     276      rn_Ud        = 0.018           !  lateral diffusive velocity [m/s] (nn_aht_ijk_t= 0, 10, 20, 30) 
    136277      rn_Ld        = 200.e+3        !  lateral diffusive length   [m]   (nn_aht_ijk_t= 0, 10) 
    137278/ 
    138279!----------------------------------------------------------------------- 
    139 &namdta_dyn    !   offline: ocean state read in files                   (OFF_SRC) 
    140 !----------------------------------------------------------------------- 
    141    ln_dynrnf       =  .false.   !  runoffs option enabled (T) or not (F) 
    142    ln_dynrnf_depth =  .false.   ! runoffs is spread in vertical (T) or not (F) 
    143 !   fwbcorr      = 3.786e-06    ! annual global mean of empmr for ssh correction 
     280&namtra_mle    !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper)        (default: OFF) 
     281!----------------------------------------------------------------------- 
     282/ 
     283!----------------------------------------------------------------------- 
     284&namtra_eiv    !   eddy induced velocity param.                         (default: OFF) 
     285!----------------------------------------------------------------------- 
     286/ 
     287!----------------------------------------------------------------------- 
     288&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: OFF) 
     289!----------------------------------------------------------------------- 
     290/ 
     291 
     292!!====================================================================== 
     293!!                      ***  Dynamics namelists  ***                  !! 
     294!!                                                                    !! 
     295!!   nam_vvl       vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     296!!   namdyn_adv    formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
     297!!   namdyn_vor    advection scheme                                     (default: NO selection) 
     298!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient                        (default: NO selection) 
     299!!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (default: NO selection) 
     300!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme                             (default: NO selection) 
     301!!   namdta_dyn    offline TOP: dynamics read in files                  (OFF_SRC only) 
     302!!====================================================================== 
     303! 
     304!----------------------------------------------------------------------- 
     305&nam_vvl       !   vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     306!----------------------------------------------------------------------- 
     307/ 
     308!----------------------------------------------------------------------- 
     309&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
     310!----------------------------------------------------------------------- 
     311/ 
     312!----------------------------------------------------------------------- 
     313&namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: NO selection) 
     314!----------------------------------------------------------------------- 
     315/ 
     316!----------------------------------------------------------------------- 
     317&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: NO selection) 
     318!----------------------------------------------------------------------- 
     319/ 
     320!----------------------------------------------------------------------- 
     321&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO selection) 
     322!----------------------------------------------------------------------- 
     323/ 
     324!----------------------------------------------------------------------- 
     325&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO selection) 
     326!----------------------------------------------------------------------- 
     327/ 
     328!----------------------------------------------------------------------- 
     329&namdta_dyn    !   offline ocean input files                            (OFF_SRC only) 
     330!----------------------------------------------------------------------- 
     331   ln_dynrnf       =  .false.    !  runoffs option enabled (T) or not (F) 
     332   ln_dynrnf_depth =  .false.    !  runoffs is spread in vertical (T) or not (F) 
     333!   fwbcorr        = 3.786e-06   !  annual global mean of empmr for ssh correction 
    144334 
    145335   cn_dir      = './'      !  root directory for the ocean data location 
     
    162352   sn_vbl      = 'dyna_grid_V'           ,       120         , 'sobblcoy'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    163353/ 
     354 
     355!!====================================================================== 
     356!!                     vertical physics namelists                     !! 
     357!!                                                                    !! 
     358!!    namzdf        vertical physics manager                            (default: NO selection) 
     359!!    namzdf_ric    richardson number vertical mixing                   (ln_zdfric=T) 
     360!!    namzdf_tke    TKE vertical mixing                                 (ln_zdftke=T) 
     361!!    namzdf_gls    GLS vertical mixing                                 (ln_zdfgls=T) 
     362!!    namzdf_osm    OSM vertical diffusion                              (ln_zdfosm=T) 
     363!!    namzdf_iwm    tidal mixing parameterization                       (ln_zdfiwm=T) 
     364!!====================================================================== 
     365! 
     366!----------------------------------------------------------------------- 
     367&namzdf        !   vertical physics manager                             (default: NO selection) 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
     369/ 
     370!----------------------------------------------------------------------- 
     371&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       (ln_zdfric =T) 
     372!----------------------------------------------------------------------- 
     373/ 
     374!----------------------------------------------------------------------- 
     375&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  (ln_zdftke =T) 
     376!----------------------------------------------------------------------- 
     377/ 
     378!----------------------------------------------------------------------- 
     379&namzdf_gls    !   GLS vertical diffusion                               (ln_zdfgls =T) 
     380!----------------------------------------------------------------------- 
     381/ 
     382!----------------------------------------------------------------------- 
     383&namzdf_osm    !   OSM vertical diffusion                               (ln_zdfosm =T) 
     384!----------------------------------------------------------------------- 
     385/ 
     386!----------------------------------------------------------------------- 
     387&namzdf_iwm    !    internal wave-driven mixing parameterization        (ln_zdfiwm =T) 
     388!----------------------------------------------------------------------- 
     389/ 
     390 
     391!!====================================================================== 
     392!!                  ***  Diagnostics namelists  ***                   !! 
     393!!                                                                    !! 
     394!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         (default: OFF) 
     395!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics                        (default: OFF) 
     396!!   namhsb       Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
     397!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
     398!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
     399!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
     400!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ("key_diaharm") 
     401!!   namdct       transports through some sections                      ("key_diadct") 
     402!!   nam_diatmb   Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
     403!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default: OFF) 
     404!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
     405!!====================================================================== 
     406! 
     407!----------------------------------------------------------------------- 
     408&namtrd        !   trend diagnostics                                    (default: OFF) 
     409!----------------------------------------------------------------------- 
     410/ 
     411!----------------------------------------------------------------------- 
     412&namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                        (default: OFF) 
     413!----------------------------------------------------------------------- 
     414/ 
     415!----------------------------------------------------------------------- 
     416&namhsb        !  Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
     417!----------------------------------------------------------------------- 
     418/ 
     419!----------------------------------------------------------------------- 
     420&namdiu        !   Cool skin and warm layer models                      (default: OFF) 
     421!----------------------------------------------------------------------- 
     422/ 
     423!----------------------------------------------------------------------- 
     424&namflo        !   float parameters                                     ("key_float") 
     425!----------------------------------------------------------------------- 
     426/ 
     427!----------------------------------------------------------------------- 
     428&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ("key_diaharm") 
     429!----------------------------------------------------------------------- 
     430/ 
     431!----------------------------------------------------------------------- 
     432&namdct        ! transports through some sections                       ("key_diadct") 
     433!----------------------------------------------------------------------- 
     434/ 
     435!----------------------------------------------------------------------- 
     436&nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
     437!----------------------------------------------------------------------- 
     438/ 
     439!----------------------------------------------------------------------- 
     440&nam_dia25h    !  25h Mean Output                                       (default: OFF) 
     441!----------------------------------------------------------------------- 
     442/ 
     443!----------------------------------------------------------------------- 
     444&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     445!----------------------------------------------------------------------- 
     446/ 
     447 
     448!!====================================================================== 
     449!!               ***  Observation & Assimilation  ***                 !! 
     450!!                                                                    !! 
     451!!   namobs       observation and model comparison                      (default: OFF) 
     452!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     453!!====================================================================== 
     454! 
     455!----------------------------------------------------------------------- 
     456&namobs        !  observation usage switch                              (default: OFF) 
     457!----------------------------------------------------------------------- 
     458/ 
     459!----------------------------------------------------------------------- 
     460&nam_asminc    !   assimilation increments                              ('key_asminc') 
     461!----------------------------------------------------------------------- 
     462/ 
     463 
     464!!====================================================================== 
     465!!                  ***  Miscellaneous namelists  ***                 !! 
     466!!                                                                    !! 
     467!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi") 
     468!!   namctl            Control prints                                   (default: OFF) 
     469!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS                (default: OFF) 
     470!!====================================================================== 
     471! 
     472!----------------------------------------------------------------------- 
     473&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi") 
     474!----------------------------------------------------------------------- 
     475/ 
     476!----------------------------------------------------------------------- 
     477&namctl        !   Control prints                                       (default: OFF) 
     478!----------------------------------------------------------------------- 
     479/ 
     480!----------------------------------------------------------------------- 
     481&namsto        ! Stochastic parametrization of EOS                      (default: OFF) 
     482!----------------------------------------------------------------------- 
     483/ 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_TRC/EXP00/context_nemo.xml

    r7635 r9539  
    77<!-- $id$ --> 
    88<!-- Fields definition --> 
    9     <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
     9    <field_definition src="./field_def_nemo-opa.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
     10    <field_definition src="./field_def_nemo-innerttrc.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    1011 
    1112<!-- Files definition --> 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_TRC/EXP00/namelist_cfg

    r9527 r9539  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/OPA  :  ORCA2_OFF_TRC configuration namelist: overwrite SHARED/namelist_ref 
     2!! NEMO/OCE :   Reference namelist_ref                                !! 
     3!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     4!! NEMO/OPA  :  1 - Domain & run manager (namrun, namcfg, namdom, namtsd, namcrs, namc1d, namc1d_uvd) 
     5!! namelists    2 - Surface boundary (namsbc, namsbc_flx, namsbc_blk, namsbc_cpl, 
     6!!                                    namsbc_sas, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
     7!!                                    namsbc_isf, namsbc_iscpl, namsbc_apr,  
     8!!                                    namsbc_ssr, namsbc_wave, namberg) 
     9!!              3 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     10!!              4 - top/bot boundary (namdrg, namdrg_top, namdrg_bot, nambbc, nambbl) 
     11!!              5 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_eiv, namtra_dmp) 
     12!!              6 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
     13!!              7 - Vertical physics (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_gls, namzdf_iwm) 
     14!!              8 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb) 
     15!!              9 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
     16!!             10 - miscellaneous    (nammpp, namctl, namsto) 
    317!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    418 
     
    923!!   namdom       space and time domain 
    1024!!   namcfg       parameters of the configuration                       (default: user defined GYRE) 
     25!!   namwad       Wetting and drying                                    (default: OFF) 
     26!!   namtsd       data: temperature & salinity                          (default: OFF) 
     27!!   namcrs       coarsened grid (for outputs and/or TOP)               (ln_crs =T) 
     28!!   namc1d       1D configuration options                              ("key_c1d") 
     29!!   namc1d_dyndmp 1D newtonian damping applied on currents             ("key_c1d") 
     30!!   namc1d_uvd   1D data (currents)                                    ("key_c1d") 
    1131!!====================================================================== 
    1232! 
     
    1434&namrun        !   parameters of the run 
    1535!----------------------------------------------------------------------- 
    16    cn_exp      =  "TRACERS"  !  experience name  
    17    nn_it000    =       1    !  first time step 
    18    nn_itend    =    1460    !  last  time step (std 1460) 
    19    nn_stock    =    1460    !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     36   cn_exp      =  "TRACERS"  !  experience name 
     37   nn_it000    =       1     !  first time step 
     38   nn_itend    =    14600    !  last  time step (std 5475) 
     39   nn_date0    =  19600101   !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1) 
     40   nn_stock    =    14600    !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     41   ln_mskland  = .true.      !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     42   ln_cfmeta   = .true.      !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
     43   ln_clobber  = .true.      !  clobber (overwrite) an existing file 
    2044/ 
    2145!----------------------------------------------------------------------- 
     
    2448   ln_linssh   = .true.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
    2549   ! 
    26    rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    27 / 
    28 !----------------------------------------------------------------------- 
    29 &namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: user defined GYRE) 
    30 !----------------------------------------------------------------------- 
    31    ln_read_cfg = .true.    !  (=T) read the domain configuration file 
    32       cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"    ! domain configuration filename 
     50   rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics and tracer 
     51/ 
     52!----------------------------------------------------------------------- 
     53&namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: use namusr_def in namelist_cfg) 
     54!----------------------------------------------------------------------- 
     55   ln_read_cfg = .true.   !  (=T) read the domain configuration file 
     56      !                    !  (=F) user defined configuration           (F => create/check namusr_def) 
     57      cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"   ! domain configuration filename 
     58      ! 
     59/ 
     60!----------------------------------------------------------------------- 
     61&namtsd        !    Temperature & Salinity Data  (init/dmp)             (default: OFF) 
     62!----------------------------------------------------------------------- 
     63/ 
     64!----------------------------------------------------------------------- 
     65&namwad        !   Wetting and Drying (WaD)                             (default: OFF) 
     66!----------------------------------------------------------------------- 
     67/ 
     68!----------------------------------------------------------------------- 
     69&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              (ln_crs =T) 
     70!----------------------------------------------------------------------- 
     71/ 
     72!----------------------------------------------------------------------- 
     73&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d" default: PAPA station) 
     74!----------------------------------------------------------------------- 
     75/ 
     76!----------------------------------------------------------------------- 
     77&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d" default: OFF) 
     78!----------------------------------------------------------------------- 
     79/ 
     80!----------------------------------------------------------------------- 
     81&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d" default: OFF) 
     82!----------------------------------------------------------------------- 
    3383/ 
    3484 
     
    53103! 
    54104!----------------------------------------------------------------------- 
    55 &namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
     105&namsbc        !   Surface Boundary Condition manager                   (default: NO selection) 
    56106!----------------------------------------------------------------------- 
    57107   nn_fsbc     = 1         !  frequency of SBC module call 
    58    ln_blk      = .true.    !  Bulk formulation                          (T => fill namsbc_blk ) 
    59 / 
    60 !----------------------------------------------------------------------- 
    61 &namsbc_blk   !   namsbc_blk  generic Bulk formula                      (ln_blk =T) 
    62 !----------------------------------------------------------------------- 
    63    ln_NCAR     = .true.   ! "NCAR"      algorithm   (Large and Yeager 2008) 
    64  
    65    cn_dir      = './'      !  root directory for the bulk data location 
    66    !___________!_________________________!___________________!___________!_____________!________!___________!______________________________________!__________!_______________! 
    67    !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ !       weights filename               ! rotation ! land/sea mask ! 
    68    !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                                      ! pairing  !    filename   ! 
    69    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'U_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Uwnd'   , '' 
    70    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'V_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Vwnd'   , '' 
    71    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'SWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    72    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'LWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    73    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'T_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    74    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'Q_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    75    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'PRC_MOD1',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    76    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'SNOW'    ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    77    sn_slp      = 'slp.15JUNE2009_fill'        ,    6         , 'SLP'     ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    78    sn_tdif     = 'taudif_core'                ,   24         , 'taudif'  ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    79 / 
     108      !                    !  (control sea-ice & iceberg model call) 
     109                     ! Type of air-sea fluxes  
     110   ln_usr      = .true.   !  user defined formulation                  (T => check usrdef_sbc) 
     111/ 
     112!----------------------------------------------------------------------- 
     113&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation        (ln_flx =T) 
     114!----------------------------------------------------------------------- 
     115/ 
     116!----------------------------------------------------------------------- 
     117&namsbc_blk    !   namsbc_blk  generic Bulk formula                     (ln_blk =T) 
     118!----------------------------------------------------------------------- 
     119/ 
     120!----------------------------------------------------------------------- 
     121&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
     122!----------------------------------------------------------------------- 
     123/ 
     124!----------------------------------------------------------------------- 
     125&namsbc_sas    !   Stand-Alone Surface module: ocean data               (SAS_SRC  only) 
     126!----------------------------------------------------------------------- 
     127/ 
     128!----------------------------------------------------------------------- 
     129&namsbc_iif    !   Ice-IF : use observed ice cover                      (nn_ice = 1) 
     130!----------------------------------------------------------------------- 
     131/ 
     132!----------------------------------------------------------------------- 
     133&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr =T) 
     134!----------------------------------------------------------------------- 
     135   !                       !  type of penetration                        (default: NO selection) 
     136   ln_qsr_2bd  = .true.      !  2BD light penetration (two bands) 
     137/ 
     138!----------------------------------------------------------------------- 
     139&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr =T) 
     140!----------------------------------------------------------------------- 
     141/ 
     142!----------------------------------------------------------------------- 
     143&namsbc_rnf    !   runoffs                                              (ln_rnf =T) 
     144!----------------------------------------------------------------------- 
     145/ 
     146!----------------------------------------------------------------------- 
     147&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing           (ln_apr_dyn =T) 
     148!----------------------------------------------------------------------- 
     149/ 
     150!----------------------------------------------------------------------- 
     151&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (ln_isfcav =T : read (ln_read_cfg=T)  
     152!-----------------------------------------------------------------------             or set or usr_def_zgr ) 
     153/ 
     154!----------------------------------------------------------------------- 
     155&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                     (ln_isfcav =T : read (ln_read_cfg=T)  
     156!-----------------------------------------------------------------------             or set or usr_def_zgr ) 
     157/ 
     158!----------------------------------------------------------------------- 
     159&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     160!----------------------------------------------------------------------- 
     161/ 
     162!----------------------------------------------------------------------- 
     163&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: OFF) 
     164!----------------------------------------------------------------------- 
     165/ 
     166 
    80167!!====================================================================== 
    81168!!               ***  Lateral boundary condition  ***                 !! 
    82169!!                                                                    !! 
    83170!!   namlbc        lateral momentum boundary condition                  (default: NO selection) 
    84 !!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif") 
     171!!   namagrif      agrif nested grid   (read by child model only)       ("key_agrif") 
    85172!!   nam_tide      Tidal forcing                                        (default: OFF) 
    86173!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         (default: OFF) 
     
    92179&namlbc        !   lateral momentum boundary condition                  (default: NO selection) 
    93180!----------------------------------------------------------------------- 
    94    rn_shlat    =    2.     !  no slip 
    95 / 
    96  
    97 !!====================================================================== 
    98 !!                     TOP OFF-line namelists                         !! 
     181   !                       !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
     182   rn_shlat    =  2        !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
     183/ 
     184!----------------------------------------------------------------------- 
     185&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
     186!----------------------------------------------------------------------- 
     187/ 
     188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&nam_tide      !   tide parameters                                      (default: OFF) 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191/ 
     192!----------------------------------------------------------------------- 
     193&nambdy        !  unstructured open boundaries                          (default: OFF) 
     194!----------------------------------------------------------------------- 
     195/ 
     196!----------------------------------------------------------------------- 
     197&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       (see nam_bdy) 
     198!----------------------------------------------------------------------- 
     199/ 
     200!----------------------------------------------------------------------- 
     201&nambdy_tide   !  tidal forcing at open boundaries                      (default: OFF) 
     202!----------------------------------------------------------------------- 
     203/ 
     204 
     205!!====================================================================== 
     206!!                ***  Top/Bottom boundary condition  ***             !! 
     207!!                                                                    !! 
     208!!   namdrg        top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
     209!!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_OFF=F & ln_isfcav=T) 
     210!!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_OFF=F) 
     211!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
     212!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
     213!!====================================================================== 
     214! 
     215!----------------------------------------------------------------------- 
     216&namdrg        !   top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
     217!----------------------------------------------------------------------- 
     218/ 
     219!----------------------------------------------------------------------- 
     220&namdrg_top    !   TOP friction                                         (ln_OFF =F & ln_isfcav=T) 
     221!----------------------------------------------------------------------- 
     222/ 
     223!----------------------------------------------------------------------- 
     224&namdrg_bot    !   BOTTOM friction                                      (ln_OFF =F) 
     225!----------------------------------------------------------------------- 
     226/ 
     227!----------------------------------------------------------------------- 
     228&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
     229!----------------------------------------------------------------------- 
     230/ 
     231!----------------------------------------------------------------------- 
     232&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
     233!----------------------------------------------------------------------- 
     234/ 
     235 
     236!!====================================================================== 
     237!!                        Tracer (T-S) namelists                      !! 
    99238!!                                                                    !! 
    100239!!   nameos        equation of state                                    (default: NO selection) 
    101 !!   namtra_ldf       lateral diffusion scheme                          (default: NO selection) 
    102 !!   namdta_dyn    offline TOP: ocean state read in files               (OFF_SRC only) 
    103 !!====================================================================== 
    104 ! 
    105 !----------------------------------------------------------------------- 
    106 &nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: OFF) 
    107 !----------------------------------------------------------------------- 
    108    ln_teos10    = .true.         !  = Use TEOS-10 equation of state 
     240!!   namtra_adv    advection scheme                                     (default: NO selection) 
     241!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme                             (default: NO selection) 
     242!!   namtra_mle    mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.)          (default: OFF) 
     243!!   namtra_eiv    eddy induced velocity param.                         (default: OFF) 
     244!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              (default: OFF) 
     245!!====================================================================== 
     246! 
     247!----------------------------------------------------------------------- 
     248&nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: NO selection) 
     249!----------------------------------------------------------------------- 
     250   ln_teos10   = .true.         !  = Use TEOS-10 
     251/ 
     252!----------------------------------------------------------------------- 
     253&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO selection) 
     254!----------------------------------------------------------------------- 
    109255/ 
    110256!----------------------------------------------------------------------- 
    111257&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO selection) 
    112258!----------------------------------------------------------------------- 
    113    ln_traldf_lap   = .true.    !    laplacian operator 
    114    ln_traldf_iso   = .true.    !  iso-neutral (Standard operator) 
    115    ln_traldf_msc   = .true.    !  Method of Stabilizing Correction      (both operators) 
     259   !                       !  Operator type: 
     260   ln_traldf_lap   = .true.   !    laplacian operator 
     261   ! 
     262   !                       !  Direction of action: 
     263   ln_traldf_iso   = .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     264   ! 
    116265   !                       !  Coefficients: 
    117    nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
    118       !                             !   = 20     aht = 1/2  Ud. max(e1,e2) 
    119       rn_Ud        = 0.018          !  lateral diffusive velocity [m/s] (nn_aht_ijk_t= 0, 10, 20, 30) 
     266   nn_aht_ijk_t    = 20         !  space/time variation of eddy coefficient: 
     267      !                             !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     268      !                             !   =  0           constant  
     269      !                             !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     270      !                             !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     271      !                             !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     272      !                             !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d 
     273      !                             !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing) 
     274      !                        !  time invariant coefficients:  aht0 = 1/2  Ud*Ld   (lap case)  
     275      !                             !                           or   = 1/12 Ud*Ld^3 (blp case) 
     276      rn_Ud        = 0.018           !  lateral diffusive velocity [m/s] (nn_aht_ijk_t= 0, 10, 20, 30) 
    120277      rn_Ld        = 200.e+3        !  lateral diffusive length   [m]   (nn_aht_ijk_t= 0, 10) 
    121278/ 
    122279!----------------------------------------------------------------------- 
    123 &namdta_dyn    !   offline: ocean state read in files                   (OFF_SRC) 
    124 !----------------------------------------------------------------------- 
    125    ln_dynrnf       =  .false.   !  runoffs option enabled (T) or not (F) 
    126    ln_dynrnf_depth =  .false.   ! runoffs is spread in vertical (T) or not (F) 
    127 !   fwbcorr      = 3.786e-06    ! annual global mean of empmr for ssh correction 
    128  
     280&namtra_mle    !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper)        (default: OFF) 
     281!----------------------------------------------------------------------- 
     282/ 
     283!----------------------------------------------------------------------- 
     284&namtra_eiv    !   eddy induced velocity param.                         (default: OFF) 
     285!----------------------------------------------------------------------- 
     286/ 
     287!----------------------------------------------------------------------- 
     288&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: OFF) 
     289!----------------------------------------------------------------------- 
     290/ 
     291 
     292!!====================================================================== 
     293!!                      ***  Dynamics namelists  ***                  !! 
     294!!                                                                    !! 
     295!!   nam_vvl       vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     296!!   namdyn_adv    formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
     297!!   namdyn_vor    advection scheme                                     (default: NO selection) 
     298!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient                        (default: NO selection) 
     299!!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (default: NO selection) 
     300!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme                             (default: NO selection) 
     301!!   namdta_dyn    offline TOP: dynamics read in files                  (OFF_SRC only) 
     302!!====================================================================== 
     303! 
     304!----------------------------------------------------------------------- 
     305&nam_vvl       !   vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     306!----------------------------------------------------------------------- 
     307/ 
     308!----------------------------------------------------------------------- 
     309&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
     310!----------------------------------------------------------------------- 
     311/ 
     312!----------------------------------------------------------------------- 
     313&namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: NO selection) 
     314!----------------------------------------------------------------------- 
     315/ 
     316!----------------------------------------------------------------------- 
     317&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: NO selection) 
     318!----------------------------------------------------------------------- 
     319/ 
     320!----------------------------------------------------------------------- 
     321&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO selection) 
     322!----------------------------------------------------------------------- 
     323/ 
     324!----------------------------------------------------------------------- 
     325&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO selection) 
     326!----------------------------------------------------------------------- 
     327/ 
     328!----------------------------------------------------------------------- 
     329&namdta_dyn    !   offline ocean input files                            (OFF_SRC only) 
     330!----------------------------------------------------------------------- 
     331   ln_dynrnf       =  .false.    !  runoffs option enabled (T) or not (F) 
     332   ln_dynrnf_depth =  .false.    !  runoffs is spread in vertical (T) or not (F) 
     333!   fwbcorr        = 3.786e-06   !  annual global mean of empmr for ssh correction 
    129334 
    130335   cn_dir      = './'      !  root directory for the ocean data location 
     
    147352   sn_vbl      = 'dyna_grid_V'           ,       120         , 'sobblcoy'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    148353/ 
     354 
     355!!====================================================================== 
     356!!                     vertical physics namelists                     !! 
     357!!                                                                    !! 
     358!!    namzdf        vertical physics manager                            (default: NO selection) 
     359!!    namzdf_ric    richardson number vertical mixing                   (ln_zdfric=T) 
     360!!    namzdf_tke    TKE vertical mixing                                 (ln_zdftke=T) 
     361!!    namzdf_gls    GLS vertical mixing                                 (ln_zdfgls=T) 
     362!!    namzdf_osm    OSM vertical diffusion                              (ln_zdfosm=T) 
     363!!    namzdf_iwm    tidal mixing parameterization                       (ln_zdfiwm=T) 
     364!!====================================================================== 
     365! 
     366!----------------------------------------------------------------------- 
     367&namzdf        !   vertical physics manager                             (default: NO selection) 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
     369/ 
     370!----------------------------------------------------------------------- 
     371&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       (ln_zdfric =T) 
     372!----------------------------------------------------------------------- 
     373/ 
     374!----------------------------------------------------------------------- 
     375&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  (ln_zdftke =T) 
     376!----------------------------------------------------------------------- 
     377/ 
     378!----------------------------------------------------------------------- 
     379&namzdf_gls    !   GLS vertical diffusion                               (ln_zdfgls =T) 
     380!----------------------------------------------------------------------- 
     381/ 
     382!----------------------------------------------------------------------- 
     383&namzdf_osm    !   OSM vertical diffusion                               (ln_zdfosm =T) 
     384!----------------------------------------------------------------------- 
     385/ 
     386!----------------------------------------------------------------------- 
     387&namzdf_iwm    !    internal wave-driven mixing parameterization        (ln_zdfiwm =T) 
     388!----------------------------------------------------------------------- 
     389/ 
     390 
     391!!====================================================================== 
     392!!                  ***  Diagnostics namelists  ***                   !! 
     393!!                                                                    !! 
     394!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         (default: OFF) 
     395!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics                        (default: OFF) 
     396!!   namhsb       Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
     397!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
     398!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
     399!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
     400!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ("key_diaharm") 
     401!!   namdct       transports through some sections                      ("key_diadct") 
     402!!   nam_diatmb   Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
     403!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default: OFF) 
     404!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
     405!!====================================================================== 
     406! 
     407!----------------------------------------------------------------------- 
     408&namtrd        !   trend diagnostics                                    (default: OFF) 
     409!----------------------------------------------------------------------- 
     410/ 
     411!----------------------------------------------------------------------- 
     412&namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                        (default: OFF) 
     413!----------------------------------------------------------------------- 
     414/ 
     415!----------------------------------------------------------------------- 
     416&namhsb        !  Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
     417!----------------------------------------------------------------------- 
     418/ 
     419!----------------------------------------------------------------------- 
     420&namdiu        !   Cool skin and warm layer models                      (default: OFF) 
     421!----------------------------------------------------------------------- 
     422/ 
     423!----------------------------------------------------------------------- 
     424&namflo        !   float parameters                                     ("key_float") 
     425!----------------------------------------------------------------------- 
     426/ 
     427!----------------------------------------------------------------------- 
     428&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ("key_diaharm") 
     429!----------------------------------------------------------------------- 
     430/ 
     431!----------------------------------------------------------------------- 
     432&namdct        ! transports through some sections                       ("key_diadct") 
     433!----------------------------------------------------------------------- 
     434/ 
     435!----------------------------------------------------------------------- 
     436&nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
     437!----------------------------------------------------------------------- 
     438/ 
     439!----------------------------------------------------------------------- 
     440&nam_dia25h    !  25h Mean Output                                       (default: OFF) 
     441!----------------------------------------------------------------------- 
     442/ 
     443!----------------------------------------------------------------------- 
     444&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     445!----------------------------------------------------------------------- 
     446/ 
     447 
     448!!====================================================================== 
     449!!               ***  Observation & Assimilation  ***                 !! 
     450!!                                                                    !! 
     451!!   namobs       observation and model comparison                      (default: OFF) 
     452!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     453!!====================================================================== 
     454! 
     455!----------------------------------------------------------------------- 
     456&namobs        !  observation usage switch                              (default: OFF) 
     457!----------------------------------------------------------------------- 
     458/ 
     459!----------------------------------------------------------------------- 
     460&nam_asminc    !   assimilation increments                              ('key_asminc') 
     461!----------------------------------------------------------------------- 
     462/ 
     463 
     464!!====================================================================== 
     465!!                  ***  Miscellaneous namelists  ***                 !! 
     466!!                                                                    !! 
     467!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi") 
     468!!   namctl            Control prints                                   (default: OFF) 
     469!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS                (default: OFF) 
     470!!====================================================================== 
     471! 
     472!----------------------------------------------------------------------- 
     473&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi") 
     474!----------------------------------------------------------------------- 
     475/ 
     476!----------------------------------------------------------------------- 
     477&namctl        !   Control prints                                       (default: OFF) 
     478!----------------------------------------------------------------------- 
     479/ 
     480!----------------------------------------------------------------------- 
     481&namsto        ! Stochastic parametrization of EOS                      (default: OFF) 
     482!----------------------------------------------------------------------- 
     483/ 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_TRC/EXP00/namelist_top_cfg

    r9516 r9539  
    22&namtrc_run      !   run information 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
     4   ln_top_euler = .true. 
    45/ 
    56!----------------------------------------------------------------------- 
     
    1213   ln_age        =  .true.      !  Run the sea water age tracer 
    1314   ln_cfc11      =  .true.      !  Run the CFC11 passive tracer 
    14    ln_cfc12      =  .false.     !  Run the CFC12 passive tracer 
    15    ln_sf6        =  .false.     !  Run the SF6 passive tracer 
     15   ln_cfc12      =  .true.      !  Run the CFC12 passive tracer 
     16   ln_sf6        =  .true.      !  Run the SF6 passive tracer 
    1617   ln_c14        =  .true.      !  Run the Radiocarbon passive tracer 
    1718/ 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def_nemo-pisces.xml

    r9138 r9539  
    113113       <field id="DOM"         long_name="Dissolved Organic Matter"                 unit="mmol-N/m3" /> 
    114114       <field id="DOM_e3t"     long_name="DOM * e3t"                                unit="mmol-N/m2"  > DOM * e3t </field > 
    115  
    116        <!-- CFC11 : variables available with ln_cfc11 --> 
    117        <field id="CFC11"       long_name="Chlorofluoro carbon11 Concentration"      unit="umol/m3" /> 
    118        <field id="CFC11_e3t"   long_name="CFC11 * e3t"                              unit="umol/m2"  > CFC11 * e3t </field > 
    119  
    120        <!-- CFC12 : variables available with ln_cfc12 --> 
    121        <field id="CFC12"       long_name="Chlorofluoro carbon12 Concentration"      unit="umol/m3" /> 
    122        <field id="CFC12_e3t"   long_name="CFC12 * e3t"                              unit="umol/m2"  > CFC12 * e3t </field > 
    123  
    124        <!-- SF6 : variables available with ln_sf6 --> 
    125        <field id="SF6"       long_name="Sulfur hexafluoride Concentration"      unit="umol/m3" /> 
    126        <field id="SF6_e3t"   long_name="SF6 * e3t"                              unit="umol/m2"  > SF6 * e3t </field > 
    127  
    128        <!-- C14 : variables available with ln_c14 --> 
    129        <field id="RC14"        long_name="Radiocarbon ratio"                        unit="-"         /> 
    130        <field id="RC14_e3t"    long_name="RC14 * e3t"                               unit="m"  > RC14 * e3t </field > 
    131  
    132        <!-- AGE : variables available with ln_age --> 
    133        <field id="Age"        long_name="Sea water age since surface contact"       unit="yr"         /> 
    134        <field id="Age_e3t"    long_name="Age * e3t"                                 unit="yr * m"  > Age * e3t </field > 
    135115 
    136116     </field_group> 
     
    254234       <field id="SEDPOC"      long_name="SEDPOC"                                  unit=""  />  
    255235       <field id="TDETSED"     long_name="TDETSED"                                 unit=""  />  
    256  
    257        <!-- CFC11 : variables available with ln_cfc11 --> 
    258        <field id="qtr_CFC11"    long_name="Air-sea flux of CFC-11"                  unit="mol/m2/s"   /> 
    259        <field id="qint_CFC11"   long_name="Cumulative air-sea flux of CFC-11"       unit="mol/m2"     /> 
    260  
    261        <!-- CFC12 : variables available with ln_cfc12 --> 
    262        <field id="qtr_CFC12"    long_name="Air-sea flux of CFC12"                  unit="mol/m2/s"   /> 
    263        <field id="qint_CFC12"   long_name="Cumulative air-sea flux of CFC12"       unit="mol/m2"     /> 
    264  
    265        <!-- SF6 : variables available with ln_sf6 --> 
    266        <field id="qtr_SF6"      long_name="Air-sea flux of SF6"                    unit="mol/m2/s"   /> 
    267        <field id="qint_SF6"     long_name="Cumulative air-sea flux of SF6"         unit="mol/m2"     /> 
    268  
    269        <!--  C14 : variables available with ln_c14 --> 
    270        <field id="DeltaC14"     long_name="Delta C14"                              unit="permil" grid_ref="grid_T_3D"   /> 
    271        <field id="C14Age"       long_name="Radiocarbon age"                        unit="yr"     grid_ref="grid_T_3D"   /> 
    272        <field id="RAge"         long_name="Reservoir Age"                          unit="yr"     /> 
    273        <field id="qtr_C14"      long_name="Air-sea flux of C14"                    unit="1/m2/s"   /> 
    274        <field id="qint_C14"     long_name="Cumulative air-sea flux of C14"         unit="1/m2"     /> 
    275236     </field_group> 
    276237 
     
    288249       <field id="tnfix"           long_name="Global total nitrogen fixation"                     unit="mol/s"   /> 
    289250       <field id="tdenit"          long_name="Total denitrification"                              unit="mol/s"   /> 
    290      <!-- C14 scalar  --> 
    291        <field id="AtmCO2"          long_name="Global atmospheric CO2"                             unit="ppm"   /> 
    292        <field id="AtmC14"          long_name="Global atmospheric DeltaC14"                        unit="permil"   /> 
    293        <field id="K_C14"           long_name="Global 14C/C exchange velocity"                     unit="m/yr"   /> 
    294        <field id="K_CO2"           long_name="Global CO2 piston velocity"                         unit="cm/h"   /> 
    295        <field id="C14Inv"          long_name="global Radiocarbon ocean inventory"                 unit="10^26 atoms"   /> 
    296251     </field_group> 
    297252 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_trc_ref

    r8599 r9539  
    1111   ! 
    1212   ! Formatted file of annual hemisperic CFCs concentration in the atmosphere (ppt) 
    13    clname     = 'CFCs_in_air_CMIP6.dat' 
     13   clname     = 'CFCs_CMIP6.dat' 
    1414/ 
    1515! 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/NEMO/OFF_SRC/nemogcm.F90

    r9436 r9539  
    109109         ! 
    110110         IF( istp /= nit000 )   CALL day        ( istp )         ! Calendar (day was already called at nit000 in day_init) 
    111                                 CALL iom_setkt  ( istp - nit000 + 1, "nemo" )   ! say to iom that we are at time step kstp 
     111                                CALL iom_setkt  ( istp - nit000 + 1, cxios_context )   ! say to iom that we are at time step kstp 
    112112                                CALL dta_dyn    ( istp )         ! Interpolation of the dynamical fields 
    113113         IF( .NOT.ln_linssh )   CALL dta_dyn_swp( istp )         ! swap of sea  surface height and vertical scale factors 
  • branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zsed.F90

    r9125 r9539  
    119119      IF( ln_dust ) THEN 
    120120         !                                               
    121          ALLOCATE( zsidep(jpi,jpj) ) 
    122          ALLOCATE( zpdep(jpi,jpj,jpk), zirondep(jpi,jpj,jpk) ) 
     121         ALLOCATE( zsidep(jpi,jpj), zpdep(jpi,jpj,jpk), zirondep(jpi,jpj,jpk) ) 
    123122         !                                              ! Iron and Si deposition at the surface 
    124123         IF( ln_solub ) THEN 
     
    138137         !                                              ! Iron solubilization of particles in the water column 
    139138         tra(:,:,1,jpsil) = tra(:,:,1,jpsil) + zsidep  (:,:) 
    140          tra(:,:,:,jppo4) = tra(:,:,:,jppo4) + zpdep   (:,:,:) 
    141          tra(:,:,:,jpfer) = tra(:,:,:,jpfer) + zirondep(:,:,:)  
     139         DO jk = 1, jpkm1 
     140            tra(:,:,jk,jppo4) = tra(:,:,jk,jppo4) + zpdep   (:,:,jk) 
     141            tra(:,:,jk,jpfer) = tra(:,:,jk,jpfer) + zirondep(:,:,jk)  
     142         ENDDO 
    142143         !  
    143144         IF( lk_iomput ) THEN 
     
    149150            ENDIF 
    150151         ENDIF 
    151          DEALLOCATE( zsidep ) 
    152          DEALLOCATE( zpdep, zirondep ) 
     152         DEALLOCATE( zsidep, zpdep, zirondep ) 
    153153         !                                               
    154154      ENDIF 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.