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cetlod
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    5454=== '''AGRIF''' === 
    5555==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    56   '''                           Motivation:'''     Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                       '''                           Status: '''     Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                       '''                          Main Tasks: '''                           [[BR]]                       '''                           Science Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           System Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           Deadline:'''                           [[BR]]                                                                   '''                           Priority:'''      Medium                     [[BR]]                                                                   '''     Tim Graham                      Depends on:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           Principal Investigator : ''' 
     56  '''                            Motivation:'''      Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                        '''                            Status: '''      Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                        '''                           Main Tasks: '''                            [[BR]]                        '''                            Science Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            System Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            Deadline:'''                            [[BR]]                                                                    '''                            Priority:'''       Medium                     [[BR]]                                                                    '''      Tim Graham                      Depends on:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            Principal Investigator : ''' 
    5757 
    5858==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
     
    6161 
    6262==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    63   '''                           Motivation:'''    Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                       '''                           Status: '''     Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized.                      [[BR]]                       '''                          Main Tasks: '''                           [[BR]]                       '''                           Science Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           System Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           Deadline:'''                           [[BR]]                                                                   '''                           Priority:'''    High                     [[BR]]   '''   Depends on:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           Principal Investigator :'''    Jérôme Chanut 
     63  '''                            Motivation:'''     Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                        '''                            Status: '''      Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized.                      [[BR]]                        '''                           Main Tasks: '''                            [[BR]]                        '''                            Science Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            System Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            Deadline:'''                            [[BR]]                                                                    '''                            Priority:'''     High                     [[BR]]    '''    Depends on:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            Principal Investigator :'''     Jérôme Chanut 
    6464 
    6565=== '''HPC''' === 
     
    7070'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    7171 
    72   '''                      Status: '''     lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                  '''                     Main Tasks: '''     Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                  '''                      Science Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      System Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Deadline:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Priority:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Depends on:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Principal Investigator : '''     Miguel Castrillo 
     72  '''                       Status: '''      lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                   '''                      Main Tasks: '''      Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                   '''                       Science Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       System Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Deadline:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Priority:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Depends on:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Principal Investigator : '''      Miguel Castrillo 
    7373 
    7474==== ''' '''HPC-3 / Barcelona - Suppress useless communications ==== 
    7575'''                Motivation:''' Suppress unnecessary calls to lbc_lnk. 
    7676 
    77   [[BR]]                  '''                      Status: '''                  [[BR]]                  '''                     Main Tasks: '''     Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                  '''                      Science Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      System Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Deadline:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Priority:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Depends on:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Principal Investigator : '''     Tim Graham 
     77  [[BR]]                   '''                       Status: '''                   [[BR]]                   '''                      Main Tasks: '''      Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                   '''                       Science Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       System Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Deadline:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Priority:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Depends on:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Principal Investigator : '''      Tim Graham 
    7878 
    7979==== ''' '''HPC-4 / CMCC - Scalability with MPI-OPENMP ==== 
    8080'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    8181 
    82   [[BR]]                  '''                      Status: '''       continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                  '''                     Main Tasks: '''     1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                  '''                      Science Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      System Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Deadline:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Priority:'''       HIGH               [[BR]]                                                              '''                      Depends on:'''      results of the same action in 2015             [[BR]]                                                              '''                      Principal Investigator : '''     Silvia Mocavero 
     82  [[BR]]                   '''                       Status: '''        continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                   '''                      Main Tasks: '''      1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                   '''                       Science Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       System Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Deadline:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Priority:'''        HIGH               [[BR]]                                                               '''                       Depends on:'''       results of the same action in 2015             [[BR]]                                                               '''                       Principal Investigator : '''      Silvia Mocavero 
    8383 
    8484==== ''' '''HPC-5 / NERC - Implement larger haloes ==== 
    8585'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    8686 
    87   [[BR]]                  '''                      Status: '''       New implementation - old idea           [[BR]]                  '''                     Main Tasks: '''         Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                  '''                      Science Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      System Reviewer:'''                                                              [[BR]]                                                              '''                      Deadline:'''                      [[BR]]                                                              '''                      Priority:'''       HIGH               [[BR]]                                                              '''                      Depends on:'''                 [[BR]]                                                              '''                      Principal Investigator : '''     Andrew Coward 
     87  [[BR]]                   '''                       Status: '''        New implementation - old idea           [[BR]]                   '''                      Main Tasks: '''          Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                   '''                       Science Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       System Reviewer:'''                                                               [[BR]]                                                               '''                       Deadline:'''                       [[BR]]                                                               '''                       Priority:'''        HIGH               [[BR]]                                                               '''                       Depends on:'''                  [[BR]]                                                               '''                       Principal Investigator : '''      Andrew Coward 
     88 
     89===  === 
     90=== '''System Simplification''' === 
     91==== SIMPLIF-1 / CNRS - Simplification of vertical diffusion  ==== 
     92'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
     93 
     94  '''Status: ''' Already started[[BR]]'''Main Tasks: ''' [[BR]]'''Science Reviewer:''' [[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator : '''Gurvan Madec 
    8895 
    8996=== '''Configuration Manager''' === 
    90 ==== ''' '''!ConfigMan-1 / MERCATOR - SIREN improvement and robustness ==== 
     97==== !ConfigMan-1 / MERCATOR - SIREN improvement and robustness ==== 
    9198'''                 Motivation:''' 
    9299 
     
    125132 
    126133=== '''ROBUSTNESS''' === 
    127 ==== ''' '''ROBUSTNESS-1 / CNRS - INTEGRATION OF THE SEABASS CONFIGURATION AS A TEST CASE ==== 
     134==== ''' '''ROBUSTNESS-1 / CNRS - Integration of the SEABASS configuration as a test case  ==== 
    128135'''                 Motivation: '''SEABASS is the reference configuration for Data Assimilation, included  in the NEMO v3.4_STABLE version. Various data assimilation experiments  have been done with this configuration, with various data assimilation  systems (e.g. Cosme et al, 2011, Bouttier et al. 2014, Yin et al.,  2014). In this context, this configuration appears to be useful for data  assimilation users, to couple their own DA system on NEMO and compare  their results with thgose obtained on this configuration. SEABASS is  also easy to take in hand. Also, it allows to update the configuration  status to the future version of NEMO. For these reasons, this  configuration is a relevant test case for Data Assimilation. [[BR]]             '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Principal Investigator: '''Pierre-Antoine Bouttier 
    129136 
    130137'''ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system''' 
    131138 
    132 '''Motivation: '''Implementation of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme)[[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks:''' 
     139'''Motivation: '''Implementation of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme)[[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks:''' 
    133140 
    134 '''Science Reviewer:''' Gurvan Madec[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Simona Flavoni 
     141'''Science Reviewer:''' Gurvan Madec[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Simona Flavoni 
    135142 
    136 ==== ROBUSTNESS-4 / CNRS - Passive tracers run offline with vvl  ==== 
    137 '''Motivation: '''Add missing pieces of code to be able to run offline component with vvl [[BR]]'''Status: '''Started in 2015 ; to be improved[[BR]]'''Main Tasks:''' 
     143==== ROBUSTNESS-4 / CNRS - Passive tracers run offline with vvl ==== 
     144'''Motivation: '''Add missing pieces of code to be able to run offline component with vvl [[BR]]'''Status: '''Started in 2015 ; to be improved[[BR]]'''Main Tasks:''' 
    138145 
    139 (1) run a forced simulation ORCA2(1)-LIM2(3) and output variables needed for linear free surface, especially the changing vertical grid in time ( already done )[[BR]](2) Rewrite the Offline module to take into account the changing grid in time'''[[BR]]Science Reviewer:''' Gurvan Madec[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethe 
     146(1) run a forced simulation ORCA2(1)-LIM2(3) and output variables needed for linear free surface, especially the changing vertical grid in time ( already done )[[BR]](2) Rewrite the Offline module to take into account the changing grid in time'''[[BR]]Science Reviewer:''' Gurvan Madec[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethe 
    140147 
    141148==== ROBUSTNESS-5 / CNRS - Revisiting TOP interface ==== 
    142 '''Motivation: '''Some aspects of TOP interface need to be improved [[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks: ''' 
     149'''Motivation: '''Some aspects of TOP interface need to be improved [[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks: ''' 
    143150 
    144 (1) move the number of passive tracers from the code to the namelist[[BR]](2) generalisation of the work done at CMCC on boundary conditions to others models in the system ( PISCES, CFC, C14b )'''[[BR]]Science Reviewer:''' Olivier Aumont[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Low[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethe 
     151(1) move the number of passive tracers from the code to the namelist[[BR]](2) generalisation of the work done at CMCC on boundary conditions to others models in the system ( PISCES, CFC, C14b )'''[[BR]]Science Reviewer:''' Olivier Aumont[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Low[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethe 
    145152 
    146153==== ROBUSTNESS-8 / Mercator Océan - Improve split-explicit free surface ====