source: TOOLS/CMIP6_FORCING/AER_TROP_EMISSIONS/REGRID/regrid.sh @ 3391

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Current version of regrid scripts for creating aerosol emissions files for CMIP6

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Line 
1#--updated on 4/5/2017 with improved Sheng & Zwiers algorithm, ThL
2#--corrected some interpolation preprocessing (compared to v4)
3#--updated on 5/5/2017 with correction factor (30/46) on NOx vs. NO
4#--updated on 9/5/2017 with output separation BB/anthro for SO2, NOx and NH3
5#--corrected on 22/6/2017 for BB: undef values zeroed before remapping
6#--corrected on 26/09/2017 for NOx units: PNNL dataset is kg NO2, VUA is kg NO.
7#  INCA expects NO2 in its AER version, this may have to be changed for the full INCA version
8#
9#INCA  conc_dms flx_nox flx_bc flx_pom flx_bbbc flx_bbpom flx_so2 flx_so4 flx_h2s flx_nh3
10#CMIP6 species  NOx     BC     OC                         SO2                     NH3
11# + NMVOC CO
12
13#--INCA example file where dms_conc can be reused
14fileINCAex="/home/oboucher/CMIP6/AER_EMISSIONS/INCAfile/sflx_lmdz_phy_1997.nc"
15
16#--input directory for anthropogenic (non-BB) emissions
17dirinPNNL="/prodigfs/project/input4MIPs/PNNL-JGCRI/emissions/CMIP/CEDS-2017-05-18/mon/"
18dirinVUA="/prodigfs/project/input4MIPs/VUA/emissions/CMIP/VUA-CMIP-BB4CMIP6-1-2/mon/"
19
20#--output directory
21dirout="/data/"${USER}"/CMIP6/AEROSOL/"
22if [ ! -d ${dirout} ] ; then mkdir -p ${dirout} ; fi
23
24#--LMDz grid information
25grid="144-143"
26gridfile="/home/oboucher/CMIP6/GRID/grid-lmdz-lonlat_144x143"
27nbpoint=$((144*141+2))
28
29#--year
30for year in {1850..2014}
31do
32
33#--species
34for species in "BC" "NOx" "OC" "SO2" "NH3"
35do
36
37if [ ${species} = "BC"  ] ; then speciesinca="bc"  ; fi
38if [ ${species} = "NOx" ] ; then speciesinca="nox" ; fi
39if [ ${species} = "OC"  ] ; then speciesinca="pom" ; fi
40if [ ${species} = "SO2" ] ; then speciesinca="so2" ; fi
41if [ ${species} = "NH3" ] ; then speciesinca="nh3" ; fi
42
43#--finding correct file for PNNL data
44if [ $year -ge 1750 -a $year -lt 1800 ]; then
45year1=1750
46year2=1799
47elif [ $year -ge 1800 -a $year -lt 1850 ]; then
48year1=1800
49year2=1849
50elif [ $year == 1850 ]; then
51year1=1850
52year2=1850
53elif [ $year -ge 1851 -a $year -lt 1900 ]; then
54year1=1851
55year2=1899
56elif [ $year -ge 1900 -a $year -lt 1950 ]; then
57year1=1900
58year2=1949
59elif [ $year -ge 1950 -a $year -lt 2000 ]; then
60year1=1950
61year2=1999
62elif [ $year -ge 2000 -a $year -lt 2015 ]; then
63year1=2000
64year2=2014
65else
66echo 'Houston we have a problem for the PNNL data'
67exit 1
68fi
69
70#--input file PNNL
71filename=${dirinPNNL}${species}"_em_anthro/gn/v20170519/"${species}"-em-anthro_input4MIPs_emissions_CMIP_CEDS-2017-05-18_gn_${year1}01-${year2}12.nc"
72
73#--output files
74filenameout1=${dirout}flux_${speciesinca}_${year}.nc
75filenameout2=${dirout}flux_lmdz_${speciesinca}_${year}.nc
76filenameout3=${dirout}flux_vector_${speciesinca}_${year}.nc
77
78echo ${filename} ${filenameout1} ${filenameout2} ${filenameout3}
79rm -f ${filenameout1} ${filenameout2} ${filenameout3}
80
81#--unfortunately idl not happy with PNNL netcdf files so need to ferretize files
82#--I also sum over sectors and I extract the correct year as well
83rm -f rewrite.jnl
84cat << eod > rewrite.jnl
85use "${filename}"
86set region/t=16-jan-${year}:16-dec-${year}
87save/clobber/file="${filenameout1}" ${species}_EM_ANTHRO[k=@sum]
88eod
89
90#--run ferret script
91ferret << eod
92go rewrite.jnl
93exit
94eod
95
96#--remap to LMDz grid
97#--OC to POM conversion factor
98#--otherwise change to capital letters if not (eg NOx)
99if [ ${species} == "OC"  ] ; then
100echo cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species}_EM_ANTHRO | awk '{print toupper($0)}'`,flux -mulc,1.4 ${filenameout1} ${filenameout2}
101cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species}_EM_ANTHRO | awk '{print toupper($0)}'`,flux -mulc,1.4 ${filenameout1} ${filenameout2}
102else
103echo cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species}_EM_ANTHRO | awk '{print toupper($0)}'`,flux  ${filenameout1} ${filenameout2}
104cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species}_EM_ANTHRO | awk '{print toupper($0)}'`,flux ${filenameout1} ${filenameout2}
105fi
106
107#--Improved Sheng & Zwiers algorithm + transform into vector
108rm -f regrid.pro
109cat << eod >> regrid.pro
110pro regrid
111filename='${filenameout2}'
112print, filename
113NETCDFREAD,filename,'flux',flux,dimflux
114NETCDFREAD,filename,'lat',lat,dimlat0
115NETCDFREAD,filename,'lon',lon,dimlon0
116NETCDFREAD,filename,'TIME',time,dimtime0
117dimlat=dimlat0(0)
118dimlon=dimlon0(0)
119dimtime=dimtime0(0)
120print, 'dim flux=', dimflux
121A = float([     [3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8.],$
122                [1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
123                [0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
124                [0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
125                [0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
126                [0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0.],$
127                [0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0.],$
128                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0.],$
129                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0.],$
130                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0.],$
131                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8.],$
132                [1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4.]   ])
133fluxinit=flux
134flux_check=flux
135for lo=0,dimlon-1 do begin
136for la=0,dimlat-1 do begin
137flux_check(lo,la,*) = invert(A) ## transpose(fluxinit(lo,la,*))
138endfor
139endfor                 
140m_bloq = make_array(dimlon,dimlat,12,value=0)           ; Matrice booléenne "mois à bloquer ou non"
141if total(where(flux_check lt 0)) ne -1 then m_bloq(where(flux_check lt 0)) = 1
142; Correction/adaptation de la matrice S&Z en fonction du masque booléen m_bloq
143for lo=0,dimlon-1 do begin
144for la=0,dimlat-1 do begin
145whereneg = where(flux_check(lo,la,*) lt 0)              ; (12 pts max) Identification de potentiels points à problÚmes, corrigés négativement
146nbannul=n_elements(whereneg)*(total(whereneg) ne -1)
147flux_corr=flux_check(lo,la,*)                           ; Création d'un vecteur pour recevoir les valeurs corrigées, initialisé à flux_check au cas où on n'ait rien à faire d'autre qu'une seule itération
148A2 = A                                                  ; Je repars de la matrice A initiale, ce pour chaque point de grille
149;                                                       ; Potentiellement plusieurs passages pour éliminer toutes les valeurs négatives
150while nbannul ne 0 do begin                             ; Si l'on a effectivement des émissions corrigées négativement...
151m_bloq(lo,la,whereneg) = 1                              ; Update de la matrice m_bloq
152for m=0,11 do begin
153if m eq 11 then begin                                   ; Pour plus de facilité, mois précédents et suivants codés ici
154p=10
155s=0
156endif else if m eq 0 then begin
157p=11
158s=1
159endif else begin
160p = m-1
161s = m+1
162endelse
163if m_bloq(lo,la,m) then begin                           ; Je traite les mois bloqués en eux-mêmes
164A2(p,m) = 0.
165A2(m,m) = 1.
166A2(s,m) = 0.
167endif                                                   ; Fin du cas si l'on est sur un mois bloqué
168if ~m_bloq(lo,la,m) then begin                          ; Je traite les mois non bloqués, pour ceux adjacents à un mois bloqué
169if m_bloq(lo,la,p) and m_bloq(lo,la,s) then begin               ; Mois encadré de deux mois bloqués
170A2(p,m) = 1./4.
171A2(m,m) = 1./2.
172A2(s,m) = 1./4.
173endif else if m_bloq(lo,la,p) and ~m_bloq(lo,la,s) then begin   ; Mois précédent bloqué (uniquement)
174A2(p,m) = 2./8.
175A2(m,m) = 5./8.
176A2(s,m) = 1./8.
177endif else if ~m_bloq(lo,la,p) and m_bloq(lo,la,s) then begin   ; Mois suivant bloqué (uniquement)
178A2(p,m) = 1./8.
179A2(m,m) = 5./8.
180A2(s,m) = 2./8.
181endif
182endif                                                           ; Fin du cas mois non bloqué
183endfor                                                          ; Fin de la boucle sur les mois, balayage de la matrice
184flux_corr = invert(A2) ## transpose(fluxinit(lo,la,*))          ; Ré-itération de la multiplication matricielle avec la matrice A modifiée (A2)
185whereneg = where(flux_corr lt 0)                                ; (12 pts max) Ré-identification de potentiels nouveaux points à problÚmes, corrigés négativement
186nbannul=n_elements(whereneg)*(total(whereneg) ne -1)
187endwhile                                                        ; Fin du cas où l'on avait des problÚmes d'émissions corrigées négativement
188; *** IMPORTANT ! *** Pour signaler les mois bloqués, on prend la convention suivante :
189;       valeur négative ou nulle <=> mois bloqué
190;       valeur positive <=> mois à interpolation classique
191flux(lo,la,*) = flux_corr                                       ; En sortie de la boucle while, normalement flux_corr est complÚtement positif
192endfor                                                          ; Fin boucle lat
193endfor                                                          ; Fin boucle lon
194nbnegtotal = n_elements(where(m_bloq eq 1)) * (total(where(m_bloq eq 1)) ne -1)
195if nbnegtotal ne 0 then flux(where(m_bloq eq 1)) = -flux(where(m_bloq eq 1))            ; Je force à des valeurs négatives
196;
197month_in_year=12
198nbpoint=${nbpoint}
199flux2=fltarr(nbpoint,month_in_year)
200flux2(*,*)=0.0
201;
202for l=0,month_in_year-1 do begin
203flux2(0,l)=TOTAL(flux(*,0,l))/float(dimlon)
204flux2(nbpoint-1,l)=TOTAL(flux(*,dimlat-1,l))/float(dimlon)
205endfor
206;
207pt=1
208for j=1,dimlat-2  do begin
209for i=0,dimlon-1  do begin
210for l=0,month_in_year-1 do begin
211  flux2(pt,l)=flux(i,j,l)
212endfor
213pt=pt+1
214endfor
215endfor
216;
217;saving netcdf file
218;
219fluxstruct={vector:fltarr(nbpoint),time:fltarr(month_in_year), $
220            flx_${speciesinca}:fltarr(nbpoint,month_in_year) }
221;
222fluxstruct.vector=float(indgen(nbpoint)+1)
223;;fluxstruct.time=float(indgen(month_in_year)+1)
224fluxstruct.time=[15, 45, 75, 105, 135, 165, 195, 225, 255, 285, 315, 345]
225fluxstruct.flx_${speciesinca}=flux2
226;
227attributes = {units:strarr(3),long_name:strarr(3)}
228attributes.units = ['vector','days since 1960-01-01','flux']
229attributes.long_name = ['vector', 'time', 'flux']
230;
231dimensions = {isdim:intarr(3), links:intarr(2,3)}
232       dimensions.isdim =  [1,1,0]  ; (1=dimension, 0=variable)
233       dimensions.links = [ [-1,-1],[-1,-1],[0,1]    ]
234;
235netcdfwrite,'${filenameout3}',fluxstruct,clobber=1, attributes=attributes, dimensions=dimensions
236;
237end
238eod
239
240#
241#--calling IDL
242#
243/opt/idl-6.4/idl/bin/idl << eod
244.r netcdf
245.r netcdfwrite
246.r struct_dims
247.r regrid
248regrid
249exit
250eod
251#
252
253#--finding correct file for VUA data
254if [ $year -ge 1750 -a $year -lt 1850 ]; then
255year1=1750
256year2=1849
257elif [ $year -ge 1850 -a $year -lt 2016 ]; then
258year1=1850
259year2=2015
260else
261echo 'Houston we have a problem for the VUA data'
262exit 1
263fi
264
265#--now dealing with BB sources
266filename=${dirinVUA}${species}"-em-biomassburning/gn/v20161213/"${species}"-em-biomassburning_input4MIPs_emissions_CMIP_VUA-CMIP-BB4CMIP6-1-2_gn_${year1}01-${year2}12.nc"
267
268#--output files
269filenameout1=${dirout}flux_${speciesinca}bb_${year}.nc
270filenameout1b=${dirout}flux_0_${speciesinca}bb_${year}.nc
271filenameout2=${dirout}flux_lmdz0_${speciesinca}bb_${year}.nc
272filenameout3=${dirout}flux_vector_${speciesinca}bb_${year}.nc
273
274echo ${filename} ${filenameout1} ${filenameout1b} ${filenameout2} ${filenameout3}
275rm -f ${filenameout1} ${filenameout1b} ${filenameout2} ${filenameout3}
276
277#--unfortunately idl not happy with VUA netcdf files so need to ferretize files
278#--I extract the correct year as well
279rm -f rewrite.jnl
280cat << eod > rewrite.jnl
281set memory/size=100
282use "${filename}"
283set region/t=16-jan-${year}:16-dec-${year}
284save/clobber/file="${filenameout1}" ${species}
285eod
286
287#--run ferret script
288ferret << eod
289go rewrite.jnl
290exit
291eod
292
293#--replace undef with 0               --------------------------- Moved here (before remap) by ThL 22/06/2017
294cdo setmisstoc,0.0 ${filenameout1} ${filenameout1b}
295
296#--remap to LMDz grid
297#--OC to POM conversion factor
298#--as ferret returns NOX, treat NOx NOX inconsistency in names by converting to upper case
299if [ ${species} != "OC"  ] ; then
300echo cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species} | awk '{print toupper($0)}'`,flux ${filenameout1b} ${filenameout2}
301cdo remapcon,${gridfile} -chname,`echo ${species} | awk '{print toupper($0)}'`,flux ${filenameout1b} ${filenameout2}
302else
303echo cdo remapcon,${gridfile} -chname,${species},flux -mulc,1.4 ${filenameout1b} ${filenameout2}
304cdo remapcon,${gridfile} -chname,${species},flux -mulc,1.4 ${filenameout1b} ${filenameout2}
305fi
306
307#--Improved Sheng & Zwiers algorithm + transform into vector
308rm -f regrid.pro
309cat << eod >> regrid.pro
310pro regrid
311filename='${filenameout2}'
312print, filename
313NETCDFREAD,filename,'flux',flux,dimflux
314NETCDFREAD,filename,'lat',lat,dimlat0
315NETCDFREAD,filename,'lon',lon,dimlon0
316NETCDFREAD,filename,'TIME',time,dimtime0
317dimlat=dimlat0(0)
318dimlon=dimlon0(0)
319dimtime=dimtime0(0)
320print, 'dim flux=', dimflux
321A = float([     [3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8.],$
322                [1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
323                [0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
324                [0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
325                [0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],$
326                [0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0., 0.],$
327                [0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0., 0.],$
328                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0., 0.],$
329                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0., 0.],$
330                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8., 0.],$
331                [0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4., 1./8.],$
332                [1./8., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1./8., 3./4.]   ])
333fluxinit=flux
334flux_check=flux
335for lo=0,dimlon-1 do begin
336for la=0,dimlat-1 do begin
337flux_check(lo,la,*) = invert(A) ## transpose(fluxinit(lo,la,*))
338endfor
339endfor                 
340m_bloq = make_array(dimlon,dimlat,12,value=0)           ; Matrice booléenne "mois à bloquer ou non"
341if total(where(flux_check lt 0)) ne -1 then m_bloq(where(flux_check lt 0)) = 1
342; Correction/adaptation de la matrice S&Z en fonction du masque booléen m_bloq
343for lo=0,dimlon-1 do begin
344for la=0,dimlat-1 do begin
345whereneg = where(flux_check(lo,la,*) lt 0)              ; (12 pts max) Identification de potentiels points à problÚmes, corrigés négativement
346nbannul=n_elements(whereneg)*(total(whereneg) ne -1)
347flux_corr=flux_check(lo,la,*)                           ; Création d'un vecteur pour recevoir les valeurs corrigées, initialisé à flux_check au cas où on n'ait rien à faire (à part 1 seule correction matricielle)
348A2 = A                                                  ; Je repars de la matrice A initiale, ce pour chaque point de grille
349;                                                       ; Potentiellement plusieurs passages pour éliminer toutes les valeurs négatives
350while nbannul ne 0 do begin                             ; Si l'on a effectivement des émissions corrigées négativement...
351m_bloq(lo,la,whereneg) = 1                              ; Update de la matrice m_bloq
352for m=0,11 do begin
353if m eq 11 then begin                                   ; Pour plus de facilité, mois précédents et suivants codés ici
354p=10
355s=0
356endif else if m eq 0 then begin
357p=11
358s=1
359endif else begin
360p = m-1
361s = m+1
362endelse
363if m_bloq(lo,la,m) then begin                           ; Je traite les mois bloqués en eux-mêmes
364A2(p,m) = 0.
365A2(m,m) = 1.
366A2(s,m) = 0.
367endif                                                   ; Fin du cas si l'on est sur un mois bloqué
368if ~m_bloq(lo,la,m) then begin                          ; Je traite les mois non bloqués, pour ceux adjacents à un mois bloqué
369if m_bloq(lo,la,p) and m_bloq(lo,la,s) then begin               ; Mois encadré de deux mois bloqués
370A2(p,m) = 1./4.
371A2(m,m) = 1./2.
372A2(s,m) = 1./4.
373endif else if m_bloq(lo,la,p) and ~m_bloq(lo,la,s) then begin   ; Mois précédent bloqué (uniquement)
374A2(p,m) = 2./8.
375A2(m,m) = 5./8.
376A2(s,m) = 1./8.
377endif else if ~m_bloq(lo,la,p) and m_bloq(lo,la,s) then begin   ; Mois suivant bloqué (uniquement)
378A2(p,m) = 1./8.
379A2(m,m) = 5./8.
380A2(s,m) = 2./8.
381endif
382endif                                                           ; Fin du cas mois non bloqué
383endfor                                                          ; Fin de la boucle sur les mois, balayage de la matrice
384flux_corr = invert(A2) ## transpose(fluxinit(lo,la,*))          ; Ré-itération de la multiplication matricielle avec la matrice A modifiée (A2)
385whereneg = where(flux_corr lt 0)                                ; (12 pts max) Ré-identification de potentiels nouveaux points à problÚmes, corrigés négativement
386nbannul=n_elements(whereneg)*(total(whereneg) ne -1)
387endwhile                                                        ; Fin du cas où l'on avait des problÚmes d'émissions corrigées négativement
388; *** IMPORTANT ! *** Pour signaler les mois bloqués, on prend la convention suivante :
389;       valeur négative ou nulle <=> mois bloqué
390;       valeur positive <=> mois à interpolation classique
391flux(lo,la,*) = flux_corr                                       ; En sortie de la boucle while, normalement flux_corr est complÚtement positif
392endfor                                                          ; Fin boucle lat
393endfor                                                          ; Fin boucle lon
394nbnegtotal = n_elements(where(m_bloq eq 1)) * (total(where(m_bloq eq 1)) ne -1)
395if nbnegtotal ne 0 then flux(where(m_bloq eq 1)) = -flux(where(m_bloq eq 1))            ; Je force à des valeurs négatives
396;
397month_in_year=12
398nbpoint=${nbpoint}
399flux2=fltarr(nbpoint,month_in_year)
400flux2(*,*)=0.0
401;
402for l=0,month_in_year-1 do begin
403flux2(0,l)=TOTAL(flux(*,0,l))/float(dimlon)
404flux2(nbpoint-1,l)=TOTAL(flux(*,dimlat-1,l))/float(dimlon)
405endfor
406;
407pt=1
408for j=1,dimlat-2  do begin
409for i=0,dimlon-1  do begin
410for l=0,month_in_year-1 do begin
411  flux2(pt,l)=flux(i,j,l)
412endfor
413pt=pt+1
414endfor
415endfor
416;
417;saving netcdf file
418;
419fluxstruct={vector:fltarr(nbpoint),time:fltarr(month_in_year), $
420            flx_bb${speciesinca}:fltarr(nbpoint,month_in_year) }
421;
422fluxstruct.vector=float(indgen(nbpoint)+1)
423;;fluxstruct.time=float(indgen(month_in_year)+1)
424fluxstruct.time=[15, 45, 75, 105, 135, 165, 195, 225, 255, 285, 315, 345]
425fluxstruct.flx_bb${speciesinca}=flux2
426;
427attributes = {units:strarr(3),long_name:strarr(3)}
428attributes.units = ['vector','days since 1960-01-01','flux']
429attributes.long_name = ['vector', 'time', 'flux']
430;
431dimensions = {isdim:intarr(3), links:intarr(2,3)}
432       dimensions.isdim =  [1,1,0]  ; (1=dimension, 0=variable)
433       dimensions.links = [ [-1,-1],[-1,-1],[0,1]    ]
434;
435netcdfwrite,'${filenameout3}',fluxstruct,clobber=1, attributes=attributes, dimensions=dimensions
436;
437end
438eod
439
440#
441#--calling IDL
442#
443/opt/idl-6.4/idl/bin/idl << eod
444.r netcdf
445.r netcdfwrite
446.r struct_dims
447.r regrid
448regrid
449exit
450eod
451#
452
453#--end loop on species
454done
455
456#--unfortunately idl use capital letters for variable names so need to change to small letters for now
457rm -f ${dirout}flux_vector_h2s_${year}.nc ${dirout}flux_vector_so4_${year}.nc
458cdo expr,'flx_h2s=0.*FLX_SO2' ${dirout}flux_vector_so2_${year}.nc ${dirout}flux_vector_h2s_${year}.nc
459cdo expr,'flx_so4=0.*FLX_SO2' ${dirout}flux_vector_so2_${year}.nc ${dirout}flux_vector_so4_${year}.nc
460
461rm -f ${dirout}flux_vector_${year}.nc
462
463#--combining everything into a single file with some final preprocessing
464rm -f ${dirout}flux_vector_noxtot_${year}.nc ${dirout}flux_vector_so2tot_${year}.nc ${dirout}flux_vector_nh3tot_${year}.nc
465
466#--deleting output file if already there
467rm -f ${dirout}sflx_lmdz_cmip6_${year}.nc
468#--merging all files into a single one
469#--PNNL NOx is NO2 so no change in unit
470#--VUA NOx is NO so 46/30 ratio to convert to NO2
471cdo merge -expr,'flx_bc=FLX_BC' ${dirout}flux_vector_bc_${year}.nc -expr,'flx_bbbc=FLX_BBBC' ${dirout}flux_vector_bcbb_${year}.nc -expr,'flx_pom=FLX_POM' ${dirout}flux_vector_pom_${year}.nc -expr,'flx_bbpom=FLX_BBPOM' ${dirout}flux_vector_pombb_${year}.nc -expr,'flx_nox=FLX_NOX' ${dirout}flux_vector_nox_${year}.nc -expr,'flx_bbnox=46.*FLX_BBNOX/30.;' ${dirout}flux_vector_noxbb_${year}.nc -expr,'flx_so2=FLX_SO2' ${dirout}flux_vector_so2_${year}.nc -expr,'flx_bbso2=FLX_BBSO2' ${dirout}flux_vector_so2bb_${year}.nc -expr,'flx_nh3=FLX_NH3' ${dirout}flux_vector_nh3_${year}.nc -expr,'flx_bbnh3=FLX_BBNH3' ${dirout}flux_vector_nh3bb_${year}.nc  ${dirout}flux_vector_h2s_${year}.nc ${dirout}flux_vector_so4_${year}.nc -selname,conc_dms ${fileINCAex} ${dirout}sflx_lmdz_cmip6_${year}.nc
472
473ncrename -d VECTOR,vector -v VECTOR,vector ${dirout}sflx_lmdz_cmip6_${year}.nc
474ncrename -d TIME,time     -v TIME,time     ${dirout}sflx_lmdz_cmip6_${year}.nc
475
476#--cleaning up
477rm -f ${dirout}flux*_${year}.nc
478
479#--end loop on years
480done
481
482#--cleaning the mess
483rm -f ferret*
484rm -f regrid.pro
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.