source: TOOLS/PACK_IPSL/find_size_pack.sh @ 1921

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Line 
1#!/bin/bash
2
3# But : trouver la taille ideale de pack pour une simulation donnee
4# on part sur une base de 10 ans et on augmente par 0.5 ou on divise
5# par 2 suivant un critÚre de taille
6# on passe en revue tous les types de fichiers d'Output et on conserve
7# la taille de pack la plus petite (hors HF)
8
9# $1= PATH/config_card d'une simulation avec
10# TagName/JobName/ExperimentName/SpaceName/DateBegin/DateEnd/PATH_SIMUL
11
12# pour commencer on travaille avec le fichier information_dmnfs
13#/cscratch/cont003/p86mart/FROM_CCRT_INFORMATIONS_DMNFS/information_dmnfs_2011-09-21
14
15config_card=${1}
16LISTE_DMNFS=${2}
17
18# ----
19export JOB_DIR=${JOB_DIR:-${TMP_MIGR_DATA}}
20export IGCM_DEM=${IGCM_DEM:-${SCRATCHDIR}/IGCM_DEM}
21export IGCM_TMP=${IGCM_TMP:-${IGCM_DEM}/tmp}
22mkdir -p ${IGCM_DEM}
23mkdir -p ${IGCM_TMP}
24clean_tmp=${clean_tmp:-yes}
25EXE_DIR=$(dirname ${0})
26SCRIPT_NAME=$(basename ${0} )
27source ${EXE_DIR}/DEM_utilities.sh
28
29# gpdebug : verif si le present script a ete execute jusqu'au bout #########
30MonitoringInfo="${SCRIPT_NAME}-->OK"
31simuMonitoring_check "$MonitoringInfo" "$config_card"
32
33# gpdebug : Execute la function errorReceive() si reception d'un signal TERM
34trap 'DEM_errorReceive' TERM ########
35
36# gpdebug : on augmente la liste des proc à détruire en cas d'erreur bloquante du présent proc
37export listPID="$$ ${listPID}" #########
38
39DEM_log -0 "Demmarrage de ${SCRIPT_NAME}"
40cd ${EXE_DIR}
41# ----
42
43eval $(grep JobName         ${config_card} ) 
44eval $(grep PATH_SIMUL_FULL ${config_card} ) 
45eval $(grep DateBegin       ${config_card} ) 
46eval $(grep DateEnd         ${config_card} ) 
47eval $(grep IGCM_DEM_SIMU   ${config_card} )
48
49DEM_state=$( DEM_read_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} )
50# gpdebug : si c'est une premiere exec (pas une reprise)
51if [[ "x${execEveryStep}" == "1" ]] && [[ "${DEM_state}" != "ListToBeDone" ]] ; then
52    echo "gpdebug : DEM_state=${DEM_state}"
53    DEM_errorSend "${SCRIPT_NAME}:${LINENO}:Etat incorrect dans ${IGCM_DEM}/config_card.liste"
54fi
55
56DEM_write_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} FindSizePackRunning
57
58# Periodicite du pack (20 ans par defaut)
59period_pack=20Y
60periodpackinyear=$( echo ${period_pack} | sed -e 's/[yY]//' ) 
61
62# Taille max et min que devra avoir un pack en octet (20Go - 70Go)
63size_pack_max=70000000000
64size_pack_min=20000000000
65
66SIMUL=${PATH_SIMUL_FULL}/
67
68# Nettoyons les tests precedents ....
69rm -f ${IGCM_DEM_SIMU}/info_Output.txt
70rm -f ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt
71
72# 1- Trouver tous les repertoires d'Output
73DEM_log -1 "Recherche des repertoires Output"
74
75#grep ${SIMUL} ${LISTE_DMNFS} > ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt
76#grep "/Output/"  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_2.txt
77#awk '{print $(NF-2) " " $(NF-1)}' ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_2.txt > ${IGCM_DEM_SIMU}/info_Output.txt
78
79[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f   ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_2.txt
80
81# 2- Trouver la liste des noms des fichiers d'Output
82DEM_log -1 "Recherche des noms de fichiers Output"
83
84sed -e "s%.*_\([0-9]\{8\}\)_\([0-9]\{8\}\)_%%" ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_output_files_config.txt  | awk '/.nc/{print $0}'  >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt
85
86#on enleve si des fichiers ne repondent pas au critere et sont donc encore en /
87cat ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt | grep -v "/" > ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt
88
89
90## On enleve mesh_mask qui est un cas particulier a traiter ulterieurement
91#sed '/mesh_mask/d' ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_2.txt
92
93# On retire les doublons de la liste précédent
94awk '{if (x[$0] != "") next ; print $0 ; x[$0]=$0}' <  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt >> ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt
95[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt
96
97
98#!!!# Reduction de la taille du probleme pour test
99# grep 1M_cpl_atm.nc  ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt >  ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt.tmp
100# grep 1M_grid_T.nc  ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt >>  ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt.tmp
101# mv ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt.tmp ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt
102
103# On cree la liste des fichiers pour chaque type_file
104DEM_log -1 "Creation de la liste des fichiers"
105
106for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
107do
108#for type_file in 1D_cpl_atm.nc ; do
109    DEM_log -1 "Traitement type de fichier = ${type_file}"
110    grep ${type_file} ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_output_files_config.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
111    # cette liste comporte en premiere colonne la taille et en deuxieme le path du fichier
112    # on classe la liste par ordre alphabetique des path des fichiers
113    sort -k 2  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp
114    cp ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
115    [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp
116done
117
118
119# 3- Maintenant pour chaque type de fichier de sortie nous allons calculer la
120# taille qu'aurait le pack de {periodpackinyear}ans
121DEM_log -1 "Debut recherche taille de pack"
122
123# Recherche des dates du premier pack
124
125year_begin=$(  echo ${DateBegin} | cut -c 1-4 )
126month_begin=$( echo ${DateBegin} | cut -c 5-6 )
127year_end=$(    echo ${DateEnd}   | cut -c 1-4 )
128month_end=$(   echo ${DateEnd}   | cut -c 5-6 )
129
130date_begin_pack=${DateBegin}
131date_end_simulation=${DateEnd}
132
133month_begin_pack=${month_begin}
134year_begin_pack=${year_begin}
135
136number_pack=1
137
138# on ne fait le calcul que pour les dix premiers pack (donc 20 * 10 =  200 ans)
139# cela doit donner un echantillon suffisant
140while [[ ${date_begin_pack} -le ${date_end_simulation}  && ${number_pack} -le 10 ]]
141do
142   
143    month_end_pack=${month_begin_pack}
144    year_end_pack=$(( ${year_begin_pack} + ${periodpackinyear} ))
145   
146    date_end_pack=${year_end_pack}${month_end_pack}01
147
148    DEM_log -2 "Entree boucle : year_begin_pack month_begin_pack year_end_pack month_end_pack : ${year_begin_pack} ${month_begin_pack} ${year_end_pack} ${month_end_pack}"
149    # on travaille pour chaque type de fichiers
150    for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
151    do
152    #for type_file in 1M_grid_T.nc ; do
153        DEM_log -3 ${type_file} ${number_pack}
154        taille=0
155        #il faut les passer en revue et calculer par tranche de period_pack leur somme
156        for file in `awk '{print $2}'  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt` ; do 
157            #extraire la date de debut et la date de fin de la periode d'output traitee par le fichier   
158            extract_date_file=$( echo ${file}             | sed "s%.*${JobName}_%%"            )
159            date_debut=$(        echo ${extract_date_file}| sed 's%\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g'    )
160            date_fin=$(          echo ${extract_date_file}| sed 's%.*_\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g' )
161            if [  ${date_debut} -lt ${date_end_pack} ]
162            then
163                if [ ${date_fin} -ge ${date_begin_pack} ]
164                then
165                    grep ${file}  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt >>  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt
166                    # on efface le fichier de la liste pour ne pas travailler dessus pour le prochain pack
167                    grep -v ${file} ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp
168                    cp ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
169                    [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp
170                fi
171            else
172            # comme la liste est classee par ordre alphabetique --> par ordre croissant des periodes de sorties
173            # des que un fichier n'est plus dans le pack on peut sortir c'est qu'on les a tous.
174                break
175            fi
176           
177        done
178       # on fait la somme par periodpack et par type de fichier de la taille qu'aurait le pack
179        if [ -f ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt ]
180        then
181            awk 'BEGIN {y = 0} {x = $1 ; y = y + x } END{print y}'  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt >> ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt
182            [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt
183        fi
184    done
185   
186    DEM_log -2 "Sortie boucle : year_begin_pack month_begin_pack year_end_pack month_end_pack : ${year_begin_pack} ${month_begin_pack} ${year_end_pack} ${month_end_pack}"
187
188    month_begin_pack=${month_end_pack}
189    year_begin_pack=${year_end_pack}
190    date_begin_pack=${year_begin_pack}${month_begin_pack}01
191   
192    number_pack=$(( ${number_pack} + 1 ))
193
194
195done
196
197# Pour chaque type de fichier on verifie si toutes les tailles sont dans
198# la fourchette size_pack_min / size_pack_max
199# Si une taille est plus petite
200# attention il ne faut pas tenir compte du dernier pack qui peut etre
201# inferieur a periodpack
202
203new_period=999999
204newpackinyear=0
205
206for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
207do
208    nb_line=$(cat ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt | wc -l )
209    if [ ${nb_line} -gt 1 ]
210    then
211        for taille in `head -n -1  ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt`
212        do 
213            [[ ${taille} -lt ${size_pack_min} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_min} * ${periodpackinyear} / ${taille} ))
214            [[ ${taille} -gt ${size_pack_max} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_min} * ${periodpackinyear} / ${taille} ))
215            [[ ${taille} -ge ${size_pack_min} && ${taille} -le ${size_pack_max} ]] && period_tmp=${periodpackinyear}
216            [[ ${period_tmp} -lt ${new_period} ]] && new_period=${period_tmp}
217        done
218    else
219        # Dans ce cas la il n'y avait pas assez de fichiers pour remplir une periode complete #
220        # il faut donc commencer par calculer la taille du pack que l'on a fait #
221        newpackinyear=$((    ${year_end}  - ${year_begin}        ))
222        newpackinyear=$(( $newpackinyear + 1 ))
223        [[ ${newpackinyear} -lt 1 ]] && newpackinyear=1
224       
225        for taille in `head  ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt`
226        do 
227#         echo ${taille} ${type_file}
228            [[ ${taille} -lt ${size_pack_min} ]] && period_tmp=${newpackinyear}
229            [[ ${taille} -gt ${size_pack_max} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_min} * ${newpackinyear} / ${taille} ))
230            [[ ${taille} -ge ${size_pack_min} && ${taille} -le ${size_pack_max} ]] && period_tmp=${newpackinyear}
231            [[ ${period_tmp} -lt ${new_period} ]] && new_period=${period_tmp}
232        done
233       
234    fi
235done
236
237DEM_log -1 "taille=${taille}"
238DEM_log -1 "new_period=${new_period}"
239
240# on veut que la taille de pack soit de 1 2 5 10 20 50 ou 100 ans
241# sauf si newperiod = nb annee de simul auquel cas on ne tronque pas
242declare -a liste_period=( 1 2 5 10 20 50 100 )
243
244change=0
245for i in 1 2 3 4 5 6 ; do
246    if [[ ${new_period} -lt ${liste_period[i]} && ${change} -eq 0 && ${newpackinyear} -eq 0 ]]
247    then
248        new_period=${liste_period[i-1]}
249        change=1
250    fi
251done
252
253[[ ${new_period} -gt 100 ]] && new_period=100
254
255[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.*
256
257echo ${new_period} > ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt
258DEM_log -0 "La nouvelle periode de pack est : ${new_period}Y"
259
260DEM_write_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} FindSizePackDone
261
262# gpdebug : le script n'a pas rencontre d'erreur. On l'inscrit dans le fichier de suivi
263simuMonitoring_OK "$MonitoringInfo" "$config_card"
264
265DEM_log -0 "Fin de ${SCRIPT_NAME}"
266
267exit
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.