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2016WP/2016SharedActions (diff) – NEMO

Changes between Version 65 and Version 66 of 2016WP/2016SharedActions


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2016-01-07T14:29:55+01:00 (8 years ago)
Author:
nicolasmartin
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    v65 v66  
    6666=== '''AGRIF''' === 
    6767==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    68   '''                                                   Motivation:'''                             Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                               '''                                                   Status: '''                             Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                               '''                                                  Main Tasks: '''                                                   [[BR]]                                               '''                                                   Science Reviewer:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   System Reviewer:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   Deadline:'''                                                   [[BR]]                                                                                           '''                                                   Priority:'''                              Medium                     [[BR]]                      '''                      Depends on:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   Principal Investigator : '''                      Tim Graham 
     68  '''                                                         Motivation:'''                                   Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                                     '''                                                         Status: '''                                   Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                                     '''                                                        Main Tasks: '''                                                         [[BR]]                                                     '''                                                         Science Reviewer:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         System Reviewer:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Deadline:'''                                                         [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Priority:'''                                    Medium                     [[BR]]                            '''                            Depends on:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Principal Investigator : '''                            Tim Graham 
    6969 
    7070====  ==== 
     
    7272====  ==== 
    7373==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
    74   '''                                                   Motivation:'''               enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                               '''                                                   Status: '''                  Not yet started in 2015 [[BR]]                                               '''                                                  Main Tasks: '''              AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                               '''                                                   Science Reviewer:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   System Reviewer:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   Deadline: '''              end of 2016                                     [[BR]]                                                                                           '''                                                   Priority:'''                            High                     [[BR]]                           '''                           Depends on:'''                                                                                           [[BR]]                                                                                           '''                                                   Principal Investigator :'''                   Clément Rousset 
     74  '''                                                         Motivation:'''                     enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                                     '''                                                         Status: '''                        Not yet started in 2015 [[BR]]                                                     '''                                                        Main Tasks: '''                    AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                                     '''                                                         Science Reviewer:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         System Reviewer:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Deadline: '''                    end of 2016                                     [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Priority:'''                                  High                     [[BR]]                                 '''                                 Depends on:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Principal Investigator :'''                         Clément Rousset 
    7575 
    7676===  === 
    7777==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    78   '''                   Motivation:'''                    Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                   '''                   Status: '''                   Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]                   '''                   Main Tasks: '''                   [[BR]]                   '''                   Science Reviewer:'''                    [[BR]]                   '''                   System Reviewer:'''                    [[BR]]                   '''                   Deadline:'''                    [[BR]]                   '''                   Priority:'''                    High [[BR]]                   '''                   Depends on:'''                    [[BR]]                   '''                   Principal Investigator :'''                    Jérôme Chanut 
     78  '''                         Motivation:'''                          Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                         '''                         Status: '''                         Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]                         '''                         Main Tasks: '''                         [[BR]]                         '''                         Science Reviewer:'''                          [[BR]]                         '''                         System Reviewer:'''                          [[BR]]                         '''                         Deadline:'''                          [[BR]]                         '''                         Priority:'''                          High [[BR]]                         '''                         Depends on:'''                          [[BR]]                         '''                         Principal Investigator :'''                          Jérôme Chanut 
    7979 
    8080===  === 
     
    9292'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    9393 
    94   '''                                              Status: '''                             lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                          '''                                             Main Tasks: '''                             Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline:'''                                              [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:'''                                              [[BR]]                                                                                      '''                                              Depends on:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator : '''                             Miguel Castrillo 
     94  '''                                                    Status: '''                                   lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                                '''                                                   Main Tasks: '''                                   Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                                '''                                                    Science Reviewer:'''                                                                                            [[BR]]                                                                                            '''                                                    System Reviewer:'''                                                                                            [[BR]]                                                                                            '''                                                    Deadline:'''                                                    [[BR]]                                                                                            '''                                                    Priority:'''                                                    [[BR]]                                                                                            '''                                                    Depends on:'''                                                                                            [[BR]]                                                                                            '''                                                    Principal Investigator : '''                                   Miguel Castrillo 
    9595 
    9696==== ''' '''HPC-3 / Met Office - Suppress useless communications ==== 
    9797'''                Motivation:''' Suppress unnecessary halo updates (calls to lbc_lnk) as these are expensive and are a barrier to increased parallelisation of NEMO. 
    9898 
    99   [[BR]]                                          '''                                              Status: '''                                          [[BR]]                                          '''                                             Main Tasks: '''  
    100    * Use a script to search for lbc_lnk calls in the model code. 
    101    * Combine with SETTE testing to see if they can be safely removed 
    102    * Discussions with ST to determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed. As described in the HPC working group document above this would mean that haloes could no longer be output in NEMO output files.              [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline:''' October 2016                                             [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:''' High                                             [[BR]]                                                                                      '''                                              Depends on:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator : '''                             Tim Graham 
     99  [[BR]]                                                '''                                                    Status: '''                                                [[BR]]                                                '''                                                   Main Tasks: ''' 
     100 
     101 * Use a script to search for lbc_lnk calls in the model code. 
     102 * Combine with SETTE testing to see if they can be safely removed 
     103 * Discussions with ST to determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed. As described in the HPC working group document above this would mean that haloes could no longer be output in NEMO output files.              [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline:''' October 2016                                             [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:''' High                                             [[BR]]                                                                                      '''                                              Depends on:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator : '''                             Tim Graham 
    103104 
    104105==== ''' '''HPC-4 / CMCC - Scalability with MPI-OPENMP ==== 
     
    115116'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    116117 
    117   [[BR]]                                          '''                                              Status: '''                               New implementation - old idea           [[BR]]                                          '''                                             Main Tasks: '''                                 Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline:'''                                              [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:'''                               HIGH               [[BR]]                                                                                      '''                                              Depends on:'''                                         [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator : '''                             Andrew Coward 
     118  [[BR]]                                                '''                                                    Status: '''                                     New implementation - old idea           [[BR]]                                                '''                                                   Main Tasks: '''                                       Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                                '''                                                    Science Reviewer:'''                                                                                            [[BR]]                                                                                            '''                                                    System Reviewer:'''                                                                                            [[BR]]                                                                                            '''                                                    Deadline:'''                                                    [[BR]]                                                                                            '''                                                    Priority:'''                                     HIGH               [[BR]]                                                                                            '''                                                    Depends on:'''                                               [[BR]]                                                                                            '''                                                    Principal Investigator : '''                                   Andrew Coward 
    118119 
    119120===  === 
     
    122123'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
    123124 
    124   '''                       Status: '''                        Already started[[BR]]                       '''                       Main Tasks: '''                        [[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:'''                        [[BR]]                       '''                       Priority:'''                        High[[BR]]                       '''                       Depends on:'''                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''                       Gurvan Madec 
     125  '''                             Status: '''                              Already started[[BR]]                             '''                             Main Tasks: '''                              [[BR]]                             '''                             Science Reviewer:'''                              [[BR]]                             '''                             System Reviewer:'''                              [[BR]]                             '''                             Deadline:'''                              [[BR]]                             '''                             Priority:'''                              High[[BR]]                             '''                             Depends on:'''                              [[BR]]                             '''                             Principal Investigator : '''                             Gurvan Madec 
    125126 
    126127==== SIMPLIF-2 / CNRS - Simplification of configurations, introduction of user-defined module ==== 
     
    185186'''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps. 
    186187 
    187   [[BR]]                            '''                                Status: '''                                [[BR]]                            '''                               Main Tasks: '''                                [[BR]]                            '''                                Science Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                System Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Deadline:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Priority:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Depends on:'''                                                                        [[BR]] 
     188  [[BR]]                                  '''                                      Status: '''                                      [[BR]]                                  '''                                     Main Tasks: '''                                      [[BR]]                                  '''                                      Science Reviewer:'''                                                                              [[BR]]                                                                              '''                                      System Reviewer:'''                                                                              [[BR]]                                                                              '''                                      Deadline:'''                                      [[BR]]                                                                              '''                                      Priority:'''                                      [[BR]]                                                                              '''                                      Depends on:'''                                                                              [[BR]] 
    188189 
    189190'''ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system''' 
     
    209210 
    210211 * Follow-up the status of the trusting for supported configurations & HPC centers 
     212 * Finalize documentation (help content, wiki page, ...) 
    211213 * Complete the list of monitored configurations & add new features for improvement 
    212  * If needed,  
     214 * If needed,install the trusting on new HPCC for benchmarking the code over several centers 
    213215 
    214216'''Science Reviewer:'''[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Medium[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin 
     
    226228 
    227229==== ROBUSTNESS-10 / CNRS - Evolution of the Collaborative Development Environment (CDE) ==== 
    228 '''Motivation: '''in anticipation of the web server EOL hosting the NEMO website[[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks:''' 
    229  
    230  1. ''' ''' 
    231  1.  
    232  
    233 '''Science Reviewer:'''[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin 
     230'''Motivation: '''in anticipation of the web server EOL hosting the NEMO website, overall review on different components (website, forge & mailing lists) in order to make a compromise between groups with specific needs and tools aggregation & integration[[BR]] '''Status: '''[[BR]] '''Main Tasks:''' 
     231 
     232 1. New repository for users with some adjustments for NEMO ST operations 
     233 
     234   * Website reduced to its public area 
     235   * New public repository for users 
     236   * NEMO officers granted as Forge administrators 
     237   * Trac becomes the only management portal 
     238 
     239 2. New website or new full CDE if NEMO ST not satisfied with this new architecture 
     240 
     241'''Science Reviewer:'''[[BR]]'''System Reviewer:''' [[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin