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user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description (diff) – NEMO

Changes between Version 12 and Version 13 of user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description


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Timestamp:
2015-10-30T21:20:06+01:00 (8 years ago)
Author:
flavoni
Comment:

--

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  • user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description

    v12 v13  
    88 
    99 * '''[UserChoices]            ''':  set all you choises''' (you can modify everything)''' 
    10      * be careful to '''R_BC '''directory''' ''' 
     10   * be careful to '''R_BC '''directory''' ''' 
    1111 
     12 * if you use common login of ipsl (ada: /workgpfs/rech/psl/rpsl035''', '''tgcc:/ccc/work/cont003/dsm/p86ipsl/) nothing to do 
    1213 
    13        * if you use common login of ipsl (ada: /workgpfs/rech/psl/rpsl035''', '''tgcc:/ccc/work/cont003/dsm/p86ipsl/) nothing to do 
    14  
    15  
    16        * if you want to change and use your own directory you need to: 
    17          * create ~F${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version} directory in which you put your forcing files 
    18          * remark: opa9_UserChoices_OPA_version is defined in COMP/opa9.card 
     14 * if you want to change and use your own directory you need to: 
     15   * create ~F${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version} directory in which you put your forcing files 
     16   * remark: opa9_UserChoices_OPA_version is defined in COMP/opa9.card 
    1917 * '''[ListOfComponents]  ''':  don't modify 
    2018 * '''[Executable]              ''':  coherent name between executable in modipsl/bin directory, be careful of NUMBER OF PROCS ('''Total Number of Processors = NEMO.exe procs + xios.server procs''') 
    2119 * '''[Restarts]'''                  :  if you want that '''all components RESTART''' from the same simulation''' (if not set RESTART of component section: [OCE] or [ICE] or [MBG])''' 
    2220 * '''[OCE]'''                         : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ocean''' simulation 
     21   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
     22     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
     23     * and be careful also to COMP/opa9.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    2324 * '''[ICE]'''                          : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ice''' simulation 
     25   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
     26     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
     27     * and be careful also to COMP/im3.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    2428 * '''[MBG]'''                         : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''biology''' simulation 
     29   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
     30     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
     31     * and be careful also to COMP/im3.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    2532 * '''[Post]'''                         : fill if you want have libIGCM Post Treatment (ATLAS and Time Series) 
    2633 * '''[IOS]   '''                       :  don't modify  (IOS has no output frequency not restarts) 
    … …  
    2835'''config.card file:''' 
    2936 
    30   # This is config.card file for restart with an NEW libIGCM simulation tree.  [[BR]]           # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]           #      [[BR]]             #========================================================================   [[BR]]             #D-- Compatibility -   [[BR]]             [Compatibility]     [[BR]]             libIGCM=1.0     [[BR]]             #D-- UserChoices              -[[BR]]            '''  [!UserChoices ]'''        [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- ('''           <8 chars MAX'''            for JobName             ) [[BR]]            JobName             ='''        eOR1L3P '''        [[BR]]            #----- Short Name of Experiment [[BR]]            ExperimentName             =ORCA1clim [[BR]]            #----- DEVT TEST PROD [[BR]]            SpaceName             =DEVT [[BR]]            LongName             ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]            TagName             =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]            #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]            ExpType             =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- leap, noleap, 360d [[BR]]            CalendarType             =noleap [[BR]]            #-- Begin and end of Job [[BR]]            #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]            DateBegin             =0001-01-01 [[BR]]            DateEnd             =0050-12-31 [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 PeriodLength             =1Y [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]            #JobClass             =mono [[BR]]            JobClass             =multi [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- Total Number of Processors [[BR]]            JobNumProcTot             =225 [[BR]]            #============================ [[BR]]            #-- Run Options : [[BR]]            JobRunOptions             =''             [[BR]]            #============================ [[BR]]            # config.card configuration options :''            [[BR]]            #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]            #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- ListOfComponents              - [[BR]]            '''        [!ListOfComponents ]        '''            [[BR]]            #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]            OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]            ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]            MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]            IOS= (xios, XIOS) [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- Executable - [[BR]]            '''        [Executable]        '''         [[BR]]            Name=nemo [[BR]]            #D- For each component, Real name of executable [[BR]]            OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]            ICE= ("", "", "") [[BR]]            MBG= ("", "", "") [[BR]]            IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- Restarts - [[BR]]            '''        [Restarts] '''        [[BR]]            #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]            #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]            #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]            #D-      put OveRule              flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]            OverRule             =n [[BR]]            #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]            RestartDate             =0094-12-31 [[BR]]            #D- Define restart simulation name [[BR]]            RestartJobName             =NO1-T17 [[BR]]            #D- Path Server Group Login [[BR]]            RestartPath             =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]             #======================================================================== [[BR]]            #D-- OCE - [[BR]]            '''        [OCE] '''        [[BR]]            WriteFrequency            ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]            #WriteFrequency             ="5D" [[BR]]            Restart= n [[BR]]            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]            RestartDate             =1999-12-31 [[BR]]            # Define restart simulation name [[BR]]            RestartJobName             =NL1 [[BR]]            RestartPath             =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]            OldName             = [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- ICE - [[BR]]            '''        [ICE] '''        [[BR]]            WriteFrequency             ="1M" [[BR]]            Restart= n [[BR]]            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]         RestartDate             =1999-12-31[[BR]]            # Define restart simulation name [[BR]]            RestartJobName            =NL1 [[BR]]            RestartPath            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]            OldName            = [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- MBG - [[BR]]            '''        [MBG] '''        [[BR]]            WriteFrequency            ="1D 1M 1Y" [[BR]]            Restart= n [[BR]]            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]            RestartDate            =2000-12-31 [[BR]]            # Define restart simulation name [[BR]]            RestartJobName            =OR2LP1 [[BR]]            RestartPath            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]            OldName            = [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            #D-- Post - [[BR]]            '''        [Post] '''        [[BR]]            #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]            #D- frequency of rebuild submission [[BR]]            #-- 1Y [[BR]]            RebuildFrequency            =NONE [[BR]]            #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]            RebuildFromArchive            =NONE [[BR]]            #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]            #D- frequency of post-processing submission [[BR]]            TimeSeriesFrequency            =10Y [[BR]]            #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]            #D- the period of this average [[BR]]            SeasonalFrequency            =NONE [[BR]]            #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as SeasonalFrequency             [[BR]]            #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]            #SeasonalFrequencyOffset            =0 [[BR]]            PackFrequency            =1Y [[BR]]            #======================================================================== [[BR]]            ###======================================================================== [[BR]]            #D-- IOS - [[BR]]            '''        [IOS] '''        [[BR]]            WriteFrequency            ="" [[BR]]            # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]            Restart= n [[BR]]            ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]            RestartDate            =1899-12-31 [[BR]]            # Define restart simulation name for this component [[BR]]            RestartJobName            =EXP00 [[BR]]            RestartPath            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]            OldName            = [[BR]]            #======================================================================== 
     37  # This is config.card file for restart with an NEW libIGCM simulation tree.  [[BR]]                # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]                #      [[BR]]                  #========================================================================   [[BR]]                  #D-- Compatibility -   [[BR]]                  [Compatibility]     [[BR]]                  libIGCM=1.0     [[BR]]                  #D-- UserChoices                   -[[BR]]                 '''       [!UserChoices      ]'''             [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- ('''                <8 chars MAX'''                 for JobName                  ) [[BR]]                 JobName                  ='''             eOR1L3P '''             [[BR]]                 #----- Short Name of Experiment [[BR]]                 ExperimentName                  =ORCA1clim [[BR]]                 #----- DEVT TEST PROD [[BR]]                 SpaceName                  =DEVT [[BR]]                 LongName                  ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]                 TagName                  =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]                 #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]                 ExpType                  =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- leap, noleap, 360d [[BR]]                 CalendarType                  =noleap [[BR]]                 #-- Begin and end of Job [[BR]]                 #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]                 DateBegin                  =0001-01-01 [[BR]]                 DateEnd                  =0050-12-31 [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 PeriodLength                  =1Y [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]                 #JobClass                  =mono [[BR]]                 JobClass                  =multi [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- Total Number of Processors [[BR]]                 JobNumProcTot                  =225 [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 #-- Run Options : [[BR]]                 JobRunOptions                  =''                  [[BR]]                 #============================ [[BR]]                 # config.card configuration options :''                 [[BR]]                 #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]                 #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- ListOfComponents                   - [[BR]]                 '''             [!ListOfComponents      ]        '''                 [[BR]]                 #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]                 OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]                 ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]                 MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]                 IOS= (xios, XIOS) [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- Executable - [[BR]]                 '''             [Executable]        '''              [[BR]]                 Name=nemo [[BR]]                 #D- For each component, Real name of executable [[BR]]                 OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]                 ICE= ("", "", "") [[BR]]                 MBG= ("", "", "") [[BR]]                 IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- Restarts - [[BR]]                 '''             [Restarts] '''             [[BR]]                 #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]                 #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]                 #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]                 #D-      put OveRule                   flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]                 OverRule                  =n [[BR]]                 #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]                 RestartDate                  =0094-12-31 [[BR]]                 #D- Define restart simulation name [[BR]]                 RestartJobName                  =NO1-T17 [[BR]]                 #D- Path Server Group Login [[BR]]                 RestartPath                  =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]                  #======================================================================== [[BR]]                 #D-- OCE - [[BR]]                 '''             [OCE] '''             [[BR]]                 WriteFrequency                 ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]                 #WriteFrequency                  ="5D" [[BR]]                 Restart= n [[BR]]                 ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                 RestartDate                  =1999-12-31 [[BR]]                 # Define restart simulation name [[BR]]                 RestartJobName                  =NL1 [[BR]]                 RestartPath                  =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                 # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                 OldName                  = [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- ICE - [[BR]]                 '''             [ICE] '''             [[BR]]                 WriteFrequency                  ="1M" [[BR]]                 Restart= n [[BR]]                 ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]              RestartDate                  =1999-12-31[[BR]]                 # Define restart simulation name [[BR]]                 RestartJobName                 =NL1 [[BR]]                 RestartPath                 =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                 # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                 OldName                 = [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- MBG - [[BR]]                 '''             [MBG] '''             [[BR]]                 WriteFrequency                 ="1D 1M 1Y" [[BR]]                 Restart= n [[BR]]                 ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                 RestartDate                 =2000-12-31 [[BR]]                 # Define restart simulation name [[BR]]                 RestartJobName                 =OR2LP1 [[BR]]                 RestartPath                 =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]                 # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                 OldName                 = [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 #D-- Post - [[BR]]                 '''             [Post] '''             [[BR]]                 #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]                 #D- frequency of rebuild submission [[BR]]                 #-- 1Y [[BR]]                 RebuildFrequency                 =NONE [[BR]]                 #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]                 RebuildFromArchive                 =NONE [[BR]]                 #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]                 #D- frequency of post-processing submission [[BR]]                 TimeSeriesFrequency                 =10Y [[BR]]                 #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]                 #D- the period of this average [[BR]]                 SeasonalFrequency                 =NONE [[BR]]                 #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as SeasonalFrequency                  [[BR]]                 #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]                 #SeasonalFrequencyOffset                 =0 [[BR]]                 PackFrequency                 =1Y [[BR]]                 #======================================================================== [[BR]]                 ###======================================================================== [[BR]]                 #D-- IOS - [[BR]]                 '''             [IOS] '''             [[BR]]                 WriteFrequency                 ="" [[BR]]                 # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]                 Restart= n [[BR]]                 ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]                 RestartDate                 =1899-12-31 [[BR]]                 # Define restart simulation name for this component [[BR]]                 RestartJobName                 =EXP00 [[BR]]                 RestartPath                 =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]                 # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                 OldName                 = [[BR]]                 #======================================================================== 
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