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2015WP/2015SharedActions (diff) – NEMO

Changes between Version 44 and Version 45 of 2015WP/2015SharedActions


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2014-11-04T12:14:08+01:00 (9 years ago)
Author:
clevy
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  • 2015WP/2015SharedActions

    v44 v45  
    5050|| WAVE-4 || Definition of wave coupling at small (coastal) scale || INGV || M. De Dominicis || 
    5151|| '''NEMO robustness''' || || || || 
     52|| ROBUST-1 || TOP online coarsening || Mercator, CNRS || Clement Bricaud, Coralie Perruche, Christian Ethé || 
     53|| ROBUST-2 || NEMO ready for ESMs-CMIP6: ORCA1_LIM3_PISCES || CNRS || Claire Levy || 
     54|| ROBUST-3 || Validation of NEMO3.6 (inc. ORCA025 and AMM7) || Met Office || Enda O'Dea, Tim Graham, Dave Storkey || 
     55|| ROBUST-4 || test NEMO3.6 with global configurations + test new features (LIM3, VVL, time-splitting, flux form,...) || Mercator || Romain Bourdalle-Badie, Clement Bricaud, Jerome Chanut || 
     56|| ROBUST-5 || Quantifying & reducing numerical mixing || Met Office || Dave Storkey || 
     57|| ROBUST-6 || BDY and biogeochemistry || CMCC || Tomas Lovato || 
     58|| ROBUST-7 || Improvement of lateral diffusion and dissipation || CNRS || Sebastien Masson/Gurvan Madec || 
    5259|| ROBUST-8 || Further 1D config changes || Met Office || Daley Calvert || 
    5360|| ROBUST-9 || Efficiency improvements in OBS || Met Office || Jennie Waters || 
    54 || ROBUST-5 || Quantifying & reducing numerical mixing || Met Office || Dave Storkey || 
    55 || ROBUST-3 || Validation of NEMO3.6 (inc. ORCA025 and AMM7) || Met Office || Enda O'Dea, Tim Graham, Dave Storkey || 
    56 || ROBUST-4 || test NEMO3.6 with global configurations + test new features (LIM3, VVL, time-splitting, flux form,...) || Mercator || Romain Bourdalle-Badie, Clement Bricaud, Jerome Chanut || 
    57 || ROBUST-1 || TOP online coarsening || Mercator, CNRS || Clement Bricaud, Coralie Perruche, Christian Ethé || 
    5861|| ROBUST-10 || Lead working Group on Tests cases || CNRS || Simona Flavoni || 
    59 || ROBUST-2 || NEMO ready for ESMs-CMIP6: ORCA1_LIM3_PISCES || CNRS || Claire Levy || 
    60 || ROBUST-7 || Improvement of lateral diffusion and dissipation || CNRS ||Sebastien Masson/Gurvan Madec || 
    61 || ROBUST-6 || BDY and biogeochemistry || CMCC || Tomas Lovato || 
    6262|| '''GMD Special Issue''' || || || || 
    6363|| || Coupling NEMO with wave model: first step and sensitivity experiments in the Mediterranean Sea || INGV || E. Clementi || 
     
    7373=== '''AGRIF''' === 
    7474==== ''' '''AGRIF-1 / Met_Office-7 - AGRIF vertical grid refinement ==== 
    75   '''   Motivation: '''   Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows) '''   Status: '''   Laurent Debreu has a first attempt version of this. '''   Main Tasks: '''   Take Laurent's 1st attempt code and update/improve it to provide this functionality '''   Science Reviewer:'''                                           [[BR]]                                           '''   System Reviewer:'''                                           [[BR]]                                           '''   Deadline:'''   [[BR]]                                           '''   Priority:'''   Medium                                        [[BR]]                                           '''   Depends on:'''                                           [[BR]]                                           '''   Principal Investigator : '''   Daley Calvert/Tim Graham (TBD) 
     75  '''    Motivation: '''    Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows) '''    Status: '''    Laurent Debreu has a first attempt version of this. '''    Main Tasks: '''    Take Laurent's 1st attempt code and update/improve it to provide this functionality '''    Science Reviewer:'''                                            [[BR]]                                            '''    System Reviewer:'''                                            [[BR]]                                            '''    Deadline:'''    [[BR]]                                            '''    Priority:'''    Medium                                        [[BR]]                                            '''    Depends on:'''                                            [[BR]]                                            '''    Principal Investigator : '''    Daley Calvert/Tim Graham (TBD) 
    7676 
    7777=== '''Configuration Manager''' === 
    7878==== CONFIGMAN-2 / NOC-1  - BDY configuration tool ==== 
    79   '''                                                      Motivation: '''                 The ability for NEMO to be configured and run as a regional model with open boundaries forced with output saved from a wider area configuration is under-used due to the difficulty of preparing suitable boundary files. This task aims to contribute to the Configuration manager shared action by providing a high-level tool capable of completing all the necessary steps.  [[BR]]                                                      '''                                                      Status :'''                              [[BR]]                                                      '''                                                      Main tasks :'''              To produce an open source Python tool to configure open boundary (BDY) condition files for use with NEMO v3.4 onwards by transferring data from global NEMO simulations to defined regional domains. The tool will produce tracer/ice/dynamics (including tidal boundaries from TPXO7.2) BDY files. Written in Python this tool will be ready for integration into an all encompassing  'Configuration Manager' if desired.      [[BR]]                                                      '''                                                      Science Reviewer:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      System Reviewer:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      Deadline:'''                                                        [[BR]]                                                      '''                                                      Priority:'''                                                        [[BR]]                                                      '''                                                      Depends on:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      Principal Investigator :'''               James Harle 
     79  '''                                                       Motivation: '''                  The ability for NEMO to be configured and run as a regional model with open boundaries forced with output saved from a wider area configuration is under-used due to the difficulty of preparing suitable boundary files. This task aims to contribute to the Configuration manager shared action by providing a high-level tool capable of completing all the necessary steps.  [[BR]]                                                       '''                                                       Status :'''                               [[BR]]                                                       '''                                                       Main tasks :'''               To produce an open source Python tool to configure open boundary (BDY) condition files for use with NEMO v3.4 onwards by transferring data from global NEMO simulations to defined regional domains. The tool will produce tracer/ice/dynamics (including tidal boundaries from TPXO7.2) BDY files. Written in Python this tool will be ready for integration into an all encompassing  'Configuration Manager' if desired.      [[BR]]                                                       '''                                                       Science Reviewer:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       System Reviewer:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       Deadline:'''                                                         [[BR]]                                                       '''                                                       Priority:'''                                                         [[BR]]                                                       '''                                                       Depends on:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       Principal Investigator :'''                James Harle 
    8080 
    8181=== '''System simplification''' === 
    8282==== SIMPLIF-1 / NOC-3  - System support and Simplification work ==== 
    83   '''                                                      Motivation: '''                The need for simplifying NEMO in preparation for next generation computer architecture work has been accepted by the NEMO community. The exact details of what is to be done and the timing and order of these changes has yet to be decided. NOC expects to take an active role in this process and reserves a substantial block of its annual contribution to ensure it can respond accordingly to the consortium plans.   This block also covers routine system team work to respond to user initiated tasks (bug-fixes, requests for assistance, documentation etc.). [[BR]]                                                      '''                                                      Status :'''                              [[BR]]                                                      '''                                                      Main tasks :'''                     [[BR]]                                                      '''                                                      Science Reviewer:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      System Reviewer:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      Deadline:'''                                                        [[BR]]                                                      '''                                                      Priority:'''                                                        [[BR]]                                                      '''                                                      Depends on:'''                                                       [[BR]]                                                      '''                                                      Principal Investigator : '''               Andrew Coward 
     83  '''                                                       Motivation: '''                 The need for simplifying NEMO in preparation for next generation computer architecture work has been accepted by the NEMO community. The exact details of what is to be done and the timing and order of these changes has yet to be decided. NOC expects to take an active role in this process and reserves a substantial block of its annual contribution to ensure it can respond accordingly to the consortium plans.   This block also covers routine system team work to respond to user initiated tasks (bug-fixes, requests for assistance, documentation etc.). [[BR]]                                                       '''                                                       Status :'''                               [[BR]]                                                       '''                                                       Main tasks :'''                      [[BR]]                                                       '''                                                       Science Reviewer:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       System Reviewer:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       Deadline:'''                                                         [[BR]]                                                       '''                                                       Priority:'''                                                         [[BR]]                                                       '''                                                       Depends on:'''                                                        [[BR]]                                                       '''                                                       Principal Investigator : '''                Andrew Coward 
    8484 
    8585=== '''Wave Coupling''' === 
    8686==== Wave Coupling-1 / Met Office-8 - Modifications to surface coupling required for surface waves ==== 
    87   '''                                          Motivation: '''   Surface wave coupling will require changes to sbccpl to allow surface waves in coupled models (Action from Wave WG meeting) [BR]]                                        '''                                          Main tasks :'''    Changes to sbccpl [[BR]]     '''                                          System Reviewer:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Deadline:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Priority:'''   high                                          [[BR]]                                          '''                                          Depends on: Wave Coupling-2'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Principal Investigator: '''   Francois-Xavier Boquet 
     87  '''                                           Motivation: '''    Surface wave coupling will require changes to sbccpl to allow surface waves in coupled models (Action from Wave WG meeting) [BR]]                                        '''                                           Main tasks :'''     Changes to sbccpl [[BR]]      '''                                           System Reviewer:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Deadline:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Priority:'''    high                                          [[BR]]                                           '''                                           Depends on: Wave Coupling-2'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Principal Investigator: '''    Francois-Xavier Boquet 
    8888 
    8989==== Wave Coupling-2 / INGV-1 - Implementation of the WAVE-WG 2014 results ==== 
    90   '''                                          Motivation: '''   In 2014 the Wave–WG defined a series of developments to be implemented by the WG participants in order to implement processes occurring from meso-scale to large-scale. A temporary branch hosting the surface wave components from ECMWF already exists and some modifications respect to this branch have been identified. INGV will take care of some of the developments identified [[BR]]  '''        Status :'''   Implementation of some of the identified processes has been started in 2014. To be continued in 2015            [[BR]]                                          '''                                          Main tasks :'''    [[BR]]   - 3D Stokes drift computation will be modified according to Breivik et al., (2014) formulation. It will be a public variable to be used also in other terms (tracers and momentum advection, surface vertical velocity); [[BR]]   - implementation of surface vertical velocity accounting for the Stokes Drift in case of wave coupling; [[BR]]   - implementation of the tracers advection accounting for the 3D Stokes drift; [[BR]]   - implementation of the Qiao et al., (2010) formulation accounting for the enhanced vertical mixing induced by waves; [[BR]]   - others if agreed by the WAVE-WG. [[BR]]     '''                                          System Reviewer:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Deadline:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Priority:'''   high                                          [[BR]]                                          '''                                          Depends on:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Principal Investigator: '''   Emanuela Clementi (emanuela.clementi@ingv.it) 
     90  '''                                           Motivation: '''    In 2014 the Wave–WG defined a series of developments to be implemented by the WG participants in order to implement processes occurring from meso-scale to large-scale. A temporary branch hosting the surface wave components from ECMWF already exists and some modifications respect to this branch have been identified. INGV will take care of some of the developments identified [[BR]]   '''         Status :'''    Implementation of some of the identified processes has been started in 2014. To be continued in 2015            [[BR]]                                           '''                                           Main tasks :'''     [[BR]]    - 3D Stokes drift computation will be modified according to Breivik et al., (2014) formulation. It will be a public variable to be used also in other terms (tracers and momentum advection, surface vertical velocity); [[BR]]    - implementation of surface vertical velocity accounting for the Stokes Drift in case of wave coupling; [[BR]]    - implementation of the tracers advection accounting for the 3D Stokes drift; [[BR]]    - implementation of the Qiao et al., (2010) formulation accounting for the enhanced vertical mixing induced by waves; [[BR]]    - others if agreed by the WAVE-WG. [[BR]]      '''                                           System Reviewer:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Deadline:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Priority:'''    high                                          [[BR]]                                           '''                                           Depends on:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Principal Investigator: '''    Emanuela Clementi (emanuela.clementi@ingv.it) 
    9191 
    9292==== Wave Coupling-3 / INGV-2 - Reference configuration to test wave-current interactions ==== 
    93   '''                                          Motivation: '''    A reference configuration is needed in order to test the wave-current developments as agreed by the WAVE-WG   [[BR]]                                          '''                                          Status :'''   To be started            [[BR]]                                          '''                                          Main tasks:'''      Contribute, within the WAVE-WG, in the definition and implementation of a reference configuration to test the wave-current processes implemented  '''    [[BR]]                                         System Reviewer:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Deadline:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Priority:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Depends on:'''    INGV.01 and NEMO-WAVE WG actions                                       [[BR]]                                          '''                                          Principal Investigator: '''  Emanuela Clementi (emanuela.clementi@ingv.it) 
     93  '''                                           Motivation: '''     A reference configuration is needed in order to test the wave-current developments as agreed by the WAVE-WG   [[BR]]                                           '''                                           Status :'''    To be started            [[BR]]                                           '''                                           Main tasks:'''       Contribute, within the WAVE-WG, in the definition and implementation of a reference configuration to test the wave-current processes implemented  '''     [[BR]]                                          System Reviewer:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Deadline:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Priority:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Depends on:'''     INGV.01 and NEMO-WAVE WG actions                                       [[BR]]                                           '''                                           Principal Investigator: '''   Emanuela Clementi (emanuela.clementi@ingv.it) 
    9494 
    9595==== Wave Coupling-4 /  INGV-3 - Definition of wave coupling at small (coastal) scale ==== 
    96   '''                                          Motivation: '''    According to the WAVE-WG, in order to achieve a full wave-current coupling, the small (coastal) scale processes need to be investigated  [[BR]]                                          '''                                          Status:'''     To be started             [[BR]]                                          '''                                          Main tasks:'''    Contribute, within the WAVE-WG, in the analysis of this issue in order to finalize the discussion started in 2014 before proceeding with any new implementation     [[BR]]                                          '''                                          Science Reviewer:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          System Reviewer:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Deadline:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Priority:'''                                            [[BR]]                                          '''                                          Depends on:'''                                           [[BR]]                                          '''                                          Principal Investigator: '''  Michela De Dominicis (michela.dedominicis@ingv.it) 
     96  '''                                           Motivation: '''     According to the WAVE-WG, in order to achieve a full wave-current coupling, the small (coastal) scale processes need to be investigated  [[BR]]                                           '''                                           Status:'''      To be started             [[BR]]                                           '''                                           Main tasks:'''     Contribute, within the WAVE-WG, in the analysis of this issue in order to finalize the discussion started in 2014 before proceeding with any new implementation     [[BR]]                                           '''                                           Science Reviewer:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           System Reviewer:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Deadline:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Priority:'''                                             [[BR]]                                           '''                                           Depends on:'''                                            [[BR]]                                           '''                                           Principal Investigator: '''   Michela De Dominicis (michela.dedominicis@ingv.it) 
    9797 
    9898=== '''NEMO robustness''' === 
    9999==== ROBUST-2 / CNRS-11 - Lead working Group on Tests cases ==== 
    100   '''       Motivation: '''   There are several motivations to define a suite of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme). This work will be done in throughout a Working Group. The purpose of the Working Group is to (i) specify the expected outcome of standard test-cases in NEMO and (ii) to define how standard test-cases should be distributed within NEMO. There will be interactions with Configuration Manager Working Group to decide how input files (bathymetry, coordinates,...) will be given, and how they will be maintained. In 2015, this new working group will need to be started (list of members to be fianlised during Developer’s Committee 2014).[[BR]]   '''   Status : '''   Starting[[BR]]   '''   Main tasks :'''   [[BR]]   '''   Science Reviewer:'''   [[BR]]   '''   System Reviewer:'''   [[BR]]   '''   Deadline:'''   [[BR]]   '''   Priority: '''   P2 (2nd semester 2015)[[BR]]   '''   Depends on: '''   Simplification, Configuration Manager…[[BR]]   '''   Principal Investigator : '''       Simona Flavoni 
     100  '''        Motivation: '''    There are several motivations to define a suite of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme). This work will be done in throughout a Working Group. The purpose of the Working Group is to (i) specify the expected outcome of standard test-cases in NEMO and (ii) to define how standard test-cases should be distributed within NEMO. There will be interactions with Configuration Manager Working Group to decide how input files (bathymetry, coordinates,...) will be given, and how they will be maintained. In 2015, this new working group will need to be started (list of members to be fianlised during Developer’s Committee 2014).[[BR]]    '''    Status : '''    Starting[[BR]]    '''    Main tasks :'''    [[BR]]    '''    Science Reviewer:'''    [[BR]]    '''    System Reviewer:'''    [[BR]]    '''    Deadline:'''    [[BR]]    '''    Priority: '''    P2 (2nd semester 2015)[[BR]]    '''    Depends on: '''    Simplification, Configuration Manager…[[BR]]    '''    Principal Investigator : '''        Simona Flavoni 
    101101 
    102102==== ROBUST-3 / Met_Office-12 - Validation (including ORCA025/AMM12/AMM7) ==== 
    103   '''   Motivation: '''   Model configurations need to be validated before the release of the model. [[BR]]  '''   Status: '''  '''   Main Tasks: ''' 
     103  '''    Motivation: '''    Model configurations need to be validated before the release of the model. [[BR]]   '''    Status: '''   '''    Main Tasks: ''' 
    104104 
    105105 * Upgrading configs to new model version (after merge party) 
     
    109109 
    110110==== ''' '''ROBUST-5 / Met_Office-11 - Numerical Mixing ==== 
    111   '''   Motivation: '''   Recent tests with the Lee et al (JPO 2002) diagnostic in ORCA025 have shown that NEMO in common with other models has high levels of numerical mixing of water masses in the interior when used at eddy-permitting resolution. The goal of this action is to further quantify this in the ORCA025 configuration and test options that may reduce the problem. This action aims to address section 4.3 of the NEMO development strategy. [[BR]]      '''   Status: '''   Lee et al diagnostics have been developed by Alex Megann at NOC. [[BR]]  '''   Main Tasks: ''' 
     111  '''    Motivation: '''    Recent tests with the Lee et al (JPO 2002) diagnostic in ORCA025 have shown that NEMO in common with other models has high levels of numerical mixing of water masses in the interior when used at eddy-permitting resolution. The goal of this action is to further quantify this in the ORCA025 configuration and test options that may reduce the problem. This action aims to address section 4.3 of the NEMO development strategy. [[BR]]       '''    Status: '''    Lee et al diagnostics have been developed by Alex Megann at NOC. [[BR]]   '''    Main Tasks: ''' 
    112112 
    113113 * Repeat Lee et al diagnosis for coupled model with ORCA025 [[BR]] 
     
    120120 
    121121==== ROBUST-8 / Met_Office-9  - Further 1D configuration changes ==== 
    122   '''                         Motivation: '''  Add further functionality that there wasn't time for in the 2013 development[[BR]]                         '''                         Status :'''   [[BR]]                         '''                         Main tasks :'''   Add namelist domain control, case studies, maybe remove CPP key dependence.[[BR]]                         '''                         Science Reviewer:'''   Romain Bourdalle-Badie                       [[BR]]                         '''                         System Reviewer:'''   Romain Bourdalle-Badie                       [[BR]]                         '''                         Deadline:'''   October 2015[[BR]]                         '''                         Priority:'''                           Medium [[BR]]                         '''                         Depends on: '''  N/A                        [[BR]]                         '''                         Principal Investigator :  '''  Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
     122  '''                          Motivation: '''   Add further functionality that there wasn't time for in the 2013 development[[BR]]                          '''                          Status :'''    [[BR]]                          '''                          Main tasks :'''    Add namelist domain control, case studies, maybe remove CPP key dependence.[[BR]]                          '''                          Science Reviewer:'''    Romain Bourdalle-Badie                       [[BR]]                          '''                          System Reviewer:'''    Romain Bourdalle-Badie                       [[BR]]                          '''                          Deadline:'''    October 2015[[BR]]                          '''                          Priority:'''                            Medium [[BR]]                          '''                          Depends on: '''   N/A                        [[BR]]                          '''                          Principal Investigator :  '''   Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
    123123 
    124124==== ROBUST-9 / Met_Office-10 - Effiency improvements in OBS ====