source: TOOLS/SURPACK_IPSL/find_size_pack.sh @ 2166

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fixe a bug to calcul the new size for a pack

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Line 
1#!/bin/bash
2# But : trouver la taille ideale de pack pour une simulation donnee
3# on part sur une base de 10 ans et on augmente par 0.5 ou on divise
4# par 2 suivant un critÚre de taille
5# on passe en revue tous les types de fichiers d'Output et on conserve
6# la taille de pack la plus petite (hors HF)
7
8# $1= PATH/config_card d'une simulation avec
9# TagName/JobName/ExperimentName/SpaceName/DateBegin/DateEnd/PATH_SIMUL
10
11# pour commencer on travaille avec le fichier information_dmnfs
12#/cscratch/cont003/p86mart/FROM_CCRT_INFORMATIONS_DMNFS/information_dmnfs_2011-09-21
13
14config_card=${1}
15LISTE_DMNFS=${2}
16
17# ----
18export JOB_DIR=${JOB_DIR:-${TMP_MIGR_DATA}}
19export IGCM_DEM=${IGCM_DEM:-${SCRATCHDIR}/IGCM_DEM}
20export IGCM_TMP=${IGCM_TMP:-${IGCM_DEM}/tmp}
21mkdir -p ${IGCM_DEM}
22mkdir -p ${IGCM_TMP}
23clean_tmp=${clean_tmp:-yes}
24EXE_DIR=$(dirname ${0})
25SCRIPT_NAME=$(basename ${0} )
26source ${EXE_DIR}/DEM_utilities.sh
27
28# gpdebug : verif si le present script a ete execute jusqu'au bout #########
29MonitoringInfo="${SCRIPT_NAME}-->OK"
30simuMonitoring_check "$MonitoringInfo" "$config_card"
31
32# gpdebug : Execute la function errorReceive() si reception d'un signal TERM
33trap 'DEM_errorReceive' TERM ########
34
35# gpdebug : on augmente la liste des proc à détruire en cas d'erreur bloquante du présent proc
36export listPID="$$ ${listPID}" #########
37
38DEM_log -0 "Demmarrage de ${SCRIPT_NAME}"
39cd ${EXE_DIR}
40# ----
41
42eval $(grep JobName         ${config_card} ) 
43eval $(grep PATH_SIMUL_FULL ${config_card} ) 
44eval $(grep DateBegin       ${config_card} ) 
45eval $(grep DateEnd         ${config_card} ) 
46eval $(grep IGCM_DEM_SIMU   ${config_card} )
47
48DEM_log -0 "on travaille avec la simu ${JobName}"
49
50DEM_state=$( DEM_read_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} )
51# gpdebug : si c'est une premiere exec (pas une reprise)
52if [[ "x${execEveryStep}" == "1" ]] && [[ "${DEM_state}" != "ListToBeDone" ]] ; then
53    echo "gpdebug : DEM_state=${DEM_state}"
54    DEM_errorSend "${SCRIPT_NAME}:${LINENO}:Etat incorrect dans ${IGCM_DEM}/config_card.liste"
55fi
56
57DEM_write_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} FindSizePackRunning
58# Periodicite du pack (20 ans par defaut)
59period_pack=20Y
60periodpackinyear=$( echo ${period_pack} | sed -e 's/[yY]//' ) 
61
62# Taille max et min que devra avoir un pack en octet (20Go - 70Go)
63size_pack_max=70000000000
64size_pack_min=20000000000
65
66SIMUL=${PATH_SIMUL_FULL}/
67
68# Nettoyons les tests precedents ....
69rm -f ${IGCM_DEM_SIMU}/info_Output.txt
70rm -f ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt
71
72[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f   ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_2.txt
73
74# 1- Trouver la liste des noms des fichiers d'Output
75DEM_log -1 "Recherche des noms de fichiers Output"
76
77sed -e "s%.*_\([0-9]\{8\}\)_\([0-9]\{8\}\)_%%" ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_output_files_config.txt  | awk '/.nc/{print $0}'  >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt
78
79#on enleve si des fichiers ne repondent pas au critere et ont donc encore en / dans leur nom
80cat ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt | grep -v "/" > ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt
81
82
83# On retire les doublons de la liste precedente
84awk '{if (x[$0] != "") next ; print $0 ; x[$0]=$0}' <  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt >> ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt
85[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp.txt ${IGCM_TMP}/${$}.info_tmp_bis.txt
86
87
88# On cree la liste des fichiers pour chaque type_file (type_file = histmth, histday, etc...)
89DEM_log -1 "Creation de la liste des fichiers"
90
91for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
92do
93    DEM_log -1 "Traitement type de fichier = ${type_file}"
94    grep ${type_file} ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_output_files_config.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
95    # cette liste comporte en premiere colonne la taille et en deuxieme le path du fichier
96    # on classe la liste par ordre alphabetique des path des fichiers
97    sort -k 2  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt >  ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp
98    cp ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
99    [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f ${IGCM_TMP}/${$}.tmp_info_${type_file}.txt.tmp
100done
101
102
103
104# 3- Maintenant pour chaque type de fichier de sortie nous allons calculer la
105# taille qu'aurait le pack de {periodpackinyear}ans
106DEM_log -1 "Debut recherche taille de pack"
107# Recherche des dates du premier pack
108
109year_begin=$(  echo ${DateBegin} | cut -c 1-4 )
110month_begin=$( echo ${DateBegin} | cut -c 5-6 )
111year_end=$(    echo ${DateEnd}   | cut -c 1-4 )
112month_end=$(   echo ${DateEnd}   | cut -c 5-6 )
113
114date_begin_pack=${DateBegin}
115date_end_simulation=${DateEnd}
116
117month_begin_pack=${month_begin}
118year_begin_pack=${year_begin}
119
120number_pack=1
121
122# on ne fait le calcul que pour les dix premiers pack (donc 20 * 10 =  200 ans)
123# cela doit donner un echantillon suffisant
124date_begin_pack=`echo $date_begin_pack|sed 's/^0*//'` 
125date_end_simulation=`echo $date_end_simulation|sed 's/^0*//'` 
126
127echo "begin_pack  =  $date_begin_pack end_simu $date_end_simulation"
128while [[ ${date_begin_pack} -le ${date_end_simulation}  && ${number_pack} -le 3 ]]  ###### ANNE 10 au lieu de 3
129do
130   
131    month_end_pack=${month_begin_pack}
132    year_end_pack=$(( 10#${year_begin_pack} + ${periodpackinyear} ))
133    date_end_pack=${year_end_pack}${month_end_pack}01 
134
135    DEM_log -0 "Entree boucle : year_begin_pack month_begin_pack year_end_pack month_end_pack : ${year_begin_pack} ${month_begin_pack} ${year_end_pack} ${month_end_pack}"
136    # on travaille pour chaque type de fichiers
137    for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
138    do
139    #for type_file in 1M_grid_T.nc ; do
140        DEM_log -3 "type file, number_pack " ${type_file} ${number_pack}
141        taille=0
142        #il faut les passer en revue et calculer par tranche de period_pack leur somme
143        for file in `awk '{print $2}'  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt` ; do 
144            #extraire la date de debut et la date de fin de la periode d'output traitee par le fichier   
145            extract_date_file=$( echo ${file}             | sed "s%.*${JobName}_%%"            )
146            date_debut=$(        echo ${extract_date_file}| sed 's%\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g'    )
147            date_fin=$(          echo ${extract_date_file}| sed 's%.*_\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g' )
148            if [  ${date_debut} -lt ${date_end_pack} ]
149            then
150                if [ ${date_fin} -ge ${date_begin_pack} ]
151                then
152                    grep ${file}  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt >>  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt
153                    # on efface le fichier de la liste pour ne pas travailler dessus pour le prochain pack
154                    grep -v ${file} ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp
155                    cp ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt
156                    [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}.txt.tmp
157                fi
158            else
159            # comme la liste est classee par ordre alphabetique --> par ordre croissant des periodes de sorties
160            # des que un fichier n'est plus dans le pack on peut sortir c'est qu'on les a tous.
161                break
162            fi
163           
164        done
165       # on fait la somme par periodpack et par type de fichier de la taille qu'aurait le pack
166        if [ -f ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt ]
167        then
168            awk 'BEGIN {y = 0} {x = $1 ; y = y + x } END{print y}'  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt >> ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt
169            [[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.info_${type_file}_${number_pack}.txt
170        fi
171    done
172   
173    DEM_log -2 "Sortie boucle : year_begin_pack month_begin_pack year_end_pack month_end_pack : ${year_begin_pack} ${month_begin_pack} ${year_end_pack} ${month_end_pack}"
174
175    month_begin_pack=${month_end_pack}
176    year_begin_pack=${year_end_pack}
177    date_begin_pack=${year_begin_pack}${month_begin_pack}01
178   
179    number_pack=$(( ${number_pack} + 1 ))
180
181
182done
183
184# Pour chaque type de fichier on verifie si toutes les tailles sont dans
185# la fourchette size_pack_min / size_pack_max
186# Si une taille est plus petite
187# attention il ne faut pas tenir compte du dernier pack qui peut etre
188# inferieur a periodpack
189
190new_period=999999
191newpackinyear=0
192if [[ -f ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt ]]; then
193    for type_file in `awk '{print $0}' ${IGCM_DEM_SIMU}/info_name_file.txt`
194    do
195        nb_line=$(cat ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt | wc -l )
196        if [ ${nb_line} -gt 1 ]
197        then
198            for taille in `head -n -1  ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt`
199            do 
200                [[ ${taille} -lt ${size_pack_min} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_min} * ${periodpackinyear} / ${taille} ))
201                [[ ${taille} -gt ${size_pack_max} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_max} * ${periodpackinyear} / ${taille} ))
202                [[ ${taille} -ge ${size_pack_min} && ${taille} -le ${size_pack_max} ]] && period_tmp=${periodpackinyear}
203                [[ ${period_tmp} -lt ${new_period} ]] && new_period=${period_tmp}
204                echo "type_file =  ${type_file} taille = ${taille} new_period = ${new_period}"
205
206            done
207        else
208        # Dans ce cas la il n'y avait pas assez de fichiers pour remplir une periode complete #
209        # il faut donc commencer par calculer la taille du pack que l'on a fait #
210            newpackinyear=$((    ${year_end}  - ${year_begin}        ))
211            newpackinyear=$(( $newpackinyear + 1 ))
212            [[ ${newpackinyear} -lt 1 ]] && newpackinyear=1
213            for taille in `head  ${IGCM_TMP}/${$}.size_pack_${type_file}.txt`
214            do 
215                [[ ${taille} -lt ${size_pack_min} ]] && period_tmp=${newpackinyear}
216                [[ ${taille} -gt ${size_pack_max} ]] && period_tmp=$(( ${size_pack_max} * ${newpackinyear} / ${taille} ))
217                [[ ${taille} -ge ${size_pack_min} && ${taille} -le ${size_pack_max} ]] && period_tmp=${newpackinyear}
218                [[ ${period_tmp} -lt ${new_period} ]] && new_period=${period_tmp}
219            done
220        fi
221    done
222fi
223DEM_log -1 "taille=${taille}"
224DEM_log -1 "new_period=${new_period}"
225
226# on veut que la taille de pack soit de 1 2 5 10 20 50 ou 100 ans
227# sauf si newperiod = nb annee de simul auquel cas on ne tronque pas
228declare -a liste_period=( 1 2 5 10 20 50 100 )
229
230change=0
231for i in 1 2 3 4 5 6 ; do
232    if [[ ${new_period} -lt ${liste_period[i]} && ${change} -eq 0 ]]
233    then
234        new_period=${liste_period[i-1]}
235        change=1
236    fi
237done
238
239[[ ${new_period} -gt 100 ]] && new_period=100
240
241[[ ${new_period} -eq 0 ]] && new_period=1
242
243[[ "${clean_tmp}" = "yes" ]] && rm -f  ${IGCM_TMP}/${$}.*
244
245echo ${new_period} > ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt
246DEM_log -0 "La nouvelle periode de pack est : ${new_period}Y"
247
248DEM_write_state ${IGCM_DEM}/config_card.liste ${config_card} FindSizePackDone
249
250# gpdebug : le script n'a pas rencontre d'erreur. On l'inscrit dans le fichier de suivi
251simuMonitoring_OK "$MonitoringInfo" "$config_card"
252DEM_log -0 "Fin de ${SCRIPT_NAME}"
253
254exit
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.