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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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2014WP/Met_Office (diff) – NEMO

Changes between Version 2 and Version 3 of 2014WP/Met_Office


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Timestamp:
2013-11-05T17:26:19+01:00 (10 years ago)
Author:
rfurner
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  • 2014WP/Met_Office

    v2 v3  
    99 
    1010|| Name || Institution || % || Position || 
    11 || xx || xx || xx || xx || 
     11|| Rachel Furner || Met Office || 40 || NEMO officer || 
     12|| Dave Storkey || Met Office || 20 || NEMO developer || 
     13|| Enda O'Dea || Met Office || 20 || NEMO developer || 
     14|| Daley Calvert || Met Office || 20 || NEMO developer || 
    1215 
    1316Summary: List here actions of the institution so as contributions to [https://forge.ipsl.jussieu.fr/nemo/wiki/2014WP/2014Stream0 shared actions] 
    1417 
    15 || Action || Brief description || Status || Branch name || Trac ticket n° || Wiki page name || Reviewer(s) || Review status || Nb of weeks || Ready for merge If "NO", reason and status for 2015 || 
    16 || Met_Office-1 || xx || xx || || || || || || || || 
     18|| Action || || Brief description || Status || Branch name || Trac ticket n° || Wiki page name || Reviewer(s) || Review status || Nb of weeks || Ready for merge If "NO", reason and status for 2015 || 
     19|| Met_Office-1 || || Ice shelf cavities || || || || || || || || || 
     20|| Met_Office-2 || || === '''Masked damping''' === || || || || || || || || || 
     21|| Met_Office-3 || || || || || || || || || || || 
     22|| Met_Office-4 || || || || || || || || || || || 
     23|| Met_Office-5 || || || || || || || || || || || 
     24|| Met_Office-6 || || || || || || || || || || || 
     25|| Met_Office-7 || || || || || || || || || || || 
     26|| Met_Office-8 || || || || || || || || || || || 
     27|| Met_Office-9 || || || || || || || || || || || 
     28|| Met_Office-10 || || || || || || || || || || || 
    1729 
    1830---- 
    19 === '''Met_Office-1  - title''' === 
    20   '''                      Motivation: '''                      xx [[BR]]                      '''                      Status :'''                    xx [[BR]]                      '''                      Main tasks :'''                       xx[[BR]]                      '''                      Science Reviewer:'''                       [[BR]]                      '''                      System Reviewer:'''                       [[BR]]                      '''                      Deadline:'''                       [[BR]]                      '''                      Priority:'''                       [[BR]]                      '''                      Depends on:'''                       [[BR]]                      '''                      Principal Investigator : '''                      xx 
     31=== '''Met_Office-1  - '''Ice Shelf Cavities === 
     32'''                       Motivation: '''Include circulation and melting beneath the ice shelves. An ice shelf is a floating extension of an ice sheet that is sandwiched  between atmosphere and ocean. Basal melting of ice shelves is one of the  main components of the fresh water runoff around Antarctica.  Furthermore, this fresh water source is spread between 200m and 1000m  depth. The temperature of this water is also much colder than the winter  surface water due to the pressure effect on the freezing point  temperature (from -1.8°C in surface up to -2.5°C in depth). Consequently, ice shelves lead to large changes in TS properties on the  shelf, in sea ice thickness and concentration, in Antarctic bottom water  formation, in horizontal circulation as well as in meridional  overturning circulation (Hellmer et al., 2004).  Modelling ice shelf basal melting is also a required step to build an  earth system model including ocean/ice sheet coupling. [[BR]]                       '''                       Status :''' '''''' Code exists (version 3.4_stable) in BAS and works for  regional configuration of Pine Island Glacier and idealised  configuration ISOMIP. [[BR]]                       '''                       Main tasks :'''  
     33 
     34 * Validate it for all ice shelves around Antarctica[[BR]] 
     35 * Update to latest version[[BR]] 
     36 * Clean the code[[BR]] 
     37 * Write documentation 
     38 
     39'''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' September 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''  Medium[[BR]]                       '''                       Depends on:'''                         N/A[[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Pierre Mathiot ([mailto:piethi@bas.ac.uk]) 
     40 
     41=== '''Met_Office-2  - Masked damping''' === 
     42'''                       Motivation: '''To allow generic damping in specific regions[[BR]]                       '''                       Status :''' Code exists at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Module will be developed to damp Temperature & Salinity in any  region specified using a mask read in from a netcdf file. The module  will be developed outside of the current tradmp module to avoid  conflicts with the hard coded resolution dependent regional variations  to the damping that are currently implemented in this module. Regional  variations to the damping will be permitted by specifying values of the  mask between zero and one where zero indicates no damping at that grid  point and non-zero values indicate damping with a relaxation coefficient  value obtained by multiplying the mask value with a namelist specified  max relaxation coefficient. [[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:'''                         September 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium[[BR]]                       '''                       Depends on:'''                         N/A[[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Tim Graham (tim.graham@metoffice.gov.uk) 
     43 
     44=== '''Met_Office-3  - '''Ensuring CF/MOCF compliance and implementation of CMIP5 diagnostics via XIOS === 
     45'''                       Motivation: '''Standardization of output to meet CF and MOCF compliance and addition of CMIP5 diagnostics[[BR]]                       '''                       Status :''' Not started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Necessary NEMO-side code modifications where XIOS does not support the required changes (and there are no plans to)[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:'''                        October 2014 (but depends on CMIP5 and UKMO requirements) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                        [[BR]]                       '''                       Depends on:'''                        Feedback from Alistair Sellar (UKMO), Matt Palmer(UKMO) & others[[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
     46 
     47=== '''Met_Office-4  - Implementation of a kara mixed layer diagnostic''' === 
     48'''                       Motivation: '''Add the Kara et al. variable density criterion MLD diagnostic to allow comparison with their MLD climatology[[BR]]                       '''                       Status :''' Has existed in a local UKMO branch for sometime, but needs updating, and retesting[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:'''                         October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
     49 
     50=== '''Met_Office-5  - Sponge Layer at open boundaries''' === 
     51'''                       Motivation: ''' Add the sponge layer (region of increased lateral viscosity) near open boundaries as an option in BDY[[BR]]                       '''                       Status :''' Has existed in a local branch for a while[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do)[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Dave Storkey (dave.storkey@metoffice.gov.uk) 
     52 
     53=== '''Met_Office-6  - Equatorial Pressure correction''' === 
     54'''                       Motivation: '''The pressure correction code exists to maintain balance in equatorial regions as data are assimilated[[BR]]                       '''                       Status :''' The code already exits, but still needs to be reviewed[[BR]]                       '''                       Main tasks :'''  Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     55 
     56=== '''Met_Office-7  - '''Seaice increments === 
     57'''                       Motivation: '''Implement code used to apply seaice increments; this is used for data assimilation of ice variables.  It will also be necessary to make sure the code is compatible with cice[[BR]]                       '''                       Status : ''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' '''''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     58 
     59=== '''Met_Office-8  - Temperature Criterion Mixed Layer''' === 
     60'''                       Motivation: ''' A new mixed layer definition based on a temperature criterion[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     61 
     62=== '''Met_Office-9  - '''Observation operator for profiles for use with all vertical coordinates (i.e. generalised vertical interpolation) === 
     63'''                       Motivation: '''This code is necessary to get profile minus model differences in any model not using vertical z-coordinates[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     64 
     65=== '''Met_Office-10  - '''SST bias correction === 
     66'''                       Motivation: ''' This code reads in a bias field and uses it to correct SST observations  before they are passed to the obs operator.  It is necessary for  successful SST assimilation[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     67 
     68=== '''Met_Office-11  - '''ADCP data to be included in OBS routines === 
     69'''                       Motivation: ''' Reads current data from ADCP files for comparison with model data[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     70 
     71=== '''Met_Office-12  - '''Read and Process gridded seaice and sst data === 
     72'''                       Motivation: '''  This code would allow us to process gridded SST and seaice data through the observation operator[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     73 
     74=== '''Met_Office-13  -'''Netcdf4 compression of feedback files === 
     75'''                       Motivation: '''This code would allow us to more easily store feedback files at a higher compression[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     76 
     77=== '''Met_Office-14  - '''Add record information to SLA data === 
     78'''                       Motivation: '''Allows storage of record information for SLA data[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
     79 
     80=== '''Met_Office-14  - Addition of Satellite Surface Salinity data and Microwave SST data to OBS routines''' === 
     81'''                       Motivation: '''Allow comparison of satellite surface salinity and microwave SST data through the OBS routines.[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) (work to be done with Niall [wiki:McConner McConnell and Jonah Roberts Jones)] 
     82 
     83=== '''Met_Office-15  - '''Implement assimilation interface SETTE test === 
     84'''                       Motivation: '''Create a SETTE test configuration which includes observation operator  and increments tests, to ensure that  future NEMO developments do not break OBS and ASM.[[BR]]                       '''                       Status :''' Not started[[BR]]                       '''                       Main tasks :'''  
     85 
     86 1. Add some observations and increments to the standard input files. 
     87 1. Confirm that the text output will indicate the correct functioning of  the OBS and ASM. 
     88 1. If not add additional diagnostic text output. 
     89 
     90'''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     91 
     92=== '''Met_Office-16  - '''Allow specification of an hour start time === 
     93'''                       Motivation: '''NEMO currently assumes runs start at 00 UTC. For the coupled DA work we  needed to change the code to start at a specified hour and date.[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     94 
     95=== '''Met_Office-17  - '''Inclusion of surface wave effects in NEMO === 
     96'''                       Motivation: '''Modifying NEMO SBC to include wave-induced mixing and Langmuir  circulation with data obtained from a surface wave model and modifying  the equation of motion to include Stokes-Coriolis forcing[[BR]]                       '''                       Status :''' Not started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' NEMO-side code modifications to read/couple wave fields and modifications in the TKE scheme and dynamics module[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Francois-Xavier Bocquet (francois.bocquet@metoffice.gov.uk) 
     97 
     98=== '''Met_Office-18  - ''' === 
     99'''                       Motivation: '''[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     100 
     101=== '''Met_Office-19  - ''' === 
     102'''                       Motivation: '''[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     103 
     104=== '''Met_Office-20  - ''' === 
     105'''                       Motivation: '''[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     106 
     107=== '''Met_Office-21  - ''' === 
     108'''                       Motivation: '''[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
     109 
     110=== '''Met_Office-22  - ''' === 
     111'''                       Motivation: '''[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.2[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk)