Changes between Version 19 and Version 20 of user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description


Ignore:
Timestamp:
2015-11-02T11:25:50+01:00 (5 years ago)
Author:
flavoni
Comment:

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description

    v19 v20  
    77'''They are: ''' 
    88 
    9  * '''[UserChoices]            ''':  set all you choises''' (you can modify everything)''' 
     9 * '''[!UserChoices]            ''':  set all you choises''' (you can modify everything)''' 
    1010   * be careful to '''R_BC '''directory''' ''' 
    1111 
     
    1515   * create ~${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version} directory in which you put your forcing files 
    1616   * remark: opa9_UserChoices_OPA_version is defined in COMP/opa9.card 
    17  * '''[ListOfComponents]  ''':  don't modify 
     17 * '''[!ListOfComponents]  ''':  don't modify 
    1818 * '''[Executable]              ''':  coherent name between executable in modipsl/bin directory, be careful of NUMBER OF PROCS ('''Total Number of Processors = NEMO.exe procs + xios.server procs''') 
    1919 * '''[Restarts]'''                  :  if you want that '''all components RESTART''' from the same simulation''' (if not set RESTART of component section: [OCE] or [ICE] or [MBG])''' 
    20  * '''[OCE]'''                         : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ocean''' simulation 
     20 * '''[OCE]'''                         : you can choise !WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ocean''' simulation 
    2121   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
    2222     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
    2323     * and be careful also to COMP/opa9.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    24  * '''[ICE]'''                          : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ice''' simulation 
     24 * '''[ICE]'''                          : you can choise !WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''ice''' simulation 
    2525   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
    2626     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
    2727     * and be careful also to COMP/im3.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    28  * '''[MBG]'''                         : you can choise WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''biology''' simulation 
     28 * '''[MBG]'''                         : you can choise !WriteFrequency and if you want to start from RESTART '''biology''' simulation 
    2929   * be careful !WriteFrequency of each section need to be coherent with output in iodef.xml  : 
    3030     * for example if in iodef.xml you want output ocean field every '''1Y''' in !WriteFrequency you want just '''1Y''' 
    3131     * and be careful also to COMP/im3.card to section [!OutputFiles] : {PREFIX_WF'''1'''} you'll have WF'''n''' for each write frequency output 
    32  * '''[Post]'''                         : fill if you want have libIGCM Post Treatment (ATLAS and Time Series) 
     32 * '''[Post]'''                         : fill if you want have lib IGCM Post Treatment (ATLAS and Time Series) 
    3333 * '''[IOS]   '''                       :  don't modify  (IOS has no output frequency not restarts) 
    3434 
    3535'''config.card file:''' 
    3636 
    37   # This is config.card file for restart with an NEW libIGCM simulation tree.  [[BR]]                           # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]                           #      [[BR]]                             #========================================================================   [[BR]]                             #D-- Compatibility -   [[BR]]                             [Compatibility]     [[BR]]                             lib IGCM=1.0     [[BR]]                             #D-- !UserChoices                              -[[BR]]                            '''                  [!UserChoices                 ]'''                        [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- ('''                           <8 chars MAX'''                            for !JobName                             ) [[BR]]                            !JobName                             ='''                        eOR1L3P '''                        [[BR]]                            #----- Short Name of Experiment [[BR]]                            !ExperimentName                             =ORCA1clim [[BR]]                            #----- DEVT TEST PROD [[BR]]                            !SpaceName                             =DEVT [[BR]]                            !LongName                             ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]                            !TagName                             =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]                            #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]                            !ExpType                             =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- leap, noleap, 360d [[BR]]                            !CalendarType                             =noleap [[BR]]                            #-- Begin and end of Job [[BR]]                            #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]                            !DateBegin                             =0001-01-01 [[BR]]                            !DateEnd                             =0050-12-31 [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 !PeriodLength                             =1Y [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]                            #!JobClass                             =mono [[BR]]                            !JobClass                             =multi [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- Total Number of Processors [[BR]]                            !JobNumProcTot                             =225 [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            #-- Run Options : [[BR]]                            !JobRunOptions                             =''                             [[BR]]                            #============================ [[BR]]                            # config.card configuration options :''                            [[BR]]                            #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]                            #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- !ListOfComponents                              - [[BR]]                            '''                        [!ListOfComponents                 ]        '''                            [[BR]]                            #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]                            OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]                            ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]                            MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]                            IOS= (xios, XIOS) [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- Executable - [[BR]]                            '''                        [Executable]        '''                         [[BR]]                            Name=nemo [[BR]]                            #D- For each component, Real name of executable [[BR]]                            OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]                            ICE= ("", "", "") [[BR]]                            MBG= ("", "", "") [[BR]]                            IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- Restarts - [[BR]]                            '''                        [Restarts] '''                        [[BR]]                            #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]                            #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]                            #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]                            #D-      put !OveRule                              flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]                            !OverRule                             =n [[BR]]                            #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]                            !RestartDate                             =0094-12-31 [[BR]]                            #D- Define restart simulation name [[BR]]                            !RestartJobName                             =NO1-T17 [[BR]]                            #D- Path Server Group Login [[BR]]                            !RestartPath                             =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]                             #======================================================================== [[BR]]                            #D-- OCE - [[BR]]                            '''                        [OCE] '''                        [[BR]]                            !WriteFrequency                            ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]                            #!WriteFrequency                             ="5D" [[BR]]                            Restart= n [[BR]]                            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                            !RestartDate                             =1999-12-31 [[BR]]                            # Define restart simulation name [[BR]]                            !RestartJobName                             =NL1 [[BR]]                            !RestartPath                             =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                            !OldName                             = [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- ICE - [[BR]]                            '''                        [ICE] '''                        [[BR]]                            !WriteFrequency                             ="1M" [[BR]]                            Restart= n [[BR]]                            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                         !RestartDate                             =1999-12-31[[BR]]                            # Define restart simulation name [[BR]]                            !RestartJobName                            =NL1 [[BR]]                            !RestartPath                            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                            !OldName                            = [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- MBG - [[BR]]                            '''                        [MBG] '''                        [[BR]]                            !WriteFrequency                            ="1D 1M 1Y" [[BR]]                            Restart= n [[BR]]                            ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                            !RestartDate                            =2000-12-31 [[BR]]                            # Define restart simulation name [[BR]]                            !RestartJobName                            =OR2LP1 [[BR]]                            !RestartPath                            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]                            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                            !OldName                            = [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- Post - [[BR]]                            '''                        [Post] '''                        [[BR]]                            #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]                            #D- frequency of rebuild submission [[BR]]                            #-- 1Y [[BR]]                            !RebuildFrequency                            =NONE [[BR]]                            #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]                            !RebuildFromArchive                            =NONE [[BR]]                            #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]                            #D- frequency of post-processing submission [[BR]]                            !TimeSeriesFrequency                            =10Y [[BR]]                            #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]                            #D- the period of this average [[BR]]                            !SeasonalFrequency                            =NONE [[BR]]                            #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as !SeasonalFrequency                             [[BR]]                            #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]                            #!SeasonalFrequencyOffset                            =0 [[BR]]                            !PackFrequency                            =1Y [[BR]]                            #======================================================================== [[BR]]                            #D-- IOS - [[BR]]                            '''                        [IOS] '''                        [[BR]]                            !WriteFrequency                            ="" [[BR]]                            # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]                            Restart= n [[BR]]                            ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]                            !RestartDate                            =1899-12-31 [[BR]]                            # Define restart simulation name for this component [[BR]]                            !RestartJobName                            =EXP00 [[BR]]                            !RestartPath                            =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]                            # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                            !OldName                            = [[BR]]                            #======================================================================== 
     37  # This is config.card file for restart with an NEW lib IGCM simulation tree.  [[BR]]                             # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]                             #      [[BR]]                               #========================================================================   [[BR]]                               #D-- Compatibility -   [[BR]]                               [Compatibility]     [[BR]]                               lib IGCM=1.0     [[BR]]                               #D-- !UserChoices                                -[[BR]]                              '''                    [!UserChoices                   ]'''                          [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- ('''                             <8 chars MAX'''                              for !JobName                               ) [[BR]]                              !JobName                               ='''                          eOR1L3P '''                          [[BR]]                              #----- Short Name of Experiment [[BR]]                              !ExperimentName                               =ORCA1clim [[BR]]                              #----- DEVT TEST PROD [[BR]]                              !SpaceName                               =DEVT [[BR]]                              !LongName                               ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]                              !TagName                               =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]                              #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]                              !ExpType                               =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- leap, noleap, 360d [[BR]]                              !CalendarType                               =noleap [[BR]]                              #-- Begin and end of Job [[BR]]                              #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]                              !DateBegin                               =0001-01-01 [[BR]]                              !DateEnd                               =0050-12-31 [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 !PeriodLength                               =1Y [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]                              #!JobClass                               =mono [[BR]]                              !JobClass                               =multi [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- Total Number of Processors [[BR]]                              !JobNumProcTot                               =225 [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- Run Options : [[BR]]                              !JobRunOptions                               =''                               [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              # config.card configuration options :''                              [[BR]]                              #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]                              #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- !ListOfComponents                                - [[BR]]                              '''                          [!ListOfComponents                   ]        '''                              [[BR]]                              #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]                              OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]                              ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]                              MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]                              IOS= (xios, XIOS) [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Executable - [[BR]]                              '''                          [Executable]        '''                           [[BR]]                              Name=nemo [[BR]]                              #D- For each component, Real name of executable [[BR]]                              OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]                              ICE= ("", "", "") [[BR]]                              MBG= ("", "", "") [[BR]]                              IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Restarts - [[BR]]                              '''                          [Restarts] '''                          [[BR]]                              #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]                              #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]                              #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]                              #D-      put !OveRule                                flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]                              !OverRule                               =n [[BR]]                              #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                               =0094-12-31 [[BR]]                              #D- Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                               =NO1-T17 [[BR]]                              #D- Path Server Group Login [[BR]]                              !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                              #D-- OCE - [[BR]]                              '''                          [OCE] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]                              #!WriteFrequency                               ="5D" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                               =1999-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                               =NL1 [[BR]]                              !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                               = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- ICE - [[BR]]                              '''                          [ICE] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                               ="1M" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                           !RestartDate                               =1999-12-31[[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                              =NL1 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- MBG - [[BR]]                              '''                          [MBG] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="1D 1M 1Y" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                              =2000-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                              =OR2LP1 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Post - [[BR]]                              '''                          [Post] '''                          [[BR]]                              #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]                              #D- frequency of rebuild submission [[BR]]                              #-- 1Y [[BR]]                              !RebuildFrequency                              =NONE [[BR]]                              #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]                              !RebuildFromArchive                              =NONE [[BR]]                              #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]                              #D- frequency of post-processing submission [[BR]]                              !TimeSeriesFrequency                              =10Y [[BR]]                              #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]                              #D- the period of this average [[BR]]                              !SeasonalFrequency                              =NONE [[BR]]                              #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as !SeasonalFrequency                               [[BR]]                              #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]                              #!SeasonalFrequencyOffset                              =0 [[BR]]                              !PackFrequency                              =1Y [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- IOS - [[BR]]                              '''                          [IOS] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="" [[BR]]                              # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]                              !RestartDate                              =1899-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name for this component [[BR]]                              !RestartJobName                              =EXP00 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== 
    3838 
    3939=== Important files === 
     
    5151 
    5252=== '''  DRIVER ''' === 
    53   :  shell script to use data of cards :'''      don't change''' 
     53  :  shell script to use data of cards :'''        don't change''' 
    5454 
    5555opa9.driver[[BR]]lim2.driver[[BR]]lim3.driver[[BR]]pisces.driver[[BR]]xios.driver