source: TOOLS/PACK_IPSL/archive_restart.sh @ 2022

Last change on this file since 2022 was 2022, checked in by aclsce, 9 years ago

Added check if file exist to fix small bug.

  • Property svn:executable set to *
File size: 6.6 KB
Line 
1#!/bin/bash
2
3
4#on veut archiver les fichiers restart
5#Dans le cadre du demenagement ils seront renommes
6#ATM/Restart/****.nc
7#OCE/Restart/****.nc
8#...
9#sous la forme
10#RESTART/ATM_****.nc
11#RESTART/OCE_****.nc
12#Attention de bien conserver les dates d'origines
13#
14#Dans le cadre de la production nouvelle chaine
15#ils auront directement le bon nom
16#
17#On veut egalement que l'archive soit par periode de temps
18# cette periode est definie par la taille du pack donc connue
19# en entree du script (1M, 1Y, 5Y, 10Y etc...)
20#
21
22
23# $1= PATH/config_card d'une simulation avec
24# TagName/JobName/ExperimentName/SpaceName/DateBegin/DateEnd/PATH_SIMUL
25# $2=period_pack en M/m ou Y/y
26
27config_card=${1}
28LISTE_DMNFS=${2}
29
30
31export JOB_DIR=${JOB_DIR:-${TMP_MIGR_DATA}}
32export IGCM_DEM=${IGCM_DEM:-${SCRATCHDIR}/IGCM_DEM}
33export IGCM_TMP=${IGCM_TMP:-${IGCM_DEM}/tmp}
34mkdir -p ${IGCM_DEM}
35mkdir -p ${IGCM_TMP}
36clean_tmp=${clean_tmp:-yes}
37EXE_DIR=$(dirname ${0})
38SCRIPT_NAME=$(basename ${0} )
39
40source ${EXE_DIR}/DEM_utilities.sh
41
42# gpdebug : verif si le present script a ete execute jusqu'au bout #########
43MonitoringInfo="${SCRIPT_NAME}-->OK"
44simuMonitoring_check "$MonitoringInfo" "$config_card"
45
46DEM_log -0 "Demarrage de ${SCRIPT_NAME}"
47
48
49#### 0- lecture de config.card
50#### on veut les renseignements suivants :
51#### JobName, PATH_SIMUL, DateBegin et DateEnd
52eval $(grep JobName ${config_card}) 
53eval $(grep PATH_SIMUL_FULL ${config_card}) 
54eval $(grep DateBegin ${config_card}) 
55eval $(grep DateEnd ${config_card}) 
56eval $(grep IGCM_DEM_SIMU ${config_card})
57
58
59#### Preparation de l'environnement
60# repertoire dans lequel seront renommes les fichiers de restart
61STORE_RESTART=$IGCM_DEM_SIMU/RESTART
62mkdir -p ${STORE_RESTART}
63
64# repertoire dans lequel nous stockerons les listes de restart a archiver
65RESTART_TAR=$IGCM_DEM_SIMU/restart_tar
66mkdir -p ${RESTART_TAR}
67
68# lecture de periodpack dans ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt
69period_pack=`awk '{print $0} ' ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt`
70
71DEM_log -1 "Period pack = ${period_pack}" 
72#### 1- renommer les fichiers ######
73DEM_log -1 "Renommer les fichiers de Restart"
74
75cd ${STORE_RESTART}
76if [ "x${STORE_RESTART}" != "x" ]
77then
78rm -rf *
79fi
80# On les copie sur le scratchdir en changeant le nom et conservant la date
81awk '{print $2}' ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_restart_files_config.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt
82#grep ${PATH_SIMUL_FULL} ${LISTE_DMNFS} | grep Restart | awk '{print $3}' | sed '/^.*Restart$/d' >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt
83
84 
85gawk -F/ '{dest_name=$(NF-2)("_") $(NF); system("ln -s " $0 " "dest_name)}' ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt
86
87ls -l ${STORE_RESTART} > ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt
88
89### 2- creer les listes de fichiers par periode ####
90DEM_log -1 "Creation des listes de fichiers par periode"
91### 2.1- extraire l'annee et le mois de DateBegin ###
92date_begin=${DateBegin}
93date_end=${DateEnd}
94
95year_begin=$(echo ${date_begin} | cut -c 1-4 )
96month_begin=$(echo ${date_begin} | cut -c 5-6 )
97year_end=$(echo ${date_end} | cut -c 1-4 )
98month_end=$(echo ${date_end} | cut -c 5-6 )
99
100
101### 2.2- creation des listes ###
102date_begin_pack=${date_begin}
103date_end_simulation=${date_end}
104
105month_begin_pack=${month_begin}
106year_begin_pack=${year_begin}
107
108number_pack=1
109while [ ${date_begin_pack} -le ${date_end_simulation} ]
110do
111
112DEM_log -1 "On calcule la date de fin du pack "
113
114   month_end_pack=${month_begin_pack}
115   year_end_pack=`expr ${year_begin_pack} + ${period_pack}`
116
117
118   date_end_pack=${year_end_pack}${month_end_pack}01   
119   
120   if [ "x${ON_IDRIS}" == "xno" ]
121   then
122       for file in `awk '{print $9}' ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt`; do   
123         extract_date_file=`echo ${file}  | sed -e "s/.*\${JobName}_//"`
124         date_file=`echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g'`
125
126         # DEM_log "date_file = ${date_file}"
127         if [  ${date_file} -lt ${date_end_pack} ]
128         then
129            if [ ${date_file} -ge ${date_begin_pack} ]
130            then
131               # DEM_log "${file} ${date_file} dans ${date_begin_pack} ${date_end_pack} "
132               echo ${file} >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt
133            fi
134         fi 
135       done
136   else
137      for file in `awk '{print $8}' ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt`; do   
138         extract_date_file=`echo ${file}  | sed -e "s/.*\${JobName}_//"`
139         date_file=`echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g'`
140
141         # DEM_log "date_file = ${date_file}"
142         if [  ${date_file} -lt ${date_end_pack} ]
143         then
144            if [ ${date_file} -ge ${date_begin_pack} ]
145            then
146               # DEM_log "${file} ${date_file} dans ${date_begin_pack} ${date_end_pack} "
147               echo ${file} >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt
148            fi
149         fi 
150       done 
151   fi
152
153#on archive les restart - le nom de l'archive contiendra ${yearbegin}${monthbegin}_${yearend}${monthend} 
154# end etant la date du dernier fichier contenu et non pas la premiere date suivant
155DEM_log -1 "Recherche de la date de fin reel pour nommer l'archive "
156#On classe par ordre alphabetique les fichiers contenus dans liste_pack_restart
157#la date du dernier fichier donnera la date de fin du pack
158  if [[ -f ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt ]] ; then
159   sort ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp
160
161   first_file=$(head -n 1 ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp )
162   extract_date_file=$( echo ${first_file}  | sed -e "s/.*${JobName}_//" )
163   DateBegin_Restart=$(echo ${extract_date_file}| sed 's%\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g' )
164
165   last_file=$(tail -n 1 ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp )
166   extract_date_file=$( echo ${last_file}  | sed -e "s/.*${JobName}_//" )
167   DateEnd_Restart=$(   echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g' )
168   mv ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp ${RESTART_TAR}/${JobName}_restart_${DateBegin_Restart}_${DateEnd_Restart}.list
169  fi
170
171DEM_log -1 "Passage de la commande Tar pour archiver la liste creee"
172#   tar -cf ${JobName}_${date_begin_pack}_${DateEnd_Restart}_restart.tar --dereference  --files-from ${RESTART_TAR}/tar_restart_${date_begin_pack}_${DateEnd_Restart}.list
173#   cat  ${RESTART_TAR}/tar_restart_${number_pack}.list | xargs rm
174
175
176DEM_log -1 "On definit le datebegin de la  prochaine periode pack"
177#on definit la periode pack suivante
178   month_begin_pack=${month_end_pack}
179   year_begin_pack=${year_end_pack}
180
181   date_begin_pack=${year_begin_pack}${month_begin_pack}01
182
183   number_pack=`expr ${number_pack} + 1`
184
185done
186
187cd ${EXE_DIR}
188
189# gpdebug : le script n'a pas rencontre d'erreur. On l'inscrit dans le fichier de suivi
190simuMonitoring_OK "$MonitoringInfo" "$config_card"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.