source: branches/bibliolocean/src/README.rst @ 238

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.. TIPS
.. ====
.. 
.. To process this file for HTML output::
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..   rst2html --strip-comments README.rst  > README.html
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.. TODO
.. ====
..
.. validation par autre que fp
..
.. complete doc
..
.. EVOLUTIONS
.. ==========
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.. - fplod 20120629T131738Z cratos (Linux)
..
..  * creation à l'arrache
..

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How to
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... produire les fichiers rtf pour aeres à partir d'un .bib
    avec superbib branche bibliolocean

.. warning::

   travail sur cratos à cause de jabref et bibtool

Récupération de superbib
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Remplacer pinsard par votre login dans la commande suivante::

   svn checkout svn+ssh://pinsard@forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/superbib/svn/ ${HOME}/superbib_ws/


Configurer l'environnement de travail
=====================================

::

  SUPERBIB=${HOME}/superbib_ws/
  export SUPERBIB

  . ${SUPERBIB}/project_profile.sh \
  -d ${SUPERBIB} \
  -i /usr/temp/${LOGNAME}/superbib_d/ \
  -o /usr/temp/${LOGNAME}/superbib_d/ \
  -t /usr/temp/${LOGNAME}/log/
  -jv 2.6 \
  -j /usr/home/incas/francoise/jabref-2.6_cratos/ \
  -b /usr/home/incas/francoise/bibtool-2.52_cratos/bin

Cette séquence de commande peut être incluse dans le ${HOME}/.profile
quand les tests suivants passent.

Tester si path ok pour jabref
+++++++++++++++++++++++++++++

::

  java -jar ${JABREF_DIR}/JabRef-${JABREF_VERSION}.jar \
       -p ${PROJECT}/../branches/bibliolocean/src/jabref.preferences.xml \
       ${PROJECT}/data/bibloceantest1.bib

Vous devez voir apparaitre une fenêtre jabref et dans cette fenêtre une réf biblio::

       Techreport (MadecLevyEtAl:ES:2007) Madec, G.; Lévy, M.; Takahashi, K.; Pinsard, F.; Talandier, C.; Benshila, R. & Foujols, M.-A. Activities between CNRS and ESC under MOU The Earth Simulator Center, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 2007


Sur la fenêtre de lancement de la commande java ..., on voit des messages genre::

     Jun 29, 2012 3:03:45 PM net.sf.jabref.plugin.PluginCore initialize
     INFO: Found 2 plugin(s):
       - net.sf.jabref.core (jar:file:/.autofs/home/incas/francoise/jabref-2.6_cratos/JabRef-2.6.jar!/plugins/net.sf.jabref.core/plugin.xml)
           - net.sf.jabref.export.misq (jar:file:/.autofs/home/incas/francoise/jabref-2.6_cratos/JabRef-2.6.jar!/plugins/net.sf.jabref.export.misq/plugin.xml)

           Opening: /usr/lodyc/incas/fplod/superbib/svn/trunk//data/bibloceantest1.bib
           Jun 29, 2012 3:03:46 PM net.sf.jabref.Globals logger
           INFO: Exception while setting column widths. Choosing default.
           Jun 29, 2012 3:03:46 PM net.sf.jabref.Globals logger
           INFO: Exception while setting column widths. Choosing default.
           Jun 29, 2012 3:03:46 PM net.sf.jabref.Globals logger
           INFO: Exception while setting column widths. Choosing default.

Je ne sais pas m'en débarraser mais ça n'a pas l'air grave ...



Tester si path ok pour bibtool
++++++++++++++++++++++++++++++

Recherche des publications dont l'année (champ year bibtex est 2007) ::

  bibtool -- 'select={year "2007"}' ${PROJECT}/data/bibloceantest1.bib

On doit voir ::

  @PREAMBLE{ "Bibliographie du LOCEAN - test1 superbib/bibliolocean" }

  @TechReport{      madeclevyetal:es:2007,
    author        = {{G}urvan {M}adec and {M}arina {L}évy and {K}eiko
                     {T}akahashi and {F}rançoise {P}insard and {C}laude
                     {T}alandier and {R}achid {B}enshila and {M}arie-{A}lice
                     {F}oujols},
    title         = {{A}ctivities between {CNRS} and {ESC} under {MOU}},
    institution   = {{T}he {E}arth {S}imulator {C}enter, {J}apan {A}gency for
                     {M}arine-{E}arth {S}cience and {T}echnology},
    year          = {2007},
    loceanaffectation={cnrs},
    loceanbibid   = {00561},
    loceanteam    = {nemo,dycos,incas,phybiocar},
    timestamp     = {20120419}
  }

Recherche des publications dont l'auteur est ginette (il n'y en a pas)::

  bibtool -- 'select={author "ginette" ' ${PROJECT}/data/bibloceantest1.bib

On ne doit rien voir.

Copier la liste des références du working space dans l'espace de données
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toutes les références biblio du labo sont dans ${PROJECT}/../branches/bibliolocean/data/biblioref.bib.
Les outils utilisent ${PROJECT_ID}/biblioref.bib pour éviter tous risques de scratch (même si on a le dépôt en secours).

Il faut donc commencer par copier le fichier du working space dans l'espace "données"::

  cp ${PROJECT}/../branches/bibliolocean/data/biblioref.bib ${PROJECT_ID}/


Générer les fichiers GTBIBLIO pour le www et les rtf
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nb : Les fichiers rtf peuvent être utilisé sous openofffice  (commande ooffice3.2 sous cratos).

:: 

 genbib.sh

Les fichiers sont dans ${PROJECT_OD}/public_html/gtbiblio/.

Vérifier la référence::

   checkaeres.sh

.. warning::

   Si erreur, corriger ${PROJECT_ID}/biblioref.bib
   avant de passer à la suite

.. warning::

   Pour l'instant toutes les sélections ne sont pas faites, j'avance ...

::

 genaeres.sh 

Les fichiers sont dans ${PROJECT_OD}/public_html/gtbiblio/aeres2007_2012/.